#QUERY: #Match: All #Type of multimerization: Homomultimeric #PDB_ID ENTRY_ID PUBMED_ID RESOLUTION SPECIES MULTICOMPLEXITY NO_INTERFACES ASYMMETRIC_UNIT BIOLOGICAL_UNITS IS_CRUCIFORM HAS_ZDNA HAS_WATER CLASSIFICATION TYPE SUBTYPE COMPLEX_ID INTERFACE_ID DNA_DOUBLE_STRAND DNA_SINGLE_STRAND STICKY_ENDS FLIPPED_BASE NICKED_DNA GAPPED_DNA OPEN_DNA MODIFIED_DNA PROTEIN_MONOMERS MULTIMERIZATION PROT_PROT_INTERACTION DNA_PROT_INTERACTION PROT_CHAIN_IDS PROT_SEQS DNA_CHAIN_IDS DNA_SEQS SEQ_GROUPS INTERFACE_GROUP NUMBER_EFF_CONTACTS GROOVE_CONTACTS(MA;MI;BB;NA) TYPE_CONTACTS(1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13;14;15;16;17;18;19;20) 1A3Q 1a3q_1_1 9384586 2.1 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet NFkB 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B 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P22 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Ribbon|Helix|Helix Arc Repressor 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 C;D mkgmsKMpqfnLrWPREVLDLVrKVAEENGRsvnsEIYQRVMESFKKEGR;mkgmskmpqfnLrWPREVLDLVrKVAeENgrsvnsEIYQRVMESFKKEGR E;F TATAGTAGAGTgcttctatCAT;aatgatagaAGCacTCTACTAT 106 650 230 89;0;141;0 4;0;10;0;6;1;0;0;3;12;22;0;0;0;0;5;2;6;33;126 1BG1 1bg1_1_1 9671298 2.25 MUS MUSCULUS 1 1 1 1 0 0 1 Transcription factor Alpha|Beta STAT3B 1 1 1 2 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;C 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SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtKVLsTIFELFSRPIINKIAEKHGYIVEEPqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTEKIKFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVyTRVKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsQLrNDKYnNISEYRNWIYRGR;SLRSDLINALYDEDVCGIISAEGKIYPLGSDtKVLsTIFELFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKIkFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVyTrSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsQLrNDKYnNISEYRNWIYRGR C;D aaagactctt;aaagactctt 1 640 403 97;11;294;1 4;0;4;3;4;6;4;2;21;23;19;0;0;0;0;7;2;16;49;239 1CKQ 1ckq_1_1 0 1.85 ESCHERICHIA COLI 1 1 1 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRI 1 1 1 2 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;E SQGVIGIFGDYAKAHDLAVGEVSKLVKKALSNEYPQLSFRYRDSIKKTEINEALKKIDPDLGGTLFvSnssikPdGGIVEVKDDYGEWRVVLVAeakhqgkDIInIRNGLLvgkRGDQDLmaagnaIerSHknISEIANFMLSESHFPYVLFLEGSNFLTENISITRPDGRVVNLEYnsgiLNrLDrLTAANYGMPINSNLCINKFVNHKDKSIMLQAASIYTQGDGREWDSKIMFEIMFDISTTSLRVLGRDLFEQLTSK;SQGVIGIFGDYAKAHDLAVGEVSKLVKKALSNEYPQLSFRYRDSIKKTEINEALKKIDPDLGGTLFvSnssikPdGGIVEVKDDYGEWRVVLVAeakhqgkDIInIRNGLLvgkRGDQDLmaagnaIerSHknISEIANFMLSESHFPYVLFLEGSNFLTENISITRPDGRVVNLEYnsgiLNrLDrLTAANYGMPINSNLCINKFVNHKDKSIMLQAASIYTQGDGREWDSKIMFEIMFDISTTSLRVLGRDLFEQLTSK B;D TcgcgaattcgCg;TcgcgaattcgCg 28 632 374 122;4;246;2 10;0;0;0;4;0;8;4;16;4;20;0;0;0;0;2;6;24;40;236 1CL8 1cl8_1_1 0 1.8 ESCHERICHIA COLI 1 1 1 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRI 1 1 1 2 1, 1 0 0 0 0 1 2 1 1 1 A;E SQGVIGIFGDYAKAHDLAVGEVSKLVKKALSNEYPQLSFRYRDSIKKTEINEALKKIDPDLGGTLFvSnssikPdGGIVEVKDDYGEWRVVLVAeakhqgkDIINIRNGLLvgkRGDQDLmaagnaIerSHknISEIANFMLSESHFPYVLFLEGSNFLTENISITRPDGRVVNLEYnsgiLNrLDrLTAANYGMPINSNLCINKFVNHKDKSIMLQAASIYTQGDGREWDSKIMFEIMFDISTTSLRVLGRDLFEQLTSK;SQGVIGIFGDYAKAHDLAVGEVSKLVKKALSNEYPQLSFRYRDSIKKTEINEALKKIDPDLGGTLFvSnssikPdGGIVEVKDDYGEWRVVLVAeakhqgkDIINIRNGLLvgkRGDQDLmaagnaIerSHknISEIANFMLSESHFPYVLFLEGSNFLTENISITRPDGRVVNLEYnsgiLNrLDrLTAANYGMPINSNLCINKFVNHKDKSIMLQAASIYTQGDGREWDSKIMFEIMFDISTTSLRVLGRDLFEQLTSK B;D TcgcgattcgcG;TcgcgattcgcG 28 630 364 118;2;244;0 8;0;0;0;2;0;6;4;8;8;14;0;0;0;0;2;4;24;44;240 1CRX 1crx_1_1 9288963 2.4 BACTERIOPHAGE P1 1 1 0 1 1 0 1 Enzyme Recombinase Cre Recombinase 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 1 0 2 1 0 1 A;B SDEVRKNLMDMFRDRQafsEhtWkmLLsVCrsWAAWCKLNNRKWFPAEPEDVRDYLLYLQArglaVktIqqhLgqLnmLHrrSGLPrPSDSNAVSLVMRRIRKENVDAGerakqaLAFERTDFDQVRSLMENSDRCqDIrNLAFLGIAYNTLLriaEIArIRVKDISRTDGGRMLIHIGRTktlvSTAGVEKALSLGVTKLVERWISVSGVADDPNNYLFCrvrknGVAAPSATsqlstraLeGIFeATHRLIYGAkDDsgqryLawsghSArVGAARDMARAGVSIPEIMQAGgwtnVniVMnyIRNLDSETGAMVRLLED;SDEVRKNLMDMFRDRQafsEhtWkmLLsVCrsWAAWCKLNNRKWFPAEPEDVRDYLLYLQArglaVktIqqhLgqLnmLHrrSGLPrPsDSNAVsLVmrRIrkENVDAGerakqaLAFERTDFDQVRSLMENSDrCqDIrNLAFLGIAYNTLLriaEIArIRVKDISRTDGGRMLIHIGrtkTLVSTAGVEKALSLGVTKLVERWISVSGVADDPNNYLFCrvrknGvAAPSATsqlstraLeGIFeATHRLIYGAkDDSgqryLawsghSARvGAARDMARAGVSIPEIMQAGGwTNVniVMnyIrNLDSETGAMVRLLED C;D;E;F Tataacttcgtatag;AtAtgctatacgaAGttat;ataacttcgtatagc;atatgctatacgaAGttat 15 134 944 199;48;697;0 20;1;22;0;3;0;3;0;47;28;32;0;0;0;2;15;3;67;148;553 1CYQ 1cyq_1_1 10581547 1.93 PHYSARUM POLYCEPHALUM 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease I-PpoI 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B ALTNAQILAVIDSWEETVGQFPVITHHVPLGGGLQGTLHCYEIPLAapygvgfaknGPTrWqYkrtINqVvHrwgShtVPFLLEPDNINGktCtasaLChNtRCHNPLHLCwESldDnkGRnWCPGPNGGCVHAVVCLRQGplYGPGATVAGPQQRGSHFVV;ALTNAQILAVIDSWEETVGQFPVITHHVPLGGGLQGTLHCYEIPLAapygvgfaknGPTrWqYkrtiNqVvHrwgShtVPFLLEPDNINGktCtasaLChNtRCHNPLHLCwESldDnkGRnWCPGPNGGCVHAVVCLRQGplYGPGATVAGPQQRGSHFVV C;D ttgactcTCttaagagagTCA;ttgactcTCttaagagagTCA 29 7 393 118;21;254;0 20;0;9;0;4;0;4;0;17;8;21;0;0;0;0;3;8;19;53;227 1CZ0 1cz0_1_1 10581547 2.1 PHYSARUM POLYCEPHALUM 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease I-PpoI 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B ALTNAQILAVIDSWEETVGQFPVITHHVPLGGGLQGTLHCYEIPLAapygvgfaknGPTrWqYkrtINqVvHrwgShtVPFLLEPDNINGktCtashLChNtRCHNPLHLCwESldDnkGRnWCPGPNGGCVHAVVCLRQGplYGPGATVAGPQQRGSHFVV;ALTNAQILAVIDSWEETVGQFPVITHHVPLGGGLQGTLHCYEIPLAapygvgfaknGPTrWqYkrtINqVvHrwgShtVPFLLEPDNINGktCtashLChNtRCHNPLHLCwESldDnkGRnWCPGPNGGCVHAVVCLRQGplYGPGATVAGPQQRGSHFVV C;D ttgactcTCttaagagagTCA;ttgactcTCttaagagagtCA 29 7 389 114;21;254;0 19;0;10;0;4;0;4;0;18;11;18;0;0;0;0;2;8;18;53;224 1D02 1d02_1_1 10545092 1.7 MYCOPLASMA 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease MunI 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B LSGRLNWQALAGLKASGAEQNLYNVFNAVFEGTKYVLYekPKHLkNLYAQVVLPDDVIKEIFNPLIDLSTTqwgvsPaFAIENTETHKILFGeikrqdGWVEGKDpsaGrgnaHerSCkLFTPGLLKAYRTIGGINDEEILPFWVVFEGDITRDPkrVReITFWYDHYQDNYFMWRPNESGEKLVQHFNEKLKKYLD;KSELSGRLNWQALAGLKASGAEQNLYNVFNAVFEGTKYVLYEkPKHLkNLYAQVVLPDDVIKEIFNPLIDLSTTqwgvsPaFAIENTETHKILFGeikrqdGWVEGKDPsaGrgnaHerSCkLFTPGLLKAYRTIGGINDEEILPFWVVFEGDITRDPkrVReITFWYDHYQDNYFMWRPNESGEKLVQHFNEKLKKYLD C;D gccaattggc;gccaattggC 158 628 290 110;3;175;2 6;0;0;0;4;0;2;4;7;1;10;0;0;0;0;1;5;42;38;170 1D2I 1d2i_1_1 10655616 1.7 BACILLUS SUBTILIS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease BglII 1 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B 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KPFENHLKSVDDLKTTYEEYRAGfIAfALEkNKRSTPYIERARALKVAASVAKTPKDLLYLEDIQDALLyASGIsdkAKkfLTEDDKKESINNLIENFLEPAGEEFIDELIFRYLLFQGdsLGgtMrnIagALaqQKLTRAIISALDIANIPYKWLDSRDkKyTNWMDKPEDDYELETFAkGISWTINGKHRTLMYnItVSLVkknVdICLFNCEPQQPEKYLLLGelkggidpagAdehWktANTaLTrIRNKFSEKGLSPKTIFIGAAIehsMAEEIWDQLQSGSLTNSANLTKTEQVGSLCRWIINI;QKPFENHLKSVDDLkTTYEEYRAGfIAfALEkNKRSTPYIERARALKVAASVAKTPKDLLYLEDIQDALLyASGIsdkAKkFLTEDDKKESINNLIENFLEPAGEEFIDELIFRYLLFQGdsLGgtMrnIagALaQQKLTRAIISALDIANIPYKWLDSRDkKyTNWMDKPEDDYELETFAkGISWTINGKHRTLMYnITVSLVkknVdICLFNCEPQQPEKYLLLGelkggidpagAdehWktANTaLTrIRNKFSEKGLSPKTIFIGAAIehsMAEEIWDQLQSGSLTNSANLTKTEQVGSLCRWIINI C;W TAtactcgagtat;atactcgagtat 137 625 540 102;51;381;6 10;0;7;1;4;0;2;2;16;14;24;0;0;0;0;8;2;37;70;343 1DFM 1dfm_1_1 10655616 1.5 BACILLUS SUBTILIS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease BglII 1 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B KIDITDYNHADEILNPQLWKEIEETLLKPLHVkAsdqaskVGSLiFDpvGTnqYIkDELVPKHWKNnIpiPKRFdflgtdIdFGKRDTLVevqfsnyPfLLnNTVrSELFHKSNDIDEEGKVAIIITKGhFPAsnssLyYEqAQNQLNSLAEYNVFDVPIRLVGLIEDFETDIDIVSTTYAdkrysrtITKRDTVKGKVIDTNTPNTRRrkrGTIVTY;KIDITDYNHADEILNPQLWKEIEETLLKPLHVkAsdqaskVGSLiFdpvGTnqYIkDELVPKHWKNnIpiPKRFdflgtdIdFGKRDTLVevqfsnyPfLLnNTVrSELFHKSNDIDEEGKVAIIITKGhFPAsnssLyYEqAQNQLNSLAEYNVFDVPIRLVGLIEDFETDIDIVSTTyAdkrysrtITKRDTVKGKVIDTNTrkrGTIVTY C;D TAttatagatctataa;TAttatagatctataa 79 133 612 135;24;453;0 6;4;6;4;6;0;3;0;32;16;30;0;0;0;0;13;6;35;89;362 1DMU 1dmu_1_1 9736624 2.2 BACILLUS SUBTILIS 1 1 1 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease BglI 1 1 1 2 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B MYNLHREKIFMSYNQNKQYLEDNPEIQEKIELYGLNLLNEVISDNEEEIRADYNEANFLHPFWMNYppldrgkmpkGdqIPwieVGeKAVGSKLTRLVSQREDITVREIGLPTgPdERYLLTSPTIYSLTNGFTDSIMMFVdiksvgPrdsDyDLVLsPnqVSGNGDWAQLEGGIQNNQQTIQgprsSqIFLPTIPPLYILSDGTIAPVVHLFIKPIyAMRSLTKGDTGQSLYKIKLASVPNGLGLFCNPGYAFDSAYKfLFrpgkddrTkSLLqkrVrVdLrVLDKIGPRVMTIDMDK;MYNLHREKIFMSYNQNKQYLEDNPEIQEKIELYGLNLLNEVISDNEEEIRADYNEANFLHPFWMNYppldrgkmpkGdqIPwieVGeKAVGSKLTRLVSQREDITVREIGLPTgPdERYLLTSPTIYSLTNGFTDSIMMFVdiksvgPrdsDyDLVLsPnqVSGNGDWAQLEGGIQNNQQTIQgprsSqIFLPTIPPLYILSDGTIAPVVHLFIKPIyAMRSLTKGDTGQSLYKIKLASVPNGLGLFCNPGYAFDSAYKfLFrpgkddrTkSLLqkrVrVdLrVLDKIGPRVMTIDMDK E;F atcgcctaataggcgaT;atcgcctaataggcgaT 138 624 648 124;36;484;4 18;0;6;0;6;0;6;4;28;12;30;0;0;0;0;8;4;42;94;390 1DSZ 1dsz_1_1 10698945 1.7 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Hormone Nuclear Receptor, Retinoic Acid Receptor 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B PCFVCQdkSsGyhygVSACegCkgfFrrSIqkNmVyTCHRDKNCIINKVTrnRCqYCrLQKCFEVGMSKEsvrNd;GSFTKHICAICGdrSsGkhygVYSCegCkgfFkrTVrkDlTyTCRDNKDCLIDkRQrnRCqYCrYQKCLAMGMKREavqeerqr C;D caggtCaaaggtCAG;ctgaccTttgaccTg 46;247 622 317 81;3;233;0 8;1;11;0;5;0;2;0;26;1;12;0;0;0;0;1;1;29;33;187 1E3M 1e3m_1_1 11048711 2.2 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein Repair Protein DNA Mismatch Repair Protein MutS 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B 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E;F agctgccaggcaccAgtG;ACTggtgcttggcagct 21 129 294 17;43;231;3 0;0;2;0;3;2;0;1;16;4;10;0;0;0;0;3;0;16;50;187 1EGW 1egw_1_1 10715212 1.5 HOMO SAPIENS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Alpha Helix MADS box, MEF2A 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B grkkiQITRIMDErnRQvtFTkrKFgLMkKAYeLSVLCDCEIALIIFNSSNKLFQYASTDMDKVLLKYTEY;grkkiQITRIMDErnRQvtFTkrKFgLMkKAYeLSVLCDCEIALIIFNSSNKLFQYASTDMDKVLLKYTEYN E;F aAAgctatTatTagctT;TaAgctaAtaAtagcTT 98 128 236 21;43;172;0 3;0;6;0;0;4;0;4;14;2;9;0;0;0;0;0;0;12;31;151 1EGW 1egw_2_1 10715212 1.5 HOMO SAPIENS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Alpha Helix MADS box, MEF2A 2 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 C;D grkkiQITRIMDErnRQvtFTkrKFgLMkKAYeLSVLCDCEIALIIFNSSNKLFQYASTDMDKVLLKYTEYN;grkkiQITRIMDErnRQvtFTkrKFgLMkKAYeLSVLCDCEIALIIFNSSNKLFQYASTDMDKVLLKYTEY G;H taAgctaAtaAtagctT;aAAgctatTatTagctT 98 128 233 19;45;169;0 3;0;6;0;0;4;0;4;10;2;10;0;0;0;0;0;0;12;33;149 1EO3 1eo3_1_1 -1 2 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRV 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 1 2 1 1 1 A;B SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtKVLsTIFELFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKENEKIkftLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTRVATKSSLKTYNILNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsqLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK;SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtKVLsTIFeLFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNEKIKftLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTRVSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgntTnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsqLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK C;D aagaatctt;caagaatctt 1 126 373 94;7;272;0 3;2;1;3;4;6;6;2;15;16;18;0;0;0;0;7;0;16;43;231 1EO4 1eo4_1_1 -1 1.9 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRV 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 1 2 1 1 1 A;B SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtkVLsTIFeLFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKENEKIkFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTRVKSSLKTYNILNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsQrNDKYnNISEYRNWIYRGRK;SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtkVLsTIFeLFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKKIKFtLggYtsfIRNNtknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTRVSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsQLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK C;D aagaatctt;caagaatct 1 617 380 90;9;281;0 5;2;5;3;5;6;2;2;18;17;17;0;0;0;0;6;0;18;43;231 1EON 1eon_1_1 -1 1.6 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRV 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 1 2 1 1 1 A;B SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtKVLsTIFELFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKENEKIKFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTRVKSSLKTYNIIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsqLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK;SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtKVLsTIFELFSRPIINKIAEKHGYIVEEPkqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKIkFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTRVSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsqLrNKYnNISEYRNWIYRGRK C;D aaagaatctt;caagaatctt 1 126 406 102;10;294;0 3;2;2;2;4;6;6;2;16;19;23;0;0;0;0;7;0;22;48;244 1EOO 1eoo_1_1 10801972 2.16 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRV 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtkVLsTIFELFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKENEKIkFtLggYtsfIRnNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTrVATRKSSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIhAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsQLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK;SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtkVLsTIFeLFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKQqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKENEKIkFtLggYtsfIRnNtknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTRVATRKSSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIhAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsQLrnDKYnNISEYRNWIYRGRK C;D gaagatatcttc;gaagatatcttc 1 616 479 113;18;348;0 6;2;5;4;5;6;5;2;24;25;23;0;0;0;0;6;2;23;58;283 1ERI 1eri_1_1 2399465 2.5 ESCHERICHIA COLI 1 1 1 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRI 1 1 1 2 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;E SQGVIGIFGDYAKAHDLAVGEVSKLVKKALSNEYPQLSFRYRDSIKKTEINEALKKIDPDLGGTLFvSnssikPdGGIVEVKDDYGEWRVVLVAeakhqgkDIInIRNGLLvgkRGDQDLmaagnaIerSHknISEIANFMLSESHFPYVLFLEGSNFLTENISITRPDGRVVNLeYNsgiLNrLdrLTAANYGMPINSNLCINKFVNHKDKSIMLQAASIYTQGDGREWDSKIMFEIMFDISTTSLRVLGRDLFEQLTSK;SQGVIGIFGDYAKAHDLAVGEVSKLVKKALSNEYPQLSFRYRDSIKKTEINEALKKIDPDLGGTLFvSnssikPdGGIVEVKDDYGEWRVVLVAeakhqgkDIInIRNGLLvgkRGDQDLmaagnaIerSHknISEIANFMLSESHFPYVLFLEGSNFLTENISITRPDGRVVNLeYNsgiLNrLdrLTAANYGMPINSNLCINKFVNHKDKSIMLQAASIYTQGDGREWDSKIMFEIMFDISTTSLRVLGRDLFEQLTSK B;D TcgcgaattcgCg;TcgcgaattcgCg 28 615 386 134;6;244;2 12;0;0;0;4;2;6;4;22;2;18;0;0;0;0;2;6;30;56;222 1ESG 1esg_1_1 10882125 1.9 BACILLUS AMYLOLIQUEFACIENS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease BamHI 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B MEVEKEFITDEAKELLSKDKLIQQAYNEVKTSICSPIWPATSKTFTINNTEKNCNgvvPIkELCYTLLEDTYNWYREKPLDilKLeKKKgGPIDVYKEFIENSELKRVGMEFEtgnIssAHrSMNKLLLGLKHGEIDLAIILMPIKQLAYYLtdrVTNFEELEPYFELTEGQPFIFIGFNAEAYNSNVPLIPkgsdGMSKRSIKKWKDK;MEVEKEFITDEAKELLSKDKLIQQAYNEVKTSICSPIWPATSKTFTINNTEKNCNGVvPIKELCYTLLEDTYNWYREKPLDILKLeKKKGGPIDVYKEFIENSELKRVGMEFEtgnISsAHrSMNKLLLGLKHGEIDLAIILMPIKQLAYYLtdrVTNFEELEPYFELTEGQPFIFIGFNAEAYNSNVPLIPkgsdGMSKRSIKKWKDKVEN C;D tggattCa;tgaatcCa 40 614 126 28;1;97;0 4;1;6;0;0;0;0;0;3;9;7;0;0;0;0;3;1;11;9;72 1EWQ 1ewq_1_1 11048710 2.2 THERMUS AQUATICUS 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein Repair Protein DNA Mismatch Repair Protein MutS 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B