#QUERY: #Match: All #Sticky ends: Both ends, both strands #PDB_ID ENTRY_ID PUBMED_ID RESOLUTION SPECIES MULTICOMPLEXITY NO_INTERFACES ASYMMETRIC_UNIT BIOLOGICAL_UNITS IS_CRUCIFORM HAS_ZDNA HAS_WATER CLASSIFICATION TYPE SUBTYPE COMPLEX_ID INTERFACE_ID DNA_DOUBLE_STRAND DNA_SINGLE_STRAND STICKY_ENDS FLIPPED_BASE NICKED_DNA GAPPED_DNA OPEN_DNA MODIFIED_DNA PROTEIN_MONOMERS MULTIMERIZATION PROT_PROT_INTERACTION DNA_PROT_INTERACTION PROT_CHAIN_IDS PROT_SEQS DNA_CHAIN_IDS DNA_SEQS SEQ_GROUPS INTERFACE_GROUP NUMBER_EFF_CONTACTS GROOVE_CONTACTS(MA;MI;BB;NA) TYPE_CONTACTS(1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13;14;15;16;17;18;19;20) 1A1F 1a1f_1_1 9562555 2.1 MUS MUSCULUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zif268 Zinc Finger 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A rPYACPVESCDrrfsdssnLtrhIriHTGQkPfQCRICMrnfsrsdhLtthIrtHTGEkPfACDICGrkfarsderkrhTKIHL B;C agcgtgggacc;tggtcccacgC 19 671 245 107;6;131;1 12;1;12;2;11;0;0;0;5;11;1;0;0;0;0;10;1;16;26;137 1A1G 1a1g_1_1 9562555 1.9 MUS MUSCULUS 1 1 0 1 0 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Zinc Coordinating Zif268 Zinc Finger 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A rPYACPVESCDrrfsrSadLtrhIriHTGQkPfQCRICMrnfsrsdhLtthIrtHTGEkPfACDICGrkfarsderkrhTKIHL B;C agcgtgggcGT;tacgcccacgC 19 43 214 80;7;125;2 8;1;10;0;7;0;0;0;5;11;1;0;0;0;0;6;1;21;20;123 1A1K 1a1k_1_1 9562555 1.9 MUS MUSCULUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zif268 Zinc Finger 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A rPYACPVESCDrrfsrsadLtrhIriHTGQkPfQCRICMrnfsrsdhLtthIrtHTGEkPfACDICGrkfarsderkrhTKIHLR B;C agcgtgggacc;tggtcccacgC 19 668 231 89;6;135;1 10;0;12;0;7;0;0;0;3;11;3;0;0;0;0;8;1;21;23;132 1A1L 1a1l_1_1 9562555 2.3 MUS MUSCULUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zif268 Zinc Finger 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A rPYACPVESCDrrfsrSdeLtrhIriHTGQkPfQCRICMrnfsrsdhLtthIrtHTGEkPfACDICGrkfarsderkrhTKIHLR B;C agcgtgggcaC;tgtgcccacgC 19 43 232 84;8;139;1 10;1;9;0;8;0;0;0;5;13;1;0;0;0;0;8;1;27;25;124 1A73 1a73_1_1 9665136 1.8 PHYSARUM POLYCEPHALUM 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease 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ttgactcTCttaagagagtCA;ttgactcTCttaagagagTCA 29 7 402 115;21;266;0 14;0;8;0;6;0;4;0;17;11;18;0;0;0;0;3;8;21;47;245 1AAY 1aay_1_1 8939742 1.6 MUS MUSCULUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zif268 Zinc Finger 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A rPYACPVESCDrRfsrsdeLtrhIriHTGQkPfQCRICMrnfsrsdhLtthIrtHTGEkPfACDICGrKfarsderkrhTKIHLR B;C agcgtgggcgt;tacgcccacgC 19 137 226 90;6;130;0 9;1;13;0;9;0;0;0;3;12;1;0;0;0;0;8;1;27;19;123 1AKH 1akh_1_1 9838003 2.5 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodamain, Mat Alpha 2 1 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 2 2 2 1 A;B iSPQArAFLeEVFRRKQslnsKEkEEVAKKCGITPlqVrvwFinKrmrS;TKpyrghrfTkENvRILeSWFAKNIENPylDTKGLENLMKNTSLSriqIknwVsnRrrkEkTITIAPELADLLSGEPL C;D TacatgtaaaaatttacatCA;TAtgatgTAAATTtttacaTG 121;123 662 322 76;26;220;0 12;1;11;1;5;1;0;1;18;4;8;0;0;0;0;3;1;18;47;191 1AWC 1awc_1_1 9461436 2.15 MUS MUSCULUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Ets Domain, GABP 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 1 2 2 0 1 A;B 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aaagatatctt;aaagatatctt 1 39 445 109;9;326;1 5;2;5;3;5;6;6;2;13;23;19;0;0;0;0;6;2;19;59;270 1B72 1b72_1_1 10052460 2.35 HOMO SAPIENS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, PBX1 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A ARTFDwMKvlrtnfTTRQlTELEKEFHFNKylSrARrVEIAATLELNEtqVkiwFqnRrmkQkKRERE D;E ACTCTATGATtgatcGGCTG;TCAgccgaTcaatcATAGAG 251 657 148 18;6;123;1 3;0;1;0;1;0;0;0;10;2;3;0;0;0;0;0;0;11;26;91 1B72 1b72_1_2 10052460 2.35 HOMO SAPIENS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, PBX1 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B rkrrnfNKQAtEILnEYFYSHLSNPypSeEAkEELAKKCGITVsqVsnwFgnkrirYkkNIGkfQEeANIYAA D;E ACTCTatgatTGATCGGCTG;TCAGCCGatcaatCatagAG 191 656 158 33;6;118;1 5;0;3;0;2;0;1;0;14;1;3;0;0;0;0;2;0;12;24;91 1B8I 1b8i_1_1 10067897 2.4 DROSOPHILA MELANOGASTER 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, UBX|EXD 1 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A FYPwMarqtyTRYQtLELeKEFHTNHyLTrRRrIEMAHALSLTErqIkiwFqnRrmkLkkEI C;D 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B;D TGCatttcccgtaaAtct;TGCatttcccgtaaAtct 128 648 284 52;0;232;0 4;0;6;0;0;2;0;0;22;8;8;0;0;0;0;6;2;24;34;168 1BL0 1bl0_1_1 9724717 2.3 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, MARA 1 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A dAITIHSILDWIEDNLESPLSlekVSERSGyskwhLqrmFkkETGHslgqYIrSRKMTEIAQKLKESNEpilYLAERYgfesqqtLtrtFknYFDVpphkYrMTNMQGESRFLHPL B;C GGGGAtttagCAAAacgtggcATC;CCGatgccaCGTtttgctaAATCc 232 645 253 85;0;168;0 3;1;7;0;1;0;2;0;6;7;14;0;0;0;0;8;2;13;46;143 1BSS 1bss_1_1 9811827 2.15 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRV 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B 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19;0;10;0;4;0;4;0;18;11;18;0;0;0;0;2;8;18;53;224 1D2I 1d2i_1_1 10655616 1.7 BACILLUS SUBTILIS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease BglII 1 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B KIDITDYNHADEILNPQLWKEIEETLLKPLHVkAsdqaskVGSLiFdpvGTnqYIkDELVPKHWKNnIpiPKRFdflgtdIdFGKRDTLVevqfsnyPfLLnNTVrSELFHKSNDIDEEGKVAIIITKGhFPAsnssLyYEqAQNQLNSLAEYNVFDVPIRLVGLIEDFETDIDIVSTTYAdkrysrtITKRDTVKGKVIDTNTPNTrRrkrGTIVTY;KIDITDYNHADEILNPQLWKEIEETLLKPLHVkAsdqaskVGSLiFdpvGTnqYIkDELVPKHWKNnIpiPKRFdflgtdIdFGKRDTLVevqfsnyPfLLnNTVrSELFHKSNDIDEEGKVAIIITKGhFPAsnssLyYEqAQNQLNSLAEYNVFDVPIRLVGLIEDFETDIDIVSTTyAdkrysrtITKRDTVKGKVIDTNTrkrGTIVTY C;D TAttatagatctataa;Tattatagatctataa 79 133 622 135;23;464;0 6;4;5;4;7;0;2;0;32;18;31;0;0;0;0;13;6;40;95;359 1DC1 1dc1_1_1 11250198 1.7 BACILLUS STEAROTHERMOPHILUS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease BsobI 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B KPFENHLKSVDDLKTTYEEYRAGfIAfALEkNKRSTPYIERARALKVAASVAKTPKDLLYLEDIQDALLyASGIsdkAKkfLTEDDKKESINNLIENFLEPAGEEFIDELIFRYLLFQGdsLGgtMrnIagALaqQKLTRAIISALDIANIPYKWLDSRDkKyTNWMDKPEDDYELETFAkGISWTINGKHRTLMYnItVSLVkknVdICLFNCEPQQPEKYLLLGelkggidpagAdehWktANTaLTrIRNKFSEKGLSPKTIFIGAAIehsMAEEIWDQLQSGSLTNSANLTKTEQVGSLCRWIINI;QKPFENHLKSVDDLkTTYEEYRAGfIAfALEkNKRSTPYIERARALKVAASVAKTPKDLLYLEDIQDALLyASGIsdkAKkFLTEDDKKESINNLIENFLEPAGEEFIDELIFRYLLFQGdsLGgtMrnIagALaQQKLTRAIISALDIANIPYKWLDSRDkKyTNWMDKPEDDYELETFAkGISWTINGKHRTLMYnITVSLVkknVdICLFNCEPQQPEKYLLLGelkggidpagAdehWktANTaLTrIRNKFSEKGLSPKTIFIGAAIehsMAEEIWDQLQSGSLTNSANLTKTEQVGSLCRWIINI C;W TAtactcgagtat;atactcgagtat 137 625 540 102;51;381;6 10;0;7;1;4;0;2;2;16;14;24;0;0;0;0;8;2;37;70;343 1DFM 1dfm_1_1 10655616 1.5 BACILLUS SUBTILIS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease BglII 1 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B 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1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Engrailed 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B rprTAFSSEQLARLKREFNENRylTeRRrQQLSSELGLNEaqIkiWFanKraKIkk C;D TTTTGCCATGTAATTacctaa;atTAGGTAATTACATGGCAAA 35 620 90 20;2;68;0 3;0;0;0;2;0;0;0;3;0;2;0;0;0;0;0;0;12;13;55 1EGW 1egw_1_1 10715212 1.5 HOMO SAPIENS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Alpha Helix MADS box, MEF2A 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B grkkiQITRIMDErnRQvtFTkrKFgLMkKAYeLSVLCDCEIALIIFNSSNKLFQYASTDMDKVLLKYTEY;grkkiQITRIMDErnRQvtFTkrKFgLMkKAYeLSVLCDCEIALIIFNSSNKLFQYASTDMDKVLLKYTEYN E;F aAAgctatTatTagctT;TaAgctaAtaAtagcTT 98 128 236 21;43;172;0 3;0;6;0;0;4;0;4;14;2;9;0;0;0;0;0;0;12;31;151 1EGW 1egw_2_1 10715212 1.5 HOMO SAPIENS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Alpha Helix MADS box, MEF2A 2 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 C;D grkkiQITRIMDErnRQvtFTkrKFgLMkKAYeLSVLCDCEIALIIFNSSNKLFQYASTDMDKVLLKYTEYN;grkkiQITRIMDErnRQvtFTkrKFgLMkKAYeLSVLCDCEIALIIFNSSNKLFQYASTDMDKVLLKYTEY G;H taAgctaAtaAtagctT;aAAgctatTatTagctT 98 128 233 19;45;169;0 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SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtKVLsTIFELFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKENEKIKFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTRVKSSLKTYNIIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsqLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK;SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtKVLsTIFELFSRPIINKIAEKHGYIVEEPkqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKIkFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTRVSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsqLrNKYnNISEYRNWIYRGRK C;D aaagaatctt;caagaatctt 1 126 406 102;10;294;0 3;2;2;2;4;6;6;2;16;19;23;0;0;0;0;7;0;22;48;244 1ERI 1eri_1_1 2399465 2.5 ESCHERICHIA COLI 1 1 1 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRI 1 1 1 2 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;E 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124 158 14;27;111;6 0;0;0;0;0;1;1;1;2;3;4;0;0;0;0;0;0;7;35;104 1EWQ 1ewq_1_1 11048710 2.2 THERMUS AQUATICUS 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein Repair Protein DNA Mismatch Repair Protein MutS 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B 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C;D GCGACGCtagcgtgcgGctcgTC;GGacgagccgccgctagcgTCG 125 613 346 18;22;304;2 1;0;0;0;0;0;0;1;14;3;19;0;0;0;0;0;0;24;66;218 1EYU 1eyu_1_1 10903853 1.78 PROTEUS VULGARIS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease PvuII 1 1 1 0 2, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SHPDLNKLLELWPHIQEYQDLALKHGInDIFqdnGGkLLQVLLITGLTVLPGRegnDAVDNAGQEYelksinIDltKgFsthhHMNPviIAkyRQVPWIFAIYRGIAIEAIYRLEPKDLEFyYDkWERkWYSdGHkdinnpkIpVKYVMEHGTKIY;SHPDLNKLLELWPHIQEYQDLALKHGInDIFqdnGGKLLQVLLITGLTVLPgndAVDNAGQEYelksinIDltKgFsthhHMNPviIAkyRQVPWIFAIYRGIAIEAIYRLEPKDLEfyYDkwERkWYSdGHKDinnpkIpVkYVMEHGTKIY C;D tgaccagctggtC;tgaccagctggtC 41 612 422 150;11;259;2 7;4;9;0;5;3;6;3;17;4;9;0;0;0;0;5;6;23;52;269 1F0O 1f0o_1_1 10903853 2.5 PROTEUS VULGARIS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease PvuII 1 1 1 0 2, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SHPDLNKLLELWPHIQEYQDLALKHGInDIFqdnGGklLQVLLITGLTVLPegNdAVDNAGQEYelksinIDltkgFsthhHMNPviIAkyRQVPWIFAIYRGIAIEAIYRLEPKDLEfyYDkwERkWYSdGHKdinnpkIpVkYVMEHGTKIY;PDLNKLLELWPHIQEYQDLALKHGInDIFqdnGGKlLQVLLITGLTVLPegNdAVDNAGQEYelksinIDltKgFsthhHMNPviIAkyRQVPWIFAIYRGIAIEAIYRLEPKDLEfyYDkwERkWYSdGHKdinnpkIpVkYVMEHGTKIY C;D tgaccagctggtC;tgaccagctggtC 41 611 420 142;10;267;1 7;4;10;1;5;4;6;2;12;2;13;0;0;0;0;5;6;16;48;279 1F44 1f44_1_1 11601846 2.05 BACTERIOPHAGE P1 1 1 1 1 0 0 1 Enzyme Recombinase Cre Recombinase 1 1 1 0 4, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A SDEVrKNLMDMFRDRQafsEhtWkmLlsVCrsWAAWCKLNNRKWFPAEPEDVRDYLLYLQArglaVktIqqhlgqLnmLHrRSGLPrPsDSNAVsLVmRRIrKENVDAGERakqaLAFERTDFDQVRSLMENSDrCqDIrNLAFLGIAYNTLLriaEIArIRVKDISRTDGGRMLIHIGRGVEKALSLGVTKLVERWISVSGVADDPNNYLFCrvrknGvAAPSATsqlstraLeGIFeATHRLIYGAkDDSgqryLawsghSArvGAARDMARAGVSIPEIMQAGgwtNVNiVMnfIrNLDSETGAMVRLLEDGD M;N TAtaacttcgtatagc;ATatgctatacgaAGttat 15 609 481 106;20;355;0 11;1;12;0;1;0;3;0;21;14;16;0;0;0;1;11;2;37;77;274 1F4R 1f4r_1_1 11106395 2.4 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Glycosylase 3-Methyladenine DNA Glycosylase I 1 1 1 0 1, 1 1 0 0 0 1 1 0 0 1 A HLTRLGLEFFDQPAVPLARAFLGQVLVRRLPNGTELRGRIVETEAYLGPEDEAAhSrGGrQtprnRGMFMKPGTLYVyiiygmyFcMNISSQGDGACVLLrALEPLEGLETMRQLrSTVLKDReLCsgpskLCQALAINkSFDQRDLAQDEAVWLERGPAVVAAARvgVGHAGEWARKPLRFYVRGSPWVsvVDRVAEQ D;E GACATgttgCC;GCAatcatgtCA 115 124 172 12;32;123;5 0;0;0;0;0;1;1;1;4;3;5;0;0;0;0;0;0;7;37;113 1F6O 1f6o_1_1 11106395 2.4 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Glycosylase 3-Methyladenine DNA Glycosylase I 1 1 1 0 1, 1 1 0 0 0 1 1 0 0 1 A KGHLTRLGLEFFDQPAVPLARAFLGQVLVRRLPNGTELRGRIVETEAYLGPEDEAAhSrGGrQtprNRGMFMKPGTLYVyiiygmyFcMNISSQGDGACVlLrALEPLEGLETMRQLrSTlsRVlKDReLCsgpskLCQALAINkSFDQRDLAQDEAVWLERGPLEPSEPAVVAAARvgVGhAGEWARKPLRFYVRGSPWVsvVDRVAEQD D;E GACATgttgcCT;GGCAatcatgtcA 115 607 189 17;29;139;4 0;0;0;0;0;1;1;1;1;2;7;0;0;0;0;0;0;11;38;127 1FIU 1fiu_1_1 10966652 1.6 NEISSERIA GONORRHOEAE 2 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease NgoMIV 1 1 1 0 1, 1 0 2 0 0 0 2 1 1 1 A;B 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MQPLFTQERRIFHKKLLDGNILATnNrGVVsNadgsntrSFNIAKGIADLLHSETVSErlpgqtsgnAfeAICSEFVQSAFEKLQHIRPGDWNVKQVGsRnrLEIARYQQYAHLTALAKAAEENPELAAALGSDYtItPdIIVTRNLIADAEINRNEFLVDENIATYASLRAGNGNMPLLHASISckwtIrsdrAQnARSeGLNLVRNRKGRLPHIVVVTAEPtPsrISSIALGTGEIDCVYHFALYELEQILQSLNYEdALDLFYIMVNGKRLKDISDLPLDLAV;MQPLFTQERRIFHKKLLDGNILATnNrGVVsNAdgsntrSFNIAKGIADLLHSETVSerlpgqtsgnAfeAICSEFVQSAFEKLQHIRPGDWNVKQVGsrNrLEIARYQQYAHLTALAKAAEENPELAAALGSDYTiTPdIIVTRNLIADAEINRNEFLVDENIATYASLRAGNGNMPLLHASISckwtIrsdrAQnARSeGLNLVRNRKGRLPHIVVVTAEPTPsrISSIALGTGEIDCVYHFALYELEQILQSLNYEdALDLFYIMVNGKRLKDISDLPLDLAV G;H;K;L tgcg;Tgcg;ccggcgc;ccggcgc 71 123 433 117;23;293;0 7;0;4;2;13;2;1;2;15;25;11;0;0;0;0;12;1;40;47;251 1FJL 1fjl_1_1 7671301 2 DROSOPHILA MELANOGASTER 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Paired Protein Pax 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B kQrrsrtTfSASQlDELERAFERTQypDiYTrEELAQRTNLTEArIqvwFqnRrarLrKQHTSVS;QrrsrtTfSASQlDELERAFERTQyPDiYTrEELAQRTNLTeArIqvwFqnRrarLrK D;E Aataatctgattac;Tgtaatcagattat 99 606 363 49;35;279;0 10;0;18;0;2;0;0;0;27;2;9;0;0;0;0;2;0;27;55;211 1FJL 1fjl_2_1 7671301 2 DROSOPHILA MELANOGASTER 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Paired Protein Pax 2 1 1 2 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 C;D kqrrsrtTfSASQlDELERAFERTQypDiYTrEELAQRTNLTEArIqvwFqnRrarLrK;kqrrsrtTfSASQlDELERAFERTQypDiYTrEELAQRTNLTEArIqvwFqnRrarLrK E;F Tgtaatctgattac;Tgtaatctgattac 99 605 370 56;34;280;0 8;0;20;0;2;0;0;0;30;2;12;0;0;0;0;4;0;26;54;212 1FJX 1fjx_1_1 11102456 2.26 HAEMOPHILUS HAEMOLYTICUS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Methyltransferase DNA Methyltransferase HhaI 1 1 1 0 1, 1 1 0 0 0 0 1 0 0 1 A MIEIKDKQLTGLRFIDLFAGLGGFRLALESCGAECVYSNEwdkyAQEVYEMNFGEKPEGDITQVNEKTIPDHDILCAgfpcqAFsisgkqKGFEDSrGTLFFDIARIVREKKPKVVFMenvknFAsHDNGNTLEVVKNTMNELDYSFHAKVLNALDYGIPQkrErIYMICFRNDLNIQNFQFPKPFELNTFVKDLLLPDSEVEHLVIDrKDLVMtnQEIEQTTPKtVrLGIVGkGgqGerIySTRGIAiglsaygggiFakTGGYLVNGKTRkLHPRECARVMGYPDSYKVHPstsqAyKQFgnsVVINVLQYIAYNIGSSLNFKPY C;D tgatagcgctatc;TGAtagcgctATC 26 604 348 94;30;208;16 6;2;3;0;2;1;10;4;10;10;12;2;0;0;0;4;2;20;44;216 1G2D 1g2d_1_1 11587646 2.2 MUS