#QUERY: #Match: All #Protein-protein interaction: At right angle to DNA helix #PDB_ID ENTRY_ID PUBMED_ID RESOLUTION SPECIES MULTICOMPLEXITY NO_INTERFACES ASYMMETRIC_UNIT BIOLOGICAL_UNITS IS_CRUCIFORM HAS_ZDNA HAS_WATER CLASSIFICATION TYPE SUBTYPE COMPLEX_ID INTERFACE_ID DNA_DOUBLE_STRAND DNA_SINGLE_STRAND STICKY_ENDS FLIPPED_BASE NICKED_DNA GAPPED_DNA OPEN_DNA MODIFIED_DNA PROTEIN_MONOMERS MULTIMERIZATION PROT_PROT_INTERACTION DNA_PROT_INTERACTION PROT_CHAIN_IDS PROT_SEQS DNA_CHAIN_IDS DNA_SEQS SEQ_GROUPS INTERFACE_GROUP NUMBER_EFF_CONTACTS GROOVE_CONTACTS(MA;MI;BB;NA) TYPE_CONTACTS(1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13;14;15;16;17;18;19;20) 1A3Q 1a3q_1_1 9384586 2.1 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet NFkB 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B 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1BY4 1by4_2_1 10669605 2.1 HOMO SAPIENS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Hormone Nuclear Receptor, Retinoic Acid Receptor 2 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 2 2 1 1 C;D KHICAICGdrSsgkhygVYSCegCkgfFkrTVrkDlTyTCRDNKDCLIDKRQrnRCqYCrYQKCLAMGMKREavQeer;SFTKhICAICGdrSsGkhygVYScegCkgfFkrTVrkDLTyTCRDNKDCLIDKRQrnRCqYCrYQKCLAMGMKREavqee G;H CtaggtCaaaggtCAG;ctgaccTttgacCTA 46 638 266 73;0;193;0 7;1;6;0;3;0;2;0;14;0;9;0;0;0;0;1;1;25;23;174 1CKQ 1ckq_1_1 0 1.85 ESCHERICHIA COLI 1 1 1 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRI 1 1 1 2 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;E 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LSGRLNWQALAGLKASGAEQNLYNVFNAVFEGTKYVLYekPKHLkNLYAQVVLPDDVIKEIFNPLIDLSTTqwgvsPaFAIENTETHKILFGeikrqdGWVEGKDpsaGrgnaHerSCkLFTPGLLKAYRTIGGINDEEILPFWVVFEGDITRDPkrVReITFWYDHYQDNYFMWRPNESGEKLVQHFNEKLKKYLD;KSELSGRLNWQALAGLKASGAEQNLYNVFNAVFEGTKYVLYEkPKHLkNLYAQVVLPDDVIKEIFNPLIDLSTTqwgvsPaFAIENTETHKILFGeikrqdGWVEGKDPsaGrgnaHerSCkLFTPGLLKAYRTIGGINDEEILPFWVVFEGDITRDPkrVReITFWYDHYQDNYFMWRPNESGEKLVQHFNEKLKKYLD C;D gccaattggc;gccaattggC 158 628 290 110;3;175;2 6;0;0;0;4;0;2;4;7;1;10;0;0;0;0;1;5;42;38;170 1D2I 1d2i_1_1 10655616 1.7 BACILLUS SUBTILIS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease BglII 1 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B 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KPFENHLKSVDDLKTTYEEYRAGfIAfALEkNKRSTPYIERARALKVAASVAKTPKDLLYLEDIQDALLyASGIsdkAKkfLTEDDKKESINNLIENFLEPAGEEFIDELIFRYLLFQGdsLGgtMrnIagALaqQKLTRAIISALDIANIPYKWLDSRDkKyTNWMDKPEDDYELETFAkGISWTINGKHRTLMYnItVSLVkknVdICLFNCEPQQPEKYLLLGelkggidpagAdehWktANTaLTrIRNKFSEKGLSPKTIFIGAAIehsMAEEIWDQLQSGSLTNSANLTKTEQVGSLCRWIINI;QKPFENHLKSVDDLkTTYEEYRAGfIAfALEkNKRSTPYIERARALKVAASVAKTPKDLLYLEDIQDALLyASGIsdkAKkFLTEDDKKESINNLIENFLEPAGEEFIDELIFRYLLFQGdsLGgtMrnIagALaQQKLTRAIISALDIANIPYKWLDSRDkKyTNWMDKPEDDYELETFAkGISWTINGKHRTLMYnITVSLVkknVdICLFNCEPQQPEKYLLLGelkggidpagAdehWktANTaLTrIRNKFSEKGLSPKTIFIGAAIehsMAEEIWDQLQSGSLTNSANLTKTEQVGSLCRWIINI C;W TAtactcgagtat;atactcgagtat 137 625 540 102;51;381;6 10;0;7;1;4;0;2;2;16;14;24;0;0;0;0;8;2;37;70;343 1DFM 1dfm_1_1 10655616 1.5 BACILLUS SUBTILIS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease BglII 1 1 1 0 2, 2 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B KIDITDYNHADEILNPQLWKEIEETLLKPLHVkAsdqaskVGSLiFDpvGTnqYIkDELVPKHWKNnIpiPKRFdflgtdIdFGKRDTLVevqfsnyPfLLnNTVrSELFHKSNDIDEEGKVAIIITKGhFPAsnssLyYEqAQNQLNSLAEYNVFDVPIRLVGLIEDFETDIDIVSTTYAdkrysrtITKRDTVKGKVIDTNTPNTRRrkrGTIVTY;KIDITDYNHADEILNPQLWKEIEETLLKPLHVkAsdqaskVGSLiFdpvGTnqYIkDELVPKHWKNnIpiPKRFdflgtdIdFGKRDTLVevqfsnyPfLLnNTVrSELFHKSNDIDEEGKVAIIITKGhFPAsnssLyYEqAQNQLNSLAEYNVFDVPIRLVGLIEDFETDIDIVSTTyAdkrysrtITKRDTVKGKVIDTNTrkrGTIVTY C;D TAttatagatctataa;TAttatagatctataa 79 133 612 135;24;453;0 6;4;6;4;6;0;3;0;32;16;30;0;0;0;0;13;6;35;89;362 1DMU 1dmu_1_1 9736624 2.2 BACILLUS SUBTILIS 1 1 1 