#QUERY:
#Match: All
#Protein-protein interaction: Parallel to DNA helix
#PDB_ID	ENTRY_ID	PUBMED_ID	RESOLUTION	SPECIES	MULTICOMPLEXITY	NO_INTERFACES	ASYMMETRIC_UNIT	BIOLOGICAL_UNITS	IS_CRUCIFORM	HAS_ZDNA	HAS_WATER	CLASSIFICATION	TYPE	SUBTYPE	COMPLEX_ID	INTERFACE_ID	DNA_DOUBLE_STRAND	DNA_SINGLE_STRAND	STICKY_ENDS	FLIPPED_BASE	NICKED_DNA	GAPPED_DNA	OPEN_DNA	MODIFIED_DNA	PROTEIN_MONOMERS	MULTIMERIZATION	PROT_PROT_INTERACTION	DNA_PROT_INTERACTION	PROT_CHAIN_IDS	PROT_SEQS	DNA_CHAIN_IDS	DNA_SEQS	SEQ_GROUPS	INTERFACE_GROUP	NUMBER_EFF_CONTACTS	GROOVE_CONTACTS(MA;MI;BB;NA)	TYPE_CONTACTS(1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13;14;15;16;17;18;19;20)
1A6Y	1a6y_1_1	9660968	2.3	HOMO SAPIENS	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Zinc Coordinating	Hormone Nuclear Receptor, Orphan Nuclear Receptor NR1D1	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	1	2	1	2	1	A;B	LLCKVCGdVAsgfhyGVLACegCkgfFrrSIqQNiykRCLKNENCSIVRINrnrCqQCrFKKCLSVGMSrDAvrfgr;GMVLLCKVCGdvAsgfhyGVLACegCkgfFrrSiqQNiyKRCLKNENCSIVrINrnRCqQCrFKKCLSVGMSrDAvrfgripk	C;D	CAactaggtCacaggtCAG;ctgaccTagtgaccTAgttg	54	664	428	69;27;332;0	11;0;9;0;4;3;2;4;20;0;16;0;0;0;0;0;0;27;64;268
1A73	1a73_1_1	9665136	1.8	PHYSARUM POLYCEPHALUM	1	1	0	1	0	0	1	Enzyme	Endonuclease	Endonuclease I-PpoI	1	1	1	0	1, 1	0	2	0	0	0	2	1	2	1	A;B	ALTNAQILAVIDSWEETVGQFPVITHHVPLGGGLQGTLHCYEIPLAapygvgfaknGPtrWqYkrtINqVvHrwgShtVPFLLEPDNINGktCtaShLChNtRCHNPLHLCwESldDnkGRnWCPGPNGGCVHAVVCLRQGplYGPGATVAGPQQRGSHFVV;ALTNAQILAVIDSWEETVGQFPVITHHVPLGGGLQGTLHCYEIPLAapyGvgfaknGPtrWqYkrtINqVvHrwgShtVPFLLEPDNINgktCtaShLCHNtRCHNPLHLCwESldDnkGRnWCPGPNGGCVHAVVCLRQGplYGPGATVAGPQQRGSHFVV	C;D;E;F	ttgactcTCttaa;gagagTCA;ttgactcTCttaa;gagagTCA	29	7	385	117;22;246;0	18;0;9;0;4;0;4;0;13;8;19;0;0;0;0;3;8;21;51;227
1A74	1a74_1_1	9665136	2.2	PHYSARUM POLYCEPHALUM	1	1	0	1	0	0	1	Enzyme	Endonuclease	Endonuclease I-PpoI	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	ALTNAQILAVIDSWEETVGQFPVITHHVPLGGGLQGTLHCYEIPLAapygvgfaknGPTrWqYkrtINqVvHrwgShtVPFLLEPDNINGktCtashLChNtRCHNPLHLCwESldDnkGRnWCPGPNGGCVHAVVCLRQGplYGPGATVAGPQQRGSHFVV;ALTNAQILAVIDSWEETVGQFPVITHHVPLGGGLQGTLHCYEIPLAapygvgfaknGPTrWqYkrtINqVvHrwgShtVPFLLEPDNINGktctashLChNtRCHNPLHLCwESldDnkGRnWCPGPNGGCVHAVVCLRQGplYGPGATVAGPQQRGSHFVV	C;D	ttgactcTCttaagagagtCA;ttgactcTCttaagagagTCA	29	7	402	115;21;266;0	14;0;8;0;6;0;4;0;17;11;18;0;0;0;0;3;8;21;47;245
1AKH	1akh_1_1	9838003	2.5	SACCHAROMYCES CEREVISIAE	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Homeodamain, Mat Alpha 2	1	1	1	0	2, 2	0	0	0	0	0	2	2	2	1	A;B	iSPQArAFLeEVFRRKQslnsKEkEEVAKKCGITPlqVrvwFinKrmrS;TKpyrghrfTkENvRILeSWFAKNIENPylDTKGLENLMKNTSLSriqIknwVsnRrrkEkTITIAPELADLLSGEPL	C;D	TacatgtaaaaatttacatCA;TAtgatgTAAATTtttacaTG	121;123	662	322	76;26;220;0	12;1;11;1;5;1;0;1;18;4;8;0;0;0;0;3;1;18;47;191
1B3T	1b3t_1_1	9878348	2.2	EPSTEIN-BARR VIRUS	1	1	0	1	0	0	1	Structural|DNA Binding protein	Replication	Origin Binding Protein, EBNA-1	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	kggwfGkhrgqggSnPkfEniAEGLRALLARSHVERTTDEGTWVAGVFVYGGsktsLynLrrGTALAIPQCRLTplsrLPFGMAPGPGPQPGPlReSiVcYFMVFLQTHIFAEVLKDAIKDLVMTkpAptCNIRVTVCSFDDGVDLP;kggwfGkhrgqggSnPkfEniAEGLRALLARSHVERTTDEGTWVAGVFVYGGsktsLynLrrGTALAIPQCRLTplsrLPFGMAPGPGPQPGPlReSiVcYFMVFLQTHIFAEVLKDAIKDLVMTkpAptCNIRVTVCSFDDGVDLP	C;D	gggaagcatatgcttccC;gggaagcatatgcttccC	166	658	549	59;69;421;0	5;2;10;0;1;6;4;4;29;8;27;2;0;0;0;0;0;23;108;320
1BDT	1bdt_1_1	9927650	2.5	BACTERIOPHAGE P22	1	2	0	1	0	0	1	Transcription factor	Ribbon|Helix|Helix	Arc Repressor	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	mkgmsKMpqfnLrWPrEVLDLVrKVAEENGRsvnsEIYQRVMESFKKEGRIG;mkgmsKMpqfnLrWPREVLDLVrKVAEENgrsvnsEIYQRVMESFKKEGRIGA	E;F	tatagtagaGTGCtTCTATCAT;AATGATAGAAGcactctacTAT	106	651	209	81;0;128;0	5;1;6;0;5;0;0;0;3;8;21;0;0;0;0;4;4;4;33;115
1BDT	1bdt_1_2	9927650	2.5	BACTERIOPHAGE P22	1	2	0	1	0	0	1	Transcription factor	Ribbon|Helix|Helix	Arc Repressor	1	2	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	C;D	mkgmsKMpqfnLrWPREVLDLVrKVAEENGRsvnsEIYQRVMESFKKEGR;mkgmskmpqfnLrWPREVLDLVrKVAeENgrsvnsEIYQRVMESFKKEGR	E;F	TATAGTAGAGTgcttctatCAT;aatgatagaAGCacTCTACTAT	106	650	230	89;0;141;0	4;0;10;0;6;1;0;0;3;12;22;0;0;0;0;5;2;6;33;126
1CYQ	1cyq_1_1	10581547	1.93	PHYSARUM POLYCEPHALUM	1	1	0	1	0	0	1	Enzyme	Endonuclease	Endonuclease I-PpoI	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	ALTNAQILAVIDSWEETVGQFPVITHHVPLGGGLQGTLHCYEIPLAapygvgfaknGPTrWqYkrtINqVvHrwgShtVPFLLEPDNINGktCtasaLChNtRCHNPLHLCwESldDnkGRnWCPGPNGGCVHAVVCLRQGplYGPGATVAGPQQRGSHFVV;ALTNAQILAVIDSWEETVGQFPVITHHVPLGGGLQGTLHCYEIPLAapygvgfaknGPTrWqYkrtiNqVvHrwgShtVPFLLEPDNINGktCtasaLChNtRCHNPLHLCwESldDnkGRnWCPGPNGGCVHAVVCLRQGplYGPGATVAGPQQRGSHFVV	C;D	ttgactcTCttaagagagTCA;ttgactcTCttaagagagTCA	29	7	393	118;21;254;0	20;0;9;0;4;0;4;0;17;8;21;0;0;0;0;3;8;19;53;227
1CZ0	1cz0_1_1	10581547	2.1	PHYSARUM POLYCEPHALUM	1	1	0	1	0	0	1	Enzyme	Endonuclease	Endonuclease I-PpoI	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	ALTNAQILAVIDSWEETVGQFPVITHHVPLGGGLQGTLHCYEIPLAapygvgfaknGPTrWqYkrtINqVvHrwgShtVPFLLEPDNINGktCtashLChNtRCHNPLHLCwESldDnkGRnWCPGPNGGCVHAVVCLRQGplYGPGATVAGPQQRGSHFVV;ALTNAQILAVIDSWEETVGQFPVITHHVPLGGGLQGTLHCYEIPLAapygvgfaknGPTrWqYkrtINqVvHrwgShtVPFLLEPDNINGktCtashLChNtRCHNPLHLCwESldDnkGRnWCPGPNGGCVHAVVCLRQGplYGPGATVAGPQQRGSHFVV	C;D	ttgactcTCttaagagagTCA;ttgactcTCttaagagagtCA	29	7	389	114;21;254;0	19;0;10;0;4;0;4;0;18;11;18;0;0;0;0;2;8;18;53;224
1DSZ	1dsz_1_1	10698945	1.7	HOMO SAPIENS	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Zinc Coordinating	Hormone Nuclear Receptor, Retinoic Acid Receptor	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	PCFVCQdkSsGyhygVSACegCkgfFrrSIqkNmVyTCHRDKNCIINKVTrnRCqYCrLQKCFEVGMSKEsvrNd;GSFTKHICAICGdrSsGkhygVYSCegCkgfFkrTVrkDlTyTCRDNKDCLIDkRQrnRCqYCrYQKCLAMGMKREavqeerqr	C;D	caggtCaaaggtCAG;ctgaccTttgaccTg	46;247	622	317	81;3;233;0	8;1;11;0;5;0;2;0;26;1;12;0;0;0;0;1;1;29;33;187
1EGW	1egw_1_1	10715212	1.5	HOMO SAPIENS	2	1	1	2	0	0	1	Transcription factor	Alpha Helix	MADS box, MEF2A	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	grkkiQITRIMDErnRQvtFTkrKFgLMkKAYeLSVLCDCEIALIIFNSSNKLFQYASTDMDKVLLKYTEY;grkkiQITRIMDErnRQvtFTkrKFgLMkKAYeLSVLCDCEIALIIFNSSNKLFQYASTDMDKVLLKYTEYN	E;F	aAAgctatTatTagctT;TaAgctaAtaAtagcTT	98	128	236	21;43;172;0	3;0;6;0;0;4;0;4;14;2;9;0;0;0;0;0;0;12;31;151
1EGW	1egw_2_1	10715212	1.5	HOMO SAPIENS	2	1	1	2	0	0	1	Transcription factor	Alpha Helix	MADS box, MEF2A	2	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	C;D	grkkiQITRIMDErnRQvtFTkrKFgLMkKAYeLSVLCDCEIALIIFNSSNKLFQYASTDMDKVLLKYTEYN;grkkiQITRIMDErnRQvtFTkrKFgLMkKAYeLSVLCDCEIALIIFNSSNKLFQYASTDMDKVLLKYTEY	G;H	taAgctaAtaAtagctT;aAAgctatTatTagctT	98	128	233	19;45;169;0	3;0;6;0;0;4;0;4;10;2;10;0;0;0;0;0;0;12;33;149
1F4K	1f4k_1_1	11224562	2.5	BACILLUS SUBTILIS	1	1	0	1	0	0	1	Structural|DNA Binding protein	Replication	Replication Termination Protein	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	stGfLVkqrAFLKLYMITMTEQERLyglKLLEVLRSEFKEIGFKPnhteVyrSLhELLDDGILKqIkVkKEGAklqevvLyQFKDYEAAKLYKKQLKVELDRSKKLIEKALSDNF;stGfLVkqrAFLKLYMITMTEQERLyglKLLeVLRSEFKEIGFKPnhteVyrSLhELLDDGILKqIkVkKEGAKlqevvLyQFKDYEAAKLYKKQLKVELDRSKKLIEKALSDNF	D;E	CtatgaaCATAatgttCATag;CtatgaaCATTatgttCATAg	51	608	346	83;5;258;0	2;1;4;4;2;0;1;0;17;4;19;0;0;0;0;2;0;20;70;200