MUSCULUS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating TATA Box Binding Zinc Finger 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 C MerPyACPVESCDrrfsqktnLdthIriHTGQkPfQCRICMrnfsqhtgLnqhIrtHTGEkPfACDICGrKfatlhtRdrhTKiHLrqk A;B gacgctataaaagGAG;tccttttatagcGTCc 19 120 268 117;1;150;0 7;1;5;5;9;0;0;1;6;5;2;0;0;0;0;9;0;17;45;156 1G2D 1g2d_2_1 11587646 2.2 MUS MUSCULUS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating TATA Box Binding Zinc Finger 2 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 F mErPyACPVESCDrrfsqktnLdthIriHTGQkPfQCRICMrnfsqhtgLnqhIrtHTGEkPfACDICGrkfatlhtRdrhTKiHLrq D;E gacgctataaaaGGAG;tccttttatagcGTCC 19 120 276 121;0;154;1 7;1;3;5;11;0;0;1;8;3;3;0;0;0;0;9;0;21;40;164 1G2F 1g2f_1_1 11587646 2 MUS MUSCULUS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating TATA Box Binding Zinc Finger 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 C MerPyACPVESCDrrfsqktnLdthIriHTGQkPfQCRICMrnfsqqasLnahIrtHTGEkPfACDICGrkfatlhtRtrhTKiHLrqk A;B gacgctataaaagGAG;tccttttatagcGTCC 19 119 265 110;0;155;0 6;1;3;3;10;0;0;2;4;6;2;0;0;0;0;7;0;13;47;161 1G2F 1g2f_2_1 11587646 2 MUS MUSCULUS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating TATA Box Binding Zinc Finger 2 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 F erPyACPVESCDrrfSqktnLdthIriHTGQkPfQCRICMrnfsqqasLnahIrtHTGEkPfACDICGrkfatlhtRtrhTKiHLrq D;E gacgctataaaaGGAG;tccttttatagcGTCC 19 119 266 117;0;148;1 5;1;3;3;8;0;0;2;4;6;1;0;0;0;0;10;0;15;46;162 1GD2 1gd2_1_1 11017199 2 SCHIZOSACCHAROMYCES POMBE 2 1 1 3 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, PAP1 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 E;F;I;J DqepSSKrkAqnrAaqrafrKrKEDHLKALETQVVTLKELHSSTTLENDQLRQKVRQLEEELRIL;epSSKrkAqnrAaqrafrKrkEDHLKALETQVVTLKELHSSTTLENDQLRQKVRQLEEELRILK;rKAQNRETQVVTLKELHSSTTLENDQLRVRQLEEELRILK;TQVVTLKELHS A;B Aggttacgtaacc;aggttacgtaacC 100;209;266 117 256 121;0;134;1 12;0;11;0;4;0;2;0;11;0;1;0;0;0;0;2;4;23;49;137 1GD2 1gd2_2_1 11017199 2 SCHIZOSACCHAROMYCES POMBE 2 1 1 3 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, PAP1 2 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 G;H;I;J qepSSKrkAqnrAaqrafrKrkEDHLKALETQVVTLKELHSSTTLENDQLRQKVRQLEEELRIL;qepSSKrkAqnrAaqrafrKrkEDHLKALETQVVTLKELHSSTTLENDQLRQKVRQLEEELRIL;RKaQNRETQVVTLKELHSSTTLENDQLRVRQLEEELRILK;TQVVTLKELHS C;D aggttacgtaacC;AggttacgtaacC 100;209;267 117 258 120;0;137;1 12;0;10;0;4;0;2;0;10;0;1;0;0;0;0;2;4;19;48;146 1GTW 1gtw_1_1 0 1.85 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, C|EbpBeta 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B DkHSDeyKirrErnnIavrksrdkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQ;DkHSDeyKIrrernnIavrksrDkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQLP C;D AatgtggcgcaaTCCT;TaggattgcgccaCAT 23 24 243 98;0;145;0 8;0;9;0;3;0;0;0;9;4;0;0;0;0;0;5;4;32;33;136 1GU4 1gu4_1_1 0 1.8 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, C|EbpBeta 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B DkHSDeyKirrErnnIavrksrdkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQ;DkHSDeyKIrrernnIavrksrDkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQLP C;D TAggattgcgcaaTAT;aatattgcgcaaTCCT 23 24 253 108;0;145;0 8;0;8;0;3;0;0;0;9;4;0;0;0;0;0;4;5;32;36;144 1GU5 1gu5_1_1 0 2.1 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, C|EbpBeta 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B DkHSDeyKirrErnnIavrksrdkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQ;DkHSDeyKIrrernnIavrksrDkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQLP C;D TTgtgttggccaaTCA;atgattggccaaCACA 23 24 232 97;0;135;0 7;0;8;0;4;0;0;0;8;3;0;0;0;0;0;6;6;29;38;123 1GXP 1gxp_1_1 12015152 2.5 ESCHERICHIA COLI 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Alpha Helix PhoB 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B AVEEVIEMQGLSLDPTSHRVMAGEEPLemgpteFKLLHFFMTHPERVYSrEQLLNHVwGTNVyveDrtVdvhIrrLrKALePGGHDRMVQtvrgTgyRFSTRF;EEVIEMQGLSLDPTSHRVMAGEEPLemgpteFKLLHFFMTHPERVYsrEQLLNHVwGTNVyvedrtVdvhIrrLrKALePGGHDRMVQtvrgtgyRFSTRF C;D GAGctgtcaTAAagttgtcaCGG;cccgtgaCAACtttatgaCAGCT 91 603 319 92;13;209;5 8;0;10;0;0;0;2;0;12;11;13;0;0;0;0;2;1;29;48;183 1GXP 1gxp_2_1 12015152 2.5 ESCHERICHIA COLI 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Alpha Helix PhoB 2 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 E;F VEEVIEMQGLSLDPTSHRVMAGEEPLemgpteFKLLHFFMTHPERVYSrEQLLNHVwGTNVyveDrtVdvhirrLrKALEPGGHDRMVQtvrgTgyRFSTRF;VEEVIEMQGLSLDPTSHRVMAGEEPLEmgpteFKLLHFFMTHPERVYsrEQLLNHVwGTNVyvedrtVdvhIrrLrKALePGGHDRMVQtvrgtgyRFSTRF G;H GAGctgtcATAAagttgtcACGG;cccgtgaCAACtttatgaCAGCT 91 602 315 85;11;216;3 8;0;9;0;0;0;1;0;14;11;15;0;0;0;0;3;3;24;51;176 1H6F 1h6f_1_1 12005433 1.7 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet T Box, TBX3 1 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B DPKVHLEAKELWDQFHKRGTEMvitksgrrmfPPFKVRCSGLDKKAKYILLMDIIAADDCrYkfhNSRWMVAGKADPEMPKRMYIHPDSPATGEQWMSKVVTFhKLkLTnNISDKHGFTILNsmHKYQPRFHIVRANDILKLPYSTFRTYLFPETEFIAVtayqNdKItQLkiDNnpfakgfRD;KDDPKVHLEAKELWDQFHKRGTEMvitksgrrmfPPFKVRCSGLDKKAKYILLMDIIAADDCRYkfHNSRWMVAGKADPEMPKRMYIHPDSPATGEQWMSKVVTFHKLkLTnNISDKHGFTILNsmHKYQPRFHIVRANDILKLPYSTFRTYLFPETEFIAVtayqNdKItqLkiDNnpfakgfRD C;D TAatttcACacctaggtgtGAAAT;TAatttcACacctaggtgtgAAAT 161 601 376 41;26;309;0 2;0;2;0;0;0;2;0;19;8;8;0;0;0;0;4;4;15;86;226 1H89 1h89_1_1 11792321 2.45 MUS MUSCULUS, HOMO SAPIENS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, C|EbpBeta 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B eyKIrrErnnIavrksrDkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQLPE;eyKIrrErnnIavrksrDkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQLPE D;E GatgtggcgcaaTCCTTAACGGACTG;CCAGTCCGTTAAggattgcgccacAT 23 600 233 100;0;133;0 6;0;12;0;4;0;0;0;7;3;0;0;0;0;0;6;4;31;24;136 1H89 1h89_1_2 11792321 2.45 MUS MUSCULUS, HOMO SAPIENS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, C|EbpBeta 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 C qCqhrWqkvLNPELIkgpwTKEEDQRVIKLVQKYGpkrwsvIAKHLKGrIGkqCrerWhnhLNPEVKkTSwTEEEDRIIYQAHKRLGnrwaEIAkLLPGRTdnAIknhWnstMRr D;E GATGTGGCGCAATCCttaacggaCTG;ccagtccgttAAGGATTGCGCCACAT 173 599 194 61;0;132;1 7;0;3;0;5;0;0;0;7;10;10;0;0;0;0;5;1;16;19;111 1H8A 1h8a_1_1 11792321 2.23 AVIAN MYELOBLASTOSIS VIRUS, HOMO SAPIENS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, C|EbpBeta 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B VDkHSDEyKIrrernnIavrksrDkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQL;DkHSDeyKIrrernnIavrksrDkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQL D;E GatgtggcgcaaTCCTTAACGGACTG;CCAGTCCGTTAAggattgcgccaCAT 23 598 217 88;0;129;0 6;0;10;0;2;0;0;0;8;3;0;0;0;0;0;5;4;32;29;118 1H8A 1h8a_1_2 11792321 2.23 AVIAN MYELOBLASTOSIS VIRUS, HOMO SAPIENS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, C|EbpBeta 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 C NPELnkgpwTKEEDQRVIEHVQKYGpkrwsDIAKHLKGrIGkqCrerWhnhLNPEVKKTSwTEEEDRIIYQAHKRLGnrwaeIAkLLPGRtdnaVknhWnstMRr D;E GATGTGGCGCAATCcttaacggaCTG;CCagtccgttAAGGATTGCGCCACAT 173 597 198 62;0;136;0 6;0;4;0;5;0;0;0;7;9;10;0;0;0;0;4;1;14;25;113 1HCQ 1hcq_1_1 8221895 2.4 HOMO SAPIENS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Hormone Nuclear Receptor, Estrogen Receptor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B MKETRYCAVCNdYAsgyhyGVwSCegCkafFkrSiqGHNDyMCPATNQCTIDKNRrkSCqACrLRKCYEVGMMk;TRYCAVCNdYAsgyhyGVwSCegCkafFkrSiqGHnDyMCPATNQCTIDkNRrkSCqACrLRKCYEVGMMk C;D CcaggtCACAgtgacCTG;CcaggtCACTgtgacCTG 97 596 243 66;0;177;0 10;0;9;0;2;0;1;0;13;0;8;0;0;0;0;2;0;21;25;152 1HCQ 1hcq_2_1 8221895 2.4 HOMO SAPIENS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Hormone Nuclear Receptor, Estrogen Receptor 2 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 E;F MKETRYCAVCNdYAsgyhyGVWScegCkafFkrSiQGHNDyMCPATNQCTIDkNRRKsCqACrLRKCYEVGMMk;KETRYCAVCNdYAsgyhyGVWSCegCkafFkrSiQGDyMCPATNQCTIDkNRRKsCqACrLRKCYEVGMMk G;H CcaggtCACAgtgacCTG;CcaggtCACTgtgacCTG 97 595 205 63;0;142;0 10;0;7;0;2;0;1;0;8;3;9;0;0;0;0;1;0;17;20;127 1I3J 1i3j_1_1 11447104 2.2 BACTERIOPHAGE T4 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease I-TevI 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A KFCKCGVriqTsaytcskCrNrsgENnsffnhkhSDItkSkisEkmkgkkpsnikKISCDGVIFDcaaDAArHFkissglVtyrVksDkwNWFyIN B;C TTCTtgggtctaccgtttAAT;aattaaACGgtagacccaaga 175 592 448 43;56;349;0 8;3;3;1;4;1;0;1;17;12;21;2;0;0;1;3;2;12;91;266 1IAW 1iaw_1_2 11473254 2.4 NOCARDIA AEROCOLONIGENES 1 2 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease NaeI 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B EPDDDLERVRATLYSLDPDGDRTAGVLRDTLDQLYDGQRTGRWNfDQLHktEktHMgtLVeINLHREFQFGDGFeTdYEIAGVQVdckfsmsQGaWmLppeSIGHICLVIWASDQQCAWTAGLVKVIPQFLGtanrdLkRrlTpEGrAQVVKLWPDHGKLQENLLLHIPGDVRDQIFSAKSSRGNQHGQARVNELFRRVHGRLIGRAVIATVAQQDDFMKRVRGSGGARSILRPEGIIILGHQDNDPKVANDLGLPVPRKGQVVAARVVPADEGDQRQTAEIQGRRWAVAVPGDPIVEAPVVPR;EPDDDLERVRATLYSLDPDGDRTAGVLRDTLDQLYDGQRTGRWNfDQLHktEktHMgtLVeINLHREFQFGDGFeTdYEIAGVQVdckfsmsQGaWmLppeSIGHICLVIWASDQQCAWTAGLVKVIPQFLGtanrdLkRrlTpEGrAQVVKLWPDHGKLQENLLLHIPGDVRDQIFSAKSSRGNQHGQARVNELFRRVHGRLIGRAVIATVAQQDDFMKRVRGSGGARSILRPEGIIILGHQDNDPKVANDLGLPVPRKGQVVAARVVPADEGDQRQTAEIQGRRWAVAVPGDPIVEAPVVPR E;F TGCcacgccggcgtGGC;TGccacgccggcgtGGC 69 589 453 137;29;285;2 9;4;15;1;9;2;1;0;8;17;13;1;0;0;2;8;4;32;66;261 1IGN 1ign_1_1 8620531 2.25 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 2 1 1 2 0 0 1 Structural|DNA Binding protein Telomeric Protein Telomere Binding Protein, RAP1 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A kasfTDEEDEFILDVVRKNPtRrtthtLYDEISHYVPnhtGnsIrhrFrVyLSKRLEYVYEVDKFGKLVRDDDGNLIKTKVLPPsikrkfSADEDYTLAIAVKKQFYRDLFQIDPDTGRSLIRTQSRrgpiareffkHFAEEHAahtenaWrdrfrkfLLAYGIDDYISYYEAEEPMknltPtpgnyns C;D CCGcacacccacacacCAG;cctggtGTgtgggtGTgcg 160 115 430 128;8;294;0 10;0;9;0;3;0;5;2;15;16;24;0;0;0;0;4;5;11;75;251 1IHF 1ihf_1_1 8980235 2.2 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein DNA Bending Integrator Host Factor 1 1 1 0 1, 1 0 1 0 0 0 2 1 1 1 A;B aLtkaEMSEYLFDKLGLSkRDAkELVELFFEEIRRALENGEQVkLsgfGnFDLrdknqrpgrnpkTgeDipitArRvvtFrpgqkLkSRVENASPK;MtkseLIeRLATQQSHIPaKTVEDAVkEMLEHMASTLAQGErIeirgFgsFsLhyraPrtgrnpkTGDKvElEGkYvPhFkPgkeLrDRANIYG C;D;E cGGTGCaacaaattgataagcaatgCTTTtttGGC;ggCCAAAAaagCAtt;GcttatcaattTGttgcaCC 63;64 8 472 29;87;354;2 9;0;13;0;0;3;1;1;35;8;14;0;0;0;0;1;1;30;82;274 1IJW 1ijw_1_1 11847127 2.4 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Recombinase Hin Recombinase 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 1 1 1 0 0 1 C grpraINKHEQEQISRLLEKGHPrqQLAIIFgigvstLyryFpasSI A;B TGTttttgatAAGA;AtttatCAaaaac 65 113 169 34;21;113;1 2;1;3;0;1;3;1;1;5;3;11;0;0;0;0;0;0;5;28;105 1IPP 1ipp_1_1 9665136 2.2 PHYSARUM POLYCEPHALUM 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease I-PpoI 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B ALTNAQILAVIDSWEETVGQFPVITHHVPLGGGLQGTLHCYEIPLAapyGvgfaknGPtrWqYkrtINqVvHrwgShtVPFLLEPDNINGktctaShLChNtRCHNPLHLCwESldDnkGRnWCPGPNGGCVHAVVCLRQGplYGPGATVAGPQQRGSHFVV;ALTNAQILAVIDSWEETVGQFPVITHHVPLGGGLQGTLHCYEIPLAapyGvgfakngPtrWqYkrtiNqVvHrwgShtVPFLLEPDNINGktctaShLChNtRCHNPLHLCwESldDnkGRnWCPGPNGGCVHAVVCLRQGplYGPGATVAGPQQRGSHFVV C;D ttgactcTCttaagagagTCA;ttgactcTCttaagagagTCA 29 7 400 120;21;259;0 14;0;7;0;6;0;5;0;12;9;18;0;0;0;0;2;8;20;49;250 1J59 1j59_1_1 8757802 2.5 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Catabolite Gene Activator Protein 1 1 1 0 1, 1 0 2 0 0 0 2 1 2 1 A;B PTLEWFLSHCHIHKYPSkSTLIHQGEKAETLYYIVKGSVAVLIKDEEGkEMILSYLNQGDFIGELGLFEEGQERSAWVRAKTACEVAEISYKKFRQLIQVNPDILMRLSAQMARRLQVTSEKVGNLAFLdvtGrIAQTLLNLAKQPDAMTHPDGMQIkItrqEIGQIVgcsretVgriLkMLEDQNLISAhgKTIVVYG;PTLEWFLSHCHIHKYPsKSTLIHQGEKAETLYYIVKGSVAVLIKDEEGkEMILSYLNQGDFIGELGLFEEGQERSAWVRAKTACEVAEISYKKFRQLIQVNPDILMRLSAQMARRLQVTSEKVGNLAFLdvtGrIAQTLLNLAKQPDAMTHPDGMQIkItrqeIGQIVGcsretVgriLkMLEDQNLISAhgKTIVV C;D;E;F GCGAAAagtgtgaC;ATatgtcacACTtttcG;GCGAAAAgtgtgaC;ATatgtcaCACTtttcG 62 583 274 70;0;204;0 6;0;12;0;4;0;0;0;7;15;11;0;0;0;0;6;0;18;31;164 1J75 1j75_1_1 11524677 1.85 MUS MUSCULUS 1 2 1 1 0 1 1 Structural|DNA Binding protein Zalpha DLM-1|DAI 1 1 1 2 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A NLEQKILQVLSDDGGPVkiGQLVKKCQVPkkTLnqVLyRLKKEDRVSSPEpaTwSIG B;E tCgcgcg;TCGCgCg 103 114 72 6;0;66;0 0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;3;0;0;0;0;0;0;3;13;48 1J75 1j75_1_2 11524677 1.85 MUS MUSCULUS 1 2 1 1 0 1 1 Structural|DNA Binding protein Zalpha DLM-1|DAI 1 2 1 2 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 D NLEQKILQVLSDDGGPVkiGQLVKKCQVPkkTLnqVLyRLKKEDRVSSPEpaTwSIG B;E TCGCgCg;tCgcgcg 103 114 72 6;0;66;0 0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;3;0;0;0;0;0;0;3;13;48 1JFT 1jft_1_1 11781089 2.5 ESCHERICHIA COLI 1 1 1 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Purine Repressor 1 1 1 2 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;D atikDVAKRAnvstttVshVinKtrfvaEEtRNAVWAAIKELHyspsAVarSlkvnHTKSIGLLATSSEAAYFAEIIEAVEKNCFQKGYTLILGNAWNNLEKQRAYLSMMAQKrVDGLLVMCSEYPEPLLAMLEEYRHIPMVVMDAGEAKADFTDAVIDNAFEGGYMAGRYLIERGHREIGVIPGPLERNTGAGRLAGFMKAMEEAMIKVPESWIVQGDFEPESGYRAMQQILSQPHRPTAVFCGGDIMAMGALCAADEMGLRVPQDVSLIGYDNVRNARYFTPALTTIHQPKDSLGETAFNMLLDRIVNKREEPQSIEVHPRLIERRSVADGPFRDYRR;atikDVAKRAnvstttVshVinKtrfvaEEtRNAVWAAIKELHyspsAVarSlkvnHTKSIGLLATSSEAAYFAEIIEAVEKNCFQKGYTLILGNAWNNLEKQRAYLSMMAQKrVDGLLVMCSEYPEPLLAMLEEYRHIPMVVMDAGEAKADFTDAVIDNAFEGGYMAGRYLIERGHREIGVIPGPLERNTGAGRLAGFMKAMEEAMIKVPESWIVQGDFEPESGYRAMQQILSQPHRPTAVFCGGDIMAMGALCAADEMGLRVPQDVSLIGYDNVRNARYFTPALTTIHQPKDSLGETAFNMLLDRIVNKREEPQSIEVHPRLIERRSVADGPFRDYRR B;E TacgcaAacgtttgCGT;TacgcaAacgtttgCGT 68 98 388 88;50;246;4 4;2;4;4;6;0;2;2;6;20;10;0;0;0;0;10;6;8;60;244 1JJ6 1jj6_1_1 11847127 2.3 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Recombinase Hin Recombinase 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 1 1 1 0 0 1 C grpraINKHEQEQISRLLEKGHprqQLAIIFgigvstLyryFpasSI A;B TGTtttgatAAGA;ATcttatCAAaaaC 65 113 167 32;19;116;0 2;1;2;0;1;3;1;1;6;2;8;0;0;0;0;0;0;5;29;106 1JK1 1jk1_1_1 11800559 1.9 MUS MUSCULUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zif268 Zinc Finger 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A rPYACPVESCDrrfsrsaeLtrhIriHTGQkPfQCRICMrnfsrsdhLtthIrtHTGEkPfACDICGrkfarsdeRkrhTkIHLR B;C agcgtgggcgg;tccgcccacgC 19 112 237 91;6;139;1 10;0;12;0;7;0;0;0;4;11;3;0;0;0;0;6;1;21;29;133 1JK2 1jk2_1_1 11800559 1.65 MUS MUSCULUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zif268 Zinc Finger 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A rPYACPVESCDrrfsrSaeLtrhIriHTGQkPfQCRICMrnfsrsdhLtthIrtHTGEkPfACDICGrkfarsderkrhTKiHLR B;C agcgtgggctG;tcagcccacgC 19 112 231 