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease BglI 1 1 1 2 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B 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E;F agctgccaggcaccAgtG;ACTggtgcttggcagct 21 129 294 17;43;231;3 0;0;2;0;3;2;0;1;16;4;10;0;0;0;0;3;0;16;50;187 1EO3 1eo3_1_1 -1 2 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRV 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 1 2 1 1 1 A;B SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtKVLsTIFELFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKENEKIkftLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTRVATKSSLKTYNILNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsqLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK;SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtKVLsTIFeLFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNEKIKftLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTRVSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgntTnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsqLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK C;D aagaatctt;caagaatctt 1 126 373 94;7;272;0 3;2;1;3;4;6;6;2;15;16;18;0;0;0;0;7;0;16;43;231 1EO4 1eo4_1_1 -1 1.9 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRV 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 1 2 1 1 1 A;B 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SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtKVLsTIFELFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKENEKIKFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTRVKSSLKTYNIIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsqLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK;SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtKVLsTIFELFSRPIINKIAEKHGYIVEEPkqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKIkFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTRVSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsqLrNKYnNISEYRNWIYRGRK C;D aaagaatctt;caagaatctt 1 126 406 102;10;294;0 3;2;2;2;4;6;6;2;16;19;23;0;0;0;0;7;0;22;48;244 1EOO 1eoo_1_1 10801972 2.16 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRV 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtkVLsTIFELFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKENEKIkFtLggYtsfIRnNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTrVATRKSSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIhAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsQLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK;SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtkVLsTIFeLFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKQqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKENEKIkFtLggYtsfIRnNtknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTRVATRKSSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIhAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsQLrnDKYnNISEYRNWIYRGRK C;D gaagatatcttc;gaagatatcttc 1 616 479 113;18;348;0 6;2;5;4;5;6;5;2;24;25;23;0;0;0;0;6;2;23;58;283 1ERI 1eri_1_1 2399465 2.5 ESCHERICHIA COLI 1 1 1 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRI 1 1 1 2 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;E SQGVIGIFGDYAKAHDLAVGEVSKLVKKALSNEYPQLSFRYRDSIKKTEINEALKKIDPDLGGTLFvSnssikPdGGIVEVKDDYGEWRVVLVAeakhqgkDIInIRNGLLvgkRGDQDLmaagnaIerSHknISEIANFMLSESHFPYVLFLEGSNFLTENISITRPDGRVVNLeYNsgiLNrLdrLTAANYGMPINSNLCINKFVNHKDKSIMLQAASIYTQGDGREWDSKIMFEIMFDISTTSLRVLGRDLFEQLTSK;SQGVIGIFGDYAKAHDLAVGEVSKLVKKALSNEYPQLSFRYRDSIKKTEINEALKKIDPDLGGTLFvSnssikPdGGIVEVKDDYGEWRVVLVAeakhqgkDIInIRNGLLvgkRGDQDLmaagnaIerSHknISEIANFMLSESHFPYVLFLEGSNFLTENISITRPDGRVVNLeYNsgiLNrLdrLTAANYGMPINSNLCINKFVNHKDKSIMLQAASIYTQGDGREWDSKIMFEIMFDISTTSLRVLGRDLFEQLTSK B;D TcgcgaattcgCg;TcgcgaattcgCg 28 615 386 134;6;244;2 12;0;0;0;4;2;6;4;22;2;18;0;0;0;0;2;6;30;56;222 