1G9Y	1g9y_1_1	11276249	2.05	CHLAMYDOMONAS REINHARDTII	1	1	0	1	0	0	1	Enzyme	Endonuclease	Endonuclease I-CreI	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	NTKYNKEFLLYLAGFVDgdgsiiaqikpnQsykFKHqlsLtFqVtqkTQrRWFLDKLVDEIGVgyVrdrGsvSDYiLseiKPLHNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKIIEQlPSAkESPDKFLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAVLD;NTKYNKEFLLYLAGFVDgdgsIiaqikpnQsykfKHqlsLtFqVtqkTQrRWFLDKLVDEIGVgyVrdrGsvSDYiLseikPLHNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKIIEQlPSAkESPDKFLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAVLD	C;D	cgaaactgtctcacgacgttttGC;gcaaaacgtcgtgagacagttTCG	4	11	666	185;17;463;1	14;9;14;6;12;0;0;0;11;13;24;0;0;0;0;3;3;30;131;396
1G9Z	1g9z_1_1	11276249	1.8	CHLAMYDOMONAS REINHARDTII	1	1	0	1	0	0	1	Enzyme	Endonuclease	Endonuclease I-CreI	1	1	1	0	0, 0	0	2	0	0	0	2	1	2	1	A;B	NTKYNKEFLLYLAGFVDgdgsIiaqikpnQsykfKHqlsLTFqVtqkTQrRWFLDKLVDEIGVgyVrdrGsvSDYiLseiKPLHNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKIIEQlPSAkESPDKFLEVCTWVDQiaALndsktrktTSETVRAVLD;NTKYNKEFLLYLAGFVDgdgsIiaqikpnQsykFKHqlsLTFqVtqkTQrRWFLDKLVDEIGVGyVrdrGsvSDYiLseikPLHNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKIIEQlPSAkESPDKFLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAVLD	C;D;E;F	gcaaaacgtcgtga;gacagttTCG;cgaaactgtctcac;gacgtttTGC	4	11	675	186;17;471;1	14;10;19;5;6;0;0;0;13;13;26;0;0;0;0;3;3;34;128;401
1GA5	1ga5_1_1	11669620	2.4	HOMO SAPIENS	2	1	1	2	0	0	1	Transcription factor	Zinc Coordinating	Hormone Nuclear Receptor, Orphan Nuclear Receptor NR1D1	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	1	2	1	2	1	A;B	VLLCKVCGdvAsgfhyGVLACegCkgfFrrSIQQNIykRCLKNENCSIVRINrnRCqQCrFKKCLSVGMSrDAvrfgripk;VLLCKVCGdVAsgfhyGVLACegCkgfFrrSIqQNIykRCLKNENCSIVRINrnrCqQCrFKKCLSVGMSrDAvrfgr	C;D	CAactaggtcactaggtCAG;ctgacCTAgtgaccTAgtg	54	118	408	75;30;303;0	10;0;11;0;3;2;2;2;24;0;12;0;0;0;0;0;1;25;59;257
1GA5	1ga5_2_1	11669620	2.4	HOMO SAPIENS	2	1	1	2	0	0	1	Transcription factor	Zinc Coordinating	Hormone Nuclear Receptor, Orphan Nuclear Receptor NR1D1	2	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	1	2	1	2	1	E;F	VLLCKVCGdvAsgfhyGVLACegCkgfFrrSIqQNIykRCLKNENCSIVRINrnRCqQCrFKKCLSVGMSrDAvrfgrip;VLLCKVCGdVAsgfhyGVLACegCkgfFrrSIqQNIyKRCLKNENCSIVRINrnrCqQCrFKKCLSVGMSrDAvrfg	G;H	CAactaggtcactaggtCAG;ctgacCTAgtgaccTAgtg	54	118	405	74;33;298;0	11;0;12;0;4;2;2;4;22;0;15;0;0;0;0;0;0;19;60;254
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1GXP	1gxp_2_1	12015152	2.5	ESCHERICHIA COLI	2	1	1	2	0	0	1	Transcription factor	Alpha Helix	PhoB	2	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	E;F	VEEVIEMQGLSLDPTSHRVMAGEEPLemgpteFKLLHFFMTHPERVYSrEQLLNHVwGTNVyveDrtVdvhirrLrKALEPGGHDRMVQtvrgTgyRFSTRF;VEEVIEMQGLSLDPTSHRVMAGEEPLEmgpteFKLLHFFMTHPERVYsrEQLLNHVwGTNVyvedrtVdvhIrrLrKALePGGHDRMVQtvrgtgyRFSTRF	G;H	GAGctgtcATAAagttgtcACGG;cccgtgaCAACtttatgaCAGCT	91	602	315	85;11;216;3	8;0;9;0;0;0;1;0;14;11;15;0;0;0;0;3;3;24;51;176
1H6F	1h6f_1_1	12005433	1.7	HOMO SAPIENS	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Beta Sheet	T Box, TBX3	1	1	1	0	2, 2	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	DPKVHLEAKELWDQFHKRGTEMvitksgrrmfPPFKVRCSGLDKKAKYILLMDIIAADDCrYkfhNSRWMVAGKADPEMPKRMYIHPDSPATGEQWMSKVVTFhKLkLTnNISDKHGFTILNsmHKYQPRFHIVRANDILKLPYSTFRTYLFPETEFIAVtayqNdKItQLkiDNnpfakgfRD;KDDPKVHLEAKELWDQFHKRGTEMvitksgrrmfPPFKVRCSGLDKKAKYILLMDIIAADDCRYkfHNSRWMVAGKADPEMPKRMYIHPDSPATGEQWMSKVVTFHKLkLTnNISDKHGFTILNsmHKYQPRFHIVRANDILKLPYSTFRTYLFPETEFIAVtayqNdKItqLkiDNnpfakgfRD	C;D	TAatttcACacctaggtgtGAAAT;TAatttcACacctaggtgtgAAAT	161	601	376	41;26;309;0	2;0;2;0;0;0;2;0;19;8;8;0;0;0;0;4;4;15;86;226
1HCQ	1hcq_1_1	8221895	2.4	HOMO SAPIENS	2	1	1	2	0	0	1	Transcription factor	Zinc Coordinating	Hormone Nuclear Receptor, Estrogen Receptor	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	MKETRYCAVCNdYAsgyhyGVwSCegCkafFkrSiqGHNDyMCPATNQCTIDKNRrkSCqACrLRKCYEVGMMk;TRYCAVCNdYAsgyhyGVwSCegCkafFkrSiqGHnDyMCPATNQCTIDkNRrkSCqACrLRKCYEVGMMk	C;D	CcaggtCACAgtgacCTG;CcaggtCACTgtgacCTG	97	596	243	66;0;177;0	10;0;9;0;2;0;1;0;13;0;8;0;0;0;0;2;0;21;25;152
1HCQ	1hcq_2_1	8221895	2.4	HOMO SAPIENS	2	1	1	2	0	0	1	Transcription factor	Zinc Coordinating	Hormone Nuclear Receptor, Estrogen Receptor	2	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	E;F	MKETRYCAVCNdYAsgyhyGVWScegCkafFkrSiQGHNDyMCPATNQCTIDkNRRKsCqACrLRKCYEVGMMk;KETRYCAVCNdYAsgyhyGVWSCegCkafFkrSiQGDyMCPATNQCTIDkNRRKsCqACrLRKCYEVGMMk	G;H	CcaggtCACAgtgacCTG;CcaggtCACTgtgacCTG	97	595	205	63;0;142;0	10;0;7;0;2;0;1;0;8;3;9;0;0;0;0;1;0;17;20;127
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1HWT	1hwt_2_1	9886294	2.5	SACCHAROMYCES CEREVISIAE	2	1	1	2	0	0	1	Transcription factor	Zinc Coordinating	Heme Activator Protein	2	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	G;H	rIplsCTICrKrkvkcDkLRPHCQQCTktGVAHLCHYmEQTwAEEAEKELLKDNELKKLRERVKSLEKTL;krnriplsCTICrkrkvkcDkLRPHCQQCTKTGVAHLCHYMEqtwAEEAEKELLKDNELKKLRERVKSLEKTL	E;F	gcgcTATtatcgcTATTagC;GCTAAtagcgataatagcgC	57	116	269	56;17;196;0	5;0;8;0;0;0;6;0;10;4;13;0;0;0;0;0;4;13;43;163
1IPP	1ipp_1_1	9665136	2.2	PHYSARUM POLYCEPHALUM	1	1	0	1	0	0	1	Enzyme	Endonuclease	Endonuclease I-PpoI	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	ALTNAQILAVIDSWEETVGQFPVITHHVPLGGGLQGTLHCYEIPLAapyGvgfaknGPtrWqYkrtINqVvHrwgShtVPFLLEPDNINGktctaShLChNtRCHNPLHLCwESldDnkGRnWCPGPNGGCVHAVVCLRQGplYGPGATVAGPQQRGSHFVV;ALTNAQILAVIDSWEETVGQFPVITHHVPLGGGLQGTLHCYEIPLAapyGvgfakngPtrWqYkrtiNqVvHrwgShtVPFLLEPDNINGktctaShLChNtRCHNPLHLCwESldDnkGRnWCPGPNGGCVHAVVCLRQGplYGPGATVAGPQQRGSHFVV	C;D	ttgactcTCttaagagagTCA;ttgactcTCttaagagagTCA	29	7	400	120;21;259;0	14;0;7;0;6;0;5;0;12;9;18;0;0;0;0;2;8;20;49;250
1J59	1j59_1_1	8757802	2.5	ESCHERICHIA COLI	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Catabolite Gene Activator Protein	1	1	1	0	1, 1	0	2	0	0	0	2	1	2	1	A;B	PTLEWFLSHCHIHKYPSkSTLIHQGEKAETLYYIVKGSVAVLIKDEEGkEMILSYLNQGDFIGELGLFEEGQERSAWVRAKTACEVAEISYKKFRQLIQVNPDILMRLSAQMARRLQVTSEKVGNLAFLdvtGrIAQTLLNLAKQPDAMTHPDGMQIkItrqEIGQIVgcsretVgriLkMLEDQNLISAhgKTIVVYG;PTLEWFLSHCHIHKYPsKSTLIHQGEKAETLYYIVKGSVAVLIKDEEGkEMILSYLNQGDFIGELGLFEEGQERSAWVRAKTACEVAEISYKKFRQLIQVNPDILMRLSAQMARRLQVTSEKVGNLAFLdvtGrIAQTLLNLAKQPDAMTHPDGMQIkItrqeIGQIVGcsretVgriLkMLEDQNLISAhgKTIVV	C;D;E;F	GCGAAAagtgtgaC;ATatgtcacACTtttcG;GCGAAAAgtgtgaC;ATatgtcaCACTtttcG	62	583	274	70;0;204;0	6;0;12;0;4;0;0;0;7;15;11;0;0;0;0;6;0;18;31;164
1JE8	1je8_1_1	12352954	2.12	ESCHERICHIA COLI	2	1	1	2	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Response Regulator Protein NARL	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	RDVNQLtprERDILKLIAQGLpnkIARRLDitestVkvhvkhlkKKlksrvEAAVWVHQERIF;RDVNQLtprERDILKLIAQGLpnkIARRLDitestVkvhvkhlkKKlksrvEAAVWVHQERIF	C;D	cgtaccCATTaatgggtACG;cgtaccCATTaatgggtACG	32	6	311	84;0;227;0	7;0;6;0;0;0;2;0;6;17;11;0;0;0;0;0;4;17;49;192
1JE8	1je8_2_1	12352954	2.12	ESCHERICHIA COLI	2	1	1	2	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Response Regulator Protein NARL	2	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	E;F	ERDVNQLtprERDILKLIAQGLpnkIARRLDitestVkvhvkhlkKKlksrvEAAVWVHQERIF;RDVNQLtprERDILKLIAQGLpnkIARRLDitestVkvhvkhlkKKlksrvEAAVWVHQERIF	G;H	cgtacCCATTaatgggtACG;cgtaccCATTaatgggtACG	32	6	309	84;0;225;0	8;0;6;0;0;0;2;0;6;17;11;0;0;0;0;0;4;15;51;189
1JJ4	1jj4_1_1	10906136	2.4	HUMAN PAPILLOMAVIRUS TYPE 18	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Alpha|Beta	Regulatory Protein E2	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	MTPIIHLKGdrnsLkcLryrLrKHSDHYRDISstWhWtKTGILTVTYHSETQRTKFLNTVaIpdsVQILVGYMT;HMTPIIHLKGdrnsLkcLryrLrkHSDHYRDISstWhWtEKTGILTVTYHSETQRTKFLNTVAIpDsVQILVGYMT	C;D	caacCGAAttcggtTG;caacCGAAttcggtTG	190	579	212	74;0;138;0	7;0;4;0;2;0;1;0;4;9;2;0;1;2;0;2;0;22;45;111
