#QUERY: #Match: All #Representatives of sequence clustering group only: on #PDB_ID ENTRY_ID PUBMED_ID RESOLUTION SPECIES MULTICOMPLEXITY NO_INTERFACES ASYMMETRIC_UNIT BIOLOGICAL_UNITS IS_CRUCIFORM HAS_ZDNA HAS_WATER CLASSIFICATION TYPE SUBTYPE COMPLEX_ID INTERFACE_ID DNA_DOUBLE_STRAND DNA_SINGLE_STRAND STICKY_ENDS FLIPPED_BASE NICKED_DNA GAPPED_DNA OPEN_DNA MODIFIED_DNA PROTEIN_MONOMERS MULTIMERIZATION PROT_PROT_INTERACTION DNA_PROT_INTERACTION PROT_CHAIN_IDS PROT_SEQS DNA_CHAIN_IDS DNA_SEQS SEQ_GROUPS INTERFACE_GROUP NUMBER_EFF_CONTACTS GROOVE_CONTACTS(MA;MI;BB;NA) TYPE_CONTACTS(1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13;14;15;16;17;18;19;20) 1A35 1a35_1_1 9488644 2.5 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Topoisomerase Topoisomerase I 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 1 1 0 0 1 A IkWKFLEHKGPVFAPPYEPLPENVKFYYDGKVMKLSPKAEEVATFFAKMLDhEYTTKEIFRKNFFKDWRKEMTNEEKNIITNLSKCDFTQMSQYFKAQTEArKqMSkEEKLKikEEnEKLLKEYGFCIMDNHKERIanfkIepPGlfrgrGNhPKMGMLkRRIMPEDIIINCSKDAKVPSPPPGHKWKEVrHdNkvtwLVsWteNIQgsikyImLNPSSRikGEkDWQkYETARRLKKCVDKIRNQYREDWKSKEMKVRQRAVALYFIDKLALragnEkeEGEtaDtvGCCSLRVEHINLHPELDGQEYVVEFDFLgkdSiRYYNKVPVEKRVFKNLQLFMENKQPEDDLFDRLntgiLnKHLqDLMEGLtakVFrtYNASITLQQQLKELTAPDENIPAKILSYNRANRAVAILCnhqraQIaLGtSKLnfLDPRITVAWCKKWGVPIEKIYNKTQREKFAWAIDMADEDYEF C;D AaAaagacttagaaaaaTTT;aaaAATcaagtctTTT 129 666 344 30;12;302;0 6;0;2;0;0;0;1;0;27;11;14;0;0;0;0;1;0;25;44;213 1A3Q 1a3q_1_1 9384586 2.1 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet NFkB 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B GPYLVIVEQPKQRgFrFryGceGPShggLPGASSEKGRkTYPTVKICNYEGPAKIEVDLVTHSDPPRAHAHSLVGKQCSELGICAVSVGPKDMTAQFNNLGVLhvtkkNMMGTMIQKLQRQRLRSRPQGLTEAEQRELEQEAKELKKVMDlSIVRLRFSAFLRSLPLKPVISQPIHDSkSpGASNLkISRMDKTAGSVRGGDEVYLLCDkVqkDDIEVRFYEDDENGWQAFGDFSPTDvHkqyAIVFRTPPYHKMKIERPVTVFLQLKRKRGGDVSDSKQFTYYP;GPYLVIVEQPKQRgFrFryGceGPShgGLPGASSEKGRkTYPTVKICNYEGPAKIEVDLVTHSDPPRAHAHSLVGKQCSELGICAVSVGPKDMTAQFNNLGVLhvtkkNMMGTMIQKLQRQRLRSRPQGLTEAEQRELEQEAKELKKVMDlSIVRLRFSAFLRSLPLKPVISQPIHDskspGASnLkISRMDKTAGSVRGGDEVYLLCdkVqkDDIEVRFYEDDENGWQAFGDFSPTDvHkqyAIVFRTPPYHKMKIERPVTVFLQLKRKRGGDVSDSKQFTYYP C;D ggggaatcccC;ggggattcccC 140 665 295 112;0;183;0 16;0;13;0;6;0;2;0;15;2;5;4;0;0;0;2;6;18;42;164 1A6Y 1a6y_1_1 9660968 2.3 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Hormone Nuclear Receptor, Orphan Nuclear Receptor NR1D1 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 1 2 1 2 1 A;B LLCKVCGdVAsgfhyGVLACegCkgfFrrSIqQNiykRCLKNENCSIVRINrnrCqQCrFKKCLSVGMSrDAvrfgr;GMVLLCKVCGdvAsgfhyGVLACegCkgfFrrSiqQNiyKRCLKNENCSIVrINrnRCqQCrFKKCLSVGMSrDAvrfgripk C;D CAactaggtCacaggtCAG;ctgaccTagtgaccTAgttg 54 664 428 69;27;332;0 11;0;9;0;4;3;2;4;20;0;16;0;0;0;0;0;0;27;64;268 1A73 1a73_1_1 9665136 1.8 PHYSARUM POLYCEPHALUM 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease I-PpoI 1 1 1 0 1, 1 0 2 0 0 0 2 1 2 1 A;B ALTNAQILAVIDSWEETVGQFPVITHHVPLGGGLQGTLHCYEIPLAapygvgfaknGPtrWqYkrtINqVvHrwgShtVPFLLEPDNINGktCtaShLChNtRCHNPLHLCwESldDnkGRnWCPGPNGGCVHAVVCLRQGplYGPGATVAGPQQRGSHFVV;ALTNAQILAVIDSWEETVGQFPVITHHVPLGGGLQGTLHCYEIPLAapyGvgfaknGPtrWqYkrtINqVvHrwgShtVPFLLEPDNINgktCtaShLCHNtRCHNPLHLCwESldDnkGRnWCPGPNGGCVHAVVCLRQGplYGPGATVAGPQQRGSHFVV C;D;E;F ttgactcTCttaa;gagagTCA;ttgactcTCttaa;gagagTCA 29 7 385 117;22;246;0 18;0;9;0;4;0;4;0;13;8;19;0;0;0;0;3;8;21;51;227 1AIS 1ais_1_1 9177165 2.1 PYROCOCCUS WOESEI 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet TATA Box Binding Protein 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 1 2 2 0 1 A;B MVDMSKVKLRIenIvAsVDLFAQLDLEKVLDLCPNSkYNPEefpGIiChLDDPkVaLlIfssGklvVtgAkSVQDIERAVAKLAQKLKSIGVKFKRAPQIDVqnMvfsgDIGREFNLDVVALTLPNCeYEPeqfpGViYrVKEPKSvIlLfssGkivCsGAkSEADAWEAVRKLLRELDKY;NLAFALSELDRITAQLKLPRHVEEEAARLYREAVRKGLIRGRSIESVMAACVYAACRLLKVPRTLDEIADIARVDkkEIGrSYrFIARNLNLTPKKLFVKPTDYVNKFADELGLSEKVRRRAIEILDEAYKRGLTsgksPAgLVAAALYIASLLEGEKRTQREVAEVArvtEvtVrnrYKELVEKLKIKVPIA C;E aacTTACtttaaaGC;GctttaaaaagtaagTT 157;163 663 333 16;63;254;0 2;1;0;2;0;0;0;0;9;8;6;0;0;0;0;0;0;21;83;201 1AKH 1akh_1_1 9838003 2.5 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodamain, Mat Alpha 2 1 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 2 2 2 1 A;B iSPQArAFLeEVFRRKQslnsKEkEEVAKKCGITPlqVrvwFinKrmrS;TKpyrghrfTkENvRILeSWFAKNIENPylDTKGLENLMKNTSLSriqIknwVsnRrrkEkTITIAPELADLLSGEPL C;D TacatgtaaaaatttacatCA;TAtgatgTAAATTtttacaTG 121;123 662 322 76;26;220;0 12;1;11;1;5;1;0;1;18;4;8;0;0;0;0;3;1;18;47;191 1AM9 1am9_2_1 9634703 2.3 HOMO SAPIENS 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Helix Loop Helix, SREBP-1A 2 1 1 0 4, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 C;D qSRGEkrTahnAiekryrSsinDKIIELKDLVVGTEAKLnksAVLRKAIDYIRFLQHSNQKLKQENLSLRTAVHKSKSLKDL;QSrGEKrTahnAiekryrSsinDKIiELKDLVVGTEAkLnksAVLRKAIDYIRFLQHSNQKLKQENLSLRTAVHKS E;H TTGCagtggggtgatCt;CATgagatcaccccaCTGCAA 95 136 282 101;0;181;0 2;0;1;0;5;0;0;0;18;6;9;0;0;0;0;7;3;12;58;161 1AU7 1au7_1_1 9009203 2.3 RATTUS NORVEGICUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Pit-1 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B GMRALEQFANEFkVRrIKLGytqtNVGEALAAVHGSefsqttIcrFEnLqlsFknACklKAILSKWLEEAEQkrrttiSIAAkDALERHFGEHSkpSsQEiMRMAEELNLEkevVrvwFcnRrqrEkrVK;GMRALEQFANEFkVRriKLGYtqtNVGEALAAVhGSefsqttIcrFEnLqlsFknACklKAILSKWLEEAkrrttiSIAAkDALERHFGEHSKpSsQEiMRMAEELNLEkevVrvwFcnRrqREkrVK C;D TcctcatgtatatacatgAGGAAGG;CTTcctcatgtatatacatgAGGA 170 661 561 161;18;382;0 15;1;22;4;12;0;1;0;24;19;16;9;0;0;0;13;3;30;63;329 1AWC 1awc_1_1 9461436 2.15 MUS MUSCULUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Ets Domain, GABP 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 1 2 2 0 1 A;B IqlWQFLLELLTDKDARDCISWVGDEGEFKLNQPELVAQKwGQRkNkPtmNyeklsraLryyyDGDMICkVQgkrfVyKFVCDLKTLIGYSAAELNRLVIECEQKKLARM;DLGKKLLEAARAGQDDEVRILMANGApFttDwLGTSPLHLAAQYGHFSTTEVLLRAGVSRDARTkVDRTPLHMAASEGHANIVEVLLKHGADVNAKDMLKMTALHWATEHNHQEVVELLIKYGADVHTQSKFCKTAFDISIDNGNEDLAEILQ D;E AAGaccggaaGTAAcgGA;TTCCGGGacttccGGTCAT 225;237 660 171 50;0;120;1 3;0;1;0;0;0;1;0;5;3;3;0;0;0;0;1;3;10;39;102 1AZP 1azp_1_1 9515968 1.6 SULFOLOBUS ACIDOCALDARIUS 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein DNA Packaging Histone-like, SAC7D 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A MVKVKFkykgEEKEVDTSKIKkVwrvGkmVsFtYDDNGktGrGavsEkdAPKELLDMLARAeReKK B;C GcgatcgC;GCGatcgc 18 659 166 3;28;129;6 0;0;3;1;1;0;1;0;4;2;4;0;0;0;0;0;0;9;42;99 1B3T 1b3t_1_1 9878348 2.2 EPSTEIN-BARR VIRUS 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein Replication Origin Binding Protein, EBNA-1 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B kggwfGkhrgqggSnPkfEniAEGLRALLARSHVERTTDEGTWVAGVFVYGGsktsLynLrrGTALAIPQCRLTplsrLPFGMAPGPGPQPGPlReSiVcYFMVFLQTHIFAEVLKDAIKDLVMTkpAptCNIRVTVCSFDDGVDLP;kggwfGkhrgqggSnPkfEniAEGLRALLARSHVERTTDEGTWVAGVFVYGGsktsLynLrrGTALAIPQCRLTplsrLPFGMAPGPGPQPGPlReSiVcYFMVFLQTHIFAEVLKDAIKDLVMTkpAptCNIRVTVCSFDDGVDLP C;D gggaagcatatgcttccC;gggaagcatatgcttccC 166 658 549 59;69;421;0 5;2;10;0;1;6;4;4;29;8;27;2;0;0;0;0;0;23;108;320 1B72 1b72_1_1 10052460 2.35 HOMO SAPIENS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, PBX1 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A ARTFDwMKvlrtnfTTRQlTELEKEFHFNKylSrARrVEIAATLELNEtqVkiwFqnRrmkQkKRERE D;E ACTCTATGATtgatcGGCTG;TCAgccgaTcaatcATAGAG 251 657 148 18;6;123;1 3;0;1;0;1;0;0;0;10;2;3;0;0;0;0;0;0;11;26;91 1B72 1b72_1_2 10052460 2.35 HOMO SAPIENS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, PBX1 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B rkrrnfNKQAtEILnEYFYSHLSNPypSeEAkEELAKKCGITVsqVsnwFgnkrirYkkNIGkfQEeANIYAA D;E ACTCTatgatTGATCGGCTG;TCAGCCGatcaatCatagAG 191 656 158 33;6;118;1 5;0;3;0;2;0;1;0;14;1;3;0;0;0;0;2;0;12;24;91 1B8I 1b8i_1_1 10067897 2.4 DROSOPHILA MELANOGASTER 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, UBX|EXD 1 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A FYPwMarqtyTRYQtLELeKEFHTNHyLTrRRrIEMAHALSLTErqIkiwFqnRrmkLkkEI C;D GTcgccataaatcAC;ACGTGAtttatgGCG 253 655 165 35;8;122;0 2;0;3;0;4;0;0;0;10;3;4;0;0;0;0;2;0;17;28;92 1B8I 1b8i_1_2 10067897 2.4 DROSOPHILA MELANOGASTER 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, UBX|EXD 1 2 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B rrnfSKQAsEILNEYFYSHLSNPypSeEAkEELARKCGITVSqVsnwFgnKrirYkkN C;D GTCGCCataaatCac;ACgtgatTTATGGCG 255 654 137 28;10;98;1 3;0;4;0;0;0;0;0;14;1;1;0;0;0;0;1;0;11;17;85 1B94 1b94_1_1 10446231 1.9 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRV 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtkVLsTIFeLFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKENEKIkFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTrVATRKSSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsqLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK;SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtkVLsTIFeLFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKqQnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKENEKIkFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTrVATRKSSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgntTnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsQLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK C;D aaagatatctt;aaagatatctt 1 26 465 111;16;338;0 5;2;6;4;4;6;4;2;20;21;18;0;0;0;0;6;2;29;61;275 1BDT 1bdt_1_1 9927650 2.5 BACTERIOPHAGE P22 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Ribbon|Helix|Helix Arc Repressor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B mkgmsKMpqfnLrWPrEVLDLVrKVAEENGRsvnsEIYQRVMESFKKEGRIG;mkgmsKMpqfnLrWPREVLDLVrKVAEENgrsvnsEIYQRVMESFKKEGRIGA E;F tatagtagaGTGCtTCTATCAT;AATGATAGAAGcactctacTAT 106 651 209 81;0;128;0 5;1;6;0;5;0;0;0;3;8;21;0;0;0;0;4;4;4;33;115 1BG1 1bg1_1_1 9671298 2.25 MUS MUSCULUS 1 1 1 1 0 0 1 Transcription factor Alpha|Beta STAT3B 1 1 1 2 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;C VVTEKQQMLEQHLQDVRKRVQDLEQKMKVVENLQDDFDFNYKTLKSQGDSVTRQKMQQLEQMLTALDQMRRSIVSELAGLLSAMEYVQKTLTDEELADWKRRQQIACIGGPPNICLDRLENWITSLAESQLQTRQQIKKLEELQQKVSYKGDPIVQHRPMLEERIVELFRNLMKSAFVVERQPCmpmhPDRPLVIktgvqFTTKVRLLVKFPELNYQLKIKVCIDKDSGDVAALRGSrKFNILGTNTKVMNMEESNNGSLSAEFKhLTLReQrCGNGGrANCDaSLivtEELHLITFETEVYHQGLKIDLETHSLPVVVIsnicqMPNAWASILWYNMLTNNPKNVNFFTKPPIGTWDQVAEVLSWQFSSTTKRGLSIEQLTTLAEKLLGPGVNYSGCQITWAKFCKENMAGKGFSFWVWLDNIIDLVKkYILALWNEGYIMGFISKERERAILSTKPPGTFLLRFSESSKeGGVTFTWVEKDISGSTQIQSVEPYTKqQLNNMSFAEIIMGYKIMDATNILVSPLVYLYPDIPKEEAFGKYCRAAPLKTKFICVTPF;VVTEKQQMLEQHLQDVRKRVQDLEQKMKVVENLQDDFDFNYKTLKSQGDSVTRQKMQQLEQMLTALDQMRRSIVSELAGLLSAMEYVQKTLTDEELADWKRRQQIACIGGPPNICLDRLENWITSLAESQLQTRQQIKKLEELQQKVSYKGDPIVQHRPMLEERIVELFRNLMKSAFVVERQPCmpmhPDRPLVIktgvqFTTKVRLLVKFPELNYQLKIKVCIDKDSGDVAALRGSrKFNILGTNTKVMNMEESNNGSLSAEFKhLTLReQrCGNGGrANCDaSLivtEELHLITFETEVYHQGLKIDLETHSLPVVVIsnicqMPNAWASILWYNMLTNNPKNVNFFTKPPIGTWDQVAEVLSWQFSSTTKRGLSIEQLTTLAEKLLGPGVNYSGCQITWAKFCKENMAGKGFSFWVWLDNIIDLVKkYILALWNEGYIMGFISKERERAILSTKPPGTFLLRFSESSKeGGVTFTWVEKDISGSTQIQSVEPYTKqQLNNMSFAEIIMGYKIMDATNILVSPLVYLYPDIPKEEAFGKYCRAAPLKTKFICVTPF B;D TGCatttcccgtaaAtct;TGCatttcccgtaaAtct 128 648 284 52;0;232;0 4;0;6;0;0;2;0;0;22;8;8;0;0;0;0;6;2;24;34;168 1BL0 1bl0_1_1 9724717 2.3 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, MARA 1 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A dAITIHSILDWIEDNLESPLSlekVSERSGyskwhLqrmFkkETGHslgqYIrSRKMTEIAQKLKESNEpilYLAERYgfesqqtLtrtFknYFDVpphkYrMTNMQGESRFLHPL B;C GGGGAtttagCAAAacgtggcATC;CCGatgccaCGTtttgctaAATCc 232 645 253 85;0;168;0 3;1;7;0;1;0;2;0;6;7;14;0;0;0;0;8;2;13;46;143 1BPX 1bpx_1_1 9287163 2.4 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Polymerase DNA Polymerase Beta 1 1 1 0 0, 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 A KAPQETLNGGITDMLTELANFEknVSqAIhkYnayRkAASVIAKYPHKIKSGAEAkKlpgvgtkiAEkIDEFLATGKLRkLEKIRQDDTSSSINFLtRvsgigpsaARkFVDEGIKTLEDLRKNEDKLnhhQRIGLKYFGDFEKRIPREEMLQMQDIVLNEVKKVDSEYIATVCGSFRRGAESSGdMdVLLTHPSFTSESTKQPKLLHQVVEQLQKVHFITDTlskgetkFmGVCQLPSKNDEKEYPHRrIdIRLIPKDQYYCGVLyfTGSdIFNkNMrAHALEKGFTINeyTIRPLGVTGVAGEPLPVDSEKDIFDYIQWKYREPKDRSE D;P;T gtcGG;GCTGATgcgc;CCGAcggcgcatcAGC 22 644 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IAKNDFSDIELAAIPFNTLADHYGERLAREQLALEHESYEMGEARFRKMFPLITTLLPKMIARINDWFEevkakrgkrptAFqFLQEIKPEAVAYITIKTTLACLTSADnTtvqaVAsAIGrAIEDEARFGRIRDLEAKHFKKNVEEQLNKRVGHVYKKAFMQVVEADMLSKGLLGGEAwSSWHkEDSihVGVrCIEMLIESTGMVSLHrQNagvvgQdseTIELAPEYAEAIATRAGALAGISPMFQPCVVPPKPWTGITGGGYWANGRRPLALVrthSKKaLMRYEDVYMPEVYKAINIAQNTAWKINKKVLAVANVITKWKHCPVEDIPAIEREELPMKPEDIDMNPEALTAWKRAAAAVYRKDKARKSRRISLEFMLEQANKFANHKAIWFPYNMdwrGRVYAVSMFNPQGNDMTKGLLTLAKGKPIGKEGYYWLKIHGANCAGVDKVPFPERIKFIEENHENIMACAKSPLENTWWAEQDSPFCFLAFCFEYAGVQHHGLSYNCSLPLAFDGSCSGIQHFSAMLRDEVGGRAVNLLPSETVQDIYGIVAKKVNEILQADAINGTDNEVVTVTDENTGEISEKVKLGTKALAGQWLAYGVTRSVTKRSVMTLAYGSKEFGFRQQVLEDTIQPAIDSGKGLMFTQPNQAAGYMAKLIWESVSVTVVAAVEAMNWLKSAAKLLAAEVKDKKTGEILRKRCAVHWVTPDGFPVwqeyKKpIqtrlnlmFLGqfrlqptintnKdSEIDAHkQESGIAPNFVHSQDGSHLRKTVVWAHEKYGIESFALIHDSFGTIPADAANLFKAVRETMVDTYESCDVLADFYDQFADQLHESQLDKMPALPAKGNLNLRDILESDFAFA N;T taatacgactCActa;tatagtgagtCGtatta 124 633 436 113;84;232;7 12;1;16;1;4;3;4;5;16;5;13;0;0;0;0;2;0;12;81;261 1CKQ 1ckq_1_1 0 1.85 ESCHERICHIA COLI 1 1 1 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRI 1 1 1 2 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;E SQGVIGIFGDYAKAHDLAVGEVSKLVKKALSNEYPQLSFRYRDSIKKTEINEALKKIDPDLGGTLFvSnssikPdGGIVEVKDDYGEWRVVLVAeakhqgkDIInIRNGLLvgkRGDQDLmaagnaIerSHknISEIANFMLSESHFPYVLFLEGSNFLTENISITRPDGRVVNLEYnsgiLNrLDrLTAANYGMPINSNLCINKFVNHKDKSIMLQAASIYTQGDGREWDSKIMFEIMFDISTTSLRVLGRDLFEQLTSK;SQGVIGIFGDYAKAHDLAVGEVSKLVKKALSNEYPQLSFRYRDSIKKTEINEALKKIDPDLGGTLFvSnssikPdGGIVEVKDDYGEWRVVLVAeakhqgkDIInIRNGLLvgkRGDQDLmaagnaIerSHknISEIANFMLSESHFPYVLFLEGSNFLTENISITRPDGRVVNLEYnsgiLNrLDrLTAANYGMPINSNLCINKFVNHKDKSIMLQAASIYTQGDGREWDSKIMFEIMFDISTTSLRVLGRDLFEQLTSK B;D TcgcgaattcgCg;TcgcgaattcgCg 28 632 374 122;4;246;2 10;0;0;0;4;0;8;4;16;4;20;0;0;0;0;2;6;24;40;236 1CKT 1ckt_1_1 10385126 2.5 RATTUS NORVEGICUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Alpha Helix HMG, HMG-1 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 1 1 0 0 1 A KPrgkmssyaFFvqTCrEEHkKKHPDasvNfsEfskKCsERwkTMSAKEKGKFEDMaKADKARYEREMKTY B;C CCCTCTggaccttcC;GGAAggtccaGAGAGG 249 631 184 9;34;131;10 0;2;0;1;2;0;1;0;5;5;3;0;0;0;0;0;0;5;50;110 1CW0 1cw0_1_1 10612397 2.3 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease VSR 1 1 1 0 0, 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 A advhDKAtrsknmraiatRDtaieKRLASLLTGQGLAFRVqDaSLPgrPdFVVDEYRCVIftHgCfwhHHHCylFkVpatrTEfwLEkIGknVerDRrdISRLQELGWRVLIVWeCALrgrEkLTDEALTERLEEWICGEGASAQIDTQGIHLLA M;N;O ACgtacctggct;agc;taggtaCGT 224 629 377 72;51;249;5 4;0;7;0;1;0;5;1;4;4;12;0;0;0;0;1;2;19;70;247 1D02 1d02_1_1 10545092 1.7 MYCOPLASMA 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease MunI 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B LSGRLNWQALAGLKASGAEQNLYNVFNAVFEGTKYVLYekPKHLkNLYAQVVLPDDVIKEIFNPLIDLSTTqwgvsPaFAIENTETHKILFGeikrqdGWVEGKDpsaGrgnaHerSCkLFTPGLLKAYRTIGGINDEEILPFWVVFEGDITRDPkrVReITFWYDHYQDNYFMWRPNESGEKLVQHFNEKLKKYLD;KSELSGRLNWQALAGLKASGAEQNLYNVFNAVFEGTKYVLYEkPKHLkNLYAQVVLPDDVIKEIFNPLIDLSTTqwgvsPaFAIENTETHKILFGeikrqdGWVEGKDPsaGrgnaHerSCkLFTPGLLKAYRTIGGINDEEILPFWVVFEGDITRDPkrVReITFWYDHYQDNYFMWRPNESGEKLVQHFNEKLKKYLD C;D gccaattggc;gccaattggC 158 628 290 110;3;175;2 6;0;0;0;4;0;2;4;7;1;10;0;0;0;0;1;5;42;38;170 1D2I 1d2i_1_1 10655616 1.7 BACILLUS SUBTILIS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease BglII 1 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B KIDITDYNHADEILNPQLWKEIEETLLKPLHVkAsdqaskVGSLiFdpvGTnqYIkDELVPKHWKNnIpiPKRFdflgtdIdFGKRDTLVevqfsnyPfLLnNTVrSELFHKSNDIDEEGKVAIIITKGhFPAsnssLyYEqAQNQLNSLAEYNVFDVPIRLVGLIEDFETDIDIVSTTYAdkrysrtITKRDTVKGKVIDTNTPNTrRrkrGTIVTY;KIDITDYNHADEILNPQLWKEIEETLLKPLHVkAsdqaskVGSLiFdpvGTnqYIkDELVPKHWKNnIpiPKRFdflgtdIdFGKRDTLVevqfsnyPfLLnNTVrSELFHKSNDIDEEGKVAIIITKGhFPAsnssLyYEqAQNQLNSLAEYNVFDVPIRLVGLIEDFETDIDIVSTTyAdkrysrtITKRDTVKGKVIDTNTrkrGTIVTY C;D TAttatagatctataa;Tattatagatctataa 79 133 622 135;23;464;0 6;4;5;4;7;0;2;0;32;18;31;0;0;0;0;13;6;40;95;359 1D3U 1d3u_1_1 10570130 2.4 PYROCOCCUS WOESEI 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet TATA Box Binding Protein 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 2 2 0 1 A;B MVDMSKVKLrIenIvAsVDLFAQLDLEKVLDLCPNSkYNpeefpGIiChLDDPkVaLlIfssGklvVtgAkSVQDIERAVAKLAQKLKSIGVKFKRAPQIDVqnMvFsGDIGREFNLDVVALTLPNCEYEpeqfpGViYrVKEPkSvIlLfssGkivCsgAkSEADAWEAVRKLLRELDKY;MVSdaaERnLAFALSELDRITAQLKLPRHVEEEAARLYREAvRKGLirgrSiESVMAACVYAACRLLKVPRTLDEIADIARVDkkeIGrSYrfIARNLNLTPKKLFVKPTDYVNKFADELGLSEKVRRRAIEILDEAYKRGLTsgksPAgLVAAALyIASLLEGEkRtqREVAEVArvtevtVrnrykELVEKLKIKVPIa C;D agagtaAAGtttaaatactTAtat;TAtaagtatttaaactttacTCT 157;163 626 505 36;74;392;3 4;1;3;2;1;0;0;0;17;11;7;0;0;0;0;4;0;36;109;310 1DC1 1dc1_1_1 11250198 1.7 BACILLUS STEAROTHERMOPHILUS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease BsobI 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B KPFENHLKSVDDLKTTYEEYRAGfIAfALEkNKRSTPYIERARALKVAASVAKTPKDLLYLEDIQDALLyASGIsdkAKkfLTEDDKKESINNLIENFLEPAGEEFIDELIFRYLLFQGdsLGgtMrnIagALaqQKLTRAIISALDIANIPYKWLDSRDkKyTNWMDKPEDDYELETFAkGISWTINGKHRTLMYnItVSLVkknVdICLFNCEPQQPEKYLLLGelkggidpagAdehWktANTaLTrIRNKFSEKGLSPKTIFIGAAIehsMAEEIWDQLQSGSLTNSANLTKTEQVGSLCRWIINI;QKPFENHLKSVDDLkTTYEEYRAGfIAfALEkNKRSTPYIERARALKVAASVAKTPKDLLYLEDIQDALLyASGIsdkAKkFLTEDDKKESINNLIENFLEPAGEEFIDELIFRYLLFQGdsLGgtMrnIagALaQQKLTRAIISALDIANIPYKWLDSRDkKyTNWMDKPEDDYELETFAkGISWTINGKHRTLMYnITVSLVkknVdICLFNCEPQQPEKYLLLGelkggidpagAdehWktANTaLTrIRNKFSEKGLSPKTIFIGAAIehsMAEEIWDQLQSGSLTNSANLTKTEQVGSLCRWIINI C;W TAtactcgagtat;atactcgagtat 137 625 540 102;51;381;6 10;0;7;1;4;0;2;2;16;14;24;0;0;0;0;8;2;37;70;343 1DIZ 1diz_1_1 10675345 2.5 ESCHERICHIA COLI 2 1 1 2 0 0 1 Enzyme Glycosylase 3-Methyladenine DNA Glycosylase II 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 1 1 0 0 1 A MYTLNWQPPYDWSWMLGFLAARAVSSVETVADSYYARSLAVGEYRGVVTAIPDIARHTLHINLSAGLEPVAAECLAKMSRLFDLQCNPQIVNGALGRLGAARPGLRLPGCVDAFEQGVRAILgqlvsVAmAAKLTArVAQLYGERLDDFPEYICFPTPQRLAAADPQALkALgmplkrAEALIHLANAALEGTLPMTIPGDVEQAMKTLqTfPgigrwtANYFALRGWQAKDVFLPddyLIkqRFPGMTPAQIRRYAERWKPWRSYALLHIWYTEGWQPDEA E;F GACATgatgcCT;GGCaatcaTGTCA 7 132 164 19;18;125;2 0;0;2;0;0;0;0;0;5;1;13;0;0;0;0;0;1;4;43;95 1DMU 1dmu_1_1 9736624 2.2 BACILLUS SUBTILIS 1 1 1 