1ESG 1esg_1_1 10882125 1.9 BACILLUS AMYLOLIQUEFACIENS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease BamHI 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B 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EGLKGEGPGPLpplLQQYVELRDQYPDYLLLFQvgdfYeCFGEDAERLARALGlvLthktskdFTTPAgIpLraFEAyAERLLKGFRLAVADqVEPaEEAEglvRrEVTQLLTPGTLLQESLLPREANYLAAIATGDGWGLAFLDVSTGEFKGTVLKSKSALYDELFRHRPAEVLLAPELLENGAFLDEFRKRFPVLSEAPFEPEGEGPLALRRARGALLAYAQRTQGGALSLQPFRFYDPGAFRLPEATLRALEVFEPLRGQDTLFSVLDETRTAPGRRLLQSWLRHPLLDRGPLEARLDRVEGFVREGALREGVRRLLYRLADLERLATRLELGRASPKDLGALRRSLQILPELRALLGEEVGLPDLSPLKEELEAALVEDPPLKVSEGGLIREGYDPDLDALRAAHREGVAYFLELEERERERTGIPTLKVGynavFGYyLEVTRPYYERVPKEYRPVqTlkdrQrYTLPEKEKEREVYRLEALIRRREEEVFLEVRERAKRQAEALREAARILAELDVYAALAEVAVRYGYVRPRFGDRLQIRAGRHPVVERRTEFVPNDLEAHELVLITGPNAGKSTFLRQTALIALLAQVGSFVPAEEAHLPLFDGIYTRIGAGKSTFVEEEVALILKEATENSLVLLDEVGRGTSSLDGVAIATAVAEALHERRAYTLFATHYFELTALGLPRLKNLHVAAREEAGGLVFYHQVLPGPASKSYGVEVAAAGLPKEVVARARALLQAAAR;EGLKGEGPGpLppllQQYVELRDQYPDYLLLFQvgDfYECFGEDAERLARALGLvLtHktskdFTTPAGIPLrAFEAYAERLLKGFRLAVADqVEPvRrEVTQLLTPGTLLQESLLPREANYLAAIATGDGWGLAFLDVSTGEFKGTVLKSKSALYDELFRHRPAEVLLAPELLENGAFLDEFRKRFPVLSEAPFEPEGEGPLALRRARGALLAYAQRTQGGALSLQPFRFYDPGAFRLPEATLRALEVFEPLRGQDTLFSVLDETRTAPGRRLLQSWLRHPLLDRGPLEARLDRVEGFVREGALREGVRRLLYRLADLERLATRLELGRASPKDLGALRRSLQILPELRALLGEEVGLPDLSPLKEELEAALVEDPPLKVSEGGLIREGYDPDLDALRAAHREGVAYFLELEERERERTGIptLkVGYnavfGYYLEVtrpyYERVPKEYRPVqTlkdrQrYTLPEKEKEREVYRLEALIRRREEEVFLEVRERAKRQAEALREAARILAELDVYAALAEVAVRYGYVRPRFGDRLQIRAGRHPVVERRTEFVPNDLEAHELVLITGPNAGKSTFLRQTALIALLAQVGSFVPAEEAHLPLFDGIYTRIGAGKSTFVEEEVALILKEATENSLVLLDEVGRGTSSLDGVAIATAVAEALHERRAYTLFATHYFELTALGLPRLKNLHVAAREEAGGLVFYHQVLPGPASKSYGVEVAAAGLPKEVVARARALLQA C;D GCGACGCtagcgtgcgGctcgTC;GGacgagccgccgctagcgTCG 125 613 346 18;22;304;2 1;0;0;0;0;0;0;1;14;3;19;0;0;0;0;0;0;24;66;218 1EYU 1eyu_1_1 10903853 1.78 PROTEUS VULGARIS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease PvuII 1 1 1 0 2, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SHPDLNKLLELWPHIQEYQDLALKHGInDIFqdnGGkLLQVLLITGLTVLPGRegnDAVDNAGQEYelksinIDltKgFsthhHMNPviIAkyRQVPWIFAIYRGIAIEAIYRLEPKDLEFyYDkWERkWYSdGHkdinnpkIpVKYVMEHGTKIY;SHPDLNKLLELWPHIQEYQDLALKHGInDIFqdnGGKLLQVLLITGLTVLPgndAVDNAGQEYelksinIDltKgFsthhHMNPviIAkyRQVPWIFAIYRGIAIEAIYRLEPKDLEfyYDkwERkWYSdGHKDinnpkIpVkYVMEHGTKIY C;D tgaccagctggtC;tgaccagctggtC 41 612 422 150;11;259;2 7;4;9;0;5;3;6;3;17;4;9;0;0;0;0;5;6;23;52;269 1F0O 1f0o_1_1 10903853 2.5 PROTEUS VULGARIS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease PvuII 1 1 1 0 2, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SHPDLNKLLELWPHIQEYQDLALKHGInDIFqdnGGklLQVLLITGLTVLPegNdAVDNAGQEYelksinIDltkgFsthhHMNPviIAkyRQVPWIFAIYRGIAIEAIYRLEPKDLEfyYDkwERkWYSdGHKdinnpkIpVkYVMEHGTKIY;PDLNKLLELWPHIQEYQDLALKHGInDIFqdnGGKlLQVLLITGLTVLPegNdAVDNAGQEYelksinIDltKgFsthhHMNPviIAkyRQVPWIFAIYRGIAIEAIYRLEPKDLEfyYDkwERkWYSdGHKdinnpkIpVkYVMEHGTKIY C;D tgaccagctggtC;tgaccagctggtC 41 611 420 142;10;267;1 7;4;10;1;5;4;6;2;12;2;13;0;0;0;0;5;6;16;48;279 1F2I 1f2i_1_1 11427887 2.35 MUS MUSCULUS 3 1 1 3 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zif268 Zinc Finger 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 G;H NLLNYVVPkMrPYACPVESCDrrfsrsdeLTrhIriHTGQkPFQCRICMrnfsrsdhLtthIrTHT;NLLNYVVPkMrPYACPVESCDrrfsrSdeLTrhIriHTGQkPFQCRICMrnfsrsdhLttHIrTHT A;B atgggcgcgccCAT;atgggcgcgccCAT 58 125 289 112;3;171;3 12;1;14;0;8;0;0;0;5;17;4;0;0;0;0;4;0;33;45;146 1F2I 1f2i_2_1 11427887 2.35 MUS MUSCULUS 3 1 1 3 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zif268 Zinc Finger 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 I;J NLLNYVVPkMrPYACPVESCDrrfsrSdeLTrhIriHTGQkPFQCRICMrnfsrsdhLttHIrTHT;NLLNYVVPkMrPYACPVESCDrRfsrsdeLTrhIriHTGQkPFQCRICMRnfsrsdhLtthIrTHT C;D atgggcgcgccCAT;atgggcgcgccCAT 58 125 287 115;3;165;4 