1L3L	1l3l_1_1	12087407	1.66	AGROBACTERIUM TUMEFACIENS	2	1	1	2	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	TraR Activator	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;C	QHWLDKLTDLAAIEGDECILKTGLADIADHFGFTGYAYLHIQHRHITAVTNYHRQWQSTYFDKKFEALDPVVKRARSRKHIFTWSGEHERPTLSKDERAFYDHASDFGIRSGITIPIKTANGFSFTASDKPVIDLDREIDAVAAAATIGQIHARISFLRTTPTAEDAAwLDPkEATYLRWiAVGKteeIADVEGVkynsVrvkLreAKRFDvrskAHLTALAIRRKLI;QHWLDKLTDLAAIEGDECILKTGLADIADHFGFTGYAYLHIQHRHITAVTNYHRQWQSTYFDKKFEALDPVVKRARSRKHIFTWSGEHERPTLSKDERAFYDHASDFGIRSGITIPIKTANGFSFTASDKPVIDLDREIDAVAAAATIGQIHARISFLAWLDPKEATYLRWiAVGKteEIADVEGVkynsVrvkLreAKRFDvrskAHLTALAIRRKLI	F;H	GAtgtgcAGAtctgcaCATC;GatgtgcAGAtctgcaCATC	77	108	203	73;0;130;0	5;0;15;0;0;0;0;0;6;6;4;0;0;0;0;2;0;17;25;123
1L3L	1l3l_2_1	12087407	1.66	AGROBACTERIUM TUMEFACIENS	2	1	1	2	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	TraR Activator	2	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	B;D	QHWLDKLTDLAAIEGDECILKTGLADIADHFGFTGYAYLHIQHRHITAVTNYHRQWQSTYFDKKFEALDPVVKRARSRKHIFTWSGEHERPTLSKDERAFYDHASDFGIRSGITIPIKTANGFSFTASDKPVIDLDREIDAVAAAATIGQIHARISFLRTTPTAEDAAwLDPkEATYLRWiAVGKteeIADVEGVkynsVrvkLreAKRFDvrskAHLTALAIRRKLI;QHWLDKLTDLAAIEGDECILKTGLADIADHFGFTGYAYLHIQHRHITAVTNYHRQWQSTYFDKKFEALDPVVKRARSRKHIFTWSGEHERPTLSKDERAFYDHASDFGIRSGITIPIKTANGFSFTASDKPVIDLDREIDAVAAAATIGQIHARISFLAWLDPKEATYLRWiAVGKteeIADVEGVkynsVrvkLreAKRFDvrskAHLTALAIRRKLI	E;G	GAtgtgcAGAtctgcaCATC;GatgtgcAGAtctgcaCATC	77	108	202	74;0;128;0	5;0;15;0;0;0;0;0;4;6;4;0;0;0;0;2;0;18;27;121
1LE8	1le8_1_1	12121651	2.3	SACCHAROMYCES CEREVISIAE	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Homeodamain, Mat Alpha 2	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	2	2	1	A;B	KSsiSPQArAFLEQVFRRKQslNsKEkEEVAKKCGITPlqVrvwFinKrmrSk;rghrfTKENvRILeSWFAKNIENPylDTKGLENLMKNTSLSriqIknwVaaRrakEktiTIAPELADLLSGEPL	C;D	acatgTAaaaatttacatCA;TtgatGtAAATTtttacaTG	121;123	553	271	61;14;196;0	5;0;7;0;2;0;1;0;11;3;4;0;0;0;0;1;1;18;41;177
1LLI	1lli_1_1	8278404	2.1	BACTERIOPHAGE LAMBDA	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Lambda Repressor	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	kkPlTQEQLEDARRLkAIyeKKkNELGLsqeSLADKLgmgqsgIgAlFnGinaLnAYnAALLAKILKVSVEEFSPSIAREIYEMYEAVS;stkkkPLTQEqLEDARRLkAIyeKKkNELGLsqeSLADKLgmgqsgIgalfnGinalnAYnAALLAKILKVSVEEFSPSIAREIYEMYEAVS	D;E	AataccACTggcggtgaTAT;TatatcaccgccagtggTAT	53	552	313	114;0;197;2	10;2;3;3;4;2;5;2;22;5;13;0;0;0;0;4;4;11;43;180
1LMB	1lmb_1_1	1387915	1.8	BACTERIOPHAGE LAMBDA	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Lambda Repressor	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	3;4	PlTQEQLEDARRLkAIyeKKkNELGLsqeSVADKMgmgqsgVgalFnGinaLnAYnAALLAKILKVSVEEFSPSIAREIYEMYEAVS;StkkkPLTQEQLEDARRLkAIyeKKkNELGLsqeSVADKMgmgqsgVgalfnGinalnAYnAALLAKILKVSVEEFSPSIAREIYEMYEAVS	1;2	AataccACTggcggtgaTAT;TatatcaccgCCagtggTAT	53	550	275	103;0;172;0	8;2;5;3;3;0;3;0;20;2;9;0;0;0;0;5;2;12;35;166
1LQ1	1lq1_1_1	12176382	2.3	BACILLUS SUBTILIS	2	1	1	2	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Initiation Factor Spo0A	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	KKNLDASITSIIHEIGVpAhikgYLyLREAISMVYNDIELlgsitkVLyPDIAKKFNttAsrVeraIrhAIEvAWSrGNIDSISSLFAkptnsEFIAMVADKLRLEH;NLDASITSIIHEIGVpAhikgYLYLREAISMVYNDIELLGSITKVLYPDIAKKFNTTASrVEraIRhAIEvAWSrGNIDSISSLFAKPTNSEFIAMVADKLRL	G;H	TTcgtgtcGAATtttg;acAAAattcgaCACGA	88	549	248	62;0;186;0	1;0;6;0;3;0;0;0;0;8;11;0;0;0;0;5;1;12;51;150
1LQ1	1lq1_2_1	12176382	2.3	BACILLUS SUBTILIS	2	1	1	2	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Initiation Factor Spo0A	2	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	C;D	KNLDASITSIIHEIGVpAhikgYLyLREAISMVYNDIELLGSITKVLYPDIAKKFNTTASrVEraIRhAIEvAWSrGNIDSISSLFGYTKAKPTNSEFIAMVADKLRLEHKA;KNLDASITSIIHEIGVpAhikgYLyLREAISMVYNDIELlgsitkVLyPDIAKKFNttAsrVeraIrhAIEvAWSrGNIDSISSLFKAkptnsEFIAMVADKLRLEH	E;F	TTcgtgtcGAATtttg;ACAAAattcgaCACGA	88	548	240	70;0;170;0	2;0;6;0;2;0;1;0;2;8;11;0;0;0;0;6;1;14;50;137
1M5X	1m5x_1_1	12758074	2.25	MONOMASTIX SP.	1	1	0	1	0	0	1	Enzyme	Endonuclease	Endonuclease I-MsoI	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	TLQPTEAAYIAGFLDgdgsIyakliprPdykDIKYqVslAIsFiqrKDkFPYLQDIYDQLGKRgnlrKdrGdGiAdYtIigsthLSIILPDLVPYLRIkKKQANRILHIINLyPQAqkNPSKFLDLVKIVDDvqNLnkrADeLKSTnYDRLLEEFLKAGKI;TLQPTEAAYIAGFLDgdgsIyakliprPdykDIKYqVslAIsFiqrKDkFPYLQDIYDQLGKRgnlrKdrgdGiAdYtIigsthLSIILPDLVPYLRIkKKQANRILHIINLyPQAqkNPSKFLDLVKIVDDvqNLnkrADeLKSTnYDrLLEEFLKAGKI	C;D	gcagaacgtcgtgagacagtTCCG;cggaactgtcTcacgacgttcTGC	82	540	603	203;0;400;0	14;6;18;1;14;0;0;0;21;10;14;0;0;0;0;7;6;32;114;346
1MA7	1ma7_1_1	12779336	2.3	BACTERIOPHAGE P1	1	1	1	1	1	0	1	Enzyme	Recombinase	Cre Recombinase	1	1	1	0	0, 0	0	0	1	0	0	2	1	2	1	A;B	TSDEVRKNLMDMFRDRQafsEhtWkmLLsVCrsWAAWCKLNNRKWFPAEPEDVRDYLLYLQArglaVktIqqhLgqLnmLHrrSGLPrPSDSNAVSLVMRRIRKENVDAGERakqALAFERTDFDQVRSLMENSDrCqDIrNLAFLGIAYNTLLriaEIArIRVKDISRTDGGRMLIHIGrtktLvsTAGVEKALSLGVTKLVERWISVSGVADDPNNYLFCrvrknGVAAPSATsqlstraLeGIFeATHRLIYGAKDDSgqryLawsghSARVGAARDMARAGVSIPEIMQAGgwtnVNiVMNyIRNLDSETGAMVRLLED;SDEVRKNLMDMFRDRQafsehtWkmLLsVCrsWAAWCKLNNRKWFPAEPEDVRDYLLYLQArglaVktIqqhLgqLnmLHrrSGLPrPsDSNAVsLVmrRIrkENVDAGerakqaLAFERTDFDQVRSLMENSDrCqDIrNLAFLGIAYNTLLriaeIArIRVKDISRTDGGRMLIHIGrtktLVSTAGVEKALSLGVTKLVERWISVSGVADDPNNYLFCrvrknGVAAPSATsqlstraLeGIFeATHRLIYGAkDDSgQryLawsghSArVGAARDMARAGVSIPEIMQAGGwtnVniVMnyIRNGAMVRLLED	C;D	ataacttagtataatgtgctatactaAGttat;ataacttagtatagcatacattatactaAGttat	15	539	969	201;44;724;0	19;0;21;0;6;1;3;0;52;41;33;0;0;0;2;16;8;54;167;546
1MJ2	1mj2_1_1	10986458	2.4	ESCHERICHIA COLI	1	2	0	1	0	0	1	Transcription factor	Ribbon|Helix|Helix	Methionine Repressor	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	AEWSGEYISPYAEhgKksEQvKkitVsIPLKVlKILTDErTRRkVNNlrhatnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY;AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVLKILTDErTRRkVNNLRHAtnsELLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY	F;G	ttagacgTCTAGacgTCTA;TTAGACGTctagacGTCTA	17	536	183	33;1;149;0	4;2;2;0;3;0;0;0;7;9;17;0;0;0;0;1;2;14;15;107
1MJ2	1mj2_1_2	10986458	2.4	ESCHERICHIA COLI	1	2	0	1	0	0	1	Transcription factor	Ribbon|Helix|Helix	Methionine Repressor	1	2	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	C;D	AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVlKILTDErTRRkVNnlrhatnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKeRSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY;AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVLKILTDErTRRKVNNLRHAtnsELLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY	F;G	TTAGACGTCtagacgTCTA;ttagacgtCTAGacgTCTA	17	535	193	33;1;159;0	4;2;2;0;4;0;0;0;3;9;17;0;0;0;0;0;2;14;23;113
1MJM	1mjm_1_1	10986458	2.2	ESCHERICHIA COLI	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Ribbon|Helix|Helix	Methionine Repressor	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	AEWSGEYISPYaeHGKKSeQvkkitVsIPLKVLKILTDErTRRKVNNLRHAtnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY;AEWSGEYISPYaeHgKKsEQvKkitVsIPLKVLKILTDErTRRKVNNLRHAtnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY	C;D	gagacGtCTC;gagacgTCTC	17	534	127	32;0;95;0	4;2;2;0;4;0;0;0;5;7;7;0;0;0;0;1;2;8;10;75
1MJO	1mjo_1_1	10986458	2.1	ESCHERICHIA COLI	1	2	0	1	0	0	1	Transcription factor	Ribbon|Helix|Helix	Methionine Repressor	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVLKILTDErTRRkVNNlrhatnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY;AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVLKILTDErTRRkVNNLRHAtnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY	F;G	ttagacgtCATGacgTCTA;TTAGACGTcatgacgTCTA	17	107	195	33;1;161;0	3;2;1;0;4;0;0;0;5;8;18;0;0;0;0;1;2;16;21;114