79;5;146;1 9;0;10;0;7;0;0;0;4;10;3;0;0;0;0;5;1;23;25;134 1JKO 1jko_1_1 11847127 2.24 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Recombinase Hin Recombinase 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 1 0 1 0 0 1 C grpraINKHEQEQISRLLEKGHprqQLAIIFgigvstLyryFpasS A;B TGTttttggtAAGA;ATcttacCAaaaaC 65 578 163 28;20;115;0 3;1;1;2;0;2;0;1;8;3;8;0;0;0;0;0;0;5;25;104 1JKR 1jkr_1_1 11847127 2.28 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Recombinase Hin Recombinase 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 1 0 1 0 0 1 C grpraINKHEQEQISRLLEKGHprqQLAIIFgigVstLyryFpasS A;B TGTttttgacAAGA;ATcttgtCAAaaaC 65 577 169 33;16;120;0 2;1;2;0;1;2;0;2;8;4;8;0;0;0;0;0;0;5;28;106 1K61 1k61_1_1 12466549 2.1 1 4 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodamain, Mat Alpha 2 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 1 1 0 0 1 A rghrfTKENvRILESWFAKNIENPylDTKGLENLMKNTSLSriqIknwVsnRrrkEkTIt E;F ACATGTAATTCatttacaCGC;gcgtgtAaatgAATTACATG 101 573 165 40;14;111;0 3;1;7;1;4;0;0;0;6;1;4;0;0;0;0;2;1;7;22;106 1K61 1k61_1_2 12466549 2.1 1 4 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodamain, Mat Alpha 2 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 1 1 0 0 1 B RGhrfTKENvRILeSWFAKNIENPylDTKGLENLMKNTSLSRiqIknwVsnRrrkEktI E;F acatgtAattcATTTACACGC;GCGTGTAAATGAattacaTG 101 572 167 42;11;114;0 3;1;9;1;3;0;0;0;8;1;3;0;0;0;0;2;1;8;30;97 1K61 1k61_1_3 12466549 2.1 1 4 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodamain, Mat Alpha 2 1 3 1 0 1, 1 0 0 0 0 1 1 0 0 1 C hrfTKENvRILeSWFAKNIENPYLDTKGLENLMKNTSLSRiqIKnwVsnRRrkEKT E;F ACATGTAATTCATTTAcacgc;gcGTgtaAATGAATTACATG 101 571 84 18;2;64;0 1;0;3;0;2;0;0;0;3;0;2;0;0;0;0;2;0;4;13;54 1K61 1k61_1_4 12466549 2.1 1 4 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodamain, Mat Alpha 2 1 4 1 0 1, 1 0 0 0 0 1 1 0 0 1 D rghrfTKENvRILESWFAKNIENPylDtKGLENLMKNTSLsriqIknwVsnRrrkEKT E;F ACATgtaattCATTTACACGC;GCGTGTAAAtgaatTacatG 101 570 169 22;10;137;0 4;2;1;1;2;0;1;0;14;3;7;0;0;0;0;1;0;7;24;102 1K78 1k78_1_1 11779502 2.25 MUS MUSCULUS, HOMO SAPIENS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Paired Protein Pax 1 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 3 2 0 1 A;B;I GvnqLGGVfvngrplPDVVrQRIVELAHQGVrpcDISrQLRvshgcVskilGrYyETGSIKpgviggskpkvaTPKVVEKIAEYkRQNPTmfawEIRDRLLAERVCDNdTvpsvssInriIrtK;IqlWQFLLELLTDKSCQSFISWTGDGWEFKLSDPDEVARRwGKRknkPkmNyeklSrgLryyydKNIIHkTAGkrYVYRFVCDLQSLLGYTPEELHAMLDVK;ggskpkvaTPKVVEKIAEYKRQNPTmfawEIrDRLLAERVCDNdTvPsvssInrIirT C;D TTGTgccggagatgggctccagtggcC;aaggccactggagcccatctccGGCAC 90;118;257 569 689 132;48;508;1 7;3;5;4;7;5;7;2;13;15;28;6;0;0;0;3;1;33;106;444 1K78 1k78_2_1 11779502 2.25 MUS MUSCULUS, HOMO SAPIENS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Paired Protein Pax 2 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 2 2 0 1 E;F GvnqLGGVfvngrplPDVVrQRIVELAHQGVrpcDISrQLRvshgcVskiLGrYYETGSIKpgviggskpkvaTPKVVEKIAEYkRQNPTmfawEIRDRLLAERVCDNdTvpsvssInrIirtK;piqlWQFLLELLTDKSCQSFISWTGDGWEFKLSDPDEVARRwGKRknkpkmNyeklSrgLryyydKNIIHkTAGKryVYRFVCDLQSLLGYTPEELHAMLDVK G;H TTGTgccggagatgggctccagtggcC;aaggccACtggagcccatctccGGCAC 90;118 568 531 101;34;395;1 7;3;6;2;6;2;3;2;15;7;23;6;0;0;0;2;1;18;89;339 1K79 1k79_1_1 11779502 2.4 MUS MUSCULUS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Paired Protein Pax 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A gpIqlWQFLLELLTDKSCQSFISWTGDGWEFKLSDPdEVARRwGKRknkpkmNyeklSrgLryyydkNIIHkTAgkryVyRFVCDLQSLLGYTPEELHAMLDVK B;C TAGTgccggaaAtgt;CACatttccGGCACT 90 567 188 48;1;138;1 1;0;2;0;2;0;1;0;5;0;4;0;0;0;0;2;2;16;41;112 1K79 1k79_2_1 11779502 2.4 MUS MUSCULUS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Paired Protein Pax 2 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 D gpIqlwQFLLELLTDKSCQSFISWTGDGWEFKLSDPdEVARRwgKRknkPkmNyeklsrgLryyydkNIIHkTAgKryVyRFVCDLQSLLGYTPEELHAMLDVK E;F TAGtgccggaaATgt;CACatttccGGCACt 90 566 201 52;0;148;1 1;0;1;0;1;0;1;0;4;0;5;0;0;0;0;1;2;16;42;127 1KU7 1ku7_1_1 11931761 2.4 THERMUS AQUATICUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Sigma A Factor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 2 0 1 A;D SEELEKALSKLSErEAMVLKMrKGLIDGREHtleeVGAYFgvtrerIrqienkALRKLKYHESRTRKLRDFLE;KALSKLSEREAMVLKMRKGLIDGREHTLEEVGAYFGVTRERIRQIENKALRKLKYHESRTRKLRDFLE B;C ccttgaCAAAG;CCTTtgtcaAG 192 565 130 59;0;71;0 2;0;3;0;3;0;0;0;3;2;3;0;0;0;0;8;1;11;28;66 1LAT 1lat_1_1 7664096 1.9 RATTUS NORVEGICUS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Hormone Nuclear Receptor, Glucocorticoid Receptor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A RPCLVCSdEAsgchyGVLTCegCkafFkrAVeGQhnyLCKYEGKCIIDkIRrknCpACrYRKCLQAGMNlE C;D TTCcagaACATgttCTGGA;TTCCAGAACatgttcTGGA 56 555 133 33;0;100;0 4;0;3;0;1;0;0;0;3;0;4;0;0;0;0;1;1;11;20;85 1LAT 1lat_1_2 7664096 1.9 RATTUS NORVEGICUS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Hormone Nuclear Receptor, Glucocorticoid Receptor 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B ARPCLVCSdEAsgchyGVLTCegCkafFkrAVEGqhNyLCkYEGKCIIDkIRrknCpACrYRKCLQAGMNlEar C;D TTCCAGAACatgttcTGgA;TTccagaACATgttcTGGA 56 554 146 35;3;108;0 4;0;6;0;3;0;0;0;9;0;3;0;0;0;0;1;1;9;17;93 1LE8 1le8_1_1 12121651 2.3 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodamain, Mat Alpha 2 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 2 2 1 A;B KSsiSPQArAFLEQVFRRKQslNsKEkEEVAKKCGITPlqVrvwFinKrmrSk;rghrfTKENvRILeSWFAKNIENPylDTKGLENLMKNTSLSriqIknwVaaRrakEktiTIAPELADLLSGEPL C;D acatgTAaaaatttacatCA;TtgatGtAAATTtttacaTG 121;123 553 271 61;14;196;0 5;0;7;0;2;0;1;0;11;3;4;0;0;0;0;1;1;18;41;177 1LLI 1lli_1_1 8278404 2.1 BACTERIOPHAGE LAMBDA 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Lambda Repressor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B kkPlTQEQLEDARRLkAIyeKKkNELGLsqeSLADKLgmgqsgIgAlFnGinaLnAYnAALLAKILKVSVEEFSPSIAREIYEMYEAVS;stkkkPLTQEqLEDARRLkAIyeKKkNELGLsqeSLADKLgmgqsgIgalfnGinalnAYnAALLAKILKVSVEEFSPSIAREIYEMYEAVS D;E AataccACTggcggtgaTAT;TatatcaccgccagtggTAT 53 552 313 114;0;197;2 10;2;3;3;4;2;5;2;22;5;13;0;0;0;0;4;4;11;43;180 1LLM 1llm_1_1 14621985 1.5 MUS MUSCULUS AND SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zif268 Zinc Finger 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 C;D MkPFQCRICMrnfsrSdhLTthIrtHTGEkPfACDICGrkfarsderkrhRDiqHILPILEDKVEELLSKNYHLENEVARLKKLVGE;mkPFQCRICMrnfsrsdhLtthIrtHTGEkPfACDICGrkfarsderkrhRDiqHILPILEDKVEELLSKNYHLENEVARLKKLV A;B Tcccacgcgtggg;tcccacgcgtggg 180 551 345 111;13;221;0 8;0;15;3;10;0;0;1;11;12;3;0;0;0;0;9;2;24;37;210 1LMB 1lmb_1_1 1387915 1.8 BACTERIOPHAGE LAMBDA 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Lambda Repressor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 3;4 PlTQEQLEDARRLkAIyeKKkNELGLsqeSVADKMgmgqsgVgalFnGinaLnAYnAALLAKILKVSVEEFSPSIAREIYEMYEAVS;StkkkPLTQEQLEDARRLkAIyeKKkNELGLsqeSVADKMgmgqsgVgalfnGinalnAYnAALLAKILKVSVEEFSPSIAREIYEMYEAVS 1;2 AataccACTggcggtgaTAT;TatatcaccgCCagtggTAT 53 550 275 103;0;172;0 8;2;5;3;3;0;3;0;20;2;9;0;0;0;0;5;2;12;35;166 1LQ1 1lq1_1_1 12176382 2.3 BACILLUS SUBTILIS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Initiation Factor Spo0A 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B KKNLDASITSIIHEIGVpAhikgYLyLREAISMVYNDIELlgsitkVLyPDIAKKFNttAsrVeraIrhAIEvAWSrGNIDSISSLFAkptnsEFIAMVADKLRLEH;NLDASITSIIHEIGVpAhikgYLYLREAISMVYNDIELLGSITKVLYPDIAKKFNTTASrVEraIRhAIEvAWSrGNIDSISSLFAKPTNSEFIAMVADKLRL G;H TTcgtgtcGAATtttg;acAAAattcgaCACGA 88 549 248 62;0;186;0 1;0;6;0;3;0;0;0;0;8;11;0;0;0;0;5;1;12;51;150 1LQ1 1lq1_2_1 12176382 2.3 BACILLUS SUBTILIS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Initiation Factor Spo0A 2 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 C;D KNLDASITSIIHEIGVpAhikgYLyLREAISMVYNDIELLGSITKVLYPDIAKKFNTTASrVEraIRhAIEvAWSrGNIDSISSLFGYTKAKPTNSEFIAMVADKLRLEHKA;KNLDASITSIIHEIGVpAhikgYLyLREAISMVYNDIELlgsitkVLyPDIAKKFNttAsrVeraIrhAIEvAWSrGNIDSISSLFKAkptnsEFIAMVADKLRLEH E;F TTcgtgtcGAATtttg;ACAAAattcgaCACGA 88 548 240 70;0;170;0 2;0;6;0;2;0;1;0;2;8;11;0;0;0;0;6;1;14;50;137 1MEY 1mey_1_1 8901872 2.2 2 1 1 3 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zinc Finger, Synthetic 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 1 2 2 0 1 C;G EkPyKCPECGksfsqssnLqkhQrtHTGEkPyKCPECGksfsqssdLqkhQrtHTGEkPyKCPECGksfsrsdhLsrhQrtHQ;TGEKPYKCPECGKSFSrSDhLSRHQRTH A;B atgaggcagaacT;tagttctgcCtA 184;262 538 232 103;0;129;0 12;2;9;1;11;0;0;0;4;17;1;0;0;0;0;6;2;15;20;132 1MEY 1mey_2_1 8901872 2.2 2 1 1 3 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zinc Finger, Synthetic 2 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 1 1 0 0 1 F MekPyKCPECGkSfsqssnLqkhQrtHTGEkPyKCPECGksfsqssdLqkhQRtHTGEkPyKCPECGksfsrsdhLsrhQrtHQ D;E atgaggcagaaCT;tagttctgcCtA 184 537 244 105;0;139;0 12;4;8;2;11;0;0;0;4;15;2;0;0;0;0;7;2;12;28;137 1MJ2 1mj2_1_1 10986458 2.4 ESCHERICHIA COLI 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Ribbon|Helix|Helix Methionine Repressor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B AEWSGEYISPYAEhgKksEQvKkitVsIPLKVlKILTDErTRRkVNNlrhatnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY;AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVLKILTDErTRRkVNNLRHAtnsELLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY F;G ttagacgTCTAGacgTCTA;TTAGACGTctagacGTCTA 17 536 183 33;1;149;0 4;2;2;0;3;0;0;0;7;9;17;0;0;0;0;1;2;14;15;107 1MJ2 1mj2_1_2 10986458 2.4 ESCHERICHIA COLI 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Ribbon|Helix|Helix Methionine Repressor 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 C;D AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVlKILTDErTRRkVNnlrhatnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKeRSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY;AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVLKILTDErTRRKVNNLRHAtnsELLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY F;G TTAGACGTCtagacgTCTA;ttagacgtCTAGacgTCTA 17 535 193 33;1;159;0 4;2;2;0;4;0;0;0;3;9;17;0;0;0;0;0;2;14;23;113 1MJO 1mjo_1_1 10986458 2.1 ESCHERICHIA COLI 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Ribbon|Helix|Helix Methionine Repressor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVLKILTDErTRRkVNNlrhatnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY;AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVLKILTDErTRRkVNNLRHAtnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY F;G ttagacgtCATGacgTCTA;TTAGACGTcatgacgTCTA 17 107 195 33;1;161;0 3;2;1;0;4;0;0;0;5;8;18;0;0;0;0;1;2;16;21;114 1MJO 1mjo_1_2 10986458 2.1 ESCHERICHIA COLI 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Ribbon|Helix|Helix Methionine Repressor 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 C;D AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVLKILTDErTRRkVNnlrhatnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY;AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVLKILTDErTRRKVNNLRHAtnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY F;G TTAGACGTcatgacgTCTA;ttagacgTCATGacgTCTA 17 107 194 39;0;155;0 3;2;2;0;4;0;0;0;5;8;18;0;0;0;0;1;2;13;23;113 1MJQ 1mjq_1_1 10986458 2.4 ESCHERICHIA COLI 2 2 1 2 0 0 1 Transcription factor Ribbon|Helix|Helix Methionine Repressor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVlKILTDErTRRkVNnlrhatnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY;AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVLKILTDErTRRKVNNLRHAtnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY E;F ttagataTCTAGataTCTA;TTAGATATctagataTCTA 17 106 193 44;0;149;0 4;2;2;3;2;0;0;0;6;9;18;0;0;0;0;2;2;13;23;107 1MJQ 1mjq_1_2 10986458 2.4 ESCHERICHIA COLI 2 2 1 2 0 0 1 Transcription factor Ribbon|Helix|Helix Methionine Repressor 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 C;D AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVlKILTDErTRRkVNnlrhatnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKeRSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY;AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVLKILTDErTRRkVNNLRHAtnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY E;F TTAGATATctagataTCTA;ttagatATCTAGataTCTA 17 106 198 46;1;151;0 4;3;2;3;2;0;0;0;4;8;18;0;0;0;0;2;2;16;26;108 1MJQ 1mjq_2_1 10986458 2.4 ESCHERICHIA COLI 2 2 1 2 0 0 1 Transcription factor Ribbon|Helix|Helix Methionine Repressor 2 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 G;H AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVlKILtDErTRRkVNnlrhatnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY;AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVLKILTDErTRRKVNNLRHAtnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY K;L ttagatatCTAGataTCTA;TTAGATATctagataTCTA 17 105 186 46;0;140;0 4;2;2;3;2;0;1;0;7;9;18;0;0;0;0;2;2;14;25;95 1MJQ 1mjq_2_2 10986458 2.4 ESCHERICHIA COLI 2 2 1 2 0 0 1 Transcription factor Ribbon|Helix|Helix Methionine Repressor 2 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 I;J AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVlKILTDErTRRkVNnlrhatnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKeRSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY;AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVlKILTDErTRRkVNNLRHAtnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY K;L TTAGATATctagataTCTA;ttagataTCTAGataTCTA 17 105 206 47;1;158;0 4;3;2;3;2;0;0;0;8;7;18;0;0;0;0;2;2;16;22;117 1MNM 1mnm_1_1 9490409 2.25 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 3 0 1 0 0 1 Transcription factor Alpha|Beta Transcriptional Regulator, MCM1 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B QkerrkiEiKFIENktrRhvtFskrKHgIMkkAFeLSVlTGTQVLLLVVSETGLVYTFSTPKFEPIVTQQEGRNLIQACLNAPDD;rrkiEIKFIENkTrRhvtfskrkhgIMkkAFeLSVlTGTQVLLLVVSEtGlVyTFSTPKFEPIVTQQEGRNLIQACLNAPD E;F gattacctaatagggaaATTTACACG;CCGTGTAaatttCCCTattaggtAAT 182 533 304 51;11;241;1 4;0;7;0;0;0;0;0;9;9;6;0;0;0;0;1;3;22;51;192 1MNM 1mnm_1_2 9490409 2.25 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 3 0 1 0 0 1 Transcription factor Alpha|Beta Transcriptional Regulator, MCM1 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 C GLVFNVVTQDMINKSTKpyrghrfTKENvRILeSWFAKNIENPylDTKGLENLMKNTSLSRiqIknwVsnRrrkEkT E;F GATTACCTAATAGGGAAAtttacaCG;ccgtgtaaattTCCCTATTAGGTAAT 188 532 213 39;25;149;0 4;1;8;1;2;1;0;1;10;1;5;0;0;0;0;3;1;7;32;136 1MNM 1mnm_1_3 9490409 2.25 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 3 0 1 0 0 1 Transcription factor Alpha|Beta Transcriptional Regulator, MCM1 1 3 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 D GLVFNVVTQDMINKSTKPyrGhrfTKENvRILeSWFAKNIENPYLDTKGLENLMKNTSLSRiqIKnwVsnRRrkEkT E;F gatTAcctaATAGGGAAATTTACACG;CCGTGTAAATTTCCCTATTAggtaat 188 531 137 23;10;104;0 