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease BglI 1 1 1 2 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B MYNLHREKIFMSYNQNKQYLEDNPEIQEKIELYGLNLLNEVISDNEEEIRADYNEANFLHPFWMNYppldrgkmpkGdqIPwieVGeKAVGSKLTRLVSQREDITVREIGLPTgPdERYLLTSPTIYSLTNGFTDSIMMFVdiksvgPrdsDyDLVLsPnqVSGNGDWAQLEGGIQNNQQTIQgprsSqIFLPTIPPLYILSDGTIAPVVHLFIKPIyAMRSLTKGDTGQSLYKIKLASVPNGLGLFCNPGYAFDSAYKfLFrpgkddrTkSLLqkrVrVdLrVLDKIGPRVMTIDMDK;MYNLHREKIFMSYNQNKQYLEDNPEIQEKIELYGLNLLNEVISDNEEEIRADYNEANFLHPFWMNYppldrgkmpkGdqIPwieVGeKAVGSKLTRLVSQREDITVREIGLPTgPdERYLLTSPTIYSLTNGFTDSIMMFVdiksvgPrdsDyDLVLsPnqVSGNGDWAQLEGGIQNNQQTIQgprsSqIFLPTIPPLYILSDGTIAPVVHLFIKPIyAMRSLTKGDTGQSLYKIKLASVPNGLGLFCNPGYAFDSAYKfLFrpgkddrTkSLLqkrVrVdLrVLDKIGPRVMTIDMDK E;F atcgcctaataggcgaT;atcgcctaataggcgaT 138 624 648 124;36;484;4 18;0;6;0;6;0;6;4;28;12;30;0;0;0;0;8;4;42;94;390 1DP7 1dp7_1_1 10706293 1.5 1 2 1 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix hRFX1 1 1 1 2 0, 0 0 0 0 0 1 1 0 0 1 P TVQWLLDNYETAEGVSLPrSTLYNHYLLHSQEQKLEPvnaasFgkLIrSVFMGLRtrrlgtrgNskyHyYGLRIKA D;E CGTaccaggtAaCG;cgtaCCAggtaACG 189 131 153 27;13;113;0 4;0;4;1;1;0;0;0;9;2;4;0;0;0;0;2;1;8;13;104 1DSZ 1dsz_1_1 10698945 1.7 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Hormone Nuclear Receptor, Retinoic Acid Receptor 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B PCFVCQdkSsGyhygVSACegCkgfFrrSIqkNmVyTCHRDKNCIINKVTrnRCqYCrLQKCFEVGMSKEsvrNd;GSFTKHICAICGdrSsGkhygVYSCegCkgfFkrTVrkDlTyTCRDNKDCLIDkRQrnRCqYCrYQKCLAMGMKREavqeerqr C;D caggtCaaaggtCAG;ctgaccTttgaccTg 46;247 622 317 81;3;233;0 8;1;11;0;5;0;2;0;26;1;12;0;0;0;0;1;1;29;33;187 1DUX 1dux_1_1 10742173 2.1 HOMO SAPIENS 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Ets Domain, ELK-1 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 C VtlWQFLLQLLREQGNGHIISWTSRDGGEFKLVDAeEVARLwgLRkNkTnmnydklsraLryyydkNIIRkVsGqkfVyKFVSYPE A;B TGaccggaAGtgT;ACacttccGGTCA 92 130 168 52;1;114;1 2;0;1;0;4;0;1;0;6;1;2;0;0;0;0;3;3;16;38;91 1E3O 1e3o_1_1 11583619 1.9 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Oct-1 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 C EEPSDLEELEQFAKTFKQRRIKLGFTQGDVGLAMGKLYGNdfsqttIsrFEALnlsFknMSklKPLLEKWLNDAEkrtsiETNIrVALEKSFMENQkpTsEDiTLIAEQLNMEKevIrvwFsnRrqkEkrIN A;B atgcatgAGGA;TcctcatgcaT 227 619 208 64;3;141;0 6;0;6;1;10;0;0;0;4;10;9;0;0;0;0;6;1;15;25;115 1EGW 1egw_1_1 10715212 1.5 HOMO SAPIENS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Alpha Helix MADS box, MEF2A 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B grkkiQITRIMDErnRQvtFTkrKFgLMkKAYeLSVLCDCEIALIIFNSSNKLFQYASTDMDKVLLKYTEY;grkkiQITRIMDErnRQvtFTkrKFgLMkKAYeLSVLCDCEIALIIFNSSNKLFQYASTDMDKVLLKYTEYN E;F aAAgctatTatTagctT;TaAgctaAtaAtagcTT 98 128 236 21;43;172;0 3;0;6;0;0;4;0;4;14;2;9;0;0;0;0;0;0;12;31;151 1EMH 1emh_1_1 10805771 1.8 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Glycosylase Uracil DNA Glycosylase 1 1 1 0 1, 0 1 0 0 0 1 1 0 0 1 A MEFFGESWKKHLSGEFGKPYFIKLMGFVAEERKHYTVYPPPHQVFTWTQMCDIKDVKVVILGqDPyhGPNqAHGLCFSVQRPVPPPpsLENIYkELSTDIEDFVHPGHGDLSGWAKQGVLLLNAVLTVRAhQaNSHkeRGWEQFTDAVVSWLNQNSNGLVFLLWgsyAqKKGSAIDRKRHHVLQTahPsplsVyrGFFGCRHFSKTNELLQKSGKKPIDWKEL B;C TgtatcTT;aaAGAtaaca 45 618 141 17;14;108;2 1;0;2;0;0;0;0;0;3;10;4;0;0;0;0;1;0;2;34;84 1EQZ 1eqz_1_1 11092917 2.5 GALLUS GALLUS 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein DNA Packaging Histone 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 8 3 3 1 A;B;C;D;E;F;G;H sGrgkQGgKARakaksrsSrAGLQFPVgrVHrLLrKGNYAervgaGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNkktrIiPRHLQLAIRNDEELNKLLGKVTIAQGGVLPNIQAVLLpKKtDShka;VTKTqKKGdkkrkksrkesYsiyVykVLKQVHPDTgissKAMGIMNSFVNDIFERIAGEASRLAHYNkrstItSrEIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSSk;aPatGgVKkphryrpgtvaLreIrrYQkSTELLIrklpFqrLVrEIAQDFKTdLrfqsSAVMALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAkrvtImPkDIQLARRIRGERA;GAkRhrkvLrDNIQGItkpaIrrLArRGGVkrisglIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAkrktVtAMDVVYALKRQGRTLYGFGG;GRGKQGGKARAkaksrSSrAGLQFPVgrVHrLLrkGNYAervgaGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNkktrIiPRHLQLAIRNDEELNKLLGKVTIAQGGVLPNIQAVLLpkKTDshKAKAK;tktQKKGdkkrkksrkesYsiyVykVLKQVHPDTgisskAMGIMNSFVNDIFERIAGEASRLAHYNkrstItSrEIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSSK;PRKQLATKaarkSAPATGGvKkphryrpgtvalreIrrYQkSTELLIrklpFqrLVrEIAQDFKTdLrfqsSAVMALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAkrvtImPkDIQLARRIRGERA;KGlGkGGakrHrKVLRDNIqGItkpAIrrLArRGGVkrisgLIyEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAkrktVtAMDVVYALKRQGRTLYGFGG I;J aTCaatatccaCCTGCAGattCTaccaaaagtgTATTtggaaACTgctCcatcAAAAGgcatGTtcagcggaattCCGctgaacATGCCtttTGATggagcagttTCCAAataCACTtttggtagAATCTgcaGGTGGATattgat;ATCaatatccaCCTGCAgattCTaccaaaagtgTATTtggaaACtgctccatCAAAAGGcatgtTcagcggaaTTCCGCtgaacatGCcttttGATggagcagtTTCCAaataCACTtttggtagaATCtgcaGGTGGATAttgat 9;11;12;86;231 3 1577 37;73;1467;0 21;0;16;1;1;0;0;0;86;28;100;0;0;0;0;1;4;137;232;950 1ESG 1esg_1_1 10882125 1.9 BACILLUS AMYLOLIQUEFACIENS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease BamHI 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B MEVEKEFITDEAKELLSKDKLIQQAYNEVKTSICSPIWPATSKTFTINNTEKNCNgvvPIkELCYTLLEDTYNWYREKPLDilKLeKKKgGPIDVYKEFIENSELKRVGMEFEtgnIssAHrSMNKLLLGLKHGEIDLAIILMPIKQLAYYLtdrVTNFEELEPYFELTEGQPFIFIGFNAEAYNSNVPLIPkgsdGMSKRSIKKWKDK;MEVEKEFITDEAKELLSKDKLIQQAYNEVKTSICSPIWPATSKTFTINNTEKNCNGVvPIKELCYTLLEDTYNWYREKPLDILKLeKKKGGPIDVYKEFIENSELKRVGMEFEtgnISsAHrSMNKLLLGLKHGEIDLAIILMPIKQLAYYLtdrVTNFEELEPYFELTEGQPFIFIGFNAEAYNSNVPLIPkgsdGMSKRSIKKWKDKVEN C;D tggattCa;tgaatcCa 40 614 126 28;1;97;0 4;1;6;0;0;0;0;0;3;9;7;0;0;0;0;3;1;11;9;72 1EWQ 1ewq_1_1 11048710 2.2 THERMUS AQUATICUS 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein Repair Protein DNA Mismatch Repair Protein MutS 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B EGLKGEGPGPLpplLQQYVELRDQYPDYLLLFQvgdfYeCFGEDAERLARALGlvLthktskdFTTPAgIpLraFEAyAERLLKGFRLAVADqVEPaEEAEglvRrEVTQLLTPGTLLQESLLPREANYLAAIATGDGWGLAFLDVSTGEFKGTVLKSKSALYDELFRHRPAEVLLAPELLENGAFLDEFRKRFPVLSEAPFEPEGEGPLALRRARGALLAYAQRTQGGALSLQPFRFYDPGAFRLPEATLRALEVFEPLRGQDTLFSVLDETRTAPGRRLLQSWLRHPLLDRGPLEARLDRVEGFVREGALREGVRRLLYRLADLERLATRLELGRASPKDLGALRRSLQILPELRALLGEEVGLPDLSPLKEELEAALVEDPPLKVSEGGLIREGYDPDLDALRAAHREGVAYFLELEERERERTGIPTLKVGynavFGYyLEVTRPYYERVPKEYRPVqTlkdrQrYTLPEKEKEREVYRLEALIRRREEEVFLEVRERAKRQAEALREAARILAELDVYAALAEVAVRYGYVRPRFGDRLQIRAGRHPVVERRTEFVPNDLEAHELVLITGPNAGKSTFLRQTALIALLAQVGSFVPAEEAHLPLFDGIYTRIGAGKSTFVEEEVALILKEATENSLVLLDEVGRGTSSLDGVAIATAVAEALHERRAYTLFATHYFELTALGLPRLKNLHVAAREEAGGLVFYHQVLPGPASKSYGVEVAAAGLPKEVVARARALLQAAAR;EGLKGEGPGpLppllQQYVELRDQYPDYLLLFQvgDfYECFGEDAERLARALGLvLtHktskdFTTPAGIPLrAFEAYAERLLKGFRLAVADqVEPvRrEVTQLLTPGTLLQESLLPREANYLAAIATGDGWGLAFLDVSTGEFKGTVLKSKSALYDELFRHRPAEVLLAPELLENGAFLDEFRKRFPVLSEAPFEPEGEGPLALRRARGALLAYAQRTQGGALSLQPFRFYDPGAFRLPEATLRALEVFEPLRGQDTLFSVLDETRTAPGRRLLQSWLRHPLLDRGPLEARLDRVEGFVREGALREGVRRLLYRLADLERLATRLELGRASPKDLGALRRSLQILPELRALLGEEVGLPDLSPLKEELEAALVEDPPLKVSEGGLIREGYDPDLDALRAAHREGVAYFLELEERERERTGIptLkVGYnavfGYYLEVtrpyYERVPKEYRPVqTlkdrQrYTLPEKEKEREVYRLEALIRRREEEVFLEVRERAKRQAEALREAARILAELDVYAALAEVAVRYGYVRPRFGDRLQIRAGRHPVVERRTEFVPNDLEAHELVLITGPNAGKSTFLRQTALIALLAQVGSFVPAEEAHLPLFDGIYTRIGAGKSTFVEEEVALILKEATENSLVLLDEVGRGTSSLDGVAIATAVAEALHERRAYTLFATHYFELTALGLPRLKNLHVAAREEAGGLVFYHQVLPGPASKSYGVEVAAAGLPKEVVARARALLQA C;D GCGACGCtagcgtgcgGctcgTC;GGacgagccgccgctagcgTCG 125 613 346 18;22;304;2 1;0;0;0;0;0;0;1;14;3;19;0;0;0;0;0;0;24;66;218 1EYU 1eyu_1_1 10903853 1.78 PROTEUS VULGARIS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease PvuII 1 1 1 0 2, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SHPDLNKLLELWPHIQEYQDLALKHGInDIFqdnGGkLLQVLLITGLTVLPGRegnDAVDNAGQEYelksinIDltKgFsthhHMNPviIAkyRQVPWIFAIYRGIAIEAIYRLEPKDLEFyYDkWERkWYSdGHkdinnpkIpVKYVMEHGTKIY;SHPDLNKLLELWPHIQEYQDLALKHGInDIFqdnGGKLLQVLLITGLTVLPgndAVDNAGQEYelksinIDltKgFsthhHMNPviIAkyRQVPWIFAIYRGIAIEAIYRLEPKDLEfyYDkwERkWYSdGHKDinnpkIpVkYVMEHGTKIY C;D tgaccagctggtC;tgaccagctggtC 41 612 422 150;11;259;2 7;4;9;0;5;3;6;3;17;4;9;0;0;0;0;5;6;23;52;269 1F2I 1f2i_1_1 11427887 2.35 MUS MUSCULUS 3 1 1 3 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zif268 Zinc Finger 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 G;H NLLNYVVPkMrPYACPVESCDrrfsrsdeLTrhIriHTGQkPFQCRICMrnfsrsdhLtthIrTHT;NLLNYVVPkMrPYACPVESCDrrfsrSdeLTrhIriHTGQkPFQCRICMrnfsrsdhLttHIrTHT A;B atgggcgcgccCAT;atgggcgcgccCAT 58 125 289 112;3;171;3 12;1;14;0;8;0;0;0;5;17;4;0;0;0;0;4;0;33;45;146 1F4K 1f4k_1_1 11224562 2.5 BACILLUS SUBTILIS 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein Replication Replication Termination Protein 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B stGfLVkqrAFLKLYMITMTEQERLyglKLLEVLRSEFKEIGFKPnhteVyrSLhELLDDGILKqIkVkKEGAklqevvLyQFKDYEAAKLYKKQLKVELDRSKKLIEKALSDNF;stGfLVkqrAFLKLYMITMTEQERLyglKLLeVLRSEFKEIGFKPnhteVyrSLhELLDDGILKqIkVkKEGAKlqevvLyQFKDYEAAKLYKKQLKVELDRSKKLIEKALSDNF D;E CtatgaaCATAatgttCATag;CtatgaaCATTatgttCATAg 51 608 346 83;5;258;0 2;1;4;4;2;0;1;0;17;4;19;0;0;0;0;2;0;20;70;200 1F6O 1f6o_1_1 11106395 2.4 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Glycosylase 3-Methyladenine DNA Glycosylase I 1 1 1 0 1, 1 1 0 0 0 1 1 0 0 1 A KGHLTRLGLEFFDQPAVPLARAFLGQVLVRRLPNGTELRGRIVETEAYLGPEDEAAhSrGGrQtprNRGMFMKPGTLYVyiiygmyFcMNISSQGDGACVlLrALEPLEGLETMRQLrSTlsRVlKDReLCsgpskLCQALAINkSFDQRDLAQDEAVWLERGPLEPSEPAVVAAARvgVGhAGEWARKPLRFYVRGSPWVsvVDRVAEQD D;E GACATgttgcCT;GGCAatcatgtcA 115 607 189 17;29;139;4 0;0;0;0;0;1;1;1;1;2;7;0;0;0;0;0;0;11;38;127 1FIU 1fiu_1_1 10966652 1.6 NEISSERIA GONORRHOEAE 2 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease NgoMIV 1 1 1 0 1, 1 0 2 0 0 0 2 1 1 1 A;B MQPLFTQERRIFHKKLLDGNILATnNRGVVsNadgsntrSFNIAKGIADLLHSETVSErlpgqtsgnAfeAICSEFVQSAFEKLQHIRPGDWNVKQVGsrNrLEIARYQQYAHLTALAKAAEENPELAAALGSDYTItPdIIVTRNLIADAEINRNEFLVDENIATYASLRAGNGNMPLLHASISckwtIrsdrAQnARSeGLNLVRNRKGRLPHIVVVTAEPTPsrISSIALGTGEIDCVYHFALYELEQILQSLNYEDALDLFYIMVNGKRLKDISDLPLDLAV;MQPLFTQERRIFHKKLLDGNILATnNrGVVsNAdgsntrSFNIAKGIADLLHSETVSErlpgqtsgnAfeAICSEFVQSAFEKLQHIRPGDWNVKQVGsrNrLEIARYQQYAHLTALAKAAEENPELAAALGSdYTiTPdIIVTRNLIADAEINRNEFLVDENIATYASLRAGNGNMPLLHASISckwtIrsdrAQnARSeGLNLVRNRKGRLPHIVVVTAEPTPsrISSIALGTGEIDCVYHFALYELEQILQSLNYEDALDLFYIMVNGKRLKDISDLPLDLAV E;F;I;J Tgcg;Tgcg;ccggcgc;ccggcgc 71 123 431 115;27;289;0 7;0;4;1;18;2;0;2;18;18;11;0;0;0;0;12;0;37;46;255 1FJL 1fjl_1_1 7671301 2 DROSOPHILA MELANOGASTER 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Paired Protein Pax 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B kQrrsrtTfSASQlDELERAFERTQypDiYTrEELAQRTNLTEArIqvwFqnRrarLrKQHTSVS;QrrsrtTfSASQlDELERAFERTQyPDiYTrEELAQRTNLTeArIqvwFqnRrarLrK D;E Aataatctgattac;Tgtaatcagattat 99 606 363 49;35;279;0 10;0;18;0;2;0;0;0;27;2;9;0;0;0;0;2;0;27;55;211 1FYL 1fyl_2_1 11599025 2.1 KLUYVEROMYCES LACTIS 2 2 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Heat Shock Factor Protein 2 1 1 2 0, 0 0 0 0 0 1 1 0 0 1 B RPAFVNKLWSVNDKSNEKFIHWSTSGESIVVPNreRFvQEVLPKYFKHSnfasFVrQLNYGWHKVDSRWEFEN D;E AGGAACGTTCC;AggaACGTTCC 34 122 36 0;0;36;0 0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;4;0;0;0;0;0;0;6;2;23 1G9Y 1g9y_1_1 11276249 2.05 CHLAMYDOMONAS REINHARDTII 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease I-CreI 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B NTKYNKEFLLYLAGFVDgdgsiiaqikpnQsykFKHqlsLtFqVtqkTQrRWFLDKLVDEIGVgyVrdrGsvSDYiLseiKPLHNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKIIEQlPSAkESPDKFLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAVLD;NTKYNKEFLLYLAGFVDgdgsIiaqikpnQsykfKHqlsLtFqVtqkTQrRWFLDKLVDEIGVgyVrdrGsvSDYiLseikPLHNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKIIEQlPSAkESPDKFLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAVLD C;D cgaaactgtctcacgacgttttGC;gcaaaacgtcgtgagacagttTCG 4 11 666 185;17;463;1 14;9;14;6;12;0;0;0;11;13;24;0;0;0;0;3;3;30;131;396 1GD2 1gd2_1_1 11017199 2 SCHIZOSACCHAROMYCES POMBE 2 1 1 3 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, PAP1 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 E;F;I;J DqepSSKrkAqnrAaqrafrKrKEDHLKALETQVVTLKELHSSTTLENDQLRQKVRQLEEELRIL;epSSKrkAqnrAaqrafrKrkEDHLKALETQVVTLKELHSSTTLENDQLRQKVRQLEEELRILK;rKAQNRETQVVTLKELHSSTTLENDQLRVRQLEEELRILK;TQVVTLKELHS A;B Aggttacgtaacc;aggttacgtaacC 100;209;266 117 256 121;0;134;1 12;0;11;0;4;0;2;0;11;0;1;0;0;0;0;2;4;23;49;137 1GD2 1gd2_2_1 11017199 2 SCHIZOSACCHAROMYCES POMBE 2 1 1 3 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, PAP1 2 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 G;H;I;J qepSSKrkAqnrAaqrafrKrkEDHLKALETQVVTLKELHSSTTLENDQLRQKVRQLEEELRIL;qepSSKrkAqnrAaqrafrKrkEDHLKALETQVVTLKELHSSTTLENDQLRQKVRQLEEELRIL;RKaQNRETQVVTLKELHSSTTLENDQLRVRQLEEELRILK;TQVVTLKELHS C;D aggttacgtaacC;AggttacgtaacC 100;209;267 117 258 120;0;137;1 12;0;10;0;4;0;2;0;10;0;1;0;0;0;0;2;4;19;48;146 1GTW 1gtw_1_1 0 1.85 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, C|EbpBeta 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B DkHSDeyKirrErnnIavrksrdkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQ;DkHSDeyKIrrernnIavrksrDkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQLP C;D AatgtggcgcaaTCCT;TaggattgcgccaCAT 23 24 243 98;0;145;0 8;0;9;0;3;0;0;0;9;4;0;0;0;0;0;5;4;32;33;136 1GXP 1gxp_1_1 12015152 2.5 ESCHERICHIA COLI 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Alpha Helix PhoB 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B AVEEVIEMQGLSLDPTSHRVMAGEEPLemgpteFKLLHFFMTHPERVYSrEQLLNHVwGTNVyveDrtVdvhIrrLrKALePGGHDRMVQtvrgTgyRFSTRF;EEVIEMQGLSLDPTSHRVMAGEEPLemgpteFKLLHFFMTHPERVYsrEQLLNHVwGTNVyvedrtVdvhIrrLrKALePGGHDRMVQtvrgtgyRFSTRF C;D GAGctgtcaTAAagttgtcaCGG;cccgtgaCAACtttatgaCAGCT 91 603 319 92;13;209;5 8;0;10;0;0;0;2;0;12;11;13;0;0;0;0;2;1;29;48;183 1H6F 1h6f_1_1 12005433 1.7 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet T Box, TBX3 1 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B DPKVHLEAKELWDQFHKRGTEMvitksgrrmfPPFKVRCSGLDKKAKYILLMDIIAADDCrYkfhNSRWMVAGKADPEMPKRMYIHPDSPATGEQWMSKVVTFhKLkLTnNISDKHGFTILNsmHKYQPRFHIVRANDILKLPYSTFRTYLFPETEFIAVtayqNdKItQLkiDNnpfakgfRD;KDDPKVHLEAKELWDQFHKRGTEMvitksgrrmfPPFKVRCSGLDKKAKYILLMDIIAADDCRYkfHNSRWMVAGKADPEMPKRMYIHPDSPATGEQWMSKVVTFHKLkLTnNISDKHGFTILNsmHKYQPRFHIVRANDILKLPYSTFRTYLFPETEFIAVtayqNdKItqLkiDNnpfakgfRD C;D TAatttcACacctaggtgtGAAAT;TAatttcACacctaggtgtgAAAT 161 601 376 41;26;309;0 2;0;2;0;0;0;2;0;19;8;8;0;0;0;0;4;4;15;86;226 1H89 1h89_1_2 11792321 2.45 MUS MUSCULUS, HOMO SAPIENS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, C|EbpBeta 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 C qCqhrWqkvLNPELIkgpwTKEEDQRVIKLVQKYGpkrwsvIAKHLKGrIGkqCrerWhnhLNPEVKkTSwTEEEDRIIYQAHKRLGnrwaEIAkLLPGRTdnAIknhWnstMRr D;E GATGTGGCGCAATCCttaacggaCTG;ccagtccgttAAGGATTGCGCCACAT 173 599 194 61;0;132;1 7;0;3;0;5;0;0;0;7;10;10;0;0;0;0;5;1;16;19;111 1HCQ 1hcq_1_1 8221895 2.4 HOMO SAPIENS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Hormone Nuclear Receptor, Estrogen Receptor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B MKETRYCAVCNdYAsgyhyGVwSCegCkafFkrSiqGHNDyMCPATNQCTIDKNRrkSCqACrLRKCYEVGMMk;TRYCAVCNdYAsgyhyGVwSCegCkafFkrSiqGHnDyMCPATNQCTIDkNRrkSCqACrLRKCYEVGMMk C;D CcaggtCACAgtgacCTG;CcaggtCACTgtgacCTG 97 596 243 66;0;177;0 10;0;9;0;2;0;1;0;13;0;8;0;0;0;0;2;0;21;25;152 1HCR 1hcr_1_1 8278807 2.3 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Recombinase Hin Recombinase 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A grpraINKHEQEQISRLLEKGHPrqQLAIIFgigvstLyryFpassikkrmn B;C TGTttttgataaga;TcttatcaAaaaC 65 594 300 32;49;219;0 2;1;2;1;1;4;2;3;11;2;16;0;0;0;0;1;1;5;58;190 1HLV 1hlv_1_1 11726497 2.5 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein Centromeric Protein Centromere Binding Protein, CENP-B 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A MgpkrrqlTfREkSRIIQEVEENPDLrkgEIARRFNippstlstilknKRaiLASERKYGVASTcrktnklspyDKLEGLLIAWFQQIRAAGLPVKgiILkEKALRIAEELGMDdftAsngwldrFrrrRS B;C GccttcGttggaaacgggaTT;aatccCGTTtccaacgaAGGC 228 593 409 83;22;303;1 5;3;8;3;3;2;1;1;17;10;18;0;0;0;0;4;4;19;73;238 1HU0 1hu0_1_1 12592398 2.35 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Glycosylase 8-Oxoguanine DNA Glycosylase 1 1 1 0 0, 0 1 0 0 0 1 1 0 0 1 A GSEGHRTLASTPALWASIPCPRSELRLDLVLPSGQSFRWREQSPAHWSGVLADQVWTLTQTEEQLHCTVYRSQASRPTPDELEAVRKYFQLDVTLAQLYHHWGSVDSHFQEVAQKFQGVRLLRQDPIECLFSFICSsnnnIarITGMVErLCQAFGPRLIQLDDVTYHGFPSLQALAGPEVEAHLrKLglgyrARyVSASARAILEEQGGLAWLQQLRESSYEEAHKALcIlpgvgtkvADCICLMALDKPQAVPvdvhMWHIAQRDYSWHPTTsqaKGPspqTnKELGNFFRSLWGPYAGWAQAVLFSADLRQ D;E GgtAGAcctggACGC;GCGTCCagtctACC 16 22 229 32;34;153;10 2;1;6;0;1;1;1;0;8;2;20;0;0;0;0;2;0;3;36;146 1HWT 1hwt_2_1 9886294 2.5 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Heme Activator Protein 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 G;H rIplsCTICrKrkvkcDkLRPHCQQCTktGVAHLCHYmEQTwAEEAEKELLKDNELKKLRERVKSLEKTL;krnriplsCTICrkrkvkcDkLRPHCQQCTKTGVAHLCHYMEqtwAEEAEKELLKDNELKKLRERVKSLEKTL E;F gcgcTATtatcgcTATTagC;GCTAAtagcgataatagcgC 57 116 269 56;17;196;0 5;0;8;0;0;0;6;0;10;4;13;0;0;0;0;0;4;13;43;163 1I3J 1i3j_1_1 11447104 2.2 BACTERIOPHAGE T4 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease I-TevI 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A KFCKCGVriqTsaytcskCrNrsgENnsffnhkhSDItkSkisEkmkgkkpsnikKISCDGVIFDcaaDAArHFkissglVtyrVksDkwNWFyIN B;C TTCTtgggtctaccgtttAAT;aattaaACGgtagacccaaga 175 592 448 43;56;349;0 8;3;3;1;4;1;0;1;17;12;21;2;0;0;1;3;2;12;91;266 1IAW 1iaw_1_1 11473254 2.4 NOCARDIA AEROCOLONIGENES 1 2 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease NaeI 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B EPDDDLERVRATLYSLDPDGDRTAGVLRDTLDQLYDGQRTGRWNFDQLHKTEKTHMGTLVEINLHREFQFGDGFETDYEIAGVQVDCKFSMSQGAWMLPPESIGHICLVIWASDQQCAWTAGLVKVIPQFLGTANRDLKRRLTPEGRAQVVKLWPDHGKLQENLLLHIPGDVRDQIFSAKssrgnqhgqaRVnELFRRVHGRLIGrAVIATVAqqddFmkrvrgsgGArSiLRPEGIIILghqdNdpKVANDLGLPVPRkgqvVAARVVPADEGDQRQTAEIQGRRWAVAVPGDPIVEAPvvPr;EPDDDLERVRATLYSLDPDGDRTAGVLRDTLDQLYDGQRTGRWNFDQLHKTEKTHMGTLVEINLHREFQFGDGFETDYEIAGVQVDCKFSMSQGAWMLPPESIGHICLVIWASDQQCAWTAGLVKVIPQFLGTANRDLKRRLTPEGRAQVVKLWPDHGKLQENLLLHIPGDVRDQIFSAKssrgnqhgqaRVnELFRRVHGRLIGrAVIATVAqqddFmkrvrgsgGArsiLRPEGIIILghqdNdPKVANDLGLPVPRkgqvVAARVVPADEGDQRQTAEIQGRRWAVAVPGDPIVEAPvvPr C;D gccacgccggcgtggc;TGccacgccggcgtggc 69 590 494 