15;1;17;0;8;0;0;0;4;16;3;0;0;0;0;6;0;29;43;145 1F2I 1f2i_3_1 11427887 2.35 MUS MUSCULUS 3 1 1 3 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zif268 Zinc Finger 3 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 K;L NYVVPkMrPYACPVESCDrrfsrsdeLTrhIriHTGQkPfQCRICMrNfsrsdhLttHIrTHT;NLLNYVVPkMrPYACPVESCDrrfsrSdeLTrhIriHTGQkPFQCRICMrNfsrsdhLttHIrTHT E;F AtgggcgcgccCAT;atgggcgcgccCAT 58 610 270 110;0;157;3 15;1;13;0;8;0;1;0;4;13;2;0;0;0;0;4;0;27;46;136 1FIU 1fiu_1_1 10966652 1.6 NEISSERIA GONORRHOEAE 2 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease NgoMIV 1 1 1 0 1, 1 0 2 0 0 0 2 1 1 1 A;B 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MQPLFTQERRIFHKKLLDGNILATnNrGVVsNadgsntrSFNIAKGIADLLHSETVSErlpgqtsgnAfeAICSEFVQSAFEKLQHIRPGDWNVKQVGsRnrLEIARYQQYAHLTALAKAAEENPELAAALGSDYtItPdIIVTRNLIADAEINRNEFLVDENIATYASLRAGNGNMPLLHASISckwtIrsdrAQnARSeGLNLVRNRKGRLPHIVVVTAEPtPsrISSIALGTGEIDCVYHFALYELEQILQSLNYEdALDLFYIMVNGKRLKDISDLPLDLAV;MQPLFTQERRIFHKKLLDGNILATnNrGVVsNAdgsntrSFNIAKGIADLLHSETVSerlpgqtsgnAfeAICSEFVQSAFEKLQHIRPGDWNVKQVGsrNrLEIARYQQYAHLTALAKAAEENPELAAALGSDYTiTPdIIVTRNLIADAEINRNEFLVDENIATYASLRAGNGNMPLLHASISckwtIrsdrAQnARSeGLNLVRNRKGRLPHIVVVTAEPTPsrISSIALGTGEIDCVYHFALYELEQILQSLNYEdALDLFYIMVNGKRLKDISDLPLDLAV G;H;K;L tgcg;Tgcg;ccggcgc;ccggcgc 71 123 433 117;23;293;0 7;0;4;2;13;2;1;2;15;25;11;0;0;0;0;12;1;40;47;251 1FJL 1fjl_1_1 7671301 2 DROSOPHILA MELANOGASTER 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Paired Protein Pax 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B kQrrsrtTfSASQlDELERAFERTQypDiYTrEELAQRTNLTEArIqvwFqnRrarLrKQHTSVS;QrrsrtTfSASQlDELERAFERTQyPDiYTrEELAQRTNLTeArIqvwFqnRrarLrK D;E Aataatctgattac;Tgtaatcagattat 99 606 363 49;35;279;0 10;0;18;0;2;0;0;0;27;2;9;0;0;0;0;2;0;27;55;211 1FJL 1fjl_2_1 7671301 2 DROSOPHILA MELANOGASTER 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, Paired Protein Pax 2 1 1 2 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 C;D kqrrsrtTfSASQlDELERAFERTQypDiYTrEELAQRTNLTEArIqvwFqnRrarLrK;kqrrsrtTfSASQlDELERAFERTQypDiYTrEELAQRTNLTEArIqvwFqnRrarLrK E;F Tgtaatctgattac;Tgtaatctgattac 99 605 370 56;34;280;0 8;0;20;0;2;0;0;0;30;2;12;0;0;0;0;4;0;26;54;212 1GD2 1gd2_1_1 11017199 2 SCHIZOSACCHAROMYCES POMBE 2 1 1 3 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, PAP1 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 E;F;I;J DqepSSKrkAqnrAaqrafrKrKEDHLKALETQVVTLKELHSSTTLENDQLRQKVRQLEEELRIL;epSSKrkAqnrAaqrafrKrkEDHLKALETQVVTLKELHSSTTLENDQLRQKVRQLEEELRILK;rKAQNRETQVVTLKELHSSTTLENDQLRVRQLEEELRILK;TQVVTLKELHS A;B Aggttacgtaacc;aggttacgtaacC 100;209;266 117 256 121;0;134;1 12;0;11;0;4;0;2;0;11;0;1;0;0;0;0;2;4;23;49;137 1GD2 1gd2_2_1 11017199 2 SCHIZOSACCHAROMYCES POMBE 2 1 1 3 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, PAP1 2 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 G;H;I;J qepSSKrkAqnrAaqrafrKrkEDHLKALETQVVTLKELHSSTTLENDQLRQKVRQLEEELRIL;qepSSKrkAqnrAaqrafrKrkEDHLKALETQVVTLKELHSSTTLENDQLRQKVRQLEEELRIL;RKaQNRETQVVTLKELHSSTTLENDQLRVRQLEEELRILK;TQVVTLKELHS C;D aggttacgtaacC;AggttacgtaacC 100;209;267 117 258 120;0;137;1 12;0;10;0;4;0;2;0;10;0;1;0;0;0;0;2;4;19;48;146 1GTW 1gtw_1_1 0 1.85 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, C|EbpBeta 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B DkHSDeyKirrErnnIavrksrdkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQ;DkHSDeyKIrrernnIavrksrDkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQLP C;D AatgtggcgcaaTCCT;TaggattgcgccaCAT 23 24 243 98;0;145;0 8;0;9;0;3;0;0;0;9;4;0;0;0;0;0;5;4;32;33;136 1GU4 1gu4_1_1 0 1.8 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, C|EbpBeta 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B DkHSDeyKirrErnnIavrksrdkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQ;DkHSDeyKIrrernnIavrksrDkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQLP C;D TAggattgcgcaaTAT;aatattgcgcaaTCCT 23 24 253 108;0;145;0 8;0;8;0;3;0;0;0;9;4;0;0;0;0;0;4;5;32;36;144 1GU5 1gu5_1_1 0 2.1 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, C|EbpBeta 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B DkHSDeyKirrErnnIavrksrdkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQ;DkHSDeyKIrrernnIavrksrDkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQLP C;D TTgtgttggccaaTCA;atgattggccaaCACA 23 24 232 97;0;135;0 7;0;8;0;4;0;0;0;8;3;0;0;0;0;0;6;6;29;38;123 1H89 1h89_1_1 11792321 2.45 MUS MUSCULUS, HOMO SAPIENS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, C|EbpBeta 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B eyKIrrErnnIavrksrDkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQLPE;eyKIrrErnnIavrksrDkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQLPE D;E GatgtggcgcaaTCCTTAACGGACTG;CCAGTCCGTTAAggattgcgccacAT 23 600 233 100;0;133;0 6;0;12;0;4;0;0;0;7;3;0;0;0;0;0;6;4;31;24;136 1H8A 1h8a_1_1 11792321 2.23 AVIAN MYELOBLASTOSIS VIRUS, HOMO SAPIENS 1 2 0 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, C|EbpBeta 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B VDkHSDEyKIrrernnIavrksrDkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQL;DkHSDeyKIrrernnIavrksrDkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQL D;E GatgtggcgcaaTCCTTAACGGACTG;CCAGTCCGTTAAggattgcgccaCAT 23 598 217 88;0;129;0 6;0;10;0;2;0;0;0;8;3;0;0;0;0;0;5;4;32;29;118 1IAW 1iaw_1_1 11473254 2.4 NOCARDIA AEROCOLONIGENES 1 2 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease NaeI 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B EPDDDLERVRATLYSLDPDGDRTAGVLRDTLDQLYDGQRTGRWNFDQLHKTEKTHMGTLVEINLHREFQFGDGFETDYEIAGVQVDCKFSMSQGAWMLPPESIGHICLVIWASDQQCAWTAGLVKVIPQFLGTANRDLKRRLTPEGRAQVVKLWPDHGKLQENLLLHIPGDVRDQIFSAKssrgnqhgqaRVnELFRRVHGRLIGrAVIATVAqqddFmkrvrgsgGArSiLRPEGIIILghqdNdpKVANDLGLPVPRkgqvVAARVVPADEGDQRQTAEIQGRRWAVAVPGDPIVEAPvvPr;EPDDDLERVRATLYSLDPDGDRTAGVLRDTLDQLYDGQRTGRWNFDQLHKTEKTHMGTLVEINLHREFQFGDGFETDYEIAGVQVDCKFSMSQGAWMLPPESIGHICLVIWASDQQCAWTAGLVKVIPQFLGTANRDLKRRLTPEGRAQVVKLWPDHGKLQENLLLHIPGDVRDQIFSAKssrgnqhgqaRVnELFRRVHGRLIGrAVIATVAqqddFmkrvrgsgGArsiLRPEGIIILghqdNdPKVANDLGLPVPRkgqvVAARVVPADEGDQRQTAEIQGRRWAVAVPGDPIVEAPvvPr C;D gccacgccggcgtggc;TGccacgccggcgtggc 69 590 494 105;35;354;0 10;0;15;0;4;1;2;0;28;9;25;0;0;0;0;4;1;28;60;307 1IAW 1iaw_1_2 11473254 2.4 NOCARDIA AEROCOLONIGENES 1 2 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease NaeI 1 2 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B EPDDDLERVRATLYSLDPDGDRTAGVLRDTLDQLYDGQRTGRWNfDQLHktEktHMgtLVeINLHREFQFGDGFeTdYEIAGVQVdckfsmsQGaWmLppeSIGHICLVIWASDQQCAWTAGLVKVIPQFLGtanrdLkRrlTpEGrAQVVKLWPDHGKLQENLLLHIPGDVRDQIFSAKSSRGNQHGQARVNELFRRVHGRLIGRAVIATVAQQDDFMKRVRGSGGARSILRPEGIIILGHQDNDPKVANDLGLPVPRKGQVVAARVVPADEGDQRQTAEIQGRRWAVAVPGDPIVEAPVVPR;EPDDDLERVRATLYSLDPDGDRTAGVLRDTLDQLYDGQRTGRWNfDQLHktEktHMgtLVeINLHREFQFGDGFeTdYEIAGVQVdckfsmsQGaWmLppeSIGHICLVIWASDQQCAWTAGLVKVIPQFLGtanrdLkRrlTpEGrAQVVKLWPDHGKLQENLLLHIPGDVRDQIFSAKSSRGNQHGQARVNELFRRVHGRLIGRAVIATVAQQDDFMKRVRGSGGARSILRPEGIIILGHQDNDPKVANDLGLPVPRKGQVVAARVVPADEGDQRQTAEIQGRRWAVAVPGDPIVEAPVVPR E;F TGCcacgccggcgtGGC;TGccacgccggcgtGGC 69 589 453 137;29;285;2 9;4;15;1;9;2;1;0;8;17;13;1;0;0;2;8;4;32;66;261 1IHF 1ihf_1_1 8980235 2.2 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein DNA Bending Integrator Host Factor 1 1 1 0 1, 1 0 1 0 0 0 2 1 1 1 A;B 