#QUERY: #Match: All #Classification: Transcription factor #PDB_ID ENTRY_ID PUBMED_ID RESOLUTION SPECIES MULTICOMPLEXITY NO_INTERFACES ASYMMETRIC_UNIT BIOLOGICAL_UNITS IS_CRUCIFORM HAS_ZDNA HAS_WATER CLASSIFICATION TYPE SUBTYPE COMPLEX_ID INTERFACE_ID DNA_DOUBLE_STRAND DNA_SINGLE_STRAND STICKY_ENDS FLIPPED_BASE NICKED_DNA GAPPED_DNA OPEN_DNA MODIFIED_DNA PROTEIN_MONOMERS MULTIMERIZATION PROT_PROT_INTERACTION DNA_PROT_INTERACTION PROT_CHAIN_IDS PROT_SEQS DNA_CHAIN_IDS DNA_SEQS SEQ_GROUPS INTERFACE_GROUP NUMBER_EFF_CONTACTS GROOVE_CONTACTS(MA;MI;BB;NA) TYPE_CONTACTS(1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13;14;15;16;17;18;19;20) 1A1F 1a1f_1_1 9562555 2.1 MUS MUSCULUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zif268 Zinc Finger 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A rPYACPVESCDrrfsdssnLtrhIriHTGQkPfQCRICMrnfsrsdhLtthIrtHTGEkPfACDICGrkfarsderkrhTKIHL B;C agcgtgggacc;tggtcccacgC 19 671 245 107;6;131;1 12;1;12;2;11;0;0;0;5;11;1;0;0;0;0;10;1;16;26;137 1A1G 1a1g_1_1 9562555 1.9 MUS MUSCULUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zif268 Zinc Finger 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A rPYACPVESCDrrfsdssnLtrhIriHTGqkPfQCRICMrnfsrsdhLtthIrtHTGEkPfACDICGrkfarsderkrhTKIHL B;C agcgtgggcgT;tacgcccacgC 19 670 236 90;7;138;1 8;2;10;0;8;0;1;0;5;15;2;0;0;0;0;6;1;17;23;138 1A1H 1a1h_1_1 9562555 1.6 MUS MUSCULUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zif268 Zinc Finger 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A RPYACPVESCDrrfsqsgsLtrhIriHTGQkPfQCRICMrnfsrsdhLtthIrtHTGEkPfACDICGrkfarsderkrhTKIHLR B;C agcgtgggcac;tgtgcccacgC 19 669 224 89;6;127;2 8;1;10;0;9;0;0;0;4;12;1;0;0;0;0;7;2;18;23;129 1A1I 1a1i_1_1 9562555 1.6 MUS MUSCULUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zif268 Zinc Finger 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A rPYACPVESCDrrfsrSadLtrhIriHTGQkPfQCRICMrnfsrsdhLtthIrtHTGEkPfACDICGrkfarsderkrhTKiHLR B;C agcgtgggcAC;tgtgcccacgC 19 43 235 80;8;146;1 9;1;10;0;7;0;0;0;6;13;1;0;0;0;0;6;1;27;26;128 1A1J 1a1j_1_1 9562555 2 MUS MUSCULUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zif268 Zinc Finger 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A rPYACPVESCDrrfsrSadLtrhIriHTGQkPfQCRICMrnfsrsdhLtthIrtHTGEkPfACDICGrkfarsderkrhTKIHL B;C agcgtgggcGT;tacgcccacgC 19 43 214 80;7;125;2 8;1;10;0;7;0;0;0;5;11;1;0;0;0;0;6;1;21;20;123 1A1K 1a1k_1_1 9562555 1.9 MUS MUSCULUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zif268 Zinc Finger 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A rPYACPVESCDrrfsrsadLtrhIriHTGQkPfQCRICMrnfsrsdhLtthIrtHTGEkPfACDICGrkfarsderkrhTKIHLR B;C agcgtgggacc;tggtcccacgC 19 668 231 89;6;135;1 10;0;12;0;7;0;0;0;3;11;3;0;0;0;0;8;1;21;23;132 1A1L 1a1l_1_1 9562555 2.3 MUS MUSCULUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zif268 Zinc Finger 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A rPYACPVESCDrrfsrSdeLtrhIriHTGQkPfQCRICMrnfsrsdhLtthIrtHTGEkPfACDICGrkfarsderkrhTKIHLR B;C agcgtgggcaC;tgtgcccacgC 19 43 232 84;8;139;1 10;1;9;0;8;0;0;0;5;13;1;0;0;0;0;8;1;27;25;124 1A3Q 1a3q_1_1 9384586 2.1 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet NFkB 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B GPYLVIVEQPKQRgFrFryGceGPShggLPGASSEKGRkTYPTVKICNYEGPAKIEVDLVTHSDPPRAHAHSLVGKQCSELGICAVSVGPKDMTAQFNNLGVLhvtkkNMMGTMIQKLQRQRLRSRPQGLTEAEQRELEQEAKELKKVMDlSIVRLRFSAFLRSLPLKPVISQPIHDSkSpGASNLkISRMDKTAGSVRGGDEVYLLCDkVqkDDIEVRFYEDDENGWQAFGDFSPTDvHkqyAIVFRTPPYHKMKIERPVTVFLQLKRKRGGDVSDSKQFTYYP;GPYLVIVEQPKQRgFrFryGceGPShgGLPGASSEKGRkTYPTVKICNYEGPAKIEVDLVTHSDPPRAHAHSLVGKQCSELGICAVSVGPKDMTAQFNNLGVLhvtkkNMMGTMIQKLQRQRLRSRPQGLTEAEQRELEQEAKELKKVMDlSIVRLRFSAFLRSLPLKPVISQPIHDskspGASnLkISRMDKTAGSVRGGDEVYLLCdkVqkDDIEVRFYEDDENGWQAFGDFSPTDvHkqyAIVFRTPPYHKMKIERPVTVFLQLKRKRGGDVSDSKQFTYYP C;D ggggaatcccC;ggggattcccC 140 665 295 112;0;183;0 16;0;13;0;6;0;2;0;15;2;5;4;0;0;0;2;6;18;42;164 1A6Y 1a6y_1_1 9660968 2.3 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Hormone Nuclear Receptor, Orphan Nuclear Receptor NR1D1 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 1 2 1 2 1 A;B LLCKVCGdVAsgfhyGVLACegCkgfFrrSIqQNiykRCLKNENCSIVRINrnrCqQCrFKKCLSVGMSrDAvrfgr;GMVLLCKVCGdvAsgfhyGVLACegCkgfFrrSiqQNiyKRCLKNENCSIVrINrnRCqQCrFKKCLSVGMSrDAvrfgripk C;D CAactaggtCacaggtCAG;ctgaccTagtgaccTAgttg 54 664 428 69;27;332;0 11;0;9;0;4;3;2;4;20;0;16;0;0;0;0;0;0;27;64;268 1AAY 1aay_1_1 8939742 1.6 MUS MUSCULUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zif268 Zinc Finger 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A rPYACPVESCDrRfsrsdeLtrhIriHTGQkPfQCRICMrnfsrsdhLtthIrtHTGEkPfACDICGrKfarsderkrhTKIHLR B;C agcgtgggcgt;tacgcccacgC 19 137 226 90;6;130;0 9;1;13;0;9;0;0;0;3;12;1;0;0;0;0;8;1;27;19;123 1AIS 1ais_1_1 9177165 2.1 PYROCOCCUS WOESEI 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet TATA Box Binding Protein 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 1 2 2 0 1 A;B MVDMSKVKLRIenIvAsVDLFAQLDLEKVLDLCPNSkYNPEefpGIiChLDDPkVaLlIfssGklvVtgAkSVQDIERAVAKLAQKLKSIGVKFKRAPQIDVqnMvfsgDIGREFNLDVVALTLPNCeYEPeqfpGViYrVKEPKSvIlLfssGkivCsGAkSEADAWEAVRKLLRELDKY;NLAFALSELDRITAQLKLPRHVEEEAARLYREAVRKGLIRGRSIESVMAACVYAACRLLKVPRTLDEIADIARVDkkEIGrSYrFIARNLNLTPKKLFVKPTDYVNKFADELGLSEKVRRRAIEILDEAYKRGLTsgksPAgLVAAALYIASLLEGEKRTQREVAEVArvtEvtVrnrYKELVEKLKIKVPIA C;E aacTTACtttaaaGC;GctttaaaaagtaagTT 157;163 663 333 16;63;254;0 2;1;0;2;0;0;0;0;9;8;6;0;0;0;0;0;0;21;83;201 1AKH 1akh_1_1 9838003 2.5 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodamain, Mat Alpha 2 1 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 2 2 2 1 A;B iSPQArAFLeEVFRRKQslnsKEkEEVAKKCGITPlqVrvwFinKrmrS;TKpyrghrfTkENvRILeSWFAKNIENPylDTKGLENLMKNTSLSriqIknwVsnRrrkEkTITIAPELADLLSGEPL C;D TacatgtaaaaatttacatCA;TAtgatgTAAATTtttacaTG 121;123 662 322 76;26;220;0 12;1;11;1;5;1;0;1;18;4;8;0;0;0;0;3;1;18;47;191 1AM9 1am9_1_1 9634703 2.3 HOMO SAPIENS 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Helix Loop Helix, SREBP-1A 1 1 1 0 4, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B qSRGEkrTahnAiekryrSsinDKIIELKDLVVGTEAKLnksAVLRKAIDYIRFLQHSNQKLKQENLSLRTAVHKSKSLK;SrGEKrTahnAiekryrSsinDKIiELKDLVVGTEAkLnksAVLRKAIDYIRFLQHSNQKLKQENLSLRTAVHKS F;G CATgagatcaccccaCTGCAA;TTGCagtggggtgatCt 95 136 290 103;0;186;1 1;0;0;0;6;0;0;0;19;7;6;0;0;0;0;6;3;12;60;170 1AM9 1am9_2_1 9634703 2.3 HOMO SAPIENS 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Helix Loop Helix, SREBP-1A 2 1 1 0 4, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 C;D qSRGEkrTahnAiekryrSsinDKIIELKDLVVGTEAKLnksAVLRKAIDYIRFLQHSNQKLKQENLSLRTAVHKSKSLKDL;QSrGEKrTahnAiekryrSsinDKIiELKDLVVGTEAkLnksAVLRKAIDYIRFLQHSNQKLKQENLSLRTAVHKS E;H TTGCagtggggtgatCt;CATgagatcaccccaCTGCAA 95 136 282 101;0;181;0 2;0;1;0;5;0;0;0;18;6;9;0;0;0;0;7;3;12;58;161 1AU7 1au7_1_1 9009203 2.3 RATTUS NORVEGICUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Pit-1 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B GMRALEQFANEFkVRrIKLGytqtNVGEALAAVHGSefsqttIcrFEnLqlsFknACklKAILSKWLEEAEQkrrttiSIAAkDALERHFGEHSkpSsQEiMRMAEELNLEkevVrvwFcnRrqrEkrVK;GMRALEQFANEFkVRriKLGYtqtNVGEALAAVhGSefsqttIcrFEnLqlsFknACklKAILSKWLEEAkrrttiSIAAkDALERHFGEHSKpSsQEiMRMAEELNLEkevVrvwFcnRrqREkrVK C;D TcctcatgtatatacatgAGGAAGG;CTTcctcatgtatatacatgAGGA 170 661 561 161;18;382;0 15;1;22;4;12;0;1;0;24;19;16;9;0;0;0;13;3;30;63;329 1AWC 1awc_1_1 9461436 2.15 MUS MUSCULUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Ets Domain, GABP 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 1 2 2 0 1 A;B IqlWQFLLELLTDKDARDCISWVGDEGEFKLNQPELVAQKwGQRkNkPtmNyeklsraLryyyDGDMICkVQgkrfVyKFVCDLKTLIGYSAAELNRLVIECEQKKLARM;DLGKKLLEAARAGQDDEVRILMANGApFttDwLGTSPLHLAAQYGHFSTTEVLLRAGVSRDARTkVDRTPLHMAASEGHANIVEVLLKHGADVNAKDMLKMTALHWATEHNHQEVVELLIKYGADVHTQSKFCKTAFDISIDNGNEDLAEILQ D;E AAGaccggaaGTAAcgGA;TTCCGGGacttccGGTCAT 225;237 660 171 50;0;120;1 3;0;1;0;0;0;1;0;5;3;3;0;0;0;0;1;3;10;39;102 1B72 1b72_1_1 10052460 2.35 HOMO SAPIENS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, PBX1 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A ARTFDwMKvlrtnfTTRQlTELEKEFHFNKylSrARrVEIAATLELNEtqVkiwFqnRrmkQkKRERE D;E ACTCTATGATtgatcGGCTG;TCAgccgaTcaatcATAGAG 251 657 148 18;6;123;1 3;0;1;0;1;0;0;0;10;2;3;0;0;0;0;0;0;11;26;91 1B72 1b72_1_2 10052460 2.35 HOMO SAPIENS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, PBX1 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B rkrrnfNKQAtEILnEYFYSHLSNPypSeEAkEELAKKCGITVsqVsnwFgnkrirYkkNIGkfQEeANIYAA D;E ACTCTatgatTGATCGGCTG;TCAGCCGatcaatCatagAG 191 656 158 33;6;118;1 5;0;3;0;2;0;1;0;14;1;3;0;0;0;0;2;0;12;24;91 1B8I 1b8i_1_1 10067897 2.4 DROSOPHILA MELANOGASTER 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, UBX|EXD 1 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A FYPwMarqtyTRYQtLELeKEFHTNHyLTrRRrIEMAHALSLTErqIkiwFqnRrmkLkkEI C;D GTcgccataaatcAC;ACGTGAtttatgGCG 253 655 165 35;8;122;0 2;0;3;0;4;0;0;0;10;3;4;0;0;0;0;2;0;17;28;92 1B8I 1b8i_1_2 10067897 2.4 DROSOPHILA MELANOGASTER 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, UBX|EXD 1 2 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B rrnfSKQAsEILNEYFYSHLSNPypSeEAkEELARKCGITVSqVsnwFgnKrirYkkN C;D GTCGCCataaatCac;ACgtgatTTATGGCG 255 654 137 28;10;98;1 3;0;4;0;0;0;0;0;14;1;1;0;0;0;0;1;0;11;17;85 1BC7 1bc7_1_1 9734357 2.01 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Ets Domain, SAP-1 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 C MDSaItlWQFLLQLLQKPQNKHMICWTSNDGQFKLLQAeEVARLwGIRkNkPnmNydklSraLryyyVkNIIKkVnGqkfVyKFVSYPEILNM A;B gacaggatGtg;CacatccTGTC 92 653 183 54;1;127;1 5;0;1;0;1;1;2;0;5;0;3;0;0;0;0;1;2;11;38;113 1BC8 1bc8_1_1 9734357 1.93 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Ets Domain, SAP-1 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 C MDSAItlWQFLLQLLQKPQNKHMICWTSNDGQFKLLQAeEVARLwGIRkNkPnmNydklsraLryyyvkNIIKkVngqkfVyKFVSYPEILNM A;B taccggaaGt;AacttccGGT 92 652 188 57;2;128;1 1;0;3;0;3;0;0;0;5;2;5;0;0;0;0;5;2;10;43;109 1BDT 1bdt_1_1 9927650 2.5 BACTERIOPHAGE P22 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Ribbon|Helix|Helix Arc Repressor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B mkgmsKMpqfnLrWPrEVLDLVrKVAEENGRsvnsEIYQRVMESFKKEGRIG;mkgmsKMpqfnLrWPREVLDLVrKVAEENgrsvnsEIYQRVMESFKKEGRIGA E;F tatagtagaGTGCtTCTATCAT;AATGATAGAAGcactctacTAT 106 651 209 81;0;128;0 5;1;6;0;5;0;0;0;3;8;21;0;0;0;0;4;4;4;33;115 1BDT 1bdt_1_2 9927650 2.5 BACTERIOPHAGE P22 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Ribbon|Helix|Helix Arc Repressor 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 C;D mkgmsKMpqfnLrWPREVLDLVrKVAEENGRsvnsEIYQRVMESFKKEGR;mkgmskmpqfnLrWPREVLDLVrKVAeENgrsvnsEIYQRVMESFKKEGR E;F TATAGTAGAGTgcttctatCAT;aatgatagaAGCacTCTACTAT 106 650 230 89;0;141;0 4;0;10;0;6;1;0;0;3;12;22;0;0;0;0;5;2;6;33;126 1BG1 1bg1_1_1 9671298 2.25 MUS MUSCULUS 1 1 1 1 0 0 1 Transcription factor Alpha|Beta STAT3B 1 1 1 2 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;C VVTEKQQMLEQHLQDVRKRVQDLEQKMKVVENLQDDFDFNYKTLKSQGDSVTRQKMQQLEQMLTALDQMRRSIVSELAGLLSAMEYVQKTLTDEELADWKRRQQIACIGGPPNICLDRLENWITSLAESQLQTRQQIKKLEELQQKVSYKGDPIVQHRPMLEERIVELFRNLMKSAFVVERQPCmpmhPDRPLVIktgvqFTTKVRLLVKFPELNYQLKIKVCIDKDSGDVAALRGSrKFNILGTNTKVMNMEESNNGSLSAEFKhLTLReQrCGNGGrANCDaSLivtEELHLITFETEVYHQGLKIDLETHSLPVVVIsnicqMPNAWASILWYNMLTNNPKNVNFFTKPPIGTWDQVAEVLSWQFSSTTKRGLSIEQLTTLAEKLLGPGVNYSGCQITWAKFCKENMAGKGFSFWVWLDNIIDLVKkYILALWNEGYIMGFISKERERAILSTKPPGTFLLRFSESSKeGGVTFTWVEKDISGSTQIQSVEPYTKqQLNNMSFAEIIMGYKIMDATNILVSPLVYLYPDIPKEEAFGKYCRAAPLKTKFICVTPF;VVTEKQQMLEQHLQDVRKRVQDLEQKMKVVENLQDDFDFNYKTLKSQGDSVTRQKMQQLEQMLTALDQMRRSIVSELAGLLSAMEYVQKTLTDEELADWKRRQQIACIGGPPNICLDRLENWITSLAESQLQTRQQIKKLEELQQKVSYKGDPIVQHRPMLEERIVELFRNLMKSAFVVERQPCmpmhPDRPLVIktgvqFTTKVRLLVKFPELNYQLKIKVCIDKDSGDVAALRGSrKFNILGTNTKVMNMEESNNGSLSAEFKhLTLReQrCGNGGrANCDaSLivtEELHLITFETEVYHQGLKIDLETHSLPVVVIsnicqMPNAWASILWYNMLTNNPKNVNFFTKPPIGTWDQVAEVLSWQFSSTTKRGLSIEQLTTLAEKLLGPGVNYSGCQITWAKFCKENMAGKGFSFWVWLDNIIDLVKkYILALWNEGYIMGFISKERERAILSTKPPGTFLLRFSESSKeGGVTFTWVEKDISGSTQIQSVEPYTKqQLNNMSFAEIIMGYKIMDATNILVSPLVYLYPDIPKEEAFGKYCRAAPLKTKFICVTPF B;D TGCatttcccgtaaAtct;TGCatttcccgtaaAtct 128 648 284 52;0;232;0 4;0;6;0;0;2;0;0;22;8;8;0;0;0;0;6;2;24;34;168 1BL0 1bl0_1_1 9724717 2.3 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, MARA 1 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A dAITIHSILDWIEDNLESPLSlekVSERSGyskwhLqrmFkkETGHslgqYIrSRKMTEIAQKLKESNEpilYLAERYgfesqqtLtrtFknYFDVpphkYrMTNMQGESRFLHPL B;C GGGGAtttagCAAAacgtggcATC;CCGatgccaCGTtttgctaAATCc 232 645 253 85;0;168;0 3;1;7;0;1;0;2;0;6;7;14;0;0;0;0;8;2;13;46;143 1BY4 1by4_1_1 10669605 2.1 HOMO SAPIENS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Hormone Nuclear Receptor, Retinoic Acid Receptor 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 2 1 1 A;B TKHICAICGdrSsgkhyGVYSCegCkgfFkrTVrkDlTYTCrDNKDCLIDKRQrnRCqYCrYQKCLAMGMKREavqEEr;GSFTkhICAICGdrSsGkhygVYScegCkgfFkrTVrkDlTyTCRDNKDCLIDkRQrnRCqYCrYQKCLAMGMKREaVqEer E;F taggtcaaaggtCAG;ctgacCTttgacCTA 46 639 288 76;0;212;0 9;1;8;0;2;0;2;0;16;0;10;0;0;0;0;1;1;31;29;178 1BY4 1by4_2_1 10669605 2.1 HOMO SAPIENS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Hormone Nuclear Receptor, Retinoic Acid Receptor 2 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 2 2 1 1 C;D KHICAICGdrSsgkhygVYSCegCkgfFkrTVrkDlTyTCRDNKDCLIDKRQrnRCqYCrYQKCLAMGMKREavQeer;SFTKhICAICGdrSsGkhygVYScegCkgfFkrTVrkDLTyTCRDNKDCLIDKRQrnRCqYCrYQKCLAMGMKREavqee G;H CtaggtCaaaggtCAG;ctgaccTttgacCTA 46 638 266 73;0;193;0 7;1;6;0;3;0;2;0;14;0;9;0;0;0;0;1;1;25;23;174 1CDW 1cdw_1_1 8643494 1.9 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet TATA Box Binding Protein 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A SGIVPQLqnIvStVNLGCKLDLKTIALRARNAEYNpKrfaAViMrIREPrTtAlIfssGkmvCtgAkSEENSRLAARKYARVVQKLGFPAKFLDFKIqnMvGsCDVKFPIRLEGLVLTHQQFSsYEpelfpGLiYrMIKPrIvLlIfvsGkvvLtgAkVRAEIYEAFENIYPILKGFRK B;C CTGCtataaaaggcTG;CAGCcttttatagcAG 6 634 321 0;58;262;1 0;1;2;0;0;0;0;0;6;9;3;0;0;0;0;0;0;16;91;193 1CKT 1ckt_1_1 10385126 2.5 RATTUS NORVEGICUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Alpha Helix HMG, HMG-1 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 1 1 0 0 1 A KPrgkmssyaFFvqTCrEEHkKKHPDasvNfsEfskKCsERwkTMSAKEKGKFEDMaKADKARYEREMKTY B;C CCCTCTggaccttcC;GGAAggtccaGAGAGG 249 631 184 9;34;131;10 0;2;0;1;2;0;1;0;5;5;3;0;0;0;0;0;0;5;50;110 1D3U 1d3u_1_1 10570130 2.4 PYROCOCCUS WOESEI 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet TATA Box Binding Protein 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 2 2 0 1 A;B MVDMSKVKLrIenIvAsVDLFAQLDLEKVLDLCPNSkYNpeefpGIiChLDDPkVaLlIfssGklvVtgAkSVQDIERAVAKLAQKLKSIGVKFKRAPQIDVqnMvFsGDIGREFNLDVVALTLPNCEYEpeqfpGViYrVKEPkSvIlLfssGkivCsgAkSEADAWEAVRKLLRELDKY;MVSdaaERnLAFALSELDRITAQLKLPRHVEEEAARLYREAvRKGLirgrSiESVMAACVYAACRLLKVPRTLDEIADIARVDkkeIGrSYrfIARNLNLTPKKLFVKPTDYVNKFADELGLSEKVRRRAIEILDEAYKRGLTsgksPAgLVAAALyIASLLEGEkRtqREVAEVArvtevtVrnrykELVEKLKIKVPIa C;D agagtaAAGtttaaatactTAtat;TAtaagtatttaaactttacTCT 157;163 626 505 36;74;392;3 4;1;3;2;1;0;0;0;17;11;7;0;0;0;0;4;0;36;109;310 1DP7 1dp7_1_1 10706293 1.5 1 2 1 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix hRFX1 1 1 1 2 0, 0 0 0 0 0 1 1 0 0 1 P TVQWLLDNYETAEGVSLPrSTLYNHYLLHSQEQKLEPvnaasFgkLIrSVFMGLRtrrlgtrgNskyHyYGLRIKA D;E CGTaccaggtAaCG;cgtaCCAggtaACG 189 131 153 27;13;113;0 4;0;4;1;1;0;0;0;9;2;4;0;0;0;0;2;1;8;13;104 1DP7 1dp7_1_2 10706293 1.5 1 2 1 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix hRFX1 1 2 1 2 0, 0 0 0 0 0 1 1 0 0 1 Q TVQWLLDNYETAEGVSLPrSTLYNHYLLHSQEQKLEPvnaasFgkLIrSVFMGLRtrrlgtrgNskyHyYGLRIKA D;E cgtaCCAggtaACG;CGTaccaggtAaCG 189 131 153 27;13;113;0 4;0;4;1;1;0;0;0;9;2;4;0;0;0;0;2;1;8;13;104 1DSZ 1dsz_1_1 10698945 1.7 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Hormone Nuclear Receptor, Retinoic Acid Receptor 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B PCFVCQdkSsGyhygVSACegCkgfFrrSIqkNmVyTCHRDKNCIINKVTrnRCqYCrLQKCFEVGMSKEsvrNd;GSFTKHICAICGdrSsGkhygVYSCegCkgfFkrTVrkDlTyTCRDNKDCLIDkRQrnRCqYCrYQKCLAMGMKREavqeerqr C;D caggtCaaaggtCAG;ctgaccTttgaccTg 46;247 622 317 81;3;233;0 8;1;11;0;5;0;2;0;26;1;12;0;0;0;0;1;1;29;33;187 1DU0 1du0_1_1 10889025 2 DROSOPHILLA MELANOGASTER 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Engrailed 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A afSSEQlARLkREFNENRylTeRRrQQLSSELGLNEAqIkiwFanKrakIkkS C;D TTTTGCCATgtaatTACCTAA;ATTAggtaatTACatGGCAAA 35 621 94 23;0;71;0 2;0;0;0;1;0;0;0;5;0;2;0;0;0;0;0;0;12;14;58 1DU0 1du0_1_2 10889025 2 DROSOPHILLA MELANOGASTER 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Engrailed 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B rprTAFSSEQLARLKREFNENRylTeRRrQQLSSELGLNEaqIkiWFanKraKIkk C;D TTTTGCCATGTAATTacctaa;atTAGGTAATTACATGGCAAA 35 620 90 20;2;68;0 3;0;0;0;2;0;0;0;3;0;2;0;0;0;0;0;0;12;13;55 1DUX 1dux_1_1 10742173 2.1 HOMO SAPIENS 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Ets Domain, ELK-1 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 C VtlWQFLLQLLREQGNGHIISWTSRDGGEFKLVDAeEVARLwgLRkNkTnmnydklsraLryyydkNIIRkVsGqkfVyKFVSYPE A;B TGaccggaAGtgT;ACacttccGGTCA 92 130 168 52;1;114;1 2;0;1;0;4;0;1;0;6;1;2;0;0;0;0;3;3;16;38;91 1DUX 1dux_2_1 10742173 2.1 HOMO SAPIENS 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Ets Domain, ELK-1 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 F VtlWQFLLQLLREQGNGHIISWTSRDGGEFKLVDAeEVARLwgLRkNkTnmnydklsraLryyydkNIIRkVsGqkfVyKFVSYPE D;E TGaccggaAGtgT;ACacttccGGTCA 92 130 172 53;1;117;1 2;0;1;0;4;0;1;0;6;1;2;0;0;0;0;3;3;17;39;93 