105;35;354;0 10;0;15;0;4;1;2;0;28;9;25;0;0;0;0;4;1;28;60;307 1IG7 1ig7_1_1 11580277 2.2 MUS MUSCULUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Msx-1 1 1 1 0 2.1, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A rkprtPfTTAQlLALeRKFRQKQylSiAErAEFSSSLSLTEtqVkiwFqnRrakAkrL B;C CActaattGAAGG;TCCttcaattagtGAC 256 588 172 29;13;130;0 6;0;7;0;2;0;0;0;11;2;5;0;0;0;0;2;0;11;23;103 1IGN 1ign_1_1 8620531 2.25 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 2 1 1 2 0 0 1 Structural|DNA Binding protein Telomeric Protein Telomere Binding Protein, RAP1 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A kasfTDEEDEFILDVVRKNPtRrtthtLYDEISHYVPnhtGnsIrhrFrVyLSKRLEYVYEVDKFGKLVRDDDGNLIKTKVLPPsikrkfSADEDYTLAIAVKKQFYRDLFQIDPDTGRSLIRTQSRrgpiareffkHFAEEHAahtenaWrdrfrkfLLAYGIDDYISYYEAEEPMknltPtpgnyns C;D CCGcacacccacacacCAG;cctggtGTgtgggtGTgcg 160 115 430 128;8;294;0 10;0;9;0;3;0;5;2;15;16;24;0;0;0;0;4;5;11;75;251 1IHF 1ihf_1_1 8980235 2.2 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein DNA Bending Integrator Host Factor 1 1 1 0 1, 1 0 1 0 0 0 2 1 1 1 A;B aLtkaEMSEYLFDKLGLSkRDAkELVELFFEEIRRALENGEQVkLsgfGnFDLrdknqrpgrnpkTgeDipitArRvvtFrpgqkLkSRVENASPK;MtkseLIeRLATQQSHIPaKTVEDAVkEMLEHMASTLAQGErIeirgFgsFsLhyraPrtgrnpkTGDKvElEGkYvPhFkPgkeLrDRANIYG C;D;E cGGTGCaacaaattgataagcaatgCTTTtttGGC;ggCCAAAAaagCAtt;GcttatcaattTGttgcaCC 63;64 8 472 29;87;354;2 9;0;13;0;0;3;1;1;35;8;14;0;0;0;0;1;1;30;82;274 1IXY 1ixy_1_1 12445783 2.5 BACTERIOPHAGE T4 2 1 1 2 0 0 1 Enzyme Glucosyltransferase DNA Beta Glucosyltransferase 1 1 1 0 0, 0 1 0 0 1 1 1 0 0 1 A MKIAIINMgnnVinFktvpsSETIYLFKVISEMGLNVDIISLkNGVYTKSFDEVDVNDYDRLIVVNSsinffggkPnLAILSAQKFMAKYKSKIYYLFTDIrlPFSQSWPnVKnrPWAYLYTEEELLIKSPIKVISQGINLDIAKaaHkkVDNVIEFEYFPIEQYKIHMNDFQLSKPTKKTLDVIYGGsfRsGqRESKMVEFLFDTGLNIEFFGnArEkqFkNPKYPWTKAPVFTgkIPMNMVSEKNSQAIAALIIGDknYNDNFITLRVWETMASDAVMLIDEEFDTKHRIINDARFYVNNRAELIDRVNELKHSDVLRKEMLSIQHDILNKTRAKKAEWQDAFKKAIDL C;E GATactagaTAG;ctatctgagtatc 37 587 173 48;18;100;7 4;1;3;0;1;2;1;1;13;4;3;0;0;0;0;2;1;9;21;107 1J1V 1j1v_1_1 12682358 2.1 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein Replication Replication Initiator Protein dnaA 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A VTIDNIQKTVAEYYKIKVADLLSkrrsrSVarPrqAALAkELTNHslpeIGDAFggrdhttVlhaCrkIEQLREESHDIKEDFSNLIRTLSS B;C TGTtatccacAGG;CctgtGGAtaaca 242 585 184 41;7;136;0 3;0;3;0;3;0;0;0;10;4;8;0;0;0;0;4;0;12;37;100 1J3E 1j3e_1_1 14704346 2.5 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein Replication Origin Binding Protein, SeqA 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 1 1 0 0 1 A PLGSAMRELLLSDEYAEQKravnRFMLLLSTLYSLDAQAFAEATESLhgrtrVyFAADEQTLLKNgnqTkPkHVPGTPYWVItntntGrkCsMIEHIMQSMQFPAELIEKVCGTI B;C AaggtCCAa;TtggagcCTt 234 584 143 33;2;108;0 4;0;7;0;0;1;0;0;5;5;10;0;0;0;0;0;0;8;17;86 1J75 1j75_1_1 11524677 1.85 MUS MUSCULUS 1 2 1 1 0 1 1 Structural|DNA Binding protein Zalpha DLM-1|DAI 1 1 1 2 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A NLEQKILQVLSDDGGPVkiGQLVKKCQVPkkTLnqVLyRLKKEDRVSSPEpaTwSIG B;E tCgcgcg;TCGCgCg 103 114 72 6;0;66;0 0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;3;0;0;0;0;0;0;3;13;48 1JE8 1je8_2_1 12352954 2.12 ESCHERICHIA COLI 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Response Regulator Protein NARL 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 E;F ERDVNQLtprERDILKLIAQGLpnkIARRLDitestVkvhvkhlkKKlksrvEAAVWVHQERIF;RDVNQLtprERDILKLIAQGLpnkIARRLDitestVkvhvkhlkKKlksrvEAAVWVHQERIF G;H cgtacCCATTaatgggtACG;cgtaccCATTaatgggtACG 32 6 309 84;0;225;0 8;0;6;0;0;0;2;0;6;17;11;0;0;0;0;0;4;15;51;189 1JEY 1jey_1_1 11493912 2.5 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein Repair Protein Ku Protein 1 1 1 3 0, 0 1 0 0 0 0 2 2 1 1 A;B gRDSLIFLVDASKAMFESQSEDELTPFDMSIQCIQSVYISKIIssDrDLLAVVFYGTEKDKNSVNFKNIYVLQELDNPGAKRILELDQFKGQQGQKRFQDMMGHGSDYSLSEVLWVCANLFSDVQFKMsHKRIMLFTNEDNPHGNDSAKASRARTKAGDLRDTGIFLDLMHLKKPGGFDISLFYRDIISVHFEESSKLEDLLRKVRAKETRKralsrlKLKLNKDIVISVGIYnLVqkAlkPppIkLYRETNEPVKTKtRTFNTSTGGLLLPSDTKrSQIYGSRQIILEkEETeELkRFDDPGLMLMGFKPLVLLKKHHYLrPSlFVYPEESLVIGSSTLFSALLIKCLEKEVAALCRYTprrniPPYFVALVPQEEELDDQKIQVTPPGFQLVfLPFADDKrKMPFTEKIMATPEQVGKMKAIVEKLRFTYRSDSFENPvLQQHFRNLEALALDLMEPEQAVDLTLPKVEAMNKRLGSLVDEFKELVYPPDY;nkAAVVLCMDVGFTMSNSIPGIESPFEQAKKVITMFVQRQVFAENkDeIALVLFGTDGTDNPLSGGDQYQNITVHRHLmlPDFDLLEDIESKIQPGSQQADFLDALIVSMDVIQHETIgkkFEKRHIEIFTDLSSRFSKSQLDIIIHSLKKCDISLQFFLPFSLGGPFRLGGHGPSFPLKGITEQQKEGLEIVKMVMISLEGEDGLDEIYSFSESLRKLCVFKKIErHsiHwpCrLTIGSNLSIRIAAYkSIlqErvKktwTVVDAKTLKkEDIQkETVYCLNDDDETEVLKEDIIQGFRYGSDIVPFSkVDEEQMkYKSEGkCFSVLGFCKSSQVQRRFFMGnqVLKVFAARDDEAAAVALSSLIHALDDLDMVAIVRyAydkranPqVGVAFPHIKHNYECLVYVQLPFMEDLrQYMFSSLKNSKKYAPTEAQLNAVDALIDSMSLAKKDEKTDTLEDLFPTTKIPNPrFQRLFQCLLHRALHPREPLPPIQQHIWNMLNPPAEVTTKSQIPLSKIKTLFPLIEAKKK C;D GTttttagttTattgggC;GCCCAGctttCCCAGCtaataaactaaaaac 211;213 582 330 19;13;297;1 5;0;5;0;0;0;0;1;27;4;10;0;0;0;0;1;1;43;41;192 1JGG 1jgg_1_1 8557047 2 DROSOPHILA MELANOGASTER 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Even Skipped 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A ryrtafTRDQlGRLEKEFYKENYVSRPRRCELAAQLNLPEStIkvwFqnRRmkDkrQ C;D TAATtgaatt;aattcaatTA 202 581 146 30;15;101;0 9;0;7;0;2;0;0;0;7;3;4;0;0;0;0;0;0;2;24;88 1JJ4 1jj4_1_1 10906136 2.4 HUMAN PAPILLOMAVIRUS TYPE 18 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Alpha|Beta Regulatory Protein E2 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B MTPIIHLKGdrnsLkcLryrLrKHSDHYRDISstWhWtKTGILTVTYHSETQRTKFLNTVaIpdsVQILVGYMT;HMTPIIHLKGdrnsLkcLryrLrkHSDHYRDISstWhWtEKTGILTVTYHSETQRTKFLNTVAIpDsVQILVGYMT C;D caacCGAAttcggtTG;caacCGAAttcggtTG 190 579 212 74;0;138;0 7;0;4;0;2;0;1;0;4;9;2;0;1;2;0;2;0;22;45;111 1K3W 1k3w_1_1 11847126 1.42 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease VIII 1 1 1 0 3, 0 1 0 0 0 1 1 0 0 1 A peGPEIRRAADNLEAAIKGKPLTDVWFAFPQLKTYQSQLIGQHVTHVETRGkALLTHFSNDLTLYShNqlyGVWRVVDTGEEPQTtrvLrVKLQTADKTILLYsAsdIEMLRPEQLTTHpfLQrVGPDVLDPNLTPEVVKERLLSPRFRNRQFAGLLldqAFLAGLgnYLRVEILWQVGLTGNHKAKDLNAAQLDALAHALLEIPRFSYATRGQALFRFKVfhRDGEPCERCGSIIEkTtLSsrpFyWCPGCQH B;C tcatccTG;CAGGagaagC 73 111 168 19;17;132;0 2;0;1;0;0;0;1;0;4;4;3;0;0;0;0;0;0;10;24;119 1K4T 1k4t_1_1 12426403 2.1 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Topoisomerase Topoisomerase I 1 1 1 0 0, 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 A QKWKWWEEERYPeGIkWKFLEHKGPVFAPPYEPLPENVKFYYDGKVMKLSPKAEEVATFFAKmLdhEYTTKEIFRKNFFKDWRKEMTNEEKNIITNLSKCDFTQMSQYFKAQtEArkQmSKEEkLKIkEEnEKLLKEYGFCIMDNHKERIAnFkIeppglfrgrGNhPKMGMLkRRIMPEDIIINCSKDAKVPSPPPGHKWKEVrHdNkvtwLVsWteNIqgsikyImLNPSSRIkGEkDWQkYETARRLKKCVDKIRNQYREDWKSKEMKVRQRAVALYFIDKLALragnekeEGEtaDtVGCCSLRVEHINLHPELDGQEYVVEFDFLgkdSiRYYNKVPVEKRVFKNLQLFMENKQPEDDLFDRLntgILnKHLqDLMEgLtakVFrtYNASITLQQQLKELTAPDENIPAKILSYNRANRAVAILCNhqraPpkTfEKsMMnlQtkIDAKKEQLADARRDLKSAKADAKVMKDAKTKKVVESKKKAVQRLEEQLMKLEVQATDrEENKQIaLgtSKLnLDPRITVAWCKKWGVPIEKIYnktQREKFAWAIDMADEDYEF B;C;D Aaaaagactt;gaaaaatTttt;AAAAatttttccaagtctttTT 127 95 343 36;5;302;0 4;0;3;0;1;0;1;0;19;14;16;0;0;0;0;5;0;31;39;210 1K61 1k61_1_1 12466549 2.1 1 4 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodamain, Mat Alpha 2 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 1 1 0 0 1 A rghrfTKENvRILESWFAKNIENPylDTKGLENLMKNTSLSriqIknwVsnRrrkEkTIt E;F ACATGTAATTCatttacaCGC;gcgtgtAaatgAATTACATG 101 573 165 40;14;111;0 3;1;7;1;4;0;0;0;6;1;4;0;0;0;0;2;1;7;22;106 1K78 1k78_1_1 11779502 2.25 MUS MUSCULUS, HOMO SAPIENS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Paired Protein Pax 1 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 3 2 0 1 A;B;I GvnqLGGVfvngrplPDVVrQRIVELAHQGVrpcDISrQLRvshgcVskilGrYyETGSIKpgviggskpkvaTPKVVEKIAEYkRQNPTmfawEIRDRLLAERVCDNdTvpsvssInriIrtK;IqlWQFLLELLTDKSCQSFISWTGDGWEFKLSDPDEVARRwGKRknkPkmNyeklSrgLryyydKNIIHkTAGkrYVYRFVCDLQSLLGYTPEELHAMLDVK;ggskpkvaTPKVVEKIAEYKRQNPTmfawEIrDRLLAERVCDNdTvPsvssInrIirT C;D TTGTgccggagatgggctccagtggcC;aaggccactggagcccatctccGGCAC 90;118;257 569 689 132;48;508;1 7;3;5;4;7;5;7;2;13;15;28;6;0;0;0;3;1;33;106;444 1K79 1k79_1_1 11779502 2.4 MUS MUSCULUS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Paired Protein Pax 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A gpIqlWQFLLELLTDKSCQSFISWTGDGWEFKLSDPdEVARRwGKRknkpkmNyeklSrgLryyydkNIIHkTAgkryVyRFVCDLQSLLGYTPEELHAMLDVK B;C TAGTgccggaaAtgt;CACatttccGGCACT 90 567 188 48;1;138;1 1;0;2;0;2;0;1;0;5;0;4;0;0;0;0;2;2;16;41;112 1K82 1k82_1_1 11912217 2.1 ESCHERICHIA COLI 4 1 1 4 0 0 1 Enzyme Glycosylase Formamidopyrimidine DNA Glycosylase 1 1 1 0 0, 0 1 0 0 0 1 1 0 0 1 A peLPEVETSRRGIEPHLVGATILHAVVRNGRLrwPVSEEIYRLSDQPVLSVQRRAkyLLLELPEGWIIIhLgmSGSLRILPEELPPEkhDHVDLVMSNGKVLRYTDprrfGAWLWTKELEGHNvLTHlGPEPLSDDFNGEYLHQKCAKkKtaIKpwLmdnKLVVGVgnIYASESLFAAGIHPDRLASSLSLAECELLARVIKAVLLRSIEQGGTTlKPGYFAQELQVyGRkGEPCRVCGTPIVATkhaqraTfYCRQCQK E;I ggcttcctcCTGg;CCAGgagaagCC 72 23 227 33;35;151;8 6;0;1;0;0;0;1;0;16;2;6;0;0;0;0;2;2;10;32;149 1KBU 1kbu_1_1 12051940 2.2 BACTERIOPHAGE P1 1 1 1 1 0 0 1 Enzyme Recombinase Cre Recombinase 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 1 0 2 1 0 1 A;B ATSDEVRKNLMDMFRDRQAFSEhTWkmLLsVCrsWAAWCKLNNRKWFPAEPEDVRDYLLYLQArglaVktIQqhLGQLNMLHRRSGLPRPSDSNAVSLVMRRIRKENVDAGerakqALAFERTDFDQVRSLMENSDrCqDIrNLAFLGIAYNTLLrIAEIARIRVKDISRTDGGRMLIHIGrtktLvSTAGVEKALSLGVTKLVERWISVSGVADDPNNYLFCrvrkNGVAAPSATsqlsTraLeGIFEATHRLIYGAKDDSGQryLAWSGhSArVGAARDMARAGVSIPEIMQAGgwtnVNiVMnyIRNLDSETGAMVRLLED;TSDEVRKNLMDMFRDRQafsehtWkmLLsVCrsWAAWCKLNNRKWFPAEPEDVRDYLLYLQArglaVktIqqhLgqLnmLHrrSGLPrPsDSNAVsLVmrRIrkENVDAGeRakqaLAFERTDFDQVRSLMENSDrCqDIrNLAFLGIAYNTLLriaeIArIRVKDISRTDGGRMLIHIGrtktlVSTAGVEKALSLGVTKLVERWISVSGVADDPNNYLFCrvrknGvAAPSATsqlstraLeGIFeATHRLIYGAkDDSgqryLawsghSArVGAARDMARAGVSIPEIMQAGgwtnVniVMnyIRNLGAMVRLLED C;D ataagttcgtataatgtATGCTATACGAAGTTAT;ataacttcgtatagcatacattatacgaACttat 15 110 801 172;35;594;0 15;0;13;0;6;0;3;0;41;23;23;0;0;0;2;12;7;55;137;464 1KU7 1ku7_1_1 11931761 2.4 THERMUS AQUATICUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Sigma A Factor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 2 0 1 A;D SEELEKALSKLSErEAMVLKMrKGLIDGREHtleeVGAYFgvtrerIrqienkALRKLKYHESRTRKLRDFLE;KALSKLSEREAMVLKMRKGLIDGREHTLEEVGAYFGVTRERIRQIENKALRKLKYHESRTRKLRDFLE B;C ccttgaCAAAG;CCTTtgtcaAG 192 565 130 59;0;71;0 2;0;3;0;3;0;0;0;3;2;3;0;0;0;0;8;1;11;28;66 1KX5 1kx5_1_1 12079350 1.94 XENOPUS LAEVIS, HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein DNA Packaging Histone 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 8 3 3 1 A;B;C;D;E;F;G;H ARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARkSAPATGGVKkphryrpgtvaLreIrrYQkSTELLIrklpFqrLVrEIAQDFKTdLrfqsSAVMALQEASEAYLVALFEDTNLCAIHAkrvtImPkDIQLARRIRGERA;SGRGkggkglgkggakrhrKVLrdNIqGItkpAIrrLArRGGVkrisgLIYEETrGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAkrktVtAMDVVYALKRQGRTLYGFGG;sgrGkqGgktrakaktrSSrAGLQFpVgrVHrLLrkGNYAervgaGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNkktrIiPRHLQLAVRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQSVLLpKKTeSSkSKSk;AKsAPApkkgskkAvTKTQKkdgkkrrktrkesYaiyVykVLKQVHPdTgisskAMSIMNSFVNDVFERIAGEASRLAHYNkrstItSReIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAk;ARTKQTARKSTGGKAPRKQLAtKAarkSAPATGgvkkphryrpgtvaLreIrrYQkSTELLIrklpFqrLVrEIAQDFKTDLrfqsSAVMALQEASEAYLVALFEDTNLCAIHAkrvtImPkDIQLARRIRGERA;sgrgkggKglgkGGAkrhrKVLRDNIqGItkpAIrrLArRGGVkrisgLIyEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAkrktVtAMDVVYALKRQGRTLYGFGG;SGRGkqggktrakaktrSSrAGLQFpVgrVHrLLrKGNYAervgaGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNkktrIiPRHLQLAVRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQSVLLpKkTESSKSKSK;AKSAPAPKKGSKKAVTKtqkkdgkkrrktrkesYAiyVykVLKQVHPDTgisskAMSIMNSFVNDVFERIAGEASRLAHYNkrstItSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK I;J ATcaatatccaCCTGCAgataCTaccaaaagtgtaTttggaaACtgctCcatCAAAAGgcatgttcagctggaAtccAGctgaacATGCCtttTGATggagcagtttCCAaatACACttttggtagTATCtgcaGGTGGATAttgat;ATCaatatcCaCCTGCagataCTaccaaaagtgtATttggaaACtgctccatcAAAAGGcatgtTcagctggaTTCCAgctgaacatgcctttTGATggagcagttTCCAAatACACTtttggtagtATCtgcaGGTGGATAttgat 9;86;168;172 564 1977 51;111;1813;2 24;2;26;0;0;0;5;0;111;43;131;0;0;0;0;1;1;146;279;1208 1L2B 1l2b_1_1 12055620 2.4 BACILLUS STEAROTHERMOPHILUS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Glycosylase 8-Oxoguanine DNA Glycosylase 1 1 1 0 0, 0 0 0 1 0 1 1 0 0 1 A peLPEVETIRRTLLPLIVGKTIEDVRIFwPnIIrHPRDSEAFAARMIGQTVRGLERRGkFLKFLLDRDALIShLrmEGRYAVASALEPLEPhTHVVFCFTDGSELRYRDvrkfGTMHVYAKEEADRRPpLAELGPEPLSPAFSPAVLAERAVKTKrsVKaLLlDqTVVAGFgnIYVDESLFRAGILPGRPAASLSSKEIERLHEEMVATIGEAVMKGGSTVRGTFQHHLYVYGRQGNPCKRCGTPIEkTvVagrGTHYCPRCQR B;C;D gtagAcctgGAC;GTCc;gtcTAC 27 563 149 20;24;97;8 1;0;4;0;0;0;0;0;5;0;6;0;0;0;0;0;1;7;25;100 1L3L 1l3l_1_1 12087407 1.66 AGROBACTERIUM TUMEFACIENS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix TraR Activator 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;C QHWLDKLTDLAAIEGDECILKTGLADIADHFGFTGYAYLHIQHRHITAVTNYHRQWQSTYFDKKFEALDPVVKRARSRKHIFTWSGEHERPTLSKDERAFYDHASDFGIRSGITIPIKTANGFSFTASDKPVIDLDREIDAVAAAATIGQIHARISFLRTTPTAEDAAwLDPkEATYLRWiAVGKteeIADVEGVkynsVrvkLreAKRFDvrskAHLTALAIRRKLI;QHWLDKLTDLAAIEGDECILKTGLADIADHFGFTGYAYLHIQHRHITAVTNYHRQWQSTYFDKKFEALDPVVKRARSRKHIFTWSGEHERPTLSKDERAFYDHASDFGIRSGITIPIKTANGFSFTASDKPVIDLDREIDAVAAAATIGQIHARISFLAWLDPKEATYLRWiAVGKteEIADVEGVkynsVrvkLreAKRFDvrskAHLTALAIRRKLI F;H GAtgtgcAGAtctgcaCATC;GatgtgcAGAtctgcaCATC 77 108 203 73;0;130;0 5;0;15;0;0;0;0;0;6;6;4;0;0;0;0;2;0;17;25;123 1LE8 1le8_1_1 12121651 2.3 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodamain, Mat Alpha 2 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 2 2 1 A;B KSsiSPQArAFLEQVFRRKQslNsKEkEEVAKKCGITPlqVrvwFinKrmrSk;rghrfTKENvRILeSWFAKNIENPylDTKGLENLMKNTSLSriqIknwVaaRrakEktiTIAPELADLLSGEPL C;D acatgTAaaaatttacatCA;TtgatGtAAATTtttacaTG 121;123 553 271 61;14;196;0 5;0;7;0;2;0;1;0;11;3;4;0;0;0;0;1;1;18;41;177 1LLM 1llm_1_1 14621985 1.5 MUS MUSCULUS AND SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zif268 Zinc Finger 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 C;D MkPFQCRICMrnfsrSdhLTthIrtHTGEkPfACDICGrkfarsderkrhRDiqHILPILEDKVEELLSKNYHLENEVARLKKLVGE;mkPFQCRICMrnfsrsdhLtthIrtHTGEkPfACDICGrkfarsderkrhRDiqHILPILEDKVEELLSKNYHLENEVARLKKLV A;B Tcccacgcgtggg;tcccacgcgtggg 180 551 345 111;13;221;0 8;0;15;3;10;0;0;1;11;12;3;0;0;0;0;9;2;24;37;210 1LMB 1lmb_1_1 1387915 1.8 BACTERIOPHAGE LAMBDA 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Lambda Repressor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 3;4 PlTQEQLEDARRLkAIyeKKkNELGLsqeSVADKMgmgqsgVgalFnGinaLnAYnAALLAKILKVSVEEFSPSIAREIYEMYEAVS;StkkkPLTQEQLEDARRLkAIyeKKkNELGLsqeSVADKMgmgqsgVgalfnGinalnAYnAALLAKILKVSVEEFSPSIAREIYEMYEAVS 1;2 AataccACTggcggtgaTAT;TatatcaccgCCagtggTAT 53 550 275 103;0;172;0 8;2;5;3;3;0;3;0;20;2;9;0;0;0;0;5;2;12;35;166 1LQ1 1lq1_1_1 12176382 2.3 BACILLUS SUBTILIS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Initiation Factor Spo0A 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B KKNLDASITSIIHEIGVpAhikgYLyLREAISMVYNDIELlgsitkVLyPDIAKKFNttAsrVeraIrhAIEvAWSrGNIDSISSLFAkptnsEFIAMVADKLRLEH;NLDASITSIIHEIGVpAhikgYLYLREAISMVYNDIELLGSITKVLYPDIAKKFNTTASrVEraIRhAIEvAWSrGNIDSISSLFAKPTNSEFIAMVADKLRL G;H TTcgtgtcGAATtttg;acAAAattcgaCACGA 88 549 248 62;0;186;0 1;0;6;0;3;0;0;0;0;8;11;0;0;0;0;5;1;12;51;150 1M0E 1m0e_1_1 12206775 2.5 HAEMOPHILUS HAEMOLYTICUS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Methyltransferase DNA Methyltransferase HhaI 1 1 1 0 0, 0 1 0 0 0 0 1 0 0 1 A MIEIKDKQLTGLRFIDLFAGLGGFRLALESCGAECVYSNEWDKyAQEVYEMNFGEKPEGDITQVNEKTIPDHDILCAGFPcqAFsisgkqkGFEDSrGTLFFDIARIVREKKPKVVFMENvknFAsHdNGNTLEVVKNTMNELDYSFHAKVLNALDYGIPQkRErIYMICFRNDLNIQNFQFPKPFELNTFVKDLLLPDSEVEHLVIDrKDLVMtnQEIEQTTPKtVrLGIVGkGgqGerIySTRGIAitLsaygggiFakTGGYLVNGKTRkLHPRECARVMGYPDSYKVHPstsqAykQFGnSVVINVLQYIAYNIGSSLNFKPY C;D ccatgcgctgac;GTcaggcaTGG 26 545 288 65;21;196;6 4;2;3;0;1;1;4;2;8;11;10;1;0;0;0;1;3;20;42;175 1M19 1m19_1_1 12559907 2.3 XENOPUS LAEVIS 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein DNA Packaging Histone 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 8 3 3 1 A;B;C;D;E;F;G;H kkphryrpgtvaLreIrrYQkSTELLIrklpFQrLVrEIAQDFKTdLrfqsSAVMALQEASEAYLVALFEDTNLCAIHakrvtImPkDIQLARRIRGERA;DNIqGItkpaIrrLArRGGVkrisgLIyEETrGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAkrktVtAMDVVYALKRQGRTLYGFGG;aktrSSrAGLQFPVgrVhrLLrKGNYAervgaGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNkktrIiPRHLQLAVRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQSVLLpkKT;trkesYaiyVykVLkQVHPDTgissKAMSIMNSFVNDVFERIAGEASRLAHYNkrstItSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAk;phryrpgtvaLreIrrYQkSTeLLIrklpFqrLVrEIAQDFKTdLrfqsSAVMALQEASEAYLVALFEDTNLCAIHAkrvtImPkDIQLARRIRGERA;rhrkVLRDNIqgItkpAIrrLArRGGVkrisgLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAkrktVtAMDVVYALKRQGRTLYGFGG;ktrsSrAGLQFPVgrVhrLLrkGNYAervgaGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNkktrIIPRHLQLAVRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQSVLLpkK;trkesYAiyVykVLKQVHPDTgisskAMSIMNSFVNDVFERIAGEASRLAHYNkrstITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK I;J ATCaatatccaCCTGCaGattCTACcaaaagtGTATttggaAACTGCtccaTCAAAAGgcatGttcagcggaATTCCGctgaacATGCCtttTGATggagcagtTTCCAaataCACTTTtggtaGAATCtgcaGGTGGATAttgaT;ATCaatatcCACCTGCAgattCTACCaaaagtGTATttggaaACTGCTCcatcAAAAGGcatgttcagcggaaTTCCGCtgaacaTGCCttttGATGgagcagtTTCCAAatacACTTTtggtagAATCTgcaGGTGGATAttgaT 9;11;12;14 3 1298 25;70;1203;0 24;0;17;0;0;0;0;0;73;34;88;0;0;0;0;0;0;114;166;782 1M5X 1m5x_1_1 12758074 2.25 MONOMASTIX SP. 