EGLKGEGPGPLpplLQQYVELRDQYPDYLLLFQvgdfYeCFGEDAERLARALGlvLthktskdFTTPAgIpLraFEAyAERLLKGFRLAVADqVEPaEEAEglvRrEVTQLLTPGTLLQESLLPREANYLAAIATGDGWGLAFLDVSTGEFKGTVLKSKSALYDELFRHRPAEVLLAPELLENGAFLDEFRKRFPVLSEAPFEPEGEGPLALRRARGALLAYAQRTQGGALSLQPFRFYDPGAFRLPEATLRALEVFEPLRGQDTLFSVLDETRTAPGRRLLQSWLRHPLLDRGPLEARLDRVEGFVREGALREGVRRLLYRLADLERLATRLELGRASPKDLGALRRSLQILPELRALLGEEVGLPDLSPLKEELEAALVEDPPLKVSEGGLIREGYDPDLDALRAAHREGVAYFLELEERERERTGIPTLKVGynavFGYyLEVTRPYYERVPKEYRPVqTlkdrQrYTLPEKEKEREVYRLEALIRRREEEVFLEVRERAKRQAEALREAARILAELDVYAALAEVAVRYGYVRPRFGDRLQIRAGRHPVVERRTEFVPNDLEAHELVLITGPNAGKSTFLRQTALIALLAQVGSFVPAEEAHLPLFDGIYTRIGAGKSTFVEEEVALILKEATENSLVLLDEVGRGTSSLDGVAIATAVAEALHERRAYTLFATHYFELTALGLPRLKNLHVAAREEAGGLVFYHQVLPGPASKSYGVEVAAAGLPKEVVARARALLQAAAR;EGLKGEGPGpLppllQQYVELRDQYPDYLLLFQvgDfYECFGEDAERLARALGLvLtHktskdFTTPAGIPLrAFEAYAERLLKGFRLAVADqVEPvRrEVTQLLTPGTLLQESLLPREANYLAAIATGDGWGLAFLDVSTGEFKGTVLKSKSALYDELFRHRPAEVLLAPELLENGAFLDEFRKRFPVLSEAPFEPEGEGPLALRRARGALLAYAQRTQGGALSLQPFRFYDPGAFRLPEATLRALEVFEPLRGQDTLFSVLDETRTAPGRRLLQSWLRHPLLDRGPLEARLDRVEGFVREGALREGVRRLLYRLADLERLATRLELGRASPKDLGALRRSLQILPELRALLGEEVGLPDLSPLKEELEAALVEDPPLKVSEGGLIREGYDPDLDALRAAHREGVAYFLELEERERERTGIptLkVGYnavfGYYLEVtrpyYERVPKEYRPVqTlkdrQrYTLPEKEKEREVYRLEALIRRREEEVFLEVRERAKRQAEALREAARILAELDVYAALAEVAVRYGYVRPRFGDRLQIRAGRHPVVERRTEFVPNDLEAHELVLITGPNAGKSTFLRQTALIALLAQVGSFVPAEEAHLPLFDGIYTRIGAGKSTFVEEEVALILKEATENSLVLLDEVGRGTSSLDGVAIATAVAEALHERRAYTLFATHYFELTALGLPRLKNLHVAAREEAGGLVFYHQVLPGPASKSYGVEVAAAGLPKEVVARARALLQA C;D GCGACGCtagcgtgcgGctcgTC;GGacgagccgccgctagcgTCG 125 613 346 18;22;304;2 1;0;0;0;0;0;0;1;14;3;19;0;0;0;0;0;0;24;66;218 1EYU 1eyu_1_1 10903853 1.78 PROTEUS VULGARIS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease PvuII 1 1 1 0 2, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SHPDLNKLLELWPHIQEYQDLALKHGInDIFqdnGGkLLQVLLITGLTVLPGRegnDAVDNAGQEYelksinIDltKgFsthhHMNPviIAkyRQVPWIFAIYRGIAIEAIYRLEPKDLEFyYDkWERkWYSdGHkdinnpkIpVKYVMEHGTKIY;SHPDLNKLLELWPHIQEYQDLALKHGInDIFqdnGGKLLQVLLITGLTVLPgndAVDNAGQEYelksinIDltKgFsthhHMNPviIAkyRQVPWIFAIYRGIAIEAIYRLEPKDLEfyYDkwERkWYSdGHKDinnpkIpVkYVMEHGTKIY C;D tgaccagctggtC;tgaccagctggtC 41 612 422 150;11;259;2 7;4;9;0;5;3;6;3;17;4;9;0;0;0;0;5;6;23;52;269 1F0O 1f0o_1_1 10903853 2.5 PROTEUS VULGARIS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease PvuII 1 1 1 0 2, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SHPDLNKLLELWPHIQEYQDLALKHGInDIFqdnGGklLQVLLITGLTVLPegNdAVDNAGQEYelksinIDltkgFsthhHMNPviIAkyRQVPWIFAIYRGIAIEAIYRLEPKDLEfyYDkwERkWYSdGHKdinnpkIpVkYVMEHGTKIY;PDLNKLLELWPHIQEYQDLALKHGInDIFqdnGGKlLQVLLITGLTVLPegNdAVDNAGQEYelksinIDltKgFsthhHMNPviIAkyRQVPWIFAIYRGIAIEAIYRLEPKDLEfyYDkwERkWYSdGHKdinnpkIpVkYVMEHGTKIY C;D tgaccagctggtC;tgaccagctggtC 41 611 420 142;10;267;1 7;4;10;1;5;4;6;2;12;2;13;0;0;0;0;5;6;16;48;279 1F2I 1f2i_1_1 11427887 2.35 MUS MUSCULUS 3 1 1 3 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zif268 Zinc Finger 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 G;H NLLNYVVPkMrPYACPVESCDrrfsrsdeLTrhIriHTGQkPFQCRICMrnfsrsdhLtthIrTHT;NLLNYVVPkMrPYACPVESCDrrfsrSdeLTrhIriHTGQkPFQCRICMrnfsrsdhLttHIrTHT A;B atgggcgcgccCAT;atgggcgcgccCAT 58 125 289 112;3;171;3 12;1;14;0;8;0;0;0;5;17;4;0;0;0;0;4;0;33;45;146 1F2I 1f2i_2_1 11427887 2.35 MUS MUSCULUS 3 1 1 3 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zif268 Zinc Finger 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 I;J NLLNYVVPkMrPYACPVESCDrrfsrSdeLTrhIriHTGQkPFQCRICMrnfsrsdhLttHIrTHT;NLLNYVVPkMrPYACPVESCDrRfsrsdeLTrhIriHTGQkPFQCRICMRnfsrsdhLtthIrTHT C;D atgggcgcgccCAT;atgggcgcgccCAT 58 125 287 115;3;165;4 15;1;17;0;8;0;0;0;4;16;3;0;0;0;0;6;0;29;43;145 1F2I 1f2i_3_1 11427887 2.35 MUS MUSCULUS 3 1 1 3 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zif268 Zinc Finger 3 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 K;L NYVVPkMrPYACPVESCDrrfsrsdeLTrhIriHTGQkPfQCRICMrNfsrsdhLttHIrTHT;NLLNYVVPkMrPYACPVESCDrrfsrSdeLTrhIriHTGQkPFQCRICMrNfsrsdhLttHIrTHT E;F AtgggcgcgccCAT;atgggcgcgccCAT 58 610 270 110;0;157;3 15;1;13;0;8;0;1;0;4;13;2;0;0;0;0;4;0;27;46;136 1F4K 1f4k_1_1 11224562 2.5 BACILLUS SUBTILIS 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein Replication Replication Termination Protein 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B stGfLVkqrAFLKLYMITMTEQERLyglKLLEVLRSEFKEIGFKPnhteVyrSLhELLDDGILKqIkVkKEGAklqevvLyQFKDYEAAKLYKKQLKVELDRSKKLIEKALSDNF;stGfLVkqrAFLKLYMITMTEQERLyglKLLeVLRSEFKEIGFKPnhteVyrSLhELLDDGILKqIkVkKEGAKlqevvLyQFKDYEAAKLYKKQLKVELDRSKKLIEKALSDNF D;E CtatgaaCATAatgttCATag;CtatgaaCATTatgttCATAg 51 608 346 83;5;258;0 2;1;4;4;2;0;1;0;17;4;19;0;0;0;0;2;0;20;70;200 1FIU 1fiu_1_1 10966652 1.6 NEISSERIA GONORRHOEAE 2 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease NgoMIV 1 1 1 0 1, 1 0 2 0 0 0 2 1 1 1 A;B 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MQPLFTQERRIFHKKLLDGNILATnNrGVVsNadgsntrSFNIAKGIADLLHSETVSErlpgqtsgnAfeAICSEFVQSAFEKLQHIRPGDWNVKQVGsRnrLEIARYQQYAHLTALAKAAEENPELAAALGSDYtItPdIIVTRNLIADAEINRNEFLVDENIATYASLRAGNGNMPLLHASISckwtIrsdrAQnARSeGLNLVRNRKGRLPHIVVVTAEPtPsrISSIALGTGEIDCVYHFALYELEQILQSLNYEdALDLFYIMVNGKRLKDISDLPLDLAV;MQPLFTQERRIFHKKLLDGNILATnNrGVVsNAdgsntrSFNIAKGIADLLHSETVSerlpgqtsgnAfeAICSEFVQSAFEKLQHIRPGDWNVKQVGsrNrLEIARYQQYAHLTALAKAAEENPELAAALGSDYTiTPdIIVTRNLIADAEINRNEFLVDENIATYASLRAGNGNMPLLHASISckwtIrsdrAQnARSeGLNLVRNRKGRLPHIVVVTAEPTPsrISSIALGTGEIDCVYHFALYELEQILQSLNYEdALDLFYIMVNGKRLKDISDLPLDLAV G;H;K;L tgcg;Tgcg;ccggcgc;ccggcgc 71 123 433 117;23;293;0 7;0;4;2;13;2;1;2;15;25;11;0;0;0;0;12;1;40;47;251 1FJL 1fjl_1_1 7671301 2 DROSOPHILA MELANOGASTER 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Paired Protein Pax 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B kQrrsrtTfSASQlDELERAFERTQypDiYTrEELAQRTNLTEArIqvwFqnRrarLrKQHTSVS;QrrsrtTfSASQlDELERAFERTQyPDiYTrEELAQRTNLTeArIqvwFqnRrarLrK D;E Aataatctgattac;Tgtaatcagattat 99 606 363 49;35;279;0 10;0;18;0;2;0;0;0;27;2;9;0;0;0;0;2;0;27;55;211 1FJL 1fjl_2_1 7671301 2 DROSOPHILA MELANOGASTER 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Paired Protein Pax 2 1 1 2 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 C;D kqrrsrtTfSASQlDELERAFERTQypDiYTrEELAQRTNLTEArIqvwFqnRrarLrK;kqrrsrtTfSASQlDELERAFERTQypDiYTrEELAQRTNLTEArIqvwFqnRrarLrK E;F Tgtaatctgattac;Tgtaatctgattac 99 605 370 56;34;280;0 8;0;20;0;2;0;0;0;30;2;12;0;0;0;0;4;0;26;54;212 1G9Y 1g9y_1_1 11276249 2.05 CHLAMYDOMONAS REINHARDTII 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease I-CreI 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B NTKYNKEFLLYLAGFVDgdgsiiaqikpnQsykFKHqlsLtFqVtqkTQrRWFLDKLVDEIGVgyVrdrGsvSDYiLseiKPLHNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKIIEQlPSAkESPDKFLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAVLD;NTKYNKEFLLYLAGFVDgdgsIiaqikpnQsykfKHqlsLtFqVtqkTQrRWFLDKLVDEIGVgyVrdrGsvSDYiLseikPLHNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKIIEQlPSAkESPDKFLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAVLD C;D cgaaactgtctcacgacgttttGC;gcaaaacgtcgtgagacagttTCG 4 11 666 185;17;463;1 14;9;14;6;12;0;0;0;11;13;24;0;0;0;0;3;3;30;131;396 1G9Z 1g9z_1_1 11276249 1.8 CHLAMYDOMONAS REINHARDTII 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease I-CreI 1 1 1 0 0, 0 0 2 0 0 0 2 1 2 1 A;B NTKYNKEFLLYLAGFVDgdgsIiaqikpnQsykfKHqlsLTFqVtqkTQrRWFLDKLVDEIGVgyVrdrGsvSDYiLseiKPLHNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKIIEQlPSAkESPDKFLEVCTWVDQiaALndsktrktTSETVRAVLD;NTKYNKEFLLYLAGFVDgdgsIiaqikpnQsykFKHqlsLTFqVtqkTQrRWFLDKLVDEIGVGyVrdrGsvSDYiLseikPLHNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKIIEQlPSAkESPDKFLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAVLD C;D;E;F gcaaaacgtcgtga;gacagttTCG;cgaaactgtctcac;gacgtttTGC 4 11 675 186;17;471;1 14;10;19;5;6;0;0;0;13;13;26;0;0;0;0;3;3;34;128;401 1GA5 1ga5_1_1 11669620 2.4 HOMO SAPIENS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Hormone Nuclear Receptor, Orphan Nuclear Receptor NR1D1 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 1 2 1 2 1 A;B VLLCKVCGdvAsgfhyGVLACegCkgfFrrSIQQNIykRCLKNENCSIVRINrnRCqQCrFKKCLSVGMSrDAvrfgripk;VLLCKVCGdVAsgfhyGVLACegCkgfFrrSIqQNIykRCLKNENCSIVRINrnrCqQCrFKKCLSVGMSrDAvrfgr C;D CAactaggtcactaggtCAG;ctgacCTAgtgaccTAgtg 54 118 408 75;30;303;0 10;0;11;0;3;2;2;2;24;0;12;0;0;0;0;0;1;25;59;257 1GA5 1ga5_2_1 11669620 2.4 HOMO SAPIENS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Hormone Nuclear Receptor, Orphan Nuclear Receptor NR1D1 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 1 2 1 2 1 E;F VLLCKVCGdvAsgfhyGVLACegCkgfFrrSIqQNIykRCLKNENCSIVRINrnRCqQCrFKKCLSVGMSrDAvrfgrip;VLLCKVCGdVAsgfhyGVLACegCkgfFrrSIqQNIyKRCLKNENCSIVRINrnrCqQCrFKKCLSVGMSrDAvrfg G;H CAactaggtcactaggtCAG;ctgacCTAgtgaccTAgtg 54 118 405 74;33;298;0 11;0;12;0;4;2;2;4;22;0;15;0;0;0;0;0;0;19;60;254 1GD2 1gd2_1_1 11017199 2 SCHIZOSACCHAROMYCES POMBE 2 1 1 3 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, PAP1 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 E;F;I;J DqepSSKrkAqnrAaqrafrKrKEDHLKALETQVVTLKELHSSTTLENDQLRQKVRQLEEELRIL;epSSKrkAqnrAaqrafrKrkEDHLKALETQVVTLKELHSSTTLENDQLRQKVRQLEEELRILK;rKAQNRETQVVTLKELHSSTTLENDQLRVRQLEEELRILK;TQVVTLKELHS A;B Aggttacgtaacc;aggttacgtaacC 100;209;266 117 256 121;0;134;1 12;0;11;0;4;0;2;0;11;0;1;0;0;0;0;2;4;23;49;137 1GD2 1gd2_2_1 11017199 2 SCHIZOSACCHAROMYCES POMBE 2 1 1 3 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, PAP1 2 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 G;H;I;J qepSSKrkAqnrAaqrafrKrkEDHLKALETQVVTLKELHSSTTLENDQLRQKVRQLEEELRIL;qepSSKrkAqnrAaqrafrKrkEDHLKALETQVVTLKELHSSTTLENDQLRQKVRQLEEELRIL;RKaQNRETQVVTLKELHSSTTLENDQLRVRQLEEELRILK;TQVVTLKELHS C;D aggttacgtaacC;AggttacgtaacC 100;209;267 117 258 120;0;137;1 12;0;10;0;4;0;2;0;10;0;1;0;0;0;0;2;4;19;48;146 1GTW 1gtw_1_1 0 1.85 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, C|EbpBeta 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B DkHSDeyKirrErnnIavrksrdkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQ;DkHSDeyKIrrernnIavrksrDkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQLP C;D AatgtggcgcaaTCCT;TaggattgcgccaCAT 23 24 243 98;0;145;0 8;0;9;0;3;0;0;0;9;4;0;0;0;0;0;5;4;32;33;136 1GU4 1gu4_1_1 0 1.8 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, C|EbpBeta 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B DkHSDeyKirrErnnIavrksrdkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQ;DkHSDeyKIrrernnIavrksrDkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQLP C;D TAggattgcgcaaTAT;aatattgcgcaaTCCT 23 24 253 108;0;145;0 8;0;8;0;3;0;0;0;9;4;0;0;0;0;0;4;5;32;36;144 1GU5 1gu5_1_1 0 2.1 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, C|EbpBeta 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B DkHSDeyKirrErnnIavrksrdkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQ;DkHSDeyKIrrernnIavrksrDkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQLP C;D TTgtgttggccaaTCA;atgattggccaaCACA 23 24 232 97;0;135;0 7;0;8;0;4;0;0;0;8;3;0;0;0;0;0;6;6;29;38;123 1GXP 1gxp_1_1 12015152 2.5 ESCHERICHIA COLI 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Alpha Helix PhoB 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B AVEEVIEMQGLSLDPTSHRVMAGEEPLemgpteFKLLHFFMTHPERVYSrEQLLNHVwGTNVyveDrtVdvhIrrLrKALePGGHDRMVQtvrgTgyRFSTRF;EEVIEMQGLSLDPTSHRVMAGEEPLemgpteFKLLHFFMTHPERVYsrEQLLNHVwGTNVyvedrtVdvhIrrLrKALePGGHDRMVQtvrgtgyRFSTRF C;D GAGctgtcaTAAagttgtcaCGG;cccgtgaCAACtttatgaCAGCT 91 603 319 92;13;209;5 8;0;10;0;0;0;2;0;12;11;13;0;0;0;0;2;1;29;48;183 1GXP 1gxp_2_1 12015152 2.5 ESCHERICHIA COLI 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Alpha Helix PhoB 2 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 E;F VEEVIEMQGLSLDPTSHRVMAGEEPLemgpteFKLLHFFMTHPERVYSrEQLLNHVwGTNVyveDrtVdvhirrLrKALEPGGHDRMVQtvrgTgyRFSTRF;VEEVIEMQGLSLDPTSHRVMAGEEPLEmgpteFKLLHFFMTHPERVYsrEQLLNHVwGTNVyvedrtVdvhIrrLrKALePGGHDRMVQtvrgtgyRFSTRF G;H GAGctgtcATAAagttgtcACGG;cccgtgaCAACtttatgaCAGCT 91 602 315 85;11;216;3 8;0;9;0;0;0;1;0;14;11;15;0;0;0;0;3;3;24;51;176 1H6F 1h6f_1_1 12005433 1.7 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet T Box, TBX3 1 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B DPKVHLEAKELWDQFHKRGTEMvitksgrrmfPPFKVRCSGLDKKAKYILLMDIIAADDCrYkfhNSRWMVAGKADPEMPKRMYIHPDSPATGEQWMSKVVTFhKLkLTnNISDKHGFTILNsmHKYQPRFHIVRANDILKLPYSTFRTYLFPETEFIAVtayqNdKItQLkiDNnpfakgfRD;KDDPKVHLEAKELWDQFHKRGTEMvitksgrrmfPPFKVRCSGLDKKAKYILLMDIIAADDCRYkfHNSRWMVAGKADPEMPKRMYIHPDSPATGEQWMSKVVTFHKLkLTnNISDKHGFTILNsmHKYQPRFHIVRANDILKLPYSTFRTYLFPETEFIAVtayqNdKItqLkiDNnpfakgfRD C;D TAatttcACacctaggtgtGAAAT;TAatttcACacctaggtgtgAAAT 161 601 376 41;26;309;0 2;0;2;0;0;0;2;0;19;8;8;0;0;0;0;4;4;15;86;226 1H89 1h89_1_1 11792321 2.45 MUS MUSCULUS, HOMO SAPIENS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, C|EbpBeta 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B eyKIrrErnnIavrksrDkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQLPE;eyKIrrErnnIavrksrDkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQLPE D;E GatgtggcgcaaTCCTTAACGGACTG;CCAGTCCGTTAAggattgcgccacAT 23 600 233 100;0;133;0 6;0;12;0;4;0;0;0;7;3;0;0;0;0;0;6;4;31;24;136 1H8A 1h8a_1_1 11792321 2.23 AVIAN MYELOBLASTOSIS VIRUS, HOMO SAPIENS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, C|EbpBeta 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B VDkHSDEyKIrrernnIavrksrDkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQL;DkHSDeyKIrrernnIavrksrDkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQL D;E GatgtggcgcaaTCCTTAACGGACTG;CCAGTCCGTTAAggattgcgccaCAT 23 598 217 88;0;129;0 6;0;10;0;2;0;0;0;8;3;0;0;0;0;0;5;4;32;29;118 1HCQ 1hcq_1_1 8221895 2.4 HOMO SAPIENS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Hormone Nuclear Receptor, Estrogen Receptor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B MKETRYCAVCNdYAsgyhyGVwSCegCkafFkrSiqGHNDyMCPATNQCTIDKNRrkSCqACrLRKCYEVGMMk;TRYCAVCNdYAsgyhyGVwSCegCkafFkrSiqGHnDyMCPATNQCTIDkNRrkSCqACrLRKCYEVGMMk C;D CcaggtCACAgtgacCTG;CcaggtCACTgtgacCTG 97 596 243 66;0;177;0 10;0;9;0;2;0;1;0;13;0;8;0;0;0;0;2;0;21;25;152 1HCQ 1hcq_2_1 8221895 2.4 HOMO SAPIENS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Hormone Nuclear Receptor, Estrogen Receptor 2 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 E;F MKETRYCAVCNdYAsgyhyGVWScegCkafFkrSiQGHNDyMCPATNQCTIDkNRRKsCqACrLRKCYEVGMMk;KETRYCAVCNdYAsgyhyGVWSCegCkafFkrSiQGDyMCPATNQCTIDkNRRKsCqACrLRKCYEVGMMk G;H CcaggtCACAgtgacCTG;CcaggtCACTgtgacCTG 97 595 205 63;0;142;0 10;0;7;0;2;0;1;0;8;3;9;0;0;0;0;1;0;17;20;127 1HWT 1hwt_1_1 9886294 2.5 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Heme Activator Protein 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 C;D rIplsCTICrkrkvkcDkLRPHCQQCTktGVAHLCHYMEQTWAEEAEKELLKDNELKKLRERVKSLEKTL;rkrnriplsCTICrkrkvkcDkLRPHCQQCTKTGVAHLCHYMEqtwAEEAEKELLKDNELKKLRERVKSLEKTL A;B gcgcTATtatcgcTATTagC;GCTAAtagcgataatagcgC 57 116 261 58;20;183;0 7;0;9;0;0;0;6;0;10;4;13;0;0;0;0;0;5;12;44;151 1HWT 1hwt_2_1 9886294 2.5 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Heme Activator Protein 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 G;H rIplsCTICrKrkvkcDkLRPHCQQCTktGVAHLCHYmEQTwAEEAEKELLKDNELKKLRERVKSLEKTL;krnriplsCTICrkrkvkcDkLRPHCQQCTKTGVAHLCHYMEqtwAEEAEKELLKDNELKKLRERVKSLEKTL E;F gcgcTATtatcgcTATTagC;GCTAAtagcgataatagcgC 57 116 269 56;17;196;0 5;0;8;0;0;0;6;0;10;4;13;0;0;0;0;0;4;13;43;163 1IAW 1iaw_1_1 11473254 2.4 NOCARDIA AEROCOLONIGENES 1 2 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease NaeI 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B EPDDDLERVRATLYSLDPDGDRTAGVLRDTLDQLYDGQRTGRWNFDQLHKTEKTHMGTLVEINLHREFQFGDGFETDYEIAGVQVDCKFSMSQGAWMLPPESIGHICLVIWASDQQCAWTAGLVKVIPQFLGTANRDLKRRLTPEGRAQVVKLWPDHGKLQENLLLHIPGDVRDQIFSAKssrgnqhgqaRVnELFRRVHGRLIGrAVIATVAqqddFmkrvrgsgGArSiLRPEGIIILghqdNdpKVANDLGLPVPRkgqvVAARVVPADEGDQRQTAEIQGRRWAVAVPGDPIVEAPvvPr;EPDDDLERVRATLYSLDPDGDRTAGVLRDTLDQLYDGQRTGRWNFDQLHKTEKTHMGTLVEINLHREFQFGDGFETDYEIAGVQVDCKFSMSQGAWMLPPESIGHICLVIWASDQQCAWTAGLVKVIPQFLGTANRDLKRRLTPEGRAQVVKLWPDHGKLQENLLLHIPGDVRDQIFSAKssrgnqhgqaRVnELFRRVHGRLIGrAVIATVAqqddFmkrvrgsgGArsiLRPEGIIILghqdNdPKVANDLGLPVPRkgqvVAARVVPADEGDQRQTAEIQGRRWAVAVPGDPIVEAPvvPr C;D gccacgccggcgtggc;TGccacgccggcgtggc 69 590 494 105;35;354;0 10;0;15;0;4;1;2;0;28;9;25;0;0;0;0;4;1;28;60;307 1IAW 1iaw_1_2 11473254 2.4 NOCARDIA AEROCOLONIGENES 