6;1;1;2;1;0;0;0;5;0;2;0;0;0;0;1;0;7;23;88 1MNN 1mnn_1_1 12411490 1.4 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet NDT80 Protein 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A VILTQLNEDGTTSNYFDkRKlkiaprstLqfKVGPPFELVRDYCPVVESHTGRTLDLRIIPRIDrGFDHIDEEWVGykrnyFTLVSTFETANCDLDTFLKSSFDLLVGRLRVQYFAIKIKAKNDDDDTEINLVQHTakrdkGPqFCPSVCPLVPSPLPKHQTIreAsnvrnITkMKKYDSTFYLHRDHVNYEEYGVDSLLFSYPEDSIQKVARYErVQFAssISVkKPSQQNKHFSLHVILGAVVDPDGIPYDELALKNGSKGMFVYLQEMKTPPLIIRGrspSNyAsSQ B;C TgcgacaCaaaaac;AGTTtttgtgtCGC 33 2 267 54;21;189;3 5;0;11;0;1;1;1;0;11;5;6;0;0;0;0;2;4;12;37;171 1NFK 1nfk_1_1 7530332 2.3 MUS MUSCULUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet NFkB 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B GPYLQILEQPKQRgfrFryVceGPShggLpGASSEkNKksYPQVKICNYVGPAKVIVQLVTNGKNIHLHAHSLVGKHCEDGVCTVTAGPKDMVVGFAnLGILhvtkkKVFETLEARMTEACIRGYNPGLLVHSDLAYLQAEGGGDRQLTDREKEIIRQAAVQQTKEMdlsVVRLMFTAFLPDSTGSFTRRLEPVVSDAIYdskApNASnLkIVRMDRTAGCVTGGEEIYLLCdkVqkDDIQIRFYEEEENGGVWEGFGDFSPTDvHrqfAIVFKTPKYKDVNITKPASVFVQLRRKSDLETSEPKPFLYYPE;GPYLQILEQPKQRGFrFryvceGpshGGLPGASSEKNKKSYPQVKICNYVGPAKVIVQLVTNGKNIHLHAHSLVGKHCEDGVCTVTAGPKDMVVGFANLGILhvtkkKVFETLEARMTEACIRGYNPGLLVHSDLAYLQAEGGGDRQLTDREKEIIRQAAVQQTKEMDlsVVRLMFTAFLPDSTGSFTRRLEPVVSDAIYDSkApNASNLKIVRMDRTAGCVTGGEEIYLLCdkVqkDDIQIRFYEEEENGGVWEGFGDFSPtDvHrqFAIVFKTPKYKDVNITKPASVFVQLRRKSDLETSEPKPFLYYPE C;D tgggaattccc;tgggaattccc 136 523 336 126;2;207;1 13;0;18;0;5;0;2;0;14;3;5;4;0;0;0;4;9;19;60;180 1NK6 1nk6_1_1 15035983 2.1 BACILLUS STEAROTHERMOPHILUS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Polymerase DNA Polymerase I 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A AKMAFTLADRVTEEMLADKAALVVEVVEENYHDAPIVGIAVVNEHGRFFLRPETALADPQFVAWLGDETKKKSMFDSKRAAVALKWKGIELCGVSFDLLLAAYLLDPAQGVDDVAAAAKMKQYEAVRPDEAVYGKGAKRAVPDEPVLAEHLVRKAAAIWELERPFLDELRRNEQDRLLVELEQPLSSILAEMEFAGVKVDTKRLEQMGKELAEQLGTVEQRIYELAGQEFnInspkqLGVILFEKLQLPVLkKtktGystsaDVLEKLAPYHEIVENILHYrqLGklQstyIegLLkVVRPDTKKVHTIFnQAltqtGrLsstePnLqnipirlEEGRKIrQAFVPSESDWLIFAAdySqIeLRVLAHIAEDDNLMEAFRRDLDIhTKTAMDIFQVSEDEVTPNMRRQAkAVNfGIVygisDyGLAqnLNISRKEAAEFIERYFESFPGVKRYMENIVQEAKQKGYVTTLLHRRrYLPDITSRNFNVRSfAErmAMNTPIqGSAADIIKKAMIDLNARLKEERLQAHLLLQVhdeLILEAPKEEMERLCRLVPEVMEQAVTLRVPLKVDYHYGSTWYDAK B;C Gcatgatcc;gatcatgca 2 516 313 10;31;268;4 3;1;5;0;0;0;0;0;14;15;13;0;0;0;0;0;0;16;54;192 1NK7 1nk7_1_1 15035983 1.9 BACILLUS STEAROTHERMOPHILUS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Polymerase DNA Polymerase I 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A AKMAFTLADRVTEEMLADKAALVVEVVEENYHDAPIVGIAVVNEHGRFFLRPETALADPQFVAWLGDETKKKSMFDSKRAAVALKWKGIELCGVSFDLLLAAYLLDPAQGVDDVAAAAKMKQYEAVRPDEAVYGkGAKRAVPDEPVLAEHLVRKAAAIWELERPFLDELRRNEQDRLLVELEQPLSSILAEMEFAGVKVDTKRLEQMGKELAEQLGTVEQRIYELAGQEFnInspkqLGVILFEKLQLPVLKKtktGYstsaDVLEKLAPYHEIVENIlHYrqLGklQstyIegLLkVVRPDTKKVHTIFNQAltqtGrLsstePnLqnipirlEEGRKIrQAFVPSESDWLIFAADySqielRVLAHIAEDDNLMEAFRRDLDIHTKTAMDIFQVSEDEVTPNMRRQAKAVnfGIvyGISDYGLAQNLNISRKEAAEFIERYFESFPGVKRYMENIVQEAKQKGYVTTLLHRRrYLPDITSRNFNVRSfAErmAMnTPIqGSAADIIKKAMIDLNARLKEERLQAHLLLQvhdeLILEAPKEEMERLCRLVPEVMEQAVTLRVPLKVDYHYGSTWYDAK B;C gCatcatgcg;gcatgatgca 2 515 334 12;31;288;3 6;0;6;0;1;0;1;0;15;10;17;0;0;0;0;0;0;13;64;201 1NKP 1nkp_1_1 12553908 1.8 HOMO SAPIENS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Helix Loop Helix, Myc|Max 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 2 1 1 A;B GhMNVkrRthnVlerQrrnElkRSFFALRDQIPELENNEkApkvvILKKATAYILSVQAEEQKLISEEDLLRKRREQLKHKLEQLGGC;DkrAhhnAlerKrrdhikDSFHSLRDSVPSLQGEkAsrAqILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQVRALGGC F;G CGAgtagcacgtgcTACTC;CGagtagcacgtgcTAcTC 94;179 510 260 82;0;178;0 3;0;2;0;6;0;0;0;9;1;4;0;0;0;0;3;3;23;31;175 1NKP 1nkp_2_1 12553908 1.8 HOMO SAPIENS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Helix Loop Helix, Myc|Max 2 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 2 1 1 D;E MNVkrRthnVlerQrrneLkRSFFALRDQIPELENNekApkvvILKKATAYILSVQAEEQKLISEEDLLRKRREQLKHKLEQL;rAhhnAlerKrrdhIkDSFHSLRDSVPSLQGEKasraqILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQVRALGGC H;J CGAGtagcacgtgcTACTC;CGAgtagcacgtgcTacTC 94;179 509 249 83;0;166;0 3;0;2;0;6;0;0;0;8;1;4;0;0;0;0;2;2;24;28;169 1NNJ 1nnj_1_1 16243784 1.9 LACTOCOCCUS LACTIS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Glycosylase Formamidopyrimidine DNA Glycosylase 1 1 1 0 1, 1 1 0 0 0 1 1 0 0 1 A geLPEVETVRRELEKRIVGQKIISIEATyPrMVLTGFEQLKKELTGKTIQGISRRGkyLIFEIGDDFRLIShLrmeGKYRLATLDAPREkhDHLTMKFADGQLIYADvrkfGTWELISTDQVLPYFLKkkiGPEPTYEDFDEKLFREKLRKStkkIKPYLleqTLVAGLgnIYVDEVLWLAKIHPEKETNQLIESSIHLLHDSIIEILQKAIKLGGSSIALGSTGKMQNELQVyGKTGEKCSRCGAEIQkIkVagrgThFCPVCQQK D;E CTCTtttttCTCG;gcgagaAacaaAGA 44 4 212 34;38;136;4 0;0;6;0;0;0;1;0;9;1;5;0;0;0;0;0;4;16;34;136 1OUZ 1ouz_1_1 12842466 2.41 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein DNA Bending Integrator Host Factor 1 1 1 0 1, 1 0 1 0 0 0 2 1 1 1 A;B aLtkaEMSEYLFDKLGLSkRDAkELVELFFEEIRRALENGEqVkLsgfGnFDLrdknqrpgrnpktgeDipiTArRvvtfrpgqklkSRVENASPK;MtksELIeRLATQQSHIPaKTVEDAVkEMLEHMASTLAQGErIairgFgsFsLhyraPrTGrnpkTGDKvElEGkYvPhfkPgkELrDRANIYG C;D;E cGGTGctacaaattgataagcaatgCTTttttGGC;ggCCAAAAaagCatt;GCttatcaattTGTagcaCC 63;64 8 464 33;89;338;4 7;0;12;1;0;2;1;1;35;8;20;0;0;0;0;1;0;29;85;262 1OWF 1owf_1_1 12842466 1.95 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein DNA Bending Integrator Host Factor 1 1 1 0 1, 1 0 1 0 0 0 2 1 1 1 A;B aLtkaEMSEYLFDKLGLSkRDAkELVELFFEEIRRALENGEQVkLsgfGnFDLrdknqrpgrnpktgedipiTArRvvtFrpgqkLkSRVENASPK;MtksELIeRLATQQSHIPaKTVEDAVkEMLEHMASTLAQGErIairgFgsFsLhyraPrTgrnpkTGDKvElEGkYvPhfkPgkeLrDRANIYG C;D;E cGGTGCaacaaattgataagcaatgCTTTtttGGC;ggCCAAAAaagCAtt;GCttatcaattTGttgcaCC 63;64 8 452 26;81;343;2 7;0;13;0;0;2;1;1;36;8;15;0;0;0;0;1;0;28;78;262 1OWG 1owg_1_1 12842466 2.1 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein DNA Bending Integrator Host Factor 1 1 1 0 1, 1 0 1 0 0 0 2 1 1 1 A;B aLtkaEMSEYLFDKLGLSkRDAkELVELFFEEIRRALENGEQVkLsgfGnFDLrdknqrpgrnpkTgeDipitArRvvtFrpgqkLkSRVENASPK;MtkseLIeRLATQQSHIPaKTVEDAVkEMLEHMASTLAQGErIeirgFgsFSLhyraPrTGrnpkTGDKvElEGkYvphfkPgkELrDRANIYG C;D;E cGGTGctacaaattgataagcaatgCTTttttGGC;ggCCAAAAaagCAtt;GCttatcaattTGTagcacC 63;64 8 461 29;88;341;3 7;0;12;0;0;2;1;1;35;7;15;0;0;0;0;1;0;35;85;260 1P47 1p47_1_1 12818197 2.2 MUS MUSCULUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zif268 Zinc Finger 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B ErPyACPVESCDrrfsrsdeLtrhIriHTGQkPfQCRICMrnfsrsdhLtthIrtHTGEkPfACDICGrkfarsderkrhTKiHLrq;rPYACPVESCDrrfsrsdeLtrhIriHTGQkPfQCRICMrnfsrsdhLtthIrtHTGEkPfACDICGrkfarsderkrhTkiHL C;D gtggcgtgggcggcgtgggcgt;cacgcccacgccgcccacgCCA 19 496 513 183;1;329;0 25;1;24;0;16;0;0;0;12;26;5;0;0;0;0;10;1;44;51;298 1P51 1p51_1_1 12853489 2.5 ANABAENA SP. 2 1 1 2 0 0 1 Structural|DNA Binding protein DNA Packaging Histone-like, HU Protein 1 1 1 0 2, 2 1 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B MNKGELVDAVAEKASVTKKQADAVLTAALETIIEAVSSGDKVTLVGFGSFESrerkaregrnpkTnEkmEipAtRvPAfsAGKLFrEKVAPP;MNKGELVDAVAEKASVTKKQADAVLTAALETIIEAVSSGDkVTLVGFGSFeSrerkaregrnpktnEkmEipAtRvPAfsAGKLFrEKVAPP E;F gCatatcaatttgttgCAT;GCatatcaatttgttgcAT 42 495 320 14;87;215;4 7;0;7;0;0;0;2;4;16;4;6;0;0;0;0;0;0;22;46;206 1P51 1p51_2_1 12853489 2.5 ANABAENA SP. 2 1 1 2 0 0 1 Structural|DNA Binding protein DNA Packaging Histone-like, HU Protein 2 1 1 0 2, 2 1 0 0 0 0 2 1 1 1 C;D MNKGELVDAVAEKASVTKKQADAVLTAALETIIEAVSSGDkVtLVGFGsFeSrerkaregrnpktnEkmEipAtRvPAfsaGkLFrEKVAPP;MNKGELVDAVAEKASVTKKQADAVLTAALETIIEAVSSGDkVTLVGFGSFeSrerkaregrnpkTnEkmEiPAtRvPAfsAGKLFrEKVAPP H;I gCatatcaatttgttgcAT;gCatatcaatttgttgcAT 42 494 326 14;90;218;4 10;0;7;0;0;0;2;3;17;5;6;0;0;0;0;0;0;28;45;203 1PDN 1pdn_1_1 7867071 2.5 DROSOPHILA MELANOGASTER 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Paired Protein Pax 1 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 1 0 0 1 C qGrvnqLGGVfingrplPNNIrLKIVEMAADGIrpcVISrQLRvshgcVskiLnrYQETGSIRpgviggskprIAtPEIENRIEEYKRSSPGMFSWEIREKLIREGVCDRSTAPSVSAISRLV A;B AacgtcACggttgac;TTGTCaaccgtgacG 230 490 279 32;28;219;0 2;0;0;0;1;4;3;1;12;3;14;7;0;0;0;2;1;14;51;164 1PER 1per_1_1 8081737 2.5 BACTERIOPHAGE 434 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix 434 Repressor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 L;R SISSRVkSKrIQLGLnqaELAQKVGttqqsIeqLEnGktkrprfLPELASALGVSVDWLLNGT;SISSRVkSKrIQLGLnqaELAQKVgttqqsIeqLEnGktkrprfLPELASALGVSVDWLLNGT A;B AAgtacaGTTTttcttgtAT;TatacaAGAaaaactgtACT 60 489 291 98;5;188;0 7;0;8;0;4;0;1;0;22;14;12;0;0;0;0;15;2;15;22;169 1PJI 1pji_1_1 16243784 1.9 LACTOCOCCUS LACTIS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Glycosylase Formamidopyrimidine DNA Glycosylase 1 1 1 0 1, 1 1 0 0 0 1 1 0 0 1 A peLPEVETVRRELEKRIVGQKIISIEATyPrMVLTGFEQLKKELTGKTIQGISRRGkyLIFEIGDDFRLIShLrmeGKYRLATLDAPREkhDHLTMKFADGQLIYADvrkfGTWELISTDQVLPYFLKkkiGPEPTYEDFDEKLFREKLRKStkkIKpYLleqTLVAGLgnIYVDEVLWLAKIHPEKETNQLIESSIHLLHDSIIEILQKAIKLGGSSSALGSTGKMQNELQVyGKTGEKCSRCGAEIQkIkVagrgThFCPVCQQK D;E CTCTtttttCTCG;gcgagaAacaaAGA 44 4 208 37;35;132;4 0;0;6;0;0;0;1;0;8;1;3;0;0;0;0;0;4;15;32;138 1PJJ 1pjj_1_1 16243784 1.9 LACTOCOCCUS LACTIS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Glycosylase Formamidopyrimidine DNA Glycosylase 1 1 1 0 1, 1 1 0 0 0 1 1 0 0 1 A geLPEVETVRRELEKRIVGQKIISIEATyPrMVLTGFEQLKKELTGKTIQGISRRGkyLIFEIGDDFRLIShLrmeGKYRLATLDAPREkhDHLTMKFADGQLIYADvrkfGTWELISTDQVLPYFLKkkiGPEPTYEDFDEKLFREKLRKStkkIKPYLleqTLVAGLgnIYVDEVLWLAKIHPEKETNQLIESSIHLLHDSIIEILQKAIKLGGSSIRTYSALGSTGKMQNELQVyGKTGEKCSRCGAEIQkIkVagrgThFCPVCQQK D;E CTCTtttttCTCG;gcgagaAacaaAGA 44 4 205 32;42;127;4 0;0;5;0;0;0;1;0;9;1;4;0;0;0;0;0;4;14;32;135 1PM5 1pm5_1_1 16243784 1.95 LACTOCOCCUS LACTIS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Glycosylase Formamidopyrimidine DNA Glycosylase 1 1 1 0 1, 1 1 0 0 0 1 1 0 0 1 A peLPEVETVRRELEKRIVGQKIISIEATyPrMVLTGFEQLKKELTGKTIQGISRRGkyLIFEIGDDFRLIShLrmeGKYRLATLDAPREkhDHLTMKFADGQLIYADvrkfGTWELISTDQVLPYFLKkkiGPEPTYEDFDEKLFREKLRKStkkIKPYLleqTLVAGLgnIYVDEVLWLAKIHPEKETNQLIESSIHLLHDSIIEILQKAIKLGGSSIRTYSALGSTGKMQNELQVyGKTGEKCSRCGAEIQkIkVagrgThFCPVCQQK D;E CTCTtttttCTCG;gcgagaAacaaAGA 44 4 203 31;39;129;4 0;0;5;0;0;0;1;0;8;1;3;0;0;0;0;0;4;15;34;132 1PUE 1pue_1_1 8602247 2.1 MUS MUSCULUS 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Ets Domain, Pu.1 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 E kirlYQFLLDLLRSGDMKDSIWWVDKDKGTFQFSsKHkEALAHRwGIQkgnrkKmTyekmAraLrnyGktGEVKkVkkklTyQFSGEV A;B AAAaaggggaAGtggg;TCCCacttcccCTTTt 177 485 208 46;1;161;0 4;0;3;0;2;0;0;0;10;1;7;0;0;0;0;2;3;15;41;120 1PUE 1pue_2_1 8602247 2.1 MUS MUSCULUS 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Ets Domain, Pu.1 2 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 F kirlYQFLLDLLRSGDMKDSIWWVDKDKGTFQFSsKHkEALAHRwGIQkGnrkKmTyekmaraLrnyGktGeVKkVkkklTyQFSGEVL C;D AAAAaggggaAGtggg;TCCCacttcccCTTtt 177 484 199 46;1;151;1 4;0;2;0;2;0;0;0;5;1;8;0;0;0;0;2;3;16;35;121 1PUF 1puf_1_1 12923056 1.9 HOMO SAPIENS, MUS MUSCULUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, HoxA9 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 2 1 1 A;B NNPAANWlharStrkkrcpyTkHQtLELEKEFLFNMylTrDRrYEVARLLNLTErqVkiwFqnRrmkMkkiNKDRAK;ArRkrrnfNKQAtEILNEYFYSHLSNPypSeEAkEELAKKCGITVSqVsnwFgnKrirYkkNIGKfQEEANIY D;E ACTCTatgatttacgaCGCT;TAgcgtcgtaaatcatagAG 191;246 483 406 72;25;309;0 10;0;8;0;6;0;1;0;25;3;10;0;0;0;0;3;0;29;76;235 1QPS 1qps_1_1 0 2.5 ESCHERICHIA COLI 1 1 1 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRI 1 1 1 2 1, 1 0 2 0 0 0 2 1 1 1 A;B SQGVIGIFGDYAKAHDLAVGEVSKLVKKALSNEYPQLSFRYRDSIKKTEINEALKKIDPDLGGTLFvsnssikPdGGIVEVKDDYGEWRVVLVAeakhqgkDIInIRNGLLvgkRGDqDLmaagnaIerSHknISEIANFMLSESHFPYVLFLEGSNFLTENISITRPDGRVVNLEYnsgiLNrLdrLTAANYGMPINSNLCINKFVNHKDKSIMLQAASIYTQGDGREWDSKIMFEIMFDISTTSLRVLGRDLFEQLTSK;SQGVIGIFGDYAKAHDLAVGEVSKLVKKALSNEYPQLSFRYRDSIKKTEINEALKKIDPDLGGTLFvsnssikPdGGIVEVKDDYGEWRVVLVAeakhqgkDIInIRNGLLvgkRGDqDLmaagnaIerSHknISEIANFMLSESHFPYVLFLEGSNFLTENISITRPDGRVVNLEYnsgiLNrLdrLTAANYGMPINSNLCINKFVNHKDKSIMLQAASIYTQGDGREWDSKIMFEIMFDISTTSLRVLGRDLFEQLTSK M;N;Q;R tcgcg;aattcgcg;tcgcg;aattcgcg 28 477 426 136;4;284;2 8;0;0;0;4;2;6;4;18;2;26;0;0;0;0;2;6;24;62;262 1QPZ 1qpz_1_1 10438625 2.5 ESCHERICHIA COLI 1 1 1 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Purine Repressor 1 1 1 2 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B atikDVAKRAnvstttVshVInKtrfvaEEtRNAVWAAIKELHyspsAVarSlkvnHTKSIGLLATSSEAAYFAEIIEAVEKNCFQKGYTLILGNAWNNLEKQRAYLSMMAQKrVDGLLVMCSEYPEPLLAMLEEYRHIPMVVMDWGEAKADFTDAVIDNAFEGGYMAGRYLIERGHREIGVIPGPLERNTGAGRLAGFMKAMEEAMIKVPESWIVQGDFEPESGYRAMQQILSQPHRPTAVFCGGDIMAMGALCAADEMGLRVPQDVSLIGYDNVRNARYFTPALTTIHQPKDSLGETAFNMLLDRIVNKREEPQSIEVHPRLIERRSVADGPFRDYR;atikDVAKRAnvstttVshVInKtrfvaEEtRNAVWAAIKELHyspsAVarSlkvnHTKSIGLLATSSEAAYFAEIIEAVEKNCFQKGYTLILGNAWNNLEKQRAYLSMMAQKrVDGLLVMCSEYPEPLLAMLEEYRHIPMVVMDWGEAKADFTDAVIDNAFEGGYMAGRYLIERGHREIGVIPGPLERNTGAGRLAGFMKAMEEAMIKVPESWIVQGDFEPESGYRAMQQILSQPHRPTAVFCGGDIMAMGALCAADEMGLRVPQDVSLIGYDNVRNARYFTPALTTIHQPKDSLGETAFNMLLDRIVNKREEPQSIEVHPRLIERRSVADGPFRDYR M;Q TacgcaAacgtttgCGT;TacgcaAacgtttgCGT 68 98 398 96;42;256;4 6;0;2;4;6;0;2;2;10;16;14;0;0;0;0;8;6;8;68;246 1QRH 1qrh_1_1 0 2.5 ESCHERICHIA COLI 1 1 1 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRI 1 1 1 2 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SQGVIGIFGDYAKAHDLAVGEVSKLVKKALSNEYPQLSFRYRDSIKKTEINEALKKIDPDLGGTLFvsnssIkPdGGIVEVKDDYGEWRVVLVAEakhqgkDIINIRNGLLvgkRGDQDLmaagnaIekSHknISEIANFMLSESHFPYVLFLEGSNFLTENISITRPDGRVVNLEYnsgiLNrLdrLTAANYGMPINSNLCINKFVNHKDKSIMLQAASIYTQGDGREWDSKIMFEIMFDISTTSLRVLGRDLFEQLTSK;SQGVIGIFGDYAKAHDLAVGEVSKLVKKALSNEYPQLSFRYRDSIKKTEINEALKKIDPDLGGTLFvsnssIkPdGGIVEVKDDYGEWRVVLVAEakhqgkDIINIRNGLLvgkRGDQDLmaagnaIekSHknISEIANFMLSESHFPYVLFLEGSNFLTENISITRPDGRVVNLEYnsgiLNrLdrLTAANYGMPINSNLCINKFVNHKDKSIMLQAASIYTQGDGREWDSKIMFEIMFDISTTSLRVLGRDLFEQLTSK M;Q TcgcgaattcgCg;TcgcgaattcgCg 28 476 368 122;10;234;2 10;0;2;0;4;0;6;4;12;8;18;0;0;0;0;2;6;16;52;228 1R0O 1r0o_1_1 14592980 2.24 DROSOPHILA MELANOGASTER 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Hormone Nuclear Receptor, Glucocorticoid Receptor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 2 1 1 A;B hLCSICGdrAsgkhygVySCegCkgfFkrTVrkDlTyACrENRNCIIDKRQrnrCqYCrYQKCLTCGMkREavqEe;EELCLVCGdrAsgyhyNALTCegCkgfFrrSVtkSAVyCCkFGRACEMDMYMrrkCqECrLKKCLAVGMRPEcVvpEn C;D CcgaggtCAatgaccTCG;CcgaggtCAttgaccTCG 46;245 472 295 75;0;220;0 7;0;6;0;3;0;2;0;14;0;10;0;0;0;0;1;0;31;29;192 1R4O 1r4o_1_1 1865905 2.5 RATTUS NORVEGICUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Hormone Nuclear Receptor, Glucocorticoid Receptor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B