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease I-MsoI 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B TLQPTEAAYIAGFLDgdgsIyakliprPdykDIKYqVslAIsFiqrKDkFPYLQDIYDQLGKRgnlrKdrGdGiAdYtIigsthLSIILPDLVPYLRIkKKQANRILHIINLyPQAqkNPSKFLDLVKIVDDvqNLnkrADeLKSTnYDRLLEEFLKAGKI;TLQPTEAAYIAGFLDgdgsIyakliprPdykDIKYqVslAIsFiqrKDkFPYLQDIYDQLGKRgnlrKdrgdGiAdYtIigsthLSIILPDLVPYLRIkKKQANRILHIINLyPQAqkNPSKFLDLVKIVDDvqNLnkrADeLKSTnYDrLLEEFLKAGKI C;D gcagaacgtcgtgagacagtTCCG;cggaactgtcTcacgacgttcTGC 82 540 603 203;0;400;0 14;6;18;1;14;0;0;0;21;10;14;0;0;0;0;7;6;32;114;346 1MEY 1mey_1_1 8901872 2.2 2 1 1 3 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zinc Finger, Synthetic 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 1 2 2 0 1 C;G EkPyKCPECGksfsqssnLqkhQrtHTGEkPyKCPECGksfsqssdLqkhQrtHTGEkPyKCPECGksfsrsdhLsrhQrtHQ;TGEKPYKCPECGKSFSrSDhLSRHQRTH A;B atgaggcagaacT;tagttctgcCtA 184;262 538 232 103;0;129;0 12;2;9;1;11;0;0;0;4;17;1;0;0;0;0;6;2;15;20;132 1MEY 1mey_2_1 8901872 2.2 2 1 1 3 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zinc Finger, Synthetic 2 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 1 1 0 0 1 F MekPyKCPECGkSfsqssnLqkhQrtHTGEkPyKCPECGksfsqssdLqkhQRtHTGEkPyKCPECGksfsrsdhLsrhQrtHQ D;E atgaggcagaaCT;tagttctgcCtA 184 537 244 105;0;139;0 12;4;8;2;11;0;0;0;4;15;2;0;0;0;0;7;2;12;28;137 1MJ2 1mj2_1_1 10986458 2.4 ESCHERICHIA COLI 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Ribbon|Helix|Helix Methionine Repressor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B AEWSGEYISPYAEhgKksEQvKkitVsIPLKVlKILTDErTRRkVNNlrhatnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY;AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVLKILTDErTRRkVNNLRHAtnsELLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY F;G ttagacgTCTAGacgTCTA;TTAGACGTctagacGTCTA 17 536 183 33;1;149;0 4;2;2;0;3;0;0;0;7;9;17;0;0;0;0;1;2;14;15;107 1MNM 1mnm_1_1 9490409 2.25 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 3 0 1 0 0 1 Transcription factor Alpha|Beta Transcriptional Regulator, MCM1 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B QkerrkiEiKFIENktrRhvtFskrKHgIMkkAFeLSVlTGTQVLLLVVSETGLVYTFSTPKFEPIVTQQEGRNLIQACLNAPDD;rrkiEIKFIENkTrRhvtfskrkhgIMkkAFeLSVlTGTQVLLLVVSEtGlVyTFSTPKFEPIVTQQEGRNLIQACLNAPD E;F gattacctaatagggaaATTTACACG;CCGTGTAaatttCCCTattaggtAAT 182 533 304 51;11;241;1 4;0;7;0;0;0;0;0;9;9;6;0;0;0;0;1;3;22;51;192 1MNM 1mnm_1_2 9490409 2.25 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 3 0 1 0 0 1 Transcription factor Alpha|Beta Transcriptional Regulator, MCM1 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 C GLVFNVVTQDMINKSTKpyrghrfTKENvRILeSWFAKNIENPylDTKGLENLMKNTSLSRiqIknwVsnRrrkEkT E;F GATTACCTAATAGGGAAAtttacaCG;ccgtgtaaattTCCCTATTAGGTAAT 188 532 213 39;25;149;0 4;1;8;1;2;1;0;1;10;1;5;0;0;0;0;3;1;7;32;136 1MOW 1mow_1_1 12419232 2.4 DESULFUROCOCCUS MOBILIS AND CHLAMYDOMONAS REINHARDTII 4 1 1 4 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease I-DreI 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A ENVSGISAYLLGLIWgdggLyklkykgnrseyrVvItqkSENLIKQFIAPRMQFLIDELNVkskIqivkgdtrYeLrVsskKLYYYFANMLERIRLFNGNRFLAYLAGIVDgdgsIiaqikpnQsykfKHqlsLtFqVtqkTerRWFLDKLVDEIGVgyVrdrGsvSDYiLseikpLHNFLTQLQPFLNFkQKQANLVLKIIEQlPSAkESPDKFLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAVLDSL B;C ccaaactgtctcaagttccggcG;cgccggaacTTgagacagttTGG 74 104 586 211;8;367;0 18;5;18;3;13;2;2;0;12;9;22;0;0;0;0;8;5;30;112;327 1MUS 1mus_1_1 15102449 1.9 ESCHERICHIA COLI 1 1 1 1 0 0 1 Enzyme Transposase Transposase Tn5 1 1 1 0 1, 0 1 0 0 1 0 1 0 0 1 A SALHRAADWAKSVFSSAALGDPRRTARLVNVAAQLAKYSGKSITISSEGSKAAQEGAYRFIRNPNVSAEAIRKAGAMQTVKLAQEFPELLAIEdttSLSYRHQVAEELGKLGSIQKASRGWWVHSVLLLEATTFRTVGLLHQEWWMRPDDPADADEKESGKWLAAAATSRLRMGSMMSNVIAVCdReADIHAYLQDKLAHNERFVVrSKHPRKDVESGLYLYDHLKNQPELGGyQisipqkgVvDkRGKrKnrpaRKASlSLRSGRITLKQGNITLNAVLaEEINPPKGETPlkwLLLTSEPVESLAQALRVIDIytHrwRIeeFhkAWktGAGAeRQRMEKPDNLERMVSILSFVAVRLLQLrESFTPPSQSAETVLTPDECQLLGYLDKGKRkRKEKAGSLQWAYMAIARLggfmDskrtGiasWGaLWEGWEALQSKLDGFLAAKDLMAQGIKIG B;C GACTTGTGTataagagtcag;ctgactctTATACACAAGTC 67 528 306 100;16;187;3 4;0;5;1;3;2;3;1;8;6;6;0;0;0;0;3;2;22;58;182 1N48 1n48_1_1 0 2.2 SULFOLOBUS SOLFATARICUS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Polymerase DNA Polymerase IV 1 1 1 0 3, 0 0 0 0 0 1 1 0 0 1 A MIVLFVdFDYFYAQVEEVLNPSLKGKPVVVCvFsGrfEDsgavATANYEARKFGVKAgIpIVEAKKILPNAVYLPMRkEVYQQVSSRIMNLLREYSEKIEIasIdeAYLDISDKVRDYREAYNLGLEIKNKILEKEKITVTVGISKNKVFAkIAADMAKPNGIKVIDDEEVKRLIRELDIADVPgignitAEkLKKLGINKLVDTLSIEFDKLKgMigeakAKYLISLARDEYNEPIRTrvrksigrivtMKRNSRNLEEIKPYLFRAIEeSYYkLDKRIPKAIhVVAVTeDldiVsRGRTFPHGISKETAYSESVKLLQKILEEDERKIrrIGVrFskFIE B;C GGgggaaGGacta;catagtccttCCCCC 3 527 222 19;15;182;6 3;0;6;0;0;0;1;0;11;7;15;0;0;0;0;0;0;24;24;131 1N6J 1n6j_1_1 12700764 2.2 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Alpha|Beta Cabin 1 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B;G grkkiQISRILDQRnRQvtFTkrKFgLMkkAYeLSVLCDCEIALIIFNSANRLFQYASTDMDRVLLKYTEYSEPHESRTNTDILETLKRRGIG;grkkiQISRiLDQRnRQvtFTkrKFgLMkkAYeLSVLCDCEIALIIFNSANRLFQYASTDMDRVLLKYTEYSEPHESRTNTDILETLKRr;SPKGSISEETKQKLKSAILSAQSAAN C;D agCtatttataagC;gcTtataaatagct 176;263 524 282 23;50;209;0 3;0;4;0;0;5;0;5;13;4;10;0;0;0;0;1;0;20;38;179 1NFK 1nfk_1_1 7530332 2.3 MUS MUSCULUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet NFkB 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B GPYLQILEQPKQRgfrFryVceGPShggLpGASSEkNKksYPQVKICNYVGPAKVIVQLVTNGKNIHLHAHSLVGKHCEDGVCTVTAGPKDMVVGFAnLGILhvtkkKVFETLEARMTEACIRGYNPGLLVHSDLAYLQAEGGGDRQLTDREKEIIRQAAVQQTKEMdlsVVRLMFTAFLPDSTGSFTRRLEPVVSDAIYdskApNASnLkIVRMDRTAGCVTGGEEIYLLCdkVqkDDIQIRFYEEEENGGVWEGFGDFSPTDvHrqfAIVFKTPKYKDVNITKPASVFVQLRRKSDLETSEPKPFLYYPE;GPYLQILEQPKQRGFrFryvceGpshGGLPGASSEKNKKSYPQVKICNYVGPAKVIVQLVTNGKNIHLHAHSLVGKHCEDGVCTVTAGPKDMVVGFANLGILhvtkkKVFETLEARMTEACIRGYNPGLLVHSDLAYLQAEGGGDRQLTDREKEIIRQAAVQQTKEMDlsVVRLMFTAFLPDSTGSFTRRLEPVVSDAIYDSkApNASNLKIVRMDRTAGCVTGGEEIYLLCdkVqkDDIQIRFYEEEENGGVWEGFGDFSPtDvHrqFAIVFKTPKYKDVNITKPASVFVQLRRKSDLETSEPKPFLYYPE C;D tgggaattccc;tgggaattccc 136 523 336 126;2;207;1 13;0;18;0;5;0;2;0;14;3;5;4;0;0;0;4;9;19;60;180 1NH2 1nh2_1_1 12972251 1.9 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet TATA Box Binding Protein 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 1 4 2 0 1 A;B;C;D SGIVPTLqnIvAtVTLGCrLDLKTVALHARNAeYNPKrfaAViMrIREPkTtAlIfasGkmvVtgAkSEDDSKLASRKYARIIQKIGFAAKFTDFKIqnIvgsCDVKFPIRLEGLAFSHGTFSSYEpelfpGLiYrMVKPkIvLlIfvsGkivLtgAkQREEIYQAFEAIYPVLSEFRKM;NAEASRVYEIIVESVVNEVREDFENAGIDEQTLQDLKNIWQKKLTE;DYLIENLMLCLYDKVtrtkArWkCSLKDGVVTINRNDYTFQKAQVEAEWV;GYYELYRRSTIGNSLVDALDTLISDGRIEASLAMRVLETFDKVVAETLKDNTQSKLTVKGNLDTYGFCDDVWTFIVKNCQVTVEDQSVISVDKLRIVACNSKKS E;F TGTagtAtaaaaac;gttttatataCATACA 6;120;205;207 99 331 1;64;264;2 2;1;2;0;0;0;1;1;9;9;2;0;0;0;0;0;0;23;94;187 1NKP 1nkp_1_1 12553908 1.8 HOMO SAPIENS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Helix Loop Helix, Myc|Max 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 2 1 1 A;B GhMNVkrRthnVlerQrrnElkRSFFALRDQIPELENNEkApkvvILKKATAYILSVQAEEQKLISEEDLLRKRREQLKHKLEQLGGC;DkrAhhnAlerKrrdhikDSFHSLRDSVPSLQGEkAsrAqILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQVRALGGC F;G CGAgtagcacgtgcTACTC;CGagtagcacgtgcTAcTC 94;179 510 260 82;0;178;0 3;0;2;0;6;0;0;0;9;1;4;0;0;0;0;3;3;23;31;175 1NLW 1nlw_1_1 12553908 2 HOMO SAPIENS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Helix Loop Helix, Mad|Max 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 2 1 1 A;B SrSthnemekNrrAHlrLSLEKLKGLVPLGPDSSrhttlSLLTKAKLHIKKLEDSDRKAVHQIDQLQREQRHLKRQLEK;krAhhnAlerKrrdhIkDSFHSLRDSVPSLQGEkasraqILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQV F;G GAgtagcacgtgcTAcTC;GAGtagcacgtgcTACtC 94;186 508 246 85;0;161;0 3;0;2;0;5;0;0;0;8;3;3;0;0;0;0;4;2;23;33;160 1NVP 1nvp_1_1 12972251 2.1 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet TATA Box Binding Protein 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 1 4 2 0 1 A;B;C;D SGIVPQLqnIvStVNLGCKLDLKTIALRARNAeYNPKrfaAViMrIREPrTtAlIfssGkmvCtgAkSEEQSRLAARKYARVVQKLGFPAKFLDFKIqnMvGsCDVKFPIRLEGLVLTHQQFSsYEpelfpGLiYrMIKPrIvLlIfvsGkvvLtgAkVRAEIYEAFENIYPILKGFRKT;TVPKLYRSVIEDVINDVRDIFLDDGVDEQVLMELKTLWENKLM;DTENVVVCQYDKIhrskNKWkFhLKDGIMNLNGRDYIFSkAiGDAEW;YQLYRNTTLGNSLQESLDELIQSQQITPQLALQVLLQFDKAINAALAQRVRNrVNFRGSLNTYRFCDNVWTFVLNDVEFREVTELIKVDKVKIVACD E;F GGGGgggCtataaaagg;CcttttatagcCCCCcc 6;240;260;261 99 337 0;60;276;1 2;1;2;0;0;0;2;0;6;12;1;0;0;0;0;0;0;28;87;196 1OE4 1oe4_1_1 12820976 2 XENOPUS LAEVIS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Glycosylase Uracil DNA Glycosylase 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 1 1 2 1 2 1 A;B ESPADSFLKVELELNLKLSNLVFQDPVQYVYNPLVYAWAPHENYVQTYCKSKKEVLFLGmNPGPFGMAQTGVPFGEVNHVRDWLQIEGPVSKPEVEHPKRRIRGFECPQSEVSGARFWSLFKSLCGQPETFFKHCFVHNHCPLIFMNHSGKNLtPtdLPkAQrDTLLEICDEALCQAVRVLGVKLVIGVgrfSEqRARKALMAEGIDVTVKGIMhPsPrnpqANKGWEGIVRGQLLELGVLSLLT;ESPADSFLKVELELNLKLSNLVFQDPVQYVYNPLVYAWAPHENYVQTYCKSKKEVLFLGMNPGPfGMAQTGVPFGEVNHVRDWLQIEGPVSKPEVEHPkrRIRGFECPqsEvSGArFWSLFKSLCGQPETFFKHCFVHNHCPLIFMnhsGkNLTPTDLPKAQRDTLLEICDEALCQAVRVLGVKLVIGVGRFSEQRARKALMAEGIDVTVKGIMHPSprNPQAnKGWEGIVRGQLLELGVLSLLT E;F cccGTGAgtccg;CGGACtacGGg 75 506 135 25;14;93;3 1;0;1;0;0;0;0;0;9;2;6;0;0;0;0;1;1;7;22;85 1ORN 1orn_1_1 12840008 1.7 BACILLUS STEAROTHERMOPHILUS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease III 1 1 1 0 1, 0 1 0 0 0 1 1 0 0 1 A MLTKQQIRYCLDEMAKMFPDAHCELVHRNPFELLIAVVLsaqctdalVNKVTKRLFEKYRTPHDYIAVPLEELEQDIrsiglyrnkARnIQKLCAMLIDKYNGEVPRDRDELmKlpgvgrktANVVVSVAFGVPAIAVdthVErVSKRLGFCRWDDSvLEVEKTLMKIIPKEEWSITHHRMIFFGrYHCkaqSPQCPSCPLLHLCREGKKRMRK B;C AAGAcgtggac;GTccagtct 114 502 233 19;35;169;10 1;0;2;0;0;2;2;0;13;4;19;0;0;0;0;0;0;5;44;141 1OUP 1oup_1_1 12881435 2.3 VIBRIO VULNIFICUS 2 1 1 2 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease I 1 1 1 0 0, 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 A APPSSfSAAkQQAVKIYQDHPISFYCGCDIEWQGKkGIPNLETCGYQVrkqQTrASrieweaVVpawQFGHHRQCwQKGgrkNCSKNDQQFRLMEADLHNLTPAIGEVngdRsnFNFSQWNGVDGVSYGRCEMQVNfkQrKVMPPDRARGSIARTYLYMSQEYGFQLSKQQQQLMQAWNKSYPVDEWECTRDDRIAKIQGNHNPFVQQSCQTQ E;F;G GCGatc;gcgatcgc;gc 154 500 159 7;13;139;0 3;0;5;2;0;0;0;0;11;3;8;0;0;0;0;0;0;10;22;95 1OZJ 1ozj_1_1 12686552 2.4 HOMO SAPIENS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating SMAD 3 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A fTPPIVKRLLGWKKGEQNGQEEKWCEkAVksLVkkLKkTGQLDELEKAITTQNVNTKCITIPRsldGrlqvshrkGlPHVIYCRLWRWPDLhshhELRAMELCEFAFNMkKDEVCVNPYHYQRVET C;D TCAGTctagaCATAC;GtatgtctAGActga 171 498 111 40;0;71;0 3;0;6;0;2;0;1;0;0;2;3;0;0;0;0;1;3;11;10;69 1P3L 1p3l_1_1 14739929 2.4 XENOPUS LAEVIS, HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein DNA Packaging Histone 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 8 3 3 1 A;B;C;D;E;F;G;H phryrpgtvalreIrrYQkSTELLIrklpFqrLVrEIAQDFKTdLrfqsSAVMALQEASEAYLVALFEDTNLCAIHakrvhImPkDIQLARRIRGERA;DNIQgItkpAIrrLArRGGVkrisglIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAkrktVtAMDVVYALKRQGRTLYGFGG;ktrSSrAGLQFPVgrVHrLLrkGNYAervgaGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNkktrIiPRHLQLAVRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQSVLLpkKT;kesYaiyVykVLKQVHPDTgissKAMSIMNSFVNDVFERIAGEASRLAHYNkrstItSreIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAk;kphryrpgtvaLreIrrYQkSTELLIrklpFqrLVrEIAQDFKTdLrfqsSAVMALQEASEAYLVALFEDTNLCAIHakrvhImPkDIQLARRIRGERA;kVLRDNIqgItkpAIrrLArRGGVkrisgLIyEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAkrktVtAMDVVYALKRQGRTLYGFGG;RakaktrSSrAGLQFPVgrVHrLLrkGNYAervgaGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNkktrIiPRHLQLAVRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQSVLLpkK;ksrkesYAiyVykVLKQVHPDTgisskAMSIMNSFVNDVFERIAGEASRLAHYNkrstItSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK I;J ATCaatatccaCCTGCAGattCTACCAAaagtgTATTtggaaACTgctCcatCAAAAGgcatGTtcagcggaATTCCGCtgaaCATGCCtttTGATGgagcagTTTCCAaatACACTtttggtaGAATCtgcaGGTGGATAttgat;ATCaatatcCACCTGCAgattCTACCaaaagtgTATttggaaACTGCTCcatCAAAAGGcatGtTcagcggaaTTCCGCtgaacaTGCCttttGATGgagcagtTTCCAaatACACTTttggtAGAATCtgcaGGTGGATAttgat 9;11;12;14 3 1284 18;55;1211;0 18;0;13;0;0;0;0;0;73;30;80;0;0;0;0;2;0;121;180;767 1P47 1p47_1_1 12818197 2.2 MUS MUSCULUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zif268 Zinc Finger 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B ErPyACPVESCDrrfsrsdeLtrhIriHTGQkPfQCRICMrnfsrsdhLtthIrtHTGEkPfACDICGrkfarsderkrhTKiHLrq;rPYACPVESCDrrfsrsdeLtrhIriHTGQkPfQCRICMrnfsrsdhLtthIrtHTGEkPfACDICGrkfarsderkrhTkiHL C;D gtggcgtgggcggcgtgggcgt;cacgcccacgccgcccacgCCA 19 496 513 183;1;329;0 25;1;24;0;16;0;0;0;12;26;5;0;0;0;0;10;1;44;51;298 1P71 1p71_1_1 12853489 1.9 ANABAENA SP. 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein DNA Packaging Histone-like, HU Protein 1 1 1 0 0, 0 1 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B MNKGELVDAVAEKASVTKKQADAVLTAALETIIEAVSSGDkVTLVGFGSFESrerkaregrnpktnEkmEiPAtRvPAfsAGKLFrEKVAPPKa;MNKGELVDAVAEKASVTKKQADAVLTAALETIIEAVSSGDkVTLVGFGSFESrerkaregrnpkTnEkmEiPAtRvPAfsAGkLFrEKVAPPK C;D tgCttatcaatttgttgcAC;tGCttatcaatttgttgcAc 42 492 330 17;83;227;3 7;0;5;0;0;0;2;5;21;2;4;0;0;0;0;0;0;28;56;200 1PDN 1pdn_1_1 7867071 2.5 DROSOPHILA MELANOGASTER 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Paired Protein Pax 1 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 1 0 0 1 C qGrvnqLGGVfingrplPNNIrLKIVEMAADGIrpcVISrQLRvshgcVskiLnrYQETGSIRpgviggskprIAtPEIENRIEEYKRSSPGMFSWEIREKLIREGVCDRSTAPSVSAISRLV A;B AacgtcACggttgac;TTGTCaaccgtgacG 230 490 279 32;28;219;0 2;0;0;0;1;4;3;1;12;3;14;7;0;0;0;2;1;14;51;164 1PER 1per_1_1 8081737 2.5 BACTERIOPHAGE 434 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix 434 Repressor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 L;R SISSRVkSKrIQLGLnqaELAQKVGttqqsIeqLEnGktkrprfLPELASALGVSVDWLLNGT;SISSRVkSKrIQLGLnqaELAQKVgttqqsIeqLEnGktkrprfLPELASALGVSVDWLLNGT A;B AAgtacaGTTTttcttgtAT;TatacaAGAaaaactgtACT 60 489 291 98;5;188;0 7;0;8;0;4;0;1;0;22;14;12;0;0;0;0;15;2;15;22;169 1PP7 1pp7_1_1 14622596 2.45 TRICHOMONAS VAGINALIS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Initiator Binding Protein IBP39 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 U DLEASFTSRLPPEIVAAlKrkssrDPNSrfpRkLHMLLTYLASNPQLEEEIGLSWISDTEFKMKkkNVALVMgiklntLnvnLrdlAFEqLQhdKGGWtQwKRSGFTRNSVFED E;F gttacttcaCTT;caagtgAAGtaac 235 488 189 30;18;141;0 3;0;7;0;1;0;0;0;9;8;3;0;0;0;0;5;0;12;36;105 1PT3 1pt3_1_1 14962381 2.5 ESCHERICHIA COLI 3 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Nuclease ColE7 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A KPGKATGKGKPVNNKWLNNAGKDLGSPVPDRIANKLRDKEFksfdDFrkKFwEEVSKDPELSKQFSRNNNDrMKVgkaPKTRTQDVsgkrTsfelhhEKpisQNGGVYDMDNISVVTPKRhiDIhrGK C;D GCgatcgc;gcGATcgc 119 487 134 16;9;109;0 1;1;3;0;2;0;0;0;2;5;7;0;0;0;0;2;0;9;17;85 1PUE 1pue_2_1 8602247 2.1 MUS MUSCULUS 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Ets Domain, Pu.1 2 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 F kirlYQFLLDLLRSGDMKDSIWWVDKDKGTFQFSsKHkEALAHRwGIQkGnrkKmTyekmaraLrnyGktGeVKkVkkklTyQFSGEVL C;D AAAAaggggaAGtggg;TCCCacttcccCTTtt 177 484 199 46;1;151;1 4;0;2;0;2;0;0;0;5;1;8;0;0;0;0;2;3;16;35;121 1PUF 1puf_1_1 12923056 1.9 HOMO SAPIENS, MUS MUSCULUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, HoxA9 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 2 1 1 A;B NNPAANWlharStrkkrcpyTkHQtLELEKEFLFNMylTrDRrYEVARLLNLTErqVkiwFqnRrmkMkkiNKDRAK;ArRkrrnfNKQAtEILNEYFYSHLSNPypSeEAkEELAKKCGITVSqVsnwFgnKrirYkkNIGKfQEEANIY D;E ACTCTatgatttacgaCGCT;TAgcgtcgtaaatcatagAG 191;246 483 406 72;25;309;0 10;0;8;0;6;0;1;0;25;3;10;0;0;0;0;3;0;29;76;235 1QAJ 1qaj_1_1 10669612 2.3 MOLONEY MURINE LEUKEMIA VIRUS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Polymerase Reverse Transcriptase 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 0 2 A;B GSHMTWLSDFPQAWAETGGMGLAVRQAPLIIPLKATSTPVSIKQyPMSQEARLGIKPHIQRLLDQGILVPCQSPWNTPLlpvKKPGTNDYrPvqdlreVnkRVEDIHPTVPNPYNLLSGLPPSHQWYTVLDLKDAFFCLRLHPTSQPLFAFEWRDPEMGISGQLTWTRLPQgfkNSpTLFDEALHRDLADFRIQHPDLILLQYVDDLLLAATSELDCQQGTRALLQTLGNLGYRASAKKAQICQKQVKYLGYLLKEGQR;HMTWLSDFPQAWAETGGMGLAVRQAPLIIPLKATSTPVSiKQypmSQEARLGIKPHIQRLLDQGILVPCQSPWNTPLlPvKKPGTNDYRPvqdlreVnkRVEDIHPTVPNPYNLLSGLPPSHQWYTVLDLKDAFFCLRLHPTSQPLFAFEWRDPEMGISGQLTWTRLPqgFKNSPTLFDEALHRDLADFRIQHPDLILLQYVDDLLLAATSELDCQQGTRALLQTLGNLGYRASAKKAQICQKQVKYLGYLLKEGQR C;D catgCATG;CATGCAtg 10 480 79 11;17;49;2 4;0;3;0;1;0;0;0;3;0;2;0;0;0;0;0;1;2;14;49 1QNE 1qne_2_1 10617571 1.9 ARABIDOPSIS THALIANA 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet TATA Box Binding Protein 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B PVDLSKHPSGIVPTLqnIvStVNLDCKLDLKAIALQARNAeYNpkrfaAViMrIREPkTtAlIfasGkmvCtgAkSEDFSKMAARKYARIVQKLGFPAKFKDFKIqnIvgsCDVKFPIRLEGLAYSHAAFSsYEpelfpGLiYrMKVPkIvLlIfvsGkivItgAkMRDETYKAFENIYPVLSEFRKI E;F GCtataaaagggCA;TGCCcttttatagc 6 1 333 0;62;270;1 2;1;2;0;0;0;1;0;6;8;3;0;0;0;0;0;0;15;98;197 1QPI 1qpi_1_1 10700280 2.5 ESCHERICHIA COLI 1 1 1 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Tetracyclin Repressor 1 1 1 2 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B lNRESVIDAALELLNETGIdglttrkLAQKLgieqptLywhVknkRALLDALAVEILARHHDYSLPAAGESWQSFLRNNAMSFRRALLRYRDGAKVHLGTRPDEKQYDTVETQLRFMTENGFSLRDGLYAISAVSHFTLGAVLEQQEHTAALENLPPLLREALQIMDSDDGEQAFLHGLESLIRGFEVQLTALLQ;lNRESVIDAALELLNETGIdglttrkLAQKLgieqptLywhVknkRALLDALAVEILARHHDYSLPAAGESWQSFLRNNAMSFRRALLRYRDGAKVHLGTRPDEKQYDTVETQLRFMTENGFSLRDGLYAISAVSHFTLGAVLEQQEHTAALENLPPLLREALQIMDSDDGEQAFLHGLESLIRGFEVQLTALLQ M;N;Q;R cctatCAAtgatAGA;tctatCATtgatAGG;cctatCAAtgatAGA;tctatCATtgatAGG 159 478 436 156;0;280;0 16;0;8;0;4;0;6;0;4;28;24;0;0;0;0;4;4;16;96;226 1QPZ 1qpz_1_1 10438625 2.5 ESCHERICHIA COLI 1 1 1 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Purine Repressor 1 1 1 2 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B atikDVAKRAnvstttVshVInKtrfvaEEtRNAVWAAIKELHyspsAVarSlkvnHTKSIGLLATSSEAAYFAEIIEAVEKNCFQKGYTLILGNAWNNLEKQRAYLSMMAQKrVDGLLVMCSEYPEPLLAMLEEYRHIPMVVMDWGEAKADFTDAVIDNAFEGGYMAGRYLIERGHREIGVIPGPLERNTGAGRLAGFMKAMEEAMIKVPESWIVQGDFEPESGYRAMQQILSQPHRPTAVFCGGDIMAMGALCAADEMGLRVPQDVSLIGYDNVRNARYFTPALTTIHQPKDSLGETAFNMLLDRIVNKREEPQSIEVHPRLIERRSVADGPFRDYR;atikDVAKRAnvstttVshVInKtrfvaEEtRNAVWAAIKELHyspsAVarSlkvnHTKSIGLLATSSEAAYFAEIIEAVEKNCFQKGYTLILGNAWNNLEKQRAYLSMMAQKrVDGLLVMCSEYPEPLLAMLEEYRHIPMVVMDWGEAKADFTDAVIDNAFEGGYMAGRYLIERGHREIGVIPGPLERNTGAGRLAGFMKAMEEAMIKVPESWIVQGDFEPESGYRAMQQILSQPHRPTAVFCGGDIMAMGALCAADEMGLRVPQDVSLIGYDNVRNARYFTPALTTIHQPKDSLGETAFNMLLDRIVNKREEPQSIEVHPRLIERRSVADGPFRDYR M;Q TacgcaAacgtttgCGT;TacgcaAacgtttgCGT 68 98 398 96;42;256;4 6;0;2;4;6;0;2;2;10;16;14;0;0;0;0;8;6;8;68;246 1QRV 1qrv_1_1 10581235 2.2 DROSOPHILA MELANOGASTER 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Alpha Helix HMG, HMG-D 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A SDkpkrplsaymLWlnSAreSIkRENPGIKvtEVakRGgELwrAMKDKSEWeAKaAKAkDDyDRAvKEfeANG C;D GCgatatcgc;GCgatatcGC 193 475 179 5;49;122;3 3;1;4;0;2;0;0;1;10;1;2;0;0;0;0;0;0;8;35;112 1QTM 1qtm_1_1 10449720 2.3 THERMUS