1 2 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease NaeI 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B EPDDDLERVRATLYSLDPDGDRTAGVLRDTLDQLYDGQRTGRWNfDQLHktEktHMgtLVeINLHREFQFGDGFeTdYEIAGVQVdckfsmsQGaWmLppeSIGHICLVIWASDQQCAWTAGLVKVIPQFLGtanrdLkRrlTpEGrAQVVKLWPDHGKLQENLLLHIPGDVRDQIFSAKSSRGNQHGQARVNELFRRVHGRLIGRAVIATVAQQDDFMKRVRGSGGARSILRPEGIIILGHQDNDPKVANDLGLPVPRKGQVVAARVVPADEGDQRQTAEIQGRRWAVAVPGDPIVEAPVVPR;EPDDDLERVRATLYSLDPDGDRTAGVLRDTLDQLYDGQRTGRWNfDQLHktEktHMgtLVeINLHREFQFGDGFeTdYEIAGVQVdckfsmsQGaWmLppeSIGHICLVIWASDQQCAWTAGLVKVIPQFLGtanrdLkRrlTpEGrAQVVKLWPDHGKLQENLLLHIPGDVRDQIFSAKSSRGNQHGQARVNELFRRVHGRLIGRAVIATVAQQDDFMKRVRGSGGARSILRPEGIIILGHQDNDPKVANDLGLPVPRKGQVVAARVVPADEGDQRQTAEIQGRRWAVAVPGDPIVEAPVVPR E;F TGCcacgccggcgtGGC;TGccacgccggcgtGGC 69 589 453 137;29;285;2 9;4;15;1;9;2;1;0;8;17;13;1;0;0;2;8;4;32;66;261 1IHF 1ihf_1_1 8980235 2.2 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein DNA Bending Integrator Host Factor 1 1 1 0 1, 1 0 1 0 0 0 2 1 1 1 A;B aLtkaEMSEYLFDKLGLSkRDAkELVELFFEEIRRALENGEQVkLsgfGnFDLrdknqrpgrnpkTgeDipitArRvvtFrpgqkLkSRVENASPK;MtkseLIeRLATQQSHIPaKTVEDAVkEMLEHMASTLAQGErIeirgFgsFsLhyraPrtgrnpkTGDKvElEGkYvPhFkPgkeLrDRANIYG C;D;E cGGTGCaacaaattgataagcaatgCTTTtttGGC;ggCCAAAAaagCAtt;GcttatcaattTGttgcaCC 63;64 8 472 29;87;354;2 9;0;13;0;0;3;1;1;35;8;14;0;0;0;0;1;1;30;82;274 1IPP 1ipp_1_1 9665136 2.2 PHYSARUM POLYCEPHALUM 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease I-PpoI 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B ALTNAQILAVIDSWEETVGQFPVITHHVPLGGGLQGTLHCYEIPLAapyGvgfaknGPtrWqYkrtINqVvHrwgShtVPFLLEPDNINGktctaShLChNtRCHNPLHLCwESldDnkGRnWCPGPNGGCVHAVVCLRQGplYGPGATVAGPQQRGSHFVV;ALTNAQILAVIDSWEETVGQFPVITHHVPLGGGLQGTLHCYEIPLAapyGvgfakngPtrWqYkrtiNqVvHrwgShtVPFLLEPDNINGktctaShLChNtRCHNPLHLCwESldDnkGRnWCPGPNGGCVHAVVCLRQGplYGPGATVAGPQQRGSHFVV C;D ttgactcTCttaagagagTCA;ttgactcTCttaagagagTCA 29 7 400 120;21;259;0 14;0;7;0;6;0;5;0;12;9;18;0;0;0;0;2;8;20;49;250 1J59 1j59_1_1 8757802 2.5 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Catabolite Gene Activator Protein 1 1 1 0 1, 1 0 2 0 0 0 2 1 2 1 A;B PTLEWFLSHCHIHKYPSkSTLIHQGEKAETLYYIVKGSVAVLIKDEEGkEMILSYLNQGDFIGELGLFEEGQERSAWVRAKTACEVAEISYKKFRQLIQVNPDILMRLSAQMARRLQVTSEKVGNLAFLdvtGrIAQTLLNLAKQPDAMTHPDGMQIkItrqEIGQIVgcsretVgriLkMLEDQNLISAhgKTIVVYG;PTLEWFLSHCHIHKYPsKSTLIHQGEKAETLYYIVKGSVAVLIKDEEGkEMILSYLNQGDFIGELGLFEEGQERSAWVRAKTACEVAEISYKKFRQLIQVNPDILMRLSAQMARRLQVTSEKVGNLAFLdvtGrIAQTLLNLAKQPDAMTHPDGMQIkItrqeIGQIVGcsretVgriLkMLEDQNLISAhgKTIVV C;D;E;F GCGAAAagtgtgaC;ATatgtcacACTtttcG;GCGAAAAgtgtgaC;ATatgtcaCACTtttcG 62 583 274 70;0;204;0 6;0;12;0;4;0;0;0;7;15;11;0;0;0;0;6;0;18;31;164 1JE8 1je8_1_1 12352954 2.12 ESCHERICHIA COLI 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Response Regulator Protein NARL 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B RDVNQLtprERDILKLIAQGLpnkIARRLDitestVkvhvkhlkKKlksrvEAAVWVHQERIF;RDVNQLtprERDILKLIAQGLpnkIARRLDitestVkvhvkhlkKKlksrvEAAVWVHQERIF C;D cgtaccCATTaatgggtACG;cgtaccCATTaatgggtACG 32 6 311 84;0;227;0 7;0;6;0;0;0;2;0;6;17;11;0;0;0;0;0;4;17;49;192 1JE8 1je8_2_1 12352954 2.12 ESCHERICHIA COLI 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Response Regulator Protein NARL 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 E;F ERDVNQLtprERDILKLIAQGLpnkIARRLDitestVkvhvkhlkKKlksrvEAAVWVHQERIF;RDVNQLtprERDILKLIAQGLpnkIARRLDitestVkvhvkhlkKKlksrvEAAVWVHQERIF G;H cgtacCCATTaatgggtACG;cgtaccCATTaatgggtACG 32 6 309 84;0;225;0 8;0;6;0;0;0;2;0;6;17;11;0;0;0;0;0;4;15;51;189 1JFT 1jft_1_1 11781089 2.5 ESCHERICHIA COLI 1 1 1 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Purine Repressor 1 1 1 2 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;D atikDVAKRAnvstttVshVinKtrfvaEEtRNAVWAAIKELHyspsAVarSlkvnHTKSIGLLATSSEAAYFAEIIEAVEKNCFQKGYTLILGNAWNNLEKQRAYLSMMAQKrVDGLLVMCSEYPEPLLAMLEEYRHIPMVVMDAGEAKADFTDAVIDNAFEGGYMAGRYLIERGHREIGVIPGPLERNTGAGRLAGFMKAMEEAMIKVPESWIVQGDFEPESGYRAMQQILSQPHRPTAVFCGGDIMAMGALCAADEMGLRVPQDVSLIGYDNVRNARYFTPALTTIHQPKDSLGETAFNMLLDRIVNKREEPQSIEVHPRLIERRSVADGPFRDYRR;atikDVAKRAnvstttVshVinKtrfvaEEtRNAVWAAIKELHyspsAVarSlkvnHTKSIGLLATSSEAAYFAEIIEAVEKNCFQKGYTLILGNAWNNLEKQRAYLSMMAQKrVDGLLVMCSEYPEPLLAMLEEYRHIPMVVMDAGEAKADFTDAVIDNAFEGGYMAGRYLIERGHREIGVIPGPLERNTGAGRLAGFMKAMEEAMIKVPESWIVQGDFEPESGYRAMQQILSQPHRPTAVFCGGDIMAMGALCAADEMGLRVPQDVSLIGYDNVRNARYFTPALTTIHQPKDSLGETAFNMLLDRIVNKREEPQSIEVHPRLIERRSVADGPFRDYRR B;E TacgcaAacgtttgCGT;TacgcaAacgtttgCGT 68 98 388 88;50;246;4 4;2;4;4;6;0;2;2;6;20;10;0;0;0;0;10;6;8;60;244 1JJ4 1jj4_1_1 10906136 2.4 HUMAN PAPILLOMAVIRUS TYPE 18 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Alpha|Beta Regulatory Protein E2 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B MTPIIHLKGdrnsLkcLryrLrKHSDHYRDISstWhWtKTGILTVTYHSETQRTKFLNTVaIpdsVQILVGYMT;HMTPIIHLKGdrnsLkcLryrLrkHSDHYRDISstWhWtEKTGILTVTYHSETQRTKFLNTVAIpDsVQILVGYMT C;D caacCGAAttcggtTG;caacCGAAttcggtTG 190 579 212 74;0;138;0 7;0;4;0;2;0;1;0;4;9;2;0;1;2;0;2;0;22;45;111 1JNM 1jnm_1_1 0 2.2 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, c-jun 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B kAERkrMrnrIaasksrKrklERIARLEEKVKTLKAQNSELASTANMLREQVAQLK;kAERkrMrnrIaasksrKrklErIARLEEKVKTLKAQNSELASTANMLREQVAQLKQ C;D CGtcgatgacgtcatCGACG;CGtcgatgacgtcatCGACG 104 576 221 85;0;136;0 5;0;7;0;4;0;0;0;5;6;6;0;0;0;0;6;5;24;33;120 1KBU 1kbu_1_1 12051940 2.2 BACTERIOPHAGE P1 1 1 1 1 0 0 1 Enzyme Recombinase Cre Recombinase 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 1 0 2 1 0 1 A;B ATSDEVRKNLMDMFRDRQAFSEhTWkmLLsVCrsWAAWCKLNNRKWFPAEPEDVRDYLLYLQArglaVktIQqhLGQLNMLHRRSGLPRPSDSNAVSLVMRRIRKENVDAGerakqALAFERTDFDQVRSLMENSDrCqDIrNLAFLGIAYNTLLrIAEIARIRVKDISRTDGGRMLIHIGrtktLvSTAGVEKALSLGVTKLVERWISVSGVADDPNNYLFCrvrkNGVAAPSATsqlsTraLeGIFEATHRLIYGAKDDSGQryLAWSGhSArVGAARDMARAGVSIPEIMQAGgwtnVNiVMnyIRNLDSETGAMVRLLED;TSDEVRKNLMDMFRDRQafsehtWkmLLsVCrsWAAWCKLNNRKWFPAEPEDVRDYLLYLQArglaVktIqqhLgqLnmLHrrSGLPrPsDSNAVsLVmrRIrkENVDAGeRakqaLAFERTDFDQVRSLMENSDrCqDIrNLAFLGIAYNTLLriaeIArIRVKDISRTDGGRMLIHIGrtktlVSTAGVEKALSLGVTKLVERWISVSGVADDPNNYLFCrvrknGvAAPSATsqlstraLeGIFeATHRLIYGAkDDSgqryLawsghSArVGAARDMARAGVSIPEIMQAGgwtnVniVMnyIRNLGAMVRLLED C;D ataagttcgtataatgtATGCTATACGAAGTTAT;ataacttcgtatagcatacattatacgaACttat 15 110 801 172;35;594;0 15;0;13;0;6;0;3;0;41;23;23;0;0;0;2;12;7;55;137;464 1L3L 1l3l_1_1 12087407 1.66 AGROBACTERIUM TUMEFACIENS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix TraR Activator 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;C QHWLDKLTDLAAIEGDECILKTGLADIADHFGFTGYAYLHIQHRHITAVTNYHRQWQSTYFDKKFEALDPVVKRARSRKHIFTWSGEHERPTLSKDERAFYDHASDFGIRSGITIPIKTANGFSFTASDKPVIDLDREIDAVAAAATIGQIHARISFLRTTPTAEDAAwLDPkEATYLRWiAVGKteeIADVEGVkynsVrvkLreAKRFDvrskAHLTALAIRRKLI;QHWLDKLTDLAAIEGDECILKTGLADIADHFGFTGYAYLHIQHRHITAVTNYHRQWQSTYFDKKFEALDPVVKRARSRKHIFTWSGEHERPTLSKDERAFYDHASDFGIRSGITIPIKTANGFSFTASDKPVIDLDREIDAVAAAATIGQIHARISFLAWLDPKEATYLRWiAVGKteEIADVEGVkynsVrvkLreAKRFDvrskAHLTALAIRRKLI F;H GAtgtgcAGAtctgcaCATC;GatgtgcAGAtctgcaCATC 77 108 203 73;0;130;0 5;0;15;0;0;0;0;0;6;6;4;0;0;0;0;2;0;17;25;123 1L3L 1l3l_2_1 12087407 1.66 AGROBACTERIUM TUMEFACIENS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix TraR Activator 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 B;D QHWLDKLTDLAAIEGDECILKTGLADIADHFGFTGYAYLHIQHRHITAVTNYHRQWQSTYFDKKFEALDPVVKRARSRKHIFTWSGEHERPTLSKDERAFYDHASDFGIRSGITIPIKTANGFSFTASDKPVIDLDREIDAVAAAATIGQIHARISFLRTTPTAEDAAwLDPkEATYLRWiAVGKteeIADVEGVkynsVrvkLreAKRFDvrskAHLTALAIRRKLI;QHWLDKLTDLAAIEGDECILKTGLADIADHFGFTGYAYLHIQHRHITAVTNYHRQWQSTYFDKKFEALDPVVKRARSRKHIFTWSGEHERPTLSKDERAFYDHASDFGIRSGITIPIKTANGFSFTASDKPVIDLDREIDAVAAAATIGQIHARISFLAWLDPKEATYLRWiAVGKteeIADVEGVkynsVrvkLreAKRFDvrskAHLTALAIRRKLI E;G GAtgtgcAGAtctgcaCATC;GatgtgcAGAtctgcaCATC 77 108 202 74;0;128;0 5;0;15;0;0;0;0;0;4;6;4;0;0;0;0;2;0;18;27;121 1LLI 1lli_1_1 8278404 2.1 BACTERIOPHAGE LAMBDA 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Lambda Repressor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B kkPlTQEQLEDARRLkAIyeKKkNELGLsqeSLADKLgmgqsgIgAlFnGinaLnAYnAALLAKILKVSVEEFSPSIAREIYEMYEAVS;stkkkPLTQEqLEDARRLkAIyeKKkNELGLsqeSLADKLgmgqsgIgalfnGinalnAYnAALLAKILKVSVEEFSPSIAREIYEMYEAVS D;E AataccACTggcggtgaTAT;TatatcaccgccagtggTAT 53 552 313 114;0;197;2 10;2;3;3;4;2;5;2;22;5;13;0;0;0;0;4;4;11;43;180 1LLM 1llm_1_1 14621985 1.5 MUS MUSCULUS AND SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zif268 Zinc Finger 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 C;D MkPFQCRICMrnfsrSdhLTthIrtHTGEkPfACDICGrkfarsderkrhRDiqHILPILEDKVEELLSKNYHLENEVARLKKLVGE;mkPFQCRICMrnfsrsdhLtthIrtHTGEkPfACDICGrkfarsderkrhRDiqHILPILEDKVEELLSKNYHLENEVARLKKLV A;B Tcccacgcgtggg;tcccacgcgtggg 180 551 345 111;13;221;0 8;0;15;3;10;0;0;1;11;12;3;0;0;0;0;9;2;24;37;210 1LMB 1lmb_1_1 1387915 1.8 BACTERIOPHAGE LAMBDA 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Lambda Repressor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 3;4 PlTQEQLEDARRLkAIyeKKkNELGLsqeSVADKMgmgqsgVgalFnGinaLnAYnAALLAKILKVSVEEFSPSIAREIYEMYEAVS;StkkkPLTQEQLEDARRLkAIyeKKkNELGLsqeSVADKMgmgqsgVgalfnGinalnAYnAALLAKILKVSVEEFSPSIAREIYEMYEAVS 1;2 AataccACTggcggtgaTAT;TatatcaccgCCagtggTAT 53 550 275 103;0;172;0 8;2;5;3;3;0;3;0;20;2;9;0;0;0;0;5;2;12;35;166 1LQ1 1lq1_1_1 12176382 2.3 BACILLUS SUBTILIS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Initiation Factor Spo0A 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B KKNLDASITSIIHEIGVpAhikgYLyLREAISMVYNDIELlgsitkVLyPDIAKKFNttAsrVeraIrhAIEvAWSrGNIDSISSLFAkptnsEFIAMVADKLRLEH;NLDASITSIIHEIGVpAhikgYLYLREAISMVYNDIELLGSITKVLYPDIAKKFNTTASrVEraIRhAIEvAWSrGNIDSISSLFAKPTNSEFIAMVADKLRL G;H TTcgtgtcGAATtttg;acAAAattcgaCACGA 88 549 248 62;0;186;0 1;0;6;0;3;0;0;0;0;8;11;0;0;0;0;5;1;12;51;150 1LQ1 1lq1_2_1 12176382 2.3 BACILLUS SUBTILIS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Initiation Factor Spo0A 2 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 C;D KNLDASITSIIHEIGVpAhikgYLyLREAISMVYNDIELLGSITKVLYPDIAKKFNTTASrVEraIRhAIEvAWSrGNIDSISSLFGYTKAKPTNSEFIAMVADKLRLEHKA;KNLDASITSIIHEIGVpAhikgYLyLREAISMVYNDIELlgsitkVLyPDIAKKFNttAsrVeraIrhAIEvAWSrGNIDSISSLFKAkptnsEFIAMVADKLRLEH E;F TTcgtgtcGAATtttg;ACAAAattcgaCACGA 88 548 240 70;0;170;0 2;0;6;0;2;0;1;0;2;8;11;0;0;0;0;6;1;14;50;137 1M5X 1m5x_1_1 12758074 2.25 MONOMASTIX SP. 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease I-MsoI 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B TLQPTEAAYIAGFLDgdgsIyakliprPdykDIKYqVslAIsFiqrKDkFPYLQDIYDQLGKRgnlrKdrGdGiAdYtIigsthLSIILPDLVPYLRIkKKQANRILHIINLyPQAqkNPSKFLDLVKIVDDvqNLnkrADeLKSTnYDRLLEEFLKAGKI;TLQPTEAAYIAGFLDgdgsIyakliprPdykDIKYqVslAIsFiqrKDkFPYLQDIYDQLGKRgnlrKdrgdGiAdYtIigsthLSIILPDLVPYLRIkKKQANRILHIINLyPQAqkNPSKFLDLVKIVDDvqNLnkrADeLKSTnYDrLLEEFLKAGKI C;D gcagaacgtcgtgagacagtTCCG;cggaactgtcTcacgacgttcTGC 82 540 603 203;0;400;0 14;6;18;1;14;0;0;0;21;10;14;0;0;0;0;7;6;32;114;346 1MA7 1ma7_1_1 12779336 2.3 BACTERIOPHAGE P1 1 1 1 1 1 0 1 Enzyme Recombinase Cre Recombinase 1 1 1 0 0, 0 0 0 1 0 0 2 1 2 1 A;B TSDEVRKNLMDMFRDRQafsEhtWkmLLsVCrsWAAWCKLNNRKWFPAEPEDVRDYLLYLQArglaVktIqqhLgqLnmLHrrSGLPrPSDSNAVSLVMRRIRKENVDAGERakqALAFERTDFDQVRSLMENSDrCqDIrNLAFLGIAYNTLLriaEIArIRVKDISRTDGGRMLIHIGrtktLvsTAGVEKALSLGVTKLVERWISVSGVADDPNNYLFCrvrknGVAAPSATsqlstraLeGIFeATHRLIYGAKDDSgqryLawsghSARVGAARDMARAGVSIPEIMQAGgwtnVNiVMNyIRNLDSETGAMVRLLED;SDEVRKNLMDMFRDRQafsehtWkmLLsVCrsWAAWCKLNNRKWFPAEPEDVRDYLLYLQArglaVktIqqhLgqLnmLHrrSGLPrPsDSNAVsLVmrRIrkENVDAGerakqaLAFERTDFDQVRSLMENSDrCqDIrNLAFLGIAYNTLLriaeIArIRVKDISRTDGGRMLIHIGrtktLVSTAGVEKALSLGVTKLVERWISVSGVADDPNNYLFCrvrknGVAAPSATsqlstraLeGIFeATHRLIYGAkDDSgQryLawsghSArVGAARDMARAGVSIPEIMQAGGwtnVniVMnyIRNGAMVRLLED C;D ataacttagtataatgtgctatactaAGttat;ataacttagtatagcatacattatactaAGttat 15 539 969 201;44;724;0 19;0;21;0;6;1;3;0;52;41;33;0;0;0;2;16;8;54;167;546 1MJ2 1mj2_1_1 10986458 2.4 ESCHERICHIA COLI 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Ribbon|Helix|Helix Methionine Repressor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B AEWSGEYISPYAEhgKksEQvKkitVsIPLKVlKILTDErTRRkVNNlrhatnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY;AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVLKILTDErTRRkVNNLRHAtnsELLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY F;G ttagacgTCTAGacgTCTA;TTAGACGTctagacGTCTA 17 536 183 33;1;149;0 4;2;2;0;3;0;0;0;7;9;17;0;0;0;0;1;2;14;15;107 1MJ2 1mj2_1_2 10986458 2.4 ESCHERICHIA COLI 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Ribbon|Helix|Helix Methionine Repressor 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 C;D AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVlKILTDErTRRkVNnlrhatnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKeRSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY;AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVLKILTDErTRRKVNNLRHAtnsELLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY F;G TTAGACGTCtagacgTCTA;ttagacgtCTAGacgTCTA 17 535 193 33;1;159;0 4;2;2;0;4;0;0;0;3;9;17;0;0;0;0;0;2;14;23;113 1MJM 1mjm_1_1 10986458 2.2 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Ribbon|Helix|Helix Methionine Repressor 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B AEWSGEYISPYaeHGKKSeQvkkitVsIPLKVLKILTDErTRRKVNNLRHAtnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY;AEWSGEYISPYaeHgKKsEQvKkitVsIPLKVLKILTDErTRRKVNNLRHAtnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY C;D gagacGtCTC;gagacgTCTC 17 534 127 32;0;95;0 4;2;2;0;4;0;0;0;5;7;7;0;0;0;0;1;2;8;10;75 1MJO 1mjo_1_1 10986458 2.1 ESCHERICHIA COLI 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Ribbon|Helix|Helix Methionine Repressor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVLKILTDErTRRkVNNlrhatnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY;AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVLKILTDErTRRkVNNLRHAtnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY F;G ttagacgtCATGacgTCTA;TTAGACGTcatgacgTCTA 17 107 195 33;1;161;0 3;2;1;0;4;0;0;0;5;8;18;0;0;0;0;1;2;16;21;114 1MJO 1mjo_1_2 10986458 2.1 ESCHERICHIA COLI 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Ribbon|Helix|Helix Methionine Repressor 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 C;D AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVLKILTDErTRRkVNnlrhatnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY;AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVLKILTDErTRRKVNNLRHAtnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY F;G TTAGACGTcatgacgTCTA;ttagacgTCATGacgTCTA 17 107 194 39;0;155;0 3;2;2;0;4;0;0;0;5;8;18;0;0;0;0;1;2;13;23;113 1MJQ 1mjq_1_1 10986458 2.4 ESCHERICHIA COLI 2 2 1 2 0 0 1 Transcription factor Ribbon|Helix|Helix Methionine Repressor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVlKILTDErTRRkVNnlrhatnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY;AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVLKILTDErTRRKVNNLRHAtnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY E;F ttagataTCTAGataTCTA;TTAGATATctagataTCTA 17 106 193 44;0;149;0 4;2;2;3;2;0;0;0;6;9;18;0;0;0;0;2;2;13;23;107 1MJQ 1mjq_1_2 10986458 2.4 ESCHERICHIA COLI 2 2 1 2 0 0 1 Transcription factor Ribbon|Helix|Helix Methionine Repressor 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 C;D AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVlKILTDErTRRkVNnlrhatnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKeRSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY;AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVLKILTDErTRRkVNNLRHAtnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY E;F TTAGATATctagataTCTA;ttagatATCTAGataTCTA 17 106 198 46;1;151;0 4;3;2;3;2;0;0;0;4;8;18;0;0;0;0;2;2;16;26;108 1MJQ 1mjq_2_1 10986458 2.4 ESCHERICHIA COLI 2 2 1 2 0 0 1 Transcription factor Ribbon|Helix|Helix Methionine Repressor 2 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 G;H AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVlKILtDErTRRkVNnlrhatnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY;AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVLKILTDErTRRKVNNLRHAtnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY K;L