1MJO	1mjo_1_2	10986458	2.1	ESCHERICHIA COLI	1	2	0	1	0	0	1	Transcription factor	Ribbon|Helix|Helix	Methionine Repressor	1	2	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	C;D	AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVLKILTDErTRRkVNnlrhatnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY;AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVLKILTDErTRRKVNNLRHAtnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY	F;G	TTAGACGTcatgacgTCTA;ttagacgTCATGacgTCTA	17	107	194	39;0;155;0	3;2;2;0;4;0;0;0;5;8;18;0;0;0;0;1;2;13;23;113
1MJQ	1mjq_1_1	10986458	2.4	ESCHERICHIA COLI	2	2	1	2	0	0	1	Transcription factor	Ribbon|Helix|Helix	Methionine Repressor	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVlKILTDErTRRkVNnlrhatnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY;AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVLKILTDErTRRKVNNLRHAtnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY	E;F	ttagataTCTAGataTCTA;TTAGATATctagataTCTA	17	106	193	44;0;149;0	4;2;2;3;2;0;0;0;6;9;18;0;0;0;0;2;2;13;23;107
1MJQ	1mjq_1_2	10986458	2.4	ESCHERICHIA COLI	2	2	1	2	0	0	1	Transcription factor	Ribbon|Helix|Helix	Methionine Repressor	1	2	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	C;D	AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVlKILTDErTRRkVNnlrhatnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKeRSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY;AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVLKILTDErTRRkVNNLRHAtnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY	E;F	TTAGATATctagataTCTA;ttagatATCTAGataTCTA	17	106	198	46;1;151;0	4;3;2;3;2;0;0;0;4;8;18;0;0;0;0;2;2;16;26;108
1MJQ	1mjq_2_1	10986458	2.4	ESCHERICHIA COLI	2	2	1	2	0	0	1	Transcription factor	Ribbon|Helix|Helix	Methionine Repressor	2	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	G;H	AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVlKILtDErTRRkVNnlrhatnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY;AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVLKILTDErTRRKVNNLRHAtnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY	K;L	ttagatatCTAGataTCTA;TTAGATATctagataTCTA	17	105	186	46;0;140;0	4;2;2;3;2;0;1;0;7;9;18;0;0;0;0;2;2;14;25;95
1MJQ	1mjq_2_2	10986458	2.4	ESCHERICHIA COLI	2	2	1	2	0	0	1	Transcription factor	Ribbon|Helix|Helix	Methionine Repressor	2	2	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	I;J	AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVlKILTDErTRRkVNnlrhatnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKeRSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY;AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVlKILTDErTRRkVNNLRHAtnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY	K;L	TTAGATATctagataTCTA;ttagataTCTAGataTCTA	17	105	206	47;1;158;0	4;3;2;3;2;0;0;0;8;7;18;0;0;0;0;2;2;16;22;117
1MNM	1mnm_1_1	9490409	2.25	SACCHAROMYCES CEREVISIAE	1	3	0	1	0	0	1	Transcription factor	Alpha|Beta	Transcriptional Regulator, MCM1	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	QkerrkiEiKFIENktrRhvtFskrKHgIMkkAFeLSVlTGTQVLLLVVSETGLVYTFSTPKFEPIVTQQEGRNLIQACLNAPDD;rrkiEIKFIENkTrRhvtfskrkhgIMkkAFeLSVlTGTQVLLLVVSEtGlVyTFSTPKFEPIVTQQEGRNLIQACLNAPD	E;F	gattacctaatagggaaATTTACACG;CCGTGTAaatttCCCTattaggtAAT	182	533	304	51;11;241;1	4;0;7;0;0;0;0;0;9;9;6;0;0;0;0;1;3;22;51;192
1N3E	1n3e_1_1	12758074	2.5	CHLAMYDOMONAS REINHARDTII	2	1	1	2	0	0	1	Enzyme	Endonuclease	Endonuclease I-CreI	1	1	1	0	0, 0	0	2	0	0	0	2	1	2	1	A;B	TKYNKEFLLYLAGFVDgdgsIiaqikpnQsykFKHqlslTFqVtqkTQrRWFLDKLVDEIGVgyVrdrGsvSDYiLseiKPLHNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKIIEQlPSAkESPDKFLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAVLD;TKYNKEFLLYLAGFVdgdgsiiaqikpnQsykFKHqlsltFqVtqkTQrRWFLDKLVDEIGVgyVrdrGsvSDYilseiKPLHNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKIIEQlPSAkESPDKFLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAVLD	C;D;E;F	cgaaaacgtcgtac;gacgttttCG;cgaaaacgtcgtac;gacgttttCG	4	101	647	167;19;461;0	10;9;13;5;5;0;2;0;11;19;24;0;0;0;0;6;3;24;111;405
1N3E	1n3e_2_1	12758074	2.5	CHLAMYDOMONAS REINHARDTII	2	1	1	2	0	0	1	Enzyme	Endonuclease	Endonuclease I-CreI	2	1	1	0	0, 0	0	2	0	0	0	2	1	2	1	G;H	TKYNKEFLLYLAGFVDgdgsIiaqikpnQsykFKhqlsltFqVtqkTQrRWFLDKLVDEIGVgyVrdrGsvSDYiLseiKPLHNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKIIEQlPSAkESPDKFLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAVLD;TKYNKEFLLYLAGFVDgdgsiiaqikpnQsykFKHqlsltFqVtqkTQrRWFLDKLVDEIGVgyVrdrGsvSDYiLseiKPLHNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKIIEQlPSAkESPDKFLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAVLD	I;J;K;L	cgaaaacgtcgtac;gacgtttTCG;cgaaaacgtcgtac;gacgttttCG	4	101	627	168;18;441;0	13;8;13;4;8;1;2;0;15;15;24;0;0;0;0;3;2;23;115;381
1N3F	1n3f_1_1	12758074	2	CHLAMYDOMONAS REINHARDTII	2	1	1	2	0	0	1	Enzyme	Endonuclease	Endonuclease I-CreI	1	1	1	0	0, 0	0	2	0	0	0	2	1	2	1	A;B	TKYNKEFLLYLAGFVDgdgsIiaqikpnQsykFKHqlsLtFqVtqkTQrRWFLDKLVDEIGVgyVrdrGsvSDYiLseiKPLHNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKIIEQlPSAkESPDKFLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAV;TKYNKEFLLYLAGFVdgdgsIiaqikpnQsykFKHqlsLtFqVtqkTQrRWFLDKLVDEIGVgyVrdrGsvSDYiLseikpLHNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKIIEQlPSAkESPDKFLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAV	C;D;E;F	cgaaactgtctcga;gacagtttCG;cgaaactgtctcga;gacagttTCG	4	11	662	192;16;454;0	20;8;17;7;15;0;0;0;18;12;24;0;0;0;0;4;2;32;117;386
1N3F	1n3f_2_1	12758074	2	CHLAMYDOMONAS REINHARDTII	2	1	1	2	0	0	1	Enzyme	Endonuclease	Endonuclease I-CreI	2	1	1	0	0, 0	0	2	0	0	0	2	1	2	1	G;H	TKYNKEFLLYLAGFVdgdgsIiaqikpnqsykFkHqlsLtFqVtqkTQrRWFLDKLVDEIGVgyVrdrGsvSDYiLseiKPLHNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKIIEQlPSAkESPDKFLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAV;TKYNKEFLLYLAGFVdgdgsIiaqikpnQsykFKHqlsLtFqVtqkTQrRWFLDKLVDEIGVgyVrdrGsvSDYiLseikpLHNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKIIEQlPSAkESPDKFLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAV	I;J;K;L	cgaaactgtctcga;gacagtttCG;cgaaactgtctcga;gacagtttCG	4	11	659	190;14;455;0	19;10;17;8;13;0;0;0;18;11;26;0;0;0;0;4;2;28;122;381
1OE4	1oe4_1_1	12820976	2	XENOPUS LAEVIS	1	1	0	1	0	0	1	Enzyme	Glycosylase	Uracil DNA Glycosylase	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	1	1	2	1	2	1	A;B	ESPADSFLKVELELNLKLSNLVFQDPVQYVYNPLVYAWAPHENYVQTYCKSKKEVLFLGmNPGPFGMAQTGVPFGEVNHVRDWLQIEGPVSKPEVEHPKRRIRGFECPQSEVSGARFWSLFKSLCGQPETFFKHCFVHNHCPLIFMNHSGKNLtPtdLPkAQrDTLLEICDEALCQAVRVLGVKLVIGVgrfSEqRARKALMAEGIDVTVKGIMhPsPrnpqANKGWEGIVRGQLLELGVLSLLT;ESPADSFLKVELELNLKLSNLVFQDPVQYVYNPLVYAWAPHENYVQTYCKSKKEVLFLGMNPGPfGMAQTGVPFGEVNHVRDWLQIEGPVSKPEVEHPkrRIRGFECPqsEvSGArFWSLFKSLCGQPETFFKHCFVHNHCPLIFMnhsGkNLTPTDLPKAQRDTLLEICDEALCQAVRVLGVKLVIGVGRFSEQRARKALMAEGIDVTVKGIMHPSprNPQAnKGWEGIVRGQLLELGVLSLLT	E;F	cccGTGAgtccg;CGGACtacGGg	75	506	135	25;14;93;3	1;0;1;0;0;0;0;0;9;2;6;0;0;0;0;1;1;7;22;85
1OE5	1oe5_1_1	12820976	2.3	XENOPUS LAEVIS	1	1	0	1	0	0	1	Enzyme	Glycosylase	Uracil DNA Glycosylase	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	1	1	2	1	2	1	A;B	SPADSFLKVELELNLKLSNLVFQDPVQYVYNPLVYAWAPHENYVQTYCKSKKEVLFLGmNPGPFGMAQTGVPFGEVNHVRDWLQIEGPVSKPEVEHPKRRIRGFECPQSEVSGARFWSLFKSLCGQPETFFKHCFVHNHCPLIFMNHSGKNLtPtdLPkAQrDTLLEICDEALCQAVRVLGVKLVIGVgrfSEqRARKALMAEGIDVTVKGIMhPsPrnpqANKGWEGIVRGQLLELGVLSLLT;ESPADSFLKVELELNLKLSNLVFQDPVQYVYNPLVYAWAPHENYVQTYCKSKKEVLFLGMNPGPFGMAQTGVPFGEVNHVRDWLQIEGPVSKPEVEHPkrRIRGFECPQSEvSGArFWSLFKSLCGQPETFFKHCFVHNHCPLIFMnhsGkNLTPTDLPKAQRDTLLEICDEALCQAVRVLGVKLVIGVGRFSEQRARKALMAEGIDVTVKGIMHPSprNPQAnKGWEGIVRGQLLELGVLSLLT	E;F	cccGTGAgtccg;CGGACtacGGg	75	505	131	26;16;85;4	1;0;1;0;1;0;0;0;7;3;7;0;0;0;0;3;1;4;23;80