AQUATICUS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Polymerase DNA Polymerase I 1 1 1 0 2, 0 0 0 0 0 1 1 0 0 1 A ALEEAPWPPPEGAFVGFVLSRKEPMWADLLALAAARGGRVHRAPEPYKALRDLKEARGLLAKDLSVLALREGLGLPPGDDPMLLAYLLDPSNTTPEGVARRYGGEWTEEAGERAALSERLFANLWGRLEGEERLLWLYREVERPLSAVLAHMEATGVRLDVAYLRALSLEVAEEIARLEAEVFRLAGHPFnLnsrdqLERVLFDELGLPAIGKtektGkRstsaAVLEALREAHPIVEKILQYreLTklKstyIDpLPDlIHPRTGRLHTRFnQTatatGrLsssdPnLqnipvrtPLGQRIrRAFIAEEGWLLVALDYSQIeLRVLAHLSGDENLIRVFQEGRDIHTETASWMFGVPREAVDPLMRrAAKtINfgVLygmsAhrLSQELAIPyEEAQAFIERYFQSFPKVRAWIEKTLEEGRRRGYVETLFGRRrYVPDLEARVKSVReaAErmAFnMPVqGTAADLMKLAMVKLFPRLEEMGARMLLQvhDeLVLEAPKERAEAVARLAKEVMEGVYPLAVPLEVEVGIGEDWLSAk B;C GACCAcggcgc;aaagcgccgtgGTC 47 40 354 18;40;295;1 4;0;4;0;2;0;2;0;18;17;16;0;0;0;0;0;0;12;51;228 1QUM 1qum_1_1 10458614 1.55 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease IV 1 1 1 0 0, 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 A MKYIGAhvsaagglANAAIRAAEIDATAFALftknqrqwRAAPLTTQTIDEFKAACEKYHYTSAQILPHDSylInLGhPVTEALEKSRDAFIDEMQRCEQLGLSLLNFhPGsHlMQISEEDCLARIAESINIALDKTQGVTAVIENTAGqgsNLGFKFEHLAAIIDGVEDKSRVGVCIDTChAFAAGYDLRTPAECEKTFADFARTVGFKYLRGMHLNDAkSTFGSrvdrhHSLGEGNIGHDAFRWIMQDDRFDGIPLILeTiNPDIWAEEIAWLKAQQ B;C;D GCGtcc;cgaCGA;TCGTcggggacgC 110 473 246 24;35;173;14 2;0;7;0;2;0;1;0;12;2;11;0;0;0;0;0;0;2;42;165 1R0O 1r0o_1_1 14592980 2.24 DROSOPHILA MELANOGASTER 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Hormone Nuclear Receptor, Glucocorticoid Receptor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 2 1 1 A;B hLCSICGdrAsgkhygVySCegCkgfFkrTVrkDlTyACrENRNCIIDKRQrnrCqYCrYQKCLTCGMkREavqEe;EELCLVCGdrAsgyhyNALTCegCkgfFrrSVtkSAVyCCkFGRACEMDMYMrrkCqECrLKKCLAVGMRPEcVvpEn C;D CcgaggtCAatgaccTCG;CcgaggtCAttgaccTCG 46;245 472 295 75;0;220;0 7;0;6;0;3;0;2;0;14;0;10;0;0;0;0;1;0;31;29;192 1R4O 1r4o_1_1 1865905 2.5 RATTUS NORVEGICUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Hormone Nuclear Receptor, Glucocorticoid Receptor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B MKPARPCLVCSdEAsgchyGVLTCgsCkvfFkrAVEGqhnyLCAGRNDCIIDkIRrkNCpACrYRKCLQAGMNlEarktk;MKPARPCLVCSdEAsgchyGVLTCgsCkvfFkrAVeGQHNyLCAGRNDCIIDkIRrkNCpACrYRKCLQAGMNlEarkTK C;D ccagaaCATcgatgtTCTG;CcagaACATCGatgttCTG 56 469 280 40;4;236;0 4;0;2;0;0;0;0;0;8;5;10;0;0;0;0;0;2;20;48;181 1R71 1r71_1_1 15170177 2.2 ESCHERICHIA COLI 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Alpha Helix Repressor KorB 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 1 2 1 1 1 A;B EADQVIENlQRnELTpREiADFIGRELAKGKkkgdIAkEIgkspafitqhvtLLDLPEKIADAFNTGrVrdvtVVneLVtAFkkRPEEVEAWLDDDTQEitrgTVkLLrEFLdE;YNEADQVIENlQRnELTpREiADFIGRELAKGKkkgdIAkEIgkspafitqhvtLLDLPEKIADAFNTGRVrdvtVVneLVtAFkkRPEEVEAWLDDDTQEitrgTVkLLrEFLDE E;F;I;J atttAgcggctaAAAG;ctttagccgctaaAA;ctttaGccgctAaAA;atttagcggctAAAAG 87 97 376 111;0;263;2 4;3;7;0;4;0;0;0;6;15;20;0;0;0;0;13;6;30;50;218 1R7M 1r7m_1_1 14636596 2.25 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 2 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease I-SceI 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A NIKKNQVMnlgpnskLlkEYkSQLIELNIEQFEAGIGLILgdayIrSrDEGkTYcMqFewkNKAYMDHVCLLYDQWVlspPhKkervnhlGnlvitWGAqtfkHQAFNKLANLFIVNnKkTIPNNLVENYLTPMSLAYWFmddggKwdynknstnKSIVLnTqsFTFEEVEYLVKGLRNKFQLNCYVkinkNkPIIyIDSMSYLIFYNLIKPYLIPQMMykLP C;D ACgctagggataacagggtaatac;GTattaccctgttatccctaGCGT 78 96 447 153;17;276;1 13;1;16;0;8;3;2;1;10;9;17;0;1;0;0;9;2;20;76;259 1R8E 1r8e_1_1 14985361 2.4 BACILLUS SUBTILIS 1 1 1 1 0 0 1 Transcription factor Alpha|Beta Activator MerR 1 1 1 2 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;D ESYYsigEVSKLANVsikaLryyDKIDLFKPAYVdPdtsyryYTDSQLIHLDLIKSLkYIGTpleEMKKAQDLEMEELFAFYTEQERQIREKLDFLSALEQTISLVKKRMKRQMEYPALGEVFVLDEEEIRIIQTEAEGIGPENVLNASYSKLKKFIESADGFTNNSYGATFSFQPYTSIDEMTYRHIFTPVLTNKQISSITPDMEITTIPKGRYACIAYNFSPEHYFLNLQKLIKYIADRQLTVVSDVYELIIPIHYSPKKQEEYRVEMKIRIA;ESYYsigEVSKLANVsikaLryyDKIDLFKPAYVdPdtsyryYTDSQLIHLDLIKSLkYIGTpleEMKKAQDLEMEELFAFYTEQERQIREKLDFLSALEQTISLVKKRMKRQMEYPALGEVFVLDEEEIRIIQTEAEGIGPENVLNASYSKLKKFIESADGFTNNSYGATFSFQPYTSIDEMTYRHIFTPVLTNKQISSITPDMEITTIPKGRYACIAYNFSPEHYFLNLQKLIKYIADRQLTVVSDVYELIIPIHYSPKKQEEYRVEMKIRIA B;E GAccctcCCCTtaggggAGGgtc;GAccctcCCCTtaggggAGGgtc 141 468 286 44;10;232;0 2;0;4;0;0;0;0;0;2;6;12;0;0;0;0;0;0;14;50;196 1RH6 1rh6_1_1 15066428 1.7 BACTERIOPHAGE LAMBDA 1 1 1 2 0 0 1 Enzyme Excisionase Excisionase Lambda 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B MYLTLqEWNARQrrpRsleTVrRWVRESRIFPPPVKDGreYLFHESAVKVDLNRP;MYLtlqEWNARQRrPrsletVrrwVreSrIFPPPVkdgreyLFHESAVkVdL C;D tatgtaGTCtgttg;CAacagactaCATA 105 467 204 33;11;160;0 2;0;7;0;3;0;0;0;9;3;6;0;0;0;0;3;0;22;17;132 1RIO 1rio_1_2 14731393 2.3 BACTERIOPHAGE LAMBDA, THERMUS AQUATICUS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Repressor Protein CI 1 2 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 H SEELEKALSKLSErEAMVLKLrKGLIDGrEHtleeVGAYFgvtrerIrqIenkALRKLKYH T;U CCAtgtcaAGCACTGGCGGTGATACCG;CGGTATCACCGCCAGTgcttGaCATGG 254 465 121 48;0;73;0 1;0;3;0;2;0;0;0;3;2;3;0;0;0;0;8;0;13;28;58 1RM1 1rm1_1_1 0 2.5 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet TATA Box Binding Protein 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 3 2 0 1 A;B;C SGIVPTLqnIvAtVTLGCrLDLKTVALHARNAeYNpKrfaAViMrIREPkTtAlIfasGkmvVtgAkSEDDSKLASRKYARIIQKIGFAAKFTDFKIqnIvGscDVKFPIRLEGLAFSHGTFSSYEpelfpGLiYrMVKPkIvLlIfvsGkivLtgAkQREEIYQAFEAIYPVLSEFRKM;pgyYeLYRRSTIGNSLvDAldTLiSDGRIeasLAMRVLeTfdkvVaetLkDntqSkLTvKGNLDTYGFCDDVWTFIVKNCQVTVEVISVDKLRIVACNSKK;SNAEASRVYEIIVESVVNEVREDFENAGIDEQTLQDLKNIWQKKLTETKVTTFSWDNQFNDYLISEDGPDENLMLCLYDkVtrtkARWkCSLKDGVVTINRNDYTFQKAQVEAEWV D;E ATCGAtcgAtataaaacg;CgttttatatcGATCGAT 6;120;233 464 330 4;70;255;1 2;1;2;0;0;1;0;1;10;10;2;0;0;0;0;0;0;30;71;200 1RRS 1rrs_1_1 14961129 2.4 BACILLUS STEAROTHERMOPHILUS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Glycosylase Adenine DNA Glycosylase 1 1 1 0 1, 0 1 0 0 0 1 1 0 0 1 A PAREFQRDLLDWFARERRDLPWRKDRDPYKVWVSEVMlqqtrVetVIPYFEQFIDRFPTLEALADADEDEVLKAWEglgyysrVRnLHAAVKEVKTRYGGKVPDDPDEFSRlKgvgpytVGAVLSLAYGVPEPAVngnVMrVLSRLFLVTDDiakpSTrKRFEQIVREIMAYENPGAFNEALIELGALVCTprrPSCLLCPVQAYCQAFAEGVAEELpVkmkVkQVPLAVAVLADDEGRVLIRKRDSTgllANLWEFPSCETDGADGKEKLEQMVGLQVELTEPIVSFEhafshLVWQLTVFPGRLVHGGPVEEPYRLAPEDELKAYAFpvsHQRVWREYKEWAS B;C aaGactggAc;GTccagtcT 109 461 261 32;27;194;8 0;0;0;2;1;1;0;0;3;3;17;0;0;0;0;1;2;2;48;181 1RXW 1rxw_1_1 14718165 2 ARCHAEOGLOBUS FULGIDUS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease Flap-1 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 2 A ADIGDLFEREEVELEYFSGKKIAVDAFNTLYQfISiirqpDGtplkdSQGRItSHLsgILyrVSnMVEVGIRPVFVFDGEPPEFKKAEIEERKKRRAEAEEMWIAALQAGDKDAKKYAQAAGRVDEYIVDSAKTLLSYMGIPFVDAPSEGEAQAAYMAAKGDVEYTGSQDYDSLLFGSPRLARNLaiDVKPEIIILESNLKRLGLTREQLIDIAILVGTDYNEGVKGVGVKKALNYIKTYGDIFRALKALKVVEEIRNFFLNPPVTDDYRIEFREPDFEKAIEFLCEEhdfsRerVEkALEkLKA B;C cgatgCT;AGCAtcgg 217 458 170 18;31;115;6 2;0;3;0;2;1;3;1;6;2;5;0;0;0;0;0;1;5;39;100 1RZT 1rzt_1_1 14992725 2.1 HOMO SAPIENS 4 1 1 4 0 0 1 Enzyme Polymerase DNA Polymerase Lambda 1 1 1 0 0, 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 A ATNHNLHITEKLEVLAKAySVQGDkwrAlgyAkAINALKSFHKPVTSYQEACSIPgigKrmAEkIIEILESGHLRKLDHISESVPVLELFsNiwgagtktAQMWYQQGFRSLEDIRSQASLttqQAIGLKHYSDFLERMPREEATEIEQTVQKAAQAFNSGLLCVACGSYRRGKATCGdVDVLITHPDGRSHRGIFSRLLDSLRQEGFLTDDlvsqeengQQQkYlGVCRLPGPGRRHRrLDIIVVPYSEFACALLyFTGSaHFNrSMraLAkTKGMsLseHALSTAVVrNTHGCKVGPGRVLPTPTEKDVFRLLGLPYREPAERDW B;C;D CGgcaacgcac;GTgcg;gccG 5 38 282 36;46;192;8 5;0;2;0;2;0;0;0;2;4;23;0;0;0;0;0;0;8;51;185 1SA3 1sa3_1_1 15341737 1.95 MORAXELLA SP. 2 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease MspI 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A MRTELLSKLYDDFGIDQLPHTqHgvTsdRLgkLYEKYILDIFKDIESLKKYNTNAFPQEKDISSKLLKALNLDLDNIIDVSSSDTDLGRTIAgGspkTdATIRFTFHNQSSRLVPLnikhsskKkvsiaeYDVETICTGVGISDGELKELIRKhQNdqsakLFTPVQkQRLTELLEPYRERFIRWCVTLRAEKSEGNILHPDLLIRFQVIDREYVDVTIKNIDDYVSDRIAEGSKArKPgFGTGlnwtyAsgskaKkMqFkG C;D cccccgggg;ccccggggG 145 92 215 63;3;148;1 2;2;4;3;5;0;2;0;3;12;12;0;0;0;0;5;4;12;31;118 1SFU 1sfu_1_1 15448208 2 YABA-LIKE DISEASE VIRUS 1 1 0 1 0 1 1 Structural|DNA Binding protein Zalpha 34L Protein 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A CTVNDAEIFSLVKKEVLSLNTNDYTTAiSLSNRLKINkkKInqQLykLQkEDTVKMVPsnppKwFKNYNC C;D cgcgcg;cGCGCg 195 445 63 9;1;53;0 0;0;1;0;0;0;0;0;4;0;1;0;0;0;0;0;0;5;14;38 1SKN 1skn_1_1 9628487 2.5 CAENORHABDITIS ELEGANS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Alpha Helix SKN-1 1 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 1 0 0 1 P GrQskdEQLASDNELPVSAFQISEMSlSElQQVlKNESLSEYQRQLIrKIrrrGknkVaartcrQrrTDrHDKM A;B TGACAAtgtcatCCC;CAgggatgaCAttgT 248 442 158 52;0;106;0 7;0;4;0;2;0;0;0;4;1;0;2;0;0;0;2;1;22;21;92 1SKR 1skr_1_1 15235589 2.4 ESCHERICHIA COLI, BACTERIOPHAGE T7 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Polymerase DNA Polymerase T7 1 1 1 0 2, 0 0 0 0 0 1 2 2 0 1 A;B MIVSDIEANALLESVTKFHCGVIYDYSTAEYVSYRPSDFGAYLDALEAEVARGGLIVFHNGHKYDVPALTKLAKLQLNREFHLPRENCIDTLVLSRLIHSNLkDTDMGLlrSgkLPGALEAWGYRLGEMKGEYKDDFKRMLEEQGEEYVDGMEWWNFNEEMMDYNVQDVVVTKALLEKLLSDKHYFPPEIDFTDVGYTTFWSESLEAVDIEHRAAWLLAKQERNGFPFDTKAIEELYVELAARRSELLRKLTETFGSWYqPkGGTEMFCHPRTGKPLPKYPRIKTPKVGGIDTREYVAGAPYTPVEHVVFnPssrdhIQKKLQEAGWVPTKYtdkGapvvddEVLEGVRVDDPEKQAAIDLIKEYlmIqkrIgqSAegdkAWLRYVAEDGKIHGSVNPNgavtGrathafpnLaqipgVRsPYGEQCrAAFGAEHHLDGITGKPWVQAGIDASGLELRCLAHFMARFDNGEYAHEILNGDIHTKNQIAAELPTRDNAKtFIygFLygagdEkIGQiVGAGKERGKELkKKFLENTPAIAALRESIQQTLVEKWKRRWIKGLDGRKVHVrSphaALntLLqSAGALICKLWIIKTEEMLVEKGLKHGWDGDFAYMAWvhDeIQVGCRTEEIAQVVIETAQEAMRWVGDHWNFRCLLDTEGKMGPNWAICh;KIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCgPCKMIAPILdeIAdeYQgkLTvAKLNIDQNpgtaPkYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANL P;T Gccagtgcca;ctttggcactggC 25;30 441 337 16;28;289;4 2;0;5;1;0;0;1;0;17;8;14;0;0;0;0;0;0;19;57;213 1TC3 1tc3_1_1 9312061 2.45 CAENORHABDITIS ELEGANS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Transposase Transposase Tc3 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 C prgsaLSDTERAQLDVMKLLNVslheMSrKIsrsrhcIrvYLKDPVsygTs A;B AGGGggggtcCtatagAACTT;AGTTCTataggACCCCCCCT 259 427 201 38;32;130;1 5;0;7;0;0;3;0;1;4;6;11;1;0;0;0;0;0;6;26;131 1TDZ 1tdz_1_1 15249553 1.8 LACTOCOCCUS LACTIS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Glycosylase Formamidopyrimidine DNA Glycosylase 1 1 1 0 1, 1 1 0 0 0 1 1 0 0 1 A eLPEVETVRRELEKRIVGQKIISIEATyPrMVLTGFEQLKKELTGKTIQGISRRGkyLIFEIGDDFRLIShLrmeGKYRLATLDAPREkhDHLTMKFADGQLIYADvrkfGTWELISTDQVLPYFLKkKiGPEPTYEDFDEKLFREKLRKStkkIKpYLleqTLVAGLgnIYVDEVLWLAKIHPEKETNQLIESSIHLLHDSIIEILQKAIKLGGSSILGSTGKMQNELQVyGKTGEKCSRCGAEIQkIkVagrgThFCPVCQQK B;C CTCTtttttCTCG;GcgagaAacaaAGA 44 4 210 32;40;134;4 0;0;6;0;0;0;1;0;7;2;4;0;0;0;0;0;4;13;36;137 1TEZ 1tez_1_1 15576622 1.8 SYNECHOCOCCUS SP. 4 1 1 4 0 0 1 Enzyme Photolyase Deoxyribodipyrimidine Photolyase 1 1 1 0 1, 1 1 0 0 0 0 1 0 0 1 A AAPILFWHRRDLRLSDNIGLAAARAQSAQLIGLFCLDPQILQSADMAPARVAYLQGCLQELQQRYQQAGSRLLLLQGDPQHLIPQLAQQLQAEAVYWNQDIEPYGRDRDGQVAAALKTAGIRAVQLWDQLLHSPDQILsgSGNpysvygpFWkNWQAQPKPTPVATPTELVDLSPEQLTAIAPLLLSELPTLKQLGFDWDGGFPVEPGETAAIARLQEFCDRAIADYDPQrNFPAEAGTSGLSPALKFGAIGIRQAWQAASAAHALSRSDEARNSIRVWQQeLAwREFyQHALYHFPSLADGPYRSLWQQFPWENREALFTAWTQAQTGYPIVDAAMRQLTETGWMHnrCRmIVASFLTKDLIIDWRRGEQFFMQHLVDGDLAANNGGWQwSASSGmdpkplrifnPAsqAKkfDATATYIKRWLPELRHVHPKDLISGEITPIERRGYPAPIVNhnLRqKQFkALynQLkAAI I;J ATCggctcgc;Cgaagccga 66 89 212 30;22;160;0 1;0;4;0;0;0;1;0;6;4;11;0;0;0;0;1;0;9;50;125 1TKD 1tkd_1_1 15297882 2.49 ESCHERICHIA COLI, BACTERIOPHAGE T7 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Polymerase DNA Polymerase T7 1 1 1 0 2.1, 0 0 0 0 0 1 2 2 0 1 A;B MIVSDIEANALLESVTKFHCGVIYDYSTAEYVSYRPSDFGAYLDALEAEVARGGLIVFHNGHKYDVPALTKLAKLQLNREFHLPRENCIDTLVLSRLIHSNLkDTDMGLlrSgklPGALEAWGYRLGEMKGEYKDDFKRMLEEQGEEYVDGMEWWNFNEEMMDYNVQDVVVTKALLEKLLSDKHYFPPEIDFTDVGYTTFWSESLEAVDIEHRAAWLLAKQERNGFPFDTKAIEELYVELAARRSELLRKLTETFGSWYqPkgGTEMFCHPRTGKPLPKYPRIkTPKVGGIFKKPKNKAQREGREPCELDTREYVAGAPYTPVEHVVFnPssrdhIQKKLQEAGWVPTKYtdkGapvvddEVLEGVRVDDPEKQAAIDLIKEYlmIqkrigqSAegdkAWLRYVAEDGKIHGSVNPNgavtGrathafpnLaqipgVRspYGEQCrAAFGAEHHLDGITGKPWVQAGIDASGLELRCLAHFMARFDNGEYAHEILNGDIHTKNQIAAELPTRDNAKtFIygFLygagDEkIGQiVGAGKERGKELkKKFLENTPAIAALrESIQQTLVESSQwVAGEqQVKWKRRWIKGLDGRKVHVrsPhaALntLLqSAGALICKLWIIKTEEMLVEKGLKHGWDGDFAYMAWvhDeIQVGCRTEEIAQVVIETAQEAMRWVGDHWNFRCLLDTEGKMGPNWAICh;KIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIrGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANL P;T cgACGGccagtgcca;catggcactggCCGTCGT 25;30 86 376 30;29;313;4 2;0;3;1;2;0;2;0;22;7;17;0;0;0;0;0;0;24;54;242 1TRR 1trr_1_1 8232559 2.4 ESCHERICHIA COLI 2 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Trp Repressor 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B aqqsPySAAMAEQrHEEWLRFVDLLKNAYQNDLHLPLLNLMLtPdeREaLGtrVRIVEELLRgEmsqreLkNELgagiatItrGsnSLkAAPVELRQWLEEVLLK;aqqsPySAAMAEQrHEEWLRFVDLLKNAYQNDLHLPLLNLMLtpdeREaLGtrVRIVEELLRGEMSQRELKNELgagIatITrGSNSLKAAPVELRQWLEEVLLK C;I AGcgtactagtACGCT;AGcgtacTAGtacgct 31 21 283 51;8;224;0 3;1;3;0;0;3;1;1;17;14;6;0;0;0;0;3;1;17;39;174 1U8B 1u8b_1_1 16209950 2.1 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Alpha Helix Ada Protein 1 1 1 0 0, 0 0 2 0 0 0 1 0 0 1 A KDDQRWQSVLArDPNADGEFVfAvRttGifRPSCrarhalREnVSFYANASEALAAGFrPckrCQPDKANPRQHRLDKITHACRLLEQETPVtleALADQVAspfhLhrLFkATTGtPkAWQqAWRAR B;C;D;E aaatt;Aattt;AaagcGCAAGAt;atcttgCGCTTt 229 418 221 16;21;184;0 1;0;5;0;0;0;0;1;14;5;6;1;0;0;0;1;1;11;60;115 1UBD 1ubd_1_1 8942976 2.5 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating YY1 Zinc Finger 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 C TIACPHKGCTkMfrDNsaMrkhLhthGPrVHVCAECGkafvesskLkrhQlvHTGEkPFQCTFEGCGkrfsldfnLrthVRiHTGDRPyVCPFDGCNkKfaqstnLkshILtHA A;B AgggtctccatttTGAAGCG;CGCttcaaaatggagaCCCT 236 415 251 102;0;149;0 8;1;3;3;9;0;0;0;3;10;1;0;0;0;0;10;1;19;29;154 1V15 1v15_2_1 15190054 2.4 ESCHERICHIA COLI 4 1 1 4 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease HNH (Colicin E9) 2 1 1 0 2, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B mEsKrnKPGKATGKGKPVGDKWLDDAGKDSGAPIPDRIADKLRDKEFKSfdDFrKAVwEEVSKDPELSKNLNPSNKSSVSKgysPFTPKNQQvggrKvyelhaDKpisQGGEVYDMDNIRVTTPKRhiDIhrGk G;H Gatcgc;gCgatcgc 84 413 145 16;9;120;0 3;0;3;0;2;0;0;0;4;3;7;0;0;0;0;2;0;5;29;87 1W0T 1w0t_1_1 15608617 2 HOMO SAPIENS 1 2 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein Telomeric Protein Telomere Binding Protein, TRF1 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A krqawLWEEDKNLRSGVRKYGEgnwskILlHYKFNNrTsvmLkdrWrtMKkl C;D CTGTTAGGGttagggTtag;TCtaaccctAACCctAACA 204 409 147 35;4;108;0 6;0;5;0;4;0;0;0;3;5;6;0;0;0;0;2;0;6;18;92 1W0U 1w0u_1_1 15608617 1.8 HOMO SAPIENS 1 2 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein Telomeric Protein Telomere Binding Protein, TRF2 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A kkqkwTVEESEWVKAGVQKYGegnwaAISKNYPFVNrTavmIkdrWrtMKrlGMN C;D CTAGGGttagggTtag;CTaaccctAACCcTAGA 203 407 152 32;6;114;0 4;1;6;0;4;0;0;0;4;2;8;0;0;0;0;2;0;7;24;90 1W7A 1w7a_1_1 15297450 2.27 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein Repair Protein DNA Mismatch Repair Protein MutS 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SAIENFDAHtpmMQQYLRLKAQHPEILLFYrmgdfYeLFYDDAKRASQLLDisLtkrgasAGEPIPmagipYhaVEnyLAKLVNQGESVAICEqIGDpATSKgpvErKVVRIVTPGTISDEALLQERQDNLLAAIWQDSKGFGYATLDISSGRFRLSEPADRETMAAELQRTNPAELLYAEDFAEMSLIEGRRGLRRRPLWEFEIDTARQQLNLQFGTRDLVGFGVENAPRGLCAAGCLLQYAKDTQRTTLPHIRSITMEREQDSIIMDAATRRNLEITQNLAGGAENTLASVLDCTVTPMGSRMLKRWLHMPVRDTRVLLERQQTIGALQDFTAGLQPVLRQVGDLERILARLALRTARPRDLARMRHAFQQLPELRAQLETVDSAPVQALREKMGEFAELRDLLERAIIDTPPVLVRDGGVIASGYNEELDEWRALADGATDYLERLEVRERERTGLDTLKVGfnavhGYYIQISRGQSHLAPINYMRRqTlknAErYIIPELKEYEDKVLTSKGKALALEKQLYEELFDLLLPHLEALQQSASALAELDVLVNLAERAYTLNYTCPTFIDKPGIRITEGRHPVVEQVLNEPFIANPLNLSPQRRMLIITGPNMGGKSTYMRQTALIALMAYIGSYVPAQKVEIGPIDRIFTRVGASTFMVEMTETANILHNATEYSLVLMDEIGRGTSTYDGLSLAWACAENLANKIKALTLFATHYFELTQLPEKMEGVANVHLDALEHGDTIAFMHSVQDGAASKSYGLAVAALAGVPKEVIKRARQKLRELESIS;MQQYLRLKAQHPEILLFYrMgdFYELFYDDAKRASQLLDISLTPMAGIPyhAVENYLAKLVNQGESVAICErKVVRIVTPGTISDEALLQERQDNLLAAIWQDSKGFGYATLDISSGRFRLSEPADRETMAAELQRTNPAELLYAEDFAEMSLIEGRRGLRRRPLWEFEIDTARQQLNLQFGTRDLVGFGVENAPRGLCAAGCLLQYAKDTQRTTLPHIRSITMEREQDSIIMDAATRRNLEITQNLAGGAENTLASVLDCTVTPMGSRMLKRWLHMPVRDTRVLLERQQTIGALQDFTAGLQPVLRQVGDLERILARLALRTARPRDLARMRHAFQQLPELRAQLETVDSAPVQALREKMGEFAELRDLLERAIIDTPPVLVRDGGVIASGYNEELDEWRALADGATDYLERLEVRErERTGLdtLkVGFnavhGYYIqIsRgqSHLAPINYMRRqTlknAErYIIPELKEYEDKVLTSKGKALALEKQLYEELFDLLLPHLEALQQSASALAELDVLVNLAERAYTLNYTCPTFIDKPGIRITEGRHPVVEQVLNEPFIANPLNLSPQRRMLIITGPNMGGKSTYMRQTALIALMAYIGSYVPAQKVEIGPIDRIFTRVGAADDSGRSTFMVEMTETANILHNATEYSLVLMDEIGRGTSTYDGLSLAWACAENLANKIKALTLFATHYFELTQLPEKMEGVANVHLDALEHGDTIAFMHSVQDGAASKSYGLAVAALAGVPKEVIKRARQKLRELESIS E;F AgctgccaggcaccAgTG;ACTggtgcttggCagct 21 129 335 17;51;264;3 0;0;2;0;2;2;1;1;16;5;16;0;0;0;0;2;0;19;60;209 1WTE 1wte_1_1 15590682 1.9 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoO109IR 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B MNKQEVILKVQECAAwwILerQSkLTKLmSEtmsINPFMTPFIFDYHSLNDFDELVEAIIAkhLMtgHdtgFgkLIdekILPRVFGAYklDkSYrAANEPFIHPCFdeidHVIQRDDGRIELLSlkagKwtiqltmAVQLNKAFHEIINNYPGVADNIVVGVfyGNShGltdkYriLRGIntgaNhNVIDIRDKVHVYAGKEFWSWLNNGEAETQHWVLEGIERAVKEADIKEKNKDLIEKFKEHVAKKYNEQVLNADGTAQWHKLLEMINE;MNKQEVILKVQECAAwwILerQSkLTKLmSEtmsInPFMTPFIFDYHSLNDFDELVEAIIAkhLMtgHdtgFgkLIdekILPRVFGAYklDKsYrAANEPFIHPCFdeIdHVIQRDDGRIELLSlkagKwtiqltmAVQLNKAFHEIINNYPGVADNIVVGVfyGNShGltdkYriLRGIntgaNhNVIDIRDKVHVYAGKEFWSWLNNGEAETQHWVLEGIERAVKEADIKEKNKDLIEKFKEHVAKKYNEQVLNADGTAQWHKLLEMINE X;Y accgggccctgcc;ggcagggcccggt 143 402 585 114;24;444;3 4;0;9;0;2;2;9;0;7;24;13;0;0;0;3;0;7;48;101;356 1XBR 1xbr_1_1 9349824 2.5 XENOPUS LAEVIS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet T Box, Protein T 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B ELKVSLEERDLWTRFKELTNEMiVtknGrrmfPVLKVSMSGLDPNAMYTVLLDFVAADNHrwkyVNGEWVPGGKPEPQAPSCVYIHPDSPNFGAHWMKDPVSFSKVkLTnkMNGGGQIMLNslHKYEPRIHIVRVGGTQRMITSHSFPETQFIAVtayqNeEItALkiKHnpfakafLdAKErN;ELKVSLEERDLWTRFKELTNEMiVtknGrrmfPVLKVSMSGLDPNAMYTVLLDFVAADNHrwkyVNGEWVPGGKPEPQAPSCVYIHPDSPNFGAHWMKDPVSFSKVkLTnkMNGGGQIMLNslHKYEPRIHIVRVGGTQRMITSHSFPETQFIAVtayqNEEItALkiKHnpfakafLdAKEr C;D AatttcACacctaggtgtgAAATT;AatttcACacctaggtgtgAAATT 162 391 417 47;27;343;0 