ttagatatCTAGataTCTA;TTAGATATctagataTCTA 17 105 186 46;0;140;0 4;2;2;3;2;0;1;0;7;9;18;0;0;0;0;2;2;14;25;95 1MJQ 1mjq_2_2 10986458 2.4 ESCHERICHIA COLI 2 2 1 2 0 0 1 Transcription factor Ribbon|Helix|Helix Methionine Repressor 2 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 I;J AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVlKILTDErTRRkVNnlrhatnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKeRSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY;AEWSGEYISPYAEhgKksEQvkkitVsIPLKVlKILTDErTRRkVNNLRHAtnseLLCEAFLHAFTGQPLPDDADLRKERSDEIPEAAKEIMREMGINPETWEY K;L TTAGATATctagataTCTA;ttagataTCTAGataTCTA 17 105 206 47;1;158;0 4;3;2;3;2;0;0;0;8;7;18;0;0;0;0;2;2;16;22;117 1MNM 1mnm_1_1 9490409 2.25 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 3 0 1 0 0 1 Transcription factor Alpha|Beta Transcriptional Regulator, MCM1 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B QkerrkiEiKFIENktrRhvtFskrKHgIMkkAFeLSVlTGTQVLLLVVSETGLVYTFSTPKFEPIVTQQEGRNLIQACLNAPDD;rrkiEIKFIENkTrRhvtfskrkhgIMkkAFeLSVlTGTQVLLLVVSEtGlVyTFSTPKFEPIVTQQEGRNLIQACLNAPD E;F gattacctaatagggaaATTTACACG;CCGTGTAaatttCCCTattaggtAAT 182 533 304 51;11;241;1 4;0;7;0;0;0;0;0;9;9;6;0;0;0;0;1;3;22;51;192 1N3E 1n3e_1_1 12758074 2.5 CHLAMYDOMONAS REINHARDTII 2 1 1 2 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease I-CreI 1 1 1 0 0, 0 0 2 0 0 0 2 1 2 1 A;B 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SPADSFLKVELELNLKLSNLVFQDPVQYVYNPLVYAWAPHENYVQTYCKSKKEVLFLGmNPGPFGMAQTGVPFGEVNHVRDWLQIEGPVSKPEVEHPKRRIRGFECPQSEVSGARFWSLFKSLCGQPETFFKHCFVHNHCPLIFMNHSGKNLtPtdLPkAQrDTLLEICDEALCQAVRVLGVKLVIGVgrfSEqRARKALMAEGIDVTVKGIMhPsPrnpqANKGWEGIVRGQLLELGVLSLLT;ESPADSFLKVELELNLKLSNLVFQDPVQYVYNPLVYAWAPHENYVQTYCKSKKEVLFLGMNPGPFGMAQTGVPFGEVNHVRDWLQIEGPVSKPEVEHPkrRIRGFECPQSEvSGArFWSLFKSLCGQPETFFKHCFVHNHCPLIFMnhsGkNLTPTDLPKAQRDTLLEICDEALCQAVRVLGVKLVIGVGRFSEQRARKALMAEGIDVTVKGIMHPSprNPQAnKGWEGIVRGQLLELGVLSLLT E;F cccGTGAgtccg;CGGACtacGGg 75 505 131 26;16;85;4 1;0;1;0;1;0;0;0;7;3;7;0;0;0;0;3;1;4;23;80 1OH6 1oh6_1_1 12907723 2.4 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein Repair Protein DNA Mismatch Repair Protein MutS 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B 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E;F agctgccaggcaccAgtG;acTggtgcgtggcagct 21 503 344 24;43;274;3 0;0;2;0;4;2;1;0;20;6;17;0;0;0;0;2;0;18;64;208 1OUZ 1ouz_1_1 12842466 2.41 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein DNA Bending Integrator Host Factor 1 1 1 0 1, 1 0 1 0 0 0 2 1 1 1 A;B aLtkaEMSEYLFDKLGLSkRDAkELVELFFEEIRRALENGEqVkLsgfGnFDLrdknqrpgrnpktgeDipiTArRvvtfrpgqklkSRVENASPK;MtksELIeRLATQQSHIPaKTVEDAVkEMLEHMASTLAQGErIairgFgsFsLhyraPrTGrnpkTGDKvElEGkYvPhfkPgkELrDRANIYG C;D;E cGGTGctacaaattgataagcaatgCTTttttGGC;ggCCAAAAaagCatt;GCttatcaattTGTagcaCC 63;64 8 464 33;89;338;4 7;0;12;1;0;2;1;1;35;8;20;0;0;0;0;1;0;29;85;262 1OWF 1owf_1_1 12842466 1.95 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein DNA Bending Integrator Host Factor 1 1 1 0 1, 1 0 1 0 0 0 2 1 1 1 A;B aLtkaEMSEYLFDKLGLSkRDAkELVELFFEEIRRALENGEQVkLsgfGnFDLrdknqrpgrnpktgedipiTArRvvtFrpgqkLkSRVENASPK;MtksELIeRLATQQSHIPaKTVEDAVkEMLEHMASTLAQGErIairgFgsFsLhyraPrTgrnpkTGDKvElEGkYvPhfkPgkeLrDRANIYG C;D;E cGGTGCaacaaattgataagcaatgCTTTtttGGC;ggCCAAAAaagCAtt;GCttatcaattTGttgcaCC 63;64 8 452 26;81;343;2 7;0;13;0;0;2;1;1;36;8;15;0;0;0;0;1;0;28;78;262 1OWG 1owg_1_1 12842466 2.1 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein DNA Bending Integrator Host Factor 1 1 1 0 1, 1 0 1 0 0 0 2 1 1 1 A;B aLtkaEMSEYLFDKLGLSkRDAkELVELFFEEIRRALENGEQVkLsgfGnFDLrdknqrpgrnpkTgeDipitArRvvtFrpgqkLkSRVENASPK;MtkseLIeRLATQQSHIPaKTVEDAVkEMLEHMASTLAQGErIeirgFgsFSLhyraPrTGrnpkTGDKvElEGkYvphfkPgkELrDRANIYG C;D;E cGGTGctacaaattgataagcaatgCTTttttGGC;ggCCAAAAaagCAtt;GCttatcaattTGTagcacC 63;64 8 461 29;88;341;3 7;0;12;0;0;2;1;1;35;7;15;0;0;0;0;1;0;35;85;260 1P47 1p47_1_1 12818197 2.2 MUS MUSCULUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zif268 Zinc Finger 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B ErPyACPVESCDrrfsrsdeLtrhIriHTGQkPfQCRICMrnfsrsdhLtthIrtHTGEkPfACDICGrkfarsderkrhTKiHLrq;rPYACPVESCDrrfsrsdeLtrhIriHTGQkPfQCRICMrnfsrsdhLtthIrtHTGEkPfACDICGrkfarsderkrhTkiHL C;D gtggcgtgggcggcgtgggcgt;cacgcccacgccgcccacgCCA 19 496 513 183;1;329;0 25;1;24;0;16;0;0;0;12;26;5;0;0;0;0;10;1;44;51;298 1P51 1p51_1_1 12853489 2.5 ANABAENA SP. 2 1 1 2 0 0 1 Structural|DNA Binding protein DNA Packaging Histone-like, HU Protein 1 1 1 0 2, 2 1 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B MNKGELVDAVAEKASVTKKQADAVLTAALETIIEAVSSGDKVTLVGFGSFESrerkaregrnpkTnEkmEipAtRvPAfsAGKLFrEKVAPP;MNKGELVDAVAEKASVTKKQADAVLTAALETIIEAVSSGDkVTLVGFGSFeSrerkaregrnpktnEkmEipAtRvPAfsAGKLFrEKVAPP E;F gCatatcaatttgttgCAT;GCatatcaatttgttgcAT 42 495 320 14;87;215;4 7;0;7;0;0;0;2;4;16;4;6;0;0;0;0;0;0;22;46;206 1P51 1p51_2_1 12853489 2.5 ANABAENA SP. 2 1 1 2 0 0 1 Structural|DNA Binding protein DNA Packaging Histone-like, HU Protein 2 1 1 0 2, 2 1 0 0 0 0 2 1 1 1 C;D MNKGELVDAVAEKASVTKKQADAVLTAALETIIEAVSSGDkVtLVGFGsFeSrerkaregrnpktnEkmEipAtRvPAfsaGkLFrEKVAPP;MNKGELVDAVAEKASVTKKQADAVLTAALETIIEAVSSGDkVTLVGFGSFeSrerkaregrnpkTnEkmEiPAtRvPAfsAGKLFrEKVAPP H;I gCatatcaatttgttgcAT;gCatatcaatttgttgcAT 42 494 326 14;90;218;4 10;0;7;0;0;0;2;3;17;5;6;0;0;0;0;0;0;28;45;203 1P71 1p71_1_1 12853489 1.9 ANABAENA SP. 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein DNA Packaging Histone-like, HU Protein 1 1 1 0 0, 0 1 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B MNKGELVDAVAEKASVTKKQADAVLTAALETIIEAVSSGDkVTLVGFGSFESrerkaregrnpktnEkmEiPAtRvPAfsAGKLFrEKVAPPKa;MNKGELVDAVAEKASVTKKQADAVLTAALETIIEAVSSGDkVTLVGFGSFESrerkaregrnpkTnEkmEiPAtRvPAfsAGkLFrEKVAPPK C;D tgCttatcaatttgttgcAC;tGCttatcaatttgttgcAc 42 492 330 17;83;227;3 7;0;5;0;0;0;2;5;21;2;4;0;0;0;0;0;0;28;56;200 1P78 1p78_1_1 12853489 2.25 ANABAENA SP. 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein DNA Packaging Histone-like, HU Protein 1 1 1 0 0, 0 1 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B MNKGELVDAVAEKASVTKKQADAVLTAALETIIEAVSSGDkVTLVGFGSFESrerkaregrnpktnEkmEipAtRvPAfsAGKLFrEKVAPP;MNKGELVDAVAEKASVTKKQADAVLTAALETIIEAVSSGDkVTLVGFGSFESrerkaregrnpktnEkmEipAtRvPAfsAGkLFrEKVAPP C;D tgCatatcaatttgttgcAC;tGCatatcaatttgttgcAcC 42 491 312 14;82;214;2 8;0;6;0;0;0;2;4;15;3;5;0;0;0;0;0;0;26;57;186 1PER 1per_1_1 8081737 2.5 BACTERIOPHAGE 434 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix 434 Repressor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 L;R SISSRVkSKrIQLGLnqaELAQKVGttqqsIeqLEnGktkrprfLPELASALGVSVDWLLNGT;SISSRVkSKrIQLGLnqaELAQKVgttqqsIeqLEnGktkrprfLPELASALGVSVDWLLNGT A;B AAgtacaGTTTttcttgtAT;TatacaAGAaaaactgtACT 60 489 291 98;5;188;0 7;0;8;0;4;0;1;0;22;14;12;0;0;0;0;15;2;15;22;169 1PVP 1pvp_1_1 14652076 2.35 BACTERIOPHAGE P1 1 1 1 1 0 0 1 Enzyme Recombinase Cre Recombinase 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 1 0 2 1 0 1 A;B TSDEVRKNLMDMFRDRQAFSEhTWkmLLsVCrsWAAWCKLNNRKWFPAEPEDVRDYLLYLQArglaVktIqqhLGQLNMLHRRSGLPRPSDSNAVSLVMRRIRKENVDAGerakqaLAFERTDFDQVRSLMENSDrCqDIrNLAFLGIAYNTLLrAAEIARIRVKDISRTDGGRMLIHIGrtktlvSTAGVEKALSLGVTKLVERWISVSGVADDPNNYLFCrvrkNGVAAPSATsqlsLsaLHGIFGATHRLIYGAKDDSgQryLAWSGhSArVGAARDMARAGVSIPEIMQAGgwtnVNiVMnyIRNLDSETGAMVRLLED;TSDEVRKNLMDMFRDRQafsEhtWkmLLsVCrsWAAWCKLNNRKWFPAEPEDVRDYLLYLQArglaVktIqqhLgqLnmLHrrSGLPrPsDSNAVsLVmrRIrkENvDAGerakqaLAFERTDFDQVRSLMENSDrCqDIrNLAFLGIAYNTLLraaeIArIRVKDISRTDGGRMLIHIGrtktLvSTAGVEKALSLGVTKLVERWISVSGVADDPNNYLFCrvrknGvAAPSATsqlslsaLhGIFGATHRLIYGAkDDSgqryLawsghSArVGAARDMARAGVSIPEIMQAGgwtnVNiVMNyIRTGAMVRLLED C;D ataactctatataatgATGCTATATAGAGTTAT;ataactctatatagcatacattatataGAGttat 15 482 758 153;34;571;0 13;0;12;2;5;0;3;0;46;22;24;0;0;0;2;10;9;43;121;446 1QAI 1qai_1_1 10669612 2.3 MOLONEY MURINE LEUKEMIA VIRUS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Polymerase Reverse Transcriptase 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 0 2 A;B TWLSDFPQAWAETGGMGLAVRQAPLIIPLKATSTPVSiKQyPMSQEARLGIKPHIQRLLDQGILVPCQSPWNTpLlpvkKPGTNDYRPvqdlreVnkRVEDIHPTVPNPYNLLSGLPPSHQWYTVLDLKDAFFCLRLHPTSQPLFAFEWRDPEMGISGQLTWTRLPQgFKNSPTLFDEALHRDLADFRIQHPDLILLQYVDDLLLAATSELDCQQGTRALLQTLGNLGYRASAKKAQICQKQVKYLGYLLK;TWLSDFPQAWAETGGMGLAVRQAPLIIPLKATSTPVSiKQypmSQEARLGIKPHIQRLLDQGILVPCQSPWNTPLlPvKKPGTNDYRPvqdlreVnkRVEDIHPTVPNPYNLLSGLPPSHQWYTVLDLKDAFFCLRLHPTSQPLFAFEWRDPEMGISGQLTWTRLPqgFKNSPTLFDEALHRDLADFRIQHPDLILLQYVDDLLLAATSELDCQQGTRALLQTLGNLGYRASAKKAQICQKQVKYLGYLLK C;D catgCAtg;catgCAtg 10 481 166 14;38;108;6 6;0;4;0;2;0;1;0;9;0;4;0;0;0;0;0;1;4;36;99 1QAJ 1qaj_1_1 10669612 2.3 MOLONEY MURINE LEUKEMIA VIRUS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Polymerase Reverse Transcriptase 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 0 2 A;B GSHMTWLSDFPQAWAETGGMGLAVRQAPLIIPLKATSTPVSIKQyPMSQEARLGIKPHIQRLLDQGILVPCQSPWNTPLlpvKKPGTNDYrPvqdlreVnkRVEDIHPTVPNPYNLLSGLPPSHQWYTVLDLKDAFFCLRLHPTSQPLFAFEWRDPEMGISGQLTWTRLPQgfkNSpTLFDEALHRDLADFRIQHPDLILLQYVDDLLLAATSELDCQQGTRALLQTLGNLGYRASAKKAQICQKQVKYLGYLLKEGQR;HMTWLSDFPQAWAETGGMGLAVRQAPLIIPLKATSTPVSiKQypmSQEARLGIKPHIQRLLDQGILVPCQSPWNTPLlPvKKPGTNDYRPvqdlreVnkRVEDIHPTVPNPYNLLSGLPPSHQWYTVLDLKDAFFCLRLHPTSQPLFAFEWRDPEMGISGQLTWTRLPqgFKNSPTLFDEALHRDLADFRIQHPDLILLQYVDDLLLAATSELDCQQGTRALLQTLGNLGYRASAKKAQICQKQVKYLGYLLKEGQR C;D catgCATG;CATGCAtg 10 480 79 11;17;49;2 4;0;3;0;1;0;0;0;3;0;2;0;0;0;0;0;1;2;14;49 1QPI 1qpi_1_1 10700280 2.5 ESCHERICHIA COLI 1 1 1 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Tetracyclin Repressor 1 1 1 2 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B lNRESVIDAALELLNETGIdglttrkLAQKLgieqptLywhVknkRALLDALAVEILARHHDYSLPAAGESWQSFLRNNAMSFRRALLRYRDGAKVHLGTRPDEKQYDTVETQLRFMTENGFSLRDGLYAISAVSHFTLGAVLEQQEHTAALENLPPLLREALQIMDSDDGEQAFLHGLESLIRGFEVQLTALLQ;lNRESVIDAALELLNETGIdglttrkLAQKLgieqptLywhVknkRALLDALAVEILARHHDYSLPAAGESWQSFLRNNAMSFRRALLRYRDGAKVHLGTRPDEKQYDTVETQLRFMTENGFSLRDGLYAISAVSHFTLGAVLEQQEHTAALENLPPLLREALQIMDSDDGEQAFLHGLESLIRGFEVQLTALLQ M;N;Q;R cctatCAAtgatAGA;tctatCATtgatAGG;cctatCAAtgatAGA;tctatCATtgatAGG 159 478 436 156;0;280;0 16;0;8;0;4;0;6;0;4;28;24;0;0;0;0;4;4;16;96;226 1QPS 1qps_1_1 0 2.5 ESCHERICHIA COLI 1 1 1 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRI 1 1 1 2 1, 1 0 2 0 0 0 2 1 1 1 A;B 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atikDVAKRAnvstttVshVInKtrfvaEEtRNAVWAAIKELHyspsAVarSlkvnHTKSIGLLATSSEAAYFAEIIEAVEKNCFQKGYTLILGNAWNNLEKQRAYLSMMAQKrVDGLLVMCSEYPEPLLAMLEEYRHIPMVVMDWGEAKADFTDAVIDNAFEGGYMAGRYLIERGHREIGVIPGPLERNTGAGRLAGFMKAMEEAMIKVPESWIVQGDFEPESGYRAMQQILSQPHRPTAVFCGGDIMAMGALCAADEMGLRVPQDVSLIGYDNVRNARYFTPALTTIHQPKDSLGETAFNMLLDRIVNKREEPQSIEVHPRLIERRSVADGPFRDYR;atikDVAKRAnvstttVshVInKtrfvaEEtRNAVWAAIKELHyspsAVarSlkvnHTKSIGLLATSSEAAYFAEIIEAVEKNCFQKGYTLILGNAWNNLEKQRAYLSMMAQKrVDGLLVMCSEYPEPLLAMLEEYRHIPMVVMDWGEAKADFTDAVIDNAFEGGYMAGRYLIERGHREIGVIPGPLERNTGAGRLAGFMKAMEEAMIKVPESWIVQGDFEPESGYRAMQQILSQPHRPTAVFCGGDIMAMGALCAADEMGLRVPQDVSLIGYDNVRNARYFTPALTTIHQPKDSLGETAFNMLLDRIVNKREEPQSIEVHPRLIERRSVADGPFRDYR M;Q TacgcaAacgtttgCGT;TacgcaAacgtttgCGT 68 98 398 96;42;256;4 6;0;2;4;6;0;2;2;10;16;14;0;0;0;0;8;6;8;68;246 1QRH 1qrh_1_1 0 2.5 ESCHERICHIA COLI 1 1 1 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRI 1 1 1 2 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SQGVIGIFGDYAKAHDLAVGEVSKLVKKALSNEYPQLSFRYRDSIKKTEINEALKKIDPDLGGTLFvsnssIkPdGGIVEVKDDYGEWRVVLVAEakhqgkDIINIRNGLLvgkRGDQDLmaagnaIekSHknISEIANFMLSESHFPYVLFLEGSNFLTENISITRPDGRVVNLEYnsgiLNrLdrLTAANYGMPINSNLCINKFVNHKDKSIMLQAASIYTQGDGREWDSKIMFEIMFDISTTSLRVLGRDLFEQLTSK;SQGVIGIFGDYAKAHDLAVGEVSKLVKKALSNEYPQLSFRYRDSIKKTEINEALKKIDPDLGGTLFvsnssIkPdGGIVEVKDDYGEWRVVLVAEakhqgkDIINIRNGLLvgkRGDQDLmaagnaIekSHknISEIANFMLSESHFPYVLFLEGSNFLTENISITRPDGRVVNLEYnsgiLNrLdrLTAANYGMPINSNLCINKFVNHKDKSIMLQAASIYTQGDGREWDSKIMFEIMFDISTTSLRVLGRDLFEQLTSK M;Q TcgcgaattcgCg;TcgcgaattcgCg 28 476 368 122;10;234;2 10;0;2;0;4;0;6;4;12;8;18;0;0;0;0;2;6;16;52;228 1R4O 1r4o_1_1 1865905 2.5 RATTUS NORVEGICUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Hormone Nuclear Receptor, Glucocorticoid Receptor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B MKPARPCLVCSdEAsgchyGVLTCgsCkvfFkrAVEGqhnyLCAGRNDCIIDkIRrkNCpACrYRKCLQAGMNlEarktk;MKPARPCLVCSdEAsgchyGVLTCgsCkvfFkrAVeGQHNyLCAGRNDCIIDkIRrkNCpACrYRKCLQAGMNlEarkTK C;D ccagaaCATcgatgtTCTG;CcagaACATCGatgttCTG 56 469 280 40;4;236;0 4;0;2;0;0;0;0;0;8;5;10;0;0;0;0;0;2;20;48;181 1R71 1r71_1_1 15170177 2.2 ESCHERICHIA COLI 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Alpha Helix Repressor KorB 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 1 2 1 1 1 A;B EADQVIENlQRnELTpREiADFIGRELAKGKkkgdIAkEIgkspafitqhvtLLDLPEKIADAFNTGrVrdvtVVneLVtAFkkRPEEVEAWLDDDTQEitrgTVkLLrEFLdE;YNEADQVIENlQRnELTpREiADFIGRELAKGKkkgdIAkEIgkspafitqhvtLLDLPEKIADAFNTGRVrdvtVVneLVtAFkkRPEEVEAWLDDDTQEitrgTVkLLrEFLDE E;F;I;J atttAgcggctaAAAG;ctttagccgctaaAA;ctttaGccgctAaAA;atttagcggctAAAAG 87 97 376 111;0;263;2 4;3;7;0;4;0;0;0;6;15;20;0;0;0;0;13;6;30;50;218 1R71 1r71_2_1 15170177 2.2 ESCHERICHIA COLI 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Alpha Helix Repressor KorB 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 1 2 1 1 1 C;D ADQVIENlQRnELTpREiADFIGRELAKGKkkgDIAKEIgkspafitqhvtLLDLPEKIADAFNTGrVrdvtVVneLvtAFkkRPEEVEAWLDDDTQEitrgTVkLLrEFLD;NEADQVIENlQRnELTpREiADFIGRELAKGKkkgDIAKEIgkspafitqhvtLLDLPEKIADAFNTGRVrdvtVVneLvtAFkkRPEEVEAWLDDDTQeitrgTVkLLrEFLdE G;H;K;L atttagcggctaaAAG;ctttAgccgctAAAA;atttagcggctaAAAG;ctttAGccgctAAAA 87 97 391 119;0;270;2 3;2;9;0;4;0;0;0;4;19;22;0;0;0;0;14;7;30;57;220 1R8E 1r8e_1_1 14985361 2.4 BACILLUS SUBTILIS 1 1 1 1 0 0 1 Transcription factor Alpha|Beta Activator MerR 1 1 1 2 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;D ESYYsigEVSKLANVsikaLryyDKIDLFKPAYVdPdtsyryYTDSQLIHLDLIKSLkYIGTpleEMKKAQDLEMEELFAFYTEQERQIREKLDFLSALEQTISLVKKRMKRQMEYPALGEVFVLDEEEIRIIQTEAEGIGPENVLNASYSKLKKFIESADGFTNNSYGATFSFQPYTSIDEMTYRHIFTPVLTNKQISSITPDMEITTIPKGRYACIAYNFSPEHYFLNLQKLIKYIADRQLTVVSDVYELIIPIHYSPKKQEEYRVEMKIRIA;ESYYsigEVSKLANVsikaLryyDKIDLFKPAYVdPdtsyryYTDSQLIHLDLIKSLkYIGTpleEMKKAQDLEMEELFAFYTEQERQIREKLDFLSALEQTISLVKKRMKRQMEYPALGEVFVLDEEEIRIIQTEAEGIGPENVLNASYSKLKKFIESADGFTNNSYGATFSFQPYTSIDEMTYRHIFTPVLTNKQISSITPDMEITTIPKGRYACIAYNFSPEHYFLNLQKLIKYIADRQLTVVSDVYELIIPIHYSPKKQEEYRVEMKIRIA B;E GAccctcCCCTtaggggAGGgtc;GAccctcCCCTtaggggAGGgtc 141 468 286 44;10;232;0 2;0;4;0;0;0;0;0;2;6;12;0;0;0;0;0;0;14;50;196 1RH6 1rh6_1_1 15066428 1.7 BACTERIOPHAGE LAMBDA 1 1 1 2 0 0 1 Enzyme Excisionase Excisionase Lambda 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B MYLTLqEWNARQrrpRsleTVrRWVRESRIFPPPVKDGreYLFHESAVKVDLNRP;MYLtlqEWNARQRrPrsletVrrwVreSrIFPPPVkdgreyLFHESAVkVdL C;D tatgtaGTCtgttg;CAacagactaCATA 105 467 204 33;11;160;0 2;0;7;0;3;0;0;0;9;3;6;0;0;0;0;3;0;22;17;132 1RIO 1rio_1_1 14731393 2.3 BACTERIOPHAGE LAMBDA, THERMUS AQUATICUS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Repressor Protein CI 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B stkkkPLTQEqLEDARRLkAIyeKKkNELglsqeSVADKggqsgVgalfnGinaLnAYnAALLAKILKVSVEEFSPSIAREIYEYEAVHHHHHH;stkkkPlTQEQLEDARRLkAIyeKKkNELGLsqeSVADKggqsgVgalFnGinaLnAYnAALLAKILKVSVEEFSPSIAREIYEYEAVHHHHH T;U CCATGTcaagcactggcggtgATACCG;CGgtatcaccgccagtgcTTGACATGG 53 466 284 110;0;173;1 10;2;5;1;4;0;4;0;20;3;15;0;0;0;0;4;4;14;37;161 1RPE 1rpe_1_1 8355273 2.5 BACTERIOPHAGE 434 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix 434 Repressor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 L;R SISSRVkSKrIQLGLnqaELAQKVGttqqsIeqLEnGktkrprfLPELASALGVSVDWLLNGT;SISSRVkSKrIQLGLnqaELAQKVgttqqsIeqLEnGktkrprfLPELASALGVSVDWLLNGT A;B ACaaacaagATacattgtAT;TatacaaTGTatcttgtTTG 60 463 290 90;5;195;0 10;0;10;0;5;0;0;0;18;12;12;0;0;0;0;11;1;11;30;170 1RV5 1rv5_1_1 9545372 2.1 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRV 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtkVLsTIFELFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKENEKIkFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTrVSSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsQLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK;SLRSDLINALDVCGIISAEGKIYPLGSDtkVLsTIFeLFSRPIINKIAEKHGYIVEEPkqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKIkFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTRVLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsqLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK C;D aaagatatctt;aaagatatctt 1 460 444 117;13;314;0 5;1;4;3;6;6;5;3;20;23;25;0;0;0;0;6;2;15;56;264 1RVA 1rva_1_1 7819264 2 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRV 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtkVLsTIFeLFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKENEKIkFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTrVATRKSSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIhAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsQLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK;SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtkVLsTIFeLFSRPIINKIAEKHGYIVEEPkqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKENEKIkFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTrVATRKSSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgntTnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsQLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK C;D aaagatatctt;aaagatatctt 1 39 460 109;21;330;0 7;1;8;2;4;6;4;2;23;20;22;0;0;0;0;6;2;26;58;269 1RVB 1rvb_1_1 7819264 2.1 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRV 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtkVLsTIFeLFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKENEKIkFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTrVATRKSSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsQLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK;SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtkVLsTIFeLFSRPIINKIAEKHGYIVEEPkqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKENEKIkFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVyTrVATRKSSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsQLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK C;D aaagatatctt;aaagatatctt 1 39 474 108;17;349;0 6;1;6;3;4;6;6;2;25;26;20;0;0;0;0;6;2;27;61;273 1RVC 1rvc_1_1 7819264 2.1 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRV 1 1 1 0 1, 1 0 2 0 0 0 2 1 1 1 A;B SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtkVLsTIFeLFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKENEKIkFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTrVATRKSSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsQLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK;SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtkVLsTIFeLFSRPIINKIAEKHGYIVEEPkqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKENEKIkFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTrVATRKSSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsQLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK C;D;E;F aaagat;atctt;aaagat;atctt 1 459 479 116;17;346;0 3;0;7;2;4;6;6;2;20;26;19;0;0;0;0;8;2;29;61;284 1STX 1stx_1_1 15170321 2.1 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRV 1 1 1 0 1, 1 0 2 0 0 0 2 1 1 1 A;B SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSdtaVLsTIFeLFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKENEKIkFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTrVATRKSSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsQLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK;SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtaVLsTIFeLFSRPIINKIAEKHGYIVEEpKqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKENEKIkFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTRVATRKSSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIhAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsQLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK C;D;E;F aaagat;atctt;aaagat;atctt 1 91 464 97;18;346;3 3;1;5;4;5;6;4;2;20;19;17;0;0;0;0;8;2;28;55;285 1SUZ 1suz_1_1 15170321 1.8 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRV 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B 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SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSdtaVLsTIFeLFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKENEKIKFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTRVATRKSSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsqLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK;SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSdtaVLsTIFeLFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNEKIkFtLggYtsfIRnNtknIVYPFDQYIAHWIIGYVyTRVKSSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsQLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK C;D;E;F aaagat;atctt;aaagat;atctt 1 91 473 97;21;354;1 4;1;5;2;5;7;4;2;20;24;21;0;0;0;0;8;3;23;63;281 1SX8 1sx8_1_1 15170321 2.15 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRV 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtkVLsTIFELFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdiattyTNKENEKIKFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVyTRVKSSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsqLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK;SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSdtkVLsTIFeLFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdiattyTnKIKFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVyTRVSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNYErtsQLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK C;D aagatatctt;caagatatct 1 90 416 96;23;296;1 4;0;4;5;4;6;4;2;13;20;17;0;0;0;0;6;2;16;54;259 1T3N 1t3n_1_1 15254543 2.3 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Polymerase DNA Polymerase Iota 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 1 2 1 2 1 A;B 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0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B NTKYNKEFLLYLAGFVDgngsIiaqikpnQsykFKHqlsLtFqVtqkTQrRWFLDKLVDEIGVgyVrdrGsvSDYiLseiKPLHNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKIIEQlPSAkESPDKFLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAVLDS;NTKYNKEFLLYLAGFVDgngsIiaqikpnQsykfKHqlSLtFqVtqkTQrRWFLDKLVDEIGVgyVrdrGsvSDYiLseikPLHNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKIIEQlPSAkESPDKfLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAVLDSLS C;D gcaaaacgtcgtgagacagtttCG;cgaaactgtctcacgacgtttTGC 4 428 661 185;19;457;0 14;8;19;5;12;0;0;0;21;9;31;0;0;0;0;3;3;13;112;411 1T9J 1t9j_1_1 15518550 2 CHLAMYDOMONAS REINHARDTII 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease I-CreI 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B TKYNKEFLLYLAGFVDgdgsiiaqikpnQsykFKHqlsLtFqVtekTQrRWFLDKLVDEIGVgyVrdrGsvSDYiLseiKPLHNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKIIEQlPSAkESPDKFLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAVLD;TKYNKEFLLYLAGFVDgdgsiiaqikpnQsykfKHqlSLtFqVtekTQrRWFLDKLVDEIGVgyVrdrGsvSDYiLseiKPLHNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKIIEQlPSAkESPDKFLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAVLD C;D gcaaaacgtcgtgagacagttTCG;cgaaactgtctcacgacgtttTGC 4 11 651 185;15;451;0 16;9;17;3;9;0;0;0;12;10;24;0;0;0;0;4;4;32;121;390 1TRO 1tro_1_1 3419502 1.9 ESCHERICHIA COLI 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Trp Repressor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;C SPYSAAMAEERHQEWLRFVDLLKNAYQNDLHLPLLNLMLtPdeREaLGtrVRIVEELLRGEmsqrELkNElgagiatItrGsnSLkAAPVELRQWLEEVLLKSD;AMAEERHQEWLRFVDLLKNAYQNDLHLPLLNLMLtPdeREaLGtrVRIVEELLRGEmsqrELknElgagiatItrGsnSLkAAPVELRQWLEEVLLKSD I;J tgtactAGTTaactagtaC;tgtacTAGTTaactagtaC 31 85 262 93;0;169;0 4;2;7;0;4;2;0;2;18;12;6;0;0;0;0;6;1;21;30;147 1TRO 1tro_2_1 3419502 1.9 ESCHERICHIA COLI 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Trp Repressor 2 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 E;G AEERHQEWLRFVDLLKNAYQNDLHLPLLNLMLtPdeREaLGtrVRIVEELLRGEmsqrELkNElgagiatItrGsnSLkAAPVELRQWLEEVLLKSD;SPYSAAMAEErHQEWLRFVDLLKNAYQNDLHLPLLNLMLtPdeREaLGtrVRIVEELLRGEmsqrELkNElgagiatItrGsnSLkAAPVELRQWLEEVLL K;L tgtactAGTTaactagtaC;tgtacTAGTTaactagtaC 31 85 261 86;0;175;0 4;2;7;0;2;3;0;2;13;13;6;0;0;0;0;6;2;22;24;155 1TRR 1trr_1_1 8232559 2.4 ESCHERICHIA COLI 2 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Trp Repressor 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B aqqsPySAAMAEQrHEEWLRFVDLLKNAYQNDLHLPLLNLMLtPdeREaLGtrVRIVEELLRgEmsqreLkNELgagiatItrGsnSLkAAPVELRQWLEEVLLK;aqqsPySAAMAEQrHEEWLRFVDLLKNAYQNDLHLPLLNLMLtpdeREaLGtrVRIVEELLRGEMSQRELKNELgagIatITrGSNSLKAAPVELRQWLEEVLLK C;I AGcgtactagtACGCT;AGcgtacTAGtacgct 31 21 283 51;8;224;0 3;1;3;0;0;3;1;1;17;14;6;0;0;0;0;3;1;17;39;174 1TRR 1trr_1_2 8232559 2.4 ESCHERICHIA COLI 2 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Trp Repressor 1 2 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 G;H aqqsPySAAMAEQrHEEWLRFVDLLKNAYQNDLHLPLLNLMLtPdeREaLGtrVRIVEELLRGEmsqreLkNELgagiatItrGsnSLkAAPVELRQWLEEVLLK;aqqsPySAAMAEQrHEEWLRFVDLLKNAYQNDLHLPLLNLMLtpdeREaLGtrVRIVEELLRGEMSQRELKNELgagIatITrGSNSLKAAPVELRQWLEEVLLK C;I AGcgtacTAGtacgct;AGcgtactagtACGCT 31 21 282 49;8;225;0 3;1;2;0;0;3;1;1;17;15;6;0;0;0;0;3;0;17;37;176 1TRR 1trr_2_1 8232559 2.4 ESCHERICHIA COLI 2 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Trp Repressor 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 D;E aqqsPySAAMAEQrHEEWLRFVDLLKNAYQNDLHLPLLNLMLtPdeREaLGtrVRIVEELLRgEmsqreLkNELgagiatItrGsnSLkAAPVELRQWLEEVLLK;aqqsPySAAMAEQrHEEWLRFVDLLKNAYQNDLHLPLLNLMLtpdeREaLGtrVRIVEELLRGEMSQRELKNELgagIatITrGSNSLKAAPVELRQWLEEVLLK F;L AGcgtactagtACGCT;AGcgtacTAGtacgct 31 21 284 52;8;224;0 3;1;3;0;0;3;1;1;17;14;6;0;0;0;0;3;1;17;41;173 1TRR 1trr_2_2 8232559 2.4 ESCHERICHIA COLI 2 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Trp Repressor 2 2 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 J;K aqqsPySAAMAEQrHEEWLRFVDLLKNAYQNDLHLPLLNLMLtPdeREaLGtrVRIVEELLRGEmsqreLkNELgagiatItrGsnSLkAAPVELRQWLEEVLLK;aqqsPySAAMAEQrHEEWLRFVDLLKNAYQNDLHLPLLNLMLtpdeREaLGtrVRIVEELLRGEMSQRELKNELgagIatITrGSNSLKAAPVELRQWLEEVLLK F;L AGcgtacTAGtacgct;AGcgtactagtACGCT 31 21 289 50;10;229;0 3;1;2;0;0;3;1;1;17;14;7;0;0;0;0;3;0;17;41;179 1TSR 1tsr_1_1 8023157 2.2 HOMO SAPIENS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet p53 Tumor Supressor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B 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SSSVPSQkTYQGSYGFRLGFLHSGTAKSVTCTYSPALNKMFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKqSqhMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCNSSCmGGMNrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVRVCACPGRDRRTEEEnL;SVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGTaksvTCTYSPALNKMFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnssCmGGMnrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcacPGrdRrtEEenL E;F TTTCCTAGACttgcccAATTA;ATAaTtgggCAagtcTAGGAA 8 83 138 31;5;102;0 4;1;6;1;1;0;0;0;16;2;4;0;0;0;0;2;1;11;15;74 1TX3 1tx3_1_1 15491133 2.5 HAEMOPHILUS INFLUENZAE 2 1 1 2 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease HincII 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 1 0 2 1 1 1 A;B 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10;0;6;0;0;0;2;0;6;18;11;0;0;0;0;1;4;15;45;185 1ZG5 1zg5_2_1 16262254 2.3 ESCHERICHIA COLI 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Response Regulator Protein NARL 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 E;F ERDVNQLtprERDILKLIAQGLpnkIARRLDitestVkvhvkhlkKKlksrvEAAVWVHQERIF;RDVNQLtprERDILKLIAQGLpnkIARRLDitestVkvhvkhlkKKlksrVEAAVWVHQERIF G;H cgtacCCCTAtaggggtACG;cgtacCCCTAtaggggtACG 32 6 304 79;0;225;0 10;0;6;0;0;0;2;0;7;17;11;0;0;0;0;0;4;15;49;183 1ZME 1zme_1_1 9303004 2.5 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating GAL4 Type, Put3 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 1 2 1 1 1 C;D svaCLSCrKrhikcPGGNPCQKCVTSNAICEYLEPSKkIvVStKYlqQLqKDLNDKTEENNRLKALLLER;svaCLSCrkrhikcPGGNPCQKCVTSNAICEYlepskkivvsTKyLQQLQKDLNDKTEENNRLKALLLER A;B AcggGAAGccaactccG;AcggAGtggctcccg 196 373 261 63;24;174;0 3;0;1;0;0;0;10;0;8;6;9;0;0;0;0;0;4;6;53;161 1ZRF 1zrf_1_1 16427082 2.1 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Catabolite Gene Activator Protein 1 1 1 0 2, 1 0 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3;1;3;1;3;0;0;0;6;3;4;0;0;0;0;4;2;12;18;64 1ZS4 1zs4_1_2 16039594 1.7 BACTERIOPHAGE LAMBDA 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Repressor Protein CII 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 1 0 2 1 2 1 C;D ANKRNEALRIESALLNKIaMLgtekTAEAVgvdksqIsrwkrdwIPKFSMLLAVLEWGVVDDDMARLARQVAAILTNKK;RNEALRIESALLNKIAMLGTEKTAEAVGVDKSqISrWKrdwIPkFSMLLAVLEWGVVDDDMARLARQVAAILT T;U TATtcgtgcaaACAAACGCAACGAGGT;TACCTCGTTGCGTTTgtttgcACGAat 96 369 147 58;2;87;0 4;1;4;0;2;0;0;0;8;4;5;0;0;0;0;6;2;12;26;73 2A07 2a07_1_1 16407075 1.9 HOMO SAPIENS 2 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Forkhead Box Protein P2 1 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 2 1 0 1 F;G VRPPFTYATLIRQAIMESSDRQLTLNEIYSWFTRTFAyFRrNAAtWKnaVrhnLslhKCFVRVENVKGAVWTVDEVEYQkrR;PftyaTLIRQAIMESSDRQLTLNEIYSWFTRTFAYFRRNAATWKNAVRHNLSLHKCFVRVENVKGAVWTVDEVEYQKRR A;B AACTAtgaaaCAAATTTTCCT;TTAGGAAAAtttgtttCATAG 55 78 94 26;0;68;0 2;0;2;0;0;0;0;0;3;3;2;0;0;0;0;2;0;5;9;66 2A07 2a07_2_1 16407075 1.9 HOMO SAPIENS 2 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Forkhead Box Protein P2 2 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 2 1 0 1 H;I PftyaTLIRQAIMESSDRQLTLNEIYSWFTRTFAYFRRNAATWKNAVRHNLSLHKCFVRVENVKGAVWTVDEVEYQKRR;VRPPFTYATLIRQAIMESSDRQLTLNEIYSWFTRTFAyFRrNAAtWKnaVrhnLslhKCFVrVENVKGAVWTVDEVEYQKr C;D AACTAtgaaACAAATTTTCCT;TTAGGAAAATttgtttCATAG 55 78 87 24;0;63;0 2;0;2;0;0;0;0;0;3;3;2;0;0;0;0;2;0;5;9;59 2AC0 2ac0_1_1 16793544 1.8 HOMO SAPIENS 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Loop Sheet Helix, Tumor Supressor Protein p53 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 1 0 2 1 1 1 A;B SSSVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGTaksvtCTYSPALNKMFCqLAkTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnssCmGGMnrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcacPGrdRRtEEEnLRKK;SSSVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGtaksVTCTYSPALNKMFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnSsCmGGMNrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcacPgrdRrtEEEnLRK E;F cgggCatgccCg;cgggCatgccCG 8 365 213 61;8;138;6 7;1;7;1;2;0;0;0;13;3;7;0;0;0;0;3;1;17;34;117 2AC0 2ac0_2_1 16793544 1.8 HOMO SAPIENS 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Loop Sheet Helix, Tumor Supressor Protein p53 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 C;D SVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGTaksVTCTYSPALNKMFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnssCmGGMnrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcacPGrdRrtEEEnLR;SVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGTaksvTCTYSPALNKMFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnSsCmGGMnrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcacPGrdRrtEEEnLRKKG G;H cgggCatgccCG;cgggCatgccCG 8 364 179 52;3;124;0 7;2;8;1;1;0;0;0;10;3;5;0;0;0;0;2;0;17;25;98 2ADY 2ady_1_1 16793544 2.5 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Loop Sheet Helix, Tumor Supressor Protein p53 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 1 0 2 1 1 1 A;B SSVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGTaksVTCTYSPALNKMFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnssCmGGMnrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcacPGrdRrtEEEnLRKK;SSSVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGtaksVTCTYSPALNKMFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnSsCmGGMNrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcacPGrdRrtEEenLRK E;F cggaCatgtcCG;cggaCatgtcCG 8 363 186 56;3;125;2 6;1;8;1;0;1;0;2;10;3;5;0;0;2;0;4;0;16;28;99 2AHI 2ahi_1_1 16793544 1.85 HOMO SAPIENS 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Loop Sheet Helix, Tumor Supressor Protein p53 