1E3O 1e3o_1_1 11583619 1.9 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Oct-1 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 C EEPSDLEELEQFAKTFKQRRIKLGFTQGDVGLAMGKLYGNdfsqttIsrFEALnlsFknMSklKPLLEKWLNDAEkrtsiETNIrVALEKSFMENQkpTsEDiTLIAEQLNMEKevIrvwFsnRrqkEkrIN A;B atgcatgAGGA;TcctcatgcaT 227 619 208 64;3;141;0 6;0;6;1;10;0;0;0;4;10;9;0;0;0;0;6;1;15;25;115 1EGW 1egw_1_1 10715212 1.5 HOMO SAPIENS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Alpha Helix MADS box, MEF2A 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B grkkiQITRIMDErnRQvtFTkrKFgLMkKAYeLSVLCDCEIALIIFNSSNKLFQYASTDMDKVLLKYTEY;grkkiQITRIMDErnRQvtFTkrKFgLMkKAYeLSVLCDCEIALIIFNSSNKLFQYASTDMDKVLLKYTEYN E;F aAAgctatTatTagctT;TaAgctaAtaAtagcTT 98 128 236 21;43;172;0 3;0;6;0;0;4;0;4;14;2;9;0;0;0;0;0;0;12;31;151 1EGW 1egw_2_1 10715212 1.5 HOMO SAPIENS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Alpha Helix MADS box, MEF2A 2 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 C;D grkkiQITRIMDErnRQvtFTkrKFgLMkKAYeLSVLCDCEIALIIFNSSNKLFQYASTDMDKVLLKYTEYN;grkkiQITRIMDErnRQvtFTkrKFgLMkKAYeLSVLCDCEIALIIFNSSNKLFQYASTDMDKVLLKYTEY G;H taAgctaAtaAtagctT;aAAgctatTatTagctT 98 128 233 19;45;169;0 3;0;6;0;0;4;0;4;10;2;10;0;0;0;0;0;0;12;33;149 1F2I 1f2i_1_1 11427887 2.35 MUS MUSCULUS 3 1 1 3 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zif268 Zinc Finger 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 G;H NLLNYVVPkMrPYACPVESCDrrfsrsdeLTrhIriHTGQkPFQCRICMrnfsrsdhLtthIrTHT;NLLNYVVPkMrPYACPVESCDrrfsrSdeLTrhIriHTGQkPFQCRICMrnfsrsdhLttHIrTHT A;B atgggcgcgccCAT;atgggcgcgccCAT 58 125 289 112;3;171;3 12;1;14;0;8;0;0;0;5;17;4;0;0;0;0;4;0;33;45;146 1F2I 1f2i_2_1 11427887 2.35 MUS MUSCULUS 3 1 1 3 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zif268 Zinc Finger 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 I;J NLLNYVVPkMrPYACPVESCDrrfsrSdeLTrhIriHTGQkPFQCRICMrnfsrsdhLttHIrTHT;NLLNYVVPkMrPYACPVESCDrRfsrsdeLTrhIriHTGQkPFQCRICMRnfsrsdhLtthIrTHT C;D atgggcgcgccCAT;atgggcgcgccCAT 58 125 287 115;3;165;4 15;1;17;0;8;0;0;0;4;16;3;0;0;0;0;6;0;29;43;145 1F2I 1f2i_3_1 11427887 2.35 MUS MUSCULUS 3 1 1 3 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zif268 Zinc Finger 3 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 K;L NYVVPkMrPYACPVESCDrrfsrsdeLTrhIriHTGQkPfQCRICMrNfsrsdhLttHIrTHT;NLLNYVVPkMrPYACPVESCDrrfsrSdeLTrhIriHTGQkPFQCRICMrNfsrsdhLttHIrTHT E;F AtgggcgcgccCAT;atgggcgcgccCAT 58 610 270 110;0;157;3 15;1;13;0;8;0;1;0;4;13;2;0;0;0;0;4;0;27;46;136 1FJL 1fjl_1_1 7671301 2 DROSOPHILA MELANOGASTER 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Paired Protein Pax 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B kQrrsrtTfSASQlDELERAFERTQypDiYTrEELAQRTNLTEArIqvwFqnRrarLrKQHTSVS;QrrsrtTfSASQlDELERAFERTQyPDiYTrEELAQRTNLTeArIqvwFqnRrarLrK D;E Aataatctgattac;Tgtaatcagattat 99 606 363 49;35;279;0 10;0;18;0;2;0;0;0;27;2;9;0;0;0;0;2;0;27;55;211 1FJL 1fjl_2_1 7671301 2 DROSOPHILA MELANOGASTER 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Paired Protein Pax 2 1 1 2 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 C;D kqrrsrtTfSASQlDELERAFERTQypDiYTrEELAQRTNLTEArIqvwFqnRrarLrK;kqrrsrtTfSASQlDELERAFERTQypDiYTrEELAQRTNLTEArIqvwFqnRrarLrK E;F Tgtaatctgattac;Tgtaatctgattac 99 605 370 56;34;280;0 8;0;20;0;2;0;0;0;30;2;12;0;0;0;0;4;0;26;54;212 1FYL 1fyl_2_1 11599025 2.1 KLUYVEROMYCES LACTIS 2 2 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Heat Shock Factor Protein 2 1 1 2 0, 0 0 0 0 0 1 1 0 0 1 B RPAFVNKLWSVNDKSNEKFIHWSTSGESIVVPNreRFvQEVLPKYFKHSnfasFVrQLNYGWHKVDSRWEFEN D;E AGGAACGTTCC;AggaACGTTCC 34 122 36 0;0;36;0 0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;4;0;0;0;0;0;0;6;2;23 1FYL 1fyl_2_2 11599025 2.1 KLUYVEROMYCES LACTIS 2 2 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Heat Shock Factor Protein 2 2 1 2 0, 0 0 0 0 0 1 1 0 0 1 F RPAFVNKLWSVNDKSNEKFIHWSTSGESIVVPNreRFvQEVLPKYFKHSnfasFVrQLNYGWHKVDSRWEFEN D;E AggaACGTTCC;AggaACGTTCC 34 122 36 0;0;36;0 0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;4;0;0;0;0;0;0;6;2;23 1FYM 1fym_2_1 11599025 2.2 KLUYVEROMYCES LACTIS 2 2 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Heat Shock Factor Protein 2 1 1 2 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B ARPAFVNKLWSMVNDKSNEKFIHWSTSGESIVVPNreRFvQEVLPKYFKHSnfasFVrQLNMYGWHKVQdDSRWEFEN D;E GGTTcTAGAACC;GgttCTAGAACC 34 121 40 0;0;40;0 0;0;0;0;0;0;0;0;2;1;4;0;0;0;0;0;0;8;2;23 1FYM 1fym_2_2 11599025 2.2 KLUYVEROMYCES LACTIS 2 2 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Heat Shock Factor Protein 2 2 1 2 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 F ARPAFVNKLWSMVNDKSNEKFIHWSTSGESIVVPNreRFvQEVLPKYFKHSnfasFVrQLNMYGWHKVQdDSRWEFEN D;E GgttCTAGAACC;GGTTcTAGAACC 34 121 40 0;0;40;0 0;0;0;0;0;0;0;0;2;1;4;0;0;0;0;0;0;8;2;23 1G2D 1g2d_1_1 11587646 2.2 MUS MUSCULUS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating TATA Box Binding Zinc Finger 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 C MerPyACPVESCDrrfsqktnLdthIriHTGQkPfQCRICMrnfsqhtgLnqhIrtHTGEkPfACDICGrKfatlhtRdrhTKiHLrqk A;B gacgctataaaagGAG;tccttttatagcGTCc 19 120 268 117;1;150;0 7;1;5;5;9;0;0;1;6;5;2;0;0;0;0;9;0;17;45;156 1G2D 1g2d_2_1 11587646 2.2 MUS MUSCULUS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating TATA Box Binding Zinc Finger 2 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 F mErPyACPVESCDrrfsqktnLdthIriHTGQkPfQCRICMrnfsqhtgLnqhIrtHTGEkPfACDICGrkfatlhtRdrhTKiHLrq D;E gacgctataaaaGGAG;tccttttatagcGTCC 19 120 276 121;0;154;1 7;1;3;5;11;0;0;1;8;3;3;0;0;0;0;9;0;21;40;164 1G2F 1g2f_1_1 11587646 2 MUS MUSCULUS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating TATA Box Binding Zinc Finger 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 C MerPyACPVESCDrrfsqktnLdthIriHTGQkPfQCRICMrnfsqqasLnahIrtHTGEkPfACDICGrkfatlhtRtrhTKiHLrqk A;B gacgctataaaagGAG;tccttttatagcGTCC 19 119 265 110;0;155;0 6;1;3;3;10;0;0;2;4;6;2;0;0;0;0;7;0;13;47;161 1G2F 1g2f_2_1 11587646 2 MUS MUSCULUS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating TATA Box Binding Zinc Finger 2 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 F erPyACPVESCDrrfSqktnLdthIriHTGQkPfQCRICMrnfsqqasLnahIrtHTGEkPfACDICGrkfatlhtRtrhTKiHLrq D;E gacgctataaaaGGAG;tccttttatagcGTCC 19 119 266 117;0;148;1 5;1;3;3;8;0;0;2;4;6;1;0;0;0;0;10;0;15;46;162 1GA5 1ga5_1_1 11669620 2.4 HOMO SAPIENS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Hormone Nuclear Receptor, Orphan Nuclear Receptor NR1D1 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 1 2 1 2 1 A;B VLLCKVCGdvAsgfhyGVLACegCkgfFrrSIQQNIykRCLKNENCSIVRINrnRCqQCrFKKCLSVGMSrDAvrfgripk;VLLCKVCGdVAsgfhyGVLACegCkgfFrrSIqQNIykRCLKNENCSIVRINrnrCqQCrFKKCLSVGMSrDAvrfgr C;D CAactaggtcactaggtCAG;ctgacCTAgtgaccTAgtg 54 118 408 75;30;303;0 10;0;11;0;3;2;2;2;24;0;12;0;0;0;0;0;1;25;59;257 1GA5 1ga5_2_1 11669620 2.4 HOMO SAPIENS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Hormone Nuclear Receptor, Orphan Nuclear Receptor NR1D1 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 1 2 1 2 1 E;F VLLCKVCGdvAsgfhyGVLACegCkgfFrrSIqQNIykRCLKNENCSIVRINrnRCqQCrFKKCLSVGMSrDAvrfgrip;VLLCKVCGdVAsgfhyGVLACegCkgfFrrSIqQNIyKRCLKNENCSIVRINrnrCqQCrFKKCLSVGMSrDAvrfg G;H CAactaggtcactaggtCAG;ctgacCTAgtgaccTAgtg 54 118 405 74;33;298;0 11;0;12;0;4;2;2;4;22;0;15;0;0;0;0;0;0;19;60;254 1GD2 1gd2_1_1 11017199 2 SCHIZOSACCHAROMYCES POMBE 2 1 1 3 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, PAP1 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 E;F;I;J DqepSSKrkAqnrAaqrafrKrKEDHLKALETQVVTLKELHSSTTLENDQLRQKVRQLEEELRIL;epSSKrkAqnrAaqrafrKrkEDHLKALETQVVTLKELHSSTTLENDQLRQKVRQLEEELRILK;rKAQNRETQVVTLKELHSSTTLENDQLRVRQLEEELRILK;TQVVTLKELHS A;B Aggttacgtaacc;aggttacgtaacC 100;209;266 117 256 121;0;134;1 12;0;11;0;4;0;2;0;11;0;1;0;0;0;0;2;4;23;49;137 1GD2 1gd2_2_1 11017199 2 SCHIZOSACCHAROMYCES POMBE 2 1 1 3 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, PAP1 2 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 G;H;I;J qepSSKrkAqnrAaqrafrKrkEDHLKALETQVVTLKELHSSTTLENDQLRQKVRQLEEELRIL;qepSSKrkAqnrAaqrafrKrkEDHLKALETQVVTLKELHSSTTLENDQLRQKVRQLEEELRIL;RKaQNRETQVVTLKELHSSTTLENDQLRVRQLEEELRILK;TQVVTLKELHS C;D aggttacgtaacC;AggttacgtaacC 100;209;267 117 258 120;0;137;1 12;0;10;0;4;0;2;0;10;0;1;0;0;0;0;2;4;19;48;146 1GTW 1gtw_1_1 0 1.85 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, C|EbpBeta 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B DkHSDeyKirrErnnIavrksrdkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQ;DkHSDeyKIrrernnIavrksrDkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQLP C;D AatgtggcgcaaTCCT;TaggattgcgccaCAT 23 24 243 98;0;145;0 8;0;9;0;3;0;0;0;9;4;0;0;0;0;0;5;4;32;33;136 1GU4 1gu4_1_1 0 1.8 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, C|EbpBeta 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B DkHSDeyKirrErnnIavrksrdkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQ;DkHSDeyKIrrernnIavrksrDkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQLP C;D TAggattgcgcaaTAT;aatattgcgcaaTCCT 23 24 253 108;0;145;0 8;0;8;0;3;0;0;0;9;4;0;0;0;0;0;4;5;32;36;144 1GU5 1gu5_1_1 0 2.1 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, C|EbpBeta 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B DkHSDeyKirrErnnIavrksrdkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQ;DkHSDeyKIrrernnIavrksrDkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQLP C;D TTgtgttggccaaTCA;atgattggccaaCACA 23 24 232 97;0;135;0 7;0;8;0;4;0;0;0;8;3;0;0;0;0;0;6;6;29;38;123 1GXP 1gxp_1_1 12015152 2.5 ESCHERICHIA COLI 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Alpha Helix PhoB 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B AVEEVIEMQGLSLDPTSHRVMAGEEPLemgpteFKLLHFFMTHPERVYSrEQLLNHVwGTNVyveDrtVdvhIrrLrKALePGGHDRMVQtvrgTgyRFSTRF;EEVIEMQGLSLDPTSHRVMAGEEPLemgpteFKLLHFFMTHPERVYsrEQLLNHVwGTNVyvedrtVdvhIrrLrKALePGGHDRMVQtvrgtgyRFSTRF C;D GAGctgtcaTAAagttgtcaCGG;cccgtgaCAACtttatgaCAGCT 91 603 319 92;13;209;5 8;0;10;0;0;0;2;0;12;11;13;0;0;0;0;2;1;29;48;183 1GXP 1gxp_2_1 12015152 2.5 ESCHERICHIA COLI 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Alpha Helix PhoB 2 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 E;F VEEVIEMQGLSLDPTSHRVMAGEEPLemgpteFKLLHFFMTHPERVYSrEQLLNHVwGTNVyveDrtVdvhirrLrKALEPGGHDRMVQtvrgTgyRFSTRF;VEEVIEMQGLSLDPTSHRVMAGEEPLEmgpteFKLLHFFMTHPERVYsrEQLLNHVwGTNVyvedrtVdvhIrrLrKALePGGHDRMVQtvrgtgyRFSTRF G;H GAGctgtcATAAagttgtcACGG;cccgtgaCAACtttatgaCAGCT 91 602 315 85;11;216;3 8;0;9;0;0;0;1;0;14;11;15;0;0;0;0;3;3;24;51;176 1H6F 1h6f_1_1 12005433 1.7 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet T Box, TBX3 1 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B DPKVHLEAKELWDQFHKRGTEMvitksgrrmfPPFKVRCSGLDKKAKYILLMDIIAADDCrYkfhNSRWMVAGKADPEMPKRMYIHPDSPATGEQWMSKVVTFhKLkLTnNISDKHGFTILNsmHKYQPRFHIVRANDILKLPYSTFRTYLFPETEFIAVtayqNdKItQLkiDNnpfakgfRD;KDDPKVHLEAKELWDQFHKRGTEMvitksgrrmfPPFKVRCSGLDKKAKYILLMDIIAADDCRYkfHNSRWMVAGKADPEMPKRMYIHPDSPATGEQWMSKVVTFHKLkLTnNISDKHGFTILNsmHKYQPRFHIVRANDILKLPYSTFRTYLFPETEFIAVtayqNdKItqLkiDNnpfakgfRD C;D TAatttcACacctaggtgtGAAAT;TAatttcACacctaggtgtgAAAT 161 601 376 41;26;309;0 2;0;2;0;0;0;2;0;19;8;8;0;0;0;0;4;4;15;86;226 1H89 1h89_1_1 11792321 2.45 MUS MUSCULUS, HOMO SAPIENS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, C|EbpBeta 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B eyKIrrErnnIavrksrDkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQLPE;eyKIrrErnnIavrksrDkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQLPE D;E GatgtggcgcaaTCCTTAACGGACTG;CCAGTCCGTTAAggattgcgccacAT 23 600 233 100;0;133;0 6;0;12;0;4;0;0;0;7;3;0;0;0;0;0;6;4;31;24;136 1H89 1h89_1_2 11792321 2.45 MUS MUSCULUS, HOMO SAPIENS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, C|EbpBeta 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 C qCqhrWqkvLNPELIkgpwTKEEDQRVIKLVQKYGpkrwsvIAKHLKGrIGkqCrerWhnhLNPEVKkTSwTEEEDRIIYQAHKRLGnrwaEIAkLLPGRTdnAIknhWnstMRr D;E GATGTGGCGCAATCCttaacggaCTG;ccagtccgttAAGGATTGCGCCACAT 173 599 194 61;0;132;1 7;0;3;0;5;0;0;0;7;10;10;0;0;0;0;5;1;16;19;111 1H8A 1h8a_1_1 11792321 2.23 AVIAN MYELOBLASTOSIS VIRUS, HOMO SAPIENS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, C|EbpBeta 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B VDkHSDEyKIrrernnIavrksrDkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQL;DkHSDeyKIrrernnIavrksrDkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQL D;E GatgtggcgcaaTCCTTAACGGACTG;CCAGTCCGTTAAggattgcgccaCAT 23 598 217 88;0;129;0 6;0;10;0;2;0;0;0;8;3;0;0;0;0;0;5;4;32;29;118 1H8A 1h8a_1_2 11792321 2.23 AVIAN MYELOBLASTOSIS VIRUS, HOMO SAPIENS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, C|EbpBeta 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 C NPELnkgpwTKEEDQRVIEHVQKYGpkrwsDIAKHLKGrIGkqCrerWhnhLNPEVKKTSwTEEEDRIIYQAHKRLGnrwaeIAkLLPGRtdnaVknhWnstMRr D;E GATGTGGCGCAATCcttaacggaCTG;CCagtccgttAAGGATTGCGCCACAT 173 597 198 62;0;136;0 6;0;4;0;5;0;0;0;7;9;10;0;0;0;0;4;1;14;25;113 1HCQ 1hcq_1_1 8221895 2.4 HOMO SAPIENS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Hormone Nuclear Receptor, Estrogen Receptor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B MKETRYCAVCNdYAsgyhyGVwSCegCkafFkrSiqGHNDyMCPATNQCTIDKNRrkSCqACrLRKCYEVGMMk;TRYCAVCNdYAsgyhyGVwSCegCkafFkrSiqGHnDyMCPATNQCTIDkNRrkSCqACrLRKCYEVGMMk C;D CcaggtCACAgtgacCTG;CcaggtCACTgtgacCTG 97 596 243 66;0;177;0 10;0;9;0;2;0;1;0;13;0;8;0;0;0;0;2;0;21;25;152 1HCQ 1hcq_2_1 8221895 2.4 HOMO SAPIENS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Hormone Nuclear Receptor, Estrogen Receptor 2 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 E;F MKETRYCAVCNdYAsgyhyGVWScegCkafFkrSiQGHNDyMCPATNQCTIDkNRRKsCqACrLRKCYEVGMMk;KETRYCAVCNdYAsgyhyGVWSCegCkafFkrSiQGDyMCPATNQCTIDkNRRKsCqACrLRKCYEVGMMk G;H CcaggtCACAgtgacCTG;CcaggtCACTgtgacCTG 97 595 205 63;0;142;0 10;0;7;0;2;0;1;0;8;3;9;0;0;0;0;1;0;17;20;127 1HWT 1hwt_1_1 9886294 2.5 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Heme Activator Protein 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 C;D rIplsCTICrkrkvkcDkLRPHCQQCTktGVAHLCHYMEQTWAEEAEKELLKDNELKKLRERVKSLEKTL;rkrnriplsCTICrkrkvkcDkLRPHCQQCTKTGVAHLCHYMEqtwAEEAEKELLKDNELKKLRERVKSLEKTL A;B gcgcTATtatcgcTATTagC;GCTAAtagcgataatagcgC 57 116 261 58;20;183;0 7;0;9;0;0;0;6;0;10;4;13;0;0;0;0;0;5;12;44;151 1HWT 1hwt_2_1 9886294 2.5 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Heme Activator Protein 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 G;H rIplsCTICrKrkvkcDkLRPHCQQCTktGVAHLCHYmEQTwAEEAEKELLKDNELKKLRERVKSLEKTL;krnriplsCTICrkrkvkcDkLRPHCQQCTKTGVAHLCHYMEqtwAEEAEKELLKDNELKKLRERVKSLEKTL E;F gcgcTATtatcgcTATTagC;GCTAAtagcgataatagcgC 57 116 269 56;17;196;0 5;0;8;0;0;0;6;0;10;4;13;0;0;0;0;0;4;13;43;163 1IG7 1ig7_1_1 11580277 2.2 MUS MUSCULUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Msx-1 1 1 1 0 2.1, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A rkprtPfTTAQlLALeRKFRQKQylSiAErAEFSSSLSLTEtqVkiwFqnRrakAkrL B;C CActaattGAAGG;TCCttcaattagtGAC 256 588 172 29;13;130;0 6;0;7;0;2;0;0;0;11;2;5;0;0;0;0;2;0;11;23;103 1J59 1j59_1_1 8757802 2.5 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Catabolite Gene Activator Protein 1 1 1 0 1, 1 0 2 0 0 0 2 1 2 1 A;B PTLEWFLSHCHIHKYPSkSTLIHQGEKAETLYYIVKGSVAVLIKDEEGkEMILSYLNQGDFIGELGLFEEGQERSAWVRAKTACEVAEISYKKFRQLIQVNPDILMRLSAQMARRLQVTSEKVGNLAFLdvtGrIAQTLLNLAKQPDAMTHPDGMQIkItrqEIGQIVgcsretVgriLkMLEDQNLISAhgKTIVVYG;PTLEWFLSHCHIHKYPsKSTLIHQGEKAETLYYIVKGSVAVLIKDEEGkEMILSYLNQGDFIGELGLFEEGQERSAWVRAKTACEVAEISYKKFRQLIQVNPDILMRLSAQMARRLQVTSEKVGNLAFLdvtGrIAQTLLNLAKQPDAMTHPDGMQIkItrqeIGQIVGcsretVgriLkMLEDQNLISAhgKTIVV C;D;E;F GCGAAAagtgtgaC;ATatgtcacACTtttcG;GCGAAAAgtgtgaC;ATatgtcaCACTtttcG 62 583 274 70;0;204;0 6;0;12;0;4;0;0;0;7;15;11;0;0;0;0;6;0;18;31;164 1JE8 1je8_1_1 12352954 2.12 ESCHERICHIA COLI 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Response Regulator Protein NARL 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B RDVNQLtprERDILKLIAQGLpnkIARRLDitestVkvhvkhlkKKlksrvEAAVWVHQERIF;RDVNQLtprERDILKLIAQGLpnkIARRLDitestVkvhvkhlkKKlksrvEAAVWVHQERIF C;D cgtaccCATTaatgggtACG;cgtaccCATTaatgggtACG 32 6 311 84;0;227;0 7;0;6;0;0;0;2;0;6;17;11;0;0;0;0;0;4;17;49;192 1JE8 1je8_2_1 12352954 2.12 ESCHERICHIA COLI 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Response Regulator Protein NARL 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 E;F ERDVNQLtprERDILKLIAQGLpnkIARRLDitestVkvhvkhlkKKlksrvEAAVWVHQERIF;RDVNQLtprERDILKLIAQGLpnkIARRLDitestVkvhvkhlkKKlksrvEAAVWVHQERIF G;H cgtacCCATTaatgggtACG;cgtaccCATTaatgggtACG 32 6 309 84;0;225;0 8;0;6;0;0;0;2;0;6;17;11;0;0;0;0;0;4;15;51;189 1JFT 1jft_1_1 11781089 2.5 ESCHERICHIA COLI 1 1 1 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Purine Repressor 1 1 1 2 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;D atikDVAKRAnvstttVshVinKtrfvaEEtRNAVWAAIKELHyspsAVarSlkvnHTKSIGLLATSSEAAYFAEIIEAVEKNCFQKGYTLILGNAWNNLEKQRAYLSMMAQKrVDGLLVMCSEYPEPLLAMLEEYRHIPMVVMDAGEAKADFTDAVIDNAFEGGYMAGRYLIERGHREIGVIPGPLERNTGAGRLAGFMKAMEEAMIKVPESWIVQGDFEPESGYRAMQQILSQPHRPTAVFCGGDIMAMGALCAADEMGLRVPQDVSLIGYDNVRNARYFTPALTTIHQPKDSLGETAFNMLLDRIVNKREEPQSIEVHPRLIERRSVADGPFRDYRR;atikDVAKRAnvstttVshVinKtrfvaEEtRNAVWAAIKELHyspsAVarSlkvnHTKSIGLLATSSEAAYFAEIIEAVEKNCFQKGYTLILGNAWNNLEKQRAYLSMMAQKrVDGLLVMCSEYPEPLLAMLEEYRHIPMVVMDAGEAKADFTDAVIDNAFEGGYMAGRYLIERGHREIGVIPGPLERNTGAGRLAGFMKAMEEAMIKVPESWIVQGDFEPESGYRAMQQILSQPHRPTAVFCGGDIMAMGALCAADEMGLRVPQDVSLIGYDNVRNARYFTPALTTIHQPKDSLGETAFNMLLDRIVNKREEPQSIEVHPRLIERRSVADGPFRDYRR B;E TacgcaAacgtttgCGT;TacgcaAacgtttgCGT 