MKPARPCLVCSdEAsgchyGVLTCgsCkvfFkrAVEGqhnyLCAGRNDCIIDkIRrkNCpACrYRKCLQAGMNlEarktk;MKPARPCLVCSdEAsgchyGVLTCgsCkvfFkrAVeGQHNyLCAGRNDCIIDkIRrkNCpACrYRKCLQAGMNlEarkTK C;D ccagaaCATcgatgtTCTG;CcagaACATCGatgttCTG 56 469 280 40;4;236;0 4;0;2;0;0;0;0;0;8;5;10;0;0;0;0;0;2;20;48;181 1RPE 1rpe_1_1 8355273 2.5 BACTERIOPHAGE 434 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix 434 Repressor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 L;R SISSRVkSKrIQLGLnqaELAQKVGttqqsIeqLEnGktkrprfLPELASALGVSVDWLLNGT;SISSRVkSKrIQLGLnqaELAQKVgttqqsIeqLEnGktkrprfLPELASALGVSVDWLLNGT A;B ACaaacaagATacattgtAT;TatacaaTGTatcttgtTTG 60 463 290 90;5;195;0 10;0;10;0;5;0;0;0;18;12;12;0;0;0;0;11;1;11;30;170 1RV5 1rv5_1_1 9545372 2.1 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRV 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtkVLsTIFELFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKENEKIkFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTrVSSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsQLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK;SLRSDLINALDVCGIISAEGKIYPLGSDtkVLsTIFeLFSRPIINKIAEKHGYIVEEPkqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKIkFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTRVLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsqLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK C;D aaagatatctt;aaagatatctt 1 460 444 117;13;314;0 5;1;4;3;6;6;5;3;20;23;25;0;0;0;0;6;2;15;56;264 1RVA 1rva_1_1 7819264 2 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRV 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtkVLsTIFeLFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKENEKIkFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTrVATRKSSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIhAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsQLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK;SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtkVLsTIFeLFSRPIINKIAEKHGYIVEEPkqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKENEKIkFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTrVATRKSSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgntTnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsQLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK C;D aaagatatctt;aaagatatctt 1 39 460 109;21;330;0 7;1;8;2;4;6;4;2;23;20;22;0;0;0;0;6;2;26;58;269 1RVB 1rvb_1_1 7819264 2.1 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRV 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtkVLsTIFeLFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKENEKIkFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTrVATRKSSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsQLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK;SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtkVLsTIFeLFSRPIINKIAEKHGYIVEEPkqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKENEKIkFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVyTrVATRKSSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsQLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK C;D aaagatatctt;aaagatatctt 1 39 474 108;17;349;0 6;1;6;3;4;6;6;2;25;26;20;0;0;0;0;6;2;27;61;273 1RVC 1rvc_1_1 7819264 2.1 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRV 1 1 1 0 1, 1 0 2 0 0 0 2 1 1 1 A;B SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtkVLsTIFeLFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKENEKIkFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTrVATRKSSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsQLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK;SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtkVLsTIFeLFSRPIINKIAEKHGYIVEEPkqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKENEKIkFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTrVATRKSSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsQLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK C;D;E;F aaagat;atctt;aaagat;atctt 1 459 479 116;17;346;0 3;0;7;2;4;6;6;2;20;26;19;0;0;0;0;8;2;29;61;284 1SKN 1skn_1_1 9628487 2.5 CAENORHABDITIS ELEGANS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Alpha Helix SKN-1 1 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 1 0 0 1 P GrQskdEQLASDNELPVSAFQISEMSlSElQQVlKNESLSEYQRQLIrKIrrrGknkVaartcrQrrTDrHDKM A;B TGACAAtgtcatCCC;CAgggatgaCAttgT 248 442 158 52;0;106;0 7;0;4;0;2;0;0;0;4;1;0;2;0;0;0;2;1;22;21;92 1STX 1stx_1_1 15170321 2.1 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRV 1 1 1 0 1, 1 0 2 0 0 0 2 1 1 1 A;B SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSdtaVLsTIFeLFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKENEKIkFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTrVATRKSSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsQLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK;SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtaVLsTIFeLFSRPIINKIAEKHGYIVEEpKqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKENEKIkFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTRVATRKSSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIhAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsQLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK C;D;E;F aaagat;atctt;aaagat;atctt 1 91 464 97;18;346;3 3;1;5;4;5;6;4;2;20;19;17;0;0;0;0;8;2;28;55;285 1SUZ 1suz_1_1 15170321 1.8 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRV 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B 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SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSdtaVLsTIFeLFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKENEKIKFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTRVATRKSSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsqLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK;SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSdtaVLsTIFeLFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNEKIkFtLggYtsfIRnNtknIVYPFDQYIAHWIIGYVyTRVKSSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsQLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK C;D;E;F aaagat;atctt;aaagat;atctt 1 91 473 97;21;354;1 4;1;5;2;5;7;4;2;20;24;21;0;0;0;0;8;3;23;63;281 1SX8 1sx8_1_1 15170321 2.15 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRV 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtkVLsTIFELFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdiattyTNKENEKIKFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVyTRVKSSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsqLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK;SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSdtkVLsTIFeLFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdiattyTnKIKFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVyTRVSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNYErtsQLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK C;D aagatatctt;caagatatct 1 90 416 96;23;296;1 4;0;4;5;4;6;4;2;13;20;17;0;0;0;0;6;2;16;54;259 1T2T 1t2t_1_1 15361856 2.5 BACTERIOPHAGE T4 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease I-TevI 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A KFCKCGVriqTsaytcsKCrNrsgENnsffnhkhSDItkSkisEkmkgkkpsnikKISCDGVIFDcaaDAArHFkissglVtyrVksDkwNWFyIN B;C TTTgtaggactgccctttAAT;aattaaAGGgcagtcctacaa 175 431 427 34;56;337;0 4;1;4;0;2;1;0;2;9;13;18;1;0;0;0;3;2;13;92;262 1TDZ 1tdz_1_1 15249553 1.8 LACTOCOCCUS LACTIS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Glycosylase Formamidopyrimidine DNA Glycosylase 1 1 1 0 1, 1 1 0 0 0 1 1 0 0 1 A eLPEVETVRRELEKRIVGQKIISIEATyPrMVLTGFEQLKKELTGKTIQGISRRGkyLIFEIGDDFRLIShLrmeGKYRLATLDAPREkhDHLTMKFADGQLIYADvrkfGTWELISTDQVLPYFLKkKiGPEPTYEDFDEKLFREKLRKStkkIKpYLleqTLVAGLgnIYVDEVLWLAKIHPEKETNQLIESSIHLLHDSIIEILQKAIKLGGSSILGSTGKMQNELQVyGKTGEKCSRCGAEIQkIkVagrgThFCPVCQQK B;C CTCTtttttCTCG;GcgagaAacaaAGA 44 4 210 32;40;134;4 0;0;6;0;0;0;1;0;7;2;4;0;0;0;0;0;4;13;36;137 1TEZ 1tez_1_1 15576622 1.8 SYNECHOCOCCUS SP. 4 1 1 4 0 0 1 Enzyme Photolyase Deoxyribodipyrimidine Photolyase 1 1 1 0 1, 1 1 0 0 0 0 1 0 0 1 A 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AAPILFWHRRDLRLSDNIGLAAARAQSAQLIGLFCLDPQILQSADMAPARVAYLQGCLQELQQRYQQAGSRLLLLQGDPQHLIPQLAQQLQAEAVYWNQDIEPYGRDRDGQVAAALKTAGIRAVQLWDQLLHSPDQILsgSGNpysvygpFWkNWQAQPKPTPVATPTELVDLSPEQLTAIAPLLLSELPTLKQLGFDWDGGFPVEPGETAAIARLQEFCDRAIADYDPQrNFPAEAGTSGLSPALKFGAIGIRQAWQAASAAHALSRSDEARNSIRVWQqeLAwREFyQHALYHFPSLADGPYrSLWQQFPWENREALFTAWTQAQTGYPIVDAAMRQLTETGWMHnrCRmIVASFLTKDLIIDWRRGEQFFMQHLVDGDLAANNGGWQwSASSGMdpkplrifnPAsqAKkfDATATYIKRWLPELRHVHPKDLISGEITPIERRGYPAPIVNhnLRqKQFKALyNQLkAAI K;L ATCggctcgc;Cgaagccga 66 89 205 29;21;155;0 1;0;4;0;0;0;1;0;6;6;9;0;0;0;0;1;0;11;49;117 1TK0 1tk0_1_1 15297882 2.3 ESCHERICHIA COLI, BACTERIOPHAGE T7 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Polymerase DNA Polymerase T7 1 1 1 0 2, 1 0 0 0 0 1 2 2 0 1 A;B 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Transcription factor Beta Sheet p53 Tumor Supressor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SSSVPSQkTYQGSYGFRLGFLHSGTAKSVTCTYSPALNKMFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKqSqhMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCNSSCmGGMNrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVRVCACPGRDRRTEEEnL;SVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGTaksvTCTYSPALNKMFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnssCmGGMnrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcacPGrdRrtEEenL E;F TTTCCTAGACttgcccAATTA;ATAaTtgggCAagtcTAGGAA 8 83 138 31;5;102;0 4;1;6;1;1;0;0;0;16;2;4;0;0;0;0;2;1;11;15;74 1TUP 1tup_1_2 8023157 2.2 HOMO SAPIENS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet p53 Tumor Supressor 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 C SSVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGTaksVTCTYSPALNKMFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnssCMGGMNrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcaCPGrdRRtEEENL E;F tttccTAGACTTGCCCAATTA;ATAATTGGGCAAGTctaggaA 8 84 70 26;1;43;0 4;0;4;0;0;0;0;0;4;4;5;0;0;0;0;2;2;1;8;36 1TX3 1tx3_1_1 15491133 2.5 HAEMOPHILUS INFLUENZAE 2 1 1 2 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease HincII 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 1 0 2 1 1 1 A;B SFIKPIYQDINSILIGQKVKRPaAGePFEKLVYKFLKENLSDLTFKQYEYLNDLFMKNPAIIGheARyKLFNSpTLlfLLsrgkaaTENWSIENLFEekqndtAdILLVKDQFYELLdvktrnISksaqapniisAykLAqTCAKMIDNKEFDLFDINYLEVDwELNGEDLVCVSTSFAELFKSEPSELyInWaaamqIqFHVRDLDQGFNGTREEWAKSYLKHFVTqAEqrAIsMIDkfVKPFKKYIL;SFIKPIYQDINSILIGQKVKRPKTlsghAagEPFEKLVYKFLKENLSDLTFKQYEYLNDLFMKNPAIIGhEARyKLFNSPTLlfLLsrgkaaTENWSIENLFEekqndtAdILLVKDQFYELLdvktrnISksaqapniisAykLAqTCAkMIDNKEFDLFDINYLEVDwELNGEDLVCVSTSFAELFKSEPSeLyInWaaamqIqFHVRDLDQGFNGTREEWAKSYLKHFVTqAEqrAIsMIDkfVKPFKKYI E;F GCcggtcgaccgg;Gccggtcgaccgg 13 425 617 168;45;385;19 9;0;13;0;3;4;3;2;15;10;27;0;0;0;0;1;6;26;110;388 1TX3 1tx3_2_1 15491133 2.5 HAEMOPHILUS INFLUENZAE 2 1 1 2 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease HincII 2 1 1 0 1, 1 0 0 0 1 0 2 1 1 1 C;D SFIKPIYQDINSILIGQKVKRPKSGTlsghAaGEPFEKLVYKFLKENLSDLTFKQYEYLNDLFMKNPAIIGheARyKLFNSPTLlfLLsrgkaaTENWSIENLFEekqndtAdILLVKQFYELLdvktrnISksaqapniisAykLAqTCAkMIDNKEFDLFDINYLEVDwELNGEDLVCVSTSFAELFKSEPSELyInwaaamqIqFhVRDLDQGFNGTREEWAKSYLKHFVTQAEQrAIsMIDkfVKPFKKYI;SFIKPIYQDINSILIGQKVKRePFEKLVYKFLKENLSDLTFKQYEYLNDLFMKNPAIIGHEARyKLFNSpTLlfLLsrgkaaTENWSIENLFEekqndtAdILLVKDQFYELLdvktrnISksaqapniisAykLAqTCAkMIDNKEFDLFDINYLEVDwELNGEDLVCVSTSFAELFKSEPSeLyInwaaamqIqFHVRDLDQGFNGTREEWAKSYLKHFVTqAEqrAIsMIDkfVKPFKKYI G;H GCcggtcgaccgg;Gccggtcgaccgg 13 424 619 164;46;389;20 9;0;12;0;6;3;4;0;19;11;29;0;0;0;0;2;6;29;108;381 1W0T 1w0t_1_1 15608617 2 HOMO SAPIENS 1 2 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein Telomeric Protein Telomere Binding Protein, TRF1 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A krqawLWEEDKNLRSGVRKYGEgnwskILlHYKFNNrTsvmLkdrWrtMKkl C;D CTGTTAGGGttagggTtag;TCtaaccctAACCctAACA 204 409 147 35;4;108;0 6;0;5;0;4;0;0;0;3;5;6;0;0;0;0;2;0;6;18;92 1W0T 1w0t_1_2 15608617 2 HOMO SAPIENS 1 2 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein Telomeric Protein Telomere Binding Protein, TRF1 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B krqawLWEEDKNLRSGVRKYGEgNwsKIlLHYKFNnrTsvmLkdrWrtMKkl C;D CTGttagggTtagGGTTAG;TCTAACCCtaaccctAACA 204 408 146 34;6;106;0 5;1;4;0;3;0;0;0;4;6;5;0;0;0;0;3;0;6;24;85 1XC8 1xc8_1_1 15249553 1.95 LACTOCOCCUS LACTIS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Glycosylase Formamidopyrimidine DNA Glycosylase 1 1 1 0 1, 1 1 0 0 0 1 1 0 0 1 A peLPEVETVRRELEKRIVGQKIISIEATyPrMVLTGFEQLKKELTGKTIQGISRRGkyLIFEIGDDFRLIShLrmeGKYRLATLDAPREkhDHLTMKFADGQLIYADvrkfGTWELISTDQVLPYFLkkKiGPEPTYEDFDEKLFREKLRKStkkIKpYLleqTLVAGLgnIYVDEVLWLAKIHPEKETNQLIESSIHLLHDSIIEILQKAIKLGGSSIRTYSALGSTGKMQNELQVyGKTGEKCSRCGAEIQkIkVagrgThFCPVCQQK B;C CTCTtttttcTCG;GcgagaAacaaAGA 44 4 214 34;41;135;4 0;0;7;0;0;0;1;0;8;1;3;0;0;0;0;0;4;12;34;144 1XHV 1xhv_1_1 15476804 2.5 HAEMOPHILUS INFLUENZAE 2 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease HincII 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 1 0 2 1 1 1 A;B SFIKPIYQDINSILIGQKVKRPTLsghAAGEPFeKLVYKFLKENLSDLTFKQYEYLNDLFMKNPAIIGheARyKLFNSPTLlfLLsrgkaaTENWSIENLFEekqndtAdILLVKDQFYELLdvktrnISksaqapniisAykLAqTCAKMIDNKEFDLFDINYLEVDwELNGEDLVCVSTSFAELFKSEPSELyInWaaamqIqFhVRDLDQGFNGTREEWAKSYLKHFVTqAEQrAIsMIDkfVKPFKKYIL;SFIKPIYQDINSILIGQKVKRPKSghaAGePFeKLVYKFLKENLSDLTFKQYEYLNDLFMKNPAIIGheARyKLFNSPTLlfLLsrgkaaTENWSIENLFEekqndtAdILLVKDQFYELLdvktrnISksaqapniisAykLAqTCAKMIDNKEFDLFDINYLEVDwELNGEDLVCVSTSFAELFKSEPSELyInWaaamqIqFhVRDLDQGFNGTREEWAKSYLKHFVTqAEQrAIsMIDkfVKPFKKYI E;F;G;H GCcggtc;gaccgg;GCcggtc;gaccgg 13 389 662 170;53;419;20 9;0;13;0;6;2;5;0;21;8;24;0;0;0;0;1;5;30;111;427 1XHV 1xhv_2_1 15476804 2.5 HAEMOPHILUS INFLUENZAE 2 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease HincII 2 1 1 0 1, 1 0 0 0 1 0 2 1 1 1 C;D SFIKPIYQDINSILIGQKVKRPKSGGePFeKLVYKFLKENLSDLTFKQYEYLNDLFMKNPAIIGheARyKLFNSPTLlfLLsrgkaaTENWIENLFEekqndtAdILLVKQFYELLdvktrnISksaqapniisAykLAqTCAKMIDNKEFDLFDINYLEVDwELNGEDLVCVSTSFAELFKSEPSELyInwaaamqIqFhVRDLDQGFNGTREEWAKSYLKHFVTqAEqrAIsMIDkfVKPFKKYI;SFIKPIYQDINSILIGQKVKRaAGePFeKLVYKFLKENLSDLTFKQYEYLNDLFMKNPAIIGheARyKLFNSPTLlfLLsrgkaaTENWSIENLFEEkqndtAdILLVKDQFYELLdvktrnISksaqapniisAykLAqTCAKMIDNKEFDLFDINYLEVDwELNGEDLVCVSTSFAELFKSEPSeLyInWaaamqIqFhVRdLDQGFNGTREEWAKSYLKHFVTqAEQrAIsMIDkfVKPFKKYI I;J;K;L GCcggtc;gaccgg;Gccggtc;gaccgg 13 388 598 164;40;370;24 10;0;11;0;7;3;3;0;19;12;25;0;0;0;0;2;5;31;95;375 1XO0 1xo0_1_1 15591069 2 BACTERIOPHAGE P1 1 1 1 1 0 0 1 Enzyme Recombinase Cre Recombinase 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 