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SSVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGTaksvtCTYSPALNKMFCqLAkTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHhERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnssCmGGMnrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcacPGrdRRtEEEnLRKKG;SSSVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGTakSVTCTYSPALNKMFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnssCmGGMnrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcacPGrdRRtEEEnLRK E;F cggaCatgtC;gGACatgtcCG 8 361 185 34;10;141;0 13;0;4;0;0;0;0;0;19;2;6;0;0;2;0;2;0;12;25;100 2AHI 2ahi_2_1 16793544 1.85 HOMO SAPIENS 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Loop Sheet Helix, Tumor Supressor Protein p53 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 C;D SVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGTaksvTCTYSPALNKMFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnssCmGGMnrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcacPGrdRRtEEEN;SVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGTaksVTCTYSPALNKMFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnssCmGGMnrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcacPGrdRrtEEEnLRK G;H cggaCatgtCCG;cggaCatgtcCG 8 360 191 56;10;125;0 12;2;8;1;1;0;0;0;16;2;8;0;1;2;0;3;0;13;23;99 2ATA 2ata_1_1 16793544 2.2 HOMO SAPIENS 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Loop Sheet Helix, Tumor Supressor Protein p53 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B 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SVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGTaksVTCTYSPALNKMFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnssCmGGMnrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcacPGrdRRtEEEnLRK;SSSVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGTaksVTCTYSPALNKMFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnssCmGGMnrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcacPGrdRrtEEENLRK G;H aaggCatgccTT;aaggCatgccT 8 352 177 50;7;120;0 8;2;5;1;4;0;0;0;6;3;4;0;0;0;0;2;0;13;26;103 2B0D 2b0d_1_1 16236314 2 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRV 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B 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SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSdtKVLsTIFELFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTKIKFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTRVLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsqLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK;SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtkVLsTIFELFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKKIkFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVyTRVSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsQLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK C;D aaagaatctt;aaagaatctt 1 350 397 91;14;292;0 6;1;4;1;4;6;4;2;17;27;18;0;0;0;0;8;0;14;49;236 2BAM 2bam_1_1 9783752 2 BACILLUS AMYLOLIQUEFACIENS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease BamHI 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B MEVEKEFITDEAKELLSKDKLIQQAYNEVKTSICSPIWPATSKTFTINNTEkNCNgvvPIkELCYTLLEDTYNWYReKPLDILkLEKKkggpIdVYKEFIENSELKRVGMefetgnIssAHrsMNkLLLGLKHGEIDLAIILMPIkqLAyyLtdrvTnFEeLEPyFELTEGQPFIFIGFNAEAYNSNVPLIpkgsdgmskRsikkwK;MEVEKEFITDEAKELLSKDKLIQQAYNEVKTSICSPIWPATSKTFTINNTEkNCNgvvPIkELCyTLLEDTYNWYReKPLDILKLEKKkggpIdVYKEFIENSELKRVGMefetgnIssAHrsMNkLLLGLKHGEIDLAIILMPIkQLAyYLtdrvTNFEeLEPyFELTEGQPFIFIGFNAEAYNSNVPLIPkgsDGmskRSIKkWKDKV C;D tatggatccaTA;tatggatccat 40 50 470 132;30;306;2 4;1;5;0;5;3;2;3;5;16;21;0;0;0;0;3;7;35;81;279 2BNW 2bnw_1_1 16528102 2.45 STREPTOCOCCUS PYOGENES 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Ribbon|Helix|Helix Omega Repressor 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B DIMGdktvrVRADLhHIIkIETAKNGGnvkeVMDQALEEYIRKYLPDKL;MAKKdImGdktvrVRADLhHIIkIETAKNGgnvkeVMDQALEEYIRKYLPDKL E;F GaatcaCAAatcACAAGC;CTTGTGATttgtgaTTCG 107 346 159 57;0;102;0 3;1;3;2;2;0;0;0;1;0;7;0;0;0;0;3;2;10;24;101 2BNW 2bnw_1_2 16528102 2.45 STREPTOCOCCUS PYOGENES 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Ribbon|Helix|Helix Omega Repressor 1 2 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 C;D MAKKDIMGdktvrVRADLhHIIkIETAKNGgnvkEVMDQALEEYIRKYLPDKL;MGdktvrVRADLhHIIkIETAKNGGnvkEVMDQALEEYIRKYLPDKL E;F GAATCACAaatcaCAAGC;CTtgtgaTTTgtGATTCG 107 345 154 61;0;93;0 3;1;3;2;2;0;0;0;4;0;8;0;0;0;0;3;2;10;28;88 2BOP 2bop_1_1 1328886 1.7 BOVINE PAPILLOMAVIRUS TYPE 1 1 1 1 1 0 0 1 Transcription factor Alpha|Beta Regulatory Protein E2 1 1 1 2 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;D SCFALISGtanqVkcyrfrVkknhRHRYENCTttWfTvAdNgaErQGQAQILITFGSPSQRQDFLKHVplppGmNISGFTASLDF;SCFALISGtanqVkcyrfrVkknhRHRYENCTttWfTvAdNgaErQGQAQILITFGSPSQRQDFLKHVplppGmNISGFTASLDF B;E ccgacCGACgtcggtcG;ccgacCGACgtcggtcG 183 344 328 78;0;250;0 8;0;4;0;4;0;0;0;12;6;8;0;4;2;0;2;0;18;60;200 2C7A 2c7a_1_1 16931575 2.5 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Hormone Nuclear Recpetor, Progesterone Receptor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B PQKICLICGdEAsgchyGVLTCgsCkvfFkrAMEGQhNyLCAGRNDCIVDkIRrkNCpACrLRKCCQAGMVlggrkFK;PQKICLICGdEAsgchyGVLTCgsCkvfFkrAMEGQHNyLCAGRNDCIVDKiRrkNCpACrLRKCCQAGMVLggrKF C;D ccagaaCAGTttgttCTg;ccagaaCAAActgttCTg 56 338 268 56;8;204;0 5;0;12;0;0;0;0;0;10;0;12;0;0;0;0;2;2;22;37;166 2C9L 2c9l_1_1 16483937 2.25 HUMAN HERPESVIRUS 4 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, BZLF1 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 Y;Z MlEIkrYknrVaarksrAkfkQLLQHYREVAAAKSSENDRLRLLLKQMCPSLDVDSIIPRTPD;LEiKrYknrVaarksrAkFkQLLQHYREVAAAKSSENDRLRLLLKQMCPSLDVDSIIPRTPD A;B AAGCactgactcatGAAGT;ACTtcatgagtcaGTGCT 199 334 187 65;0;122;0 4;0;5;0;4;0;0;0;1;4;1;0;0;0;0;4;4;24;38;98 2CRX 2crx_1_1 9670032 2.5 BACTERIOPHAGE P1 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Recombinase Cre Recombinase 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 1 0 2 1 0 1 A;B TSDEVRKNLMDMFRDRQAFSehTWkmLlsVCrsWAAWCKLNNRKWFPAEPEDVRDYLLYLQArglaVktIQqhLGQLNMLHRRSGLPRPSDSNAVSLVMRRIRKENVDAGERakQALAFERTDFDQVRSLMENSDrCqDIrNLAFLGIAYNTLLrIAEIARIRVKDISRTDGGRMLIHIGEKALSLGVTKLVERWISVSGVADDPNNYLFCrvrkNGVAAPSATsqlsTraLEGIFEATHRLIYGAyLAWSGhSArVGAARDMARAGVSIPEIMQAGgwtnVNiVMNyIRNLDSETGAMVRLLED;TSDEVRKNLMDMFRDRQafsEhtWkmLLsVCrsWAAWCKLNNRKWFPAEPEDVRDYLLYLQArglaVktIqqhLgqLnmLHrrSGLPrPsDSNAVsLVMrRIrKENVDAGeRakqaLAFERTDFDQVRSLMENSDrCqDIrNLAFLGIAYNTLLriaEIArIRVKDISRTDGGRMLIHIGAGVEKALSLGVTKLVERWISVSGVADDPNNYLFCrvrknGVAAPSATsqlstraLeGIFeATHRLIYGAkDDSgqryLawsghSArVGAARDMARAGVSIPEIMQAGgwtnVniVMnyIRGAMVRLLED C;D TataacttcgtatagcaTATGCTATACGAAGTTAT;ataacttcgtatagcatatgctatacgaAGttat 15 332 704 170;28;504;2 11;0;14;0;1;0;2;0;34;27;20;0;0;0;2;12;5;47;116;413 2DGC 2dgc_1_1 7500340 2.2 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 1 1 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, GCN4 1 1 1 2 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;D ALkrArntEaarrsrArklQrMKQLEDKVEELLSKNYHLENEVARLKKL;ALkrArntEaarrsrArklQrMKQLEDKVEELLSKNYHLENEVARLKKL B;E TGGAgatgacgtcaTCTCC;TGGAgatgacgtcaTCTCC 206 329 172 62;0;110;0 6;0;2;0;4;0;0;0;6;6;0;0;0;0;0;6;4;42;26;70 2E1C 2e1c_1_1 18073105 2.1 PYROCOCCUS HORIKOSHII 1 1 1 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Transcriptional Regulator PH1519 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A PLDEIDKKIIKILQNDGkaplrEISKITglaestIherIrkLRESGVIKKFTAIIDPEALGYSMLAFILVKVKAGKYSEVASNLAKYPEIVEVYETTGDYDMVVKIRTKNSEELNNFLDLIGSIPGVEGTHTMIVLKTHKETTELPI B;D agtgaaAATTttTCACA;TGTGAAAAAttttcACT 226 322 97 43;0;54;0 0;1;0;1;2;0;0;1;0;1;2;0;0;0;0;6;2;4;24;53 2E42 2e42_1_1 0 1.8 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, C|EbpBeta 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B DkHSDeyKIrrErnnIaarksrdkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFK;DkHSDEyKIrrernnIaarksrDkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQL C;D TaggattgcgcaaTAT;aatattgcgcaaTCCT 23 321 232 95;0;137;0 8;0;7;0;2;0;0;0;11;5;0;0;0;0;0;4;5;29;33;128 2E43 2e43_1_1 0 2.1 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, C|EbpBeta 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SDeyKirrErnnIavrksrdkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFK;SDEyKIrrernnIavrksrDkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQL C;D TAggattgcgcaaTAT;aatattgcgcaaTCCT 23 24 245 107;0;138;0 8;0;8;0;2;0;0;0;9;4;0;0;0;0;0;4;5;25;37;143 2E52 2e52_1_1 0 2 HAEMOPHILUS INFLUENZAE 3 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease HindIII 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B KKSALEKLLSLIENLTNqefkQATNSLISFIYKLNRNEVIELVRSIGIlPEAIKpsstQekLFskAGdIVLAKAFQLLNLNSKPLeQrgnaGdVIALSKEFNYGLVAdaksfrLsrtaknqkdFkVKALSEwREDKDYAVLTAPFFQYpttksqIFKQSLDENVLLFSWEHLAILLQLDLEETNIFSFEQLWNFPKKQSKKTSVSDAeNNFMRDFNKYFMDLFKIDKDTLNQLLQKEINFIEERSLIEKEYWKKQINIIKNFTREEAIEALLkdInMSskIETIDSFIKGIKSNDRLYL;KSALEKLLSLIENLTNqefkQAtNSLISFIYKLNRNEVIELVRSIGIlPEAIkpsstQekLFskAGDIVLAKAFQLLNLNSKPLeqrgnaGdVIALSKEFNYGLVAdaksfrLsrtaknqkdFkVKALSEwREDKDYAVLTAPFFQYpttksqIFKQSLDENVLLFSWEHLAILLQLDLEETNIFSFEQLWNFPKKQSKKTSVSDAeNNFMRDFNKYFMDLFKIDKDTLNQLLQKEINFIEERSLIEKEYWKKQINIIKNFTREEAIEALLKdInMSskIETIDSFIKGIKSNDRLYL E;G gccaagcttggc;gccaagcttggc 70 71 611 94;43;472;2 10;2;8;2;11;0;0;0;23;24;30;0;0;0;0;6;4;30;100;361 2E52 2e52_2_1 0 2 HAEMOPHILUS INFLUENZAE 3 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease HindIII 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 C;D KKSALEKLLSLIENLTNqEfkQAtNSLISFIYKLNRNEVIELVRSIGIlPEAIKpsstQekLFskAGDIVLAKAFQLLNLNSKPLeqrgnaGdVIALSKEFNYGLVAdaksfrLsrtaknqkdFkVKALSEwREDKDYAVLTAPFFQYpttksqIFKQSLDENVLLFSWEHLAILLQLDLEETNIFSFEQLWNFPKKQSKKTSVSDAeNNFMRDFNKYFMDLFKIDKDTLNQLLQKEINFIEERSLIEKEYWKKQINIIKNFTREEAIEALLKdinMSskIETIDSFIKGIKSNDRLYL;KSALEKLLSLIENLTNQEfkQATNSLISFIYKLNRNEVIELVRSIGIlPEAIkpsstQekLFskAGdIVLAKAFQLLNLNSKPLeqrgnaGdVIALSKEFNYGLVAdaksfrLsrtaknqkdFkVKALSEwREDKDYAVLTAPFFQYpttksqIFKQSLDENVLLFSWEHLAILLQLDLEETNIFSFEQLWNFPKKQSKKTSVSDAeNNFMRDFNKYFMDLFKIDKDTLNQLLQKEINFIEERSLIEKEYWKKQINIIKNFTREEAIEALLKDInMSskIETIDSFIKGIKSNDRLYL F;H gccaagcttggc;gccaagcttggc 70 71 605 93;44;466;2 9;2;7;2;10;0;0;0;24;26;30;0;0;0;0;6;4;29;99;357 2EFW 2efw_1_1 17521668 2.5 BACILLUS SUBTILIS 2 1 1 2 0 0 1 Structural|DNA Binding protein Replication Replication Termination Protein 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B stGFLVkqrAFLKLYMITMTEQERLyglKLLEVLRSEFKEIGFKPnhteVyrSLheLLDDGILKqIkVKkEgAklqevvLyQFKDYEAAKLYKKQLKVELDRSKKLIEKALSDNF;stGfLVkqrAFLKLYMITMTEQERLYGlkLlEVLRSEFKEIGFKPnhtevyrSlhELLDDGILKqIKVKKEGAKLQEVVLyQFKDYEAAKLYKKQLKVELDRSKKLIEKALSDNF D;E atgtaCCAAatgttcAGtc;gactgaaCATTtggtacAT 51 319 319 91;12;215;1 6;1;6;2;1;0;0;0;15;3;10;0;0;0;0;3;0;16;66;190 2EFW 2efw_2_1 17521668 2.5 BACILLUS SUBTILIS 2 1 1 2 0 0 1 Structural|DNA Binding protein Replication Replication Termination Protein 2 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 F;G stGFLVkqrAFLKLYMITMTEQERLyglKLLEVLRSEFKEIGFKpnhteVyrSLheLLDDGILKqIkVKkEGAklqevvLyQFKDYEAAKLYKKQLKVELDRSKKLIEKALSDNF;stGFLVkqrAFLKLYMITMTEQERLYGlklleVLRSEFKEIGFKPnhteVyrSLHELLDDGILKQIKVKEVVLYQFKDYEAAKLYKKQLKVELDRSKKLIEKALSDNF I;J atgtaCCAAatgttCAGtc;GactgaacATttggtaCAT 51 318 284 78;6;198;2 3;2;8;1;1;0;0;0;20;4;13;0;0;0;0;1;0;15;42;174 2EX5 2ex5_1_1 16698548 2.2 CHLAMYDOMONAS EUGAMETOS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease I-CeuI 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B ILKpgEKLPQDKLEELkKIndAVkKTkNFSKYLIDLRKLFQIDEVQVTSESKLFLAGFLEgeasLnistkklAtskFGLvVdPeFnVtrhVNGVKVLYLALEVFKtGrIrhksgsnAtLvLtIdnrqSLEEKVIPFYEQYVVAFSSPEkVKrVANFKALLELfNNdAhqDLEQLVNKILPIwDQmrkqQGqsnegFPNLEAAQDFAR;ILKpgEKLPQDKLEELkKIndAVkKTkNFSKYLIDLRKLFQIDEVQVTSESKLFLAGFLEgeasLnistkklAtskFGLvvdPeFnVtrhVNGVKVLYLALEVFKTGrIrhksGsnatLvLtIdnrqSLEEKVIPFYEQYVVAFSSPEkVKrVANFKALLELfNNDAhqDLEQLVNKILPIwDQmrkqQgqsnegfPNLEAAQDFAR X;Y CgataacggtcctaaggtagcgaagC;GcttcgctaccttaggaccgttatcG 155 317 682 163;18;501;0 8;5;8;0;15;0;3;0;26;15;32;0;0;0;0;12;6;50;100;402 2EZV 2ezv_1_1 16308566 2.4 1 1 1 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease SfiI 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B MHQDYRELSLDELESVEKQTLRTIVQALQQYSKEAKSIFETTAADssGEviVLAeDITQYALEVAETYPINRRFAGfIdYKRVRWLPSPHGLLPQVLLVdakasteKnrDtLqRsqLPMDAEfrntssGEVVTMEAGVIPHLMLQSANDGVLPAVTTSIFVHFYyReLKEGRYRELKSIYVLSLPHARLKQRYNPDPDTSFFgagkhsparGevArIrVyFDrLKEACPWRLQELHYSADSEYTQPRWRDLNDAGHEVTKEFLFLER;MHQDYRELSLDELESVEKQTLRTIVQALQQYSKEAKSIFETTAAdssgEvivLaeDITQYALEVAETYPINRRFAGfIdYKRVRWLPSPHGLLPQVLLVdakasteKnRDtLqRsqLPMDAEfrntsSGEVVTMEAGVIPHLMLQSANDGVLPAVTTSIFVHFYyReLKDVEGRYRELKSIYVLSLPHARLKQRYNPDPDTSFFGagkhsparGevArIrVyFdrLKEACPWRLQELHYSADSEYTQPRWRDLNDAGHEVTKEFLFLER F;G tggccaacaaggccT;aggccttgttggcCA 144 316 452 140;3;307;2 18;0;11;0;10;0;4;0;11;24;18;0;0;0;0;8;3;18;48;279 2FKC 2fkc_1_1 16473850 2.39 HAEMOPHILUS INFLUENZAE 2 1 1 2 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease HinP1I 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A MNlvElgsKtakdgfKNeKDIADRFENWKENSEAQDWLVTMGHNLDEIKSVKAVVLsgykSdINVQVLVFYKDALDIHNIqvklvsnKrgfnqidkhwLAhYQEMWKFDDNLLRILRHFTGELPPYHSNTKdKrrMfMTEFSQEEQNIVLNWLEKNRVLVLTDILRGRGDFAAEWVLVAQKVSNNARWILRNINEVLQHYGSGDISLsprGsInFGRVtIqrkggdngrEtANMLqFkIDPTELFDI C;D ccagcgctgg;ccagcgctgg 111 307 400 93;25;280;2 6;0;8;0;4;2;3;0;21;9;15;0;0;0;0;2;3;11;63;253 2FKC 2fkc_2_1 16473850 2.39 HAEMOPHILUS INFLUENZAE 2 1 1 2 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease HinP1I 2 1 1 0 0, 0 1 0 0 0 0 2 1 1 1 B MnlvElgsktakdgfKnekDIADRFENWKENSEAQDWLVTMGHNLDEIKSVKAVVLsgykSdINVQVLVFYKDALDIHNIqvklvsnKrgfnqidkhwLAHYQEMWKFDDNLLRILRHFTGELPPYHSNTKdKrrMfMTEFSQEEQNIVLNWLEKNRVLVLTDILRGRGDFAAEWVLVAQKVSNNARWILRNINEVLQHYGSGDISLsprGsInFGRVtIqrkggdngrEtANmLqFkIDPTELFDI E;F CCagcgctgg;ccagcgctgg 111 306 394 88;32;272;2 6;0;8;0;3;2;3;0;18;10;16;0;0;0;0;2;3;18;68;237 2FLD 2fld_1_1 16738662 2 MONOMASTIX SP. 