68 98 388 88;50;246;4 4;2;4;4;6;0;2;2;6;20;10;0;0;0;0;10;6;8;60;244 1JGG 1jgg_1_1 8557047 2 DROSOPHILA MELANOGASTER 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Even Skipped 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A ryrtafTRDQlGRLEKEFYKENYVSRPRRCELAAQLNLPEStIkvwFqnRRmkDkrQ C;D TAATtgaatt;aattcaatTA 202 581 146 30;15;101;0 9;0;7;0;2;0;0;0;7;3;4;0;0;0;0;0;0;2;24;88 1JGG 1jgg_1_2 8557047 2 DROSOPHILA MELANOGASTER 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Even Skipped 1 2 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B ryrtAfTRDQlGRLEKEFYKENyVSRPRrCELAAQLNLPEStIkvwFqnRrmkDkrQ C;D taatTGAATT;AATtcaatta 202 580 140 33;12;95;0 5;0;4;0;4;0;0;0;6;3;4;0;0;0;1;0;0;6;19;88 1JJ4 1jj4_1_1 10906136 2.4 HUMAN PAPILLOMAVIRUS TYPE 18 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Alpha|Beta Regulatory Protein E2 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B MTPIIHLKGdrnsLkcLryrLrKHSDHYRDISstWhWtKTGILTVTYHSETQRTKFLNTVaIpdsVQILVGYMT;HMTPIIHLKGdrnsLkcLryrLrkHSDHYRDISstWhWtEKTGILTVTYHSETQRTKFLNTVAIpDsVQILVGYMT C;D caacCGAAttcggtTG;caacCGAAttcggtTG 190 579 212 74;0;138;0 7;0;4;0;2;0;1;0;4;9;2;0;1;2;0;2;0;22;45;111 1JK1 1jk1_1_1 11800559 1.9 MUS MUSCULUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zif268 Zinc Finger 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A rPYACPVESCDrrfsrsaeLtrhIriHTGQkPfQCRICMrnfsrsdhLtthIrtHTGEkPfACDICGrkfarsdeRkrhTkIHLR B;C agcgtgggcgg;tccgcccacgC 19 112 237 91;6;139;1 10;0;12;0;7;0;0;0;4;11;3;0;0;0;0;6;1;21;29;133 1JK2 1jk2_1_1 11800559 1.65 MUS MUSCULUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zif268 Zinc Finger 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A rPYACPVESCDrrfsrSaeLtrhIriHTGQkPfQCRICMrnfsrsdhLtthIrtHTGEkPfACDICGrkfarsderkrhTKiHLR B;C agcgtgggctG;tcagcccacgC 19 112 231 79;5;146;1 9;0;10;0;7;0;0;0;4;10;3;0;0;0;0;5;1;23;25;134 1JNM 1jnm_1_1 0 2.2 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, c-jun 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B kAERkrMrnrIaasksrKrklERIARLEEKVKTLKAQNSELASTANMLREQVAQLK;kAERkrMrnrIaasksrKrklErIARLEEKVKTLKAQNSELASTANMLREQVAQLKQ C;D CGtcgatgacgtcatCGACG;CGtcgatgacgtcatCGACG 104 576 221 85;0;136;0 5;0;7;0;4;0;0;0;5;6;6;0;0;0;0;6;5;24;33;120 1K61 1k61_1_1 12466549 2.1 1 4 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodamain, Mat Alpha 2 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 1 1 0 0 1 A rghrfTKENvRILESWFAKNIENPylDTKGLENLMKNTSLSriqIknwVsnRrrkEkTIt E;F ACATGTAATTCatttacaCGC;gcgtgtAaatgAATTACATG 101 573 165 40;14;111;0 3;1;7;1;4;0;0;0;6;1;4;0;0;0;0;2;1;7;22;106 1K61 1k61_1_2 12466549 2.1 1 4 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodamain, Mat Alpha 2 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 1 1 0 0 1 B RGhrfTKENvRILeSWFAKNIENPylDTKGLENLMKNTSLSRiqIknwVsnRrrkEktI E;F acatgtAattcATTTACACGC;GCGTGTAAATGAattacaTG 101 572 167 42;11;114;0 3;1;9;1;3;0;0;0;8;1;3;0;0;0;0;2;1;8;30;97 1K61 1k61_1_3 12466549 2.1 1 4 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodamain, Mat Alpha 2 1 3 1 0 1, 1 0 0 0 0 1 1 0 0 1 C hrfTKENvRILeSWFAKNIENPYLDTKGLENLMKNTSLSRiqIKnwVsnRRrkEKT E;F ACATGTAATTCATTTAcacgc;gcGTgtaAATGAATTACATG 101 571 84 18;2;64;0 1;0;3;0;2;0;0;0;3;0;2;0;0;0;0;2;0;4;13;54 1K61 1k61_1_4 12466549 2.1 1 4 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodamain, Mat Alpha 2 1 4 1 0 1, 1 0 0 0 0 1 1 0 0 1 D rghrfTKENvRILESWFAKNIENPylDtKGLENLMKNTSLsriqIknwVsnRrrkEKT E;F ACATgtaattCATTTACACGC;GCGTGTAAAtgaatTacatG 101 570 169 22;10;137;0 4;2;1;1;2;0;1;0;14;3;7;0;0;0;0;1;0;7;24;102 1K78 1k78_1_1 11779502 2.25 MUS MUSCULUS, HOMO SAPIENS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Paired Protein Pax 1 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 3 2 0 1 A;B;I GvnqLGGVfvngrplPDVVrQRIVELAHQGVrpcDISrQLRvshgcVskilGrYyETGSIKpgviggskpkvaTPKVVEKIAEYkRQNPTmfawEIRDRLLAERVCDNdTvpsvssInriIrtK;IqlWQFLLELLTDKSCQSFISWTGDGWEFKLSDPDEVARRwGKRknkPkmNyeklSrgLryyydKNIIHkTAGkrYVYRFVCDLQSLLGYTPEELHAMLDVK;ggskpkvaTPKVVEKIAEYKRQNPTmfawEIrDRLLAERVCDNdTvPsvssInrIirT C;D TTGTgccggagatgggctccagtggcC;aaggccactggagcccatctccGGCAC 90;118;257 569 689 132;48;508;1 7;3;5;4;7;5;7;2;13;15;28;6;0;0;0;3;1;33;106;444 1K78 1k78_2_1 11779502 2.25 MUS MUSCULUS, HOMO SAPIENS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Paired Protein Pax 2 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 2 2 0 1 E;F GvnqLGGVfvngrplPDVVrQRIVELAHQGVrpcDISrQLRvshgcVskiLGrYYETGSIKpgviggskpkvaTPKVVEKIAEYkRQNPTmfawEIRDRLLAERVCDNdTvpsvssInrIirtK;piqlWQFLLELLTDKSCQSFISWTGDGWEFKLSDPDEVARRwGKRknkpkmNyeklSrgLryyydKNIIHkTAGKryVYRFVCDLQSLLGYTPEELHAMLDVK G;H TTGTgccggagatgggctccagtggcC;aaggccACtggagcccatctccGGCAC 90;118 568 531 101;34;395;1 7;3;6;2;6;2;3;2;15;7;23;6;0;0;0;2;1;18;89;339 1K79 1k79_1_1 11779502 2.4 MUS MUSCULUS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Paired Protein Pax 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A gpIqlWQFLLELLTDKSCQSFISWTGDGWEFKLSDPdEVARRwGKRknkpkmNyeklSrgLryyydkNIIHkTAgkryVyRFVCDLQSLLGYTPEELHAMLDVK B;C TAGTgccggaaAtgt;CACatttccGGCACT 90 567 188 48;1;138;1 1;0;2;0;2;0;1;0;5;0;4;0;0;0;0;2;2;16;41;112 1K79 1k79_2_1 11779502 2.4 MUS MUSCULUS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Paired Protein Pax 2 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 D gpIqlwQFLLELLTDKSCQSFISWTGDGWEFKLSDPdEVARRwgKRknkPkmNyeklsrgLryyydkNIIHkTAgKryVyRFVCDLQSLLGYTPEELHAMLDVK E;F TAGtgccggaaATgt;CACatttccGGCACt 90 566 201 52;0;148;1 1;0;1;0;1;0;1;0;4;0;5;0;0;0;0;1;2;16;42;127 1KU7 1ku7_1_1 11931761 2.4 THERMUS AQUATICUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Sigma A Factor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 2 0 1 A;D SEELEKALSKLSErEAMVLKMrKGLIDGREHtleeVGAYFgvtrerIrqienkALRKLKYHESRTRKLRDFLE;KALSKLSEREAMVLKMRKGLIDGREHTLEEVGAYFGVTRERIRQIENKALRKLKYHESRTRKLRDFLE B;C ccttgaCAAAG;CCTTtgtcaAG 192 565 130 59;0;71;0 2;0;3;0;3;0;0;0;3;2;3;0;0;0;0;8;1;11;28;66 1L3L 1l3l_1_1 12087407 1.66 AGROBACTERIUM TUMEFACIENS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix TraR Activator 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;C QHWLDKLTDLAAIEGDECILKTGLADIADHFGFTGYAYLHIQHRHITAVTNYHRQWQSTYFDKKFEALDPVVKRARSRKHIFTWSGEHERPTLSKDERAFYDHASDFGIRSGITIPIKTANGFSFTASDKPVIDLDREIDAVAAAATIGQIHARISFLRTTPTAEDAAwLDPkEATYLRWiAVGKteeIADVEGVkynsVrvkLreAKRFDvrskAHLTALAIRRKLI;QHWLDKLTDLAAIEGDECILKTGLADIADHFGFTGYAYLHIQHRHITAVTNYHRQWQSTYFDKKFEALDPVVKRARSRKHIFTWSGEHERPTLSKDERAFYDHASDFGIRSGITIPIKTANGFSFTASDKPVIDLDREIDAVAAAATIGQIHARISFLAWLDPKEATYLRWiAVGKteEIADVEGVkynsVrvkLreAKRFDvrskAHLTALAIRRKLI F;H GAtgtgcAGAtctgcaCATC;GatgtgcAGAtctgcaCATC 77 108 203 73;0;130;0 5;0;15;0;0;0;0;0;6;6;4;0;0;0;0;2;0;17;25;123 1L3L 1l3l_2_1 12087407 1.66 AGROBACTERIUM TUMEFACIENS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix TraR Activator 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 B;D QHWLDKLTDLAAIEGDECILKTGLADIADHFGFTGYAYLHIQHRHITAVTNYHRQWQSTYFDKKFEALDPVVKRARSRKHIFTWSGEHERPTLSKDERAFYDHASDFGIRSGITIPIKTANGFSFTASDKPVIDLDREIDAVAAAATIGQIHARISFLRTTPTAEDAAwLDPkEATYLRWiAVGKteeIADVEGVkynsVrvkLreAKRFDvrskAHLTALAIRRKLI;QHWLDKLTDLAAIEGDECILKTGLADIADHFGFTGYAYLHIQHRHITAVTNYHRQWQSTYFDKKFEALDPVVKRARSRKHIFTWSGEHERPTLSKDERAFYDHASDFGIRSGITIPIKTANGFSFTASDKPVIDLDREIDAVAAAATIGQIHARISFLAWLDPKEATYLRWiAVGKteeIADVEGVkynsVrvkLreAKRFDvrskAHLTALAIRRKLI E;G GAtgtgcAGAtctgcaCATC;GatgtgcAGAtctgcaCATC 77 108 202 74;0;128;0 5;0;15;0;0;0;0;0;4;6;4;0;0;0;0;2;0;18;27;121 1LAT 1lat_1_1 7664096 1.9 RATTUS NORVEGICUS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Hormone Nuclear Receptor, Glucocorticoid Receptor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A RPCLVCSdEAsgchyGVLTCegCkafFkrAVeGQhnyLCKYEGKCIIDkIRrknCpACrYRKCLQAGMNlE C;D TTCcagaACATgttCTGGA;TTCCAGAACatgttcTGGA 56 555 133 33;0;100;0 4;0;3;0;1;0;0;0;3;0;4;0;0;0;0;1;1;11;20;85 1LAT 1lat_1_2 7664096 1.9 RATTUS NORVEGICUS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Hormone Nuclear Receptor, Glucocorticoid Receptor 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B ARPCLVCSdEAsgchyGVLTCegCkafFkrAVEGqhNyLCkYEGKCIIDkIRrknCpACrYRKCLQAGMNlEar C;D TTCCAGAACatgttcTGgA;TTccagaACATgttcTGGA 56 554 146 35;3;108;0 4;0;6;0;3;0;0;0;9;0;3;0;0;0;0;1;1;9;17;93 1LE8 1le8_1_1 12121651 2.3 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodamain, Mat Alpha 2 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 2 2 1 A;B KSsiSPQArAFLEQVFRRKQslNsKEkEEVAKKCGITPlqVrvwFinKrmrSk;rghrfTKENvRILeSWFAKNIENPylDTKGLENLMKNTSLSriqIknwVaaRrakEktiTIAPELADLLSGEPL C;D acatgTAaaaatttacatCA;TtgatGtAAATTtttacaTG 121;123 553 271 61;14;196;0 5;0;7;0;2;0;1;0;11;3;4;0;0;0;0;1;1;18;41;177 1LLI 1lli_1_1 8278404 2.1 BACTERIOPHAGE LAMBDA 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Lambda Repressor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B kkPlTQEQLEDARRLkAIyeKKkNELGLsqeSLADKLgmgqsgIgAlFnGinaLnAYnAALLAKILKVSVEEFSPSIAREIYEMYEAVS;stkkkPLTQEqLEDARRLkAIyeKKkNELGLsqeSLADKLgmgqsgIgalfnGinalnAYnAALLAKILKVSVEEFSPSIAREIYEMYEAVS D;E AataccACTggcggtgaTAT;TatatcaccgccagtggTAT 53 552 313 114;0;197;2 10;2;3;3;4;2;5;2;22;5;13;0;0;0;0;4;4;11;43;180 1LLM 1llm_1_1 14621985 1.5 MUS MUSCULUS AND SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zif268 Zinc Finger 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 C;D MkPFQCRICMrnfsrSdhLTthIrtHTGEkPfACDICGrkfarsderkrhRDiqHILPILEDKVEELLSKNYHLENEVARLKKLVGE;mkPFQCRICMrnfsrsdhLtthIrtHTGEkPfACDICGrkfarsderkrhRDiqHILPILEDKVEELLSKNYHLENEVARLKKLV A;B Tcccacgcgtggg;tcccacgcgtggg 180 551 345 111;13;221;0 8;0;15;3;10;0;0;1;11;12;3;0;0;0;0;9;2;24;37;210 1LMB 1lmb_1_1 1387915 1.8 BACTERIOPHAGE LAMBDA 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Lambda Repressor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 3;4 PlTQEQLEDARRLkAIyeKKkNELGLsqeSVADKMgmgqsgVgalFnGinaLnAYnAALLAKILKVSVEEFSPSIAREIYEMYEAVS;StkkkPLTQEQLEDARRLkAIyeKKkNELGLsqeSVADKMgmgqsgVgalfnGinalnAYnAALLAKILKVSVEEFSPSIAREIYEMYEAVS 1;2 AataccACTggcggtgaTAT;TatatcaccgCCagtggTAT 53 550 275 103;0;172;0 8;2;5;3;3;0;3;0;20;2;9;0;0;0;0;5;2;12;35;166 1LQ1 1lq1_1_1 12176382 2.3 BACILLUS SUBTILIS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Initiation Factor Spo0A 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B KKNLDASITSIIHEIGVpAhikgYLyLREAISMVYNDIELlgsitkVLyPDIAKKFNttAsrVeraIrhAIEvAWSrGNIDSISSLFAkptnsEFIAMVADKLRLEH;NLDASITSIIHEIGVpAhikgYLYLREAISMVYNDIELLGSITKVLYPDIAKKFNTTASrVEraIRhAIEvAWSrGNIDSISSLFAKPTNSEFIAMVADKLRL G;H TTcgtgtcGAATtttg;acAAAattcgaCACGA 88 549 248 62;0;186;0 1;0;6;0;3;0;0;0;0;8;11;0;0;0;0;5;1;12;51;150 1LQ1 1lq1_2_1 12176382 2.3 BACILLUS SUBTILIS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Initiation Factor Spo0A 2 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 C;D KNLDASITSIIHEIGVpAhikgYLyLREAISMVYNDIELLGSITKVLYPDIAKKFNTTASrVEraIRhAIEvAWSrGNIDSISSLFGYTKAKPTNSEFIAMVADKLRLEHKA;KNLDASITSIIHEIGVpAhikgYLyLREAISMVYNDIELlgsitkVLyPDIAKKFNttAsrVeraIrhAIEvAWSrGNIDSISSLFKAkptnsEFIAMVADKLRLEH E;F TTcgtgtcGAATtttg;ACAAAattcgaCACGA 88 548 240 70;0;170;0 2;0;6;0;2;0;1;0;2;8;11;0;0;0;0;6;1;14;50;137 1MEY 1mey_1_1 8901872 2.2 2 1 1 3 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zinc Finger, Synthetic 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 1 2 2 0 1 C;G EkPyKCPECGksfsqssnLqkhQrtHTGEkPyKCPECGksfsqssdLqkhQrtHTGEkPyKCPECGksfsrsdhLsrhQrtHQ;TGEKPYKCPECGKSFSrSDhLSRHQRTH A;B atgaggcagaacT;tagttctgcCtA 184;262 538 232 103;0;129;0 12;2;9;1;11;0;0;0;4;17;1;0;0;0;0;6;2;15;20;132 1MEY 1mey_2_1 8901872 2.2 2 1 1 3 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zinc Finger, Synthetic 2 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 1 1 0 0 1 F MekPyKCPECGkSfsqssnLqkhQrtHTGEkPyKCPECGksfsqssdLqkhQRtHTGEkPyKCPECGksfsrsdhLsrhQrtHQ D;E atgaggcagaaCT;tagttctgcCtA 184 537 244 105;0;139;0 12;4;8;2;11;0;0;0;4;15;2;0;0;0;0;7;2;12;28;137 1MJ2 1mj2_1_1 10986458 2.4 ESCHERICHIA COLI 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Ribbon|Helix|Helix Methionine Repressor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B AEWSGEYISPYAEhgKksEQvKkitVsIPLKVlKILTDErTRRkVNNlrhatnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY;AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVLKILTDErTRRkVNNLRHAtnsELLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY F;G ttagacgTCTAGacgTCTA;TTAGACGTctagacGTCTA 17 536 183 33;1;149;0 4;2;2;0;3;0;0;0;7;9;17;0;0;0;0;1;2;14;15;107 1MJ2 1mj2_1_2 10986458 2.4 ESCHERICHIA COLI 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Ribbon|Helix|Helix Methionine Repressor 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 C;D AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVlKILTDErTRRkVNnlrhatnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKeRSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY;AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVLKILTDErTRRKVNNLRHAtnsELLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY F;G TTAGACGTCtagacgTCTA;ttagacgtCTAGacgTCTA 17 535 193 33;1;159;0 4;2;2;0;4;0;0;0;3;9;17;0;0;0;0;0;2;14;23;113 1MJM 1mjm_1_1 10986458 2.2 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Ribbon|Helix|Helix Methionine Repressor 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B AEWSGEYISPYaeHGKKSeQvkkitVsIPLKVLKILTDErTRRKVNNLRHAtnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY;AEWSGEYISPYaeHgKKsEQvKkitVsIPLKVLKILTDErTRRKVNNLRHAtnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY C;D gagacGtCTC;gagacgTCTC 17 534 127 32;0;95;0 4;2;2;0;4;0;0;0;5;7;7;0;0;0;0;1;2;8;10;75 1MJO 1mjo_1_1 10986458 2.1 ESCHERICHIA COLI 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Ribbon|Helix|Helix Methionine Repressor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVLKILTDErTRRkVNNlrhatnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY;AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVLKILTDErTRRkVNNLRHAtnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY F;G ttagacgtCATGacgTCTA;TTAGACGTcatgacgTCTA 17 107 195 33;1;161;0 3;2;1;0;4;0;0;0;5;8;18;0;0;0;0;1;2;16;21;114 1MJO 1mjo_1_2 10986458 2.1 ESCHERICHIA COLI 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Ribbon|Helix|Helix Methionine Repressor 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 C;D AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVLKILTDErTRRkVNnlrhatnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY;AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVLKILTDErTRRKVNNLRHAtnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY F;G TTAGACGTcatgacgTCTA;ttagacgTCATGacgTCTA 17 107 194 39;0;155;0 3;2;2;0;4;0;0;0;5;8;18;0;0;0;0;1;2;13;23;113 1MJQ 1mjq_1_1 10986458 2.4 ESCHERICHIA COLI 2 2 1 2 0 0 1 Transcription factor Ribbon|Helix|Helix Methionine Repressor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVlKILTDErTRRkVNnlrhatnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY;AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVLKILTDErTRRKVNNLRHAtnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY E;F ttagataTCTAGataTCTA;TTAGATATctagataTCTA 17 106 193 44;0;149;0 4;2;2;3;2;0;0;0;6;9;18;0;0;0;0;2;2;13;23;107 1MJQ 1mjq_1_2 10986458 2.4 ESCHERICHIA COLI 2 2 1 2 0 0 1 Transcription factor Ribbon|Helix|Helix Methionine Repressor 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 C;D AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVlKILTDErTRRkVNnlrhatnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKeRSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY;AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVLKILTDErTRRkVNNLRHAtnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY E;F TTAGATATctagataTCTA;ttagatATCTAGataTCTA 17 106 198 46;1;151;0 4;3;2;3;2;0;0;0;4;8;18;0;0;0;0;2;2;16;26;108 1MJQ 1mjq_2_1 10986458 2.4 ESCHERICHIA COLI 2 2 1 2 0 0 1 Transcription factor Ribbon|Helix|Helix Methionine Repressor 2 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 G;H AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVlKILtDErTRRkVNnlrhatnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY;AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVLKILTDErTRRKVNNLRHAtnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY K;L ttagatatCTAGataTCTA;TTAGATATctagataTCTA 17 105 186 46;0;140;0 4;2;2;3;2;0;1;0;7;9;18;0;0;0;0;2;2;14;25;95 1MJQ 1mjq_2_2 10986458 2.4 ESCHERICHIA COLI 2 2 1 2 0 0 1 Transcription factor Ribbon|Helix|Helix Methionine Repressor 2 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 I;J AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVlKILTDErTRRkVNnlrhatnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKeRSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY;AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVlKILTDErTRRkVNNLRHAtnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY K;L TTAGATATctagataTCTA;ttagataTCTAGataTCTA 17 105 206 47;1;158;0 4;3;2;3;2;0;0;0;8;7;18;0;0;0;0;2;2;16;22;117 1MNM 1mnm_1_1 9490409 2.25 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 3 0 1 0 0 1 Transcription factor Alpha|Beta Transcriptional Regulator, MCM1 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B QkerrkiEiKFIENktrRhvtFskrKHgIMkkAFeLSVlTGTQVLLLVVSETGLVYTFSTPKFEPIVTQQEGRNLIQACLNAPDD;rrkiEIKFIENkTrRhvtfskrkhgIMkkAFeLSVlTGTQVLLLVVSEtGlVyTFSTPKFEPIVTQQEGRNLIQACLNAPD E;F gattacctaatagggaaATTTACACG;CCGTGTAaatttCCCTattaggtAAT 182 533 304 51;11;241;1 4;0;7;0;0;0;0;0;9;9;6;0;0;0;0;1;3;22;51;192 1MNM 1mnm_1_2 9490409 2.25 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 3 0 1 0 0 1 Transcription factor Alpha|Beta