2;0;2;0;0;0;2;0;14;8;8;0;0;0;0;3;5;26;94;253 1Y6F 1y6f_1_1 16081100 2.4 BACTERIOPHAGE T4 1 2 1 2 0 0 1 Enzyme Glucosyltransferase DNA Alpha Glucosyltransferase 1 1 1 0 0, 0 1 0 0 0 1 1 0 0 1 A MGSMRICIFMArGLeGcGVTKFSLEQRDWFIKNGHEVTLVYAKDksftrTSSHDHKSFSIPVILAKEYDKALKLVNDCDILIINSVPATSVQEATINNYKKLLDNIKPSIRVVVYQHDHsvlsLrrNLGLEETVRRADVIFSHSDNGDFNKVLMKEWYPEEAPTVYNFQPPMDIVKVRSTYWKDVSEINMNINRWIGrtttwKGFYQMFDFHEKFLKPAGKSTVMEGLerspafiAIkeKGIPYEYYgnreIDKMNLAPNQPAQILdCYINSEMLERMSKSGFGYQLSklnQkyLQRSLEYTHLELGACGTIPVFWKSTGENLKFRVDNTPLTSHDSGIIWFDENDMESTFERIKELSSDRALYDREREKAYEFLYQHQDSSFCFKEQFDIITK C;D GATactagATAG;Ctatctgagtatc 48 386 184 47;26;104;7 1;1;3;0;0;1;3;0;6;9;4;1;0;0;0;3;1;10;19;122 1YF3 1yf3_1_1 15882618 2.29 BACTERIOPHAGE T4 1 2 1 1 0 0 1 Enzyme Methyltransferase DNA Adenine Methylase 1 1 1 0 1, 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 A mlGAIAYTGNKqsLLpeLKsHFPKYNRFVDLFCGGLSVSLNVNGPVLANDIQEPIIEMYKRLINVSWDDVLKVIKQYKLSktSKEEFLKLREDYNKTRDPLLLYVLHFHGfsNMIRINYKGNFTTPFgkrtinknSEkRFNhFKQNCDKIIFSSLHFKDVKILDGDFVYVDPPYLITVADYNKFWSEDEEKDLLNLLDSLNDRGIKFGLSNVLEHHGKENTLLKEWSKKYNVKHLNKKYVFNIYHSKEKNGTDEVYIFN C;D AcCatgATCTGAc;TGTcagaTCATGg 146 380 91 4;9;73;5 0;0;0;0;1;0;1;0;6;4;6;0;0;0;0;0;0;5;13;55 1YO5 1yo5_1_1 15882048 2 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Ets Domain, PDEF 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 C QpihlWQFLKELLLKPHSYGRFIRWLNKEKGIFKIEDsAQVARLwGIRkNrPamNydklsrsIrqyykkGiIRkPDIsQrlVyQFVHP A;B tagcaggatGtgt;ACacatccTGCta 243 378 221 54;7;159;1 6;1;3;0;3;0;1;0;5;4;4;0;0;0;0;3;1;10;45;135 1ZME 1zme_1_1 9303004 2.5 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating GAL4 Type, Put3 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 1 2 1 1 1 C;D svaCLSCrKrhikcPGGNPCQKCVTSNAICEYLEPSKkIvVStKYlqQLqKDLNDKTEENNRLKALLLER;svaCLSCrkrhikcPGGNPCQKCVTSNAICEYlepskkivvsTKyLQQLQKDLNDKTEENNRLKALLLER A;B AcggGAAGccaactccG;AcggAGtggctcccg 196 373 261 63;24;174;0 3;0;1;0;0;0;10;0;8;6;9;0;0;0;0;0;4;6;53;161 1ZRF 1zrf_1_1 16427082 2.1 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Catabolite Gene Activator Protein 1 1 1 0 2, 1 0 2 0 0 0 2 1 2 1 A;B TDPTLEWFLSHCHIHKYPskSTLIHQGEKAETLYYIVKGSVAVLIKDEeGkEMILSYLNQGDFIGELGLFEEGQERSAWVRAKTACEVAEISYKKFRQLIQVNPDILMRLSAQMARRLQVTSEKVGNLAFLdvtGRIAQTLLNLAKQPDAMTHPDGMQIkItrqeIGQIVgcsretVgriLkMLEDQNLISAhgktIVVYGTR;DPTLEWFLSHCHIHKYPskSTLIHQGEKAETLYYIVKGSVAVLIKDEeGkEMILSYLNQGDFIGELGLFEEGQERSAWVRAKTACEVAEISYKKFRQLIQVNPDILMRLSAQMARRLQVTSEKVGNLAFLdvtGRIAQTLLNLAKQPDAMTHPDGMQIkItrqEIGQIVgcsretVgriLkMLEDQNLISAhgktIVVYG W;X;Y;Z TTCGAAAaatgcgaT;CTagatcgCATTtttcGAAAT;TTTCGAAAaatgcgAT;CTagatcgCATTtttcGAAAT 62 371 269 61;0;208;0 6;2;6;0;4;0;0;0;3;13;18;0;0;0;0;6;0;24;28;159 1ZS4 1zs4_1_2 16039594 1.7 BACTERIOPHAGE LAMBDA 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Repressor Protein CII 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 1 0 2 1 2 1 C;D ANKRNEALRIESALLNKIaMLgtekTAEAVgvdksqIsrwkrdwIPKFSMLLAVLEWGVVDDDMARLARQVAAILTNKK;RNEALRIESALLNKIAMLGTEKTAEAVGVDKSqISrWKrdwIPkFSMLLAVLEWGVVDDDMARLARQVAAILT T;U TATtcgtgcaaACAAACGCAACGAGGT;TACCTCGTTGCGTTTgtttgcACGAat 96 369 147 58;2;87;0 4;1;4;0;2;0;0;0;8;4;5;0;0;0;0;6;2;12;26;73 2A07 2a07_1_2 16407075 1.9 HOMO SAPIENS 2 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Forkhead Box Protein P2 1 2 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 1 0 0 1 J IVrPPftyaTLIRQAIMESSDRQLTlnEIySWFTRTFAYFRRNAAtWKnaVrhnLslhkCFVrVeNVKGaVwTVDEVEYQKrr A;B AACTATGaaacaaATTTtcCT;TTAGGAAaatttgTTTCATAG 55 77 126 45;0;81;0 2;0;0;0;1;0;0;0;4;3;4;0;0;0;0;1;2;9;23;77 2A66 2a66_1_1 16289203 2.2 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Hormone Nuclear Receptor, Orphan Nuclear Receptor NR5A2 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A ELCPVCGdKVSGyhyGLLTCesCkgfFkrTVqNNkRyTCIENQNCQIDkTQrkRCpYCrFQKCLSVGMKLEavrADrmrggrnKFgpMyKRDRAL B;C GTtcaaggcCAG;ctggccttgaac 241 366 237 40;29;167;1 7;0;8;0;2;2;1;1;16;0;5;0;0;0;0;1;0;12;36;146 2AC0 2ac0_1_1 16793544 1.8 HOMO SAPIENS 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Loop Sheet Helix, Tumor Supressor Protein p53 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 1 0 2 1 1 1 A;B SSSVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGTaksvtCTYSPALNKMFCqLAkTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnssCmGGMnrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcacPGrdRRtEEEnLRKK;SSSVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGtaksVTCTYSPALNKMFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnSsCmGGMNrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcacPgrdRrtEEEnLRK E;F cgggCatgccCg;cgggCatgccCG 8 365 213 61;8;138;6 7;1;7;1;2;0;0;0;13;3;7;0;0;0;0;3;1;17;34;117 2AOR 2aor_1_2 16209953 2 HAEMOPHILUS INFLUENZAE 1 2 0 1 0 0 1 Enzyme Nuclease DNA Mismatch Repair Protein MutH 1 2 1 0 0, 0 0 0 0 0 1 1 0 0 1 B MIPQTLEQLLSQAQSIAGLTFGELADELHIPVPIDlkrdkgWvgmLLerALGATagskaeQdFSHLGVelktLpINAEGYPlettfvSlAPLVQNSGVKWENSHVRHkLSCVLWMPiEgSrHIPLRErHIGAPIFWKPTAEQERQLKQDWEELMDLIVLGKLDQItarIGEVMqLrpkgansravtKGIGKNGEIIDTLpLGFyLrkeFTAQILNAFLETK C;D CAGGTCCAAGCttggatccTG;CaggtccaagcTTGGATCCTG 112 76 326 79;21;225;1 3;0;6;0;2;1;1;3;8;9;9;0;0;0;0;4;6;23;58;193 2AQ4 2aq4_1_1 16195463 2.32 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Polymerase DNA Repair Protein REV1 1 1 1 0 4, 0 0 0 0 0 1 1 0 0 1 A KriVACDDPDfLTsyfAhsrlhHlsAWkaNLkDKFLNENIHKYTKITDKDTYIIFHIDFDCFFATVAYLCRSSSFSACDFKRDPIVVChgtknsdIASCNYVARSYGIKNGMwVSQAEKMLPNGIKLISLPyTFEQFQLKSEAFYSTLKRLNIFNLILPiSIDeAVCVRIIPDTLNARLCEEIRQEIFQGTNGCTVSIGCSDSLVLArLALKMAKPNGYNITFKSNLSEEFWSSFKLDDlpgvghstLSrLESTFDSPHSLNDLRKRYTLDALKaSVgsklGMkIHLALQGQDdEeSLKILYDPKEvLqrkslsidinwGIRFKNITQVDLFIERGCQyLLEKLNEINKTTSqITLKLMRRCKDAPIEpPkyMgmgRCdsfsrsSrLGIPTNEFGIIATEMKSLYRTLGCPPMELRGLALqFNKLVDV P;T ATCctccccta;taaggtaggggaGGAT 130 75 457 69;45;334;9 2;1;3;1;2;2;1;2;10;19;35;0;0;0;0;3;0;17;86;273 2B9S 2b9s_1_1 16487540 2.27 LEISHMANIA DONOVANI 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Topoisomerase Topoisomerase I 1 1 1 0 0, 0 0 1 0 0 0 2 2 0 1 A;B DLNWWEQENLRIAMkgERrWETLAHNGVLFPPEYEPHGIPIFYDGREFKMTPEEEEVATMFAVMKEhDyYRMEVFRRNFFESWREILDKRQHPIRRLELCDFEPIYQWHLVQREKkLSRTKEEKKAIkEKQDAEAEPYRYCVWDGRREQVanFrVepPGLfrgrGKhPLMGKLkVRVQPEDITINIGETAEVPVPPAGHKWAAVQHdHtvtwLAmWrdSVAGnmkyVmLAPSSSVkGQsdMVkFEKARKLKDKVDDIRASYMEDFKSNDLHVAQRAVAMYFIDRLALrvgnekGEDeADtVGCCSLRVEHIQLMPDNIVRFDFLgkdSiRYQNDVAVLPEVYALLQRFTRRKSPGMDIFDQLnptQLndHLkSFMDgLsakVFRtYNASITLDRWFKEKPWSTADKLAYFNKANTEVAILCnhqks;kAVsLGtSKinyIDPRIICSWAKAQDVPInkiFsatIQKKFPWAMNAENFDF C;D;E AaaAagactt;agaaaaaTTTTT;AAAAATTtttctaagtcttTTT 214;258 349 375 42;17;316;0 7;1;2;0;1;0;1;0;23;16;18;0;0;0;0;3;0;27;50;226 2BNW 2bnw_1_1 16528102 2.45 STREPTOCOCCUS PYOGENES 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Ribbon|Helix|Helix Omega Repressor 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B DIMGdktvrVRADLhHIIkIETAKNGGnvkeVMDQALEEYIRKYLPDKL;MAKKdImGdktvrVRADLhHIIkIETAKNGgnvkeVMDQALEEYIRKYLPDKL E;F GaatcaCAAatcACAAGC;CTTGTGATttgtgaTTCG 107 346 159 57;0;102;0 3;1;3;2;2;0;0;0;1;0;7;0;0;0;0;3;2;10;24;101 2BOP 2bop_1_1 1328886 1.7 BOVINE PAPILLOMAVIRUS TYPE 1 1 1 1 1 0 0 1 Transcription factor Alpha|Beta Regulatory Protein E2 1 1 1 2 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;D SCFALISGtanqVkcyrfrVkknhRHRYENCTttWfTvAdNgaErQGQAQILITFGSPSQRQDFLKHVplppGmNISGFTASLDF;SCFALISGtanqVkcyrfrVkknhRHRYENCTttWfTvAdNgaErQGQAQILITFGSPSQRQDFLKHVplppGmNISGFTASLDF B;E ccgacCGACgtcggtcG;ccgacCGACgtcggtcG 183 344 328 78;0;250;0 8;0;4;0;4;0;0;0;12;6;8;0;4;2;0;2;0;18;60;200 2C6Y 2c6y_1_1 0 2.4 HOMO SAPIENS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Forkhead Box Protein K2 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A DSkPPysyaQLIVQAITMAPDKQLTlnGIyTHITKNYPYYRTADkgWQnsIrhnLslnryFIkVPRSQEEpgkgsFwRIDPASESKLIEqAFRKrrPr C;D TGttgtaaaCAAtacA;ATGTattgtttaCAac 174 340 198 52;8;138;0 4;0;4;0;0;0;0;0;13;4;6;0;0;0;0;2;3;8;38;116 2C9L 2c9l_1_1 16483937 2.25 HUMAN HERPESVIRUS 4 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, BZLF1 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 Y;Z MlEIkrYknrVaarksrAkfkQLLQHYREVAAAKSSENDRLRLLLKQMCPSLDVDSIIPRTPD;LEiKrYknrVaarksrAkFkQLLQHYREVAAAKSSENDRLRLLLKQMCPSLDVDSIIPRTPD A;B AAGCactgactcatGAAGT;ACTtcatgagtcaGTGCT 199 334 187 65;0;122;0 4;0;5;0;4;0;0;0;1;4;1;0;0;0;0;4;4;24;38;98 2D5V 2d5v_1_1 17223534 2 RATTUS NORVEGICUS 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, HNF-6 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A MEEINTKEVAQRItTELkRYsipqaIFAQRVLcrsqgtLsdlLrnPkPWSklksgREtFRRMWKWLQEPEFQRMSALRLprlvfTDVQrRTLhAIFKENKrPSkELqITISQQLGLElstVsnfFmnArrrSLDk C;D TctaagtcaataAT;AttattgacTtaG 169 331 275 85;8;182;0 10;1;10;0;4;0;0;0;14;9;7;0;0;0;1;8;3;18;28;162 2DDG 2ddg_1_1 17870091 2.1 THERMUS THERMOPHILUS HB8 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Glycosylase Uracil DNA Glycosylase 1 1 1 0 1, 0 1 0 0 0 1 1 0 0 1 A MDREAFVQTLTACRLCPRLVAwREEVVGrkraFrGEPYWARPVPGFGDPEARILLFGlAPgahGSNRTGRPFTGdasGAFLYPLLHEAGLSSKPESLPGDDLRLYGVYLTAAVRCAPPknkPTpEELRACARWTEVELGLLPEVRVYVALgrIALEALLAHFGLRkSAHPfRHGAHYPLPGGRHLLASyhVsrqnTqtGrLTREMFLEVLMEAKRLAGL C;D ATGTTgcttagTCC;ggacTAaggcaaca 113 73 227 25;38;159;5 6;0;6;0;1;1;2;1;20;5;8;0;0;0;0;0;1;7;29;140 2DGC 2dgc_1_1 7500340 2.2 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 1 1 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, GCN4 1 1 1 2 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;D ALkrArntEaarrsrArklQrMKQLEDKVEELLSKNYHLENEVARLKKL;ALkrArntEaarrsrArklQrMKQLEDKVEELLSKNYHLENEVARLKKL B;E TGGAgatgacgtcaTCTCC;TGGAgatgacgtcaTCTCC 206 329 172 62;0;110;0 6;0;2;0;4;0;0;0;6;6;0;0;0;0;0;6;4;42;26;70 2DNJ 2dnj_1_1 1748997 2 BOS TAURUS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Nuclease Deoxyribonuclease I 1 1 1 0 2, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A LKIAAFNIrtFgetkMSNATLASYIVRIVRRYDIVLIQeVrdshLVAVGKLLDYLNQDDPNTYHYVVSEpLGRnsykeRYLFLFRPNKVSVLDTYQYDDDSFsrEPAVVKFSSHSTKVKEFAIVALhSapsDAVAEINSLYDVYLDVQQKWHLNDVMLMGDFnADCSyVTSSQWSSIRLRTSSTFQWLIPDSADTTATSTNCAYDRIVVAGSLLQSSVVPGSAAPFDFQAAYGLSNEMALAISdhYPVEVTLT B;C GCgatcgc;GCgatc 149 328 134 0;15;119;0 1;1;5;0;1;0;0;0;7;8;9;0;0;0;0;0;0;3;27;72 2DTU 2dtu_3_1 17098747 2.37 BACTERIOPHAGE RB69 4 1 1 4 0 0 1 Enzyme Polymerase DNA Polymerase Family B 3 1 1 0 2, 1 0 0 0 1 1 1 0 0 1 C MKEFYLTVEQIGDSIFERYIDSNGRERTREVEYKPSLFAHCPESQATKYFDIYGKPCTRKLFANMRDASQWIKRMEDIGLEALGMDDFKLAYLSDTYNYEIKYDHTKIRVANFDIEVTSPDGFPEPSQAKHPIDAITHYDSIDDRFYVFDLLNSPYGNVEEWSIEIAAKLQEQGGDEVPSEIIDKIIYMPFDNEKELLMEYLNFWQQKTPVILTGWNVeSFAIPYVYNRIKNIFGESTAKRLSPHRKTRVKVGEIITLFGISvLDYIdLYKKFSfTnQPSYSLDYISEFELNVGKLKYDGPISKLRESNHQRYISYNIIAVYRVLQIDAKRQFINLSLDMGYYAKIQIqSVfspiKTWDAIIFNSLKEQNKVIPQGRSHPvQpyPgaFvKePIPNRYKYVMSFDLTslypSIIRQVNISPETIAGTFKVAPLHDYINAVAERPSDVYSCSPNGMMYYKDRDGVVPTEITKVFNQRKEHKGYMLAAQRNGEIIKEALHNPNLSVDEPLDVDYRFDFSDEIKEKIKKLSAKSLNEMLFRAQRTEVAGMTAQINRKLLinSLygALgnVwFRYYDLRNATAITTFGqMALQWIERKVNEYLNEVCGTEGEAFVLYGdtdsIyVSADKIIDKVGESKFRDTNHWVDFLDKFARERMEPAIDRGFREMCEYMNNKQHLMFMDREAIAGPPLGSKGIGGFWtgkkryALNVWDMEGTRYAEPKLkimgLeTqkssTPKAVQKALKECIRRMLQEGEESLQEYFKEFEKEFRQLNYISIASvssAnnIAkyDVGGFPgpkcpfhIrGILTYNRAIKGNIDAPQVVEGEkVYVLPLREGNPFGDkCIAWPSGTEITDLIKDDVLHWMDYTVLLEkTFIkpLEGFTSAAKLDYEKKASLFD I;J cgcttatgacagCCGCG;GCGGCTgtcataaga 61 324 358 20;40;287;11 3;0;3;0;1;2;0;0;13;12;18;0;0;0;0;0;0;15;46;245 2E1C 2e1c_1_1 18073105 2.1 PYROCOCCUS HORIKOSHII 1 1 1 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Transcriptional Regulator PH1519 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A PLDEIDKKIIKILQNDGkaplrEISKITglaestIherIrkLRESGVIKKFTAIIDPEALGYSMLAFILVKVKAGKYSEVASNLAKYPEIVEVYETTGDYDMVVKIRTKNSEELNNFLDLIGSIPGVEGTHTMIVLKTHKETTELPI B;D agtgaaAATTttTCACA;TGTGAAAAAttttcACT 226 322 97 43;0;54;0 0;1;0;1;2;0;0;1;0;1;2;0;0;0;0;6;2;4;24;53 2E52 2e52_1_1 0 2 HAEMOPHILUS INFLUENZAE 3 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease HindIII 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B KKSALEKLLSLIENLTNqefkQATNSLISFIYKLNRNEVIELVRSIGIlPEAIKpsstQekLFskAGdIVLAKAFQLLNLNSKPLeQrgnaGdVIALSKEFNYGLVAdaksfrLsrtaknqkdFkVKALSEwREDKDYAVLTAPFFQYpttksqIFKQSLDENVLLFSWEHLAILLQLDLEETNIFSFEQLWNFPKKQSKKTSVSDAeNNFMRDFNKYFMDLFKIDKDTLNQLLQKEINFIEERSLIEKEYWKKQINIIKNFTREEAIEALLkdInMSskIETIDSFIKGIKSNDRLYL;KSALEKLLSLIENLTNqefkQAtNSLISFIYKLNRNEVIELVRSIGIlPEAIkpsstQekLFskAGDIVLAKAFQLLNLNSKPLeqrgnaGdVIALSKEFNYGLVAdaksfrLsrtaknqkdFkVKALSEwREDKDYAVLTAPFFQYpttksqIFKQSLDENVLLFSWEHLAILLQLDLEETNIFSFEQLWNFPKKQSKKTSVSDAeNNFMRDFNKYFMDLFKIDKDTLNQLLQKEINFIEERSLIEKEYWKKQINIIKNFTREEAIEALLKdInMSskIETIDSFIKGIKSNDRLYL E;G gccaagcttggc;gccaagcttggc 70 71 611 94;43;472;2 10;2;8;2;11;0;0;0;23;24;30;0;0;0;0;6;4;30;100;361 2ETW 2etw_1_1 16531239 1.67 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet NDT80 Protein 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A VILTQLNEDGTTSNYFDkRKlkiaprstLqfKVGPPFELVRDYCPVVESHTGRTLDLRIIPRIDrGFDHIDEEWVGykrnyFTLVSTFETANCDLDTFLKSSFDLLVEDSSVEGRLRVQYFAIKIKAKNDDDDTEINLVQHTakrdkGPqFCPSVCPLVPSPLPKHQTIreAsnvrnITkMKKYDSTFYLHRDHVNYEEYGVDSLLFSYPEDSIQKVARYErVQFAssISVKKPSQQNKHFSLHVILGAVVDPDPGIPYDELALKNGSKGMFVYLQEMKTPPLIIRGrspSNyAsSQ B;C gccacaCaaaaac;AGTTtttgtgtGGC 33 2 275 50;20;203;2 3;0;8;0;0;1;0;0;13;5;7;0;0;0;0;2;4;15;39;178 2EX5 2ex5_1_1 16698548 2.2 CHLAMYDOMONAS EUGAMETOS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease I-CeuI 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B ILKpgEKLPQDKLEELkKIndAVkKTkNFSKYLIDLRKLFQIDEVQVTSESKLFLAGFLEgeasLnistkklAtskFGLvVdPeFnVtrhVNGVKVLYLALEVFKtGrIrhksgsnAtLvLtIdnrqSLEEKVIPFYEQYVVAFSSPEkVKrVANFKALLELfNNdAhqDLEQLVNKILPIwDQmrkqQGqsnegFPNLEAAQDFAR;ILKpgEKLPQDKLEELkKIndAVkKTkNFSKYLIDLRKLFQIDEVQVTSESKLFLAGFLEgeasLnistkklAtskFGLvvdPeFnVtrhVNGVKVLYLALEVFKTGrIrhksGsnatLvLtIdnrqSLEEKVIPFYEQYVVAFSSPEkVKrVANFKALLELfNNDAhqDLEQLVNKILPIwDQmrkqQgqsnegfPNLEAAQDFAR X;Y CgataacggtcctaaggtagcgaagC;GcttcgctaccttaggaccgttatcG 155 317 682 163;18;501;0 8;5;8;0;15;0;3;0;26;15;32;0;0;0;0;12;6;50;100;402 2EZV 2ezv_1_1 16308566 2.4 1 1 1 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease SfiI 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B MHQDYRELSLDELESVEKQTLRTIVQALQQYSKEAKSIFETTAADssGEviVLAeDITQYALEVAETYPINRRFAGfIdYKRVRWLPSPHGLLPQVLLVdakasteKnrDtLqRsqLPMDAEfrntssGEVVTMEAGVIPHLMLQSANDGVLPAVTTSIFVHFYyReLKEGRYRELKSIYVLSLPHARLKQRYNPDPDTSFFgagkhsparGevArIrVyFDrLKEACPWRLQELHYSADSEYTQPRWRDLNDAGHEVTKEFLFLER;MHQDYRELSLDELESVEKQTLRTIVQALQQYSKEAKSIFETTAAdssgEvivLaeDITQYALEVAETYPINRRFAGfIdYKRVRWLPSPHGLLPQVLLVdakasteKnRDtLqRsqLPMDAEfrntsSGEVVTMEAGVIPHLMLQSANDGVLPAVTTSIFVHFYyReLKDVEGRYRELKSIYVLSLPHARLKQRYNPDPDTSFFGagkhsparGevArIrVyFdrLKEACPWRLQELHYSADSEYTQPRWRDLNDAGHEVTKEFLFLER F;G tggccaacaaggccT;aggccttgttggcCA 144 316 452 140;3;307;2 18;0;11;0;10;0;4;0;11;24;18;0;0;0;0;8;3;18;48;279 2FCC 2fcc_1_1 16916523 2.3 BACTERIOPHAGE T4 2 1 1 2 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease V 1 1 1 0 0, 0 1 0 0 0 1 1 0 0 1 A trINLTLVSELAdqhLmaEyreLprVFgaVRkhVAnGKRVRDfKISPTFILgaghvtFFyDKLEFLRKRqIELIAECLKRgfnikdTtVqDISDIPQEFRGDYIPHEASIAISQArLDEkIAqrPTwykYYgKAIYA C;D CCAggagaagcC;GGCcaccgG 167 310 198 25;25;146;2 1;0;1;0;1;2;1;0;5;2;12;0;0;0;0;0;0;9;32;132 2FKC 2fkc_1_1 16473850 2.39 HAEMOPHILUS INFLUENZAE 2 1 1 2 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease HinP1I 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A MNlvElgsKtakdgfKNeKDIADRFENWKENSEAQDWLVTMGHNLDEIKSVKAVVLsgykSdINVQVLVFYKDALDIHNIqvklvsnKrgfnqidkhwLAhYQEMWKFDDNLLRILRHFTGELPPYHSNTKdKrrMfMTEFSQEEQNIVLNWLEKNRVLVLTDILRGRGDFAAEWVLVAQKVSNNARWILRNINEVLQHYGSGDISLsprGsInFGRVtIqrkggdngrEtANMLqFkIDPTELFDI C;D ccagcgctgg;ccagcgctgg 111 307 400 93;25;280;2 6;0;8;0;4;2;3;0;21;9;15;0;0;0;0;2;3;11;63;253 2FLP 2flp_1_1 16615915 2.4 HOMO SAPIENS 1 1 1 1 0 0 1 Enzyme Polymerase DNA Polymerase Iota 1 1 1 0 2, 0 0 0 0 0 1 1 0 0 1 A SSRVIVHVDLDCFyAQVEMISNPELKDKPLGVQqkylVvTCNYEARKLGVKKlMnVRDAKEKCPQLVLVNGeDlTRYrEMSyKVTELLEEFSPVVerlgfDENFVDLTEMVEKRLQQLQSDELSAVTVSGHVYNNQSINLLDVLHIRLLVGSQIAAEMREAMYNQLGLTGCAGVASNKLLAkLVSGVFKPNQQTVLLPESCQHLIHSLNHIkEipgigyktAKCLEALGINSVRDLQTFSPKILEKELGIsvAQrIQKLSFGEDNSPViLsGPpqsfseedsFkKCSSEVEAKNKIEELLASLLNrVCQDGRKPHTVrLIIrRYygresrqCPIPSHVIQVMTPMVDILMKLFRNMTLLSVCFCNLK P;T aggacc;tggggtcCt 36 302 260 26;22;210;2 5;0;4;0;0;0;1;1;10;11;20;0;0;0;0;1;0;15;28;164 2FQZ 2fqz_1_1 16628220 2 ENTEROBACTER CLOACAE 2 1 1 2 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRII 1 1 1 0 0, 0 1 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B LSPGEFkTLIsKErkSHfITpFALVYKTFCDLGYDQKNSDYFLNNPSEYIIAMrKNcwKEfEPFEKEFTTRMLSYLIDEERIKDMSPYDAIRDFTMEYPTHIyDLAlsNtqsrrsragkeFeSILELLMMGAGIPVDVQGAIIGklVdLVMPGVVQYTSNKRNTMLIsakttLrerwqeVPEeVNRTGIREMYLATLDDsFsEetINILYEANVVVVTTVENKNFKYKNNNRVLTFEDMLQSAMELSRKWNNVSYTDSEKEEIQQSILKQIEKYSDFPYVVNYYRNRLSA;LSPGEFKTLIsKErkSHfITpFALVYKTFCDLGYDQKNSDYFLNNPSEYIIAMrKNCwKEFEPFEKEFTTRMLSYLIDEERIKDMSPYDAIRDFTMEYPTHIyDLAlSNtqsrrsraGkeFeSILELLMMGAGIPVDVqGAIIGklVdLVMPGVVQYTSNKRNTMLISakttLrerwqEVPEeVNRTGIREMYLATLDDSFsEEtINILYEANVVVVTTVENKNFKYKNNNRVLTFEDMLQSAMELSRKWNNVSYTDSEKEEIQQSILKQIEKYSDFPYVVNYYRNRLSALFD E;F cgcCagGGc;gcCCtgGcg 39 18 392 85;51;252;4 8;2;0;2;4;1;2;1;17;20;8;0;0;0;0;3;0;13;70;241 2G1P 2g1p_1_2 16524590 1.89 ESCHERICHIA COLI 1 2 0 1 0 0 1 Enzyme Methyltransferase DNA Adenine Methylase 1 2 1 0 0, 0 1 0 0 1 0 1 0 0 1 B KNRAFLKWAGGKYPLLDDIKRHLPKGECLVEPFVGAGSVFLNTDFSRYILADINSDLISLYNIVKMRTDEYVQAARELFVPETNCAEVYyQFrEEFNKSQDPFRRAVLFLYLNRYGyNGlCrynlRGEFnVpfGrYKKPYFPEAELYHFAEKAQNAFFYCESYADSMARADDSSVVYCDPPYAPLtnSFTLEQQAHLAEIAEGLVERHIPVLISNHDTMLTREWYQRAKLHVVKVKVDELLALYKP F;G tCTAGATCTAGA;TCTAGAtctaga 151 300 90 29;4;56;1 2;0;2;0;0;0;0;1;4;2;2;0;0;0;0;0;0;4;17;56 2GE5 2ge5_1_1 16981705 2.4 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRV 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtkVLsTIFELFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKENEKIKFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTRVATRKSSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNye;SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtkVLsTIFELFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKENEKIkFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTrVATRKSSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNye C;D Aaagatatctt;aaagatatctt 153 299 427 101;22;302;2 4;2;6;4;5;4;5;2;24;20;13;0;0;0;0;5;2;11;49;271 2GIH 