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease I-MsoI 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B TLQPTEAAYIAGFLDgdgsiyalliprPdyKDIKYqvSLAIsFiqrKDkFPYLQDIYDQLGKRgnlrKdrgdGiAdYrIigsthLSIILPDLVPYLRIkKKQANRILHIINLyPQAqkNPSKFLDLVKIVDDvqNLnkrADeLKSTnYDRLLEEFLKAGKI;TLQPTEAAYIAGFLDgdgsiyalliprPdykDIKYqVslAIsFiqrKDkFPYLQDIYDQLGKRgnlrKdrgdGiAdYrIigsthLSIILPDLVPYLRIkKKQANRILHIINLyPQAqkNPSKFLDLVKIVDDvqNLnkrADeLKSTnYDrLLEEFLKAGKIES C;D gcagaaggtcGtgagaccgttCCG;cggaacggtcTcacgaccttcTGC 82 304 597 205;0;392;0 19;4;21;0;12;0;0;0;24;10;11;0;0;0;0;6;6;34;103;347 2FQZ 2fqz_1_1 16628220 2 ENTEROBACTER CLOACAE 2 1 1 2 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRII 1 1 1 0 0, 0 1 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B 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LSPGEFkTLisKErkSHfITpFALVYKTFCDLGYDQKNSDYFLNNPSEYIIAMrKNcwKEFEPFEKEFTTRMLSYLIDEERIKDMSPYDAIRDFTMEYPTHIyDLAlsNtqsrrsragkeFeSILELLMMGAGIPVDVQGAIIGklVdLVMPGVVQYTSNKRNTMLIsakttLrerwqeVPEeVNRTGIREMYLATLDDSFsEetINILYEANVVVVTTVENKNFKYKNNNRVLTFEDMLQSAMELSRKWNNVSYTDSEKEEIQQSILKQIEKYSDFPYVVNYYRNRLSALF;LSPGEFKTLISKErkSHfITpFALVYKTFCDLGYDQKNSDYFLNNPSEYIIAMrKNcwKEFEPFEKEFTTRMLSYLIDEERIKDMSPYDAIRDFTMEYPTHIyDLAlSNtqsrrsraGkeFeSILELLMMGAGIPVDVqGAIIGklVdLVMPGVVQYTSNKRNTMLISakttLrerwqeVPEeVNRTGIREMYLATLDDSFsEetINILYEANVVVVTTVENKNFKYKNNNRVLTFEDMLQSAMELSRKWNNVSYTDSEKEEIQQSILKQIEKYSDFPYVVNYYRNRLSALF G;H cgcCagGGc;gcCCtgGcg 39 18 389 92;46;248;3 7;3;1;2;4;1;3;2;16;19;9;0;0;0;0;4;0;11;72;235 2GB7 2gb7_1_1 16628220 1.7 ENTEROBACTER CLOACAE 2 1 1 2 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease Ecl18kI 1 1 1 0 0, 0 1 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B RLSPGEFkTLIsKErKSHfITpFALVYKTFCDLGYDQKNSDYFLNNPSEYIIAMrKNcwKEFEPFEKEFTTRMLSYLIDEERIKDMSPYDAIRDFTMEYPTHIyDLAlsNtqsrrsragkeFeSILELLMMGAGIPVDVQGAINQIGklVdLVMPGVVQYTSNKRNTMLIsakttLrerwqeVPEEVNRTGIREMYLATLDDSFsEetINILYEANVVVVTTVENKNFKYKNNNRVLTFEDMLQSAMELSRKWNNVSYTDSEKEEIQQSILKQIEKYSDFPYVVNYYRNRLSA;RLSPGEFKTLIsKErkSHfITpFALVYKTFCDLGYDQKNSDYFLNNPSEYIIAMrKNcwKEFEPFEKEFTTRMLSYLIDEERIKDMSPYDAIRDFTMEYPTHIyDLAlSNtqsrrsraGkeFeSILELLMMGAGIPVDVQGAIQIGklVdLVMPGVVQYTSNKRNTMLISakttLrerwqeVPEeVNRTGIREMYLATLDDSFsEEtINILYEANVVVVTTVENKNFKYKNNNRVLTFEDMLQSAMELSRKWNNVSYTDSEKEEIQQSILKQIEKYSDFPYVVNYYRNRLSALFD E;F cgcCagGGc;gcCCtgGcg 39 18 395 96;45;248;6 7;2;1;3;4;1;2;1;14;21;8;0;0;0;0;4;0;11;83;233 2GB7 2gb7_2_1 16628220 1.7 ENTEROBACTER CLOACAE 2 1 1 2 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease Ecl18kI 2 1 1 0 0, 0 1 0 0 0 0 2 1 1 1 C;D LSPGEFkTLIsKErkSHfITpFALVYKTFCDLGYDQKNSDYFLNNPSEYIIAMrKNcwKEFEPFEKEFTTRMLSYLIDEERIKDMSPYDAIRDFTMEYPTHIyDLAlsNtqsrrsragkeFeSILELLMMGAGIPVDVQGAIQIGklVdLVMPGVVQYTSNKRNTMLIsakttLrerwqeVPEeVNrTGIREMYLATLDDsFsEEtINILYEANVVVVTTVENKNFKYKNNNRVLTFEDMLQSAMELSRKWNNVSYTDSEKEEIQQSILKQIEKYSDFPYVVNYYRNRLSALF;LSPGEFKTLISKErkSHfITpFALVYKTFCDLGYDQKNSDYFLNNPSEYIIAMrKNcwKEfEPFEKEFTTRMLSYLIDEERIKDMSPYDAIRDFTMEYPTHIyDLAlSNtqsrrsraGkeFeSILELLMMGAGIPVDVQGAIIGklVdLVMPGVVQYTSNKRNTMLISakttLrerwqeVPEeVNRTGIREMYLATLDDSFsEetINILYEANVVVVTTVENKNFKYKNNNRVLTFEDMLQSAMELSRKWNNVSYTDSEKEEIQQSILKQIEKYSDFPYVVNYYRNRLSALF G;H cgcCagGGc;gcCCtgGcg 39 18 396 95;53;244;4 7;3;2;3;4;1;2;2;15;17;8;0;0;0;0;4;0;13;76;239 2GE5 2ge5_1_1 16981705 2.4 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRV 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtkVLsTIFELFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKENEKIKFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTRVATRKSSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNye;SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtkVLsTIFELFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKENEKIkFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTrVATRKSSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNye C;D Aaagatatctt;aaagatatctt 153 299 427 101;22;302;2 4;2;6;4;5;4;5;2;24;20;13;0;0;0;0;5;2;11;49;271 2GEQ 2geq_1_1 16717092 2.3 MUS MUSCULUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Loop Sheet Helix, Tumor Supressor Protein p53 1 1 1 0 2, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B QKTYQGNYGFHLGFLQSvMCTYSPPLNKLFCQLAKTCPVQLWVSATPPAGSRVRAMAIYKKSQHMTEVVRRCPHHERCSDGDGLAPPQHLIRVEGNLYPEYLEDRQTFRHSVVVPYEPPEAGSEYTTIHYKYMCnssCmGGMNrRPILTIITLEDSSGNLLGRDSFEVrvcacPGrdRrtEEEnFRKK;QKTYQGNYGFHLGFLQSVmCTYSPPLNKLFCQLAKTCPVQLWVSATPPAGSRVRAMAIYKKSQHMTEVVRRCPhhERCSDGDGLAPPQHLIRVEGNLYPEYLEDRQTFRHSVVVPYEPPEAGSEYTTIHYKYMCnssCmGGMnrRPILTIITLEDSSGNLLGRDSFEVrvcacPGrdRRtEEEnFRKKE C;D CgTGAgCatgctCAC;GTgagCatgctCA 8 298 143 29;0;114;0 2;0;4;0;0;0;0;0;13;3;4;0;0;0;0;4;0;20;19;74 2GIG 2gig_1_1 16675462 1.83 HAEMOPHILUS INFLUENZAE 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease HincII 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SFIKPIYQDINSILIGQKVKRPhaagePFEKLVYKFLKENLSDLTFKQYEYLNDLFMKNPAIIGHEARyKLFNSPTLLFLLSrgkaaTENWSIENLFEEkqndtAdILLVKDQFYELLdvktrnISksafapniisAykLAqTCAKMIDNKEFDLFDINYLEVDwELNGEDLVCVSTSFAELFKSEPSELyInWaaamqIqFHVRDLDQGFNGTREEWAKSYLKHFVTQAEQrAISMIDkfVKPFKKYI;SFIKPIYQDINSILIGQKVFeKLVYKFLKENLSDLTFKQYEYLNDLFMKNPAIIGHEARYKLFNSPTLLFLLSrgkaaTENWSIENLFEEKqnDtAdILLVKDQFYELLdvktRnISksafapniisAykLAqTCAKMIDNKEFDLFDINYLEVDwELNGEDLVCVSTSFAELFKSEPSELyInWaaamqIqFHVRDLDQGFNGTREEWAKSYLKHFVTQAEQrAIsMIDkfVKPFKKYI E;F GCcggtcgaccggc;GCcggtcgaccggc 13 68 541 164;38;310;29 6;2;7;1;4;3;4;2;16;10;19;0;0;0;0;2;9;26;106;324 2GIH 2gih_1_1 16675462 2.5 HAEMOPHILUS INFLUENZAE 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease HincII 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SFIKPIYQDINSILIGQKVKRPKSGTLsghAAGEPFEKLVYKFLKENLSDLTFKQYEYLNDLFMKNPAIIGHEARyKLFNSPTLLFLLsrgkaaTENWSIENLFEEkqndtadILLVKDQFYELLdvktrnISksafapniisAykLAqTCAKMIDNKEFDLFDINYLEVDwELNGEDLVCVSTSFAELFKSEPSELyInWaaamqIqFHVRDLDQGFNGTREEWAKSYLKHFVTqAEQrAIsMIDkfVKPFKKYIL;SFIKPIYQDINSILIGQKVKRsGHaAGePFEKLVYKFLKENLSDLTFKQYEYLNDLFMKNPAIIGHEARyKLFNSPTLLFLLSrgkaaTENWSIENLFEEkqndtAdILLVKDQFYELLdvktrnISksafapniisAykLAqTCAKMIDNKEFDLFDINYLEVDwELNGEDLVCVSTSFAELFKSEPSELyInWaaamqIqFHVRDLDQGFNGTREEWAKSYLKHFVTQAEQrAIsMIDkfVKPFKKYIL E;F GCcggtcgaccggc;GCcggtcgaccggc 13 68 553 152;39;339;23 6;1;10;1;6;2;4;2;12;9;20;0;0;0;0;1;9;33;108;329 2GII 2gii_1_1 16675462 2.3 HAEMOPHILUS INFLUENZAE 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease HincII 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SFIKPIYQDINSILIGQKePFeKLVYKFLKENLSDLTFKQYEYLNDLFMKNPAIIGHEARyKLFNSPTLLFLLSrgkaaTENWSIENLFEEKqndtAdILLVKDQFYELLdvktrnISksafapnIisAykLAqTCAKMIDNKEFDLFDINYLEVDwELLVCVSTSFAELFKSEPSELyInWaaamqIqFHVRDLDQGFNGTREEWAKSYLKHFVTQAEQrAISMIDkfVKPFKKYIL;SFIKPIYQDINSILIepFeKLVYKFLKENLSDLTFKQYEYLNDLFMKNPAIIGHEARyKLFNSPTLLFLLSrgkaaTENWSLFEEkqndTAdILLVKDQFYELLDvktRnISksafapniisAykLAqTCAKMIDNKEFDLFDINYLEVDwECVSTSFAELFKSEPSELyInWaaamqIqFhVRDLDQGFNGTREEWAKSYLKHFVTQAEQrAIsMIDkfVKPFKKY E;F GCcggttaaccggc;GCcggttaaccggc 13 297 467 156;12;277;22 5;2;5;2;5;4;4;0;15;11;16;0;0;0;0;2;8;25;90;273 2GIJ 2gij_1_1 16675462 1.93 HAEMOPHILUS INFLUENZAE 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease HincII 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SFIKPIYQDINSILIGQKVKRePFEKLVYKFLKENLSDLTFKQYEYLNDLFMKNPAIIGHEARyKLFNSPTLLFLLSrgkaaTENWSIENLFEEkqndtAdILLVKDQFYELLdvktrnISksafapniisAykLAqTCAKMIDNKEFDLFDINYLEVDwELNGEDLVCVSTSFAELFKSEPSELyInWaaamqIqFHVRDLDQGFNGTREEWAKSYLKHFVTQAEQrAIsMIDkfVKPFKKYIL;SFIKPIYQDINSILIGQFeKLVYKFLKENLSDLTFKQYEYLNDLFMKNPAIIGHEARyKLFNSPTLLFLLSrgkaaTENWSIENLFEEkqndtAdILLVKDQFYELLdvktRnISksafapniisAykLAqTCAKMIDNKEFDLFDINYLEVDwEGEDLVCVSTSFAELFKSEPSELyInWaaamqIqFHVRDLDQGFNGTREEWAKSYLKHFVTQAEQrAIsMIDkfVKPFKKYI E;F GCcggttaaccggc;GCcggttaaccggc 13 28 520 156;30;308;26 5;1;6;1;6;4;4;0;17;9;18;0;0;0;0;2;9;25;108;305 2H7H 2h7h_1_1 0 2.3 AVIAN SARCOMA VIRUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, v-jun 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B kAERkrMrnrIaasksrKrklERIARLEEKVKTLKAQNSELASTANMLREQVAQLKQK;kaERkrMrnrIaasksrKrklERIARLEEKVKTLKAQNSELASTANMLREQVAQLKQK X;Y CGTcgatgactcatCGACG;CGTcgatgagtcatCGACG 104 293 215 88;0;127;0 8;0;6;0;4;0;0;0;3;7;0;0;0;0;0;2;5;21;33;126 2HAP 2hap_1_1 9886287 2.5 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Heme Activator Protein 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 C;D rkrnrIplrCTICrKrkvkcDkLRPHCQQCTktGVAHLCHYMEQTwAEEAEKELLKDNELKKLRERVKSLEKTLSK;krnriplrCTICrkrkvkcDkLRPHCQQCTKTGVAHLCHYMEqtwAEEAEKELLKDNELKKLRERVKSLEKTLSK A;B acgcTATtatcgcTATtagt;ACTaatagcgataatagcgT 57 291 318 67;18;233;0 8;0;11;0;0;0;6;0;11;0;19;0;0;0;0;0;5;15;48;195 2HOF 2hof_1_1 17573343 2.4 BACTERIOPHAGE P1 1 1 1 1 0 0 1 Enzyme Recombinase Cre Recombinase 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B SDEVRKNLMDMFRDRQafsehtWkmLLsVCrsWAAWCKLNNRKWFPAEPEDVRDYLLYLQArglaVktIQqhLgqLNmLHrrSGLPrPSDSNAVSLVMRRIRKENVDAGerakqaLAFERTDFDQVRSLMENSDrCqDIrNLAFLGIAYNTLLriaeIArIRVKDISRTDGGRMLIHIKALSLGVTKLVERWISVSGVADDPNNYLFCrvrknGVAAPSATsqlstraLeGIFeATHRLIYGAkDDSgqryLawsghSArVGAARDMARAGVSIPEIMQAGgwtnVNiVMnyIRNLDSETGAMVRLLED;SDEVRKNLMDMFRDRQafsEhtWkmLLsVCrsWAAWCKLNNRKWFPAEPEDVRDYLLYLQArglaVktIqqhlgqLnmLHrrSGLPrPsDSNAVsLVmrRIrkENvDAGerakqaLAFERTDFDQVRSLMENSDrCqDIrNLAFLGIAYNTLLriaEIArIRVKDISRTDGGRMLIHIGrtatLVSTAGVEKALSLGVTKLVERWISVSGVADDPNNYLFCrvrknGvAAPSATsqlstraLeGIFeATHRLIYGAkDDSgqryLawsghSArVGAARDMARAGVSIPEIMQAGgwtnVniVMNyIRNAMVRLLED C;D ataacttcgtatagcatACattatacgaACttat;ataagttcgtataatgtatgctatacgaAGttat 15 284 1006 215;47;744;0 20;2;21;0;2;2;4;0;53;36;36;0;0;0;2;19;6;69;157;577 2HT0 2ht0_1_1 17097674 2 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein DNA Bending Integrator Host Factor 1 1 1 0 1, 1 0 2 0 0 0 2 1 1 1 A;B aLtkaEMSEYLFDKLGLSkRDAkELVELFFEEIRRALENGEQVkLsgfGnFDLrdknqrpgrnpkTGeDipiTArRvvtFrPgqkLkSRVENASPK;MtksELIeRLATQQSHIPakTVEDAVkEMLEHMASTLAQGErIeirgFgsFSLhYraPrtgrnpkTGDKvElEGkYvPhfkpgkeLrDRANIY C;D;E;F cGGTGCaacaaAt;tgataagcaatgCTTttttgGC;ggCCAAAAaagCAtt;GcttatcaattTGttgcacC 63;64 280 475 37;73;361;4 7;0;12;0;0;4;1;1;36;7;17;0;0;0;0;1;1;33;73;282 2I3P 2i3p_1_1 16971456 2.3 CHLAMYDOMONAS REINHARDTII 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease I-CreI 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B NTKYNKEFLLYLAGFVDgdgsiiaqirpnQsykFKHqlsLTFqVtqkTQrRWFLDKLVDEIGVgyVrdrGsvSDYiLseikpLHNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKIIEQlPSAkESPDKFLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAVLD;NTKYNKEFLLYLAGFVDgdgsiiaqirpnQsykfKHqlsLTFqVtqkTQrRWFLDKLVDEIGVgyVrdrGsvSDYiLseikpLHNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKIIEQlPSAkESPDKFLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAVLD C;D gcaaatcgtcgtgagacaattTCG;cgaaattgtctcacgacgattTGC 4 61 640 183;16;440;1 19;10;14;3;8;0;0;0;15;11;26;0;0;0;0;5;4;28;113;384 2I3Q 2i3q_1_1 16971456 2.3 CHLAMYDOMONAS REINHARDTII 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease I-CreI 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B NTKYNKEFLLYLAGFVDgdgsiiaqiapnQsykFKHqlsLtFvVtqkTQrRWFLDKLVDEIGVgyVrdrGsvSdYILseiKPLHNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKIIEQlPSAkESPDKFLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAVLD;NTKYNKEFLLYLAGFVDgdgsiiaqiapnQsykfKHqlsLTFvVtqkTQrRWFLDKLVDEIGVgyVrdrGsvSdYiLseiKPLHNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKIIEQlPSAkESPDKFLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAVLD C;D gcaaaacgacgtgagtcagttTCG;cgaaactgactcacgtcgtttTGC 4 61 619 171;19;427;2 14;8;12;8;10;0;0;0;13;11;23;0;0;0;0;8;3;29;112;368 2ISZ 2isz_1_1 17209554 2.4 MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Repressor IdeR 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B mnElVdttEMyLRTIYDLEEEGVTPlrarIAeRLdqsgptVsqtVsrMErDGLLRVAGDrHLELTEKGRALAIAVMRKHRLAERLLVDVIGLPWEEVHAEACRWEHVMSEDVERRLVKVLNNPTTSPFGNPIPGLVELGV;mnElVdttEMyLRTIYDLEEEGVTPlrarIAeRLdqsgptVsqtVsrMErdGLLRVAgdrHLELTEKGRALAIAVMRKHRLAERLLVDVIGLPWEEVHAEACRWEHVMSEDVERRLVKVLNNPTTSPFGNPIPGLVELGV E;F CCCTGTTagcacaGGCTgccctaATTTtaGTGG;CACTAaaattagGGCagcctgTGCtAACAGGGC 83 266 296 65;6;225;0 3;0;4;0;4;1;1;0;22;22;14;0;0;0;0;11;0;22;38;154 2ISZ 2isz_1_2 17209554 2.4 MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Repressor IdeR 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 C;D mnElVDttEMyLRTIYDLEEEGVTPlrarIAERLdqsgptVsqtVSrMErDGLLRVAGDrHLELTEKGRALAIAVMRKHRLAERLLVDVIGLPWEEVHAEACRWEHVMSEDVERRLVKVLNNPTTSPFGNPIPGLVELGV;mnElVdttEMyLRTIYDLEEEGVTPlrarIAeRLdqsgptVsqtVSrMErDGLLRVAGDrHLELTEKGRALAIAVMRKHRLAERLLVDVIGLPWEEVHAEACRWEHVMSEDVERRLVKVLNNPTTSPFGNPIPGLVELGV E;F CCctgttagCAcaggctgCCCtAATTTTAGTGG;CACTAAAATTAgggcagCCTgtgctaACAGGGC 83 265 270 61;3;206;0 1;0;2;0;0;0;0;0;18;18;13;0;0;0;0;8;0;22;36;152 2O6M 2o6m_1_1 17516660 2.3 PHYSARUM POLYCEPHALUM 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease I-PpoI 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B ALTNAQILAVIDSWEETVGQFPVITHHVPLGGGLQGTLHCYEIPLAapygvgfaknGPtrWqYkrtINqVvHrwgShtVPFLLEPDNINGktCtaSqLChNtRCHNPLHLCwESldDnkGRnWCPGPNGGCVHAVVCLRQGPlYGPGATVAGPQQRGSHFVV;ALTNAQILAVIDSWEETVGQFPVITHHVPLGGGLQGTLHCYEIPLAapygvgfaknGPTrWqYkrtINqVvHrwgShtVPFLLEPDNINGktCtaSqLChNtRCHNPLHLCwESldDnkGRnWCPGPNGGCVHAVVCLRQGPlYGPGATVAGPQQRGSHFVV C;D ttgactctCttaagagagTCA;ttgactctCttaagagagTCA 29 7 379 113;22;244;0 17;1;8;0;4;0;4;0;14;7;21;0;0;0;0;2;8;19;52;222 2OR1 2or1_1_1 3187531 2.5 BACTERIOPHAGE 434 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix 434 Repressor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 L;R SISSRVkSKrIQLGLnqAELAQKVgttqqsIeqLEnGktkrprfLPELASALGVSVDWLLNGT;SISSRVkSKrIQLGLnqaELAQKVGttqqsIeqLEnGktkrprfLPELASALGVSVDWLLNGT A;B AAgtacaAACTttcttgtAT;TatacaaGAAagtttgtACT 60 245 279 95;4;180;0 5;0;8;0;3;0;0;0;17;10;13;0;0;0;0;15;1;10;31;166 2OXV 2oxv_1_1 17997963 1.95 ESCHERICHIA COLI 1 1 1 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRI 1 1 1 2 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;D SQGVIGIFGDYAKAHDLAVGEVSKLVKKALSNEYPQLSFRYRDSIKKTEINEALKKIDPDLGGTLFvSnssikPdGGIVEVKDDYGEWRVVLVAeakhqgkDIInIRNGLLvgkRGDQDLmtagnaIerSHknISEIANFMLSESHFPYVLFLEGSNFLTENISITRPDGRVVNLeYnSgiLnrLDrLTAANYGMPINSNLCINKFVNHKDKSIMLQAASIYTQGDGREWDSKIMFEIMFDISTTSLRVLGRDLFEQLTSK;SQGVIGIFGDYAKAHDLAVGEVSKLVKKALSNEYPQLSFRYRDSIKKTEINEALKKIDPDLGGTLFvSnssikPdGGIVEVKDDYGEWRVVLVAeakhqgkDIInIRNGLLvgkRGDQDLmtagnaIerSHknISEIANFMLSESHFPYVLFLEGSNFLTENISITRPDGRVVNLeYnSgiLnrLDrLTAANYGMPINSNLCINKFVNHKDKSIMLQAASIYTQGDGREWDSKIMFEIMFDISTTSLRVLGRDLFEQLTSK C;E Tcgcgaattcgcg;Tcgcgaattcgcg 28 242 406 144;6;254;2 10;0;0;2;4;0;6;4;4;0;16;0;0;0;0;4;6;26;60;264 2P0J 2p0j_1_1 17437717 2.1 GEOBACILLUS STEAROTHERMOPHILUS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease BstYI 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B MRIVEVYSHLNGLEYIQVHLPHIWEEIQEIIVSIDAEACRTkEskektKQGQILYspvALnEAFKEKLEAKGWKESRTNYYVTADPKLIRETLSLEPEEQKKVIEAAGKEALKSyNQTDFVKDRVAIEVqfgkySfVAYDLFVKHMAFYVSDKIDVGVEILPMkELSkEMssgiSyYEGELYNVIRQGRGVPAVPLVLIGIAP;MRIVEVYSHLNGLEYIQVHLPHIWEEIQEIIVSIDAEACRTKEskeLYSPvALnEAFKEKLEAKGWKeSrTNYYVTADPKLIRETLSLEPEEQKKVIEAAGKEALksynqTdFVKDRVAIevqFGkySfVAydLFVkHMAFYVSDKIDVGVEILPMKELSKEMssgISYYEGELYNVIRQGRGVPAVPLVLIGIAP C;D atgaatccata;tatggatTcaT 156 240 242 48;8;185;1 3;0;4;0;1;0;3;0;13;7;9;0;0;0;0;4;1;13;38;146 2PVI 2pvi_1_1 9628337 1.76 PROTEUS VULGARIS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease PvuII 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 1 2 1 1 1 A;B SHPDLNKLLELWPHIQEYQDLALKHGInDIFqdnGGkLLQVLLITGLTVLPGRagnDAVDNAGQEYelksinIDltkgFsthhHMNPviIAkARQVPWIFAIYRGIAIEAIYRLEPKDLEFyYDkwERkWYSdGHkDinnpkIpVKYVMEHGTKIY;SHPDLNKLLELWPHIQEYQDLALKHGInDIFqdnGGkLLQVLLITGLTVLPgRagnDAVDNAGQEYelksinIDltKgFsthhHMNPviIAkARQVPWIFAIYRGIAIEAIYRLEPKDLEfyYDkwERkWYSdGHkdinnpkIpVkYVMEHGTKIY C;D tgaccagtggtC;tgaccagtggtC 41 232 346 120;8;216;2 7;4;8;0;7;2;6;2;19;2;7;0;0;0;0;4;5;21;37;215 2QL2 2ql2_1_1 18069799 2.5 MUS MUSCULUS 2 1 1 3 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Helix Loop Helix, E47|NeuroD1 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B RrMAnnArerVrvRdinEAFrELGRMCQLHLKAQtklLILQQAVQVILGLEQQVRE;SRrMkanArerNrmhGlnAALDNLrKVVPCYSKTQKLskiETLRLAKNYIWALSEILRS E;F TAggccatctgGTCCT;AGgaccagatggCCTA 200;201 226 194 62;0;132;0 2;0;0;0;9;0;1;0;15;3;4;0;0;0;0;6;2;16;32;104 2QL2 2ql2_2_1 18069799 2.5 MUS MUSCULUS 2 1 1 3 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Helix Loop Helix, E47|NeuroD1 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 C;D RrMAnnArerVrvRDinEAFRELGRMCQLHLKSDQtklLILQQAVQVILGLEQQVRER;RrMkanArernrmhGlnAALDNLrKVVPCYSKTQKLskieTLRLAKNYIWALSEILR G;H TAggccatctgGTCCT;AGgaccagatggCCTA 200;201 225 181 48;0;133;0 2;0;0;0;5;0;0;0;16;3;4;0;0;0;0;5;2;9;24;111 2R1J 2r1j_1_1 18237194 1.53 BACTERIOPHAGE P22 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Repressor P22 c2 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 L;R TQLMGERIrARrkKLKIrqaALGKMVgvsnvaIsqwErSetepnGEnLLALSKALQCSPDYLLKGD;TQLMGERIrARrkKLKIrqaALGKMVgvsnvaIsqwErSetepnGEnLLALSKALQCSPDYLLKGD A;B TatttaaGATatcttaAATG;CatttaAGATatcttaAATA 197 223 283 102;0;181;0 0;0;4;0;3;0;0;0;14;7;11;0;0;0;0;19;2;15;54;154 2RAM 2ram_1_1 9437432 2.4 MUS MUSCULUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet NFkB 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 1 2 1 1 1 A;B PYVEIIEQPKQRgmrFryKceGrsAgsIPGERSTDTTKTHPTIKINGYTGPGTVRISLVTKDPPHRPHPHELVGKDCRDGYYEADLCPDRSIHSFQNLGIQCVkkRDLEQAISQRIQTNNNPFHVPIEEQRGDYDlnAVRLCFQVTVRDPAGRPLLLTPVLSHPIFDNrApnTAELkICRVNRNSGSCLGGDEIFLLCDkVqkeDIEVYFTGPGWEARGSFSqADvHrqVAIVFRTPPYADPSLQAPVRVSMQLRRPSDRELSEPMEFQYLPD;PYVEIIEQPKQRGMrFryKceGrsaGSIPGERSTDTTKTHPTIKINGYTGPGTVRISLVTKDPPHRPHPHELVGKDCRDGYYEADLCPDRSIHSFQNLGIQCvkkrDLEQAISQRIQTNNNPFHVPIEEQRGDYDlnAVRLCFQVTVRDPAGRPLLLTPVLSHPIFDNrApNTAeLKICRVNRNSGSCLGGDEIFLLCDkVqkeDIEVYFTGPGWEARGSFSQADvHrqVAIVFRTPPYADPSLQAPVRVSMQLRRPSDRELSEPMEFQYLPD C;D CGGCtggaaatccAGCCG;CGgctggaaatCCaGCCG 142 218 224 55;0;169;0 11;1;7;0;2;0;1;0;11;5;9;0;0;0;0;0;3;17;21;136 2RBF 2rbf_1_1 18586269 2.25 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Ribbon|Helix|Helix Bifunctional Protein PutA 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B tttmgVkLDDATRERIKSAATRIDRtphwLIkQAIFSYLEQLEN;ttmgvkLdDATrERIKSAATRIDRtphwLIkQAIFSYLEQLENSD C;D TGcggttgcaCCTTTCAAA;TTTGAAAggtgcaaCCGCA 208 217 175 70;0;105;0 4;1;4;1;4;1;1;1;1;6;8;0;0;0;0;1;3;6;36;97 2VBJ 2vbj_1_1 0 1.95 CHLAMYDOMONAS REINHARDTII 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease I-CreI 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B