Transcriptional Regulator, MCM1 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 C GLVFNVVTQDMINKSTKpyrghrfTKENvRILeSWFAKNIENPylDTKGLENLMKNTSLSRiqIknwVsnRrrkEkT E;F GATTACCTAATAGGGAAAtttacaCG;ccgtgtaaattTCCCTATTAGGTAAT 188 532 213 39;25;149;0 4;1;8;1;2;1;0;1;10;1;5;0;0;0;0;3;1;7;32;136 1MNM 1mnm_1_3 9490409 2.25 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 3 0 1 0 0 1 Transcription factor Alpha|Beta Transcriptional Regulator, MCM1 1 3 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 D GLVFNVVTQDMINKSTKPyrGhrfTKENvRILeSWFAKNIENPYLDTKGLENLMKNTSLSRiqIKnwVsnRRrkEkT E;F gatTAcctaATAGGGAAATTTACACG;CCGTGTAAATTTCCCTATTAggtaat 188 531 137 23;10;104;0 6;1;1;2;1;0;0;0;5;0;2;0;0;0;0;1;0;7;23;88 1MNN 1mnn_1_1 12411490 1.4 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet NDT80 Protein 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A VILTQLNEDGTTSNYFDkRKlkiaprstLqfKVGPPFELVRDYCPVVESHTGRTLDLRIIPRIDrGFDHIDEEWVGykrnyFTLVSTFETANCDLDTFLKSSFDLLVGRLRVQYFAIKIKAKNDDDDTEINLVQHTakrdkGPqFCPSVCPLVPSPLPKHQTIreAsnvrnITkMKKYDSTFYLHRDHVNYEEYGVDSLLFSYPEDSIQKVARYErVQFAssISVkKPSQQNKHFSLHVILGAVVDPDGIPYDELALKNGSKGMFVYLQEMKTPPLIIRGrspSNyAsSQ B;C TgcgacaCaaaaac;AGTTtttgtgtCGC 33 2 267 54;21;189;3 5;0;11;0;1;1;1;0;11;5;6;0;0;0;0;2;4;12;37;171 1N6J 1n6j_1_1 12700764 2.2 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Alpha|Beta Cabin 1 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B;G grkkiQISRILDQRnRQvtFTkrKFgLMkkAYeLSVLCDCEIALIIFNSANRLFQYASTDMDRVLLKYTEYSEPHESRTNTDILETLKRRGIG;grkkiQISRiLDQRnRQvtFTkrKFgLMkkAYeLSVLCDCEIALIIFNSANRLFQYASTDMDRVLLKYTEYSEPHESRTNTDILETLKRr;SPKGSISEETKQKLKSAILSAQSAAN C;D agCtatttataagC;gcTtataaatagct 176;263 524 282 23;50;209;0 3;0;4;0;0;5;0;5;13;4;10;0;0;0;0;1;0;20;38;179 1NFK 1nfk_1_1 7530332 2.3 MUS MUSCULUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet NFkB 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B GPYLQILEQPKQRgfrFryVceGPShggLpGASSEkNKksYPQVKICNYVGPAKVIVQLVTNGKNIHLHAHSLVGKHCEDGVCTVTAGPKDMVVGFAnLGILhvtkkKVFETLEARMTEACIRGYNPGLLVHSDLAYLQAEGGGDRQLTDREKEIIRQAAVQQTKEMdlsVVRLMFTAFLPDSTGSFTRRLEPVVSDAIYdskApNASnLkIVRMDRTAGCVTGGEEIYLLCdkVqkDDIQIRFYEEEENGGVWEGFGDFSPTDvHrqfAIVFKTPKYKDVNITKPASVFVQLRRKSDLETSEPKPFLYYPE;GPYLQILEQPKQRGFrFryvceGpshGGLPGASSEKNKKSYPQVKICNYVGPAKVIVQLVTNGKNIHLHAHSLVGKHCEDGVCTVTAGPKDMVVGFANLGILhvtkkKVFETLEARMTEACIRGYNPGLLVHSDLAYLQAEGGGDRQLTDREKEIIRQAAVQQTKEMDlsVVRLMFTAFLPDSTGSFTRRLEPVVSDAIYDSkApNASNLKIVRMDRTAGCVTGGEEIYLLCdkVqkDDIQIRFYEEEENGGVWEGFGDFSPtDvHrqFAIVFKTPKYKDVNITKPASVFVQLRRKSDLETSEPKPFLYYPE C;D tgggaattccc;tgggaattccc 136 523 336 126;2;207;1 13;0;18;0;5;0;2;0;14;3;5;4;0;0;0;4;9;19;60;180 1NH2 1nh2_1_1 12972251 1.9 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet TATA Box Binding Protein 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 1 4 2 0 1 A;B;C;D SGIVPTLqnIvAtVTLGCrLDLKTVALHARNAeYNPKrfaAViMrIREPkTtAlIfasGkmvVtgAkSEDDSKLASRKYARIIQKIGFAAKFTDFKIqnIvgsCDVKFPIRLEGLAFSHGTFSSYEpelfpGLiYrMVKPkIvLlIfvsGkivLtgAkQREEIYQAFEAIYPVLSEFRKM;NAEASRVYEIIVESVVNEVREDFENAGIDEQTLQDLKNIWQKKLTE;DYLIENLMLCLYDKVtrtkArWkCSLKDGVVTINRNDYTFQKAQVEAEWV;GYYELYRRSTIGNSLVDALDTLISDGRIEASLAMRVLETFDKVVAETLKDNTQSKLTVKGNLDTYGFCDDVWTFIVKNCQVTVEDQSVISVDKLRIVACNSKKS E;F TGTagtAtaaaaac;gttttatataCATACA 6;120;205;207 99 331 1;64;264;2 2;1;2;0;0;0;1;1;9;9;2;0;0;0;0;0;0;23;94;187 1NKP 1nkp_1_1 12553908 1.8 HOMO SAPIENS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Helix Loop Helix, Myc|Max 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 2 1 1 A;B GhMNVkrRthnVlerQrrnElkRSFFALRDQIPELENNEkApkvvILKKATAYILSVQAEEQKLISEEDLLRKRREQLKHKLEQLGGC;DkrAhhnAlerKrrdhikDSFHSLRDSVPSLQGEkAsrAqILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQVRALGGC F;G CGAgtagcacgtgcTACTC;CGagtagcacgtgcTAcTC 94;179 510 260 82;0;178;0 3;0;2;0;6;0;0;0;9;1;4;0;0;0;0;3;3;23;31;175 1NKP 1nkp_2_1 12553908 1.8 HOMO SAPIENS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Helix Loop Helix, Myc|Max 2 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 2 1 1 D;E MNVkrRthnVlerQrrneLkRSFFALRDQIPELENNekApkvvILKKATAYILSVQAEEQKLISEEDLLRKRREQLKHKLEQL;rAhhnAlerKrrdhIkDSFHSLRDSVPSLQGEKasraqILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQVRALGGC H;J CGAGtagcacgtgcTACTC;CGAgtagcacgtgcTacTC 94;179 509 249 83;0;166;0 3;0;2;0;6;0;0;0;8;1;4;0;0;0;0;2;2;24;28;169 1NLW 1nlw_1_1 12553908 2 HOMO SAPIENS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Helix Loop Helix, Mad|Max 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 2 1 1 A;B SrSthnemekNrrAHlrLSLEKLKGLVPLGPDSSrhttlSLLTKAKLHIKKLEDSDRKAVHQIDQLQREQRHLKRQLEK;krAhhnAlerKrrdhIkDSFHSLRDSVPSLQGEkasraqILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQV F;G GAgtagcacgtgcTAcTC;GAGtagcacgtgcTACtC 94;186 508 246 85;0;161;0 3;0;2;0;5;0;0;0;8;3;3;0;0;0;0;4;2;23;33;160 1NLW 1nlw_2_1 12553908 2 HOMO SAPIENS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Helix Loop Helix, Mad|Max 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 2 1 1 D;E srSthnEmekNrrAHlrLSlEKLKGLVPLGPDSSRhttlSLLTKAKLHIKKLEDSDRKAVHQIDQLQREQRHLKRQL;AhhnAlerKrrdHikDSFhSLRDSVPSLQGEKasraQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQV H;J GAGtagcacgtgcTACTC;GAgtagcacgtgcTACTC 94;186 507 229 91;0;138;0 3;0;1;0;6;0;0;0;4;9;4;0;0;0;0;5;2;13;33;149 1NVP 1nvp_1_1 12972251 2.1 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet TATA Box Binding Protein 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 1 4 2 0 1 A;B;C;D SGIVPQLqnIvStVNLGCKLDLKTIALRARNAeYNPKrfaAViMrIREPrTtAlIfssGkmvCtgAkSEEQSRLAARKYARVVQKLGFPAKFLDFKIqnMvGsCDVKFPIRLEGLVLTHQQFSsYEpelfpGLiYrMIKPrIvLlIfvsGkvvLtgAkVRAEIYEAFENIYPILKGFRKT;TVPKLYRSVIEDVINDVRDIFLDDGVDEQVLMELKTLWENKLM;DTENVVVCQYDKIhrskNKWkFhLKDGIMNLNGRDYIFSkAiGDAEW;YQLYRNTTLGNSLQESLDELIQSQQITPQLALQVLLQFDKAINAALAQRVRNrVNFRGSLNTYRFCDNVWTFVLNDVEFREVTELIKVDKVKIVACD E;F GGGGgggCtataaaagg;CcttttatagcCCCCcc 6;240;260;261 99 337 0;60;276;1 2;1;2;0;0;0;2;0;6;12;1;0;0;0;0;0;0;28;87;196 1OZJ 1ozj_1_1 12686552 2.4 HOMO SAPIENS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating SMAD 3 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A fTPPIVKRLLGWKKGEQNGQEEKWCEkAVksLVkkLKkTGQLDELEKAITTQNVNTKCITIPRsldGrlqvshrkGlPHVIYCRLWRWPDLhshhELRAMELCEFAFNMkKDEVCVNPYHYQRVET C;D TCAGTctagaCATAC;GtatgtctAGActga 171 498 111 40;0;71;0 3;0;6;0;2;0;1;0;0;2;3;0;0;0;0;1;3;11;10;69 1OZJ 1ozj_1_2 12686552 2.4 HOMO SAPIENS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating SMAD 3 1 2 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B PPIVKRLLGWKKGEQNGQEEKWCEkAVKsLVkkLKkTGQLDELEKAITTQNVNTKCITIpRsldGrlqVshrkGlPHVIYCRLWRWPDLhshhELRAMELCEFAFNMKKDEVCVNPYHYQRVET C;D TcagtctAGACaTAC;GTATGTctagacTGA 171 497 93 36;0;57;0 4;0;4;0;3;0;1;0;0;2;3;0;0;0;0;1;2;6;10;57 1P47 1p47_1_1 12818197 2.2 MUS MUSCULUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zif268 Zinc Finger 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B ErPyACPVESCDrrfsrsdeLtrhIriHTGQkPfQCRICMrnfsrsdhLtthIrtHTGEkPfACDICGrkfarsderkrhTKiHLrq;rPYACPVESCDrrfsrsdeLtrhIriHTGQkPfQCRICMrnfsrsdhLtthIrtHTGEkPfACDICGrkfarsderkrhTkiHL C;D gtggcgtgggcggcgtgggcgt;cacgcccacgccgcccacgCCA 19 496 513 183;1;329;0 25;1;24;0;16;0;0;0;12;26;5;0;0;0;0;10;1;44;51;298 1PDN 1pdn_1_1 7867071 2.5 DROSOPHILA MELANOGASTER 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Paired Protein Pax 1 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 1 0 0 1 C qGrvnqLGGVfingrplPNNIrLKIVEMAADGIrpcVISrQLRvshgcVskiLnrYQETGSIRpgviggskprIAtPEIENRIEEYKRSSPGMFSWEIREKLIREGVCDRSTAPSVSAISRLV A;B AacgtcACggttgac;TTGTCaaccgtgacG 230 490 279 32;28;219;0 2;0;0;0;1;4;3;1;12;3;14;7;0;0;0;2;1;14;51;164 1PER 1per_1_1 8081737 2.5 BACTERIOPHAGE 434 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix 434 Repressor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 L;R SISSRVkSKrIQLGLnqaELAQKVGttqqsIeqLEnGktkrprfLPELASALGVSVDWLLNGT;SISSRVkSKrIQLGLnqaELAQKVgttqqsIeqLEnGktkrprfLPELASALGVSVDWLLNGT A;B AAgtacaGTTTttcttgtAT;TatacaAGAaaaactgtACT 60 489 291 98;5;188;0 7;0;8;0;4;0;1;0;22;14;12;0;0;0;0;15;2;15;22;169 1PP7 1pp7_1_1 14622596 2.45 TRICHOMONAS VAGINALIS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Initiator Binding Protein IBP39 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 U DLEASFTSRLPPEIVAAlKrkssrDPNSrfpRkLHMLLTYLASNPQLEEEIGLSWISDTEFKMKkkNVALVMgiklntLnvnLrdlAFEqLQhdKGGWtQwKRSGFTRNSVFED E;F gttacttcaCTT;caagtgAAGtaac 235 488 189 30;18;141;0 3;0;7;0;1;0;0;0;9;8;3;0;0;0;0;5;0;12;36;105 1PUE 1pue_1_1 8602247 2.1 MUS MUSCULUS 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Ets Domain, Pu.1 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 E kirlYQFLLDLLRSGDMKDSIWWVDKDKGTFQFSsKHkEALAHRwGIQkgnrkKmTyekmAraLrnyGktGEVKkVkkklTyQFSGEV A;B AAAaaggggaAGtggg;TCCCacttcccCTTTt 177 485 208 46;1;161;0 4;0;3;0;2;0;0;0;10;1;7;0;0;0;0;2;3;15;41;120 1PUE 1pue_2_1 8602247 2.1 MUS MUSCULUS 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Ets Domain, Pu.1 2 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 F kirlYQFLLDLLRSGDMKDSIWWVDKDKGTFQFSsKHkEALAHRwGIQkGnrkKmTyekmaraLrnyGktGeVKkVkkklTyQFSGEVL C;D AAAAaggggaAGtggg;TCCCacttcccCTTtt 177 484 199 46;1;151;1 4;0;2;0;2;0;0;0;5;1;8;0;0;0;0;2;3;16;35;121 1PUF 1puf_1_1 12923056 1.9 HOMO SAPIENS, MUS MUSCULUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, HoxA9 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 2 1 1 A;B NNPAANWlharStrkkrcpyTkHQtLELEKEFLFNMylTrDRrYEVARLLNLTErqVkiwFqnRrmkMkkiNKDRAK;ArRkrrnfNKQAtEILNEYFYSHLSNPypSeEAkEELAKKCGITVSqVsnwFgnKrirYkkNIGKfQEEANIY D;E ACTCTatgatttacgaCGCT;TAgcgtcgtaaatcatagAG 191;246 483 406 72;25;309;0 10;0;8;0;6;0;1;0;25;3;10;0;0;0;0;3;0;29;76;235 1QN3 1qn3_1_1 10617571 1.95 ARABIDOPSIS THALIANA 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet TATA Box Binding Protein 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A KHPSGIVPTLqnIvStVNLDCKLDLKAIALQARNAeYNpkrfaAViMrIREPkTtAlIfasGkmvCtgAkSEDFSKMAARKYARIVQKLGFPAKFKDFKIqnIvgsCDVKFPIRLEGLAYSHAAFSSYEpelfpGLiYrMKVPkIvLlIfvsGkivItgAkMRDETYKAFENIYPVLSEFRKI C;D GCtataaacgggCA;TGCCcgtttatagc 6 1 327 5;52;267;3 2;1;2;0;0;0;0;0;6;6;2;0;0;0;0;0;0;17;97;194 1QN3 1qn3_2_1 10617571 1.95 ARABIDOPSIS THALIANA 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet TATA Box Binding Protein 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B VDLSKHPSGIVPTLqnIvStVNLDCKLDLKAIALQARNAeYnpkrfaAViMrIREPkTtAlIfasGkmvCtgAkSEDFSKMAARKYARIVQKLGFPAKFKDFKIqnIvgsCDVKFPIRLEGLAYSHAAFSsYEpelfpGLiYrMKVPkIvLlIfvsGkivItgAkMRDETYKAFENIYPVLSEFRKI E;F GCtataaacgggCA;TGCCcgtttatagc 6 1 319 4;51;262;2 2;1;2;0;0;0;0;0;5;7;2;0;0;0;0;0;0;14;90;196 1QN4 1qn4_1_1 10617571 1.86 ARABIDOPSIS THALIANA 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet TATA Box Binding Protein 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A KHPSGIVPTLqnIvStVNLDCkLDLKAIALQARNAeYNpKrfaAViMrIREPkTtAlIfasGkmvCtgAkSEDFSKMAARKYARIVQKLGFPAKFKDFKIqnIvGsCDVKFPIRLEGLAYSHAAFSSYEpelfpGLiYrMKVPkIvLlIfvsGkivItgAkMRDETYKAFENIYPVLSEFRKI C;D GCtataaaatggCA;TGCCattttatagc 6 1 320 0;63;255;2 2;1;2;0;0;0;0;1;7;6;3;0;0;0;0;0;0;18;90;190 1QN4 1qn4_2_1 10617571 1.86 ARABIDOPSIS THALIANA 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet TATA Box Binding Protein 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B VDLSKHPSGIVPTLqnIvStVNLDCKLDLKAIALQARNAeYNpkrfaAViMrIREPkTtAlIfasGkmvCtgAkSEDFSKMAARKYARIVQKLGFPAKFKDFKIqnIvgsCDVKFPIRLEGLAYSHAAFSsYEpelfpGLiYrMKVPkIvLlIfvsGkivItgAkMRDETYKAFENIYPVLSEFRKI E;F GCtataaaatggCA;TGCCattttatagc 6 1 333 0;66;265;2 2;1;2;0;0;0;0;1;5;8;3;0;0;0;0;0;0;17;96;198 1QN5 1qn5_1_1 10617571 1.93 ARABIDOPSIS THALIANA 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet TATA Box Binding Protein 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A KHPSGIVPTLqnIvStVNLDCKLDLKAIALQARNAeYnpkrfaAViMrIREPkTtAlIfasGkmvCtgAkSEDFSKMAARKYARIVQKLGFPAKFKDFKIqnIvGsCDVKFPIRLEGLAYSHAAFSSYEpelfpGLiYrMKVPkIvLlIfvsGkivItgAkMRDETYKAFENIYPVLSEFRKI C;D GCtataagagggCA;TGCCctcttatagc 6 1 329 2;60;264;3 2;1;2;0;0;0;0;0;7;6;2;0;0;0;0;0;0;12;90;207 1QN5 1qn5_2_1 10617571 1.93 ARABIDOPSIS THALIANA 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet TATA Box Binding Protein 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B VDLSKHPSGIVPTLqnIvStVNLDCKLDLKAIALQARNAeYNpkrfaAViMrIREPkTtAlIfasGkmvCtgAkSEDFSKMAARKYARIVQKLGFPAKFKDFKIqnIvgsCDVKFPIRLEGLAYSHAAFSsYEpelfpGLiYrMKVPkIvLlIfvsGkivItgAkMRDETYKAFENIYPVLSEFRK E;F GCtataagagggCA;TGCCctcttatagc 6 1 330 3;62;263;2 2;1;2;1;0;0;0;0;6;8;2;0;0;0;0;0;0;16;94;198 1QN6 1qn6_1_1 10617571 2.1 ARABIDOPSIS THALIANA 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet TATA Box Binding Protein 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A SKHPSGIVPTLqnIvStVNLDCKLDLKAIALQARNAeYNpkrfaAViMrIREPkTtAlIfasGkmvCtgAkSEDFSKMAARKYARIVQKLGFPAKFKDFKIqnIvGsCDVKFPIRLEGLAYSHAAFSsYEpelfpGLiYrMKVPkIvLlIfvsGkivItgAkMRDETYKAFENIYPVLSEFRKI C;D GCtataatagggCA;TGCCctattatagc 6 1 340 3;65;269;3 2;1;2;0;0;0;1;0;7;7;2;0;0;0;0;0;0;17;101;200 1QN6 1qn6_2_1 10617571 2.1 ARABIDOPSIS THALIANA 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet TATA Box Binding Protein 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B VDLSKHPSGIVPTLqnIvStVNLDCKLDLKAIALQARNAeYNpkrfaAViMrIREPkTtAlIfasGkmvCtgAkSEDFSKMAARKYARIVQKLGFPAKFKDFKIqnIvgsCDVKFPIRLEGLAYSHAAFSsYEpelfpGLiYrMKVPkIvLlIfvsGkivItgAkMRDETYKAFENIYPVLSEFRKI E;F GCtataatagggCA;TGCCctattatagc 6 1 342 3;63;274;2 2;1;2;0;0;0;1;0;7;8;3;0;0;0;0;0;0;18;101;199 1QN7 1qn7_1_1 10617571 2.3 ARABIDOPSIS THALIANA 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet TATA Box Binding Protein 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A DLSKHPSGIVPTLqnIvStVNLDCkLDLKAIALQARNAeYNpkrfaAViMrIREPkTtAlIfasGkMvCtgAkSEDFSKMAARKYARIVQKLGFPAKFKDFKIqnIvGsCDVKFPIRLEGLAYSHAAFSsYEpelfpGLiYrMKVPkIvLlIfvsGkivItgAkMRDETYKAFENIYPVLSEFRKI C;D GCtatataagggCA;TGCCcttatatagc 6 1 321 3;56;259;3 2;1;2;0;0;0;1;0;7;6;3;0;0;0;0;0;0;17;89;193 1QN7 1qn7_2_1 10617571 2.3 ARABIDOPSIS THALIANA 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet TATA Box Binding Protein 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B VDLSKHPSGIVPTLqnIvStVNLDCKLDLKAIALQARNAeYNpkrfaAViMrIREPkTtAlIfasGkmvCtgAkSEDFSKMAARKYARIVQKLGFPAKFKDFKIqnIvgsCDVKFPIRLEGLAYSHAAFSSYEpelfpGLiYrMKVPkIvLlIfvsGkivItgAkMRDETYKAFENIYPVLSEFRK E;F GCtatataagggCA;TGCCcttatatagc 6 1 306 2;58;245;1 2;1;2;1;0;0;0;0;6;9;5;0;0;0;0;0;0;15;84;181 1QN8 1qn8_1_1 10617571 2.1 ARABIDOPSIS THALIANA 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet TATA Box Binding Protein 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A KHPSGIVPTLqnIvStVNLDCkLDLKAIALQARNAeYNpkrfaAViMrIREPkTtAlIfasGkmvCtgAkSEDFSKMAARKYARIVQKLGFPAKFKDFKIqnIvgsCDVKFPIRLEGLAYSHAAFSsYEpelfpGLiYrMKVPkIvLlIfvsGkivItgAkMRDETYKAFENIYPVLSEFRKI C;D GCtattaaagggCA;TGCCctttaatagc 6 1 322 2;52;266;2 2;0;2;1;0;0;0;0;9;7;0;0;0;0;0;0;0;20;95;186 1QN8 1qn8_2_1 10617571 2.1 ARABIDOPSIS THALIANA 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet TATA Box Binding Protein 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B VDLSKHPSGIVPTLqnIvStVNLDCkLDLKAIALQARNAeYNpkrfaAViMrIREPkTtAlIfasGkMvCtgAkSEDFSKMAARKYARIVQKLGFPAKFKDFKIqnIvgsCDVKFPIRLEGLAYSHAAFSsYEpelfpGLiYrMKVPkIvLlIfvsGkivItgAkMRDETYKAFENIYPVLSEFRKI E;F GCtattaaagggCA;TGCCctttaatagc 6 1 318 2;54;260;2 2;0;2;1;0;0;0;0;6;8;1;0;0;0;0;0;0;17;97;184 1QN9 1qn9_1_1 10617571 1.9 ARABIDOPSIS THALIANA 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet TATA Box Binding Protein 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A KHPSGIVPTLqnIvStVNLDCKLDLKAIALQARNAeYNpkrfaAViMrIREPkTtAlIfasGkmvCtgAkSEDFSKMAARKYARIVQKLGFPAKFKDFKIqnIvGsCDVKFPIRLEGLAYSHAAFSsYEpelfpGLiYrMKVPkIvLlIfvsGkivItgAkMRDETYKAFENIYPVLSEFRKI C;D GCtacaaaagggCA;TGCCcttttgtagc 6 1 333 2;59;269;3 2;1;2;0;0;0;0;0;7;6;2;0;0;0;0;0;0;18;99;196 1QN9 1qn9_2_1 10617571 1.9 ARABIDOPSIS THALIANA 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet TATA Box Binding Protein 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B VDLSKHPSGIVPTLqnIvStVNLDCKLDLKAIALQARNAeYNpkrfaAViMrIREPkTtAlIfasGkmvCtgAkSEDFSKMAARKYARIVQKLGFPAKFKDFKIqnIvGsCDVKFPIRLEGLAYSHAAFSsYEpelfpGLiYrMKVPkIvLlIfvsGkivItgAkMRDETYKAFENIYPVLSEFRK E;F GCtacaaaagggCA;TGCCcttttgtagc 6 1 334 2;65;265;2 2;1;2;0;1;0;1;0;6;7;2;0;0;0;0;0;0;12;98;202 1QNA 1qna_1_1 10617571 1.8 ARABIDOPSIS THALIANA 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet TATA Box Binding Protein 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A HPSGIVPTLqnIvStVNLDCKLDLKAIALQARNAeYNpkrfaAViMrIREPkTtAlIfasGkMvCtgAkSEDFSKMAARKYARIVQKLGFPAKFKDFKIqnIvgsCDVKFPIRLEGLAYSHAAFSSYEpelfpGLiYrMKVPkIvLlIfvsGkivItgAkMRDETYKAFENIYPVLSEFRKI C;D GCtttaaaagggCA;TGCCcttttaaagc 6 1 328 2;57;267;2 2;1;2;0;0;0;0;0;7;6;1;0;0;0;0;0;0;19;99;191 1QNA 1qna_2_1 10617571 1.8 ARABIDOPSIS THALIANA 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet TATA Box Binding Protein 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B VDLSKHPSGIVPTLqnIvStVNLDCKLDLKAIALQARNAeYNpkrfaAViMrIREPkTtAlIfasGkMvCtgAkSEDFSKMAARKYARIVQKLGFPAKFKDFKIqnIvgsCDVKFPIRLEGLAYSHAAFSsYEpelfpGLiYrMKVPkIvLlIfvsGkivItgAkMRDETYKAFENIYPVLSEFRK E;F GCtttaaaagggCA;TGCCcttttaaagc 6 1 323 2;54;264;3 2;1;2;0;0;0;0;0;7;7;1;0;0;0;0;0;0;17;102;184 1QNB 1qnb_1_1 10617571 2.23 ARABIDOPSIS THALIANA 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet TATA Box Binding Protein 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A KHPSGIVPTLqnIvStVNLDCKLDLKAIALQARNAeyNpkrfaAViMrIREPkTtAlIfasGkmvCtgAkSEDFSKMAARKYARIVQKLGFPAKFKDFKIqnIvgsCDVKFPIRLEGLAYSHAAFSsYepelfpGLiYrMKVPkIvLlIfvsGkivItgAkMRDETYKAFENIYPVLSEFRKI