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gRDSLIFLVDASKAMFESQSEDELTPFDMSIQCIQSVYISKIIssDrDLLAVVFYGTEKDKNSVNFKNIYVLQELDNPGAKRILELDQFKGQQGQKRFQDMMGHGSDYSLSEVLWVCANLFSDVQFKMsHKRIMLFTNEDNPHGNDSAKASRARTKAGDLRDTGIFLDLMHLKKPGGFDISLFYRDIISVHFEESSKLEDLLRKVRAKETRKralsrlKLKLNKDIVISVGIYnLVqkAlkPppIkLYRETNEPVKTKtRTFNTSTGGLLLPSDTKrSQIYGSRQIILEkEETeELkRFDDPGLMLMGFKPLVLLKKHHYLrPSlFVYPEESLVIGSSTLFSALLIKCLEKEVAALCRYTprrniPPYFVALVPQEEELDDQKIQVTPPGFQLVfLPFADDKrKMPFTEKIMATPEQVGKMKAIVEKLRFTYRSDSFENPvLQQHFRNLEALALDLMEPEQAVDLTLPKVEAMNKRLGSLVDEFKELVYPPDY;nkAAVVLCMDVGFTMSNSIPGIESPFEQAKKVITMFVQRQVFAENkDeIALVLFGTDGTDNPLSGGDQYQNITVHRHLmlPDFDLLEDIESKIQPGSQQADFLDALIVSMDVIQHETIgkkFEKRHIEIFTDLSSRFSKSQLDIIIHSLKKCDISLQFFLPFSLGGPFRLGGHGPSFPLKGITEQQKEGLEIVKMVMISLEGEDGLDEIYSFSESLRKLCVFKKIErHsiHwpCrLTIGSNLSIRIAAYkSIlqErvKktwTVVDAKTLKkEDIQkETVYCLNDDDETEVLKEDIIQGFRYGSDIVPFSkVDEEQMkYKSEGkCFSVLGFCKSSQVQRRFFMGnqVLKVFAARDDEAAAVALSSLIHALDDLDMVAIVRyAydkranPqVGVAFPHIKHNYECLVYVQLPFMEDLrQYMFSSLKNSKKYAPTEAQLNAVDALIDSMSLAKKDEKTDTLEDLFPTTKIPNPrFQRLFQCLLHRALHPREPLPPIQQHIWNMLNPPAEVTTKSQIPLSKIKTLFPLIEAKKK C;D GTttttagttTattgggC;GCCCAGctttCCCAGCtaataaactaaaaac 211;213 582 330 19;13;297;1 5;0;5;0;0;0;0;1;27;4;10;0;0;0;0;1;1;43;41;192 1JFT 1jft_1_1 11781089 2.5 ESCHERICHIA COLI 1 1 1 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Purine Repressor 1 1 1 2 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;D atikDVAKRAnvstttVshVinKtrfvaEEtRNAVWAAIKELHyspsAVarSlkvnHTKSIGLLATSSEAAYFAEIIEAVEKNCFQKGYTLILGNAWNNLEKQRAYLSMMAQKrVDGLLVMCSEYPEPLLAMLEEYRHIPMVVMDAGEAKADFTDAVIDNAFEGGYMAGRYLIERGHREIGVIPGPLERNTGAGRLAGFMKAMEEAMIKVPESWIVQGDFEPESGYRAMQQILSQPHRPTAVFCGGDIMAMGALCAADEMGLRVPQDVSLIGYDNVRNARYFTPALTTIHQPKDSLGETAFNMLLDRIVNKREEPQSIEVHPRLIERRSVADGPFRDYRR;atikDVAKRAnvstttVshVinKtrfvaEEtRNAVWAAIKELHyspsAVarSlkvnHTKSIGLLATSSEAAYFAEIIEAVEKNCFQKGYTLILGNAWNNLEKQRAYLSMMAQKrVDGLLVMCSEYPEPLLAMLEEYRHIPMVVMDAGEAKADFTDAVIDNAFEGGYMAGRYLIERGHREIGVIPGPLERNTGAGRLAGFMKAMEEAMIKVPESWIVQGDFEPESGYRAMQQILSQPHRPTAVFCGGDIMAMGALCAADEMGLRVPQDVSLIGYDNVRNARYFTPALTTIHQPKDSLGETAFNMLLDRIVNKREEPQSIEVHPRLIERRSVADGPFRDYRR B;E TacgcaAacgtttgCGT;TacgcaAacgtttgCGT 68 98 388 88;50;246;4 4;2;4;4;6;0;2;2;6;20;10;0;0;0;0;10;6;8;60;244 1JNM 1jnm_1_1 0 2.2 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, c-jun 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B kAERkrMrnrIaasksrKrklERIARLEEKVKTLKAQNSELASTANMLREQVAQLK;kAERkrMrnrIaasksrKrklErIARLEEKVKTLKAQNSELASTANMLREQVAQLKQ C;D CGtcgatgacgtcatCGACG;CGtcgatgacgtcatCGACG 104 576 221 85;0;136;0 5;0;7;0;4;0;0;0;5;6;6;0;0;0;0;6;5;24;33;120 1LLM 1llm_1_1 14621985 1.5 MUS MUSCULUS AND SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zif268 Zinc Finger 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 C;D MkPFQCRICMrnfsrSdhLTthIrtHTGEkPfACDICGrkfarsderkrhRDiqHILPILEDKVEELLSKNYHLENEVARLKKLVGE;mkPFQCRICMrnfsrsdhLtthIrtHTGEkPfACDICGrkfarsderkrhRDiqHILPILEDKVEELLSKNYHLENEVARLKKLV A;B Tcccacgcgtggg;tcccacgcgtggg 180 551 345 111;13;221;0 8;0;15;3;10;0;0;1;11;12;3;0;0;0;0;9;2;24;37;210 1N6J 1n6j_1_1 12700764 2.2 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Alpha|Beta Cabin 1 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B;G grkkiQISRILDQRnRQvtFTkrKFgLMkkAYeLSVLCDCEIALIIFNSANRLFQYASTDMDRVLLKYTEYSEPHESRTNTDILETLKRRGIG;grkkiQISRiLDQRnRQvtFTkrKFgLMkkAYeLSVLCDCEIALIIFNSANRLFQYASTDMDRVLLKYTEYSEPHESRTNTDILETLKRr;SPKGSISEETKQKLKSAILSAQSAAN C;D agCtatttataagC;gcTtataaatagct 176;263 524 282 23;50;209;0 3;0;4;0;0;5;0;5;13;4;10;0;0;0;0;1;0;20;38;179 1NFK 1nfk_1_1 7530332 2.3 MUS MUSCULUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet NFkB 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B GPYLQILEQPKQRgfrFryVceGPShggLpGASSEkNKksYPQVKICNYVGPAKVIVQLVTNGKNIHLHAHSLVGKHCEDGVCTVTAGPKDMVVGFAnLGILhvtkkKVFETLEARMTEACIRGYNPGLLVHSDLAYLQAEGGGDRQLTDREKEIIRQAAVQQTKEMdlsVVRLMFTAFLPDSTGSFTRRLEPVVSDAIYdskApNASnLkIVRMDRTAGCVTGGEEIYLLCdkVqkDDIQIRFYEEEENGGVWEGFGDFSPTDvHrqfAIVFKTPKYKDVNITKPASVFVQLRRKSDLETSEPKPFLYYPE;GPYLQILEQPKQRGFrFryvceGpshGGLPGASSEKNKKSYPQVKICNYVGPAKVIVQLVTNGKNIHLHAHSLVGKHCEDGVCTVTAGPKDMVVGFANLGILhvtkkKVFETLEARMTEACIRGYNPGLLVHSDLAYLQAEGGGDRQLTDREKEIIRQAAVQQTKEMDlsVVRLMFTAFLPDSTGSFTRRLEPVVSDAIYDSkApNASNLKIVRMDRTAGCVTGGEEIYLLCdkVqkDDIQIRFYEEEENGGVWEGFGDFSPtDvHrqFAIVFKTPKYKDVNITKPASVFVQLRRKSDLETSEPKPFLYYPE