2gih_1_1 16675462 2.5 HAEMOPHILUS INFLUENZAE 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease HincII 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SFIKPIYQDINSILIGQKVKRPKSGTLsghAAGEPFEKLVYKFLKENLSDLTFKQYEYLNDLFMKNPAIIGHEARyKLFNSPTLLFLLsrgkaaTENWSIENLFEEkqndtadILLVKDQFYELLdvktrnISksafapniisAykLAqTCAKMIDNKEFDLFDINYLEVDwELNGEDLVCVSTSFAELFKSEPSELyInWaaamqIqFHVRDLDQGFNGTREEWAKSYLKHFVTqAEQrAIsMIDkfVKPFKKYIL;SFIKPIYQDINSILIGQKVKRsGHaAGePFEKLVYKFLKENLSDLTFKQYEYLNDLFMKNPAIIGHEARyKLFNSPTLLFLLSrgkaaTENWSIENLFEEkqndtAdILLVKDQFYELLdvktrnISksafapniisAykLAqTCAKMIDNKEFDLFDINYLEVDwELNGEDLVCVSTSFAELFKSEPSELyInWaaamqIqFHVRDLDQGFNGTREEWAKSYLKHFVTQAEQrAIsMIDkfVKPFKKYIL E;F GCcggtcgaccggc;GCcggtcgaccggc 13 68 553 152;39;339;23 6;1;10;1;6;2;4;2;12;9;20;0;0;0;0;1;9;33;108;329 2H27 2h27_1_1 16903784 2.3 ESCHERICHIA COLI 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Sigma E Factor 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A SHMLSEELRQIVFRTIESLpEdlRMAITLrELDGLsyeEIAAIMDcpvgtVrsrIfrArEAIDNKVQPLIR B;C CCcggaaCTTCG;CGaagttcCGG 194 67 144 59;0;84;1 3;2;4;0;0;0;1;0;3;3;2;0;0;0;0;0;1;12;30;83 2H7G 2h7g_1_1 16885024 1.9 VARIOLA VIRUS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Topoisomerase Topoisomerase I 1 1 1 0 4, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 X MRALFYKDGKLFTDNNFLNPVSDNNPAYEVLQHVkIpthLTDVVVyGQTWEEALTRlIFVGSdskGrrqyfyGKMhVQNrnAkrDRIFVRVYNVMKRINSFINKNIKKSSTDSNYQLAVFMLMETMFFIrfgkmkyLkEnEtVGLLTLKNKHIEISPDKIVIKFVGkdkVSHEFVVHKSNRLYKPLLKLTDDSSPEEFLFNKLserkVyESikQFGIrikDLrtYGVNYTFLYNFWTNVKSISPLPSPKKLIALTIKQTAEVVGhTPsiSkraYMATTILEMVKDKNFLDVVSKTTFDEFLSIVVDHVKSST Y;Z Ttgtcgccctta;taataagggcGaCA 216 294 295 90;6;199;0 7;0;6;0;3;0;2;1;6;6;7;0;0;0;0;1;2;22;55;177 2H7H 2h7h_1_1 0 2.3 AVIAN SARCOMA VIRUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, v-jun 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B kAERkrMrnrIaasksrKrklERIARLEEKVKTLKAQNSELASTANMLREQVAQLKQK;kaERkrMrnrIaasksrKrklERIARLEEKVKTLKAQNSELASTANMLREQVAQLKQK X;Y CGTcgatgactcatCGACG;CGTcgatgagtcatCGACG 104 293 215 88;0;127;0 8;0;6;0;4;0;0;0;3;7;0;0;0;0;0;2;5;21;33;126 2HAN 2han_1_1 17426125 1.95 DROSOPHILA MELANOGASTER 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Hormone Nuclear Receptor, Glucocorticoid Receptor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 2 1 1 A;B KHLCSICGdrAsgkhygVYScegCkgfFkrTVrkDlTyACrENRNCIIDKRQrnrCqYCrYQKCLTCGMKREavqeer;RVQEELCLVCGdrAsgyhyNALTCegCkgfFrRSVTkSAVyCCkFGRACEMDMYMrrkCqECrLKKCLAVGMRPEcvvpEnqcAMkr C;D CAagggttCAatgcacTtgt;GACaagtgcAttgaaCCctT 46;244 292 340 76;2;262;0 8;0;8;0;3;0;2;0;24;0;13;2;0;0;0;1;1;37;27;214 2HDD 2hdd_1_1 9309220 1.9 DROSOPHILA MELANOGASTER 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Engrailed 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A rtafSSEQlARLKREFNENRylTERRrQQLSSELGLNEAqIkiwFknKrakIkkS C;D TTTTGCCATgtaatcCCCGGA;ATCCggggatTacatGGCAAA 35 290 133 30;8;95;0 7;0;6;0;1;0;0;0;8;2;3;0;0;0;0;0;0;9;19;78 2HHX 2hhx_1_1 17179038 2.26 BACILLUS STEAROTHERMOPHILUS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Polymerase DNA Polymerase I 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 1 1 0 0 1 A KMAFTLADRVTEEMLADKAALVVEVVEENYHDAPIVGIAVVNEHGRFFLRPETALADPQFVAWLGDETKKKSMFDSKRAAVALKWKGIELCGVSFDLLLAAYLLDPAQGVDDVAAAAKMKQYEAVRPDEAVYGKGAKRAVPDEPVLAEHLVRKAAAIWELERPFLDELRRNEQDRLLVELEQPLSSILAEMEFAGVKVDTKRLEQMGKELAEQLGTVEQRIYELAGQEFnInspkqLGVILFEKLQLPVLgystsaDVLEKLAPYHEIVENIlHYrqLGklQstyIegLLkVVRPDTKKVHTIFNQAltqtGrlsstePnLqnipirlEEGRKIrQAFVPSESDWLIFAADYSQIeLRVLAHIAEDDNLMEAFRRDLDIHTKTAMDIFQVSEDEVTPNMRRQAKAVNFGIVyGISDYGLAQNLNISRKEAAEFIERYFESFPGVKRYMENIVQEAKQKGYVTTLLHRRrYLPDITSRNFNVRSfAErmAMnTPIqGSAADIIKKAMIDLNARLKEERLQAHLLLQvhdeLILEAPKEEMERLCRLVPEVMEQAVTLRVPLKVDYHYGSTWYDAK B;C CCTgactcg;cgagtcagg 2 82 314 12;30;267;5 7;0;3;1;2;0;0;0;14;9;14;0;0;0;0;0;0;10;57;197 2I06 2i06_1_1 0 2.2 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein Replication Replication Termination Protein Tus 1 1 1 0 1.1, 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 A DLVDRLNTTFRQMEQELAIFAAHLEQHKLLVARVFSLPEVKkEDehNPLNRIEVKQHLGNDAQSLALRHFRHLFiQQQSENRSskaaVrLPGVLCYQVDNLSQAALVSHIQHINKLKTTFeHIvtVESELPtaArfeWVhRHLpglitlnAyrtLtVLHDPATLrFgwankhiiknLHRDEVLAQLEKsLKSprsvAPwTREEwQRKlEREYQDIAALPQNAKLkIkrpvkvqPiArVwYKGDqkqvqhaCptPLIALINRDNGAGVPDVGELLNYDADNvqhrykpqaqPlRLIIPrlhLYVAD B;C tagttacaacatact;atatgttgtaacta 218 278 569 150;42;366;11 5;1;11;1;3;4;7;1;11;13;13;0;0;0;0;5;8;25;118;343 2I13 2i13_1_1 16963084 1.96 MUS MUSCULUS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zinc Finger, Aart 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A fsrsdhLaEhQrtHkPyKCPECGksfsDkkdLTrhQrtHTGEkPyKCPECGksfsqranLrAhQrtHTGEkPyACPECGKsfsqlahLRahQRtHTGEkPyKCPECGksfsrednLhthQrtHTGEkPyKCPECGksfsrrdaLnvhQrtH C;D Cagatgtagggaaaagcccggg;gcccgggcttttccctacATCT 165 62 427 173;0;254;0 20;1;12;0;12;1;0;0;7;15;4;0;0;0;0;9;0;27;51;268 2IHM 2ihm_2_1 17159995 2.4 MUS MUSCULUS 2 1 1 2 0 0 1 Enzyme Polymerase DNA Polymerase Mu 2 1 1 0 0, 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 B SMPAYACQRPSPLTHHNTLLSEALETLAEAAGFEANEgrLlsfSrAASVLKSLPCPVASLSQLHGLPyfgehsTRVIQELLEHGTCEEVKQVRCSERYQTMKLFTQvfgvgvktANrWYQEGLRTLDELREQPQRLtQqQKAGLQYYQDLSTPVRRADAEALQQLIEAAVRQTLPGATVTLTGGFRRGKLQGhdVdFLITHPEEGQEVGLLPKVMSCLQSQGLVLyHqyferSfCILGLPQPQQAGALPPCPTWKAVrVdLVVTPSSQFPFALLgwTGSqFFereLrrFSrqEKGlwlnshGLFDPEQKRVFHATSEEDVFRLLGLKYLPPEQRNA E;Q;U gccG;CAgtat;CGgcaatactg 135 271 299 26;32;238;3 4;1;7;1;2;1;0;0;11;4;20;0;0;0;0;1;0;13;56;178 2IIE 2iie_1_1 17276457 2.41 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein DNA Bending Integrator Host Factor 1 1 1 0 1, 1 0 1 0 0 0 1 0 0 1 A MaStksELIeRLATQQSHIPaKTVEDAVkEMLEHMASTLAQGGSGgLtkaEMSeYLFDKLGLSkRDAkELVELFFEEIRRALENGEQVkLsgfGnFDLrdknqrpgrnpkTgEDipiTArRvvtFrpgqkLkSRVENAGGGErIeirgFgsFSLhyraPrtgrnpkTGDKvElEGkYvphfkpgkELrDRANIYGGSGHHhhHh C;D;E cGGTGCaacaaattgataagcaatgCTTTtttgGC;ggCCAAAAaagCAtt;gcttatcaattTGTtgcaCC 221 8 488 27;81;377;3 6;0;13;0;0;2;1;1;36;6;17;0;0;0;0;1;1;34;75;295 2IRF 2irf_1_1 10487755 2.2 MUS MUSCULUS 3 2 1 3 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Interferon Regulatory Factor 2 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 1 1 0 0 1 G RMrmRPWLEEQINSNTIPGLKWLNKEKKIFQIPWMHAARHGWDVEKDAPLFRNwAIHtGkHQPGIDKPDPKtWKanFRcaMNslpDIEEVKDRSIKKGNNAFRVYRMLP A;F AAGTgAaAGGA;TTCACTTTCact 52 59 59 9;1;49;0 0;0;0;0;0;0;0;0;2;1;1;0;0;1;0;1;1;1;15;36 2IS6 2is6_1_1 17190599 2.2 ESCHERICHIA COLI 1 2 0 1 0 0 1 Enzyme Helicase UvrD 1 1 1 0 5, 5 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A MDVSYLLDSLNDKQREAVAAPRSNLLVLAGAGSGKTRVLVHRIAWLMSVENCSPYSIMAVTftnKAAAEMRHRIGQLMGTSQGGMWVGtFhGLAHRLLRAHHMDANLPQDFQILDseDQLrLLkRLIkAMNLDekQWPPrQAmwYInSQKdEGLRPHHIQSYGNPVEQTWQKVYQAYQEACDRAGLVDfAELLLRAHELWLNKPHILQHYRERFTNILVDEFQDTNNIQYAWIRLLAGDTGKVMIVGDDDQSIyGwrGAQVENIQRFLNDFPGAETIRLEQNYRSTSNILSAANALIENNNGRLGKKLWTDGADGEPISLYCAFNELDEARFVVNRIKTWQDNGGALAECAILYrsnAQSrVLEEALLQASMPYRIyggMRFFeRqEIKDALSYLRLIVNRNDDAAFERVVnTPtrgigdrtLDvVRQTSRDRQLTLWQACRELLQEKALagrAASALQRFMELIDALAQETADMPLHVQTDRVIKDSGLRTMYEQEKGEKGQTRIENLEELVTATRQFSYNEEDLMPLQAFLSHAalEagEGQADTWQDAVQLMtLhsAKGLEFPQVFIVGMEEgMFPsqmSLdEGGrLEeERRLAYVGVTRAMQKLTLTYAETRrLygkEVYHRPSRFIGELPEECVEEVRLRATVSRPVSH C;D CGAGCACtgcaGTGCTcgttgtt;cgAgcaCTGCAGtgcTCGTTGTT 126 268 307 46;47;203;11 2;0;6;2;1;0;1;0;13;9;18;0;0;0;0;2;3;10;66;174 2ISZ 2isz_1_1 17209554 2.4 MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Repressor IdeR 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B mnElVdttEMyLRTIYDLEEEGVTPlrarIAeRLdqsgptVsqtVsrMErDGLLRVAGDrHLELTEKGRALAIAVMRKHRLAERLLVDVIGLPWEEVHAEACRWEHVMSEDVERRLVKVLNNPTTSPFGNPIPGLVELGV;mnElVdttEMyLRTIYDLEEEGVTPlrarIAeRLdqsgptVsqtVsrMErdGLLRVAgdrHLELTEKGRALAIAVMRKHRLAERLLVDVIGLPWEEVHAEACRWEHVMSEDVERRLVKVLNNPTTSPFGNPIPGLVELGV E;F CCCTGTTagcacaGGCTgccctaATTTtaGTGG;CACTAaaattagGGCagcctgTGCtAACAGGGC 83 266 296 65;6;225;0 3;0;4;0;4;1;1;0;22;22;14;0;0;0;0;11;0;22;38;154 2NLL 2nll_1_1 7746322 1.9 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Hormone Nuclear Receptor, Retinoic Acid Receptor 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 1 2 2 2 1 A;B CAICGdRSsgkhyGVYSCegCkgfFkrTVrkDLTyTCRDNKDCLIDkRQrnrCqYCrYQKCLAMGM;DELCVVCGdkAtGyhyrCITcegCkgfFrrTIqkNlHPSySCKYEGKCVIDKVTrnQCqECrFKKCIYVGMATDlvlDDSKrLAkrKliEEnrEkRRREELEK C;D caggtCATTcaggtCAG;ctgacctgaaatgacCTG 238;252 257 291 69;3;219;0 11;0;9;0;3;0;2;0;26;0;9;0;0;0;0;2;1;28;36;164 2NP6 2np6_1_1 0 2.1 THERMUS AQUATICUS 2 1 1 2 0 0 1 Enzyme Methyltransferase DNA Methyltransferase TaqI 1 1 1 0 0, 0 1 0 0 0 1 1 0 0 1 A RVETPPEVVDFMVSLAEAPRGGRVLEPACAHGPFLRAFREAHGTAYRFVGVEIDPKALDLPPWAEGILADFLLWEPGEAFDLILGNPPYgivgeAskypIHVFKAVkDLYkKAFSTWKgkynLyGAFLEKAVRLLKPGGVLVFVVPAtWLVledfALLREFLAREGKTSVYYLGeVFPqkkVSAVVIRFQKSGKGLSLWDTQESESGFTPILWAEYPHWEGEIIRFETEETRKLEISGMPLGDLFHirfaArspeFkKHPAVRKEPGPGLVPVLtgrNLkPGWVDYEKNhSGLWMPKERAKELrDFYATPHLVVAhtkgTrVVAAWDERAYPWreefHLLPKEGVRLDPSSLVQWLNSEAMQKHVRTLYRdfvphLtlRMLERLPVRREYGFHT B;C gttcgtgtC;Gacatcgac 20 17 305 81;21;201;2 2;0;8;0;1;2;1;0;15;5;10;0;0;0;0;4;5;16;58;178 2NTC 2ntc_1_1 17253903 2.4 SIMIAN VIRUS 40 1 2 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein Replication Origin Binding Protein, Large T Antigen 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A VEDPKDFPSELLSFlshavfsnrtLACFAIYTTKEKAALLYKKIMEkySVTFISRHNSYNHNILFFLTPhrhrVsaINnyAQkLCTFSFLICKGVnkEYLMYSALTRDPFSVIEESLPGGLKEHDFN C;W TCagaggcCAGAAGTGCCTCG;ACGAGGCACTTCtggcctcTG 50 251 159 63;0;96;0 5;1;6;1;1;1;2;2;8;4;9;0;0;0;0;2;0;4;20;93 2O49 2o49_1_1 17652321 2 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Trasncription Factor SATB1 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A EVSSEIYQWVrDElKRAgisqaVFArVAFnrtqglLseiLrKEEDPKTASQsLLVnLRAMQNFLQLPEAERDRIYQDErERslR B;C gctaaTATATGC;GCAtatattAGC 185 54 126 38;0;88;0 1;1;0;0;2;1;0;0;5;6;3;0;0;0;0;5;1;8;19;74 2OAA 2oaa_2_1 17344322 1.5 MICROCOCCUS VARIANS 2 1 1 2 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease MvaI 2 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B KSMSEYLNLLKEAIQNVVDGGWHETKrkgntGigkTFeDLLEkEednldaPdFHDIeiktheTaakslLtLftkspTNPRgantMLrNRYGkKDEYGNNiLhqtVSGNrKtnsnsyNYDFKIDIDWESQVVRLEVFDKQDIMIDNSVYWSFDSLQNqLDKkLKYIAVISAESKIENEKkYYKYNSANLFTDLTVQSLCRGIENGDIkVdirIgayhsGKkKGkthdhgTAFrInMEKLLEYGEVKVIV E;F ggtacctggat;catccaggtac 150 53 428 123;24;281;0 6;3;11;1;7;1;7;2;17;17;18;0;0;0;0;3;5;22;47;261 2ODI 2odi_1_1 17445830 1.45 BREVIBACILLUS CENTROSPORUS 2 1 1 2 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease BcnI 1 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A KIWSKEEVVNKLHEIKNKGYLSVPTDFrtddgVvgqILeRQFGVQenNiTLGdLGEFelkgrNrKaksnltLfhkkPVAGQtViQIFNRFGyVkPssrnPEVkKkLfttIkGGrLnnlGLTLNAKHASEINLYYQDEYLSTWDLNLSkIEKLVLVFAETIGRaNSPEEQFHFTKAYLTEINDITSLINDGVLVdlcIdQDLSKSKGphdrgPhLrIPISKLDKLYRNIERLL C;D aacccggagaC;ctccgggttgT 76 15 390 99;20;270;1 4;3;3;1;6;0;5;1;14;6;8;0;1;1;0;3;2;24;51;257 2OFI 2ofi_1_1 17410210 1.85 SALMONELLA TYPHI 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Glycosylase 3-Methyladenine DNA Glycosylase I 1 1 1 0 1, 1 1 0 0 0 1 1 0 0 1 A QRCDWVSQDPLYIAYHDNEWGVPETDSRKLFEICLEGQqaglsWitVLkKRENYRACFHQFDPIRIAAQEEDVERLLQNtGiirhRGkIQAIISNARAWLAEQNGESFADFVWSFVDGQPQITQAASLDKIPtSTPASDALAKALkKRGFkfvgttiCYsFQACGLVNDHITGCFCHPG B;C CGGACtacggG;CCGttagtCCGC 222 249 124 3;27;93;1 0;0;1;0;0;1;0;0;2;2;7;0;0;0;0;0;0;7;21;83 2OWO 2owo_1_1 17466627 2.3 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Ligase DNA Ligase 1 1 1 0 0, 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 A MESIEQQLTELRTTLRHHEYLYHVMDAPeIPDAEYDRLMRELRELETKHPELITPDSPTQRVGAAPLAafSqIRHEVPMLsldnVfDEESFLAFNkrVQdrLKNNEKVTWCCELkldglaVSILYENGVLVSAAtrgDGTTGeDITSNVRTIRAIPLKLHGENIPARLEVRGeVFLPQAGFEKINEDARRTGGkvfanPrnaAagSLrqlDPRITAKrPLTFFCYGVGVLEGGELPDTHLGRLLQFKKWGLPVSDRVTLCESAEEVLAFYHKVEEDRPTLGFDIdGVVIKVNSLAQQEQLGFvarAPrWAVAFkFPAQEQMTFVRDVEFqvgrtGaItPvArLEPVHVAGvlvsnatLhnAdeIErLGLRIGDKVVIRragDvipqVVNVVLSERPEDTREVVFPTHCPVCGSDVERVEgeavArCTGGLICGAQRKeSLKhFVSrrAMdvdgmgdkiIDQLVEKEYVHTPADLFKLTAGKLTGlermgpksAQnVVNALEKAKETTFARFLyALGirevgeatAAGLAAYFGTLEALEAASIEELqKvPdvgivvASHVHNFFAEESNRNVISELLAEGVHWPAP B;C;D CATTCcgatagtggggtcgcaatTGT;ACAATtgcgacc;cactatcggAatG 210 244 582 16;39;526;1 7;0;6;0;1;0;2;0;28;5;52;0;0;0;0;1;0;39;85;356 2P0J 2p0j_1_1 17437717 2.1 GEOBACILLUS STEAROTHERMOPHILUS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease BstYI 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B MRIVEVYSHLNGLEYIQVHLPHIWEEIQEIIVSIDAEACRTkEskektKQGQILYspvALnEAFKEKLEAKGWKESRTNYYVTADPKLIRETLSLEPEEQKKVIEAAGKEALKSyNQTDFVKDRVAIEVqfgkySfVAYDLFVKHMAFYVSDKIDVGVEILPMkELSkEMssgiSyYEGELYNVIRQGRGVPAVPLVLIGIAP;MRIVEVYSHLNGLEYIQVHLPHIWEEIQEIIVSIDAEACRTKEskeLYSPvALnEAFKEKLEAKGWKeSrTNYYVTADPKLIRETLSLEPEEQKKVIEAAGKEALksynqTdFVKDRVAIevqFGkySfVAydLFVkHMAFYVSDKIDVGVEILPMKELSKEMssgISYYEGELYNVIRQGRGVPAVPLVLIGIAP C;D atgaatccata;tatggatTcaT 156 240 242 48;8;185;1 3;0;4;0;1;0;3;0;13;7;9;0;0;0;0;4;1;13;38;146 2PI0 2pi0_1_2 17560375 2.31 HOMO SAPIENS 1 4 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Interferon Regulatory Factor 3 1 2 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B MGTPkpriLPWLVSQLDLGQLEGVAWVNKSRTRFRIPwkhglrqDAQQEDfGIFQAwAEAtGaYVPGRDKPDLptWkrnFrsaLnrkEGLRlAEdRskDPHDPHkIYEFVNS E;F CATAGGAaaactgaaaGgGaGAAGTGAAAGTG;CACTTTCACTTCTCcctttCAGTtttccTATG 89 236 220 38;9;173;0 3;1;1;1;1;0;1;0;8;2;6;0;0;0;0;2;2;11;37;144 2PYJ 2pyj_1_1 17611604 2.03 BACTERIOPHAGE PHI-29 3 1 1 3 0 0 1 Enzyme Polymerase DNA Polymerase Phi29 1 1 1 0 4, 0 0 0 0 0 1 1 0 0 1 A PRKMYSCAFETTTKVEDCRVWAYGYMNIEDHSEYKIGNSLDEFMAWVLKVQADLYFHNLkFAGAFIINWLERNGFKWSaDGLPNTYntiISrmgqWymIdICLGYKGKRkIHTVIyDSLkKLPFPVKKIAKDFKLTVLKGDIDYHKERPVGYKITPEEYAYIKNDIQIIAEALLIQFKQGLDrmtAgsDSlKGFKDIITTKKFKKVFPTLSLGLDKEVrYAyrggFtWLNDRFKEKEIGEGMVFDVNSLyPAQMYSRLLPYGEPIVFEGKYVWDEDYPLHIQHIRCEFELKEGYIPTIqIkrSrFYKGnEyLKSSGGEIADLWLSNVDLELMKEHYDLYNVEYISGLKFKATTGLFKDFIDKWTYIKTTSEGAIKQLAKlMLnsLygkFasnPDvTGkVPYLKENGALGfRlGEEeTkdPVYTPMGVFITAWARYTTITAAQACYDRIIYCdtDSIHLTGTEIPDVIKDIVDPKKLGYWAHESTFKRAKYLrqktyIQDIYMKEVVEGSPDDYTDIKFSvkcagmtdKIkKEVTFENFKVGFSRKMkpkpVqVPGGVVLVDdtftIk X;Y gaCtgctta;acacgtaagcagTC 108 231 407 40;46;315;6 1;0;1;1;4;0;2;3;18;9;16;0;0;0;1;2;3;20;65;261 2QHB 2qhb_1_1 0 2.4 NICOTIANA GLUTINOSA 2 1 1 2 0 0 1 Structural|DNA Binding protein Telomeric Protein Telomere Binding Protein, TBP1 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A rrirrPfSVAEVEALVEAVEHLGtgrwrdVKMRAFDNADhrTyvdLkdKWktLVHTASIAPQQRRGEPVPQDLLDRVLAAHAYWSQ E;F Tttaggg;ccctAAA 181 228 110 33;0;77;0 2;0;4;0;3;0;0;0;2;0;5;0;0;0;0;1;0;9;12;72 2QL2 2ql2_1_1 18069799 2.5 MUS MUSCULUS 2 1 1 3 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Helix Loop Helix, E47|NeuroD1 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B RrMAnnArerVrvRdinEAFrELGRMCQLHLKAQtklLILQQAVQVILGLEQQVRE;SRrMkanArerNrmhGlnAALDNLrKVVPCYSKTQKLskiETLRLAKNYIWALSEILRS E;F TAggccatctgGTCCT;AGgaccagatggCCTA 200;201 226 194 62;0;132;0 2;0;0;0;9;0;1;0;15;3;4;0;0;0;0;6;2;16;32;104 2QL2 2ql2_2_1 18069799 2.5 MUS MUSCULUS 2 1 1 3 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Helix Loop Helix, E47|NeuroD1 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 C;D RrMAnnArerVrvRDinEAFRELGRMCQLHLKSDQtklLILQQAVQVILGLEQQVRER;RrMkanArernrmhGlnAALDNLrKVVPCYSKTQKLskieTLRLAKNYIWALSEILR G;H TAggccatctgGTCCT;AGgaccagatggCCTA 200;201 225 181 48;0;133;0 2;0;0;0;5;0;0;0;16;3;4;0;0;0;0;5;2;9;24;111 2QOJ 2qoj_1_1 17720189 2.4 EMERICELLA NIDULANS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease I-AniI 1 1 1 0 2, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 Z GSDLTYAYLVGLFEgdgyfsitkkgkyltyeLGIelsIkdVQLIYKIKKILGIgivsfrKrnEieVALrIrdkNhLKSFILPIFEKYPFSNkQYdYLrFRNALLSGIislEDLPDyTrSDEPLNSIESIINTSYFSAWLVGFIEaegcfsvyklnkDdDyLiAsFdIaqrDGDILISAIRKYLSFttkVyLdktNcSkLkvtsvRSVENIIKFLQNAPVKLLGNkKLqYLLWLKQLRKIsrySeKIKIPSNY X;Y GCgctgaggaggtTtctctgtaaAGCGCA;GCGctttacagAGaaacctcctCAGCGCGC 220 224 552 189;0;363;0 12;1;12;0;7;0;1;0;14;10;19;4;0;0;0;13;4;37;105;313 2R1J 2r1j_1_1 18237194 1.53 BACTERIOPHAGE P22 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Repressor P22 c2 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 L;R TQLMGERIrARrkKLKIrqaALGKMVgvsnvaIsqwErSetepnGEnLLALSKALQCSPDYLLKGD;TQLMGERIrARrkKLKIrqaALGKMVgvsnvaIsqwErSetepnGEnLLALSKALQCSPDYLLKGD A;B TatttaaGATatcttaAATG;CatttaAGATatcttaAATA 197 223 283 102;0;181;0 0;0;4;0;3;0;0;0;14;7;11;0;0;0;0;19;2;15;54;154 2R9L 2r9l_1_1 17947582 2.4 MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS 2 1 1 2 0 0 1 Enzyme Polymerase DNA Polymerase LigD 1 1 1 0 6, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 2 A EQRVTLtnADkVlYPATGTTkSDIFDYYAGVAEVMLGHIAGRPATRKrWpnGVDQpAffekqLalsAPPWLSRATVAhrsGTtTyPIIDSATGLAWIAqqaALEVHVPQWRFVAEPGSGELNPGPATRLVFDLDPGEGVMMAQLAEVARAVRDLLADIGLVTFPVTSGSKGLHLYTPLDEPVSSRGATVLAKRVAQRLEQAMPALVTSTmtKSLRAGKVFVDwSQNsGsktTIAPYSLRGRTHPTVAAPRTWAELDDPALRQLSYDEVLTRIARDGDLLERLDADAP C;D gcggC;GCCGcaacgca 139 220 172 26;24;117;5 3;0;3;0;1;0;0;0;5;7;3;0;0;0;0;0;0;4;37;109 2RAM 2ram_1_1 9437432 2.4 MUS MUSCULUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet NFkB 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 1 2 1 1 1 A;B PYVEIIEQPKQRgmrFryKceGrsAgsIPGERSTDTTKTHPTIKINGYTGPGTVRISLVTKDPPHRPHPHELVGKDCRDGYYEADLCPDRSIHSFQNLGIQCVkkRDLEQAISQRIQTNNNPFHVPIEEQRGDYDlnAVRLCFQVTVRDPAGRPLLLTPVLSHPIFDNrApnTAELkICRVNRNSGSCLGGDEIFLLCDkVqkeDIEVYFTGPGWEARGSFSqADvHrqVAIVFRTPPYADPSLQAPVRVSMQLRRPSDRELSEPMEFQYLPD;PYVEIIEQPKQRGMrFryKceGrsaGSIPGERSTDTTKTHPTIKINGYTGPGTVRISLVTKDPPHRPHPHELVGKDCRDGYYEADLCPDRSIHSFQNLGIQCvkkrDLEQAISQRIQTNNNPFHVPIEEQRGDYDlnAVRLCFQVTVRDPAGRPLLLTPVLSHPIFDNrApNTAeLKICRVNRNSGSCLGGDEIFLLCDkVqkeDIEVYFTGPGWEARGSFSQADvHrqVAIVFRTPPYADPSLQAPVRVSMQLRRPSDRELSEPMEFQYLPD C;D CGGCtggaaatccAGCCG;CGgctggaaatCCaGCCG 142 218 224 55;0;169;0 11;1;7;0;2;0;1;0;11;5;9;0;0;0;0;0;3;17;21;136 2RBF 2rbf_1_1 18586269 2.25 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Ribbon|Helix|Helix Bifunctional Protein PutA 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B tttmgVkLDDATRERIKSAATRIDRtphwLIkQAIFSYLEQLEN;ttmgvkLdDATrERIKSAATRIDRtphwLIkQAIFSYLEQLENSD C;D TGcggttgcaCCTTTCAAA;TTTGAAAggtgcaaCCGCA 208 217 175 70;0;105;0 4;1;4;1;4;1;1;1;1;6;8;0;0;0;0;1;3;6;36;97 2VE9 2ve9_1_1 18722176 1.9 PSEUDOMONAS AERUGINOSA 2 1 1 2 0 0 1 Enzyme Translocase DNA