C;D GCtataaatgggCA;TGCCcatttatagc 6 1 335 3;63;267;2 2;1;2;0;0;0;1;0;6;6;3;0;0;0;0;0;0;20;101;193 1QNB 1qnb_2_1 10617571 2.23 ARABIDOPSIS THALIANA 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet TATA Box Binding Protein 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B VDLSKHPSGIVPTLqnIvStVNLDCKLDLKAIALQARNAeYNpkrfaAViMrIREPkTtAlIfasGkmvCtgAkSEDFSKMAARKYARIVQKLGFPAKFKDFKIqnIvgsCDVKFPIRLEGLAYSHAAFSsYEpelfpGLiYrMKVPkIvLlIfvsGkivItgAkMRDETYKAFENIYPVLSEFRKI E;F GCtataaatgggCA;TGCCcatttatagc 6 1 329 2;59;265;3 2;1;2;0;0;0;0;0;5;7;2;0;0;0;0;0;0;15;100;195 1QNC 1qnc_1_1 10617571 2.3 ARABIDOPSIS THALIANA 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet TATA Box Binding Protein 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A KHPSGIVPTLqnIvStVNLDCkLDLKAIALQARNAeYNpkrfaAViMrIREPkTtAlIfasGkmvCtgAkSEDFSKMAARKYARIVQKLGFPAKFKDFKIqnIvGsCDVKFPIRLEGLAYSHAAFSSYEpelfpGLiYrMKVPkIvLlIfvsGkivItgAkMRDETYKAFENIYPVLSEFRKI C;D GCaataaaagggCA;TGCCcttttattgc 6 1 326 4;59;261;2 2;1;2;0;0;0;0;0;9;8;1;0;0;0;0;0;0;18;95;190 1QNC 1qnc_2_1 10617571 2.3 ARABIDOPSIS THALIANA 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet TATA Box Binding Protein 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B VDLSKHPSGIVPTLqnIvStVNLDCKLDLKAIALQARNAeyNpkrfaAViMrIREPkTtAlIfasGkmvCtgAkSEDFSKMAARKYARIVQKLGFPAKFKDFKIqnIvGsCDVKFPIRLEGLAYSHAAFSsYEpelfpGLiYrMKVPkIvLlIfvsGkivItgAkMRDETYKAFENIYPVLSEFRKI E;F GCaataaaagggCA;TGCCcttttattgc 6 1 327 3;59;263;2 2;1;2;0;0;0;0;0;7;7;1;0;0;0;0;0;0;16;100;191 1QNE 1qne_1_1 10617571 1.9 ARABIDOPSIS THALIANA 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet TATA Box Binding Protein 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A VDLSKHPSGIVPTLqnIvStVNLDCKLDLKAIALQARNAeYNpkrfaAViMrIREPkTtAlIfasGkmvCtgAkSEDFSKMAARKYARIVQKLGFPAKFKDFkIqnIvGsCDVKFPIRLEGLAYSHAAFSsYepelfpGLiYrMKVPkIvLlIfvsGkivItgAkMRDETYKAFENIYPVLSEFRKI C;D GCtataaaagggCA;TGCCcttttatagc 6 1 331 0;60;269;2 2;1;2;0;0;0;0;0;9;7;3;0;0;0;0;0;0;21;90;196 1QNE 1qne_2_1 10617571 1.9 ARABIDOPSIS THALIANA 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet TATA Box Binding Protein 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B PVDLSKHPSGIVPTLqnIvStVNLDCKLDLKAIALQARNAeYNpkrfaAViMrIREPkTtAlIfasGkmvCtgAkSEDFSKMAARKYARIVQKLGFPAKFKDFKIqnIvgsCDVKFPIRLEGLAYSHAAFSsYEpelfpGLiYrMKVPkIvLlIfvsGkivItgAkMRDETYKAFENIYPVLSEFRKI E;F GCtataaaagggCA;TGCCcttttatagc 6 1 333 0;62;270;1 2;1;2;0;0;0;1;0;6;8;3;0;0;0;0;0;0;15;98;197 1QPI 1qpi_1_1 10700280 2.5 ESCHERICHIA COLI 1 1 1 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Tetracyclin Repressor 1 1 1 2 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B lNRESVIDAALELLNETGIdglttrkLAQKLgieqptLywhVknkRALLDALAVEILARHHDYSLPAAGESWQSFLRNNAMSFRRALLRYRDGAKVHLGTRPDEKQYDTVETQLRFMTENGFSLRDGLYAISAVSHFTLGAVLEQQEHTAALENLPPLLREALQIMDSDDGEQAFLHGLESLIRGFEVQLTALLQ;lNRESVIDAALELLNETGIdglttrkLAQKLgieqptLywhVknkRALLDALAVEILARHHDYSLPAAGESWQSFLRNNAMSFRRALLRYRDGAKVHLGTRPDEKQYDTVETQLRFMTENGFSLRDGLYAISAVSHFTLGAVLEQQEHTAALENLPPLLREALQIMDSDDGEQAFLHGLESLIRGFEVQLTALLQ M;N;Q;R cctatCAAtgatAGA;tctatCATtgatAGG;cctatCAAtgatAGA;tctatCATtgatAGG 159 478 436 156;0;280;0 16;0;8;0;4;0;6;0;4;28;24;0;0;0;0;4;4;16;96;226 1QPZ 1qpz_1_1 10438625 2.5 ESCHERICHIA COLI 1 1 1 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Purine Repressor 1 1 1 2 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B atikDVAKRAnvstttVshVInKtrfvaEEtRNAVWAAIKELHyspsAVarSlkvnHTKSIGLLATSSEAAYFAEIIEAVEKNCFQKGYTLILGNAWNNLEKQRAYLSMMAQKrVDGLLVMCSEYPEPLLAMLEEYRHIPMVVMDWGEAKADFTDAVIDNAFEGGYMAGRYLIERGHREIGVIPGPLERNTGAGRLAGFMKAMEEAMIKVPESWIVQGDFEPESGYRAMQQILSQPHRPTAVFCGGDIMAMGALCAADEMGLRVPQDVSLIGYDNVRNARYFTPALTTIHQPKDSLGETAFNMLLDRIVNKREEPQSIEVHPRLIERRSVADGPFRDYR;atikDVAKRAnvstttVshVInKtrfvaEEtRNAVWAAIKELHyspsAVarSlkvnHTKSIGLLATSSEAAYFAEIIEAVEKNCFQKGYTLILGNAWNNLEKQRAYLSMMAQKrVDGLLVMCSEYPEPLLAMLEEYRHIPMVVMDWGEAKADFTDAVIDNAFEGGYMAGRYLIERGHREIGVIPGPLERNTGAGRLAGFMKAMEEAMIKVPESWIVQGDFEPESGYRAMQQILSQPHRPTAVFCGGDIMAMGALCAADEMGLRVPQDVSLIGYDNVRNARYFTPALTTIHQPKDSLGETAFNMLLDRIVNKREEPQSIEVHPRLIERRSVADGPFRDYR M;Q TacgcaAacgtttgCGT;TacgcaAacgtttgCGT 68 98 398 96;42;256;4 6;0;2;4;6;0;2;2;10;16;14;0;0;0;0;8;6;8;68;246 1QRV 1qrv_1_1 10581235 2.2 DROSOPHILA MELANOGASTER 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Alpha Helix HMG, HMG-D 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A SDkpkrplsaymLWlnSAreSIkRENPGIKvtEVakRGgELwrAMKDKSEWeAKaAKAkDDyDRAvKEfeANG C;D GCgatatcgc;GCgatatcGC 193 475 179 5;49;122;3 3;1;4;0;2;0;0;1;10;1;2;0;0;0;0;0;0;8;35;112 1QRV 1qrv_1_2 10581235 2.2 DROSOPHILA MELANOGASTER 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Alpha Helix HMG, HMG-D 1 2 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 2 B dKPkrPlSAymLWlnSAreSIkRENPGIKvtEvaKRGGELWRAMKDKSEWEAKAAKAKDDYDRAVKEFEAN C;D gcgaTATCGC;GCGAtATcgc 193 474 68 13;16;38;1 1;0;5;0;1;0;0;0;2;0;0;0;0;0;1;0;0;4;12;42 1R0O 1r0o_1_1 14592980 2.24 DROSOPHILA MELANOGASTER 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Hormone Nuclear Receptor, Glucocorticoid Receptor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 2 1 1 A;B hLCSICGdrAsgkhygVySCegCkgfFkrTVrkDlTyACrENRNCIIDKRQrnrCqYCrYQKCLTCGMkREavqEe;EELCLVCGdrAsgyhyNALTCegCkgfFrrSVtkSAVyCCkFGRACEMDMYMrrkCqECrLKKCLAVGMRPEcVvpEn C;D CcgaggtCAatgaccTCG;CcgaggtCAttgaccTCG 46;245 472 295 75;0;220;0 7;0;6;0;3;0;2;0;14;0;10;0;0;0;0;1;0;31;29;192 1R4O 1r4o_1_1 1865905 2.5 RATTUS NORVEGICUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Hormone Nuclear Receptor, Glucocorticoid Receptor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B MKPARPCLVCSdEAsgchyGVLTCgsCkvfFkrAVEGqhnyLCAGRNDCIIDkIRrkNCpACrYRKCLQAGMNlEarktk;MKPARPCLVCSdEAsgchyGVLTCgsCkvfFkrAVeGQHNyLCAGRNDCIIDkIRrkNCpACrYRKCLQAGMNlEarkTK C;D ccagaaCATcgatgtTCTG;CcagaACATCGatgttCTG 56 469 280 40;4;236;0 4;0;2;0;0;0;0;0;8;5;10;0;0;0;0;0;2;20;48;181 1R71 1r71_1_1 15170177 2.2 ESCHERICHIA COLI 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Alpha Helix Repressor KorB 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 1 2 1 1 1 A;B EADQVIENlQRnELTpREiADFIGRELAKGKkkgdIAkEIgkspafitqhvtLLDLPEKIADAFNTGrVrdvtVVneLVtAFkkRPEEVEAWLDDDTQEitrgTVkLLrEFLdE;YNEADQVIENlQRnELTpREiADFIGRELAKGKkkgdIAkEIgkspafitqhvtLLDLPEKIADAFNTGRVrdvtVVneLVtAFkkRPEEVEAWLDDDTQEitrgTVkLLrEFLDE E;F;I;J atttAgcggctaAAAG;ctttagccgctaaAA;ctttaGccgctAaAA;atttagcggctAAAAG 87 97 376 111;0;263;2 4;3;7;0;4;0;0;0;6;15;20;0;0;0;0;13;6;30;50;218 1R71 1r71_2_1 15170177 2.2 ESCHERICHIA COLI 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Alpha Helix Repressor KorB 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 1 2 1 1 1 C;D ADQVIENlQRnELTpREiADFIGRELAKGKkkgDIAKEIgkspafitqhvtLLDLPEKIADAFNTGrVrdvtVVneLvtAFkkRPEEVEAWLDDDTQEitrgTVkLLrEFLD;NEADQVIENlQRnELTpREiADFIGRELAKGKkkgDIAKEIgkspafitqhvtLLDLPEKIADAFNTGRVrdvtVVneLvtAFkkRPEEVEAWLDDDTQeitrgTVkLLrEFLdE G;H;K;L atttagcggctaaAAG;ctttAgccgctAAAA;atttagcggctaAAAG;ctttAGccgctAAAA 87 97 391 119;0;270;2 3;2;9;0;4;0;0;0;4;19;22;0;0;0;0;14;7;30;57;220 1R8E 1r8e_1_1 14985361 2.4 BACILLUS SUBTILIS 1 1 1 1 0 0 1 Transcription factor Alpha|Beta Activator MerR 1 1 1 2 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;D ESYYsigEVSKLANVsikaLryyDKIDLFKPAYVdPdtsyryYTDSQLIHLDLIKSLkYIGTpleEMKKAQDLEMEELFAFYTEQERQIREKLDFLSALEQTISLVKKRMKRQMEYPALGEVFVLDEEEIRIIQTEAEGIGPENVLNASYSKLKKFIESADGFTNNSYGATFSFQPYTSIDEMTYRHIFTPVLTNKQISSITPDMEITTIPKGRYACIAYNFSPEHYFLNLQKLIKYIADRQLTVVSDVYELIIPIHYSPKKQEEYRVEMKIRIA;ESYYsigEVSKLANVsikaLryyDKIDLFKPAYVdPdtsyryYTDSQLIHLDLIKSLkYIGTpleEMKKAQDLEMEELFAFYTEQERQIREKLDFLSALEQTISLVKKRMKRQMEYPALGEVFVLDEEEIRIIQTEAEGIGPENVLNASYSKLKKFIESADGFTNNSYGATFSFQPYTSIDEMTYRHIFTPVLTNKQISSITPDMEITTIPKGRYACIAYNFSPEHYFLNLQKLIKYIADRQLTVVSDVYELIIPIHYSPKKQEEYRVEMKIRIA B;E GAccctcCCCTtaggggAGGgtc;GAccctcCCCTtaggggAGGgtc 141 468 286 44;10;232;0 2;0;4;0;0;0;0;0;2;6;12;0;0;0;0;0;0;14;50;196 1RIO 1rio_1_1 14731393 2.3 BACTERIOPHAGE LAMBDA, THERMUS AQUATICUS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Repressor Protein CI 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B stkkkPLTQEqLEDARRLkAIyeKKkNELglsqeSVADKggqsgVgalfnGinaLnAYnAALLAKILKVSVEEFSPSIAREIYEYEAVHHHHHH;stkkkPlTQEQLEDARRLkAIyeKKkNELGLsqeSVADKggqsgVgalFnGinaLnAYnAALLAKILKVSVEEFSPSIAREIYEYEAVHHHHH T;U CCATGTcaagcactggcggtgATACCG;CGgtatcaccgccagtgcTTGACATGG 53 466 284 110;0;173;1 10;2;5;1;4;0;4;0;20;3;15;0;0;0;0;4;4;14;37;161 1RIO 1rio_1_2 14731393 2.3 BACTERIOPHAGE LAMBDA, THERMUS AQUATICUS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Repressor Protein CI 1 2 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 H SEELEKALSKLSErEAMVLKLrKGLIDGrEHtleeVGAYFgvtrerIrqIenkALRKLKYH T;U CCAtgtcaAGCACTGGCGGTGATACCG;CGGTATCACCGCCAGTgcttGaCATGG 254 465 121 48;0;73;0 1;0;3;0;2;0;0;0;3;2;3;0;0;0;0;8;0;13;28;58 1RM1 1rm1_1_1 0 2.5 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet TATA Box Binding Protein 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 3 2 0 1 A;B;C SGIVPTLqnIvAtVTLGCrLDLKTVALHARNAeYNpKrfaAViMrIREPkTtAlIfasGkmvVtgAkSEDDSKLASRKYARIIQKIGFAAKFTDFKIqnIvGscDVKFPIRLEGLAFSHGTFSSYEpelfpGLiYrMVKPkIvLlIfvsGkivLtgAkQREEIYQAFEAIYPVLSEFRKM;pgyYeLYRRSTIGNSLvDAldTLiSDGRIeasLAMRVLeTfdkvVaetLkDntqSkLTvKGNLDTYGFCDDVWTFIVKNCQVTVEVISVDKLRIVACNSKK;SNAEASRVYEIIVESVVNEVREDFENAGIDEQTLQDLKNIWQKKLTETKVTTFSWDNQFNDYLISEDGPDENLMLCLYDkVtrtkARWkCSLKDGVVTINRNDYTFQKAQVEAEWV D;E ATCGAtcgAtataaaacg;CgttttatatcGATCGAT 6;120;233 464 330 4;70;255;1 2;1;2;0;0;1;0;1;10;10;2;0;0;0;0;0;0;30;71;200 1RPE 1rpe_1_1 8355273 2.5 BACTERIOPHAGE 434 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix 434 Repressor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 L;R SISSRVkSKrIQLGLnqaELAQKVGttqqsIeqLEnGktkrprfLPELASALGVSVDWLLNGT;SISSRVkSKrIQLGLnqaELAQKVgttqqsIeqLEnGktkrprfLPELASALGVSVDWLLNGT A;B ACaaacaagATacattgtAT;TatacaaTGTatcttgtTTG 60 463 290 90;5;195;0 10;0;10;0;5;0;0;0;18;12;12;0;0;0;0;11;1;11;30;170 1SKN 1skn_1_1 9628487 2.5 CAENORHABDITIS ELEGANS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Alpha Helix SKN-1 1 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 1 0 0 1 P GrQskdEQLASDNELPVSAFQISEMSlSElQQVlKNESLSEYQRQLIrKIrrrGknkVaartcrQrrTDrHDKM A;B TGACAAtgtcatCCC;CAgggatgaCAttgT 248 442 158 52;0;106;0 7;0;4;0;2;0;0;0;4;1;0;2;0;0;0;2;1;22;21;92 1TRO 1tro_1_1 3419502 1.9 ESCHERICHIA COLI 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Trp Repressor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;C SPYSAAMAEERHQEWLRFVDLLKNAYQNDLHLPLLNLMLtPdeREaLGtrVRIVEELLRGEmsqrELkNElgagiatItrGsnSLkAAPVELRQWLEEVLLKSD;AMAEERHQEWLRFVDLLKNAYQNDLHLPLLNLMLtPdeREaLGtrVRIVEELLRGEmsqrELknElgagiatItrGsnSLkAAPVELRQWLEEVLLKSD I;J tgtactAGTTaactagtaC;tgtacTAGTTaactagtaC 31 85 262 93;0;169;0 4;2;7;0;4;2;0;2;18;12;6;0;0;0;0;6;1;21;30;147 1TRO 1tro_2_1 3419502 1.9 ESCHERICHIA COLI 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Trp Repressor 2 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 E;G AEERHQEWLRFVDLLKNAYQNDLHLPLLNLMLtPdeREaLGtrVRIVEELLRGEmsqrELkNElgagiatItrGsnSLkAAPVELRQWLEEVLLKSD;SPYSAAMAEErHQEWLRFVDLLKNAYQNDLHLPLLNLMLtPdeREaLGtrVRIVEELLRGEmsqrELkNElgagiatItrGsnSLkAAPVELRQWLEEVLL K;L tgtactAGTTaactagtaC;tgtacTAGTTaactagtaC 31 85 261 86;0;175;0 4;2;7;0;2;3;0;2;13;13;6;0;0;0;0;6;2;22;24;155 1TRR 1trr_1_1 8232559 2.4 ESCHERICHIA COLI 2 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Trp Repressor 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B aqqsPySAAMAEQrHEEWLRFVDLLKNAYQNDLHLPLLNLMLtPdeREaLGtrVRIVEELLRgEmsqreLkNELgagiatItrGsnSLkAAPVELRQWLEEVLLK;aqqsPySAAMAEQrHEEWLRFVDLLKNAYQNDLHLPLLNLMLtpdeREaLGtrVRIVEELLRGEMSQRELKNELgagIatITrGSNSLKAAPVELRQWLEEVLLK C;I AGcgtactagtACGCT;AGcgtacTAGtacgct 31 21 283 51;8;224;0 3;1;3;0;0;3;1;1;17;14;6;0;0;0;0;3;1;17;39;174 1TRR 1trr_1_2 8232559 2.4 ESCHERICHIA COLI 2 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Trp Repressor 1 2 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 G;H aqqsPySAAMAEQrHEEWLRFVDLLKNAYQNDLHLPLLNLMLtPdeREaLGtrVRIVEELLRGEmsqreLkNELgagiatItrGsnSLkAAPVELRQWLEEVLLK;aqqsPySAAMAEQrHEEWLRFVDLLKNAYQNDLHLPLLNLMLtpdeREaLGtrVRIVEELLRGEMSQRELKNELgagIatITrGSNSLKAAPVELRQWLEEVLLK C;I AGcgtacTAGtacgct;AGcgtactagtACGCT 31 21 282 49;8;225;0 3;1;2;0;0;3;1;1;17;15;6;0;0;0;0;3;0;17;37;176 1TRR 1trr_2_1 8232559 2.4 ESCHERICHIA COLI 2 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Trp Repressor 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 D;E aqqsPySAAMAEQrHEEWLRFVDLLKNAYQNDLHLPLLNLMLtPdeREaLGtrVRIVEELLRgEmsqreLkNELgagiatItrGsnSLkAAPVELRQWLEEVLLK;aqqsPySAAMAEQrHEEWLRFVDLLKNAYQNDLHLPLLNLMLtpdeREaLGtrVRIVEELLRGEMSQRELKNELgagIatITrGSNSLKAAPVELRQWLEEVLLK F;L AGcgtactagtACGCT;AGcgtacTAGtacgct 31 21 284 52;8;224;0 3;1;3;0;0;3;1;1;17;14;6;0;0;0;0;3;1;17;41;173 1TRR 1trr_2_2 8232559 2.4 ESCHERICHIA COLI 2 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Trp Repressor 2 2 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 J;K aqqsPySAAMAEQrHEEWLRFVDLLKNAYQNDLHLPLLNLMLtPdeREaLGtrVRIVEELLRGEmsqreLkNELgagiatItrGsnSLkAAPVELRQWLEEVLLK;aqqsPySAAMAEQrHEEWLRFVDLLKNAYQNDLHLPLLNLMLtpdeREaLGtrVRIVEELLRGEMSQRELKNELgagIatITrGSNSLKAAPVELRQWLEEVLLK F;L AGcgtacTAGtacgct;AGcgtactagtACGCT 31 21 289 50;10;229;0 3;1;2;0;0;3;1;1;17;14;7;0;0;0;0;3;0;17;41;179 1TSR 1tsr_1_1 8023157 2.2 HOMO SAPIENS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet p53 Tumor Supressor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SSSVPSQkTYQGSYGFRLGFLHSGTAKSVTCTYSPALNKMFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKqSqhMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCNSSCmGGMNrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVRVCACPGRDRRTEEEnL;SVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGTaksvTCTYSPALNKMFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnssCmGGMnrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcacPGrdRrtEEenL E;F TTTCCTAGACttgcccAATTA;ATAaTtgggCAagtcTAGGAA 8 83 137 31;5;101;0 4;1;6;1;1;0;0;0;16;2;4;0;0;0;0;2;1;10;15;74 1TSR 1tsr_1_2 8023157 2.2 HOMO SAPIENS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet p53 Tumor Supressor 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 C SSVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGTaksVTCTYSPALNKMFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnSsCMGGMNrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcaCPGrdRRtEEENL E;F tttccTAGACTTGCCCAATTA;ATAATTGGGCAAGTctaggaA 8 84 73 26;1;46;0 4;0;4;0;0;0;0;0;4;5;5;0;0;0;0;2;2;1;8;38 1TUP 1tup_1_1 8023157 2.2 HOMO SAPIENS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet p53 Tumor Supressor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SSSVPSQkTYQGSYGFRLGFLHSGTAKSVTCTYSPALNKMFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKqSqhMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCNSSCmGGMNrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVRVCACPGRDRRTEEEnL;SVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGTaksvTCTYSPALNKMFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnssCmGGMnrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcacPGrdRrtEEenL E;F TTTCCTAGACttgcccAATTA;ATAaTtgggCAagtcTAGGAA 8 83 138 31;5;102;0 4;1;6;1;1;0;0;0;16;2;4;0;0;0;0;2;1;11;15;74 1TUP 1tup_1_2 8023157 2.2 HOMO SAPIENS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet p53 Tumor Supressor 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 C SSVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGTaksVTCTYSPALNKMFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnssCMGGMNrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcaCPGrdRRtEEENL E;F tttccTAGACTTGCCCAATTA;ATAATTGGGCAAGTctaggaA 8 84 70 26;1;43;0 4;0;4;0;0;0;0;0;4;4;5;0;0;0;0;2;2;1;8;36 1U8B 1u8b_1_1 16209950 2.1 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Alpha Helix Ada Protein 1 1 1 0 0, 0 0 2 0 0 0 1 0 0 1 A KDDQRWQSVLArDPNADGEFVfAvRttGifRPSCrarhalREnVSFYANASEALAAGFrPckrCQPDKANPRQHRLDKITHACRLLEQETPVtleALADQVAspfhLhrLFkATTGtPkAWQqAWRAR B;C;D;E aaatt;Aattt;AaagcGCAAGAt;atcttgCGCTTt 229 418 221 16;21;184;0 1;0;5;0;0;0;0;1;14;5;6;1;0;0;0;1;1;11;60;115 1UBD 1ubd_1_1 8942976 2.5 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating YY1 Zinc Finger 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 C TIACPHKGCTkMfrDNsaMrkhLhthGPrVHVCAECGkafvesskLkrhQlvHTGEkPFQCTFEGCGkrfsldfnLrthVRiHTGDRPyVCPFDGCNkKfaqstnLkshILtHA A;B AgggtctccatttTGAAGCG;CGCttcaaaatggagaCCCT 236 415 251 102;0;149;0 8;1;3;3;9;0;0;0;3;10;1;0;0;0;0;10;1;19;29;154 1XBR 1xbr_1_1 9349824 2.5 XENOPUS LAEVIS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet T Box, Protein T 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B ELKVSLEERDLWTRFKELTNEMiVtknGrrmfPVLKVSMSGLDPNAMYTVLLDFVAADNHrwkyVNGEWVPGGKPEPQAPSCVYIHPDSPNFGAHWMKDPVSFSKVkLTnkMNGGGQIMLNslHKYEPRIHIVRVGGTQRMITSHSFPETQFIAVtayqNeEItALkiKHnpfakafLdAKErN;ELKVSLEERDLWTRFKELTNEMiVtknGrrmfPVLKVSMSGLDPNAMYTVLLDFVAADNHrwkyVNGEWVPGGKPEPQAPSCVYIHPDSPNFGAHWMKDPVSFSKVkLTnkMNGGGQIMLNslHKYEPRIHIVRVGGTQRMITSHSFPETQFIAVtayqNEEItALkiKHnpfakafLdAKEr C;D AatttcACacctaggtgtgAAATT;AatttcACacctaggtgtgAAATT 162 391 417 47;27;343;0 2;0;2;0;0;0;2;0;14;8;8;0;0;0;0;3;5;26;94;253 1YO5 1yo5_1_1 15882048 2 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Ets Domain, PDEF 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 C QpihlWQFLKELLLKPHSYGRFIRWLNKEKGIFKIEDsAQVARLwGIRkNrPamNydklsrsIrqyykkGiIRkPDIsQrlVyQFVHP A;B tagcaggatGtgt;ACacatccTGCta 243 378 221 54;7;159;1 6;1;3;0;3;0;1;0;5;4;4;0;0;0;0;3;1;10;45;135 1YRN 1yrn_1_1 7569974 2.5 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Mat