C;D tgggaattccc;tgggaattccc 136 523 336 126;2;207;1 13;0;18;0;5;0;2;0;14;3;5;4;0;0;0;4;9;19;60;180 1NKP 1nkp_1_1 12553908 1.8 HOMO SAPIENS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Helix Loop Helix, Myc|Max 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 2 1 1 A;B GhMNVkrRthnVlerQrrnElkRSFFALRDQIPELENNEkApkvvILKKATAYILSVQAEEQKLISEEDLLRKRREQLKHKLEQLGGC;DkrAhhnAlerKrrdhikDSFHSLRDSVPSLQGEkAsrAqILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQVRALGGC F;G CGAgtagcacgtgcTACTC;CGagtagcacgtgcTAcTC 94;179 510 260 82;0;178;0 3;0;2;0;6;0;0;0;9;1;4;0;0;0;0;3;3;23;31;175 1NKP 1nkp_2_1 12553908 1.8 HOMO SAPIENS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Helix Loop Helix, Myc|Max 2 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 2 1 1 D;E MNVkrRthnVlerQrrneLkRSFFALRDQIPELENNekApkvvILKKATAYILSVQAEEQKLISEEDLLRKRREQLKHKLEQL;rAhhnAlerKrrdhIkDSFHSLRDSVPSLQGEKasraqILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQVRALGGC H;J CGAGtagcacgtgcTACTC;CGAgtagcacgtgcTacTC 94;179 509 249 83;0;166;0 3;0;2;0;6;0;0;0;8;1;4;0;0;0;0;2;2;24;28;169 1NLW 1nlw_1_1 12553908 2 HOMO SAPIENS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Helix Loop Helix, Mad|Max 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 2 1 1 A;B SrSthnemekNrrAHlrLSLEKLKGLVPLGPDSSrhttlSLLTKAKLHIKKLEDSDRKAVHQIDQLQREQRHLKRQLEK;krAhhnAlerKrrdhIkDSFHSLRDSVPSLQGEkasraqILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQV F;G GAgtagcacgtgcTAcTC;GAGtagcacgtgcTACtC 94;186 508 246 85;0;161;0 3;0;2;0;5;0;0;0;8;3;3;0;0;0;0;4;2;23;33;160 1NLW 1nlw_2_1 12553908 2 HOMO SAPIENS 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Helix Loop Helix, Mad|Max 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 2 1 1 D;E srSthnEmekNrrAHlrLSlEKLKGLVPLGPDSSRhttlSLLTKAKLHIKKLEDSDRKAVHQIDQLQREQRHLKRQL;AhhnAlerKrrdHikDSFhSLRDSVPSLQGEKasraQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQV H;J GAGtagcacgtgcTACTC;GAgtagcacgtgcTACTC 94;186 507 229 91;0;138;0 3;0;1;0;6;0;0;0;4;9;4;0;0;0;0;5;2;13;33;149 1OH6 1oh6_1_1 12907723 2.4 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein Repair Protein DNA Mismatch Repair Protein MutS 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SAIENFDAHtpmMQQYLRLKAQHPEILLFYRmgdfYeLFYDDAKRASQLLDisLtkrgasAGEPIPmagipyhaVENyLAKLVNQGESVAICEqIGDpATSkgpvErKVVRIVTPGTISDEALLQERQDNLLAAIWQDSKGFGYATLDISSGRFRLSEPADRETMAAELQRTNPAELLYAEDFAEMSLIEGRRGLRRRPLWEFEIDTARQQLNLQFGTRDLVGFGVENAPRGLCAAGCLLQYAKDTQRTTLPHIRSITMEREQDSIIMDAATRRNLEITQNLAGGAENTLASVLDCTVTPMGSRMLKRWLHMPVRDTRVLLERQQTIGALQDFTAGLQPVLRQVGDLERILARLALRTARPRDLARMRHAFQQLPELRAQLETVDSAPVQALREKMGEFAELRDLLERAIIDTPPVLVRDGGVIASGYNEELDEWRALADGATDYLERLEVRERERTGLDTLKVGfnavhGYYIQISRGQSHLAPINYMRRqTlknaErYIIPELKEYEDKVLTSKGKALALEKQLYEELFDLLLPHLEALQQSASALAELDVLVNLAERAYTLNYTCPTFIDKPGIRITEGRHPVVEQVLNEPFIANPLNLSPQRRMLIITGPNMGGKSTYMRQTALIALMAYIGSYVPAQKVEIGPIDRIFTRVGFMVEMTETANILHNATEYSLVLMDEIGRGTSTYDGLSLAWACAENLANKIKALTLFATHYFELTQLPEKMEGVANVHLDALEHGDTIAFMHSVQDGAASKSYGLAVAALAGVPKEVIKRARQKLRELESIS;mQQYLRLKAQHPEILLFYrMgdfYELFYDDAKRASQLLDISLTPMAGIPYhAVENYLAKLVNQGESVAICErKVVRIVTPGTISDEALLQERQDNLLAAIWQDSKGFGYATLDISSGRFRLSEPADRETMAAELQRTNPAELLYAEDFAEMSLIEGRRGLRRRPLWEFEIDTARQQLNLQFGTRDLVGFGVENAPRGLCAAGCLLQYAKDTQRTTLPHIRSITMEREQDSIIMDAATRRNLEITQNLAGGAENTLASVLDCTVTPMGSRMLKRWLHMPVRDTRVLLERQQTIGALQDFTAGLQPVLRQVGDLERILARLALRTARPRDLARMRHAFQQLPELRAQLETVDSAPVQALREKMGEFAELRDLLERAIIDTPPVLVrDGGVIASGYNEELDEWRALADGATDYLERLEVRERERTGLdtLkVGFnavhGYYIqIsrGqSHLAPINYMRRqTlknaErYIIPELKEYEDKVLTSKGKALALEKQLYEELFDLLLPHLEALQQSASALAELDVLVNLAERAYTLNYTCPTFIDKPGIRITEGRHPVVEQVLNEPFIANPLNLSPQRRMLIITGPNMGGKSTYMRQTALIALMAYIGSYVPAQKVEIGPIDRIFTRVGTFMVEMTETANILHNATEYSLVLMDEIGRGTSTYDGLSLAWACAENLANKIKALTLFATHYFELTQLPEKMEGVANVHLDALEHGDTIAFMHSVQDGAASKSYGLAVAALAGVPKEVIKRARQKLRELESIS