1PER	1per_1_1	8081737	2.5	BACTERIOPHAGE 434	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	434 Repressor	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	L;R	SISSRVkSKrIQLGLnqaELAQKVGttqqsIeqLEnGktkrprfLPELASALGVSVDWLLNGT;SISSRVkSKrIQLGLnqaELAQKVgttqqsIeqLEnGktkrprfLPELASALGVSVDWLLNGT	A;B	AAgtacaGTTTttcttgtAT;TatacaAGAaaaactgtACT	60	489	291	98;5;188;0	7;0;8;0;4;0;1;0;22;14;12;0;0;0;0;15;2;15;22;169
1R4O	1r4o_1_1	1865905	2.5	RATTUS NORVEGICUS	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Zinc Coordinating	Hormone Nuclear Receptor, Glucocorticoid Receptor	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	MKPARPCLVCSdEAsgchyGVLTCgsCkvfFkrAVEGqhnyLCAGRNDCIIDkIRrkNCpACrYRKCLQAGMNlEarktk;MKPARPCLVCSdEAsgchyGVLTCgsCkvfFkrAVeGQHNyLCAGRNDCIIDkIRrkNCpACrYRKCLQAGMNlEarkTK	C;D	ccagaaCATcgatgtTCTG;CcagaACATCGatgttCTG	56	469	280	40;4;236;0	4;0;2;0;0;0;0;0;8;5;10;0;0;0;0;0;2;20;48;181
1RIO	1rio_1_1	14731393	2.3	BACTERIOPHAGE LAMBDA, THERMUS AQUATICUS	1	2	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Repressor Protein CI	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	stkkkPLTQEqLEDARRLkAIyeKKkNELglsqeSVADKggqsgVgalfnGinaLnAYnAALLAKILKVSVEEFSPSIAREIYEYEAVHHHHHH;stkkkPlTQEQLEDARRLkAIyeKKkNELGLsqeSVADKggqsgVgalFnGinaLnAYnAALLAKILKVSVEEFSPSIAREIYEYEAVHHHHH	T;U	CCATGTcaagcactggcggtgATACCG;CGgtatcaccgccagtgcTTGACATGG	53	466	284	110;0;173;1	10;2;5;1;4;0;4;0;20;3;15;0;0;0;0;4;4;14;37;161
1RPE	1rpe_1_1	8355273	2.5	BACTERIOPHAGE 434	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	434 Repressor	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	L;R	SISSRVkSKrIQLGLnqaELAQKVGttqqsIeqLEnGktkrprfLPELASALGVSVDWLLNGT;SISSRVkSKrIQLGLnqaELAQKVgttqqsIeqLEnGktkrprfLPELASALGVSVDWLLNGT	A;B	ACaaacaagATacattgtAT;TatacaaTGTatcttgtTTG	60	463	290	90;5;195;0	10;0;10;0;5;0;0;0;18;12;12;0;0;0;0;11;1;11;30;170
1T3N	1t3n_1_1	15254543	2.3	HOMO SAPIENS	1	1	0	1	0	0	1	Enzyme	Polymerase	DNA Polymerase Iota	1	1	1	0	1, 0	0	0	0	0	1	2	1	2	1	A;B	SRVIVHVDLDCFYAQVEMISNPELKDKPLGVQQKYLVVTCNYEARKLGVKKLMNVRDAKEKCPQLVLVNGEDlTRYrEMSyKVTELLEEFSPVVerlgfDeNFVDLTEMVEKRLQQLQSDELSAVTVSGHVYNNQSINLLDVLHIRLLVGSQIAAEMREAMYNQLGLTGCAGVASNKLLAkLVSGVFKPNQQTVLLPESCQHLIHSLNHIKEipgigyktAKCLEALGINSVRDLQTFSPKILEKELGIsVAQrIQKLSFGEDNSPViLsGppqsfseeDSFKKCSSEVEAKNKIEELLASLLNrVCQDGRKPHtVrLIIRRYSSEKHyGresrqcpIPSHVIQKLGTGNYDVMTPMVDILMKLFRNmVNVKMPFHLTLLSVCFCnLk;SRVIVHVDLDCFyAQVEMISNPELKDKPLGVQqkYlVvTCNYEARKLGVKKLMNVRDAKEKCPQLVLVNGeDlTRYrEMSyKVTELLEEFSPVVErlgfDeNFVDLTEMVEKRLQQLQSDELSAVTVSGHVYNNQSINLLDVLHIRLLVGSQIAAEMREAMYNQLGLTGCAGVASNKLLAkLVSGVFKPNQQTVLLPESCQHLIHSLNHIKEIPgigyktAKCLEALGINSVRDLQTFSPKILEKELGISvAQRIQKLSFGEDNSPVilSGPpqsfseeDsFkKCSSEVEAKNKIEELLASLLNrVCQDGRKPhtVrLiIrRYSSEkhygresrqcpIPSHVIQKLGTGNYDVMTPMVDILMKLFRNMVNVKMPFHLTlLSVcFCnLK	P;T	gggggaaggacc;agggtccttccccc	36	430	413	47;26;340;0	4;1;7;0;0;0;0;2;17;13;42;0;0;0;0;2;0;15;37;273
1T9I	1t9i_1_1	15518550	1.6	CHLAMYDOMONAS REINHARDTII	1	1	0	1	0	0	1	Enzyme	Endonuclease	Endonuclease I-CreI	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	NTKYNKEFLLYLAGFVDgngsIiaqikpnQsykFKHqlsLtFqVtqkTQrRWFLDKLVDEIGVgyVrdrGsvSDYiLseiKPLHNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKIIEQlPSAkESPDKFLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAVLDS;NTKYNKEFLLYLAGFVDgngsIiaqikpnQsykfKHqlSLtFqVtqkTQrRWFLDKLVDEIGVgyVrdrGsvSDYiLseikPLHNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKIIEQlPSAkESPDKfLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAVLDSLS	C;D	gcaaaacgtcgtgagacagtttCG;cgaaactgtctcacgacgtttTGC	4	428	661	185;19;457;0	14;8;19;5;12;0;0;0;21;9;31;0;0;0;0;3;3;13;112;411
1T9J	1t9j_1_1	15518550	2	CHLAMYDOMONAS REINHARDTII	1	1	0	1	0	0	1	Enzyme	Endonuclease	Endonuclease I-CreI	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	TKYNKEFLLYLAGFVDgdgsiiaqikpnQsykFKHqlsLtFqVtekTQrRWFLDKLVDEIGVgyVrdrGsvSDYiLseiKPLHNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKIIEQlPSAkESPDKFLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAVLD;TKYNKEFLLYLAGFVDgdgsiiaqikpnQsykfKHqlSLtFqVtekTQrRWFLDKLVDEIGVgyVrdrGsvSDYiLseiKPLHNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKIIEQlPSAkESPDKFLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAVLD	C;D	gcaaaacgtcgtgagacagttTCG;cgaaactgtctcacgacgtttTGC	4	11	651	185;15;451;0	16;9;17;3;9;0;0;0;12;10;24;0;0;0;0;4;4;32;121;390
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1TRO	1tro_2_1	3419502	1.9	ESCHERICHIA COLI	2	1	1	2	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Trp Repressor	2	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	E;G	AEERHQEWLRFVDLLKNAYQNDLHLPLLNLMLtPdeREaLGtrVRIVEELLRGEmsqrELkNElgagiatItrGsnSLkAAPVELRQWLEEVLLKSD;SPYSAAMAEErHQEWLRFVDLLKNAYQNDLHLPLLNLMLtPdeREaLGtrVRIVEELLRGEmsqrELkNElgagiatItrGsnSLkAAPVELRQWLEEVLL	K;L	tgtactAGTTaactagtaC;tgtacTAGTTaactagtaC	31	85	261	86;0;175;0	4;2;7;0;2;3;0;2;13;13;6;0;0;0;0;6;2;22;24;155
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1TRR	1trr_1_2	8232559	2.4	ESCHERICHIA COLI	2	2	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Trp Repressor	1	2	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	G;H	aqqsPySAAMAEQrHEEWLRFVDLLKNAYQNDLHLPLLNLMLtPdeREaLGtrVRIVEELLRGEmsqreLkNELgagiatItrGsnSLkAAPVELRQWLEEVLLK;aqqsPySAAMAEQrHEEWLRFVDLLKNAYQNDLHLPLLNLMLtpdeREaLGtrVRIVEELLRGEMSQRELKNELgagIatITrGSNSLKAAPVELRQWLEEVLLK	C;I	AGcgtacTAGtacgct;AGcgtactagtACGCT	31	21	282	49;8;225;0	3;1;2;0;0;3;1;1;17;15;6;0;0;0;0;3;0;17;37;176
1TRR	1trr_2_1	8232559	2.4	ESCHERICHIA COLI	2	2	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Trp Repressor	2	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	D;E	aqqsPySAAMAEQrHEEWLRFVDLLKNAYQNDLHLPLLNLMLtPdeREaLGtrVRIVEELLRgEmsqreLkNELgagiatItrGsnSLkAAPVELRQWLEEVLLK;aqqsPySAAMAEQrHEEWLRFVDLLKNAYQNDLHLPLLNLMLtpdeREaLGtrVRIVEELLRGEMSQRELKNELgagIatITrGSNSLKAAPVELRQWLEEVLLK	F;L	AGcgtactagtACGCT;AGcgtacTAGtacgct	31	21	284	52;8;224;0	3;1;3;0;0;3;1;1;17;14;6;0;0;0;0;3;1;17;41;173
1TRR	1trr_2_2	8232559	2.4	ESCHERICHIA COLI	2	2	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Trp Repressor	2	2	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	J;K	aqqsPySAAMAEQrHEEWLRFVDLLKNAYQNDLHLPLLNLMLtPdeREaLGtrVRIVEELLRGEmsqreLkNELgagiatItrGsnSLkAAPVELRQWLEEVLLK;aqqsPySAAMAEQrHEEWLRFVDLLKNAYQNDLHLPLLNLMLtpdeREaLGtrVRIVEELLRGEMSQRELKNELgagIatITrGSNSLKAAPVELRQWLEEVLLK	F;L	AGcgtacTAGtacgct;AGcgtactagtACGCT	31	21	289	50;10;229;0	3;1;2;0;0;3;1;1;17;14;7;0;0;0;0;3;0;17;41;179
1U0C	1u0c_1_1	15313605	2.5	CHLAMYDOMONAS REINHARDTII	1	1	0	1	0	0	1	Enzyme	Endonuclease	Endonuclease I-CreI 	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	NTKYNKEFLLYLAGFVDgdgsiiaqikpnQsckFKhqlsltFqVtekTQrRWFLDKLVDEIGVgyVrdrGsvSDYiLseiKPLHNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKIIEQlpSAkESPDKFLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAVLD;NTKYNKEFLLYLAGFVDgdgsIiaqikpnQsckfKHqlsLtFqVtekTQrRWFLDKLVDEIGVGyVrdrGsvSDYiLseiKPLHNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKIIEQlPSAkESPDKFLEVCTWVDQiaALndsktrktTSETVRAVLD	C;D	gctaaacgtcgtgagacagttACG;cgtaactgtctcacgacgtttaGC	4	423	637	176;19;442;0	15;9;15;4;8;0;0;0;11;18;28;0;0;0;0;6;3;34;120;366
1XBR	1xbr_1_1	9349824	2.5	XENOPUS LAEVIS	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Beta Sheet	T Box, Protein T	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	ELKVSLEERDLWTRFKELTNEMiVtknGrrmfPVLKVSMSGLDPNAMYTVLLDFVAADNHrwkyVNGEWVPGGKPEPQAPSCVYIHPDSPNFGAHWMKDPVSFSKVkLTnkMNGGGQIMLNslHKYEPRIHIVRVGGTQRMITSHSFPETQFIAVtayqNeEItALkiKHnpfakafLdAKErN;ELKVSLEERDLWTRFKELTNEMiVtknGrrmfPVLKVSMSGLDPNAMYTVLLDFVAADNHrwkyVNGEWVPGGKPEPQAPSCVYIHPDSPNFGAHWMKDPVSFSKVkLTnkMNGGGQIMLNslHKYEPRIHIVRVGGTQRMITSHSFPETQFIAVtayqNEEItALkiKHnpfakafLdAKEr	C;D	AatttcACacctaggtgtgAAATT;AatttcACacctaggtgtgAAATT	162	391	417	47;27;343;0	2;0;2;0;0;0;2;0;14;8;8;0;0;0;0;3;5;26;94;253