Alpha 2 1 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 2 2 2 1 A;B iSPQArAFLeQVFRRKQslnsKEkEEVAKKCGITPlqVrvwFinKrmrS;TKpyrghrfTkENvRILESWFAKNIENPylDTKGLENLMKNTSLSriqIknwVsnRrrkEkTiTIAPELADLLSGEPL C;D TacatgtaatttattacatCA;TAtgatgTAATAAattacaTG 121;123 376 346 78;28;240;0 8;1;11;1;5;1;0;1;23;3;7;0;0;0;0;4;1;18;56;206 1YTF 1ytf_1_1 8610010 2.5 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 1 0 1 0 0 0 Transcription factor Beta Sheet TATA Box Binding Protein 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 1 4 2 0 1 A;B;C;D SGIVPTLqnIvAtVTLGCrLDLKTVALHARNAeYNPKrfaAViMrIREPkTtAlIfasGkMvVtgAkSEDDSKLASRKYARIIQKIGFAAKFTDFKIqnIvgsCDVKFPIRLEGLAFSHGTFSSYEpelfpGLiYrMVKPkIvLlIfvsGkivLtgAkQREEIYQAFEAIYPVLSEFRKM;SNAEASRVYEIIVESVVNEVREDFENAGIDEQTLQDLKNIWQKKLT;ENLMLCLYDKVtrtkArWkCSLKDGVVTINRNDYTFQKAQVEAEWV;GYYELYRRSTIGNSLVDALDTLISDGRiEAsLAmRVLETFDKVVAETLKDNTQSKLTVKGNLDTYGFCddVWtFIVKNCQVtvESVISvdklrIvACNSK E;F TGTAtgtAtataaaac;gttttatataCATACA 6;120;205;207 375 326 2;63;259;2 2;1;2;0;0;0;1;1;13;9;1;0;0;0;0;0;0;31;81;184 1ZAA 1zaa_1_1 2028256 2.1 MUS MUSCULUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zif268 Zinc Finger 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 C rPYACPVESCDrRfsrsdeLtrhIriHTGQkPfQCRICMrnfsrsdhLtthIrtHTGEkPfACDICGrkfarsderkrhTKIHLR A;B agcgtgggcgt;tacgcccacgC 19 137 229 98;0;130;1 10;1;12;0;9;0;1;0;3;12;1;0;0;0;0;6;1;26;21;126 1ZG1 1zg1_1_1 16262254 2.3 ESCHERICHIA COLI 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Response Regulator Protein NARL 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B RDVNQLtprERDILKLIAQGLpnkIARRLDitestVkvhvkhlkKKlksrVEAAVWVHQERIF;RDVNQLtprERDILKLIAQGLpnkIARRLditestVkvhvkhlkKKlksrvEAAVWVHQERIF C;D cgtactCCTTaatgggtACG;cgtaccCATTaaggagtACG 32 6 303 79;0;224;0 6;0;4;0;0;0;2;0;6;18;11;0;0;0;0;1;4;15;43;193 1ZG1 1zg1_2_1 16262254 2.3 ESCHERICHIA COLI 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Response Regulator Protein NARL 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 E;F RDVNQLtprERDILKLIAQGLpnkIARRLditestVkvhvkhlkKKlksrvEAAVWVHQERIF;RDVNQLtprERDILKLIAQGLpnkIARRLDitestVkvhvkhlkKKlksrVEAAVWVHQERIF G;H cgtaccCATTaaggagtACG;cgtactCCTTaatgggtACG 32 6 306 84;0;222;0 7;0;5;0;0;0;2;0;6;16;11;0;0;0;0;1;4;15;44;195 1ZG5 1zg5_1_1 16262254 2.3 ESCHERICHIA COLI 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Response Regulator Protein NARL 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B RDVNQLtprERDILKLIAQGLpnkIARRLDitestVkvhvkhlkKKlksrVEAAVWVHQERIF;RDVNQLtprERDILKLIAQGLpnkIARRLditestVkvhvkhlkKKlksrVEAAVWVHQERIF C;D cgtaccCCTAtaggggtACG;cgtaccCCTAtaggggtACG 32 6 303 81;0;222;0 10;0;6;0;0;0;2;0;6;18;11;0;0;0;0;1;4;15;45;185 1ZG5 1zg5_2_1 16262254 2.3 ESCHERICHIA COLI 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Response Regulator Protein NARL 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 E;F ERDVNQLtprERDILKLIAQGLpnkIARRLDitestVkvhvkhlkKKlksrvEAAVWVHQERIF;RDVNQLtprERDILKLIAQGLpnkIARRLDitestVkvhvkhlkKKlksrVEAAVWVHQERIF G;H cgtacCCCTAtaggggtACG;cgtacCCCTAtaggggtACG 32 6 304 79;0;225;0 10;0;6;0;0;0;2;0;7;17;11;0;0;0;0;0;4;15;49;183 1ZME 1zme_1_1 9303004 2.5 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating GAL4 Type, Put3 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 1 2 1 1 1 C;D svaCLSCrKrhikcPGGNPCQKCVTSNAICEYLEPSKkIvVStKYlqQLqKDLNDKTEENNRLKALLLER;svaCLSCrkrhikcPGGNPCQKCVTSNAICEYlepskkivvsTKyLQQLQKDLNDKTEENNRLKALLLER A;B AcggGAAGccaactccG;AcggAGtggctcccg 196 373 261 63;24;174;0 3;0;1;0;0;0;10;0;8;6;9;0;0;0;0;0;4;6;53;161 1ZRF 1zrf_1_1 16427082 2.1 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Catabolite Gene Activator Protein 1 1 1 0 2, 1 0 2 0 0 0 2 1 2 1 A;B TDPTLEWFLSHCHIHKYPskSTLIHQGEKAETLYYIVKGSVAVLIKDEeGkEMILSYLNQGDFIGELGLFEEGQERSAWVRAKTACEVAEISYKKFRQLIQVNPDILMRLSAQMARRLQVTSEKVGNLAFLdvtGRIAQTLLNLAKQPDAMTHPDGMQIkItrqeIGQIVgcsretVgriLkMLEDQNLISAhgktIVVYGTR;DPTLEWFLSHCHIHKYPskSTLIHQGEKAETLYYIVKGSVAVLIKDEeGkEMILSYLNQGDFIGELGLFEEGQERSAWVRAKTACEVAEISYKKFRQLIQVNPDILMRLSAQMARRLQVTSEKVGNLAFLdvtGRIAQTLLNLAKQPDAMTHPDGMQIkItrqEIGQIVgcsretVgriLkMLEDQNLISAhgktIVVYG W;X;Y;Z TTCGAAAaatgcgaT;CTagatcgCATTtttcGAAAT;TTTCGAAAaatgcgAT;CTagatcgCATTtttcGAAAT 62 371 269 61;0;208;0 6;2;6;0;4;0;0;0;3;13;18;0;0;0;0;6;0;24;28;159 1ZS4 1zs4_1_1 16039594 1.7 BACTERIOPHAGE LAMBDA 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Repressor Protein CII 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 1 0 2 1 2 1 A;B GSHMANKRNEALRIESALLNKIAMLgtekTAEAVgvdksqIsrwkrdwIPKFSMLLAVLEWGVVDDDMARLARQVAAILTNK;GSHMANKRNEALRIESALLNKIAMLGTEKTAEAVGVDKSqISrWKrdwIPkFSMLLAVLEWGVVDDDMARLARQVAAILTNK T;U TATTCGTGCAAACAAacgcaaCGAGGT;TACCTcgttgcGTTTgttTGCACGAAT 96 370 124 51;0;73;0 3;1;3;1;3;0;0;0;6;3;4;0;0;0;0;4;2;12;18;64 1ZS4 1zs4_1_2 16039594 1.7 BACTERIOPHAGE LAMBDA 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Repressor Protein CII 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 1 0 2 1 2 1 C;D ANKRNEALRIESALLNKIaMLgtekTAEAVgvdksqIsrwkrdwIPKFSMLLAVLEWGVVDDDMARLARQVAAILTNKK;RNEALRIESALLNKIAMLGTEKTAEAVGVDKSqISrWKrdwIPkFSMLLAVLEWGVVDDDMARLARQVAAILT T;U TATtcgtgcaaACAAACGCAACGAGGT;TACCTCGTTGCGTTTgtttgcACGAat 96 369 147 58;2;87;0 4;1;4;0;2;0;0;0;8;4;5;0;0;0;0;6;2;12;26;73 2A07 2a07_1_1 16407075 1.9 HOMO SAPIENS 2 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Forkhead Box Protein P2 1 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 2 1 0 1 F;G VRPPFTYATLIRQAIMESSDRQLTLNEIYSWFTRTFAyFRrNAAtWKnaVrhnLslhKCFVRVENVKGAVWTVDEVEYQkrR;PftyaTLIRQAIMESSDRQLTLNEIYSWFTRTFAYFRRNAATWKNAVRHNLSLHKCFVRVENVKGAVWTVDEVEYQKRR A;B AACTAtgaaaCAAATTTTCCT;TTAGGAAAAtttgtttCATAG 55 78 94 26;0;68;0 2;0;2;0;0;0;0;0;3;3;2;0;0;0;0;2;0;5;9;66 2A07 2a07_1_2 16407075 1.9 HOMO SAPIENS 2 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Forkhead Box Protein P2 1 2 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 1 0 0 1 J IVrPPftyaTLIRQAIMESSDRQLTlnEIySWFTRTFAYFRRNAAtWKnaVrhnLslhkCFVrVeNVKGaVwTVDEVEYQKrr A;B AACTATGaaacaaATTTtcCT;TTAGGAAaatttgTTTCATAG 55 77 126 45;0;81;0 2;0;0;0;1;0;0;0;4;3;4;0;0;0;0;1;2;9;23;77 2A07 2a07_2_1 16407075 1.9 HOMO SAPIENS 2 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Forkhead Box Protein P2 2 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 2 1 0 1 H;I PftyaTLIRQAIMESSDRQLTLNEIYSWFTRTFAYFRRNAATWKNAVRHNLSLHKCFVRVENVKGAVWTVDEVEYQKRR;VRPPFTYATLIRQAIMESSDRQLTLNEIYSWFTRTFAyFRrNAAtWKnaVrhnLslhKCFVrVENVKGAVWTVDEVEYQKr C;D AACTAtgaaACAAATTTTCCT;TTAGGAAAATttgtttCATAG 55 78 87 24;0;63;0 2;0;2;0;0;0;0;0;3;3;2;0;0;0;0;2;0;5;9;59 2A07 2a07_2_2 16407075 1.9 HOMO SAPIENS 2 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Forkhead Box Protein P2 2 2 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 1 0 0 1 K IVrPPftyATLIRQAIMESSDRQLTlnEIySWFTRTFAYFRRNAAtWKnaVrhnLslhKCFVrVeNVKGaVwTVDEVEYQKrr C;D AACTATGaaacaaATTTtcCT;TTAGGAAaatttgTTTCATAG 55 77 127 44;0;83;0 2;0;0;0;1;0;0;0;4;3;4;0;0;0;0;1;2;9;24;77 2A66 2a66_1_1 16289203 2.2 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Hormone Nuclear Receptor, Orphan Nuclear Receptor NR5A2 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A ELCPVCGdKVSGyhyGLLTCesCkgfFkrTVqNNkRyTCIENQNCQIDkTQrkRCpYCrFQKCLSVGMKLEavrADrmrggrnKFgpMyKRDRAL B;C GTtcaaggcCAG;ctggccttgaac 241 366 237 40;29;167;1 7;0;8;0;2;2;1;1;16;0;5;0;0;0;0;1;0;12;36;146 2AC0 2ac0_1_1 16793544 1.8 HOMO SAPIENS 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Loop Sheet Helix, Tumor Supressor Protein p53 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 1 0 2 1 1 1 A;B SSSVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGTaksvtCTYSPALNKMFCqLAkTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnssCmGGMnrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcacPGrdRRtEEEnLRKK;SSSVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGtaksVTCTYSPALNKMFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnSsCmGGMNrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcacPgrdRrtEEEnLRK E;F cgggCatgccCg;cgggCatgccCG 8 365 213 61;8;138;6 7;1;7;1;2;0;0;0;13;3;7;0;0;0;0;3;1;17;34;117 2AC0 2ac0_2_1 16793544 1.8 HOMO SAPIENS 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Loop Sheet Helix, Tumor Supressor Protein p53 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 C;D SVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGTaksVTCTYSPALNKMFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnssCmGGMnrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcacPGrdRrtEEEnLR;SVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGTaksvTCTYSPALNKMFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnSsCmGGMnrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcacPGrdRrtEEEnLRKKG G;H cgggCatgccCG;cgggCatgccCG 8 364 179 52;3;124;0 7;2;8;1;1;0;0;0;10;3;5;0;0;0;0;2;0;17;25;98 2ADY 2ady_1_1 16793544 2.5 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Loop Sheet Helix, Tumor Supressor Protein p53 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 1 0 2 1 1 1 A;B SSVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGTaksVTCTYSPALNKMFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnssCmGGMnrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcacPGrdRrtEEEnLRKK;SSSVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGtaksVTCTYSPALNKMFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnSsCmGGMNrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcacPGrdRrtEEenLRK E;F cggaCatgtcCG;cggaCatgtcCG 8 363 186 56;3;125;2 6;1;8;1;0;1;0;2;10;3;5;0;0;2;0;4;0;16;28;99 2AHI 2ahi_1_1 16793544 1.85 HOMO SAPIENS 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Loop Sheet Helix, Tumor Supressor Protein p53 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SSVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGTaksvtCTYSPALNKMFCqLAkTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHhERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnssCmGGMnrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcacPGrdRRtEEEnLRKKG;SSSVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGTakSVTCTYSPALNKMFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnssCmGGMnrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcacPGrdRRtEEEnLRK E;F cggaCatgtC;gGACatgtcCG 8 361 185 34;10;141;0 13;0;4;0;0;0;0;0;19;2;6;0;0;2;0;2;0;12;25;100 2AHI 2ahi_2_1 16793544 1.85 HOMO SAPIENS 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Loop Sheet Helix, Tumor Supressor Protein p53 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 C;D SVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGTaksvTCTYSPALNKMFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnssCmGGMnrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcacPGrdRRtEEEN;SVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGTaksVTCTYSPALNKMFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnssCmGGMnrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcacPGrdRrtEEEnLRK G;H cggaCatgtCCG;cggaCatgtcCG 8 360 191 56;10;125;0 12;2;8;1;1;0;0;0;16;2;8;0;1;2;0;3;0;13;23;99 2ATA 2ata_1_1 16793544 2.2 HOMO SAPIENS 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Loop Sheet Helix, Tumor Supressor Protein p53 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGTaksVTCTYSPALNKMFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHhERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnssCmGGMnrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcacPGrdRRtEEEnLRKK;SSSVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGTaksVTCTYSPALNKMFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnssCmGGMnrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcacPGrdRRtEEEnLRKK E;F aaggCatgcc;aggCatgccTT 8 353 185 46;12;127;0 15;1;7;0;1;0;0;0;15;2;5;0;2;0;0;2;0;12;26;97 2ATA 2ata_2_1 16793544 2.2 HOMO SAPIENS 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Loop Sheet Helix, Tumor Supressor Protein p53 2 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 C;D SVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGTaksVTCTYSPALNKMFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnssCmGGMnrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcacPGrdRRtEEEnLRK;SSSVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGTaksVTCTYSPALNKMFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnssCmGGMnrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcacPGrdRrtEEENLRK G;H aaggCatgccTT;aaggCatgccT 8 352 177 50;7;120;0 8;2;5;1;4;0;0;0;6;3;4;0;0;0;0;2;0;13;26;103 2BNW 2bnw_1_1 16528102 2.45 STREPTOCOCCUS PYOGENES 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Ribbon|Helix|Helix Omega Repressor 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B DIMGdktvrVRADLhHIIkIETAKNGGnvkeVMDQALEEYIRKYLPDKL;MAKKdImGdktvrVRADLhHIIkIETAKNGgnvkeVMDQALEEYIRKYLPDKL E;F GaatcaCAAatcACAAGC;CTTGTGATttgtgaTTCG 107 346 159 57;0;102;0 3;1;3;2;2;0;0;0;1;0;7;0;0;0;0;3;2;10;24;101 2BNW 2bnw_1_2 16528102 2.45 STREPTOCOCCUS PYOGENES 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Ribbon|Helix|Helix Omega Repressor 1 2 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 C;D MAKKDIMGdktvrVRADLhHIIkIETAKNGgnvkEVMDQALEEYIRKYLPDKL;MGdktvrVRADLhHIIkIETAKNGGnvkEVMDQALEEYIRKYLPDKL E;F GAATCACAaatcaCAAGC;CTtgtgaTTTgtGATTCG 107 345 154 61;0;93;0 3;1;3;2;2;0;0;0;4;0;8;0;0;0;0;3;2;10;28;88 2BOP 2bop_1_1 1328886 1.7 BOVINE PAPILLOMAVIRUS TYPE 1 1 1 1 1 0 0 1 Transcription factor Alpha|Beta Regulatory Protein E2 1 1 1 2 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;D SCFALISGtanqVkcyrfrVkknhRHRYENCTttWfTvAdNgaErQGQAQILITFGSPSQRQDFLKHVplppGmNISGFTASLDF;SCFALISGtanqVkcyrfrVkknhRHRYENCTttWfTvAdNgaErQGQAQILITFGSPSQRQDFLKHVplppGmNISGFTASLDF B;E ccgacCGACgtcggtcG;ccgacCGACgtcggtcG 183 344 328 78;0;250;0 8;0;4;0;4;0;0;0;12;6;8;0;4;2;0;2;0;18;60;200 2C6Y 2c6y_1_1 0 2.4 HOMO SAPIENS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Forkhead Box Protein K2 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A DSkPPysyaQLIVQAITMAPDKQLTlnGIyTHITKNYPYYRTADkgWQnsIrhnLslnryFIkVPRSQEEpgkgsFwRIDPASESKLIEqAFRKrrPr C;D TGttgtaaaCAAtacA;ATGTattgtttaCAac 174 340 198 52;8;138;0 4;0;4;0;0;0;0;0;13;4;6;0;0;0;0;2;3;8;38;116 2C6Y 2c6y_1_2 0 2.4 HOMO SAPIENS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Forkhead Box Protein K2 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B DSkPPysyAQLIVQAITMAPDKQLTlnGIyTHITKNYPYYRTADkgWQnsIrhnLslNRYFIkVPRSQEEPgkgsFwRIDPASESKLIEQAFRKrR C;D TGTTGTAAacaatacA;atgtatTGTTTACAAC 174 339 114 42;0;72;0 1;0;2;0;0;0;0;0;2;5;2;0;0;0;0;2;1;5;17;77 2C7A 2c7a_1_1 16931575 2.5 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Hormone Nuclear Recpetor, Progesterone Receptor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B PQKICLICGdEAsgchyGVLTCgsCkvfFkrAMEGQhNyLCAGRNDCIVDkIRrkNCpACrLRKCCQAGMVlggrkFK;PQKICLICGdEAsgchyGVLTCgsCkvfFkrAMEGQHNyLCAGRNDCIVDKiRrkNCpACrLRKCCQAGMVLggrKF C;D ccagaaCAGTttgttCTg;ccagaaCAAActgttCTg 56 338 268 56;8;204;0 5;0;12;0;0;0;0;0;10;0;12;0;0;0;0;2;2;22;37;166 2C9L 2c9l_1_1 16483937 2.25 HUMAN HERPESVIRUS 4 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, BZLF1 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 Y;Z MlEIkrYknrVaarksrAkfkQLLQHYREVAAAKSSENDRLRLLLKQMCPSLDVDSIIPRTPD;LEiKrYknrVaarksrAkFkQLLQHYREVAAAKSSENDRLRLLLKQMCPSLDVDSIIPRTPD A;B AAGCactgactcatGAAGT;ACTtcatgagtcaGTGCT 199 334 187 65;0;122;0 4;0;5;0;4;0;0;0;1;4;1;0;0;0;0;4;4;24;38;98 2CGP 2cgp_1_1 9096308 2.2 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Catabolite Gene Activator Protein 1 1 1 0 4, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A DPTLEWFLSHCHIHKYPSkSTLIHQGEKAETLYYIVKGSVAVLIKDEEGkEMILSYLNQGDFIGELGLFEEGQERSAWVRAKTACEVAEISYKKFRQLIQVNPDILMRLSAQMARRLQVTSEKVGNLAFLDvTGRIAQTLLNLAKQPDAMTHPDGMQIkItrqEIGQIVgcsretVGrILkMLEDQNLISAHgkTIVVYG B;C gtcaCATTaat;ATTaatgtgaCATAT 62 333 109 39;0;70;0 2;0;6;0;2;0;0;0;6;3;3;0;0;0;0;4;1;8;14;60 2D5V 2d5v_1_1 17223534 2 RATTUS NORVEGICUS 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, HNF-6 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A MEEINTKEVAQRItTELkRYsipqaIFAQRVLcrsqgtLsdlLrnPkPWSklksgREtFRRMWKWLQEPEFQRMSALRLprlvfTDVQrRTLhAIFKENKrPSkELqITISQQLGLElstVsnfFmnArrrSLDk C;D TctaagtcaataAT;AttattgacTtaG 169 331 275 85;8;182;0 10;1;10;0;4;0;0;0;14;9;7;0;0;0;1;8;3;18;28;162 2D5V 2d5v_2_1 17223534 2 RATTUS NORVEGICUS 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, HNF-6 2 1 1 0 2, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B MEEINTKEVAQRITTELkRYsipqaIFAQRVLcrsqgtLsdlLrnPkPWSklksgREtFRRMWKWLQEPEFQRMSALRLprlvfTDVQrRTLhAIFKENKrPSkELqITISQQLGLELstVsnfFmnArrrSLDk E;F tctaagtcaataAT;AttattgacTTA 169 330 272 73;8;189;2 8;1;7;0;4;1;0;0;13;9;8;0;0;0;0;7;2;15;30;167 2DGC 2dgc_1_1 7500340 2.2 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 1 1 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, GCN4 1 1 1 2 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;D ALkrArntEaarrsrArklQrMKQLEDKVEELLSKNYHLENEVARLKKL;ALkrArntEaarrsrArklQrMKQLEDKVEELLSKNYHLENEVARLKKL B;E TGGAgatgacgtcaTCTCC;TGGAgatgacgtcaTCTCC 206 329 172 62;0;110;0 6;0;2;0;4;0;0;0;6;6;0;0;0;0;0;6;4;42;26;70 2E1C 2e1c_1_1 18073105 2.1 PYROCOCCUS HORIKOSHII 1 1 1 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Transcriptional Regulator PH1519 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A PLDEIDKKIIKILQNDGkaplrEISKITglaestIherIrkLRESGVIKKFTAIIDPEALGYSMLAFILVKVKAGKYSEVASNLAKYPEIVEVYETTGDYDMVVKIRTKNSEELNNFLDLIGSIPGVEGTHTMIVLKTHKETTELPI B;D agtgaaAATTttTCACA;TGTGAAAAAttttcACT 226 322 97 43;0;54;0 0;1;0;1;2;0;0;1;0;1;2;0;0;0;0;6;2;4;24;53 2E42 2e42_1_1 0 1.8 