1 0 2 1 0 1 A;B SDEVRKNLMDMFRDRQAFSehTWkmLLsVCrsWAAWCKLNNRKWFPAEPEDVRDYLLYLQArglaVktIQqhLGQLNMLHRRSGLPRPSDSNAVSLVMRRIRKENVDAGeRakqALAFERTDFDQVRSLMENSDrCqDIrNLAFLGIAYNTLLkIAEIARIRVKDISRTDGGRMLIHIGrtktlvSTAGVEKALSLGVTKLVERWISVSGVADDPNNYLFCrvrkNGVAAPSATsqlsTraLEGIFEATHRLIYGAKDDSGQryLAWSGhSArVGAARDMARAGVSIPEIMQAGgwtnVNiVMnyIRNLDSETGAMVRLLED;SDEVRKNLMDMFRDRQafsEhtWkmLLsVCrsWAAWCKLNNRKWFPAEPEDVRDYLLYLQArglaVktIqqhLgqLnmLHrrSGLPrPsDSNAVsLVMrRIrKENVDAGerakqaLAFERTDFDQVRSLMENSDrCqDIrNLAFLGIAYNTLLkiaEIArIRVKDISRTDGGRMLIHIGrtktlvSTAGVEKALSLGVTKLVERWISVSGVADDPNNYLFCrvrknGvAAPSATsqlstraLeGIFeATHRLIYGAkDDSgqryLawsghSArVGAARDMARAGVSIPEIMQAGgwtnVniVMnyIrNLDSETGAMVRLLED C;D TataacttcgtataatgtATGCTATACGAAGTTAT;TataacttcgtatagcatacattatacgaAGttat 15 110 766 164;34;568;0 19;0;12;0;2;0;1;0;34;29;22;0;0;0;2;15;7;56;128;439 1YF3 1yf3_1_1 15882618 2.29 BACTERIOPHAGE T4 1 2 1 1 0 0 1 Enzyme Methyltransferase DNA Adenine Methylase 1 1 1 0 1, 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 A mlGAIAYTGNKqsLLpeLKsHFPKYNRFVDLFCGGLSVSLNVNGPVLANDIQEPIIEMYKRLINVSWDDVLKVIKQYKLSktSKEEFLKLREDYNKTRDPLLLYVLHFHGfsNMIRINYKGNFTTPFgkrtinknSEkRFNhFKQNCDKIIFSSLHFKDVKILDGDFVYVDPPYLITVADYNKFWSEDEEKDLLNLLDSLNDRGIKFGLSNVLEHHGKENTLLKEWSKKYNVKHLNKKYVFNIYHSKEKNGTDEVYIFN C;D AcCatgATCTGAc;TGTcagaTCATGg 146 380 91 4;9;73;5 0;0;0;0;1;0;1;0;6;4;6;0;0;0;0;0;0;5;13;55 1YF3 1yf3_1_2 15882618 2.29 BACTERIOPHAGE T4 1 2 1 1 0 0 1 Enzyme Methyltransferase DNA Adenine Methylase 1 2 1 0 1, 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 B mlGAIaYTgnKqsLLPELKSHFPKYNRFVDLFCGGLSVSLNVNGPVLANDIQEPIIEMYKRLINVSWDDVLKVIKQYKLSkTSKEEFLKLREDYNKTRDPLLLYVLHFHGfsNmIrINYKGNFTtpfGkrTInknSEkrFNHFKQNCDKIIFSSLHFKDVKILDGDFVYVDPPYLITVADYNKFWSEDEEKDLLNLLDSLNDRGIKFGLSNVLEhhGKENTLLKEWSKKYNVKHLNKkkNGTDEVYIFN C;D ACCATGAtctgaC;tgtCAGAtcatGG 146 379 81 15;3;62;1 0;0;0;0;0;0;0;0;10;1;5;0;0;0;0;1;0;11;22;31 1YQK 1yqk_1_1 15800616 2.5 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Glycosylase 8-Oxoguanine DNA Glycosylase 1 1 1 0 1, 1 1 0 0 0 1 1 0 0 1 A SEFGHRTLASTPALWASIPCPRSELRLDLVLPSGQSFRWREQSPAHWSGVLADQVWTLTQTEEQLHCTVYRSQASRPTPDELEAVRKYFQLDVTLAQLYHHWGSVDSHFQEVAQKFQGVRLLRQDPIECLFSFICsscnniariTGMVERLCQAFGPRLIQLDDVTYHGFPSLQALAGPEVEAHLrKLgLgyrAryVSASARAILEEQGGLAWLQQLRESSYEEAHKALcIlpgvgtkvADCICLMALDKPQAVPvdvhMWHIAQRDYSWHPTTsQaKGPspqTNKELGNFFRSLWGPYAGWAQAVLfSADl B;C GgtAGAcctgg;CaggtcTAC 16 377 210 24;34;141;11 1;1;3;0;0;2;0;0;1;3;17;0;2;1;0;0;0;3;32;144 1YRN 1yrn_1_1 7569974 2.5 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Mat Alpha 2 1 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 2 2 2 1 A;B iSPQArAFLeQVFRRKQslnsKEkEEVAKKCGITPlqVrvwFinKrmrS;TKpyrghrfTkENvRILESWFAKNIENPylDTKGLENLMKNTSLSriqIknwVsnRrrkEkTiTIAPELADLLSGEPL C;D TacatgtaatttattacatCA;TAtgatgTAATAAattacaTG 121;123 376 346 78;28;240;0 8;1;11;1;5;1;0;1;23;3;7;0;0;0;0;4;1;18;56;206 1ZAA 1zaa_1_1 2028256 2.1 MUS MUSCULUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zif268 Zinc Finger 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 C rPYACPVESCDrRfsrsdeLtrhIriHTGQkPfQCRICMrnfsrsdhLtthIrtHTGEkPfACDICGrkfarsderkrhTKIHLR A;B agcgtgggcgt;tacgcccacgC 19 137 229 98;0;130;1 10;1;12;0;9;0;1;0;3;12;1;0;0;0;0;6;1;26;21;126 1ZME 1zme_1_1 9303004 2.5 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating GAL4 Type, Put3 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 1 2 1 1 1 C;D svaCLSCrKrhikcPGGNPCQKCVTSNAICEYLEPSKkIvVStKYlqQLqKDLNDKTEENNRLKALLLER;svaCLSCrkrhikcPGGNPCQKCVTSNAICEYlepskkivvsTKyLQQLQKDLNDKTEENNRLKALLLER A;B AcggGAAGccaactccG;AcggAGtggctcccg 196 373 261 63;24;174;0 3;0;1;0;0;0;10;0;8;6;9;0;0;0;0;0;4;6;53;161 1ZRF 1zrf_1_1 16427082 2.1 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Catabolite Gene Activator Protein 1 1 1 0 2, 1 0 2 0 0 0 2 1 2 1 A;B TDPTLEWFLSHCHIHKYPskSTLIHQGEKAETLYYIVKGSVAVLIKDEeGkEMILSYLNQGDFIGELGLFEEGQERSAWVRAKTACEVAEISYKKFRQLIQVNPDILMRLSAQMARRLQVTSEKVGNLAFLdvtGRIAQTLLNLAKQPDAMTHPDGMQIkItrqeIGQIVgcsretVgriLkMLEDQNLISAhgktIVVYGTR;DPTLEWFLSHCHIHKYPskSTLIHQGEKAETLYYIVKGSVAVLIKDEeGkEMILSYLNQGDFIGELGLFEEGQERSAWVRAKTACEVAEISYKKFRQLIQVNPDILMRLSAQMARRLQVTSEKVGNLAFLdvtGRIAQTLLNLAKQPDAMTHPDGMQIkItrqEIGQIVgcsretVgriLkMLEDQNLISAhgktIVVYG W;X;Y;Z TTCGAAAaatgcgaT;CTagatcgCATTtttcGAAAT;TTTCGAAAaatgcgAT;CTagatcgCATTtttcGAAAT 62 371 269 61;0;208;0 6;2;6;0;4;0;0;0;3;13;18;0;0;0;0;6;0;24;28;159 1ZS4 1zs4_1_1 16039594 1.7 BACTERIOPHAGE LAMBDA 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Repressor Protein CII 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 1 0 2 1 2 1 A;B GSHMANKRNEALRIESALLNKIAMLgtekTAEAVgvdksqIsrwkrdwIPKFSMLLAVLEWGVVDDDMARLARQVAAILTNK;GSHMANKRNEALRIESALLNKIAMLGTEKTAEAVGVDKSqISrWKrdwIPkFSMLLAVLEWGVVDDDMARLARQVAAILTNK T;U TATTCGTGCAAACAAacgcaaCGAGGT;TACCTcgttgcGTTTgttTGCACGAAT 96 370 124 51;0;73;0 3;1;3;1;3;0;0;0;6;3;4;0;0;0;0;4;2;12;18;64 1ZS4 1zs4_1_2 16039594 1.7 BACTERIOPHAGE LAMBDA 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Repressor Protein CII 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 1 0 2 1 2 1 C;D ANKRNEALRIESALLNKIaMLgtekTAEAVgvdksqIsrwkrdwIPKFSMLLAVLEWGVVDDDMARLARQVAAILTNKK;RNEALRIESALLNKIAMLGTEKTAEAVGVDKSqISrWKrdwIPkFSMLLAVLEWGVVDDDMARLARQVAAILT T;U TATtcgtgcaaACAAACGCAACGAGGT;TACCTCGTTGCGTTTgtttgcACGAat 96 369 147 58;2;87;0 4;1;4;0;2;0;0;0;8;4;5;0;0;0;0;6;2;12;26;73 2A07 2a07_1_1 16407075 1.9 HOMO SAPIENS 2 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Forkhead Box Protein P2 1 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 2 1 0 1 F;G VRPPFTYATLIRQAIMESSDRQLTLNEIYSWFTRTFAyFRrNAAtWKnaVrhnLslhKCFVRVENVKGAVWTVDEVEYQkrR;PftyaTLIRQAIMESSDRQLTLNEIYSWFTRTFAYFRRNAATWKNAVRHNLSLHKCFVRVENVKGAVWTVDEVEYQKRR A;B AACTAtgaaaCAAATTTTCCT;TTAGGAAAAtttgtttCATAG 55 78 94 26;0;68;0 2;0;2;0;0;0;0;0;3;3;2;0;0;0;0;2;0;5;9;66 2A07 2a07_1_2 16407075 1.9 HOMO SAPIENS 2 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Forkhead Box Protein P2 1 2 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 1 0 0 1 J IVrPPftyaTLIRQAIMESSDRQLTlnEIySWFTRTFAYFRRNAAtWKnaVrhnLslhkCFVrVeNVKGaVwTVDEVEYQKrr A;B AACTATGaaacaaATTTtcCT;TTAGGAAaatttgTTTCATAG 55 77 126 45;0;81;0 2;0;0;0;1;0;0;0;4;3;4;0;0;0;0;1;2;9;23;77 2A07 2a07_2_1 16407075 1.9 HOMO SAPIENS 2 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Forkhead Box Protein P2 2 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 2 1 0 1 H;I PftyaTLIRQAIMESSDRQLTLNEIYSWFTRTFAYFRRNAATWKNAVRHNLSLHKCFVRVENVKGAVWTVDEVEYQKRR;VRPPFTYATLIRQAIMESSDRQLTLNEIYSWFTRTFAyFRrNAAtWKnaVrhnLslhKCFVrVENVKGAVWTVDEVEYQKr C;D AACTAtgaaACAAATTTTCCT;TTAGGAAAATttgtttCATAG 55 78 87 24;0;63;0 2;0;2;0;0;0;0;0;3;3;2;0;0;0;0;2;0;5;9;59 2A07 2a07_2_2 16407075 1.9 HOMO SAPIENS 2 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Forkhead Box Protein P2 2 2 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 1 0 0 1 K IVrPPftyATLIRQAIMESSDRQLTlnEIySWFTRTFAYFRRNAAtWKnaVrhnLslhKCFVrVeNVKGaVwTVDEVEYQKrr C;D AACTATGaaacaaATTTtcCT;TTAGGAAaatttgTTTCATAG 55 77 127 44;0;83;0 2;0;0;0;1;0;0;0;4;3;4;0;0;0;0;1;2;9;24;77 2B0D 2b0d_1_1 16236314 2 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRV 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtKVLsTIFELFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKEKIKFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTRVLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsqLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK;SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtKVLsTIFeLFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKEKIKFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTrVATSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsqLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK C;D aaagaattctt;aaagaattctt 1 351 430 96;11;322;1 2;0;1;5;4;6;4;2;18;28;23;0;0;0;0;7;2;22;58;248 2B0E 2b0e_1_1 16236314 1.9 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRV 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 1 2 1 1 1 A;B SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSdtKVLsTIFELFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTKIKFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTRVLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsqLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK;SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtkVLsTIFELFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKKIkFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVyTRVSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsQLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK C;D aaagaatctt;aaagaatctt 1 350 397 91;14;292;0 6;1;4;1;4;6;4;2;17;27;18;0;0;0;0;8;0;14;49;236 2BOP 2bop_1_1 1328886 1.7 BOVINE PAPILLOMAVIRUS TYPE 1 1 1 1 1 0 0 1 Transcription factor Alpha|Beta Regulatory Protein E2 1 1 1 2 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;D SCFALISGtanqVkcyrfrVkknhRHRYENCTttWfTvAdNgaErQGQAQILITFGSPSQRQDFLKHVplppGmNISGFTASLDF;SCFALISGtanqVkcyrfrVkknhRHRYENCTttWfTvAdNgaErQGQAQILITFGSPSQRQDFLKHVplppGmNISGFTASLDF B;E ccgacCGACgtcggtcG;ccgacCGACgtcggtcG 183 344 328 78;0;250;0 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PQKICLICGdEAsgchyGVLTCgsCkvfFkrAMEGQhNyLCAGRNDCIVDkIRrkNCpACrLRKCCQAGMVlggrkFK;PQKICLICGdEAsgchyGVLTCgsCkvfFkrAMEGQHNyLCAGRNDCIVDKiRrkNCpACrLRKCCQAGMVLggrKF C;D ccagaaCAGTttgttCTg;ccagaaCAAActgttCTg 56 338 268 56;8;204;0 5;0;12;0;0;0;0;0;10;0;12;0;0;0;0;2;2;22;37;166 2CRX 2crx_1_1 9670032 2.5 BACTERIOPHAGE P1 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Recombinase Cre Recombinase 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 1 0 2 1 0 1 A;B TSDEVRKNLMDMFRDRQAFSehTWkmLlsVCrsWAAWCKLNNRKWFPAEPEDVRDYLLYLQArglaVktIQqhLGQLNMLHRRSGLPRPSDSNAVSLVMRRIRKENVDAGERakQALAFERTDFDQVRSLMENSDrCqDIrNLAFLGIAYNTLLrIAEIARIRVKDISRTDGGRMLIHIGEKALSLGVTKLVERWISVSGVADDPNNYLFCrvrkNGVAAPSATsqlsTraLEGIFEATHRLIYGAyLAWSGhSArVGAARDMARAGVSIPEIMQAGgwtnVNiVMNyIRNLDSETGAMVRLLED;TSDEVRKNLMDMFRDRQafsEhtWkmLLsVCrsWAAWCKLNNRKWFPAEPEDVRDYLLYLQArglaVktIqqhLgqLnmLHrrSGLPrPsDSNAVsLVMrRIrKENVDAGeRakqaLAFERTDFDQVRSLMENSDrCqDIrNLAFLGIAYNTLLriaEIArIRVKDISRTDGGRMLIHIGAGVEKALSLGVTKLVERWISVSGVADDPNNYLFCrvrknGVAAPSATsqlstraLeGIFeATHRLIYGAkDDSgqryLawsghSArVGAARDMARAGVSIPEIMQAGgwtnVniVMnyIRGAMVRLLED C;D TataacttcgtatagcaTATGCTATACGAAGTTAT;ataacttcgtatagcatatgctatacgaAGttat 15 332 704 170;28;504;2 11;0;14;0;1;0;2;0;34;27;20;0;0;0;2;12;5;47;116;413 2DGC 2dgc_1_1 7500340 2.2 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 1 1 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, GCN4 1 1 1 2 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;D ALkrArntEaarrsrArklQrMKQLEDKVEELLSKNYHLENEVARLKKL;ALkrArntEaarrsrArklQrMKQLEDKVEELLSKNYHLENEVARLKKL B;E TGGAgatgacgtcaTCTCC;TGGAgatgacgtcaTCTCC 206 329 172 62;0;110;0 6;0;2;0;4;0;0;0;6;6;0;0;0;0;0;6;4;42;26;70 2DTU 2dtu_1_1 17098747 2.37 BACTERIOPHAGE RB69 4 1 1 4 0 0 1 Enzyme Polymerase DNA Polymerase Family B 1 1 1 0 2, 1 0 0 0 1 1 1 0 0 1 A 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4;1;3;0;2;0;1;0;15;17;19;0;0;0;0;0;0;20;48;208 2DTU 2dtu_2_1 17098747 2.37 BACTERIOPHAGE RB69 4 1 1 4 0 0 1 Enzyme Polymerase DNA Polymerase Family B 2 1 1 0 2, 1 0 0 0 1 1 1 0 0 1 B 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0;1;2;0;2;0;1;1;12;10;23;0;0;0;0;0;0;17;49;214 2DTU 2dtu_3_1 17098747 2.37 BACTERIOPHAGE RB69 4 1 1 4 0 0 1 Enzyme Polymerase DNA Polymerase Family B 3 1 1 0 2, 1 0 0 0 1 1 1 0 0 1 C 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3;0;3;0;1;2;0;0;13;12;18;0;0;0;0;0;0;15;46;245 2DTU 2dtu_4_1 17098747 2.37 BACTERIOPHAGE RB69 4 1 1 4 0 0 1 Enzyme Polymerase DNA Polymerase Family B 4 1 1 0 2, 1 0 0 0 1 1 1 0 0 1 D MKEFYLTVEQIGDSIFERYIDSNGRERTREVEYKPSLFAHCPESQATKYFDIYGKPCTRKLFANMRDASQWIKRMEDIGLEALGMDDFKLAYLSDTYNYEIKYDHTKIRVANFDIEVTSPDGFPEPSQAKHPIDAITHYDSIDDRFYVFDLLNSPYGNVEEWSIEIAAKLQEQGGDEVPSEIIDKIIYMPFDNEKELLMEYLNFWQQKTPVILTGWNVESFAIPYVYNRIKNIFGESTAKRLSPHRKTRVKVGEIITLFGISVLDYIdLYkkFSftnQPSYSLDYISEFELNVGKLKYDGPISKLRESNHQRYISYNIIAVYRVLQIDAKRQFINLSLDMGYYAKIQIQSVfspikTWDAIIFNSLKEQNKVIPQGRSHPvQpypgaFvKePIPNRYKYVMSFDLTslypSIIRQVNISPETIAGTFKVAPLHDYINAVAERPSDVYSCSPNGMMYYKDRDGVVPTEITKVFNQRKEHKGYMLAAQRNGEIIKEALHNPNLSVDEPLDVDYRFDFSDEIKEKIKKLSAKSLNEMLFRAQRTEVAGMTAQINRKLLInSLygALgnVwFRYYDLRNATAITTFGqMALQWIERKVNEYLNEVCGTEGEAFVLYGdtdSIYVSADKIIDKVGESKFRDTNHWVDFLDKFARERMEPAIDRGFREMCEYMNNKQHLMFMDREAIAGPPLGSKGIGGFWtgkkrYALNVWDMEGTRYAEPKLKimgleTqkssTPKAVQKALKECIRRMLQEGEESLQEYFKEFEKEFRQLNYISIASvssAnnIAKyDVGGFpgPkcpfhIrGILTYNRAIKGNIDAPQVVEGEkVYVLPLREGNPFGDKCIAWPSGTEITDLIKDDVLHWMDYTVLLEkTFIkpLEgFTSAAKLDYEKKASLF K;L cgcttatgacagcCGCG;GCGGCTgtcataaga 61 323 322 20;26;268;8 1;0;3;0;1;0;1;0;13;9;20;0;0;0;0;0;0;10;39;225 2E42 2e42_1_1 0 1.8 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, C|EbpBeta 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B DkHSDeyKIrrErnnIaarksrdkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFK;DkHSDEyKIrrernnIaarksrDkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQL C;D TaggattgcgcaaTAT;aatattgcgcaaTCCT 23 321 232 95;0;137;0 8;0;7;0;2;0;0;0;11;5;0;0;0;0;0;4;5;29;33;128 2E43 2e43_1_1 0 2.1 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, C|EbpBeta 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SDeyKirrErnnIavrksrdkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFK;SDEyKIrrernnIavrksrDkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQL C;D TAggattgcgcaaTAT;aatattgcgcaaTCCT 23 24 245 107;0;138;0 8;0;8;0;2;0;0;0;9;4;0;0;0;0;0;4;5;25;37;143 2EUX 2eux_1_1 16531239 1.57 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet NDT80 Protein 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A 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Homeodomain, Engrailed 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A rtafSSEQlARLKREFNENRylTERRrQQLSSELGLNEAqIkiwFknKrakIkkS C;D TTTTGCCATgtaatcCCCGGA;ATCCggggatTacatGGCAAA 35 290 133 30;8;95;0 7;0;6;0;1;0;0;0;8;2;3;0;0;0;0;0;0;9;19;78 2HDD 2hdd_1_2 9309220 1.9 DROSOPHILA MELANOGASTER 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Engrailed 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B krprTAFSSEQLARLKREFNENRylTeRRrQQLSSELGLNEAqIkiWFknKraKIk C;D TTTTGCCATGTAATCCccgga;atcCGGGGATTACATGGCAAA 35 289 95 22;2;71;0 3;0;2;0;1;0;0;0;2;0;2;0;0;0;0;0;0;10;16;59 2HOS 2hos_1_1 17240973 1.9 DROSOPHILA MELANOGASTER 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Engrailed 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A rtafSSEQlARLKREFNENRylTeRRrQQLSSELGLNEAqVkgwFknMrakIkkST C;D TTTTGCCATgtaatcCCCGGA;ATCCggggatTacatGGCAAA 35 283 122 22;10;90;0 4;0;5;0;1;0;0;0;4;2;2;0;0;0;0;0;0;9;16;79 2HOS 2hos_1_2 17240973 1.9 DROSOPHILA MELANOGASTER 