1YRN	1yrn_1_1	7569974	2.5	SACCHAROMYCES CEREVISIAE	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Homeodomain, Mat Alpha 2	1	1	1	0	2, 2	0	0	0	0	0	2	2	2	1	A;B	iSPQArAFLeQVFRRKQslnsKEkEEVAKKCGITPlqVrvwFinKrmrS;TKpyrghrfTkENvRILESWFAKNIENPylDTKGLENLMKNTSLSriqIknwVsnRrrkEkTiTIAPELADLLSGEPL	C;D	TacatgtaatttattacatCA;TAtgatgTAATAAattacaTG	121;123	376	346	78;28;240;0	8;1;11;1;5;1;0;1;23;3;7;0;0;0;0;4;1;18;56;206
1ZG1	1zg1_1_1	16262254	2.3	ESCHERICHIA COLI	2	1	1	2	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Response Regulator Protein NARL 	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	RDVNQLtprERDILKLIAQGLpnkIARRLDitestVkvhvkhlkKKlksrVEAAVWVHQERIF;RDVNQLtprERDILKLIAQGLpnkIARRLditestVkvhvkhlkKKlksrvEAAVWVHQERIF	C;D	cgtactCCTTaatgggtACG;cgtaccCATTaaggagtACG	32	6	303	79;0;224;0	6;0;4;0;0;0;2;0;6;18;11;0;0;0;0;1;4;15;43;193
1ZG1	1zg1_2_1	16262254	2.3	ESCHERICHIA COLI	2	1	1	2	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Response Regulator Protein NARL 	2	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	E;F	RDVNQLtprERDILKLIAQGLpnkIARRLditestVkvhvkhlkKKlksrvEAAVWVHQERIF;RDVNQLtprERDILKLIAQGLpnkIARRLDitestVkvhvkhlkKKlksrVEAAVWVHQERIF	G;H	cgtaccCATTaaggagtACG;cgtactCCTTaatgggtACG	32	6	306	84;0;222;0	7;0;5;0;0;0;2;0;6;16;11;0;0;0;0;1;4;15;44;195
1ZG5	1zg5_1_1	16262254	2.3	ESCHERICHIA COLI	2	1	1	2	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Response Regulator Protein NARL 	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	RDVNQLtprERDILKLIAQGLpnkIARRLDitestVkvhvkhlkKKlksrVEAAVWVHQERIF;RDVNQLtprERDILKLIAQGLpnkIARRLditestVkvhvkhlkKKlksrVEAAVWVHQERIF	C;D	cgtaccCCTAtaggggtACG;cgtaccCCTAtaggggtACG	32	6	303	81;0;222;0	10;0;6;0;0;0;2;0;6;18;11;0;0;0;0;1;4;15;45;185
1ZG5	1zg5_2_1	16262254	2.3	ESCHERICHIA COLI	2	1	1	2	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Response Regulator Protein NARL 	2	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	E;F	ERDVNQLtprERDILKLIAQGLpnkIARRLDitestVkvhvkhlkKKlksrvEAAVWVHQERIF;RDVNQLtprERDILKLIAQGLpnkIARRLDitestVkvhvkhlkKKlksrVEAAVWVHQERIF	G;H	cgtacCCCTAtaggggtACG;cgtacCCCTAtaggggtACG	32	6	304	79;0;225;0	10;0;6;0;0;0;2;0;7;17;11;0;0;0;0;0;4;15;49;183
1ZRF	1zrf_1_1	16427082	2.1	ESCHERICHIA COLI	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Catabolite Gene Activator Protein	1	1	1	0	2, 1	0	2	0	0	0	2	1	2	1	A;B	TDPTLEWFLSHCHIHKYPskSTLIHQGEKAETLYYIVKGSVAVLIKDEeGkEMILSYLNQGDFIGELGLFEEGQERSAWVRAKTACEVAEISYKKFRQLIQVNPDILMRLSAQMARRLQVTSEKVGNLAFLdvtGRIAQTLLNLAKQPDAMTHPDGMQIkItrqeIGQIVgcsretVgriLkMLEDQNLISAhgktIVVYGTR;DPTLEWFLSHCHIHKYPskSTLIHQGEKAETLYYIVKGSVAVLIKDEeGkEMILSYLNQGDFIGELGLFEEGQERSAWVRAKTACEVAEISYKKFRQLIQVNPDILMRLSAQMARRLQVTSEKVGNLAFLdvtGRIAQTLLNLAKQPDAMTHPDGMQIkItrqEIGQIVgcsretVgriLkMLEDQNLISAhgktIVVYG	W;X;Y;Z	TTCGAAAaatgcgaT;CTagatcgCATTtttcGAAAT;TTTCGAAAaatgcgAT;CTagatcgCATTtttcGAAAT	62	371	269	61;0;208;0	6;2;6;0;4;0;0;0;3;13;18;0;0;0;0;6;0;24;28;159
1ZS4	1zs4_1_1	16039594	1.7	BACTERIOPHAGE LAMBDA	1	2	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Repressor Protein CII	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	1	0	2	1	2	1	A;B	GSHMANKRNEALRIESALLNKIAMLgtekTAEAVgvdksqIsrwkrdwIPKFSMLLAVLEWGVVDDDMARLARQVAAILTNK;GSHMANKRNEALRIESALLNKIAMLGTEKTAEAVGVDKSqISrWKrdwIPkFSMLLAVLEWGVVDDDMARLARQVAAILTNK	T;U	TATTCGTGCAAACAAacgcaaCGAGGT;TACCTcgttgcGTTTgttTGCACGAAT	96	370	124	51;0;73;0	3;1;3;1;3;0;0;0;6;3;4;0;0;0;0;4;2;12;18;64
1ZS4	1zs4_1_2	16039594	1.7	BACTERIOPHAGE LAMBDA	1	2	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Repressor Protein CII	1	2	1	0	1, 1	0	0	0	1	0	2	1	2	1	C;D	ANKRNEALRIESALLNKIaMLgtekTAEAVgvdksqIsrwkrdwIPKFSMLLAVLEWGVVDDDMARLARQVAAILTNKK;RNEALRIESALLNKIAMLGTEKTAEAVGVDKSqISrWKrdwIPkFSMLLAVLEWGVVDDDMARLARQVAAILT	T;U	TATtcgtgcaaACAAACGCAACGAGGT;TACCTCGTTGCGTTTgtttgcACGAat	96	369	147	58;2;87;0	4;1;4;0;2;0;0;0;8;4;5;0;0;0;0;6;2;12;26;73
2BNW	2bnw_1_1	16528102	2.45	STREPTOCOCCUS PYOGENES	2	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Ribbon|Helix|Helix	Omega Repressor	1	1	1	0	1, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	DIMGdktvrVRADLhHIIkIETAKNGGnvkeVMDQALEEYIRKYLPDKL;MAKKdImGdktvrVRADLhHIIkIETAKNGgnvkeVMDQALEEYIRKYLPDKL	E;F	GaatcaCAAatcACAAGC;CTTGTGATttgtgaTTCG	107	346	159	57;0;102;0	3;1;3;2;2;0;0;0;1;0;7;0;0;0;0;3;2;10;24;101
2BNW	2bnw_1_2	16528102	2.45	STREPTOCOCCUS PYOGENES	2	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Ribbon|Helix|Helix	Omega Repressor	1	2	1	0	1, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	C;D	MAKKDIMGdktvrVRADLhHIIkIETAKNGgnvkEVMDQALEEYIRKYLPDKL;MGdktvrVRADLhHIIkIETAKNGGnvkEVMDQALEEYIRKYLPDKL	E;F	GAATCACAaatcaCAAGC;CTtgtgaTTTgtGATTCG	107	345	154	61;0;93;0	3;1;3;2;2;0;0;0;4;0;8;0;0;0;0;3;2;10;28;88
2BOP	2bop_1_1	1328886	1.7	BOVINE PAPILLOMAVIRUS TYPE 1	1	1	1	1	0	0	1	Transcription factor	Alpha|Beta	Regulatory Protein E2	1	1	1	2	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;D	SCFALISGtanqVkcyrfrVkknhRHRYENCTttWfTvAdNgaErQGQAQILITFGSPSQRQDFLKHVplppGmNISGFTASLDF;SCFALISGtanqVkcyrfrVkknhRHRYENCTttWfTvAdNgaErQGQAQILITFGSPSQRQDFLKHVplppGmNISGFTASLDF	B;E	ccgacCGACgtcggtcG;ccgacCGACgtcggtcG	183	344	328	78;0;250;0	8;0;4;0;4;0;0;0;12;6;8;0;4;2;0;2;0;18;60;200
2C7A	2c7a_1_1	16931575	2.5	HOMO SAPIENS	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Zinc Coordinating	Hormone Nuclear Recpetor, Progesterone Receptor	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	PQKICLICGdEAsgchyGVLTCgsCkvfFkrAMEGQhNyLCAGRNDCIVDkIRrkNCpACrLRKCCQAGMVlggrkFK;PQKICLICGdEAsgchyGVLTCgsCkvfFkrAMEGQHNyLCAGRNDCIVDKiRrkNCpACrLRKCCQAGMVLggrKF	C;D	ccagaaCAGTttgttCTg;ccagaaCAAActgttCTg	56	338	268	56;8;204;0	5;0;12;0;0;0;0;0;10;0;12;0;0;0;0;2;2;22;37;166
2E1C	2e1c_1_1	18073105	2.1	PYROCOCCUS HORIKOSHII	1	1	1	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Transcriptional Regulator PH1519	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A	PLDEIDKKIIKILQNDGkaplrEISKITglaestIherIrkLRESGVIKKFTAIIDPEALGYSMLAFILVKVKAGKYSEVASNLAKYPEIVEVYETTGDYDMVVKIRTKNSEELNNFLDLIGSIPGVEGTHTMIVLKTHKETTELPI	B;D	agtgaaAATTttTCACA;TGTGAAAAAttttcACT	226	322	97	43;0;54;0	0;1;0;1;2;0;0;1;0;1;2;0;0;0;0;6;2;4;24;53
2EFW	2efw_1_1	17521668	2.5	BACILLUS SUBTILIS	2	1	1	2	0	0	1	Structural|DNA Binding protein	Replication	Replication Termination Protein	1	1	1	0	1, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	stGFLVkqrAFLKLYMITMTEQERLyglKLLEVLRSEFKEIGFKPnhteVyrSLheLLDDGILKqIkVKkEgAklqevvLyQFKDYEAAKLYKKQLKVELDRSKKLIEKALSDNF;stGfLVkqrAFLKLYMITMTEQERLYGlkLlEVLRSEFKEIGFKPnhtevyrSlhELLDDGILKqIKVKKEGAKLQEVVLyQFKDYEAAKLYKKQLKVELDRSKKLIEKALSDNF	D;E	atgtaCCAAatgttcAGtc;gactgaaCATTtggtacAT	51	319	319	91;12;215;1	6;1;6;2;1;0;0;0;15;3;10;0;0;0;0;3;0;16;66;190
2EFW	2efw_2_1	17521668	2.5	BACILLUS SUBTILIS	2	1	1	2	0	0	1	Structural|DNA Binding protein	Replication	Replication Termination Protein	2	1	1	0	1, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	F;G	stGFLVkqrAFLKLYMITMTEQERLyglKLLEVLRSEFKEIGFKpnhteVyrSLheLLDDGILKqIkVKkEGAklqevvLyQFKDYEAAKLYKKQLKVELDRSKKLIEKALSDNF;stGFLVkqrAFLKLYMITMTEQERLYGlklleVLRSEFKEIGFKPnhteVyrSLHELLDDGILKQIKVKEVVLYQFKDYEAAKLYKKQLKVELDRSKKLIEKALSDNF	I;J	atgtaCCAAatgttCAGtc;GactgaacATttggtaCAT	51	318	284	78;6;198;2	3;2;8;1;1;0;0;0;20;4;13;0;0;0;0;1;0;15;42;174
2EX5	2ex5_1_1	16698548	2.2	CHLAMYDOMONAS EUGAMETOS	1	1	0	1	0	0	1	Enzyme	Endonuclease	Endonuclease I-CeuI	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	ILKpgEKLPQDKLEELkKIndAVkKTkNFSKYLIDLRKLFQIDEVQVTSESKLFLAGFLEgeasLnistkklAtskFGLvVdPeFnVtrhVNGVKVLYLALEVFKtGrIrhksgsnAtLvLtIdnrqSLEEKVIPFYEQYVVAFSSPEkVKrVANFKALLELfNNdAhqDLEQLVNKILPIwDQmrkqQGqsnegFPNLEAAQDFAR;ILKpgEKLPQDKLEELkKIndAVkKTkNFSKYLIDLRKLFQIDEVQVTSESKLFLAGFLEgeasLnistkklAtskFGLvvdPeFnVtrhVNGVKVLYLALEVFKTGrIrhksGsnatLvLtIdnrqSLEEKVIPFYEQYVVAFSSPEkVKrVANFKALLELfNNDAhqDLEQLVNKILPIwDQmrkqQgqsnegfPNLEAAQDFAR	X;Y	CgataacggtcctaaggtagcgaagC;GcttcgctaccttaggaccgttatcG	155	317	682	163;18;501;0	8;5;8;0;15;0;3;0;26;15;32;0;0;0;0;12;6;50;100;402