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, C|EbpBeta 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B DkHSDeyKIrrErnnIaarksrdkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFK;DkHSDEyKIrrernnIaarksrDkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQL C;D TaggattgcgcaaTAT;aatattgcgcaaTCCT 23 321 232 95;0;137;0 8;0;7;0;2;0;0;0;11;5;0;0;0;0;0;4;5;29;33;128 2E43 2e43_1_1 0 2.1 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, C|EbpBeta 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SDeyKirrErnnIavrksrdkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFK;SDEyKIrrernnIavrksrDkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQL C;D TAggattgcgcaaTAT;aatattgcgcaaTCCT 23 24 245 107;0;138;0 8;0;8;0;2;0;0;0;9;4;0;0;0;0;0;4;5;25;37;143 2ETW 2etw_1_1 16531239 1.67 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet NDT80 Protein 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A VILTQLNEDGTTSNYFDkRKlkiaprstLqfKVGPPFELVRDYCPVVESHTGRTLDLRIIPRIDrGFDHIDEEWVGykrnyFTLVSTFETANCDLDTFLKSSFDLLVEDSSVEGRLRVQYFAIKIKAKNDDDDTEINLVQHTakrdkGPqFCPSVCPLVPSPLPKHQTIreAsnvrnITkMKKYDSTFYLHRDHVNYEEYGVDSLLFSYPEDSIQKVARYErVQFAssISVKKPSQQNKHFSLHVILGAVVDPDPGIPYDELALKNGSKGMFVYLQEMKTPPLIIRGrspSNyAsSQ B;C gccacaCaaaaac;AGTTtttgtgtGGC 33 2 275 50;20;203;2 3;0;8;0;0;1;0;0;13;5;7;0;0;0;0;2;4;15;39;178 2EUV 2euv_1_1 16531239 1.94 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet NDT80 Protein 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A VILTQLNEDGTTSNYFDkRKlkiaprstLqfKVGPPFELVRDYCPVVESHTGRTLDLRIIPRIDrGFDHIDEEWVGykrnyFTLVSTFETANCDLDTFLKSSFDLLVGRLRVQYFAIKIKAKNDDDDTEINLVQHTakrdkGPqFCPSVCPLVPSPLPKHQTIreAsnvrnITkMKKYDSTFYLHRDHVNYEEYGVDSLLFSYPEDSIQKVARYErVQFAssISVKKPSQQNKHFSLHVILGAVVDPDGIPYDELALKNGSKGMFVYLQEMKTPPLIIRGrspSNyAsSQ B;C gcaacaCaaatac;GTAtttgtgtTG 33 2 278 53;21;202;2 3;0;10;0;0;1;0;0;12;7;7;0;0;0;0;2;4;12;44;176 2EUW 2euw_1_1 16531239 1.68 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet NDT80 Protein 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A VILTQLNEDGTTSNYFDkRKlkiaprstLqfKVGPPFELVRDYCPVVESHTGRTLDLRIIPRIDrGFDHIDEEWVGykrnyFTLVSTFETANCDLDTFLKSSFDLLVGRLRVQYFAIKIKAKNDDDDTEINLVQHTakrdkGPqFCPSVCPLVPSPLPKHQTIreAsnvrnITkMKKYDSTFYLHRDHVNYEEYGVDSLLFSYPEDSIQKVARYErVQFAssisvkKPSQQNKHFSLHVILGAVVDPDGIPYDELALKNGSKGMFVYLQEMKTPPLIIRGrspSNyAsSQ B;C gcgactCaaaaac;AGTTtttgagtCGC 33 2 277 54;22;198;3 5;0;9;0;0;1;1;0;11;6;8;0;0;0;0;2;3;12;43;176 2EUX 2eux_1_1 16531239 1.57 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet NDT80 Protein 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A VILTQLNEDGTTSNYFDkRKlkiaprstLqfKVGPPFELVRDYCPVVESHTGRTLDLRIIPRIDrGFDHIDEEWVGykrnyFTLVSTFETANCDLDTFLKSSFDLLVGRLRVQYFAIKIKAKNDDDDTEINLVQHTakrdkGPqFCPSVCPLVPSPLPKHQTIreAsnvrnITkMKKYDSTFYLHRDHVNYEEYGVDSLLFSYPEDSIQKVARYErVQFAssIsvkKPSQQNKHFSLHVILGAVVDPDGIPYDELALKNGSKGMFVYLQEMKTPPLIIRGrspSNyAsSQ B;C TgcgacgCaaaaac;AGTTtttgcgtCGC 33 2 277 58;23;193;3 6;0;9;0;0;1;1;0;11;6;9;0;0;0;0;2;4;12;42;174 2EUZ 2euz_1_1 16531239 1.56 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet NDT80 Protein 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A VILTQLNEDGTTSNYFDkRKlkiaprstLqfKVGPPFELVRDYCPVVESHTGRTLDLRIIPRIDrGFDHIDEEWVGykrnyFTLVSTFETANCDLDTFLKSSFDLLVGRLRVQYFAIKIKAKNDDDDTEINLVQHTakrdkGPqFCPSVCPLVPSPLPKHQTIreAsnvrnITkMKKYDSTFYLHRDHVNYEEYGVDSLLFSYPEDSIQKVARYErVQFAssisvKKPSQQNKHFSLHVILGAVVDPDGIPYDELALKNGSKGMFVYLQEMKTPPLIIRGrspSNyAsSQ B;C gcgacaTaaaaac;AGTTtttatgtCGC 33 2 267 48;19;199;1 6;0;9;0;1;1;1;0;11;6;7;0;0;0;0;2;4;16;41;162 2EVF 2evf_1_1 16531239 1.56 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet NDT80 Protein 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A VILTQLNEDGTTSNYFDkRKlkiaprstLqfKVGPPFELVRDYCPVVESHTGRTLDLRIIPRIDrGFDHIDEEWVGykrnyFTLVSTFETANCDLDTFLKSSFDLLVGRLRVQYFAIKIKAKNDDDDTEINLVQHTakrdkGPqFCPSVCPLVPSPLPKHQTIreAsnvrnITkMKKYDSTFYLHRDHVNYEEYGVDSLLFSYPEDSIQKVARYErVQFAssIsVkKPSQQNKHFSLHVILGAVVDPDGIPYDELALKNGSKGMFVYLQEMKTPPLIIRGrsPSNyAsSQ B;C gcgacaCtaaaac;AGTTttagtgtCGC 33 2 269 46;21;200;2 6;0;11;0;0;1;1;0;14;5;8;0;0;0;0;2;3;14;32;172 2EVG 2evg_1_1 16531239 1.55 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet NDT80 Protein 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A VILTQLNEDGTTSNYFDkRKlkiaprstLqfKVGPPFELVRDYCPVVESHTGRTLDLRIIPRIDrGFDHIDEEWVGykrnyFTLVSTFETANCDLDTFLKSSFDLLVGRLRVQYFAIKIKAKNDDDDTEINLVQHTakrdkGPqFCPSVCPLVPSPLPKHQTIreAsnvrnITkMKKYDSTFYLHRDHVNYEEYGVDSLLFSYPEDSIQKVARYErVQFAssiSvkKPSQQNKHFSLHVILGAVVDPDGIPYDELALKNGSKGMFVYLQEMKTPPLIIRGrsPSNyAsSQ B;C gcgacaCataaac;AGTTtatgtgtCGC 33 2 271 55;19;196;1 7;0;11;0;1;0;0;0;12;4;8;0;0;0;0;2;4;12;33;177 2EVH 2evh_1_1 16531239 1.99 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet NDT80 Protein 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A VILTQLNEDGTTSNYFDkRKlkiaprstLqfKVGPPFELVRDYCPVVESHTGRTLDLRIIPRIDrGFDHIDEEWVGykrnyFTLVSTFETANCDLDTFLKSSFDLLVGRLRVQYFAIKIKAKNDDDDTEINLVQHTakrdkGPqFCPSVCPLVPSPLPKHQTIreAsnvrnITkMKKYDSTFYLHRDHVNYEEYGVDSLLFSYPEDSIQKVARYErVQFAssisvkKPSQQNKHFSLHVILGAVVDPDGIPYDELALKNGSKGMFVYLQEMKTPPLIIRGrsPSNyAsSQ B;C gcgacaCagaaac;AGTTtctgtgtCGC 33 2 269 51;18;199;1 6;0;10;0;1;0;0;0;10;6;8;0;0;0;0;2;4;14;32;176 2EVI 2evi_1_1 16531239 1.8 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet NDT80 Protein 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A VILTQLNEDGTTSNYFDkRKlkiaprstLqfKVGPPFELVRDYCPVVESHTGRTLDLRIIPRIDrGFDHIDEEWVGykrnyFTLVSTFETANCDLDTFLKSSFDLLVGRLRVQYFAIKIKAKNDDDDTEINLVQHTakrdkGPqFCPSVCPLVPSPLPKHQTIreAsnvrnITkMKKYDSTFYLHRDHVNYEEYGVDSLLFSYPEDSIQKVARYErVQFAssiSvkKPSQQNKHFSLHVILGAVVDPDGIPYDELALKNGSKGMFVYLQEMKTPPLIIRGrsPSNyAsSQ B;C gcgacaCaataac;AGTTattgtgtCGC 33 2 271 52;22;196;1 6;0;10;0;0;1;0;0;12;6;7;0;0;0;0;2;4;13;38;172 2EVJ 2evj_1_1 16531239 1.89 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet NDT80 Protein 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A VILTQLNEDGTTSNYFDkRKlkiaprstLqfKVGPPFELVRDYCPVVESHTGRTLDLRIIPRIDrGFDHIDEEWVGykrnyFTLVSTFETANCDLDTFLKSSFDLLVGRLRVQYFAIKIKAKNDDDDTEINLVQHTakrdKGPqFCPSVCPLVPSPLPKHQTIreAsnvrnITkMKKYDSTFYLHRDHVNYEEYGVDSLLFSYPEDSIQKVARYErVQFAssiSvkKPSQQNKHFSLHVILGAVVDPDGIPYDELALKNGSKGMFVYLQEMKTPPLIIRGrsPSNyAsSQ B;C gcgacaCaaacac;AGTGtttgtgtCGC 33 2 277 49;21;205;2 4;0;12;0;1;1;0;0;9;5;8;0;0;0;0;2;4;13;38;180 2GEQ 2geq_1_1 16717092 2.3 MUS MUSCULUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Loop Sheet Helix, Tumor Supressor Protein p53 1 1 1 0 2, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B QKTYQGNYGFHLGFLQSvMCTYSPPLNKLFCQLAKTCPVQLWVSATPPAGSRVRAMAIYKKSQHMTEVVRRCPHHERCSDGDGLAPPQHLIRVEGNLYPEYLEDRQTFRHSVVVPYEPPEAGSEYTTIHYKYMCnssCmGGMNrRPILTIITLEDSSGNLLGRDSFEVrvcacPGrdRrtEEEnFRKK;QKTYQGNYGFHLGFLQSVmCTYSPPLNKLFCQLAKTCPVQLWVSATPPAGSRVRAMAIYKKSQHMTEVVRRCPhhERCSDGDGLAPPQHLIRVEGNLYPEYLEDRQTFRHSVVVPYEPPEAGSEYTTIHYKYMCnssCmGGMnrRPILTIITLEDSSGNLLGRDSFEVrvcacPGrdRRtEEEnFRKKE C;D CgTGAgCatgctCAC;GTgagCatgctCA 8 298 143 29;0;114;0 2;0;4;0;0;0;0;0;13;3;4;0;0;0;0;4;0;20;19;74 2H1K 2h1k_1_1 17315980 2.42 MESOCRICETUS AURATUS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Pdx1 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A rtrtayTRAQlLELeKEFLFNKyiSrPRrVELAVMLNLTERhIkiwFqnRrmkWkkEE C;D AGAaactcatTagag;TCTCtaatGAGTTTC 102 296 154 27;7;119;1 5;0;2;0;1;0;0;0;7;1;5;0;0;0;0;2;0;11;22;98 2H1K 2h1k_2_1 17315980 2.42 MESOCRICETUS AURATUS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Pdx1 2 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B NkrtrtayTrAQlLELeKEFLFNKyiSrPRrVELAVMLNLTErhIkiwFqnRrmkWkKEE E;F AGAaactcattagag;TCTCtaatgAGTTTC 102 295 189 31;14;143;1 5;0;3;0;2;0;1;0;12;1;3;0;0;0;0;2;0;15;31;114 2H27 2h27_1_1 16903784 2.3 ESCHERICHIA COLI 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Sigma E Factor 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A SHMLSEELRQIVFRTIESLpEdlRMAITLrELDGLsyeEIAAIMDcpvgtVrsrIfrArEAIDNKVQPLIR B;C CCcggaaCTTCG;CGaagttcCGG 194 67 144 59;0;84;1 3;2;4;0;0;0;1;0;3;3;2;0;0;0;0;0;1;12;30;83 2H27 2h27_2_1 16903784 2.3 ESCHERICHIA COLI 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Sigma E Factor 2 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 D MLSEELRQIVFRTIESLpEdlRMAITLrELDGLsyeEIAAIMDcpVgtVrsrIfrArEAIDNKVQPLIR E;F CCcggaaCTTCG;CGaagttcCGG 194 67 143 60;0;82;1 3;2;4;0;0;0;1;0;1;4;3;0;0;0;0;0;1;14;33;77 2H7H 2h7h_1_1 0 2.3 AVIAN SARCOMA VIRUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, v-jun 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B kAERkrMrnrIaasksrKrklERIARLEEKVKTLKAQNSELASTANMLREQVAQLKQK;kaERkrMrnrIaasksrKrklERIARLEEKVKTLKAQNSELASTANMLREQVAQLKQK X;Y CGTcgatgactcatCGACG;CGTcgatgagtcatCGACG 104 293 215 88;0;127;0 8;0;6;0;4;0;0;0;3;7;0;0;0;0;0;2;5;21;33;126 2HAN 2han_1_1 17426125 1.95 DROSOPHILA MELANOGASTER 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Hormone Nuclear Receptor, Glucocorticoid Receptor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 2 1 1 A;B KHLCSICGdrAsgkhygVYScegCkgfFkrTVrkDlTyACrENRNCIIDKRQrnrCqYCrYQKCLTCGMKREavqeer;RVQEELCLVCGdrAsgyhyNALTCegCkgfFrRSVTkSAVyCCkFGRACEMDMYMrrkCqECrLKKCLAVGMRPEcvvpEnqcAMkr C;D CAagggttCAatgcacTtgt;GACaagtgcAttgaaCCctT 46;244 292 340 76;2;262;0 8;0;8;0;3;0;2;0;24;0;13;2;0;0;0;1;1;37;27;214 2HAP 2hap_1_1 9886287 2.5 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Heme Activator Protein 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 C;D rkrnrIplrCTICrKrkvkcDkLRPHCQQCTktGVAHLCHYMEQTwAEEAEKELLKDNELKKLRERVKSLEKTLSK;krnriplrCTICrkrkvkcDkLRPHCQQCTKTGVAHLCHYMEqtwAEEAEKELLKDNELKKLRERVKSLEKTLSK A;B acgcTATtatcgcTATtagt;ACTaatagcgataatagcgT 57 291 318 67;18;233;0 8;0;11;0;0;0;6;0;11;0;19;0;0;0;0;0;5;15;48;195 2HDD 2hdd_1_1 9309220 1.9 DROSOPHILA MELANOGASTER 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Engrailed 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A rtafSSEQlARLKREFNENRylTERRrQQLSSELGLNEAqIkiwFknKrakIkkS C;D TTTTGCCATgtaatcCCCGGA;ATCCggggatTacatGGCAAA 35 290 133 30;8;95;0 7;0;6;0;1;0;0;0;8;2;3;0;0;0;0;0;0;9;19;78 2HDD 2hdd_1_2 9309220 1.9 DROSOPHILA MELANOGASTER 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Engrailed 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B krprTAFSSEQLARLKREFNENRylTeRRrQQLSSELGLNEAqIkiWFknKraKIk C;D TTTTGCCATGTAATCCccgga;atcCGGGGATTACATGGCAAA 35 289 95 22;2;71;0 3;0;2;0;1;0;0;0;2;0;2;0;0;0;0;0;0;10;16;59 2HOS 2hos_1_1 17240973 1.9 DROSOPHILA MELANOGASTER 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Engrailed 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A rtafSSEQlARLKREFNENRylTeRRrQQLSSELGLNEAqVkgwFknMrakIkkST C;D TTTTGCCATgtaatcCCCGGA;ATCCggggatTacatGGCAAA 35 283 122 22;10;90;0 4;0;5;0;1;0;0;0;4;2;2;0;0;0;0;0;0;9;16;79 2HOS 2hos_1_2 17240973 1.9 DROSOPHILA MELANOGASTER 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Engrailed 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B krprTAFSSEQLARLKREFNENRylTeRRrQQLSSELGLNEaqVkgWFknMraKIkKS C;D TTTTGCCATGTAATCcccgga;atcCGGGGATTACATGGCAAA 35 64 78 17;1;60;0 3;0;2;0;0;0;0;0;2;0;2;0;0;0;0;0;0;6;12;51 2HOT 2hot_1_1 17240973 2.19 DROSOPHILA MELANOGASTER 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Engrailed 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A rtafSSEQlARLkREFNENRylTeRRrQQLSSELGLNEaqVkgwFknMrakIkkST C;D TTTTGCCATgtaatCCCCGGA;ATCCggggatTacatGGCAAA 35 282 122 24;6;92;0 3;0;3;0;1;0;0;0;8;1;4;0;0;0;0;0;0;10;15;77 2HOT 2hot_1_2 17240973 2.19 DROSOPHILA MELANOGASTER 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Engrailed 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B krprTAFSSEQLARLKREFNENRylTeRRrQQLSSELGLNEaqVkgWFknMraKIkkS C;D TTTTGCCATGTAATCcccgga;atcCGGGGATTACATGGCAAA 35 64 77 16;1;60;0 3;0;2;0;0;0;0;0;1;0;2;0;0;0;0;0;0;7;14;48 2I13 2i13_1_1 16963084 1.96 MUS MUSCULUS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zinc Finger, Aart 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A fsrsdhLaEhQrtHkPyKCPECGksfsDkkdLTrhQrtHTGEkPyKCPECGksfsqranLrAhQrtHTGEkPyACPECGKsfsqlahLRahQRtHTGEkPyKCPECGksfsrednLhthQrtHTGEkPyKCPECGksfsrrdaLnvhQrtH C;D Cagatgtagggaaaagcccggg;gcccgggcttttccctacATCT 165 62 427 173;0;254;0 20;1;12;0;12;1;0;0;7;15;4;0;0;0;0;9;0;27;51;268 2I13 2i13_2_1 16963084 1.96 MUS MUSCULUS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zinc Finger, Aart 2 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B kPYACPECGksfsrsdhLaehQrtHTGEkPyKCPECGksfsdkkdLtrhQrtHTGEkPyKCPECGksfsqranLrahQrtHTGEkPyACPECGKsfsqlahLRAhQRtHTGEkPyKCPECGKsfsrednLhthQrtHTrrdaLn E;F CAgatgtagggaaaagcccggg;gcccgggcttttccctacATCT 165 62 404 167;1;236;0 17;0;12;0;18;1;0;0;7;20;4;0;0;0;0;11;1;24;46;243 2IRF 2irf_1_1 10487755 2.2 MUS MUSCULUS 3 2 1 3 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Interferon Regulatory Factor 2 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 1 1 0 0 1 G RMrmRPWLEEQINSNTIPGLKWLNKEKKIFQIPWMHAARHGWDVEKDAPLFRNwAIHtGkHQPGIDKPDPKtWKanFRcaMNslpDIEEVKDRSIKKGNNAFRVYRMLP A;F AAGTgAaAGGA;TTCACTTTCact 52 59 59 9;1;49;0 0;0;0;0;0;0;0;0;2;1;1;0;0;1;0;1;1;1;15;36 2IRF 2irf_1_2 10487755 2.2 MUS MUSCULUS 3 2 1 3 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Interferon Regulatory Factor 2 1 2 1 0 1, 0 0 0 0 0 1 1 0 0 1 H rMrmRPWLEEQINSNTIPGLKWLNKEKKIFQIPwmhaaRHGwDVEKDAPLFRNwAIHtGkHQPGIDKPDpktWkanFrcaMnslpDIEEVkDRSIkkGNNAFrVYRMLP A;F aagtgaaAGgA;TTCactttCACt 52 34 164 38;3;123;0 4;0;3;0;0;0;1;0;10;2;4;0;1;2;0;4;2;10;32;89 2IRF 2irf_2_1 10487755 2.2 MUS MUSCULUS 3 2 1 3 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Interferon Regulatory Factor 2 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 1 1 0 0 1 I rMrmRPWLEEQINSNTIPGLKWLNKEKKIFQIPWMHAARHGWDVEKDAPLFRNwAIHtGkHQPGIDKPDPKtWKanFRcaMNslpDIEEVKDRSIKKGNNAFRVYRMLP B;E AAGTgAaAGGA;TCACTTTcact 52 59 59 9;2;48;0 0;0;1;0;0;0;0;0;3;1;3;0;0;1;0;1;1;1;13;34 2IRF 2irf_2_2 10487755 2.2 MUS MUSCULUS 3 2 1 3 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Interferon Regulatory Factor 2 2 2 1 0 0, 0 0 0 0 0 1 1 0 0 1 J rMrmRPWLEEQINSNTIPGLKWLNKEKKIFQIPwmhaaRHGWDVEKDAPLFRNwAIHtGkHQPGIDKPDPktWkanFrcaMnslpDIEEVkDRSIkkGNNAFrVYRMLP B;E aagtgaaAGGA;TCactttCACt 52 34 165 35;5;125;0 2;0;1;0;0;0;1;0;10;1;5;0;1;3;0;4;2;13;32;90 2IRF 2irf_3_1 10487755 2.2 MUS MUSCULUS 3 2 1 3 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Interferon Regulatory Factor 2 3 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 1 1 0 0 1 K rMrmRPWLEEQINSNTIPGLKWLNKEKKIFQIPWMHAARHGWDVEKDAPLFRNwAIHtGkHQPGIDKPDPKtWKanFRcaMNslpDIEEVKDRSIKKGNNAFRVYRMLP C;D AAGTGAAAGGA;TTCACTTTCact 52 269 54 9;0;45;0 0;0;0;0;0;0;0;0;4;1;2;0;0;1;0;1;1;2;11;31 2IRF 2irf_3_2 10487755 2.2 MUS MUSCULUS 3 2 1 3 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Interferon Regulatory Factor 2 3 2 1 0 1, 0 0 0 0 0 1 1 0 0 1 L RMrmRPWLEEQINSNTIPGLKWLNKEKKIFQIPwmhaaRHGwDVEKDAPLFRNwAIHtGkHQPGIDKPDPktWkanFrcaMnslpdIEeVKDRSIkKGNNAFrVYRMLP C;D aagtgaaAGgA;TTCactttCACt 52 34 150 36;3;111;0 3;0;2;0;0;0;1;0;7;1;4;0;1;2;0;3;2;9;32;83 2ISZ 2isz_1_1 17209554 2.4 MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Repressor IdeR 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B mnElVdttEMyLRTIYDLEEEGVTPlrarIAeRLdqsgptVsqtVsrMErDGLLRVAGDrHLELTEKGRALAIAVMRKHRLAERLLVDVIGLPWEEVHAEACRWEHVMSEDVERRLVKVLNNPTTSPFGNPIPGLVELGV;mnElVdttEMyLRTIYDLEEEGVTPlrarIAeRLdqsgptVsqtVsrMErdGLLRVAgdrHLELTEKGRALAIAVMRKHRLAERLLVDVIGLPWEEVHAEACRWEHVMSEDVERRLVKVLNNPTTSPFGNPIPGLVELGV E;F CCCTGTTagcacaGGCTgccctaATTTtaGTGG;CACTAaaattagGGCagcctgTGCtAACAGGGC 83 266 296 65;6;225;0 3;0;4;0;4;1;1;0;22;22;14;0;0;0;0;11;0;22;38;154 2ISZ 2isz_1_2 17209554 2.4 MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Repressor IdeR 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 C;D mnElVDttEMyLRTIYDLEEEGVTPlrarIAERLdqsgptVsqtVSrMErDGLLRVAGDrHLELTEKGRALAIAVMRKHRLAERLLVDVIGLPWEEVHAEACRWEHVMSEDVERRLVKVLNNPTTSPFGNPIPGLVELGV;mnElVdttEMyLRTIYDLEEEGVTPlrarIAeRLdqsgptVsqtVSrMErDGLLRVAGDrHLELTEKGRALAIAVMRKHRLAERLLVDVIGLPWEEVHAEACRWEHVMSEDVERRLVKVLNNPTTSPFGNPIPGLVELGV E;F CCctgttagCAcaggctgCCCtAATTTTAGTGG;CACTAAAATTAgggcagCCTgtgctaACAGGGC 83 265 270 61;3;206;0 1;0;2;0;0;0;0;0;18;18;13;0;0;0;0;8;0;22;36;152 2NLL 2nll_1_1 7746322 1.9 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Hormone Nuclear Receptor, Retinoic Acid Receptor 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 1 2 2 2 1 A;B CAICGdRSsgkhyGVYSCegCkgfFkrTVrkDLTyTCRDNKDCLIDkRQrnrCqYCrYQKCLAMGM;DELCVVCGdkAtGyhyrCITcegCkgfFrrTIqkNlHPSySCKYEGKCVIDKVTrnQCqECrFKKCIYVGMATDlvlDDSKrLAkrKliEEnrEkRRREELEK C;D caggtCATTcaggtCAG;ctgacctgaaatgacCTG 238;252 257 291 69;3;219;0 11;0;9;0;3;0;2;0;26;0;9;0;0;0;0;2;1;28;36;164 2O49 2o49_1_1 17652321 2 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Trasncription Factor SATB1 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A EVSSEIYQWVrDElKRAgisqaVFArVAFnrtqglLseiLrKEEDPKTASQsLLVnLRAMQNFLQLPEAERDRIYQDErERslR B;C gctaaTATATGC;GCAtatattAGC 185 54 126 38;0;88;0 1;1;0;0;2;1;0;0;5;6;3;0;0;0;0;5;1;8;19;74 2O4A 2o4a_1_1 17652321 1.75 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Trasncription Factor SATB1 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A EVSSEIYQWVrDElKRAGisqaVFArVAFnrtqglLseILrKEEDPKTASQsLLVnLRAMQNFLQLPEAERDRIYQDErERSlR B;C gctaaTATATGC;GCAtatattAGC 185 54 119 38;0;81;0 1;1;1;0;2;1;0;0;3;5;3;0;0;0;0;5;1;8;19;69 2OR1 2or1_1_1 3187531 2.5 BACTERIOPHAGE 434 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix 434 Repressor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 L;R SISSRVkSKrIQLGLnqAELAQKVgttqqsIeqLEnGktkrprfLPELASALGVSVDWLLNGT;SISSRVkSKrIQLGLnqaELAQKVGttqqsIeqLEnGktkrprfLPELASALGVSVDWLLNGT