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Engrailed 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B krprTAFSSEQLARLKREFNENRylTeRRrQQLSSELGLNEaqVkgWFknMraKIkKS C;D TTTTGCCATGTAATCcccgga;atcCGGGGATTACATGGCAAA 35 64 78 17;1;60;0 3;0;2;0;0;0;0;0;2;0;2;0;0;0;0;0;0;6;12;51 2HOT 2hot_1_1 17240973 2.19 DROSOPHILA MELANOGASTER 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Engrailed 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A rtafSSEQlARLkREFNENRylTeRRrQQLSSELGLNEaqVkgwFknMrakIkkST C;D TTTTGCCATgtaatCCCCGGA;ATCCggggatTacatGGCAAA 35 282 122 24;6;92;0 3;0;3;0;1;0;0;0;8;1;4;0;0;0;0;0;0;10;15;77 2HOT 2hot_1_2 17240973 2.19 DROSOPHILA MELANOGASTER 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Engrailed 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B krprTAFSSEQLARLKREFNENRylTeRRrQQLSSELGLNEaqVkgWFknMraKIkkS C;D TTTTGCCATGTAATCcccgga;atcCGGGGATTACATGGCAAA 35 64 77 16;1;60;0 3;0;2;0;0;0;0;0;1;0;2;0;0;0;0;0;0;7;14;48 2HT0 2ht0_1_1 17097674 2 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein DNA Bending Integrator Host Factor 1 1 1 0 1, 1 0 2 0 0 0 2 1 1 1 A;B aLtkaEMSEYLFDKLGLSkRDAkELVELFFEEIRRALENGEQVkLsgfGnFDLrdknqrpgrnpkTGeDipiTArRvvtFrPgqkLkSRVENASPK;MtksELIeRLATQQSHIPakTVEDAVkEMLEHMASTLAQGErIeirgFgsFSLhYraPrtgrnpkTGDKvElEGkYvPhfkpgkeLrDRANIY C;D;E;F cGGTGCaacaaAt;tgataagcaatgCTTttttgGC;ggCCAAAAaagCAtt;GcttatcaattTGttgcacC 63;64 280 475 37;73;361;4 7;0;12;0;0;4;1;1;36;7;17;0;0;0;0;1;1;33;73;282 2I13 2i13_1_1 16963084 1.96 MUS MUSCULUS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zinc Finger, Aart 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A fsrsdhLaEhQrtHkPyKCPECGksfsDkkdLTrhQrtHTGEkPyKCPECGksfsqranLrAhQrtHTGEkPyACPECGKsfsqlahLRahQRtHTGEkPyKCPECGksfsrednLhthQrtHTGEkPyKCPECGksfsrrdaLnvhQrtH C;D Cagatgtagggaaaagcccggg;gcccgggcttttccctacATCT 165 62 427 173;0;254;0 20;1;12;0;12;1;0;0;7;15;4;0;0;0;0;9;0;27;51;268 2I13 2i13_2_1 16963084 1.96 MUS MUSCULUS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zinc Finger, Aart 2 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B kPYACPECGksfsrsdhLaehQrtHTGEkPyKCPECGksfsdkkdLtrhQrtHTGEkPyKCPECGksfsqranLrahQrtHTGEkPyACPECGKsfsqlahLRAhQRtHTGEkPyKCPECGKsfsrednLhthQrtHTrrdaLn E;F CAgatgtagggaaaagcccggg;gcccgggcttttccctacATCT 165 62 404 167;1;236;0 17;0;12;0;18;1;0;0;7;20;4;0;0;0;0;11;1;24;46;243 2IIE 2iie_1_1 17276457 2.41 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein DNA Bending Integrator Host Factor 1 1 1 0 1, 1 0 1 0 0 0 1 0 0 1 A MaStksELIeRLATQQSHIPaKTVEDAVkEMLEHMASTLAQGGSGgLtkaEMSeYLFDKLGLSkRDAkELVELFFEEIRRALENGEQVkLsgfGnFDLrdknqrpgrnpkTgEDipiTArRvvtFrpgqkLkSRVENAGGGErIeirgFgsFSLhyraPrtgrnpkTGDKvElEGkYvphfkpgkELrDRANIYGGSGHHhhHh C;D;E cGGTGCaacaaattgataagcaatgCTTTtttgGC;ggCCAAAAaagCAtt;gcttatcaattTGTtgcaCC 221 8 488 27;81;377;3 6;0;13;0;0;2;1;1;36;6;17;0;0;0;0;1;1;34;75;295 2IS6 2is6_1_1 17190599 2.2 ESCHERICHIA COLI 1 2 0 1 0 0 1 Enzyme Helicase UvrD 1 1 1 0 5, 5 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A MDVSYLLDSLNDKQREAVAAPRSNLLVLAGAGSGKTRVLVHRIAWLMSVENCSPYSIMAVTftnKAAAEMRHRIGQLMGTSQGGMWVGtFhGLAHRLLRAHHMDANLPQDFQILDseDQLrLLkRLIkAMNLDekQWPPrQAmwYInSQKdEGLRPHHIQSYGNPVEQTWQKVYQAYQEACDRAGLVDfAELLLRAHELWLNKPHILQHYRERFTNILVDEFQDTNNIQYAWIRLLAGDTGKVMIVGDDDQSIyGwrGAQVENIQRFLNDFPGAETIRLEQNYRSTSNILSAANALIENNNGRLGKKLWTDGADGEPISLYCAFNELDEARFVVNRIKTWQDNGGALAECAILYrsnAQSrVLEEALLQASMPYRIyggMRFFeRqEIKDALSYLRLIVNRNDDAAFERVVnTPtrgigdrtLDvVRQTSRDRQLTLWQACRELLQEKALagrAASALQRFMELIDALAQETADMPLHVQTDRVIKDSGLRTMYEQEKGEKGQTRIENLEELVTATRQFSYNEEDLMPLQAFLSHAalEagEGQADTWQDAVQLMtLhsAKGLEFPQVFIVGMEEgMFPsqmSLdEGGrLEeERRLAYVGVTRAMQKLTLTYAETRrLygkEVYHRPSRFIGELPEECVEEVRLRATVSRPVSH C;D CGAGCACtgcaGTGCTcgttgtt;cgAgcaCTGCAGtgcTCGTTGTT 126 268 307 46;47;203;11 2;0;6;2;1;0;1;0;13;9;18;0;0;0;0;2;3;10;66;174 2IS6 2is6_1_2 17190599 2.2 ESCHERICHIA COLI 1 2 0 1 0 0 1 Enzyme Helicase UvrD 1 2 1 0 5, 5 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B DVSYLLDSLNDKQREAVAAPRSNLLVLAGAGSGKTRVLVHRIAWLMSVENCSPYSIMAVTftnKAAAEMRHRIGQLMGTSQGGMWVGtFhGLAHRLLRAHHMDANLPQDFQILDsEDQLrLLkRLIKAMNLDEKQWPPrQAMwYInSQKDEGLRPHHINPVEQTWQKVYQAYQEACDRAGLVDfAELLLRAHELWLNKPHILQHYRERFTNILVDEFQDTNNIQYAWIRLLAGDTGKVMIVGDDDQSIyGwrGAQVENIQRFLNDFPGAETIRLEQNYRSTSNILSAANALIENNNGRLGKKLWTDGADGEPISLYCAFNELDEARFVVNRIKTWQDNGGALAECAILYrsnAQSrVLEEALLQASMPYRIyggmRFFeRqEIKDALSYLRLIVNRNDDAAFERVVnTPtrgigdrtLDvVRQTSRDRQLTLWQACRELLQEKALagrAASALQRFMELIDALAQETADMPLHVQTDRVIKDSGLRTMYEQEkGEKGQTrIENLEELVTATRQFSEDLMPLQAFLSHAalEagEGQADTWQDAVQLMtLhsAKGLEFPQVFIVGMEEGmFPsQmsLDEGGrLEeeRRLAYVGVTRAMQKLTLTYAETRrLygKEVYHRPSRFIGELPEECVEEVRLRATVSRPVSHQRMGTP C;D cgagcACTGCAgtgCTCGTTGTT;CGAGCACTgcagtGCTCgttgtt 126 267 289 50;42;185;12 1;0;2;2;2;0;1;0;10;10;15;0;0;0;0;1;1;5;71;168 2ISZ 2isz_1_1 17209554 2.4 MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Repressor IdeR 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B mnElVdttEMyLRTIYDLEEEGVTPlrarIAeRLdqsgptVsqtVsrMErDGLLRVAGDrHLELTEKGRALAIAVMRKHRLAERLLVDVIGLPWEEVHAEACRWEHVMSEDVERRLVKVLNNPTTSPFGNPIPGLVELGV;mnElVdttEMyLRTIYDLEEEGVTPlrarIAeRLdqsgptVsqtVsrMErdGLLRVAgdrHLELTEKGRALAIAVMRKHRLAERLLVDVIGLPWEEVHAEACRWEHVMSEDVERRLVKVLNNPTTSPFGNPIPGLVELGV E;F CCCTGTTagcacaGGCTgccctaATTTtaGTGG;CACTAaaattagGGCagcctgTGCtAACAGGGC 83 266 296 65;6;225;0 3;0;4;0;4;1;1;0;22;22;14;0;0;0;0;11;0;22;38;154 2ISZ 2isz_1_2 17209554 2.4 MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Repressor IdeR 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 C;D mnElVDttEMyLRTIYDLEEEGVTPlrarIAERLdqsgptVsqtVSrMErDGLLRVAGDrHLELTEKGRALAIAVMRKHRLAERLLVDVIGLPWEEVHAEACRWEHVMSEDVERRLVKVLNNPTTSPFGNPIPGLVELGV;mnElVdttEMyLRTIYDLEEEGVTPlrarIAeRLdqsgptVsqtVSrMErDGLLRVAGDrHLELTEKGRALAIAVMRKHRLAERLLVDVIGLPWEEVHAEACRWEHVMSEDVERRLVKVLNNPTTSPFGNPIPGLVELGV E;F CCctgttagCAcaggctgCCCtAATTTTAGTGG;CACTAAAATTAgggcagCCTgtgctaACAGGGC 83 265 270 61;3;206;0 1;0;2;0;0;0;0;0;18;18;13;0;0;0;0;8;0;22;36;152 2ITL 2itl_1_1 17139255 1.65 SIMIAN VIRUS 40 1 2 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein Replication Origin Binding Protein, Large T Antigen 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A DPKDFPSELLSFLshavfsnrtlACFAIYTTKEKAALLYKKIMEKYSVTFISRHNSYNHNILFFLTPHrhrVsaINnYAQkLCTFSFLICKGVnkEYLMYSALTRDPFSVIEESLPGGLK C;W AGAGGCcgaggcCGCCTCGGCCTC;AGAGGCCGAGGcggcctCGGCCTC 50 58 147 53;0;94;0 5;1;6;0;0;1;2;2;6;4;7;0;0;0;0;1;0;4;18;90 2ITL 2itl_1_2 17139255 1.65 SIMIAN VIRUS 40 1 2 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein Replication Origin Binding Protein, Large T Antigen 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B PKDFPSELLSFLshavfsnrtLACFAIYTTKEKAALLYKKIMEKYSVTFISRHNSYNHNILFFLTPHrhrVsaINnYAQKLCTFSFLICKGVnkEYLMYSALTRDPFSVIEESLP C;W AGAGGCCGAGGCCGCCTcggcctC;agaggcCGAGGCGGCCTCGGCCTC 50 58 131 54;0;77;0 6;2;6;1;1;1;2;2;6;3;8;0;0;0;0;1;0;1;19;72 2NL8 2nl8_1_1 17139255 2.3 SIMIAN VIRUS 40 1 2 1 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein Replication Origin Binding Protein, Large T Antigen 1 1 1 2 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A EDPKDFPSELLsFLshavfsnrtLACFAIYTTKEKAALLYKKIMEKySVTFISRHNSYNHNILFFLTPhrhrVsaINnYAQkLSTFSFLICKGVnkEYLMYSALTRDPFSVIEESLP W;X CGAggccATCATGGCCTC;CGAGGCCATcatggcCTC 50 56 131 46;0;85;0 4;1;4;0;1;1;2;2;5;4;7;0;0;0;0;3;0;4;15;78 2NL8 2nl8_1_2 17139255 2.3 SIMIAN VIRUS 40 1 2 1 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein Replication Origin Binding Protein, Large T Antigen 1 2 1 2 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B EDPKDFPSELLsFLshavfsnrtLACFAIYTTKEKAALLYKKIMEKySVTFISRHNSYNHNILFFLTPhrhrVsaINnYAQkLSTFSFLICKGVnkEYLMYSALTRDPFSVIEESLP W;X CGAGGCCATcatggcCTC;CGAggccATCATGGCCTC 50 56 131 46;0;85;0 4;1;4;0;1;1;2;2;5;4;7;0;0;0;0;3;0;4;15;78 2NOF 2nof_1_1 17114185 2.35 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Glycosylase 8-Oxoguanine DNA Glycosylase 1 1 1 0 1, 1 1 0 0 0 1 1 0 0 1 A SEFGHRTLASTPALWASIPCPRSELRLDLVLPSGQSFRWREQSPAHWSGVLADQVWTLTQTEEQLHCTVYRSQASRPTPDELEAVRKYFQLDVTLAQLYHHWGSVDSHFQEVAQKFQGVRLLRQDPIECLFSFICsscnnIarITGmVErLCQAFGPRLIQLDDVTYHGFPSLQALAGPEVEAHLrKLgLgyrAryVSASARAILEEQGGLAWLQQLRESSYEEAHKALcIlpgvgtkvADCICLMALDKPQAVPvdvhMWHIAQRDYSWHPTTSQAKGPSPQTnKELGNFFRSLWGPYAGWAFAVLFSADL B;C AGAcctgg;CagtcTA 16 256 160 8;30;115;7 1;1;2;0;1;0;0;0;4;0;16;0;2;1;0;0;0;4;20;108 2NTC 2ntc_1_1 17253903 2.4 SIMIAN VIRUS 40 1 2 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein Replication Origin Binding Protein, Large T Antigen 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A VEDPKDFPSELLSFlshavfsnrtLACFAIYTTKEKAALLYKKIMEkySVTFISRHNSYNHNILFFLTPhrhrVsaINnyAQkLCTFSFLICKGVnkEYLMYSALTRDPFSVIEESLPGGLKEHDFN C;W TCagaggcCAGAAGTGCCTCG;ACGAGGCACTTCtggcctcTG 50 251 159 63;0;96;0 5;1;6;1;1;1;2;2;8;4;9;0;0;0;0;2;0;4;20;93 2NTC 2ntc_1_2 17253903 2.4 SIMIAN VIRUS 40 1 2 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein Replication Origin Binding Protein, Large T Antigen 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B EDPKDFPSELLSFLshavfsnrtlACFAIYTTKEKAALLYKKIMEkySVTFISRHNSYNHNILFFLTPHrhrVsaINnYAQkLCTFSFLICKGVnkEYLMYSALTRDPFSVIEESLPGGLKEHDFN C;W TCAGAGGCCAGAAgtgcctCG;AcgaggcACTTCTGGCCTCTG 50 250 162 63;0;99;0 4;2;6;1;1;1;2;2;7;5;8;0;0;0;0;1;0;5;21;96 2O6M 2o6m_1_1 17516660 2.3 PHYSARUM POLYCEPHALUM 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease I-PpoI 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B ALTNAQILAVIDSWEETVGQFPVITHHVPLGGGLQGTLHCYEIPLAapygvgfaknGPtrWqYkrtINqVvHrwgShtVPFLLEPDNINGktCtaSqLChNtRCHNPLHLCwESldDnkGRnWCPGPNGGCVHAVVCLRQGPlYGPGATVAGPQQRGSHFVV;ALTNAQILAVIDSWEETVGQFPVITHHVPLGGGLQGTLHCYEIPLAapygvgfaknGPTrWqYkrtINqVvHrwgShtVPFLLEPDNINGktCtaSqLChNtRCHNPLHLCwESldDnkGRnWCPGPNGGCVHAVVCLRQGPlYGPGATVAGPQQRGSHFVV C;D ttgactctCttaagagagTCA;ttgactctCttaagagagTCA 29 7 379 113;22;244;0 17;1;8;0;4;0;4;0;14;7;21;0;0;0;0;2;8;19;52;222 2OAA 2oaa_2_1 17344322 1.5 MICROCOCCUS VARIANS 2 1 1 2 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease MvaI 2 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B KSMSEYLNLLKEAIQNVVDGGWHETKrkgntGigkTFeDLLEkEednldaPdFHDIeiktheTaakslLtLftkspTNPRgantMLrNRYGkKDEYGNNiLhqtVSGNrKtnsnsyNYDFKIDIDWESQVVRLEVFDKQDIMIDNSVYWSFDSLQNqLDKkLKYIAVISAESKIENEKkYYKYNSANLFTDLTVQSLCRGIENGDIkVdirIgayhsGKkKGkthdhgTAFrInMEKLLEYGEVKVIV E;F ggtacctggat;catccaggtac 150 53 428 123;24;281;0 6;3;11;1;7;1;7;2;17;17;18;0;0;0;0;3;5;22;47;261 2ODI 2odi_1_1 17445830 1.45 BREVIBACILLUS CENTROSPORUS 2 1 1 2 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease BcnI 1 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A KIWSKEEVVNKLHEIKNKGYLSVPTDFrtddgVvgqILeRQFGVQenNiTLGdLGEFelkgrNrKaksnltLfhkkPVAGQtViQIFNRFGyVkPssrnPEVkKkLfttIkGGrLnnlGLTLNAKHASEINLYYQDEYLSTWDLNLSkIEKLVLVFAETIGRaNSPEEQFHFTKAYLTEINDITSLINDGVLVdlcIdQDLSKSKGphdrgPhLrIPISKLDKLYRNIERLL C;D aacccggagaC;ctccgggttgT 76 15 390 99;20;270;1 4;3;3;1;6;0;5;1;14;6;8;0;1;1;0;3;2;24;51;257 2ODI 2odi_2_1 17445830 1.45 BREVIBACILLUS CENTROSPORUS 2 1 1 2 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease BcnI 2 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B KIWSKEEVVNKLHEIKNKGYLSVPTDFrtddgVvgqILeRQFGVqenniTLGdLGEFelkgrNrKaksnltlfhkkPVAGQtViQIFNRFGyVkPssrnPEVkKkLfttIkGGrLnnlGLTLNAKHASEINLYYQDEYLSTWDLNLSkIEKLVLVFAETIGRaNSPEEQFHFTKAYLTEINDITSLINDGVLVdlcIdQDLSKSKGphdrgPhLrIPISKLDKLYRNIERLL E;F aacccggagaC;ctccgggTtgT 76 15 390 100;16;274;0 4;2;3;1;7;0;5;1;15;8;9;0;1;1;0;2;2;22;53;254 2OFI 2ofi_1_1 17410210 1.85 SALMONELLA TYPHI 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Glycosylase 3-Methyladenine DNA Glycosylase I 1 1 1 0 1, 1 1 0 0 0 1 1 0 0 1 A QRCDWVSQDPLYIAYHDNEWGVPETDSRKLFEICLEGQqaglsWitVLkKRENYRACFHQFDPIRIAAQEEDVERLLQNtGiirhRGkIQAIISNARAWLAEQNGESFADFVWSFVDGQPQITQAASLDKIPtSTPASDALAKALkKRGFkfvgttiCYsFQACGLVNDHITGCFCHPG B;C CGGACtacggG;CCGttagtCCGC 222 249 124 3;27;93;1 0;0;1;0;0;1;0;0;2;2;7;0;0;0;0;0;0;7;21;83 2OR1 2or1_1_1 3187531 2.5 BACTERIOPHAGE 434 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix 434 Repressor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 L;R SISSRVkSKrIQLGLnqAELAQKVgttqqsIeqLEnGktkrprfLPELASALGVSVDWLLNGT;SISSRVkSKrIQLGLnqaELAQKVGttqqsIeqLEnGktkrprfLPELASALGVSVDWLLNGT A;B AAgtacaAACTttcttgtAT;TatacaaGAAagtttgtACT 60 245 279 95;4;180;0 5;0;8;0;3;0;0;0;17;10;13;0;0;0;0;15;1;10;31;166 2OXV 2oxv_1_1 17997963 1.95 ESCHERICHIA COLI 1 1 1 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRI 1 1 1 2 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;D SQGVIGIFGDYAKAHDLAVGEVSKLVKKALSNEYPQLSFRYRDSIKKTEINEALKKIDPDLGGTLFvSnssikPdGGIVEVKDDYGEWRVVLVAeakhqgkDIInIRNGLLvgkRGDQDLmtagnaIerSHknISEIANFMLSESHFPYVLFLEGSNFLTENISITRPDGRVVNLeYnSgiLnrLDrLTAANYGMPINSNLCINKFVNHKDKSIMLQAASIYTQGDGREWDSKIMFEIMFDISTTSLRVLGRDLFEQLTSK;SQGVIGIFGDYAKAHDLAVGEVSKLVKKALSNEYPQLSFRYRDSIKKTEINEALKKIDPDLGGTLFvSnssikPdGGIVEVKDDYGEWRVVLVAeakhqgkDIInIRNGLLvgkRGDQDLmtagnaIerSHknISEIANFMLSESHFPYVLFLEGSNFLTENISITRPDGRVVNLeYnSgiLnrLDrLTAANYGMPINSNLCINKFVNHKDKSIMLQAASIYTQGDGREWDSKIMFEIMFDISTTSLRVLGRDLFEQLTSK C;E Tcgcgaattcgcg;Tcgcgaattcgcg 28 242 406 144;6;254;2 10;0;0;2;4;0;6;4;4;0;16;0;0;0;0;4;6;26;60;264 2PVI 2pvi_1_1 9628337 1.76 PROTEUS VULGARIS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease PvuII 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 1 2 1 1 1 A;B SHPDLNKLLELWPHIQEYQDLALKHGInDIFqdnGGkLLQVLLITGLTVLPGRagnDAVDNAGQEYelksinIDltkgFsthhHMNPviIAkARQVPWIFAIYRGIAIEAIYRLEPKDLEFyYDkwERkWYSdGHkDinnpkIpVKYVMEHGTKIY;SHPDLNKLLELWPHIQEYQDLALKHGInDIFqdnGGkLLQVLLITGLTVLPgRagnDAVDNAGQEYelksinIDltKgFsthhHMNPviIAkARQVPWIFAIYRGIAIEAIYRLEPKDLEfyYDkwERkWYSdGHkdinnpkIpVkYVMEHGTKIY C;D tgaccagtggtC;tgaccagtggtC 41 232 346 120;8;216;2 7;4;8;0;7;2;6;2;19;2;7;0;0;0;0;4;5;21;37;215 2Q10 2q10_1_1 17445830 1.75 BREVIBACILLUS CENTROSPORUS 2 1 1 2 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease BcnI 1 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A MKIWSKEEVVNKLHEIKNKGYLSVPTDMFrtddgVvgqIleRQFGVQenNiTLGdLGEFelkgmrNrKaksnLtLfhkkPVAGQtViQIFNRFGyVkPssrnPEVMkKkLfttIkGGrLnnlGLTLNAKHASEINLYYQDEYLSTWDLNLSkIEKLVLVFAETIGRaNSPEEQFHFTKAYMLTEINDITSLINDGVLVMdlcIdQDLSKSKGphdrgPhLrIPISKLDKLYRNIERLL C;D aacccggagaC;ctccgggTtgT 76 15 384 102;19;262;1 4;3;4;1;7;0;5;1;13;6;8;0;1;1;0;2;2;24;50;252 2Q10 2q10_2_1 17445830 1.75 BREVIBACILLUS CENTROSPORUS 2 1 1 2 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease BcnI 2 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B MKIWSKEEVVNKLHEIKNKGYLSVPTDMFrtddgVvgqILeRQFGVqenniTLGdLGEFelkgmrNrKaksnltLfhkkPVAGQTViQIFNRFGyVkPssrnPEVMkKkLfttIkGGrLnnlGLTLNAKHASEINLYYQDEYLSTWDLNLSkIEKLVLVFAETIGRANSPEEQFHFTKAYMLTEINDITSLINDGVLVMdLcIdQDLSKSKGphdrgPhLrIPISKLDKLYRNIERLL E;F aacccggagaC;ctccgggTtgT 76 15 390 100;17;273;0 