NTKYNKEFLLYLAGFVDgdgsiiaqiepnQsykFKHrlkLTFkVtqkTQrRWFLDKLVDEIGVGyVrDeGsvSnYiLseiKPLRNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKITEQlPSAkESPDKFLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAVLD;NTKYNKEFLLYLAGFVDadgsiiaqiepnQsskFKHrlkLTFqVtqkTQrRWFLDKLVDEIGVgyVrDsGsvSnYiLseiKPLHNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKIIEQlPSAkESPDKFLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAVLD C;E tctgccttttttgaaggatcctAA;ttaggatccttcaaaaaaggcaGA 4 14 648 167;12;467;2 14;2;12;3;12;0;0;0;17;11;28;0;0;0;0;10;1;34;119;385 2VBL 2vbl_1_1 0 1.8 CHLAMYDOMONAS REINHARDTII 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease I-CreI 1 1 1 0 0, 0 0 2 0 0 0 2 1 2 1 A;B NTKYNKEFLLYLAGFVDgdgsiiaqiepnAsykFKHrlkLTFkVtqkTQrRWFLDKLVDEIGVgyVrDeGsvSnYiLseiKPLRNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKITEQlPSAKESPDKFLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAVLD;NTKYNKEFLLYLAGFVDadgsiiaqiapnQsskFKHrlkltFqVtqkTQrRWFLDKLVDEIGVgyVrgsGsvSnYiLseiKPLHNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKIIEQlPSAkESPDKFLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAVLD C;E;S;T tctgccttttttga;ttaggatccttcaa;aaaaggcaGA;aggatcctAA 4 14 653 161;12;478;2 14;4;13;3;12;0;0;0;16;10;28;0;0;0;0;11;1;32;118;391 2VBN 2vbn_1_1 0 1.9 CHLAMYDOMONAS REINHARDTII 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease I-CreI 1 1 1 0 0, 0 0 2 0 0 0 2 1 2 1 A;B MNTKYNKEFLLYLAGFVDgdgsiiaqikpnQsskFkHrlsLTFqVtqkTQrRWFLDKLVDEIGVgyVrdsgsvSnYiLseiKPLHNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKIIEQlPSAkESPDKFLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAVLD;NTKYNKEFLLYLAGFVDgdgsiiaqiepnQsykFKHrlkLTFkVtqkTQrRWFLDKLVDEIGVgyVsdsGsvSnYiLseiKPLHNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKIIEQlPSAkESPDKFLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAVLD C;E;S;T ttaggatccttcaa;tctgccttttttga;aaaaggcAGA;aggatcctAA 4 14 636 167;15;452;2 18;6;13;4;11;0;0;0;16;12;26;0;0;0;0;12;1;29;115;373 2VBO 2vbo_1_1 0 1.8 CHLAMYDOMONAS REINHARDTII 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease I-CreI 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B MNTKYNKEFLLYLAGFVDgdgsiiaqikpnQsskFkHrlsLtFqVtqkTQrRWFLDKLVDEIGVgyVrdsgsvSnYilseiKPLHNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKIIEQlPSAkESPDKFLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAVLD;NTKYNKEFLLYLAGFVDgdgsiiaqiepnQsykFKHrlkLTFkVtqkTQrRWFLDKLVDEIGVGyVsdsGsvSnYiLseikPLHNFLTQLQPFLKLkQKQANLVLKIIEQlPSAkESPDKFLEVCTWVDQIaALndsktrktTSETVRAVLD C;E ttaggatccttcaaaaaaggcAGA;tctgccttttttgaaggatcctAA 4 14 667 172;14;479;2 16;5;11;1;16;0;0;0;18;13;24;0;0;0;0;9;0;29;133;392 2VE9 2ve9_1_1 18722176 1.9 PSEUDOMONAS AERUGINOSA 2 1 1 2 0 0 1 Enzyme Translocase DNA Translocase FTSK 1 1 1 0 2, 0 0 0 0 1 0 3 1 1 1 A;B;C DDPLYDEAVRFVTESRrAsisaVqRKLkigynrAARMIEAMEMAGVVTPmNTngsrEVIAPAP;DPLYDEAVRFVTESRrAsisAVqrKLkigynrAArMIEAMEMAGVVTPmNtngsrEVIAPAP;DdPLYDEAVRFVTESRrasisaVqrKLkigynrAarMIEAMEMAGVVTPmNTNgSrEVIAPAP I;J ACcagggcagggCg;GtcgccctgcccTGGT 59 52 328 85;1;242;0 3;1;3;0;8;2;0;4;5;9;18;0;0;0;0;5;0;22;59;189 2VE9 2ve9_2_1 18722176 1.9 PSEUDOMONAS AERUGINOSA 2 1 1 2 0 0 1 Enzyme Translocase DNA Translocase FTSK 2 1 1 0 2, 0 0 0 0 1 0 3 1 1 1 D;E;F dPLYDEAVRFVTESRrasisaVqrKLkigynrAarMIEAMEMAGVVTPmNTNgSrEVIAPAPV;DPLYDEAVRFVTESRrAsisAVqrKLkigynrAArMIEAMEMAGVVTPmNtngSrEVIAPAPV;EDDPLYDEAVRFVTESRrAsisaVqRKLkigynrAARMIEAMEMAGVVTPmNtngSrEVIAPAP K;L ACcagggcagggCg;GtcgccctgcccTGGT 59 52 321 84;1;236;0 3;1;3;0;6;2;0;4;6;12;18;0;0;0;0;4;0;18;56;188 2VY1 2vy1_1_1 18784751 2.1 ARABIDOPSIS THALIANA 1 1 1 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Protein Leafy 1 1 1 2 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B rehpfIVTEPGEVARGKKNGLDYLFHLYEQCREFLLQVQTIAKDRGEkCPTKvtnqVFrYAkKSGAsyInkpkMrhyVHCYALHCLDEEASNALRRAFKERGEnvgSWRQACYKPLVNIACRHGWDIDAVFNAHPRLSIWyvPtKLRQLCHLERNNAVAAAAAL;rehpfIVTEPGEVARGKKNGLDYLFHLYEQCREFLLQVQTIAKDRGEkCPTKvtnqVFrYAkKSGAsyInkpkMrhyVHCYALHCLDEEASNALRRAFKERGEnvgSWRQACYKPLVNIACRHGWDIDAVFNAHPRLSIWyvPtKLRQLCHLERNNAVAAAAAL W;X AgaaggaCCAGtggtcCgta;AgaaggaCCAGtggtcCgta 81 208 338 82;18;238;0 12;0;8;0;0;2;0;2;26;10;16;0;0;0;0;0;2;16;38;206 2VY2 2vy2_1_1 18784751 2.3 ARABIDOPSIS THALIANA 1 1 1 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Protein Leafy 1 1 1 2 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 A;B rehpfIVTEPGEVARGKkNGLDYLFHLYEQCREFLLQVQTIAKDRGEkCPTKVtnqVFrYAkKSGAsYInkpkMrhyVHCYALHCLDEEASNALRRAFKERGEnvgSWRQACYKPLVNIACRHGWDIDAVFNAHPRLSIWyvPtKLrQLCHLERNNAVAAAAA;rehpfIVTEPGEVARGKkNGLDYLFHLYEQCREFLLQVQTIAKDRGEkCPTKVtnqVFrYAkKSGAsYInkpkMrhyVHCYALHCLDEEASNALRRAFKERGEnvgSWRQACYKPLVNIACRHGWDIDAVFNAHPRLSIWyvPtKLrQLCHLERNNAVAAAAA W;X AtttaatCCAAtggtTACaa;AtttaatCCAAtggtTACaa 81 207 290 52;12;226;0 8;0;8;0;0;0;0;0;20;10;14;0;0;0;0;0;0;16;40;174 2YVH 2yvh_1_1 0 2.5 CORYNEBACTERIUM GLUTAMICUM ATCC 13032 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Alpha Helix Repressor CgmR 1 1 1 0 0, 0 0 2 0 0 0 2 1 2 1 A;B SkkEILRTAIDYIGEYSLetlsydSLAEATglsksgLiyhFpsrHALLLGHELLADDWDKELRDITRDPEDPLERLRAVVVTLAENVSRPELLLLIDAPSHPDFLNAWRTVNHQWIPDTDDLENDAHKRAVYLVQLAADGLFVHDYIHDDVLSKSKRQALETILELIP;tskKEILRTAIDYIGEYSLetlsydSLAEATglsksgLiyhFpsrHALLLGHELLADDWDKELRDITRDPEDPLERLRAVVVTLAENVSRPELLLLIDAPSHPDFLNAWRTVNHQWIPDTDDLENDAHKRAVYLVQLAADGLFVHDYIHDDVLSKSKRQALETILELIP E;F;G;H TAACTGtaccgaCC;ggtCGGTACAGTTA;TaactgtACCGACc;GGTcggtacAGTTa 80 206 242 75;0;167;0 4;2;5;4;3;0;0;0;0;12;7;0;0;0;0;3;1;5;62;134 2YVH 2yvh_1_2 0 2.5 CORYNEBACTERIUM GLUTAMICUM ATCC 13032 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Alpha Helix Repressor CgmR 1 2 1 0 0, 0 0 2 0 0 0 2 1 2 1 C;D SkkEILRTAIDYIGEYSLetlsydSLAEATglsksgLiyhFpsrHALLLGHELLADDWDKELRDITRDPEDPLERLRAVVVTLAENVSRPELLLLIDAPSHPDFLNAWRTVNHQWIPDTDDLENDAHKRAVYLVQLAADGLFVHDYIHDDVLSKSKRQALETILELIP;tskKEILRTAIDYIGEYSLetlsydSLAEATglsksgLiyhFpsrHALLLGHELLADDWDKELRDITRDPEDPLERLRAVVVTLAENVSRPELLLLIDAPSHPDFLNAWRTVNHQWIPDTDDLENDAHKRAVYLVQLAADGLFVHDYIHDDVLSKSKRQALETILELIP E;F;G;H TaactgtACCGAcc;GGTcggtacAGTTa;TAACTGtaccgaCC;ggtCGGTACAGTTA 80 205 241 71;0;170;0 4;3;5;5;2;0;0;0;1;10;8;0;0;0;0;1;1;3;65;133 2Z3X 2z3x_1_1 0 2.1 BACILLUS SUBTILIS 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein Maintenance|Protection Spore Protein C 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 3 1 1 1 A;B;C akllIPQAASAiEQMkLEIASEFGVQlgaETTsrAngsvggeitkRlvRLAqQNMG;akllIPQAASAiEQMkLEIASEFGVQlgaETTsrAngsvggeitkRlVRLAQQNMG;akllIPQAASAiEQMkLEIASEFGVQlgaETTsrAngsvggeitkRlvRLAqQNMG D;E gggggggggga;cccccccccca 122 204 453 4;93;356;0 0;3;0;3;4;2;9;3;0;5;18;0;0;0;0;0;0;8;102;296 3BAM 3bam_1_1 9783752 1.8 BACILLUS AMYLOLIQUEFACIENS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease BamHI 1 1 1 0 1, 0 0 1 0 1 0 2 1 1 1 A;B MEVEKEFITDEAKELLSKDKLIQQAYNEVKTSICSPIWPATSKTFTINNTEkNCNgvvPIkELCYTLLEDTYNWYReKPLDILKLEKKkggpIdVYKEFIENSELKRVGMefetgnIssAHrsMNkLLLGLKHGEIDLAIILMPIkQLAyYLtdrvTnFEeLEPyFELTEGQPFIFIGFNAEAYNSNVPLIpkgsdgmskRsikkw;MEVEKEFITDEAKELLSKDKLIQQAYNEVKTSICSPIWPATSKTFTINNTEkNCNgvvPIkELCYTLLEDTYNWYReKPLDILKLEKKkggpIdVYKEFIENSELKRVGMefetgnIssAHrsMNkLLLGLKHGEIDLAIILMPIkQLAyYLtdrvTNFEeLEPyFELTEGQPFIFIGFNAEAYNSNVPLIPkgsDGmskRSIKkWKDK C;D;E tatggatccaTa;tatg;gatccat 40 50 463 129;26;307;1 4;2;5;0;7;3;2;2;6;14;23;0;0;0;0;5;7;35;73;275 3BEP 3bep_1_1 18191219 1.92 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Polymerase DNA Polymerase III Subunit Beta 1 1 1 0 4, 0 0 0 0 1 1 2 1 1 1 A;B MKFTVEreHLlkPLqqVSGPLgGrPTLPILGNLLLQVADGTLSLTGTDLEMEMVARVALVQPHEPGATTVPARKFfDICrGLPeGAEIAVQLEGERMLVRSGRSRFSLSTLPAADFPNLDDWQSEVEFTLPQATMkRLIeATQFSMAhQDVRYYLNGMLFETEGEELRTVATDGHRLAVCSMPIGQSLPSHSVIVPRKGVIELMrMldgGDNPLRVQIGSNNIRAHVGDFIFTSKLVDGRFPDYRRVLPKNPDKHLEAGCDLLKQAFARAAILSNEKFRGVRLYVSENQLKITANNPEQEEAEEILDVTYSGAEMEIGFNVSYVLDVLNALKCENVRMMLTDSVSSVQIEDAASQSAAYVVMPMRL;MKFTVEREHLLKPLqQVSGPLggrPTLPILGNLLLQVADGTLSLTGTDLEMEMVARVALVQPHEPGATTVPArKFFDICrGLPEGAEIAVQLEGERMLVRSGRSRFSLSTLPAADFPNLDDWQSEVEFTLPQATMKRLIEATQFSMAhqDVRYYLNGMLFETEGEELRTVATDGHRLAVCSMPIGQSLPSHSVIVPrkGVIELMrMLDGGDNPLRVQIGSNNIRAHVGDFIFTSKLVDGRFPDYRRVLPKNPDKHLEAGCDLLKQAFARAAILSNEKFRGVRLYVSENQLKITANNPEQEEAEEILDVTYSGAEMEIGFNVSYVLDVLNALKCENVRMMLTDSVSSVQIEDAASQSAAYVVMPMRL C;D ccCatcGTAT;TtttataCGatggg 133 200 116 19;9;86;2 0;0;0;0;0;0;3;0;3;0;1;0;0;0;0;0;0;13;16;80 3BM3 3bm3_1_1 0 1.7 PYROCOCCUS SP. GI-H 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease PspGI 1 1 1 0 1, 1 1 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B VRNLVIDITKkptqNiPptNEiIEEAITELNVDELLDRLFEKDESGEVITPSRIAKLeEKafEIyKEYEKQVREAYLSAGYSREkLEqsFqqarfsrggkafeIIFTKLLNKFGIRYEHDRVIKIYDYITegEkPaFIIPSVRTFLNDPSSAILItvkrkVrerwreAVGeAQILRNKFGDEINFWFVGFDEeFtiySAIALDNGIDRVYVIDGRYDSLIEEIKRISDPNFNEDKYIQKIRRFSDIFDDIIQFLNKH;RNLVIDITKkptqNiPptnEIIEEAITELNVDELLDRLFEKDESGEVITPSRIAKLeEKafEIyKEYEKQVREAYLSAGYSRekLEqsFqqarfsrggkafeIIFTKLLNKFGIRYEhDRvIKIYDYITegEkPaFIIPSVRTFLNDPSSAILItvkrkVrerwreAVGeAQILRNKFGDEINFWFVGFDEEFtiySAIALDNGIDRVYVIDGRYDSLIEEIKRISDPNFNEDKYIQKIRRFSDIFDDIIQFLNKH C;D Catccaggtac;Ggtacctggat 147 196 646 141;90;406;9 9;1;3;3;10;3;3;3;23;15;15;0;0;0;0;6;1;42;123;386 3C25 3c25_1_1 18400177 2.5 NOCARDIA OTITIDISCAVIARUM 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease NotI 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B 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eqaCDICrlkklkcSkEKPKCAkCLKNNwECRYSPktKrSpltrAHLTEVESRLERLEQLFLLIFPREDLDMILKMDSLQDIKALLTGL;eqaCDICrlkklkcSkEKPKCAKCLKNNWECRYSPktKrSpltrAHLTEVESRLERLEQLFLLIFPREDLDMILKMDSLQDIKALLTGL D;E accggAGGacAgtcctccgG;tccggAGGacTgtcctccGG 178 177 258 65;1;190;2 4;0;4;0;0;0;6;0;6;0;12;0;0;0;0;0;9;18;44;155 3CRO 3cro_1_1 2038059 2.5 BACTERIOPHAGE 434 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Cro Repressor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 2 1 L;R MQTLSERLkKRrIALKMtqteLATKAgvkqqsIqliEaGvtkrprfLFEIAMALNCDPVWLQYGTK;MQTLSERLkKRrIALKMtqteLATKAGvkqqsIqliEAGvtkrprfLFEIAMALNCDPVWLQYG A;B AAgtacaAACtttcttgtAT;TatacaAGAaagtttgtACT 198 175 289 87;12;190;0 9;0;9;0;3;0;0;0;16;15;14;0;0;0;0;11;1;10;41;160 3CRX 3crx_1_1 9670032 2.5 BACTERIOPHAGE P1 1 1 0 1 1 0 1 Enzyme Recombinase Cre Recombinase 1 1 1 0 1, 0, 1, 0 0 0 0 1 0 2 1 0 1 A;B 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1 1 1 A;B PFTYSIEATRNLATTERCIqDIRNAPvrnrstQfqlaqqNMLAYTFGEVIPGFASAGINGMDYRDVIGRPVENAVTEGTHFFRDDFRVdsnakakvagdIfeiVSSAVMWNCAARWNSLMVGEGWRSQPRYSRPTLSPSPRRQVAVLNLprsfDWVSLLVPESQEVIEEFRAGLRKDGLGLPTstPdLAVVVLPEEFQNDEMWREEIAGLTrPNQILLsGAyqRLqGRVQPGEISLAVAfkrsLrsdrLyqPLYEANVMQLLLEGKLGAPKVEFEVHTLAPegTnAFVTYEAASLYGLAEGRSAVHRAIRELYVPPTAADLARRFFAFLNERMELVNG;PFTYSIEATRNLATTERCIQDIRNAPvrnrstQfqlaqqNMLAYTFGEVIPGFASAGINGMDYRDVIGRPVENAVTEGTHFFRDDFRVdsnakakvagdIfeIVSSAVMWNCAARWNSLMVGEGWRSQPRYSRPTLSPSPRRQVAVLNLprsFDWVSLLVPESQEVIEEFRAGLRKDGLGLPTstPdLAVVVLPEEFQNDEMWREEIAGLTrPNQILLsGAyqRLQGRVQPGEISLAVAfkrsLrsdrLyqPLYEANVMQLLLEGKLGAPKVEFEVHTLAPeGTnAFVTYEAASLYGLAEGRSAVHRAIRELYVPPTAADLARRFFAFLNERMELVNG C;D AAGtcgaccggtggacT;AAgtcgaccggtggat 38 161 584 101;60;421;2 14;2;6;0;11;2;4;0;33;31;19;0;0;0;0;6;1;18;76;361 3DVO 3dvo_1_1 18701646 1.89 STREPTOMYCES GRISEUS 2 1 1 2 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease SgraIR 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B PFTYSIEATRNLATTERCIQDIRNApvrnrstQfqlaqqNMLAYTFGEVIPGFASAGINGMDYRDVIGRPVENAVTEGTHFFRDDFRVdsnakakvagdIfeIVSSAVMWNCAARWNSLMVGEGWRSQPRYSRPTLSPSPRRQVAVLNLprsfDWVSLLVPESQEVIEEFRAGLRKDGLGLPTstPdLAVVVLPEEFQNDEMWREEIAGLTrPNQILLsGAyqRLQGRVQPGEISLAVAfkrsLrsdrLyqPLYEANVMQLLLEGKLGAPKVEFEVHTLAPegtnAFVTYEAASLYGLAEVHRAIRELYVPPTAADLARRFFAFLNERMELVNG;PFTYSIEATRNLATTERCIQDIRNApvrnrstQfqlaqqNMLAYTFGEVIPGFASAGINGMDYRDVIGRPVENAVTEGTHFFRDDFrVdsnakakvagdIfeIVSSAVMWNCAARWNSLMVGEGWRSQPRYSRPTLSPSPRRQVAVLNLprsfDWVSLLVPESQEVIEEFRAGLRKDGLGLPTstPdLAVVVLPEEFQNDEMWREEIAGLTrPNQILLsGAyqRLQGRVQPGEISLAVAfkrsLrsdrLyqPLYEANVMQLLLEGKLGAPKVEFEVHTLAPegtnAFVTYEAASLYGLAEGAVHRAIRELYVPPTAADLARRFFAFLNERMELVNG E;F GagtccaccggtggacTC;GagtccaccggtggacTC 38 29 608 107;61;439;1 15;1;6;0;7;2;2;0;28;18;25;0;0;0;0;5;2;23;84;390 3DVO 3dvo_2_1 18701646 1.89 STREPTOMYCES GRISEUS 2 1 1 2 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease SgraIR 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 C;D PFTYSIEATRNLATTERCIQDIRNAPvrnrstQFqlaqqNMLAYTFGEVIPGFASAGINGMDYRDVIGRPVENAVTEGTHFFRDDFRVdsnakakvagdIfeIVSSAVMWNCAARWNSLMVGEGWRSQPRYSRPTLSPSPRRQVAVLNLprsfDWVSLLVPESQEVIEEFRAGLRKDGLGLPTstPdLAVVVLPEEFQNDEMWREEIAGLTrPNQILLsGAyQRLQGRVQPGEISLAVAfkrsLrsdrLyqPLYEANVMQLLLEGKLGAPKVEFEVHTLAPegtnAFVTYEAASLYGLAAVHRAIRELYVPPTAADLARRFFAFLNERMELVNG;PFTYSIEATRNLATTERCIQDIRNapvrnrstQfqlaqqNMLAYTFGEVIPGFASAGINGMDYRDVIGRPVENAVTEGTHFFRDDFRVdsnakakvagdIfeIVSSAVMWNCAARWNSLMVGEGWRSQPRYSRPTLSPSPRRQVAVLNLprsfDWVSLLVPESQEVIEEFRAGLRKDGLGLPTstPdLAVVVLPEEFQNDEMWREEIAGLTrPNQILLsGAyqRLQGRVQPGEISLAVAfkrsLrsdrLYqPLYEANVMQLLLEGKLGAPKVEFEVHTLAPegtnAFVTYEAASLYGLAEGAVHRAIRELYVPPTAADLARRFFAFLNERMELVNG G;H gagtccaccggtggacTC;GAgtccaccggtggacTC 38 29 602 107;57;437;1 15;1;6;0;10;2;2;0;24;23;24;0;0;0;0;6;2;23;82;382 3DW9 3dw9_1_1 18701646 2.2 STREPTOMYCES GRISEUS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease SgraIR 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B PFTYSIEATRNLATTERCIqDIRNApvrnrstQfqlaqqNMLAYTFGEVIPGFASAGINGMDYRDVIGRPVENAVTEGTHFFRDDFRVdsnakakvagdIfeIVSSAVMWNCAARWNSLMVGEGWRSQPRYSRPTLSPSPRRQVAVLNLprsfDWVSLLVPESQEVIEEFRAGLRKDGLGLPTstPdLAVVVLPEEFQNDEMWREEIAGLTrPNQILLsGAyqRLQGRVQPGEISLAVAfkrsLrsdrLyqPLYEANVMQLLLEGKLGAPKVEFEVHTLAPegtnAFVTYEAASLYGLAEGVHRAIRELYVPPTAADLARRFFAFLNERMELVNG;PFTYSIEATRNLATTERCIQDIRNApvrnrstQfqlaqqNMLAYTFGEVIPGFASAGINGMDYRDVIGRPVENAVTEGTHFFRDDFRVdsnakakvagdIfeIVSSAVMWNCAARWNSLMVGEGWRSQPRYSRPTLSPSPRRQVAVLNLprsfDWVSLLVPESQEVIEEFRAGLRKDGLGLPTstPdLAVVVLPEEFQNDEMWREEIAGLTrPNQILLsGAyQRLQGRVQPGEISLAVAfkrsLrsdrLyqPLYEANVMQLLLEGKLGAPKVEFEVHTLAPEgtnAFVTYEAASLYGLAEVHRAIRELYVPPTAADLARRFFAFLNERMELVNG E;F GagtccaccggtggacTC;GagtccaccggtggacTC 38 29 621 113;60;446;2 14;1;6;0;7;2;2;0;26;27;25;0;0;0;0;8;3;22;90;388 3E3Y 3e3y_1_1 0 2.13 HAEMOPHILUS INFLUENZAE 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease HincII 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SFIKPIYQDINSILIGQKVKRFEKLVYKFLKENLSDLTFKQYEYLNDLFMKNPAIIGHEARyKLFNSPTLLFLLSrgkaaTENWSIENLFEEkndtAdILLVKDQFYELLdvktrnISksafapniisAykLAqTCAKMIDNKEFDLFDINYLEVDwELNGEDLVCVSTSFAELFKSEPSELyInWaaamqIqFHVRDLDQGFNGTREEWAKSYLKHFVTQAEQrAIsMIDkfVKPFKKYIL;SFIKPIYQDINSILIGQKVKFEKLVYKFLKENLSDLTFKQYEYLNDLFMKNPAIIGHEARyKLFNSPTLLFLLSrgkaaTENWSIENLFEEkqndtAdILLVKDQFYELLdvktrnISksafapniisAykLAqTCAKMIDNKEFDLFDINYLEVDwELNGEDLVCVSTSFAELFKSEPSELyInWaaamqIqFHVRDLDQGFNGTREEWAKSYLKHFVTQAEQrAIsMIDkfVKPFKKYI E;F GCcggttaaccggc;GCcggttaaccggc 13 28 519 158;23;311;27 4;2;4;2;6;4;5;0;13;11;19;0;0;0;0;3;10;29;102;305 3E40 3e40_1_1 0 2.1 HAEMOPHILUS INFLUENZAE 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease HincII 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SFIKPIYQDINSILIGQKVKRagePFEKLVYKFLKENLSDLTFKQYEYLNDLFMKNPAIIGHEARyKLFNSPTLLFLLSrgkaaTENWSIENLFEEkqndtAdILLVKDQFYELLdvktrnISksafapniisAykLAqTCAKMIDNKEFDLFDINYLEVDwELNGEDLVCVSTSFAELFKSEPSELyInWaaamqIqFHVRDLDQGFNGTREEWAKSYLKHFVTQAEQrAIsMIDkfVKPFKKYIL;SFIKPIYQDINSILIGQKVKREKLVYKFLKENLSDLTFKQYEYLNDLFMKNPAIIGHEARyKLFNSPTLLFLLSrgkaaTENWSIENLFEEkndtAdILLVKDQFYELLdvktrnISksafapniisAykLAqTCAKMIDNKEFDLFDINYLEVDwELNGEDLVCVSTSFAELFKSEPSELyInWaaamqIqFHVRDLDQGFNGTREEWAKSYLKHFVTQAEQrAIsMIDkfVKPFKKYIL E;F GCcggttaaccggc;GCcggttaaccggc 13 28 522 160;31;306;25 4;1;6;1;6;4;6;1;15;11;22;0;0;0;0;2;8;33;102;300 3E54 3e54_1_1 18984620 2.5 VULCANISAETA DISTRIBUTA 1 1 1 3 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease I-Vdi141I 1 1 1 0 0, 0 0 2 0 0 0 2 1 2 1 A;B EEDFKEGYILGFIEaegsfsvsikfqrdvfGGVrldPvFsItqkNREVLEAIKEHLGIGrImekaGqPNtYVYVVdnfnELVKLINFLNKYADFMIVkKRqFLMFREIANGlVNGEhlHINGLKRLVKLAyEltKEsekgyrkyDLNHVLSIIDKWDLG;EEDFKEGYILGFIEaegsfsvsikfqrdvfGGVrldPvFsItqkNREVLEAIKEHLGIGrImekaGqPNtYvYVVdnfnELVKLINFLNKYADFMIVkKRqFLMFREIANGlVNGEhlHINGLKRLVKLAyEltKEsekgyrkyDLNHVLSIIDKWDLG C;D;E;F ctgactctcttaa;ggtagccAA;ttggctaccttaa;gagagtcAG 164 160 680 182;35;462;1 13;6;20;0;10;0;5;0;19;14;22;0;0;0;0;7;6;33;124;401 3E6C 3e6c_1_1 18717788 1.8 DESULFITOBACTERIUM HAFNIENSE 1 1 1 1 0 0 1 Transcription factor Alpha|Beta CprK 1 1 1 0 0, 0 0 2 0 0 0 2 1 2 1 C;F 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