A;B AAgtacaAACTttcttgtAT;TatacaaGAAagtttgtACT 60 245 279 95;4;180;0 5;0;8;0;3;0;0;0;17;10;13;0;0;0;0;15;1;10;31;166 2PI0 2pi0_1_1 17560375 2.31 HOMO SAPIENS 1 4 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Interferon Regulatory Factor 3 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A kpriLPWLVSQLDLGQLEGVAWVNKSRTRFRIPwkhglRGIFQAwAEAtGaYVPGRDKPdlptWkrnFrsaLnrkEGLRlAEdRskDPHDPHkIyEFV E;F CATaggaaaaCTGAAAGGGAGAAGTGAAAGTG;CACTTTCACTTCTCCCTTTCagttttCCTatg 89 237 204 46;4;154;0 5;1;2;1;1;0;0;0;9;3;3;0;0;0;0;3;2;12;35;127 2PI0 2pi0_1_2 17560375 2.31 HOMO SAPIENS 1 4 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Interferon Regulatory Factor 3 1 2 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B MGTPkpriLPWLVSQLDLGQLEGVAWVNKSRTRFRIPwkhglrqDAQQEDfGIFQAwAEAtGaYVPGRDKPDLptWkrnFrsaLnrkEGLRlAEdRskDPHDPHkIYEFVNS E;F CATAGGAaaactgaaaGgGaGAAGTGAAAGTG;CACTTTCACTTCTCcctttCAGTtttccTATG 89 236 220 38;9;173;0 3;1;1;1;1;0;1;0;8;2;6;0;0;0;0;2;2;11;37;144 2PI0 2pi0_1_3 17560375 2.31 HOMO SAPIENS 1 4 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Interferon Regulatory Factor 3 1 3 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 C pkpriLPWLVSQLDLGQLEGVAWVNKSRTRFRIPwkhglrqDAQQEDFGIFQAwAEAtGaYVPGRDKPDLptWkrnFrsaLnrkEGLRlAEdRskDPHDPHkIYEFV E;F CATAGGAAAACTGaaagggagAAGtgaAAGTG;CACTTTCActtctcCCTttcagTTTTCCTATG 89 235 204 36;9;159;0 6;1;6;0;1;0;0;1;3;2;6;0;0;0;0;1;2;11;39;125 2PI0 2pi0_1_4 17560375 2.31 HOMO SAPIENS 1 4 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Interferon Regulatory Factor 3 1 4 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 D TPkprilPWLVSQLDLGQLEGVAWVNKSRTRFRIPwKhglrqdAGIFQAwAEAtGaYVPGRDKPDlptWkrnFrsaLnrkEGLRlAEdRskDPHDPHkIYEFVN E;F CATAGGAAAACTGAAAGGGAgaagtgaaaGTG;CactttCACTtctccCTTTCAGTTTTCCTATG 89 234 221 45;9;167;0 3;1;1;2;1;0;1;0;9;2;5;0;0;0;0;2;2;13;37;142 2QL2 2ql2_1_1 18069799 2.5 MUS MUSCULUS 2 1 1 3 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Helix Loop Helix, E47|NeuroD1 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B RrMAnnArerVrvRdinEAFrELGRMCQLHLKAQtklLILQQAVQVILGLEQQVRE;SRrMkanArerNrmhGlnAALDNLrKVVPCYSKTQKLskiETLRLAKNYIWALSEILRS E;F TAggccatctgGTCCT;AGgaccagatggCCTA 200;201 226 194 62;0;132;0 2;0;0;0;9;0;1;0;15;3;4;0;0;0;0;6;2;16;32;104 2QL2 2ql2_2_1 18069799 2.5 MUS MUSCULUS 2 1 1 3 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Helix Loop Helix, E47|NeuroD1 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 C;D RrMAnnArerVrvRDinEAFRELGRMCQLHLKSDQtklLILQQAVQVILGLEQQVRER;RrMkanArernrmhGlnAALDNLrKVVPCYSKTQKLskieTLRLAKNYIWALSEILR G;H TAggccatctgGTCCT;AGgaccagatggCCTA 200;201 225 181 48;0;133;0 2;0;0;0;5;0;0;0;16;3;4;0;0;0;0;5;2;9;24;111 2R1J 2r1j_1_1 18237194 1.53 BACTERIOPHAGE P22 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Repressor P22 c2 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 L;R TQLMGERIrARrkKLKIrqaALGKMVgvsnvaIsqwErSetepnGEnLLALSKALQCSPDYLLKGD;TQLMGERIrARrkKLKIrqaALGKMVgvsnvaIsqwErSetepnGEnLLALSKALQCSPDYLLKGD A;B TatttaaGATatcttaAATG;CatttaAGATatcttaAATA 197 223 283 102;0;181;0 0;0;4;0;3;0;0;0;14;7;11;0;0;0;0;19;2;15;54;154 2RAM 2ram_1_1 9437432 2.4 MUS MUSCULUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet NFkB 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 1 2 1 1 1 A;B PYVEIIEQPKQRgmrFryKceGrsAgsIPGERSTDTTKTHPTIKINGYTGPGTVRISLVTKDPPHRPHPHELVGKDCRDGYYEADLCPDRSIHSFQNLGIQCVkkRDLEQAISQRIQTNNNPFHVPIEEQRGDYDlnAVRLCFQVTVRDPAGRPLLLTPVLSHPIFDNrApnTAELkICRVNRNSGSCLGGDEIFLLCDkVqkeDIEVYFTGPGWEARGSFSqADvHrqVAIVFRTPPYADPSLQAPVRVSMQLRRPSDRELSEPMEFQYLPD;PYVEIIEQPKQRGMrFryKceGrsaGSIPGERSTDTTKTHPTIKINGYTGPGTVRISLVTKDPPHRPHPHELVGKDCRDGYYEADLCPDRSIHSFQNLGIQCvkkrDLEQAISQRIQTNNNPFHVPIEEQRGDYDlnAVRLCFQVTVRDPAGRPLLLTPVLSHPIFDNrApNTAeLKICRVNRNSGSCLGGDEIFLLCDkVqkeDIEVYFTGPGWEARGSFSQADvHrqVAIVFRTPPYADPSLQAPVRVSMQLRRPSDRELSEPMEFQYLPD C;D CGGCtggaaatccAGCCG;CGgctggaaatCCaGCCG 142 218 224 55;0;169;0 11;1;7;0;2;0;1;0;11;5;9;0;0;0;0;0;3;17;21;136 2RBF 2rbf_1_1 18586269 2.25 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Ribbon|Helix|Helix Bifunctional Protein PutA 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B tttmgVkLDDATRERIKSAATRIDRtphwLIkQAIFSYLEQLEN;ttmgvkLdDATrERIKSAATRIDRtphwLIkQAIFSYLEQLENSD C;D TGcggttgcaCCTTTCAAA;TTTGAAAggtgcaaCCGCA 208 217 175 70;0;105;0 4;1;4;1;4;1;1;1;1;6;8;0;0;0;0;1;3;6;36;97 2VY1 2vy1_1_1 18784751 2.1 ARABIDOPSIS THALIANA 1 1 1 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Protein Leafy 1 1 1 2 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B rehpfIVTEPGEVARGKKNGLDYLFHLYEQCREFLLQVQTIAKDRGEkCPTKvtnqVFrYAkKSGAsyInkpkMrhyVHCYALHCLDEEASNALRRAFKERGEnvgSWRQACYKPLVNIACRHGWDIDAVFNAHPRLSIWyvPtKLRQLCHLERNNAVAAAAAL;rehpfIVTEPGEVARGKKNGLDYLFHLYEQCREFLLQVQTIAKDRGEkCPTKvtnqVFrYAkKSGAsyInkpkMrhyVHCYALHCLDEEASNALRRAFKERGEnvgSWRQACYKPLVNIACRHGWDIDAVFNAHPRLSIWyvPtKLRQLCHLERNNAVAAAAAL W;X AgaaggaCCAGtggtcCgta;AgaaggaCCAGtggtcCgta 81 208 338 82;18;238;0 12;0;8;0;0;2;0;2;26;10;16;0;0;0;0;0;2;16;38;206 2VY2 2vy2_1_1 18784751 2.3 ARABIDOPSIS THALIANA 1 1 1 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Protein Leafy 1 1 1 2 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B rehpfIVTEPGEVARGKkNGLDYLFHLYEQCREFLLQVQTIAKDRGEkCPTKVtnqVFrYAkKSGAsYInkpkMrhyVHCYALHCLDEEASNALRRAFKERGEnvgSWRQACYKPLVNIACRHGWDIDAVFNAHPRLSIWyvPtKLrQLCHLERNNAVAAAAA;rehpfIVTEPGEVARGKkNGLDYLFHLYEQCREFLLQVQTIAKDRGEkCPTKVtnqVFrYAkKSGAsYInkpkMrhyVHCYALHCLDEEASNALRRAFKERGEnvgSWRQACYKPLVNIACRHGWDIDAVFNAHPRLSIWyvPtKLrQLCHLERNNAVAAAAA W;X AtttaatCCAAtggtTACaa;AtttaatCCAAtggtTACaa 81 207 290 52;12;226;0 8;0;8;0;0;0;0;0;20;10;14;0;0;0;0;0;0;16;40;174 2YVH 2yvh_1_1 0 2.5 CORYNEBACTERIUM GLUTAMICUM ATCC 13032 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Alpha Helix Repressor CgmR 1 1 1 0 0, 0 0 2 0 0 0 2 1 2 1 A;B SkkEILRTAIDYIGEYSLetlsydSLAEATglsksgLiyhFpsrHALLLGHELLADDWDKELRDITRDPEDPLERLRAVVVTLAENVSRPELLLLIDAPSHPDFLNAWRTVNHQWIPDTDDLENDAHKRAVYLVQLAADGLFVHDYIHDDVLSKSKRQALETILELIP;tskKEILRTAIDYIGEYSLetlsydSLAEATglsksgLiyhFpsrHALLLGHELLADDWDKELRDITRDPEDPLERLRAVVVTLAENVSRPELLLLIDAPSHPDFLNAWRTVNHQWIPDTDDLENDAHKRAVYLVQLAADGLFVHDYIHDDVLSKSKRQALETILELIP E;F;G;H TAACTGtaccgaCC;ggtCGGTACAGTTA;TaactgtACCGACc;GGTcggtacAGTTa 80 206 242 75;0;167;0 4;2;5;4;3;0;0;0;0;12;7;0;0;0;0;3;1;5;62;134 2YVH 2yvh_1_2 0 2.5 CORYNEBACTERIUM GLUTAMICUM ATCC 13032 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Alpha Helix Repressor CgmR 1 2 1 0 0, 0 0 2 0 0 0 2 1 2 1 C;D SkkEILRTAIDYIGEYSLetlsydSLAEATglsksgLiyhFpsrHALLLGHELLADDWDKELRDITRDPEDPLERLRAVVVTLAENVSRPELLLLIDAPSHPDFLNAWRTVNHQWIPDTDDLENDAHKRAVYLVQLAADGLFVHDYIHDDVLSKSKRQALETILELIP;tskKEILRTAIDYIGEYSLetlsydSLAEATglsksgLiyhFpsrHALLLGHELLADDWDKELRDITRDPEDPLERLRAVVVTLAENVSRPELLLLIDAPSHPDFLNAWRTVNHQWIPDTDDLENDAHKRAVYLVQLAADGLFVHDYIHDDVLSKSKRQALETILELIP E;F;G;H TaactgtACCGAcc;GGTcggtacAGTTa;TAACTGtaccgaCC;ggtCGGTACAGTTA 80 205 241 71;0;170;0 4;3;5;5;2;0;0;0;1;10;8;0;0;0;0;1;1;3;65;133 3BPY 3bpy_1_1 0 1.87 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Forkhead Box Protein O4 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A RrnawGNqsyaeLISQAIESAPEKRLTlaQIyEWMVRTVPyFKDKGDSnssAgWknsIrhnLslhSKFIkVHNEATgKssWwMLN B;C CTAtgtaaACAAC;gttgtttaCATag 93 195 169 57;0;112;0 2;0;1;0;1;0;0;0;6;12;7;0;0;0;0;2;3;5;34;96 3BRD 3brd_1_1 18381292 2.21 CAENORHABDITIS ELEGANS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet Lag-1 (CSL) 1 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 2 2 0 1 A;D VQSLTSDRMIDFLSNKEKYECVISIFHAKVAqkSygnekrfFCPPPCIYLIGQGWKLKKDRVAQLYKTLQQATELVAYIGIGSDTSERQQLDFPNIYDYCAAKTLYISdSDkRkYFDLNAQFFYGCGMEIGGFVSQRIKvIskpskkktDCKYlCIASGTKVALFNrlrsqtvStRYLHVEGNAFHASSTKWGAFTIHLFDDQETDNFAVRDGFVYYGSVVKLVDSVTGIALPRLRIRKVdkQQVILDASCSEEPVSQlHkCAFQMIDNELVYLCLSHDKIIQHQATAINEHRHQINDGAAWtIISTDKAEYRFFEAMGQVANPISPCPVVGSLEVDGHGEASRVELHGRDFKPNLKVWFGATPVETTFRSEESLHCSIPPVSQVRNEQTHWMFTNRTTGDVEVPISLVRDDGVVYSSGLTFSYKSL;RRMINASVWMPPMEN B;C TTACtgtgggaAAGA;AATctttcccAcagt 131;264 194 205 49;9;147;0 6;0;5;0;3;0;1;0;5;9;7;0;0;0;0;2;4;19;44;100 3BRF 3brf_1_1 18381292 2.47 CAENORHABDITIS ELEGANS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet Lag-1 (CSL) 1 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 2 2 0 1 A;D SLTSDRMIDFLSNKEKYECVISIFHAKVAqkSygnekrfFCPPPCIYLIGQGWKLKKDRVAQLYKTLTELVAYIGIGSDTSERQQLDFPNIYDYCAAKTLYISdSDkRKYFDLNAQFFYGCGMEIGGFVSQRIKvIskPskkkqSDCKYlCIASGTKVALFNrLrsqtvSTRYLHVEGNAFHASSTKWGAFTIHLFDDEQETDNFAVRDGFVYYGSVVKLVDSVTGIALPRLRIRkvdkQQVILDASCSEEPVSQlHkCAFQMIDNELVYLCLSHDKIIQHQATAINEHRHQINDGAAWTIISTDKAEYRFFEAMGQVANPISPCPVVGSLEVDGHGEASRVELHGRDFKPNLKVWFGATPVETTFRSEESLHCSIPPVSQVRNEQTHWMFTNRTTGDVEVPISLVRDDGVVYSSGLTFSYKS;RMINASVWMPPME B;C TTACtgtgggaAAGA;AATctttcccAcagt 131;265 193 228 55;15;158;0 10;0;7;2;3;0;1;0;4;4;9;0;0;0;0;4;2;18;46;118 3BRG 3brg_1_1 18381292 2.2 MUS MUSCULUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet Lag-1 (CSL) 1 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 2 2 0 1 C PPKRLTREAMRNYLKERGDQTVLILHAKVAqkSygnekrfFCPPPCVYLMGSGWKKKKEQMERDGCSEQESQPCAFIGIGNSDQEMQQLNLEGKNYCTAKTLYISdSDkRkHFMLSVKMFYGNSDDIGVFLSKRIKvIskPskkkLknADlCIASGTKVALfNrlrsqtVSTRYLHVEGGNFHASSQQWGAFYIHLLDDDETVRDGYIHYGQTVKLVCSVTGMALPRLIIRKvdkQTALLDADDPVSQlHkCAFYLKDTERMYLCLSQERIIQFQATPCPKEQNKEMINDGASWtIISTDKAEYTFYEGMGPVLAPVTPVPVVESLQLNGGGDVAMLELTGQNFTPNLRVWFGDVEAETMYRCGESMLCVVPDISAFREGWRWVRQPVQVPVTLVRNDGVIYSTSLTFTYTPEP A;B AATctttcccacagt;TTACTgtgggAAAGA 215 192 216 45;15;156;0 4;1;4;0;3;0;1;0;10;7;5;0;0;0;0;3;4;17;40;117 3BS1 3bs1_1_1 18462677 1.6 STAPHYLOCOCCUS AUREUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet Regulator AgrA 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 1 1 0 0 1 A MDNSVETIELKrgSNSVYVQYDDIMFFEsSTKshrlIAHLDNRQIEFyGnlkELSQLDDRFFrChnsFVVNRHNIESIDSKErIVYFKNKEHCYasvrnVkKI B;C ttTaaCAGTtaagAT;aaacTTAActgtTAA 239 191 140 31;3;106;0 2;2;4;0;3;1;0;0;11;4;6;0;0;0;0;0;0;11;19;77 3C2I 3c2i_1_1 18313390 2.5 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Alpha|Beta MeCP2 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 1 1 0 0 1 A rGPYDDPTLPEGWTRkLkqrksgrsAGkydvyLINPQgkaFrskveLIYFEKVGDTSLDPNDFDftvtGr B;C TCTGgaaggAATTctTCTA;ATAGAAGAAttcgtTCCAG 250 186 96 23;1;71;1 2;0;5;0;1;0;0;0;1;5;7;0;0;0;0;1;1;8;9;56 3CBB 3cbb_1_1 0 2 HOMO SAPIENS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Hepatocyte Nuclear Factor 4 Alpha 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A ALCAICGdrAtGkhygASScdgCkgfFrrSVrkNhMySCRFSRQCVVDkDKrnQCrYCrLKKCFRAGMKKEavqne C;D TGaagtcCAAAGtTCAGTCCC;AGGGACTGAACTttggacTTC 187 182 158 35;0;123;0 3;0;5;0;2;0;0;0;9;0;7;0;0;0;0;0;0;19;10;103 3CBB 3cbb_1_2 0 2 HOMO SAPIENS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Hepatocyte Nuclear Factor 4 Alpha 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B ALCAICGdRAtGkhygASSCdgCkgfFrrSVrkNhMySCRFSRQCVVDkDKrnQCrYCrLKKCFRAGMKKEavqnerd C;D TGAAGTCCAaagttCAGTCCC;AGGGactgaacTttgGACTTC 187 181 174 41;0;133;0 5;0;5;0;2;0;0;0;9;0;7;0;0;0;0;0;0;18;14;114 3CO6 3co6_1_1 18786403 2.1 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Forkhead Box Protein O1 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 C SSRrnAwGNlsyaDLITKAIESSAEKRLTlsQIyEWMVKSVPyFKDKGDsNSSAgWknsIrhnLslhSKFIrVQNeGTgkssWwMLNPEGG A;B TGGTttgtttaCCTTG;CAAggtaaACAAAccA 93 180 146 50;0;96;0 2;0;2;0;1;0;0;0;3;9;6;0;0;0;0;2;3;4;32;82 3COA 3coa_1_1 18786403 2.2 HOMO SAPIENS 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Forkhead Box Protein O1 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 C RrnawGNLsyadLITKAIESSAEKRLTlsQIyEWMVKSVPyFKDKGDsNSSAgWknsIrhnLslhSKFIrVqNEGtgkssWwMLNP A;B TGGTttgttttGCTTG;CAagcaaaaCAAAccA 93 179 150 47;0;103;0 2;2;1;0;2;0;0;0;3;7;6;0;0;0;0;1;2;4;30;90 3COA 3coa_2_1 18786403 2.2 HOMO SAPIENS 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Forkhead Box Protein O1 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 F SRrnawGNLsyAdLITKAIESSAEKRLTlsQIyEWMVKSVPyFKDKGDsNSSAgWknsIrhnLslhSKFIrVqNEGTgkssWwMLNP D;E TGGTttgttttGCTtg;CAagcaaaaCAAAccA 93 178 153 47;4;102;0 4;1;3;0;2;0;0;0;8;7;5;0;0;0;0;1;2;5;27;88 3COQ 3coq_1_1 18611375 2.4 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating GAL4 Type, GAL4 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B eqaCDICrlkklkcSkEKPKCAkCLKNNwECRYSPktKrSpltrAHLTEVESRLERLEQLFLLIFPREDLDMILKMDSLQDIKALLTGL;eqaCDICrlkklkcSkEKPKCAKCLKNNWECRYSPktKrSpltrAHLTEVESRLERLEQLFLLIFPREDLDMILKMDSLQDIKALLTGL D;E accggAGGacAgtcctccgG;tccggAGGacTgtcctccGG 178 177 258 65;1;190;2 4;0;4;0;0;0;6;0;6;0;12;0;0;0;0;0;9;18;44;155 3CRO 3cro_1_1 2038059 2.5 BACTERIOPHAGE 434 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Cro Repressor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 L;R MQTLSERLkKRrIALKMtqteLATKAgvkqqsIqliEaGvtkrprfLFEIAMALNCDPVWLQYGTK;MQTLSERLkKRrIALKMtqteLATKAGvkqqsIqliEAGvtkrprfLFEIAMALNCDPVWLQYG A;B AAgtacaAACtttcttgtAT;TatacaAGAaagtttgtACT 198 175 289 87;12;190;0 9;0;9;0;3;0;0;0;16;15;14;0;0;0;0;11;1;10;41;160 3E6C 3e6c_1_1 18717788 1.8 DESULFITOBACTERIUM HAFNIENSE 1 1 1 1 0 0 1 Transcription factor Alpha|Beta CprK 1 1 1 0 0, 0 0 2 0 0 0 2 1 2 1 C;F DFCGAIIPDNFFPIEKLRNYTQMGLIRDFAkGSAVIMPGEEITSMIFLVEGKIKLDIIFEDGSEKLLYYAGGNSLIGKLYPTGNNIYATAMEPTRTCWFSEKSLRTVFRTDEDMIFEIFKNYLTKVAYYARQVAEMNtYnptIRILRLFYELCSSQGKRVGDTYEITMPLsqkSIGEITgvhhvtVsrVLaSLkrENILDkKkNKIIVYNLGELKHLSEQtsYyS;DFCGAIIPDNFFPIEKLRNYTQMGLIRDFAkGSAVIMPGEEITSMIFLVEGKIKLDIIFEDGSEKLLYYAGGNSLIGKLYPTGNNIYATAMEPTRTCWFSEKSLRTVFRTDEDMIFEIFKNYLTKVAYYARQVAEMNtYnptIRILRLFYELCSSQGKRVGDTYEITMPLsqkSIGEITgvhhvtVsrVLaSLkrENILDkKkNKIIVYNLGELKHLSEQtsYyS A;B;D;E GGCAtgttaaTGC;gcattaACATGcc;GGCAtgttaaTGC;gcattaACATGcc 152 159 298 116;0;182;0 4;2;0;0;0;0;0;0;8;16;14;0;0;0;0;6;4;8;64;172 3ERE 3ere_1_1 0 2.5 MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS H37RV 1 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Arginine Repressor 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 D AaNrAGrQARIVAILSSAQVrsqneLAALLAAEGIevtqatLsrDLeELGAVkLrGADggtGIyVVPEDGSPVRGVSGGTDRMARLLGELLVSTDDSGNLAVLRTPPGAAHYLASAIDRAALPQVVGTIAGDDTILVVAREPTTGAQLAGMFENLR A;B ttgcaTAACGatGCAA;TTGCATCGttatgCAA 223 156 118 35;0;83;0 3;1;3;0;1;0;0;0;6;5;7;0;0;0;0;3;1;8;7;73 3EXJ 3exj_1_1 18978813 2 MUS MUSCULUS 1 1 1 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Loop Sheet Helix, Tumor Supressor Protein p53 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B KTYQGNYGFHLGFLQSGTaKSvmCTYSPPLNKLFCQLAKTCPVQLWVSATPPAGSRVRAMAIYKKSQHMTEVVRRCPHHERCSDGDGLAPPQHLIRVEGNLYPEYLEDRQTFRHSVVVPYEPPEAGSEYTTIHYKYMCnssCmGGMnrRPILTIITLEDSSGNLLGRDSFEVrvcacPgrdRrteEEnFRKKEV;SQKTYQGNYGFHLGFLQSGTAKSvMCTYSPPLNKLFCQLAKTCPVQLWVSATPPAGSRVRAMAIYKKSQHMTEVVRRCPHHERCSDGDGLAPPQHLIRVEGNLYPEYLEDRQTFRHSVVVPYEPPEAGSEYTTIHYKYMCnssCmGGMNrRPILTIITLEDSSGNLLGRDSFEVrvcacPGrdRrteEEnFRKK C;D gagCatgctCA;ttgagCatgctC 8 155 183 38;5;140;0 5;0;5;0;0;0;0;0;12;2;2;1;4;0;0;4;0;15;21;112 3EXL 3exl_1_1 18978813 2.2 MUS MUSCULUS 1 1 1 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Loop Sheet Helix, Tumor Supressor Protein p53 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A QKTYQGNYGFHLGFLQSGTAKSvMCTYSPPLNKLFCQLAKTCPVQLWVSATPPAGSRVRAMAIYKKSQHMTEVVRRCPHHERCSDGDGLAPPQHLIRVEGNLYPEYLEDRQTFRHSVVVPYEPPEAGSEYTTIHYKYMCnssCMGGMNrRPILTIITLEDSSGNLLGRDSFEVrvcacPgrdRrtEEENFRKKE C;D tgcTC;gagCA 8 154 64 19;0;45;0 2;0;2;0;0;0;0;0;4;1;1;1;3;0;0;2;0;7;7;34 3HDD 3hdd_1_1 9813123 2.2 DROSOPHILA MELANOGASTER 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Engrailed 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A rtafSSEQlARLkREFNENRylTeRRrQQLSSELGLNEAqIkiwFqnKrakIkkS C;D TTTTGCCATgtaattACCTAA;ATTAggtaatTacaTGGCAAA 35 149 149 32;10;106;1 5;0;7;0;2;0;0;0;7;2;3;0;0;0;0;1;0;13;21;88 3HDD 3hdd_1_2 9813123 2.2 DROSOPHILA MELANOGASTER 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Engrailed 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B rprtAFSSEQLARLKREFNENRylTeRRrQQLSSELGLNEAqIkiWFqnKraKIkk C;D TTTTGCCATGTAATTAcctaa;attAGGTAATTACATGGCAAA 35 148 98 29;1;68;0 4;0;3;0;1;0;0;0;3;0;3;0;0;0;0;2;0;9;16;57 3HTS 3hts_1_1 10331875 1.75 KLUYVEROMYCES LACTIS 1 1 1 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Heat Shock Factor Protein 1 1 1 2 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 B;E MARpafVNkLWSMVNDKSNEKFIHWSTSGESIVVPNRERFVQEVLPKYfkhSnFasFvrqLnmyGWhkVqNNDSRwEFENER;MARpafVNkLWSMVNDKSNEKFIHWSTSGESIVVPNRERFVQEVLPKYfkhSnFasFvrqLnmyGWhkVqNNDSRwEFENER A;D GgttctagaACC;GgttctagaACC 34 147 230 78;0;150;2 4;0;0;0;0;0;0;0;6;4;12;0;0;0;0;6;2;10;26;160 6PAX 6pax_1_1 10346815 2.5 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Paired Protein Pax 1 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A shSGvnqlGGVfvngrplPDSTrQRIVELAHSGArpcDISrILQvsngcVskiLGrYYATGSIRpraiggskprvaTPEVVSKIAQYKQECPSifawEIRDRLLSEGVCTNdNipsvssInrVLrnLASEKQQ B;C AAGCAttttcACgcatgagtgcACAG;TTctgtGCACtcatgcgtgaAAATGC 118 141 395 57;35;303;0 5;2;1;1;2;3;3;2;16;7;20;5;0;0;0;4;3;20;65;236 9ANT 9ant_1_1 9699632 2.4 DROSOPHILA MELANOGASTER 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Antennapedia 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A rqtyTRYQtLELEKEFHFNRylTrRRrIEIAHALSLTErqIkiwFqnRrmkWkkEN C;D AGAaagccatTagag;TCTCtaatgGCTTTC 102 140 171 36;10;124;1 7;0;3;0;3;0;0;0;10;3;6;0;0;0;0;0;0;18;29;92 9ANT 9ant_2_1 9699632 2.4 DROSOPHILA MELANOGASTER 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Antennapedia 2 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B rqtyTRYQtLELEKEFHFNRylTrRRrIEIAHALSLTErqIkiwFqnRrmkWkkEN E;F AGAaagccatTagag;TCTCtaatgGCTTTC 102 139 169 33;11;125;0 6;0;4;0;2;0;0;0;10;3;4;0;0;0;0;0;0;15;30;95