4;2;3;1;7;0;5;1;15;8;9;0;1;1;0;2;1;22;46;262 2QOJ 2qoj_1_1 17720189 2.4 EMERICELLA NIDULANS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease I-AniI 1 1 1 0 2, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 Z GSDLTYAYLVGLFEgdgyfsitkkgkyltyeLGIelsIkdVQLIYKIKKILGIgivsfrKrnEieVALrIrdkNhLKSFILPIFEKYPFSNkQYdYLrFRNALLSGIislEDLPDyTrSDEPLNSIESIINTSYFSAWLVGFIEaegcfsvyklnkDdDyLiAsFdIaqrDGDILISAIRKYLSFttkVyLdktNcSkLkvtsvRSVENIIKFLQNAPVKLLGNkKLqYLLWLKQLRKIsrySeKIKIPSNY X;Y GCgctgaggaggtTtctctgtaaAGCGCA;GCGctttacagAGaaacctcctCAGCGCGC 220 224 552 189;0;363;0 12;1;12;0;7;0;1;0;14;10;19;4;0;0;0;13;4;37;105;313 2VY1 2vy1_1_1 18784751 2.1 ARABIDOPSIS THALIANA 1 1 1 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Protein Leafy 1 1 1 2 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B rehpfIVTEPGEVARGKKNGLDYLFHLYEQCREFLLQVQTIAKDRGEkCPTKvtnqVFrYAkKSGAsyInkpkMrhyVHCYALHCLDEEASNALRRAFKERGEnvgSWRQACYKPLVNIACRHGWDIDAVFNAHPRLSIWyvPtKLRQLCHLERNNAVAAAAAL;rehpfIVTEPGEVARGKKNGLDYLFHLYEQCREFLLQVQTIAKDRGEkCPTKvtnqVFrYAkKSGAsyInkpkMrhyVHCYALHCLDEEASNALRRAFKERGEnvgSWRQACYKPLVNIACRHGWDIDAVFNAHPRLSIWyvPtKLRQLCHLERNNAVAAAAAL W;X AgaaggaCCAGtggtcCgta;AgaaggaCCAGtggtcCgta 81 208 338 82;18;238;0 12;0;8;0;0;2;0;2;26;10;16;0;0;0;0;0;2;16;38;206 2VY2 2vy2_1_1 18784751 2.3 ARABIDOPSIS THALIANA 1 1 1 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Protein Leafy 1 1 1 2 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B rehpfIVTEPGEVARGKkNGLDYLFHLYEQCREFLLQVQTIAKDRGEkCPTKVtnqVFrYAkKSGAsYInkpkMrhyVHCYALHCLDEEASNALRRAFKERGEnvgSWRQACYKPLVNIACRHGWDIDAVFNAHPRLSIWyvPtKLrQLCHLERNNAVAAAAA;rehpfIVTEPGEVARGKkNGLDYLFHLYEQCREFLLQVQTIAKDRGEkCPTKVtnqVFrYAkKSGAsYInkpkMrhyVHCYALHCLDEEASNALRRAFKERGEnvgSWRQACYKPLVNIACRHGWDIDAVFNAHPRLSIWyvPtKLrQLCHLERNNAVAAAAA W;X AtttaatCCAAtggtTACaa;AtttaatCCAAtggtTACaa 81 207 290 52;12;226;0 8;0;8;0;0;0;0;0;20;10;14;0;0;0;0;0;0;16;40;174 2Z3X 2z3x_1_1 0 2.1 BACILLUS SUBTILIS 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein Maintenance|Protection Spore Protein C 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 3 1 1 1 A;B;C akllIPQAASAiEQMkLEIASEFGVQlgaETTsrAngsvggeitkRlvRLAqQNMG;akllIPQAASAiEQMkLEIASEFGVQlgaETTsrAngsvggeitkRlVRLAQQNMG;akllIPQAASAiEQMkLEIASEFGVQlgaETTsrAngsvggeitkRlvRLAqQNMG D;E gggggggggga;cccccccccca 122 204 453 4;93;356;0 0;3;0;3;4;2;9;3;0;5;18;0;0;0;0;0;0;8;102;296 3BM3 3bm3_1_1 0 1.7 PYROCOCCUS SP. GI-H 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease PspGI 1 1 1 0 1, 1 1 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B VRNLVIDITKkptqNiPptNEiIEEAITELNVDELLDRLFEKDESGEVITPSRIAKLeEKafEIyKEYEKQVREAYLSAGYSREkLEqsFqqarfsrggkafeIIFTKLLNKFGIRYEHDRVIKIYDYITegEkPaFIIPSVRTFLNDPSSAILItvkrkVrerwreAVGeAQILRNKFGDEINFWFVGFDEeFtiySAIALDNGIDRVYVIDGRYDSLIEEIKRISDPNFNEDKYIQKIRRFSDIFDDIIQFLNKH;RNLVIDITKkptqNiPptnEIIEEAITELNVDELLDRLFEKDESGEVITPSRIAKLeEKafEIyKEYEKQVREAYLSAGYSRekLEqsFqqarfsrggkafeIIFTKLLNKFGIRYEhDRvIKIYDYITegEkPaFIIPSVRTFLNDPSSAILItvkrkVrerwreAVGeAQILRNKFGDEINFWFVGFDEEFtiySAIALDNGIDRVYVIDGRYDSLIEEIKRISDPNFNEDKYIQKIRRFSDIFDDIIQFLNKH C;D Catccaggtac;Ggtacctggat 147 196 646 141;90;406;9 9;1;3;3;10;3;3;3;23;15;15;0;0;0;0;6;1;42;123;386 3BRD 3brd_1_1 18381292 2.21 CAENORHABDITIS ELEGANS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet Lag-1 (CSL) 1 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 2 2 0 1 A;D VQSLTSDRMIDFLSNKEKYECVISIFHAKVAqkSygnekrfFCPPPCIYLIGQGWKLKKDRVAQLYKTLQQATELVAYIGIGSDTSERQQLDFPNIYDYCAAKTLYISdSDkRkYFDLNAQFFYGCGMEIGGFVSQRIKvIskpskkktDCKYlCIASGTKVALFNrlrsqtvStRYLHVEGNAFHASSTKWGAFTIHLFDDQETDNFAVRDGFVYYGSVVKLVDSVTGIALPRLRIRKVdkQQVILDASCSEEPVSQlHkCAFQMIDNELVYLCLSHDKIIQHQATAINEHRHQINDGAAWtIISTDKAEYRFFEAMGQVANPISPCPVVGSLEVDGHGEASRVELHGRDFKPNLKVWFGATPVETTFRSEESLHCSIPPVSQVRNEQTHWMFTNRTTGDVEVPISLVRDDGVVYSSGLTFSYKSL;RRMINASVWMPPMEN B;C TTACtgtgggaAAGA;AATctttcccAcagt 131;264 194 205 49;9;147;0 6;0;5;0;3;0;1;0;5;9;7;0;0;0;0;2;4;19;44;100 3BRF 3brf_1_1 18381292 2.47 CAENORHABDITIS ELEGANS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet Lag-1 (CSL) 1 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 2 2 0 1 A;D SLTSDRMIDFLSNKEKYECVISIFHAKVAqkSygnekrfFCPPPCIYLIGQGWKLKKDRVAQLYKTLTELVAYIGIGSDTSERQQLDFPNIYDYCAAKTLYISdSDkRKYFDLNAQFFYGCGMEIGGFVSQRIKvIskPskkkqSDCKYlCIASGTKVALFNrLrsqtvSTRYLHVEGNAFHASSTKWGAFTIHLFDDEQETDNFAVRDGFVYYGSVVKLVDSVTGIALPRLRIRkvdkQQVILDASCSEEPVSQlHkCAFQMIDNELVYLCLSHDKIIQHQATAINEHRHQINDGAAWTIISTDKAEYRFFEAMGQVANPISPCPVVGSLEVDGHGEASRVELHGRDFKPNLKVWFGATPVETTFRSEESLHCSIPPVSQVRNEQTHWMFTNRTTGDVEVPISLVRDDGVVYSSGLTFSYKS;RMINASVWMPPME B;C TTACtgtgggaAAGA;AATctttcccAcagt 131;265 193 228 55;15;158;0 10;0;7;2;3;0;1;0;4;4;9;0;0;0;0;4;2;18;46;118 3BRG 3brg_1_1 18381292 2.2 MUS MUSCULUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet Lag-1 (CSL) 1 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 2 2 0 1 C PPKRLTREAMRNYLKERGDQTVLILHAKVAqkSygnekrfFCPPPCVYLMGSGWKKKKEQMERDGCSEQESQPCAFIGIGNSDQEMQQLNLEGKNYCTAKTLYISdSDkRkHFMLSVKMFYGNSDDIGVFLSKRIKvIskPskkkLknADlCIASGTKVALfNrlrsqtVSTRYLHVEGGNFHASSQQWGAFYIHLLDDDETVRDGYIHYGQTVKLVCSVTGMALPRLIIRKvdkQTALLDADDPVSQlHkCAFYLKDTERMYLCLSQERIIQFQATPCPKEQNKEMINDGASWtIISTDKAEYTFYEGMGPVLAPVTPVPVVESLQLNGGGDVAMLELTGQNFTPNLRVWFGDVEAETMYRCGESMLCVVPDISAFREGWRWVRQPVQVPVTLVRNDGVIYSTSLTFTYTPEP A;B AATctttcccacagt;TTACTgtgggAAAGA 215 192 216 45;15;156;0 4;1;4;0;3;0;1;0;10;7;5;0;0;0;0;3;4;17;40;117 3BS1 3bs1_1_1 18462677 1.6 STAPHYLOCOCCUS AUREUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet Regulator AgrA 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 1 1 0 0 1 A MDNSVETIELKrgSNSVYVQYDDIMFFEsSTKshrlIAHLDNRQIEFyGnlkELSQLDDRFFrChnsFVVNRHNIESIDSKErIVYFKNKEHCYasvrnVkKI B;C ttTaaCAGTtaagAT;aaacTTAActgtTAA 239 191 140 31;3;106;0 2;2;4;0;3;1;0;0;11;4;6;0;0;0;0;0;0;11;19;77 3BTX 3btx_1_1 18432238 2 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Dioxygenase DNA Repair Protein AlkB 1 1 1 0 1, 1 1 0 0 1 0 1 0 0 1 A ASWRHIRAEGLDSSYTVLFGKAEADEIFQELEKEVEYFTGALARvqvfgkWhsvprKqATYGDAGLTyTfsGLTLSPKPWIPVLERIRDHVSGVTGQTFNFVlINRYKDGSDhigehrddcrELAPGSPIASVSFGASRDFvFrHkDsrgkSPSRRVAvVrLPLAHGSLLMMNHPTNTHWyHSLpvrkkVLAPRVNLTFRKILL B;C CTGTatcatTGCG;tcgcaataataca 116 49 287 54;46;175;12 1;0;4;0;1;2;2;1;9;2;8;0;0;0;0;0;1;19;75;162 3BTY 3bty_1_1 18432238 2.35 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Dioxygenase DNA Repair Protein AlkB 1 1 1 0 1, 1 1 0 0 1 1 1 0 0 1 A SWRHIRAEGLDSSYTVLFGKAEADEIFQELEKEVEYFTGALARvqvfgkwhsvprKQATYGDAGLTYTFsGLTLSPKPWIPVLERIRDHVSGVTGQTFNFVLINRYKDGSDhicehrDdErELAPGSPIASVSFGASRDFvFrHkDsrpSRRVAvVrLPLAHGSLLMMNHPTNTHWyHSLpvrkkVLAPRVNLTFRKILL B;C CTGTatacTGCG;tcgcaGttataCa 116 190 212 32;32;142;6 2;0;1;0;0;0;1;0;6;2;4;3;0;0;0;0;0;21;44;128 3BU0 3bu0_1_1 18432238 2.5 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Dioxygenase DNA Repair Protein AlkB 1 1 1 0 1, 1 1 0 0 1 0 1 0 0 1 A SWRHIRAEGLDSSYTVLFGKAEADEIFQELEKEVEYFTGALARvqvfgkWhsvprKqATYGDAGLTyTfsGLTLSPKPWIPVLERIRDHVSGVTGQTFNFVlINRYKDGSDhigehrdDcrELAPGSPIASVSFGASRDFvFrHkDsrgkSPSRRVAvVrLPLAHGSLLMMNHPTNTHWyHSLpvrkkVLAPRVNLTFRKILL B;C CTGTatcatTGCG;tcgcaataataCa 116 49 284 50;45;177;12 1;0;3;0;2;2;2;1;8;2;6;0;0;0;0;0;1;22;68;166 3C2I 3c2i_1_1 18313390 2.5 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Alpha|Beta MeCP2 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 1 1 0 0 1 A rGPYDDPTLPEGWTRkLkqrksgrsAGkydvyLINPQgkaFrskveLIYFEKVGDTSLDPNDFDftvtGr B;C TCTGgaaggAATTctTCTA;ATAGAAGAAttcgtTCCAG 250 186 96 23;1;71;1 2;0;5;0;1;0;0;0;1;5;7;0;0;0;0;1;1;8;9;56 3C58 3c58_1_1 18635007 1.9 LACTOCOCCUS LACTIS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Glycosylase DNA Mismatch Repair Protein MutM 1 1 1 0 1, 1 1 0 0 0 1 1 0 0 1 A peLPEVETVRRELEKRIVGQKIISIEATyPrMVLTGFEQLKKELTGKTIQGISRRGkyLIFEIGDDFRLIShLrmeGKYRLATLDAPREkhDHLTMKFADGQLIYADvrkfGTWELISTDQVLPYFLKkKiGPEPTYEDFDEKLFREKLRKStkkIKpYLleqTLVAGLgnIYVDEVLWLAKIHPEKETNQLIESSIHLLHDSIIEILQKAIKLGGSSIRSALGSTGKMQNELQVyGKTGEKCSRCGAEIQkIkVagrgThFCPVCQQK B;C CTCTtttttCTCG;GcgagaAacaaAGA 44 4 216 34;38;140;4 0;0;7;0;0;0;1;0;8;2;3;0;0;0;0;0;4;13;36;142 3CBB 3cbb_1_1 0 2 HOMO SAPIENS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Hepatocyte Nuclear Factor 4 Alpha 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A ALCAICGdrAtGkhygASScdgCkgfFrrSVrkNhMySCRFSRQCVVDkDKrnQCrYCrLKKCFRAGMKKEavqne C;D TGaagtcCAAAGtTCAGTCCC;AGGGACTGAACTttggacTTC 187 182 158 35;0;123;0 3;0;5;0;2;0;0;0;9;0;7;0;0;0;0;0;0;19;10;103 3CBB 3cbb_1_2 0 2 HOMO SAPIENS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Hepatocyte Nuclear Factor 4 Alpha 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B ALCAICGdRAtGkhygASSCdgCkgfFrrSVrkNhMySCRFSRQCVVDkDKrnQCrYCrLKKCFRAGMKKEavqnerd C;D TGAAGTCCAaagttCAGTCCC;AGGGactgaacTttgGACTTC 187 181 174 41;0;133;0 5;0;5;0;2;0;0;0;9;0;7;0;0;0;0;0;0;18;14;114 3COQ 3coq_1_1 18611375 2.4 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating GAL4 Type, GAL4 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B eqaCDICrlkklkcSkEKPKCAkCLKNNwECRYSPktKrSpltrAHLTEVESRLERLEQLFLLIFPREDLDMILKMDSLQDIKALLTGL;eqaCDICrlkklkcSkEKPKCAKCLKNNWECRYSPktKrSpltrAHLTEVESRLERLEQLFLLIFPREDLDMILKMDSLQDIKALLTGL D;E accggAGGacAgtcctccgG;tccggAGGacTgtcctccGG 178 177 258 65;1;190;2 4;0;4;0;0;0;6;0;6;0;12;0;0;0;0;0;9;18;44;155 3CRO 3cro_1_1 2038059 2.5 BACTERIOPHAGE 434 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Cro Repressor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 L;R MQTLSERLkKRrIALKMtqteLATKAgvkqqsIqliEaGvtkrprfLFEIAMALNCDPVWLQYGTK;MQTLSERLkKRrIALKMtqteLATKAGvkqqsIqliEAGvtkrprfLFEIAMALNCDPVWLQYG A;B AAgtacaAACtttcttgtAT;TatacaAGAaagtttgtACT 198 175 289 87;12;190;0 9;0;9;0;3;0;0;0;16;15;14;0;0;0;0;11;1;10;41;160 3CVU 3cvu_1_1 18956392 2 DROSOPHILA MELANOGASTER 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Photolyase Photolyase RE11660p 1 1 1 0 1, 1 1 0 0 0 1 1 0 0 1 A RSTLVHWFRKGLRLHDNPALSHIFTAANAAPGRYFVRPIFILDPGILDWMQVGANRWRFLQQTLEDLDNQLRKLNSRLFVVRGKPAEVFPRIFKSWRVEMLTFETDIEPYSVTRDAAVQKLAKAEGVRVETHCSHTIYNPELVIAKnLGkAPityqkFLGIVEQLKVPKVLGVPEKLKNMPTPPKDEVEQKDSAAYDCPTMKQLVKRPEELGPNKFPGGETEALRRMEESLKDEIWVARFEKPNTAPNSLEPSTTVLSPYLKFGCLSARLFNQKLKEIIKRQPKHSQPpVSLIGQLMwREFYYTVAAAEPNFDRMLGNVyCmQIPWQEHPDHLEAWTHGRTGYPFIDAIMRQLRQEGWIHHLARHAVACFLTRGDLWISWEEGQRVFEQLLLDQDWALNAGNWMwLSASAffhqyfrvysPVafGKkTDPQGHYIRKYVPELSKYPAGCIYEPWKASLVDQRAYGCVLGTDYPHRIVKHEVVhKENiKRMGAAyKVNrEVr C;D ACAGCgggcaGGT;TACCTGCaaccgctG 212 172 177 11;27;133;6 1;0;1;0;0;1;2;0;3;2;5;0;0;0;0;0;0;12;40;110 3DPG 3dpg_1_1 18701646 1.91 STREPTOMYCES GRISEUS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease SgraIR 1 1 1 0 1, 1 0 0 1 0 0 2 1 1 1 A;B PFTYSIEATRNLATTERCIqDIRNAPvrnrstQfqlaqqNMLAYTFGEVIPGFASAGINGMDYRDVIGRPVENAVTEGTHFFRDDFRVdsnakakvagdIfeiVSSAVMWNCAARWNSLMVGEGWRSQPRYSRPTLSPSPRRQVAVLNLprsfDWVSLLVPESQEVIEEFRAGLRKDGLGLPTstPdLAVVVLPEEFQNDEMWREEIAGLTrPNQILLsGAyqRLqGRVQPGEISLAVAfkrsLrsdrLyqPLYEANVMQLLLEGKLGAPKVEFEVHTLAPegTnAFVTYEAASLYGLAEGRSAVHRAIRELYVPPTAADLARRFFAFLNERMELVNG;PFTYSIEATRNLATTERCIQDIRNAPvrnrstQfqlaqqNMLAYTFGEVIPGFASAGINGMDYRDVIGRPVENAVTEGTHFFRDDFRVdsnakakvagdIfeIVSSAVMWNCAARWNSLMVGEGWRSQPRYSRPTLSPSPRRQVAVLNLprsFDWVSLLVPESQEVIEEFRAGLRKDGLGLPTstPdLAVVVLPEEFQNDEMWREEIAGLTrPNQILLsGAyqRLQGRVQPGEISLAVAfkrsLrsdrLyqPLYEANVMQLLLEGKLGAPKVEFEVHTLAPeGTnAFVTYEAASLYGLAEGRSAVHRAIRELYVPPTAADLARRFFAFLNERMELVNG C;D AAGtcgaccggtggacT;AAgtcgaccggtggat 38 161 584 101;60;421;2 14;2;6;0;11;2;4;0;33;31;19;0;0;0;0;6;1;18;76;361 3HDD 3hdd_1_1 9813123 2.2 DROSOPHILA MELANOGASTER 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Engrailed 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A rtafSSEQlARLkREFNENRylTeRRrQQLSSELGLNEAqIkiwFqnKrakIkkS C;D TTTTGCCATgtaattACCTAA;ATTAggtaatTacaTGGCAAA 35 149 149 32;10;106;1 5;0;7;0;2;0;0;0;7;2;3;0;0;0;0;1;0;13;21;88 3HDD 3hdd_1_2 9813123 2.2 DROSOPHILA MELANOGASTER 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Engrailed 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B rprtAFSSEQLARLKREFNENRylTeRRrQQLSSELGLNEAqIkiWFqnKraKIkk C;D TTTTGCCATGTAATTAcctaa;attAGGTAATTACATGGCAAA 35 148 98 29;1;68;0 4;0;3;0;1;0;0;0;3;0;3;0;0;0;0;2;0;9;16;57 3PVI 3pvi_1_1 9878366 1.59 PROTEUS VULGARIS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease PvuII 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SHPDLNKLLELWPHIQEYQDLALKHGInDIFqgnGGkLLQVLLITGLTVLPGRegnDAVDNAGQEYelksinIDltkgFsthhHMNPviIAkyRQVPWIFAIYRGIAIEAIYRLEPKDLEfyYDkwERkWYSdGHkDInnpkIpVKYVMEHGTKIY;SHPDLNKLLELWPHIQEYQDLALKHGInDIFqgnGGKLLQVLLITGLTVLPGregndAVDNAGQEYelksinIDltkgFsthhHMNPviIAkyRQVPWIFAIYRGIAIEAIYRLEPKDLEfyYDkwERkWYSdGHkdinnpkIpVkYVMEHGTKIY C;D tgaccagctggtC;tgaccagctggtC 41 145 410 132;10;266;2 6;2;9;1;4;2;5;4;21;7;10;0;0;0;0;3;3;26;47;260 4CRX 4crx_1_1 10377382 2.2 BACTERIOPHAGE P1 1 1 1 1 1 0 1 Enzyme Recombinase Cre Recombinase 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B SDEVRKNLMDMFRDRQafsEhtWkmLLsVCrsWAAWCKLNNRKWFPAEPEDVRDYLLYLQArglaVktIqqhLgqLNmLHrrSGLPrPSDSNAVSLVMRRIRKENVDAGERakqaLAFERTDFDQVRSLMENSDrCqDIrNLAFLGIAYNTLLkiaEIArIRVKDISRTDGGRMLIHIGrtktlvSTAGVEKALSLGVTKLVERWISVSGVADDPNNYLFCrvrknGVAAPSATsqlstraLeGIFeATHRLIYGAkDDSgqryLawsghSArVGAARDMARAGVSIPEIMQAGgwtnVNiVMnyIRNLDSETGAMVRLLED;SDEVRKNLMDMFRDRQafsEhtWkmLLsVCrsWAAWCKLNNRKWFPAEPEDVRDYLLYLQArglaVktIqqhlgqLnmLHrrSGLPrPsDSNAVsLVmrRIrkENVDAGERakqaLAFERTDFDQVRSLMENSDrCqDIrNLAFLGIAYNTLLkiaEIArIRVKDISRTDGGRMLIHIGrtktLVSTAGVEKALSLGVTKLVERWISVSGVADDPNNYLFCrvrknGvAAPSATsqlstraLeGIFeATHRLIYGAkDDSgqryLawsghSArVGAARDMARAGVSIPEIMQAGgwtnVniVMnyIRNLDSETGAMVRLLED C;D TataacttcgtatagcatATgctatacgaAGttat;TataacttcgtatagcatatgctatacgaAGttat 15 134 970 204;46;719;1 20;1;21;0;3;0;3;0;56;39;32;0;0;0;2;19;6;62;154;552 6PAX 6pax_1_1 10346815 2.5 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Paired Protein Pax 1 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A shSGvnqlGGVfvngrplPDSTrQRIVELAHSGArpcDISrILQvsngcVskiLGrYYATGSIRpraiggskprvaTPEVVSKIAQYKQECPSifawEIRDRLLSEGVCTNdNipsvssInrVLrnLASEKQQ B;C AAGCAttttcACgcatgagtgcACAG;TTctgtGCACtcatgcgtgaAAATGC 118 141 395 57;35;303;0 5;2;1;1;2;3;3;2;16;7;20;5;0;0;0;4;3;20;65;236 9ANT 9ant_1_1 9699632 2.4 DROSOPHILA MELANOGASTER 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Antennapedia 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 A rqtyTRYQtLELEKEFHFNRylTrRRrIEIAHALSLTErqIkiwFqnRrmkWkkEN C;D AGAaagccatTagag;TCTCtaatgGCTTTC 102 140 171 36;10;124;1 7;0;3;0;3;0;0;0;10;3;6;0;0;0;0;0;0;18;29;92 9ANT 9ant_2_1 9699632 2.4 DROSOPHILA MELANOGASTER 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Antennapedia 2 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 B rqtyTRYQtLELEKEFHFNRylTrRRrIEIAHALSLTErqIkiwFqnRrmkWkkEN E;F AGAaagccatTagag;TCTCtaatgGCTTTC 102 139 169 33;11;125;0 6;0;4;0;2;0;0;0;10;3;4;0;0;0;0;0;0;15;30;95