Translocase FTSK 1 1 1 0 2, 0 0 0 0 1 0 3 1 1 1 A;B;C DDPLYDEAVRFVTESRrAsisaVqRKLkigynrAARMIEAMEMAGVVTPmNTngsrEVIAPAP;DPLYDEAVRFVTESRrAsisAVqrKLkigynrAArMIEAMEMAGVVTPmNtngsrEVIAPAP;DdPLYDEAVRFVTESRrasisaVqrKLkigynrAarMIEAMEMAGVVTPmNTNgSrEVIAPAP I;J ACcagggcagggCg;GtcgccctgcccTGGT 59 52 328 85;1;242;0 3;1;3;0;8;2;0;4;5;9;18;0;0;0;0;5;0;22;59;189 2VLA 2vla_1_1 18433771 1.3 BACILLUS PUMILUS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease BpujI 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A MNYNPEEQFrCtiirgkaknMLDNLLPAYANIIDDICPCDKASFVKDFNNRLIEIlGEettkktLdnhrteIAGkLFGMFYEDDEVIFPSGRTNKYIEDSDQPAFFKDICFKFQFPNGmdkldkVIEKVGAKIQIRQFPYILQVLLTADNNNIQLSkDDIAYYVLNSLQVLQGKIKPIEVIEKIIEDRSNDITKKVRHPGketsySmqHIreQLnYLELANLIRIDgNLVKLNYREAENINYIAQFWGNKPEFNAYKYDFTSeDDkkSFfKDWQQYYSNV L;M GGtacccgtGga;tccacgggtacc 219 211 274 66;8;199;1 7;0;9;1;5;0;0;0;4;10;11;0;0;0;0;6;0;19;40;162 2VOA 2voa_1_1 19015049 1.7 ARCHAEOGLOBUS FULGIDUS 1 2 1 4 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease Ap 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A MLKIATFNVnsIrsrLHIVIPWLKENKPDILCMQeTkVeNRkFPEADFHRIGYHVVFSGSkgrnGVAIASLEEPEDVSFGLDSEPKDEDrLIRAKIAGIDVINTyVPqgfKIDSEkYQYKLQWLERLYHYLQKTVDFRSFAVWCGDMnVAPEPIDVHSPDKLKNHVFHEDARRAYKKILELGFVDVLRKIHPNERIYTfYdyrVkGAIERGLGWRGDAILATPPLAERCVDCYADIKPRLAEkpSdhLPLVAVFDV C;D gcggtaGCCG;CGGCTACCgc 148 210 172 10;21;134;7 1;0;3;0;3;1;0;0;8;5;5;0;0;0;0;0;0;11;34;101 2VS7 2vs7_2_1 18974222 2.05 DESULFUROCOCCUS MOBILIS 3 1 1 3 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease I-DmoI 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 D ENVSGISAYLLGLIIgdggLyklkykgnrseyrVvItqkSENLIKQHIAPLMQFLIDELNVkskIqivkgdtrYeLrVsskKLYYYFANMLERIRLFNMREQIAFIKGLYVaegdktLkrLrIwnkNKALLEIVSRWLNNLGVRNtIhlddhrhGvYvLnislrDrIKFVHTILSSHLNPLPPEAAALEHH E;F GCCttgccgggTaagttccggcGCG;CgcgccggaacTtacccggcAAGGC 49 5 495 196;1;298;0 17;1;17;1;11;1;2;0;12;8;11;0;0;0;0;8;3;25;95;283 2VY1 2vy1_1_1 18784751 2.1 ARABIDOPSIS THALIANA 1 1 1 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Protein Leafy 1 1 1 2 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B rehpfIVTEPGEVARGKKNGLDYLFHLYEQCREFLLQVQTIAKDRGEkCPTKvtnqVFrYAkKSGAsyInkpkMrhyVHCYALHCLDEEASNALRRAFKERGEnvgSWRQACYKPLVNIACRHGWDIDAVFNAHPRLSIWyvPtKLRQLCHLERNNAVAAAAAL;rehpfIVTEPGEVARGKKNGLDYLFHLYEQCREFLLQVQTIAKDRGEkCPTKvtnqVFrYAkKSGAsyInkpkMrhyVHCYALHCLDEEASNALRRAFKERGEnvgSWRQACYKPLVNIACRHGWDIDAVFNAHPRLSIWyvPtKLRQLCHLERNNAVAAAAAL W;X AgaaggaCCAGtggtcCgta;AgaaggaCCAGtggtcCgta 81 208 338 82;18;238;0 12;0;8;0;0;2;0;2;26;10;16;0;0;0;0;0;2;16;38;206 2YVH 2yvh_1_1 0 2.5 CORYNEBACTERIUM GLUTAMICUM ATCC 13032 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Alpha Helix Repressor CgmR 1 1 1 0 0, 0 0 2 0 0 0 2 1 2 1 A;B SkkEILRTAIDYIGEYSLetlsydSLAEATglsksgLiyhFpsrHALLLGHELLADDWDKELRDITRDPEDPLERLRAVVVTLAENVSRPELLLLIDAPSHPDFLNAWRTVNHQWIPDTDDLENDAHKRAVYLVQLAADGLFVHDYIHDDVLSKSKRQALETILELIP;tskKEILRTAIDYIGEYSLetlsydSLAEATglsksgLiyhFpsrHALLLGHELLADDWDKELRDITRDPEDPLERLRAVVVTLAENVSRPELLLLIDAPSHPDFLNAWRTVNHQWIPDTDDLENDAHKRAVYLVQLAADGLFVHDYIHDDVLSKSKRQALETILELIP E;F;G;H TAACTGtaccgaCC;ggtCGGTACAGTTA;TaactgtACCGACc;GGTcggtacAGTTa 80 206 242 75;0;167;0 4;2;5;4;3;0;0;0;0;12;7;0;0;0;0;3;1;5;62;134 2Z3X 2z3x_1_1 0 2.1 BACILLUS SUBTILIS 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein Maintenance|Protection Spore Protein C 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 3 1 1 1 A;B;C akllIPQAASAiEQMkLEIASEFGVQlgaETTsrAngsvggeitkRlvRLAqQNMG;akllIPQAASAiEQMkLEIASEFGVQlgaETTsrAngsvggeitkRlVRLAQQNMG;akllIPQAASAiEQMkLEIASEFGVQlgaETTsrAngsvggeitkRlvRLAqQNMG D;E gggggggggga;cccccccccca 122 204 453 4;93;356;0 0;3;0;3;4;2;9;3;0;5;18;0;0;0;0;0;0;8;102;296 2ZO1 2zo1_1_1 18772888 1.96 MUS MUSCULUS 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein Maintenance|Protection UHRF1 1 1 1 0 2, 0 1 0 0 0 1 1 0 0 1 B HMPaNHFGPIPGVPVGTMWrfrvqVSESGVHrphvaGIhgrsNDGAySLvLaGgyEDDVDNGNYFTYTGsgGrDlSgnkrtAGQSSDQKLtnnNRALALNCHSPINEKGAEAEDWRQGKPVRVVRnMkGGKHSKYAPAEGnRYDGIYKVVKYWPERGKSGFLVWRYLLRRDDTEPEPWTREGKDRTRQLGLTMQYpEGyLEALANK D;E tgcgctgac;GTCaggcaATG 24 51 218 57;24;134;3 3;1;2;0;0;0;1;1;10;4;4;0;0;0;0;0;1;11;39;141 3BEP 3bep_1_1 18191219 1.92 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Polymerase DNA Polymerase III Subunit Beta 1 1 1 0 4, 0 0 0 0 1 1 2 1 1 1 A;B MKFTVEreHLlkPLqqVSGPLgGrPTLPILGNLLLQVADGTLSLTGTDLEMEMVARVALVQPHEPGATTVPARKFfDICrGLPeGAEIAVQLEGERMLVRSGRSRFSLSTLPAADFPNLDDWQSEVEFTLPQATMkRLIeATQFSMAhQDVRYYLNGMLFETEGEELRTVATDGHRLAVCSMPIGQSLPSHSVIVPRKGVIELMrMldgGDNPLRVQIGSNNIRAHVGDFIFTSKLVDGRFPDYRRVLPKNPDKHLEAGCDLLKQAFARAAILSNEKFRGVRLYVSENQLKITANNPEQEEAEEILDVTYSGAEMEIGFNVSYVLDVLNALKCENVRMMLTDSVSSVQIEDAASQSAAYVVMPMRL;MKFTVEREHLLKPLqQVSGPLggrPTLPILGNLLLQVADGTLSLTGTDLEMEMVARVALVQPHEPGATTVPArKFFDICrGLPEGAEIAVQLEGERMLVRSGRSRFSLSTLPAADFPNLDDWQSEVEFTLPQATMKRLIEATQFSMAhqDVRYYLNGMLFETEGEELRTVATDGHRLAVCSMPIGQSLPSHSVIVPrkGVIELMrMLDGGDNPLRVQIGSNNIRAHVGDFIFTSKLVDGRFPDYRRVLPKNPDKHLEAGCDLLKQAFARAAILSNEKFRGVRLYVSENQLKITANNPEQEEAEEILDVTYSGAEMEIGFNVSYVLDVLNALKCENVRMMLTDSVSSVQIEDAASQSAAYVVMPMRL C;D ccCatcGTAT;TtttataCGatggg 133 200 116 19;9;86;2 0;0;0;0;0;0;3;0;3;0;1;0;0;0;0;0;0;13;16;80 3BIE 3bie_1_1 18432238 1.68 ESCHERICHIA COLI K12 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Dioxygenase DNA Repair Protein AlkB 1 1 1 0 1, 0 1 0 0 0 1 1 0 0 1 A EPLAAGAVILRRFAFNAAEQLIRDINDVASQSPFRQMVtpgGytmsVAMTNCGHLGWTTHRQgyLYSPIDPQTNKPWPAMPQSFHNLCQRAATAAGYPDFQPDACLINRYAPGAklclhQDkdEPDLRAPIVSVSLGLPAIFqFGGLKrnDPlKrLLLEHGDVVVWGGESRLFYHGIqPLKAGFHPLTIDCRYNLTFRQAGK B;C AGGtaaacCGT;AacggtTTTACCT 117 198 123 21;0;102;0 3;0;4;0;0;0;1;0;5;2;5;2;0;0;0;0;0;7;24;70 3BM3 3bm3_1_1 0 1.7 PYROCOCCUS SP. GI-H 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease PspGI 1 1 1 0 1, 1 1 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B VRNLVIDITKkptqNiPptNEiIEEAITELNVDELLDRLFEKDESGEVITPSRIAKLeEKafEIyKEYEKQVREAYLSAGYSREkLEqsFqqarfsrggkafeIIFTKLLNKFGIRYEHDRVIKIYDYITegEkPaFIIPSVRTFLNDPSSAILItvkrkVrerwreAVGeAQILRNKFGDEINFWFVGFDEeFtiySAIALDNGIDRVYVIDGRYDSLIEEIKRISDPNFNEDKYIQKIRRFSDIFDDIIQFLNKH;RNLVIDITKkptqNiPptnEIIEEAITELNVDELLDRLFEKDESGEVITPSRIAKLeEKafEIyKEYEKQVREAYLSAGYSRekLEqsFqqarfsrggkafeIIFTKLLNKFGIRYEhDRvIKIYDYITegEkPaFIIPSVRTFLNDPSSAILItvkrkVrerwreAVGeAQILRNKFGDEINFWFVGFDEEFtiySAIALDNGIDRVYVIDGRYDSLIEEIKRISDPNFNEDKYIQKIRRFSDIFDDIIQFLNKH C;D Catccaggtac;Ggtacctggat 147 196 646 141;90;406;9 9;1;3;3;10;3;3;3;23;15;15;0;0;0;0;6;1;42;123;386 3BRD 3brd_1_1 18381292 2.21 CAENORHABDITIS ELEGANS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet Lag-1 (CSL) 1 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 2 2 0 1 A;D VQSLTSDRMIDFLSNKEKYECVISIFHAKVAqkSygnekrfFCPPPCIYLIGQGWKLKKDRVAQLYKTLQQATELVAYIGIGSDTSERQQLDFPNIYDYCAAKTLYISdSDkRkYFDLNAQFFYGCGMEIGGFVSQRIKvIskpskkktDCKYlCIASGTKVALFNrlrsqtvStRYLHVEGNAFHASSTKWGAFTIHLFDDQETDNFAVRDGFVYYGSVVKLVDSVTGIALPRLRIRKVdkQQVILDASCSEEPVSQlHkCAFQMIDNELVYLCLSHDKIIQHQATAINEHRHQINDGAAWtIISTDKAEYRFFEAMGQVANPISPCPVVGSLEVDGHGEASRVELHGRDFKPNLKVWFGATPVETTFRSEESLHCSIPPVSQVRNEQTHWMFTNRTTGDVEVPISLVRDDGVVYSSGLTFSYKSL;RRMINASVWMPPMEN B;C TTACtgtgggaAAGA;AATctttcccAcagt 131;264 194 205 49;9;147;0 6;0;5;0;3;0;1;0;5;9;7;0;0;0;0;2;4;19;44;100 3BRF 3brf_1_1 18381292 2.47 CAENORHABDITIS ELEGANS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet Lag-1 (CSL) 1 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 2 2 0 1 A;D SLTSDRMIDFLSNKEKYECVISIFHAKVAqkSygnekrfFCPPPCIYLIGQGWKLKKDRVAQLYKTLTELVAYIGIGSDTSERQQLDFPNIYDYCAAKTLYISdSDkRKYFDLNAQFFYGCGMEIGGFVSQRIKvIskPskkkqSDCKYlCIASGTKVALFNrLrsqtvSTRYLHVEGNAFHASSTKWGAFTIHLFDDEQETDNFAVRDGFVYYGSVVKLVDSVTGIALPRLRIRkvdkQQVILDASCSEEPVSQlHkCAFQMIDNELVYLCLSHDKIIQHQATAINEHRHQINDGAAWTIISTDKAEYRFFEAMGQVANPISPCPVVGSLEVDGHGEASRVELHGRDFKPNLKVWFGATPVETTFRSEESLHCSIPPVSQVRNEQTHWMFTNRTTGDVEVPISLVRDDGVVYSSGLTFSYKS;RMINASVWMPPME B;C TTACtgtgggaAAGA;AATctttcccAcagt 131;265 193 228 55;15;158;0 10;0;7;2;3;0;1;0;4;4;9;0;0;0;0;4;2;18;46;118 3BRG 3brg_1_1 18381292 2.2 MUS MUSCULUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet Lag-1 (CSL) 1 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 2 2 0 1 C PPKRLTREAMRNYLKERGDQTVLILHAKVAqkSygnekrfFCPPPCVYLMGSGWKKKKEQMERDGCSEQESQPCAFIGIGNSDQEMQQLNLEGKNYCTAKTLYISdSDkRkHFMLSVKMFYGNSDDIGVFLSKRIKvIskPskkkLknADlCIASGTKVALfNrlrsqtVSTRYLHVEGGNFHASSQQWGAFYIHLLDDDETVRDGYIHYGQTVKLVCSVTGMALPRLIIRKvdkQTALLDADDPVSQlHkCAFYLKDTERMYLCLSQERIIQFQATPCPKEQNKEMINDGASWtIISTDKAEYTFYEGMGPVLAPVTPVPVVESLQLNGGGDVAMLELTGQNFTPNLRVWFGDVEAETMYRCGESMLCVVPDISAFREGWRWVRQPVQVPVTLVRNDGVIYSTSLTFTYTPEP A;B AATctttcccacagt;TTACTgtgggAAAGA 215 192 216 45;15;156;0 4;1;4;0;3;0;1;0;10;7;5;0;0;0;0;3;4;17;40;117 3BS1 3bs1_1_1 18462677 1.6 STAPHYLOCOCCUS AUREUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet Regulator AgrA 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 1 1 0 0 1 A MDNSVETIELKrgSNSVYVQYDDIMFFEsSTKshrlIAHLDNRQIEFyGnlkELSQLDDRFFrChnsFVVNRHNIESIDSKErIVYFKNKEHCYasvrnVkKI B;C ttTaaCAGTtaagAT;aaacTTAActgtTAA 239 191 140 31;3;106;0 2;2;4;0;3;1;0;0;11;4;6;0;0;0;0;0;0;11;19;77 3BTX 3btx_1_1 18432238 2 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Dioxygenase DNA Repair Protein AlkB 1 1 1 0 1, 1 1 0 0 1 0 1 0 0 1 A ASWRHIRAEGLDSSYTVLFGKAEADEIFQELEKEVEYFTGALARvqvfgkWhsvprKqATYGDAGLTyTfsGLTLSPKPWIPVLERIRDHVSGVTGQTFNFVlINRYKDGSDhigehrddcrELAPGSPIASVSFGASRDFvFrHkDsrgkSPSRRVAvVrLPLAHGSLLMMNHPTNTHWyHSLpvrkkVLAPRVNLTFRKILL B;C CTGTatcatTGCG;tcgcaataataca 116 49 287 54;46;175;12 1;0;4;0;1;2;2;1;9;2;8;0;0;0;0;0;1;19;75;162 3C1B 3c1b_1_1 18794842 2.2 XENOPUS (SILURANA) TROPICALIS, XENOPUS LAEVIS 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein DNA Packaging Histone 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 8 3 3 1 A;B;C;D;E;F;G;H phryrpgtvaLreIrrYQkSTELLIrklpFQrLVrEIAQDFKTdLrfqsSAVMALQEASEAYLVALFEDTNLCAIHAkrvtImPkDIQLARRIRGERA;rDNIqgItkpaIrrLArRGGVkrisgLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAkrktVtAMDVVYALKRQGRTLYGFGG;aktrSSrAGLQFPVgrVHrLLrkGNYAervgaGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNkktrIiPRHLQLAVRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQSVLLpKK;ktrkesYaiyVykVLKQVHPDTgissKAMSIMNSFVNDVFERIAGEASRLAHYNkrstItSreIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAk;kphryrpgtvalreIrrYQkSTELLIrklpFqrLVrEIAQDFKTdLrfqsSAVMALQEASEAYLVALFEDTNLCAIHAkrvtImPkDIQLARRIRGERA;KRhRVLRDNIqGItkpAIrrLArRGGVkrisgLIyEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAkrktVtAMDVVYALKRQGRTLYGFGG;trSSrAGLQFPVgrVHrLLrkGNYAervgaGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKktrIiPRHLQLAVRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQSVLLpK;ktrkesYAiyVykVLKQVHPDTgisskAMSIMNSFVNDVFERIAGEASRLAHYNkrstItSrEIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSA I;J ATCAatatccaCCTGCagattCTACCaaaagtGTATttggaaACTGCTccatCAAAAGgcatGTtcagcggaATTCCGctgaacATGCCtttTGATgGagcagtTTCCAaataCACTTTtggtaGAATCtgcaGGTGGATAttgaT;ATCaatatcCACCTGCAgattCTACCaaaagtGTATTtggaaACTGctccatcAAAAGGcatgtTcagcggaatTCCGCtgaacaTGCCttttGATggagcagtTTCCAaatACACTtttggtaGAATCtgcaGGTGGATAttgat 9;11;12;14 3 1374 26;64;1284;0 23;0;18;0;0;0;0;0;87;37;92;0;0;0;0;1;0;130;196;790 3C25 3c25_1_1 18400177 2.5 NOCARDIA OTITIDISCAVIARUM 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease NotI 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B anFIAEFFGHRVYPEVVSTEAARNDQATGTCPFLTAAKLVETSCvkaEtsRGvCVVNTavDnERYDWLvCpNRALDPLFMSAASRKLFGYGPTEPLQFIAAPTLADQAVRDGIREWLDRGVHVVAYFQekLggelsIskTDSSpefsFdWTLAEVESIYPVPKIKRYGVLeiqtmdfhgsykhAVGAIDIALVEGIDFHGWLPTPAGRAALSKKMegpnlsnvFkrTFYqMAYkFALSGHQRCAGTGFAIPQSVWKSWLrhLANPTLIDNGDGTFSLGDTRNDSENAWIFVFELDPDTDASPRPLAPHLEIRVNVDTLIDLALRESPRAALGPSGPVATFTDkVEArMLrFWPK;anFIAEFFGHRVYPEVVSTEAARNDQATGTCPFLTAAKLVETSCvkaEtsRGvCVVNtavdnERYDWLvCpNRALDPLFMSAASRKLFGYGPTEPLQFIAAPTLADQAVRDGIREWLDRGVHVVAYFQekLggelsIskTDSSpefsFdWTLAEVESIYPVPKIKRYGVLeiqtmdfhgsykhAVGAIDIALVEGIDFHGWLPTPAGRAALSKKMegpnlsnvFkrTFYqMAYkFALSGHQRCAGTGFAIPQSVWKSWLrhLANPTLIDNGDGTFSLGDTRNDSENAWIFVFELDPDTDASPRPLAPHLEIRVNVDTLIDLALRESPRAALGPSGPVATFTDkVEArMLrFWP C;D CGGAggcgcggccgcgccgccG;CGGCggcgcggccgcgcctCcG 134 187 587 112;17;455;3 4;2;7;1;20;2;2;1;26;18;30;0;0;0;0;4;4;41;70;355 3C2I 3c2i_1_1 18313390 2.5 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Alpha|Beta MeCP2 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 1 1 0 0 1 A rGPYDDPTLPEGWTRkLkqrksgrsAGkydvyLINPQgkaFrskveLIYFEKVGDTSLDPNDFDftvtGr B;C TCTGgaaggAATTctTCTA;ATAGAAGAAttcgtTCCAG 250 186 96 23;1;71;1 2;0;5;0;1;0;0;0;1;5;7;0;0;0;0;1;1;8;9;56 3CBB 3cbb_1_2 0 2 HOMO SAPIENS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Hepatocyte Nuclear Factor 4 Alpha 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B ALCAICGdRAtGkhygASSCdgCkgfFrrSVrkNhMySCRFSRQCVVDkDKrnQCrYCrLKKCFRAGMKKEavqnerd C;D TGAAGTCCAaagttCAGTCCC;AGGGactgaacTttgGACTTC 187 181 174 41;0;133;0 5;0;5;0;2;0;0;0;9;0;7;0;0;0;0;0;0;18;14;114 3CO6 3co6_1_1 18786403 2.1 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Forkhead Box Protein O1 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 C SSRrnAwGNlsyaDLITKAIESSAEKRLTlsQIyEWMVKSVPyFKDKGDsNSSAgWknsIrhnLslhSKFIrVQNeGTgkssWwMLNPEGG A;B TGGTttgtttaCCTTG;CAAggtaaACAAAccA 93 180 146 50;0;96;0 2;0;2;0;1;0;0;0;3;9;6;0;0;0;0;2;3;4;32;82 3COQ 3coq_1_1 18611375 2.4 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating GAL4 Type, GAL4 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B eqaCDICrlkklkcSkEKPKCAkCLKNNwECRYSPktKrSpltrAHLTEVESRLERLEQLFLLIFPREDLDMILKMDSLQDIKALLTGL;eqaCDICrlkklkcSkEKPKCAKCLKNNWECRYSPktKrSpltrAHLTEVESRLERLEQLFLLIFPREDLDMILKMDSLQDIKALLTGL D;E accggAGGacAgtcctccgG;tccggAGGacTgtcctccGG 178 177 258 65;1;190;2 4;0;4;0;0;0;6;0;6;0;12;0;0;0;0;0;9;18;44;155 3CRO 3cro_1_1 2038059 2.5 BACTERIOPHAGE 434 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Cro Repressor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 L;R MQTLSERLkKRrIALKMtqteLATKAgvkqqsIqliEaGvtkrprfLFEIAMALNCDPVWLQYGTK;MQTLSERLkKRrIALKMtqteLATKAGvkqqsIqliEAGvtkrprfLFEIAMALNCDPVWLQYG A;B AAgtacaAACtttcttgtAT;TatacaAGAaagtttgtACT 198 175 289 87;12;190;0 9;0;9;0;3;0;0;0;16;15;14;0;0;0;0;11;1;10;41;160 3CVU 3cvu_1_1 18956392 2 DROSOPHILA MELANOGASTER 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Photolyase Photolyase RE11660p 1 1 1 0 1, 1 1 0 0 0 1 1 0 0 1 A RSTLVHWFRKGLRLHDNPALSHIFTAANAAPGRYFVRPIFILDPGILDWMQVGANRWRFLQQTLEDLDNQLRKLNSRLFVVRGKPAEVFPRIFKSWRVEMLTFETDIEPYSVTRDAAVQKLAKAEGVRVETHCSHTIYNPELVIAKnLGkAPityqkFLGIVEQLKVPKVLGVPEKLKNMPTPPKDEVEQKDSAAYDCPTMKQLVKRPEELGPNKFPGGETEALRRMEESLKDEIWVARFEKPNTAPNSLEPSTTVLSPYLKFGCLSARLFNQKLKEIIKRQPKHSQPpVSLIGQLMwREFYYTVAAAEPNFDRMLGNVyCmQIPWQEHPDHLEAWTHGRTGYPFIDAIMRQLRQEGWIHHLARHAVACFLTRGDLWISWEEGQRVFEQLLLDQDWALNAGNWMwLSASAffhqyfrvysPVafGKkTDPQGHYIRKYVPELSKYPAGCIYEPWKASLVDQRAYGCVLGTDYPHRIVKHEVVhKENiKRMGAAyKVNrEVr C;D ACAGCgggcaGGT;TACCTGCaaccgctG 212 172 177 11;27;133;6 1;0;1;0;0;1;2;0;3;2;5;0;0;0;0;0;0;12;40;110 3DPG 3dpg_1_1 18701646 1.91 STREPTOMYCES GRISEUS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease SgraIR 1 1 1 0 1, 1 0 0 1 0 0 2 1 1 1 A;B PFTYSIEATRNLATTERCIqDIRNAPvrnrstQfqlaqqNMLAYTFGEVIPGFASAGINGMDYRDVIGRPVENAVTEGTHFFRDDFRVdsnakakvagdIfeiVSSAVMWNCAARWNSLMVGEGWRSQPRYSRPTLSPSPRRQVAVLNLprsfDWVSLLVPESQEVIEEFRAGLRKDGLGLPTstPdLAVVVLPEEFQNDEMWREEIAGLTrPNQILLsGAyqRLqGRVQPGEISLAVAfkrsLrsdrLyqPLYEANVMQLLLEGKLGAPKVEFEVHTLAPegTnAFVTYEAASLYGLAEGRSAVHRAIRELYVPPTAADLARRFFAFLNERMELVNG;PFTYSIEATRNLATTERCIQDIRNAPvrnrstQfqlaqqNMLAYTFGEVIPGFASAGINGMDYRDVIGRPVENAVTEGTHFFRDDFRVdsnakakvagdIfeIVSSAVMWNCAARWNSLMVGEGWRSQPRYSRPTLSPSPRRQVAVLNLprsFDWVSLLVPESQEVIEEFRAGLRKDGLGLPTstPdLAVVVLPEEFQNDEMWREEIAGLTrPNQILLsGAyqRLQGRVQPGEISLAVAfkrsLrsdrLyqPLYEANVMQLLLEGKLGAPKVEFEVHTLAPeGTnAFVTYEAASLYGLAEGRSAVHRAIRELYVPPTAADLARRFFAFLNERMELVNG C;D AAGtcgaccggtggacT;AAgtcgaccggtggat 38 161 584 101;60;421;2 14;2;6;0;11;2;4;0;33;31;19;0;0;0;0;6;1;18;76;361 3E54 3e54_1_1 18984620 2.5 VULCANISAETA DISTRIBUTA 1 1 1 3 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease I-Vdi141I 1 1 1 0 0, 0 0 2 0 0 0 2 1 2 1 A;B EEDFKEGYILGFIEaegsfsvsikfqrdvfGGVrldPvFsItqkNREVLEAIKEHLGIGrImekaGqPNtYVYVVdnfnELVKLINFLNKYADFMIVkKRqFLMFREIANGlVNGEhlHINGLKRLVKLAyEltKEsekgyrkyDLNHVLSIIDKWDLG;EEDFKEGYILGFIEaegsfsvsikfqrdvfGGVrldPvFsItqkNREVLEAIKEHLGIGrImekaGqPNtYvYVVdnfnELVKLINFLNKYADFMIVkKRqFLMFREIANGlVNGEhlHINGLKRLVKLAyEltKEsekgyrkyDLNHVLSIIDKWDLG C;D;E;F ctgactctcttaa;ggtagccAA;ttggctaccttaa;gagagtcAG 164 160 680 182;35;462;1 13;6;20;0;10;0;5;0;19;14;22;0;0;0;0;7;6;33;124;401 3E6C 3e6c_1_1 18717788 1.8 DESULFITOBACTERIUM HAFNIENSE 1 1 1 1 0 0 1 Transcription factor Alpha|Beta CprK 1 1 1 0 0, 0 0 2 0 0 0 2 1 2 1 C;F DFCGAIIPDNFFPIEKLRNYTQMGLIRDFAkGSAVIMPGEEITSMIFLVEGKIKLDIIFEDGSEKLLYYAGGNSLIGKLYPTGNNIYATAMEPTRTCWFSEKSLRTVFRTDEDMIFEIFKNYLTKVAYYARQVAEMNtYnptIRILRLFYELCSSQGKRVGDTYEITMPLsqkSIGEITgvhhvtVsrVLaSLkrENILDkKkNKIIVYNLGELKHLSEQtsYyS;DFCGAIIPDNFFPIEKLRNYTQMGLIRDFAkGSAVIMPGEEITSMIFLVEGKIKLDIIFEDGSEKLLYYAGGNSLIGKLYPTGNNIYATAMEPTRTCWFSEKSLRTVFRTDEDMIFEIFKNYLTKVAYYARQVAEMNtYnptIRILRLFYELCSSQGKRVGDTYEITMPLsqkSIGEITgvhhvtVsrVLaSLkrENILDkKkNKIIVYNLGELKHLSEQtsYyS A;B;D;E GGCAtgttaaTGC;gcattaACATGcc;GGCAtgttaaTGC;gcattaACATGcc 152 159 298 116;0;182;0 4;2;0;0;0;0;0;0;8;16;14;0;0;0;0;6;4;8;64;172 3ERE 3ere_1_1 0 2.5 MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS H37RV 1 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Arginine Repressor 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 D AaNrAGrQARIVAILSSAQVrsqneLAALLAAEGIevtqatLsrDLeELGAVkLrGADggtGIyVVPEDGSPVRGVSGGTDRMARLLGELLVSTDDSGNLAVLRTPPGAAHYLASAIDRAALPQVVGTIAGDDTILVVAREPTTGAQLAGMFENLR A;B ttgcaTAACGatGCAA;TTGCATCGttatgCAA 223 156 118 35;0;83;0 3;1;3;0;1;0;0;0;6;5;7;0;0;0;0;3;1;8;7;73 3F21 3f21_1_1 19074195 2.2 HOMO SAPIENS 2 2 1 5 0 1 1 Structural|DNA Binding protein Zalpha dsRNA Adenosine Deaminase ADAR1 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A LSIYQDQEQRILKFLEELGEGKATTAhDLSGKLGTPkkEInrVLySLAKKGKLQKEAgtppLwKIAV D;E cacgtg;CACGtg 43 153 85 7;1;77;0 0;0;1;0;0;0;0;0;4;3;3;0;0;0;0;0;0;6;14;54 9ANT 9ant_1_1 9699632 2.4 DROSOPHILA MELANOGASTER 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Antennapedia 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A rqtyTRYQtLELEKEFHFNRylTrRRrIEIAHALSLTErqIkiwFqnRrmkWkkEN C;D AGAaagccatTagag;TCTCtaatgGCTTTC 102 140 171 36;10;124;1 7;0;3;0;3;0;0;0;10;3;6;0;0;0;0;0;0;18;29;92