2EZV	2ezv_1_1	16308566	2.4		1	1	1	1	0	0	1	Enzyme	Endonuclease	Endonuclease SfiI	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	MHQDYRELSLDELESVEKQTLRTIVQALQQYSKEAKSIFETTAADssGEviVLAeDITQYALEVAETYPINRRFAGfIdYKRVRWLPSPHGLLPQVLLVdakasteKnrDtLqRsqLPMDAEfrntssGEVVTMEAGVIPHLMLQSANDGVLPAVTTSIFVHFYyReLKEGRYRELKSIYVLSLPHARLKQRYNPDPDTSFFgagkhsparGevArIrVyFDrLKEACPWRLQELHYSADSEYTQPRWRDLNDAGHEVTKEFLFLER;MHQDYRELSLDELESVEKQTLRTIVQALQQYSKEAKSIFETTAAdssgEvivLaeDITQYALEVAETYPINRRFAGfIdYKRVRWLPSPHGLLPQVLLVdakasteKnRDtLqRsqLPMDAEfrntsSGEVVTMEAGVIPHLMLQSANDGVLPAVTTSIFVHFYyReLKDVEGRYRELKSIYVLSLPHARLKQRYNPDPDTSFFGagkhsparGevArIrVyFdrLKEACPWRLQELHYSADSEYTQPRWRDLNDAGHEVTKEFLFLER	F;G	tggccaacaaggccT;aggccttgttggcCA	144	316	452	140;3;307;2	18;0;11;0;10;0;4;0;11;24;18;0;0;0;0;8;3;18;48;279
2HAP	2hap_1_1	9886287	2.5	SACCHAROMYCES CEREVISIAE	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Zinc Coordinating	Heme Activator Protein	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	C;D	rkrnrIplrCTICrKrkvkcDkLRPHCQQCTktGVAHLCHYMEQTwAEEAEKELLKDNELKKLRERVKSLEKTLSK;krnriplrCTICrkrkvkcDkLRPHCQQCTKTGVAHLCHYMEqtwAEEAEKELLKDNELKKLRERVKSLEKTLSK	A;B	acgcTATtatcgcTATtagt;ACTaatagcgataatagcgT	57	291	318	67;18;233;0	8;0;11;0;0;0;6;0;11;0;19;0;0;0;0;0;5;15;48;195
2HOF	2hof_1_1	17573343	2.4	BACTERIOPHAGE P1	1	1	1	1	0	0	1	Enzyme	Recombinase	Cre Recombinase	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	SDEVRKNLMDMFRDRQafsehtWkmLLsVCrsWAAWCKLNNRKWFPAEPEDVRDYLLYLQArglaVktIQqhLgqLNmLHrrSGLPrPSDSNAVSLVMRRIRKENVDAGerakqaLAFERTDFDQVRSLMENSDrCqDIrNLAFLGIAYNTLLriaeIArIRVKDISRTDGGRMLIHIKALSLGVTKLVERWISVSGVADDPNNYLFCrvrknGVAAPSATsqlstraLeGIFeATHRLIYGAkDDSgqryLawsghSArVGAARDMARAGVSIPEIMQAGgwtnVNiVMnyIRNLDSETGAMVRLLED;SDEVRKNLMDMFRDRQafsEhtWkmLLsVCrsWAAWCKLNNRKWFPAEPEDVRDYLLYLQArglaVktIqqhlgqLnmLHrrSGLPrPsDSNAVsLVmrRIrkENvDAGerakqaLAFERTDFDQVRSLMENSDrCqDIrNLAFLGIAYNTLLriaEIArIRVKDISRTDGGRMLIHIGrtatLVSTAGVEKALSLGVTKLVERWISVSGVADDPNNYLFCrvrknGvAAPSATsqlstraLeGIFeATHRLIYGAkDDSgqryLawsghSArVGAARDMARAGVSIPEIMQAGgwtnVniVMNyIRNAMVRLLED	C;D	ataacttcgtatagcatACattatacgaACttat;ataagttcgtataatgtatgctatacgaAGttat	15	284	1006	215;47;744;0	20;2;21;0;2;2;4;0;53;36;36;0;0;0;2;19;6;69;157;577
2I3P	2i3p_1_1	16971456	2.3	CHLAMYDOMONAS REINHARDTII	1	1	0	1	0	0	1	Enzyme	Endonuclease	Endonuclease I-CreI 	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	NTKYNKEFLLYLAGFVDgdgsiiaqirpnQsykFKHqlsLTFqVtqkTQrRWFLDKLVDEIGVgyVrdrGsvSDYiLseikpLHNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKIIEQlPSAkESPDKFLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAVLD;NTKYNKEFLLYLAGFVDgdgsiiaqirpnQsykfKHqlsLTFqVtqkTQrRWFLDKLVDEIGVgyVrdrGsvSDYiLseikpLHNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKIIEQlPSAkESPDKFLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAVLD	C;D	gcaaatcgtcgtgagacaattTCG;cgaaattgtctcacgacgattTGC	4	61	640	183;16;440;1	19;10;14;3;8;0;0;0;15;11;26;0;0;0;0;5;4;28;113;384
2I3Q	2i3q_1_1	16971456	2.3	CHLAMYDOMONAS REINHARDTII	1	1	0	1	0	0	1	Enzyme	Endonuclease	Endonuclease I-CreI 	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	NTKYNKEFLLYLAGFVDgdgsiiaqiapnQsykFKHqlsLtFvVtqkTQrRWFLDKLVDEIGVgyVrdrGsvSdYILseiKPLHNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKIIEQlPSAkESPDKFLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAVLD;NTKYNKEFLLYLAGFVDgdgsiiaqiapnQsykfKHqlsLTFvVtqkTQrRWFLDKLVDEIGVgyVrdrGsvSdYiLseiKPLHNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKIIEQlPSAkESPDKFLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAVLD	C;D	gcaaaacgacgtgagtcagttTCG;cgaaactgactcacgtcgtttTGC	4	61	619	171;19;427;2	14;8;12;8;10;0;0;0;13;11;23;0;0;0;0;8;3;29;112;368
2ISZ	2isz_1_1	17209554	2.4	MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS	1	2	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Repressor IdeR	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	mnElVdttEMyLRTIYDLEEEGVTPlrarIAeRLdqsgptVsqtVsrMErDGLLRVAGDrHLELTEKGRALAIAVMRKHRLAERLLVDVIGLPWEEVHAEACRWEHVMSEDVERRLVKVLNNPTTSPFGNPIPGLVELGV;mnElVdttEMyLRTIYDLEEEGVTPlrarIAeRLdqsgptVsqtVsrMErdGLLRVAgdrHLELTEKGRALAIAVMRKHRLAERLLVDVIGLPWEEVHAEACRWEHVMSEDVERRLVKVLNNPTTSPFGNPIPGLVELGV	E;F	CCCTGTTagcacaGGCTgccctaATTTtaGTGG;CACTAaaattagGGCagcctgTGCtAACAGGGC	83	266	296	65;6;225;0	3;0;4;0;4;1;1;0;22;22;14;0;0;0;0;11;0;22;38;154
2ISZ	2isz_1_2	17209554	2.4	MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS	1	2	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Repressor IdeR	1	2	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	C;D	mnElVDttEMyLRTIYDLEEEGVTPlrarIAERLdqsgptVsqtVSrMErDGLLRVAGDrHLELTEKGRALAIAVMRKHRLAERLLVDVIGLPWEEVHAEACRWEHVMSEDVERRLVKVLNNPTTSPFGNPIPGLVELGV;mnElVdttEMyLRTIYDLEEEGVTPlrarIAeRLdqsgptVsqtVSrMErDGLLRVAGDrHLELTEKGRALAIAVMRKHRLAERLLVDVIGLPWEEVHAEACRWEHVMSEDVERRLVKVLNNPTTSPFGNPIPGLVELGV	E;F	CCctgttagCAcaggctgCCCtAATTTTAGTGG;CACTAAAATTAgggcagCCTgtgctaACAGGGC	83	265	270	61;3;206;0	1;0;2;0;0;0;0;0;18;18;13;0;0;0;0;8;0;22;36;152
2NLL	2nll_1_1	7746322	1.9	HOMO SAPIENS	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Zinc Coordinating	Hormone Nuclear Receptor, Retinoic Acid Receptor	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	1	2	2	2	1	A;B	CAICGdRSsgkhyGVYSCegCkgfFkrTVrkDLTyTCRDNKDCLIDkRQrnrCqYCrYQKCLAMGM;DELCVVCGdkAtGyhyrCITcegCkgfFrrTIqkNlHPSySCKYEGKCVIDKVTrnQCqECrFKKCIYVGMATDlvlDDSKrLAkrKliEEnrEkRRREELEK	C;D	caggtCATTcaggtCAG;ctgacctgaaatgacCTG	238;252	257	291	69;3;219;0	11;0;9;0;3;0;2;0;26;0;9;0;0;0;0;2;1;28;36;164
2O6M	2o6m_1_1	17516660	2.3	PHYSARUM POLYCEPHALUM	1	1	0	1	0	0	1	Enzyme	Endonuclease	Endonuclease I-PpoI	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	ALTNAQILAVIDSWEETVGQFPVITHHVPLGGGLQGTLHCYEIPLAapygvgfaknGPtrWqYkrtINqVvHrwgShtVPFLLEPDNINGktCtaSqLChNtRCHNPLHLCwESldDnkGRnWCPGPNGGCVHAVVCLRQGPlYGPGATVAGPQQRGSHFVV;ALTNAQILAVIDSWEETVGQFPVITHHVPLGGGLQGTLHCYEIPLAapygvgfaknGPTrWqYkrtINqVvHrwgShtVPFLLEPDNINGktCtaSqLChNtRCHNPLHLCwESldDnkGRnWCPGPNGGCVHAVVCLRQGPlYGPGATVAGPQQRGSHFVV	C;D	ttgactctCttaagagagTCA;ttgactctCttaagagagTCA	29	7	379	113;22;244;0	17;1;8;0;4;0;4;0;14;7;21;0;0;0;0;2;8;19;52;222
2OR1	2or1_1_1	3187531	2.5	BACTERIOPHAGE 434	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	434 Repressor	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	L;R	SISSRVkSKrIQLGLnqAELAQKVgttqqsIeqLEnGktkrprfLPELASALGVSVDWLLNGT;SISSRVkSKrIQLGLnqaELAQKVGttqqsIeqLEnGktkrprfLPELASALGVSVDWLLNGT	A;B	AAgtacaAACTttcttgtAT;TatacaaGAAagtttgtACT	60	245	279	95;4;180;0	5;0;8;0;3;0;0;0;17;10;13;0;0;0;0;15;1;10;31;166
2R1J	2r1j_1_1	18237194	1.53	BACTERIOPHAGE P22	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Repressor P22 c2	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	L;R	TQLMGERIrARrkKLKIrqaALGKMVgvsnvaIsqwErSetepnGEnLLALSKALQCSPDYLLKGD;TQLMGERIrARrkKLKIrqaALGKMVgvsnvaIsqwErSetepnGEnLLALSKALQCSPDYLLKGD	A;B	TatttaaGATatcttaAATG;CatttaAGATatcttaAATA	197	223	283	102;0;181;0	0;0;4;0;3;0;0;0;14;7;11;0;0;0;0;19;2;15;54;154
2VBJ	2vbj_1_1	0	1.95	CHLAMYDOMONAS REINHARDTII	1	1	0	1	0	0	1	Enzyme	Endonuclease	Endonuclease I-CreI 	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	NTKYNKEFLLYLAGFVDgdgsiiaqiepnQsykFKHrlkLTFkVtqkTQrRWFLDKLVDEIGVGyVrDeGsvSnYiLseiKPLRNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKITEQlPSAkESPDKFLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAVLD;NTKYNKEFLLYLAGFVDadgsiiaqiepnQsskFKHrlkLTFqVtqkTQrRWFLDKLVDEIGVgyVrDsGsvSnYiLseiKPLHNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKIIEQlPSAkESPDKFLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAVLD	C;E	tctgccttttttgaaggatcctAA;ttaggatccttcaaaaaaggcaGA	4	14	648	167;12;467;2	14;2;12;3;12;0;0;0;17;11;28;0;0;0;0;10;1;34;119;385
2VBL	2vbl_1_1	0	1.8	CHLAMYDOMONAS REINHARDTII	1	1	0	1	0	0	1	Enzyme	Endonuclease	Endonuclease I-CreI 	1	1	1	0	0, 0	0	2	0	0	0	2	1	2	1	A;B	NTKYNKEFLLYLAGFVDgdgsiiaqiepnAsykFKHrlkLTFkVtqkTQrRWFLDKLVDEIGVgyVrDeGsvSnYiLseiKPLRNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKITEQlPSAKESPDKFLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAVLD;NTKYNKEFLLYLAGFVDadgsiiaqiapnQsskFKHrlkltFqVtqkTQrRWFLDKLVDEIGVgyVrgsGsvSnYiLseiKPLHNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKIIEQlPSAkESPDKFLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAVLD	C;E;S;T	tctgccttttttga;ttaggatccttcaa;aaaaggcaGA;aggatcctAA	4	14	653	161;12;478;2	14;4;13;3;12;0;0;0;16;10;28;0;0;0;0;11;1;32;118;391
2VBN	2vbn_1_1	0	1.9	CHLAMYDOMONAS REINHARDTII	1	1	0	1	0	0	1	Enzyme	Endonuclease	Endonuclease I-CreI 	1	1	1	0	0, 0	0	2	0	0	0	2	1	2	1	A;B	MNTKYNKEFLLYLAGFVDgdgsiiaqikpnQsskFkHrlsLTFqVtqkTQrRWFLDKLVDEIGVgyVrdsgsvSnYiLseiKPLHNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKIIEQlPSAkESPDKFLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAVLD;NTKYNKEFLLYLAGFVDgdgsiiaqiepnQsykFKHrlkLTFkVtqkTQrRWFLDKLVDEIGVgyVsdsGsvSnYiLseiKPLHNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKIIEQlPSAkESPDKFLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAVLD	C;E;S;T	ttaggatccttcaa;tctgccttttttga;aaaaggcAGA;aggatcctAA	4	14	636	167;15;452;2	18;6;13;4;11;0;0;0;16;12;26;0;0;0;0;12;1;29;115;373
2VBO	2vbo_1_1	0	1.8	CHLAMYDOMONAS REINHARDTII	1	1	0	1	0	0	1	Enzyme	Endonuclease	Endonuclease I-CreI 	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	MNTKYNKEFLLYLAGFVDgdgsiiaqikpnQsskFkHrlsLtFqVtqkTQrRWFLDKLVDEIGVgyVrdsgsvSnYilseiKPLHNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKIIEQlPSAkESPDKFLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAVLD;NTKYNKEFLLYLAGFVDgdgsiiaqiepnQsykFKHrlkLTFkVtqkTQrRWFLDKLVDEIGVGyVsdsGsvSnYiLseikPLHNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKIIEQlPSAkESPDKFLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAVLD	C;E	ttaggatccttcaaaaaaggcAGA;tctgccttttttgaaggatcctAA	4	14	667	172;14;479;2	16;5;11;1;16;0;0;0;18;13;24;0;0;0;0;9;0;29;133;392
2VY1	2vy1_1_1	18784751	2.1	ARABIDOPSIS THALIANA	1	1	1	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Protein Leafy	1	1	1	2	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	rehpfIVTEPGEVARGKKNGLDYLFHLYEQCREFLLQVQTIAKDRGEkCPTKvtnqVFrYAkKSGAsyInkpkMrhyVHCYALHCLDEEASNALRRAFKERGEnvgSWRQACYKPLVNIACRHGWDIDAVFNAHPRLSIWyvPtKLRQLCHLERNNAVAAAAAL;rehpfIVTEPGEVARGKKNGLDYLFHLYEQCREFLLQVQTIAKDRGEkCPTKvtnqVFrYAkKSGAsyInkpkMrhyVHCYALHCLDEEASNALRRAFKERGEnvgSWRQACYKPLVNIACRHGWDIDAVFNAHPRLSIWyvPtKLRQLCHLERNNAVAAAAAL	W;X	AgaaggaCCAGtggtcCgta;AgaaggaCCAGtggtcCgta	81	208	338	82;18;238;0	12;0;8;0;0;2;0;2;26;10;16;0;0;0;0;0;2;16;38;206
2VY2	2vy2_1_1	18784751	2.3	ARABIDOPSIS THALIANA	1	1	1	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Protein Leafy	1	1	1	2	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	rehpfIVTEPGEVARGKkNGLDYLFHLYEQCREFLLQVQTIAKDRGEkCPTKVtnqVFrYAkKSGAsYInkpkMrhyVHCYALHCLDEEASNALRRAFKERGEnvgSWRQACYKPLVNIACRHGWDIDAVFNAHPRLSIWyvPtKLrQLCHLERNNAVAAAAA;rehpfIVTEPGEVARGKkNGLDYLFHLYEQCREFLLQVQTIAKDRGEkCPTKVtnqVFrYAkKSGAsYInkpkMrhyVHCYALHCLDEEASNALRRAFKERGEnvgSWRQACYKPLVNIACRHGWDIDAVFNAHPRLSIWyvPtKLrQLCHLERNNAVAAAAA	W;X	AtttaatCCAAtggtTACaa;AtttaatCCAAtggtTACaa	81	207	290	52;12;226;0	8;0;8;0;0;0;0;0;20;10;14;0;0;0;0;0;0;16;40;174
2YVH	2yvh_1_1	0	2.5	CORYNEBACTERIUM GLUTAMICUM ATCC 13032	1	2	0	1	0	0	1	Transcription factor	Alpha Helix	Repressor CgmR	1	1	1	0	0, 0	0	2	0	0	0	2	1	2	1	A;B	SkkEILRTAIDYIGEYSLetlsydSLAEATglsksgLiyhFpsrHALLLGHELLADDWDKELRDITRDPEDPLERLRAVVVTLAENVSRPELLLLIDAPSHPDFLNAWRTVNHQWIPDTDDLENDAHKRAVYLVQLAADGLFVHDYIHDDVLSKSKRQALETILELIP;tskKEILRTAIDYIGEYSLetlsydSLAEATglsksgLiyhFpsrHALLLGHELLADDWDKELRDITRDPEDPLERLRAVVVTLAENVSRPELLLLIDAPSHPDFLNAWRTVNHQWIPDTDDLENDAHKRAVYLVQLAADGLFVHDYIHDDVLSKSKRQALETILELIP	E;F;G;H	TAACTGtaccgaCC;ggtCGGTACAGTTA;TaactgtACCGACc;GGTcggtacAGTTa	80	206	242	75;0;167;0	4;2;5;4;3;0;0;0;0;12;7;0;0;0;0;3;1;5;62;134
2YVH	2yvh_1_2	0	2.5	CORYNEBACTERIUM GLUTAMICUM ATCC 13032	1	2	0	1	0	0	1	Transcription factor	Alpha Helix	Repressor CgmR	1	2	1	0	0, 0	0	2	0	0	0	2	1	2	1	C;D	SkkEILRTAIDYIGEYSLetlsydSLAEATglsksgLiyhFpsrHALLLGHELLADDWDKELRDITRDPEDPLERLRAVVVTLAENVSRPELLLLIDAPSHPDFLNAWRTVNHQWIPDTDDLENDAHKRAVYLVQLAADGLFVHDYIHDDVLSKSKRQALETILELIP;tskKEILRTAIDYIGEYSLetlsydSLAEATglsksgLiyhFpsrHALLLGHELLADDWDKELRDITRDPEDPLERLRAVVVTLAENVSRPELLLLIDAPSHPDFLNAWRTVNHQWIPDTDDLENDAHKRAVYLVQLAADGLFVHDYIHDDVLSKSKRQALETILELIP	E;F;G;H	TaactgtACCGAcc;GGTcggtacAGTTa;TAACTGtaccgaCC;ggtCGGTACAGTTA	80	205	241	71;0;170;0	4;3;5;5;2;0;0;0;1;10;8;0;0;0;0;1;1;3;65;133
3CRO	3cro_1_1	2038059	2.5	BACTERIOPHAGE 434	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Cro Repressor	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	L;R	MQTLSERLkKRrIALKMtqteLATKAgvkqqsIqliEaGvtkrprfLFEIAMALNCDPVWLQYGTK;MQTLSERLkKRrIALKMtqteLATKAGvkqqsIqliEAGvtkrprfLFEIAMALNCDPVWLQYG	A;B	AAgtacaAACtttcttgtAT;TatacaAGAaagtttgtACT	198	175	289	87;12;190;0	9;0;9;0;3;0;0;0;16;15;14;0;0;0;0;11;1;10;41;160
3E54	3e54_1_1	18984620	2.5	VULCANISAETA DISTRIBUTA	1	1	1	3	0	0	1	Enzyme	Endonuclease	Endonuclease I-Vdi141I	1	1	1	0	0, 0	0	2	0	0	0	2	1	2	1	A;B	EEDFKEGYILGFIEaegsfsvsikfqrdvfGGVrldPvFsItqkNREVLEAIKEHLGIGrImekaGqPNtYVYVVdnfnELVKLINFLNKYADFMIVkKRqFLMFREIANGlVNGEhlHINGLKRLVKLAyEltKEsekgyrkyDLNHVLSIIDKWDLG;EEDFKEGYILGFIEaegsfsvsikfqrdvfGGVrldPvFsItqkNREVLEAIKEHLGIGrImekaGqPNtYvYVVdnfnELVKLINFLNKYADFMIVkKRqFLMFREIANGlVNGEhlHINGLKRLVKLAyEltKEsekgyrkyDLNHVLSIIDKWDLG	C;D;E;F	ctgactctcttaa;ggtagccAA;ttggctaccttaa;gagagtcAG	164	160	680	182;35;462;1	13;6;20;0;10;0;5;0;19;14;22;0;0;0;0;7;6;33;124;401
3E6C	3e6c_1_1	18717788	1.8	DESULFITOBACTERIUM HAFNIENSE	1	1	1	1	0	0	1	Transcription factor	Alpha|Beta	CprK	1	1	1	0	0, 0	0	2	0	0	0	2	1	2	1	C;F	DFCGAIIPDNFFPIEKLRNYTQMGLIRDFAkGSAVIMPGEEITSMIFLVEGKIKLDIIFEDGSEKLLYYAGGNSLIGKLYPTGNNIYATAMEPTRTCWFSEKSLRTVFRTDEDMIFEIFKNYLTKVAYYARQVAEMNtYnptIRILRLFYELCSSQGKRVGDTYEITMPLsqkSIGEITgvhhvtVsrVLaSLkrENILDkKkNKIIVYNLGELKHLSEQtsYyS;DFCGAIIPDNFFPIEKLRNYTQMGLIRDFAkGSAVIMPGEEITSMIFLVEGKIKLDIIFEDGSEKLLYYAGGNSLIGKLYPTGNNIYATAMEPTRTCWFSEKSLRTVFRTDEDMIFEIFKNYLTKVAYYARQVAEMNtYnptIRILRLFYELCSSQGKRVGDTYEITMPLsqkSIGEITgvhhvtVsrVLaSLkrENILDkKkNKIIVYNLGELKHLSEQtsYyS	A;B;D;E	GGCAtgttaaTGC;gcattaACATGcc;GGCAtgttaaTGC;gcattaACATGcc	152	159	298	116;0;182;0	4;2;0;0;0;0;0;0;8;16;14;0;0;0;0;6;4;8;64;172
4CRX	4crx_1_1	10377382	2.2	BACTERIOPHAGE P1	1	1	1	1	1	0	1	Enzyme	Recombinase	Cre Recombinase	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	SDEVRKNLMDMFRDRQafsEhtWkmLLsVCrsWAAWCKLNNRKWFPAEPEDVRDYLLYLQArglaVktIqqhLgqLNmLHrrSGLPrPSDSNAVSLVMRRIRKENVDAGERakqaLAFERTDFDQVRSLMENSDrCqDIrNLAFLGIAYNTLLkiaEIArIRVKDISRTDGGRMLIHIGrtktlvSTAGVEKALSLGVTKLVERWISVSGVADDPNNYLFCrvrknGVAAPSATsqlstraLeGIFeATHRLIYGAkDDSgqryLawsghSArVGAARDMARAGVSIPEIMQAGgwtnVNiVMnyIRNLDSETGAMVRLLED;SDEVRKNLMDMFRDRQafsEhtWkmLLsVCrsWAAWCKLNNRKWFPAEPEDVRDYLLYLQArglaVktIqqhlgqLnmLHrrSGLPrPsDSNAVsLVmrRIrkENVDAGERakqaLAFERTDFDQVRSLMENSDrCqDIrNLAFLGIAYNTLLkiaEIArIRVKDISRTDGGRMLIHIGrtktLVSTAGVEKALSLGVTKLVERWISVSGVADDPNNYLFCrvrknGvAAPSATsqlstraLeGIFeATHRLIYGAkDDSgqryLawsghSArVGAARDMARAGVSIPEIMQAGgwtnVniVMnyIRNLDSETGAMVRLLED	C;D	TataacttcgtatagcatATgctatacgaAGttat;TataacttcgtatagcatatgctatacgaAGttat	15	134	970	204;46;719;1	20;1;21;0;3;0;3;0;56;39;32;0;0;0;2;19;6;62;154;552