E;F agctgccaagcaccAg;CTggtgcatggcagct 21 504 335 24;46;264;1 1;0;2;0;3;1;0;0;17;7;15;0;0;0;0;3;0;17;61;208 1OH7 1oh7_1_1 12907723 2.5 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein Repair Protein DNA Mismatch Repair Protein MutS 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SAIENFDAHtpmMQQYLRLKAQHPEILLFYRmgdfYeLFYDDAKRASQLLdisLtkrgasAGEPIPmagipyhaVEnyLAKLVNQGESVAICEqIGDpATskgpvErKVVRIVTPGTISDEALLQERQDNLLAAIWQDSKGFGYATLDISSGRFRLSEPADRETMAAELQRTNPAELLYAEDFAEMSLIEGRRGLRRRPLWEFEIDTARQQLNLQFGTRDLVGFGVENAPRGLCAAGCLLQYAKDTQRTTLPHIRSITMEREQDSIIMDAATRRNLEITQNLAGGAENTLASVLDCTVTPMGSRMLKRWLHMPVRDTRVLLERQQTIGALQDFTAGLQPVLRQVGDLERILARLALRTARPRDLARMRHAFQQLPELRAQLETVDSAPVQALREKMGEFAELRDLLERAIIDTPPVLVRDGGVIASGYNEELDEWRALADGATDYLERLEVRERERTGLDTLKVGfnavhGYYIQISRGQSHLAPINYMRRqTlknAErYIIPELKEYEDKVLTSKGKALALEKQLYEELFDLLLPHLEALQQSASALAELDVLVNLAERAYTLNYTCPTFIDKPGIRITEGRHPVVEQVLNEPFIANPLNLSPQRRMLIITGPNMGGKSTYMRQTALIALMAYIGSYVPAQKVEIGPIDRIFTRVGFMVEMTETANILHNATEYSLVLMDEIGRGTSTYDGLSLAWACAENLANKIKALTLFATHYFELTQLPEKMEGVANVHLDALEHGDTIAFMHSVQDGAASKSYGLAVAALAGVPKEVIKRARQKLRELESIS;MQQYLRLKAQHPEILLFYrmgdfYELFYDDAKRASQLLDISLTPMAGIPYHAVENYLAKLVNQGESVAICErKVVRIVTPGTISDEALLQERQDNLLAAIWQDSKGFGYATLDISSGRFRLSEPADRETMAAELQRTNPAELLYAEDFAEMSLIEGRRGLRRRPLWEFEIDTARQQLNLQFGTRDLVGFGVENAPRGLCAAGCLLQYAKDTQRTTLPHIRSITMEREQDSIIMDAATRRNLEITQNLAGGAENTLASVLDCTVTPMGSRMLKRWLHMPVRDTRVLLERQQTIGALQDFTAGLQPVLRQVGDLERILARLALRTARPRDLARMRHAFQQLPELRAQLETVDSAPVQALREKMGEFAELRDLLERAIIDTPPVLVrDGGVIASGYNEELDEWRALADGATDYLERLEVRERERTGLdtLkVGFnavhGYYIqIsRgqSHLAPINYMRRqTlknAErYIIPELKEYEDKVLTSKGKALALEKQLYEELFDLLLPHLEALQQSASALAELDVLVNLAERAYTLNYTCPTFIDKPGIRITEGRHPVVEQVLNEPFIANPLNLSPQRRMLIITGPNMGGKSTYMRQTALIALMAYIGSYVPAQKVEIGPIDRIFTRVGTFMVEMTETANILHNATEYSLVLMDEIGRGTSTYDGLSLAWACAENLANKIKALTLFATHYFELTQLPEKMEGVANVHLDALEHGDTIAFMHSVQDGAASKSYGLAVAALAGVPKEVIKRARQKLRELESIS E;F agctgccaggcaccAgtG;acTggtgcgtggcagct 21 503 344 24;43;274;3 0;0;2;0;4;2;1;0;20;6;17;0;0;0;0;2;0;18;64;208 1OUZ 1ouz_1_1 12842466 2.41 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein DNA Bending Integrator Host Factor 1 1 1 0 1, 1 0 1 0 0 0 2 1 1 1 A;B aLtkaEMSEYLFDKLGLSkRDAkELVELFFEEIRRALENGEqVkLsgfGnFDLrdknqrpgrnpktgeDipiTArRvvtfrpgqklkSRVENASPK;MtksELIeRLATQQSHIPaKTVEDAVkEMLEHMASTLAQGErIairgFgsFsLhyraPrTGrnpkTGDKvElEGkYvPhfkPgkELrDRANIYG C;D;E cGGTGctacaaattgataagcaatgCTTttttGGC;ggCCAAAAaagCatt;GCttatcaattTGTagcaCC 63;64 8 464 33;89;338;4 7;0;12;1;0;2;1;1;35;8;20;0;0;0;0;1;0;29;85;262 1OWF 1owf_1_1 12842466 1.95 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein DNA Bending Integrator Host Factor 1 1 1 0 1, 1 0 1 0 0 0 2 1 1 1 A;B aLtkaEMSEYLFDKLGLSkRDAkELVELFFEEIRRALENGEQVkLsgfGnFDLrdknqrpgrnpktgedipiTArRvvtFrpgqkLkSRVENASPK;MtksELIeRLATQQSHIPaKTVEDAVkEMLEHMASTLAQGErIairgFgsFsLhyraPrTgrnpkTGDKvElEGkYvPhfkPgkeLrDRANIYG C;D;E cGGTGCaacaaattgataagcaatgCTTTtttGGC;ggCCAAAAaagCAtt;GCttatcaattTGttgcaCC 63;64 8 452 26;81;343;2 7;0;13;0;0;2;1;1;36;8;15;0;0;0;0;1;0;28;78;262 1OWG 1owg_1_1 12842466 2.1 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein DNA Bending Integrator Host Factor 1 1 1 0 1, 1 0 1 0 0 0 2 1 1 1 A;B aLtkaEMSEYLFDKLGLSkRDAkELVELFFEEIRRALENGEQVkLsgfGnFDLrdknqrpgrnpkTgeDipitArRvvtFrpgqkLkSRVENASPK;MtkseLIeRLATQQSHIPaKTVEDAVkEMLEHMASTLAQGErIeirgFgsFSLhyraPrTGrnpkTGDKvElEGkYvphfkPgkELrDRANIYG C;D;E cGGTGctacaaattgataagcaatgCTTttttGGC;ggCCAAAAaagCAtt;GCttatcaattTGTagcacC 63;64 8 461 29;88;341;3 7;0;12;0;0;2;1;1;35;7;15;0;0;0;0;1;0;35;85;260 1P47 1p47_1_1 12818197 2.2 MUS MUSCULUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Zif268 Zinc Finger 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B ErPyACPVESCDrrfsrsdeLtrhIriHTGQkPfQCRICMrnfsrsdhLtthIrtHTGEkPfACDICGrkfarsderkrhTKiHLrq;rPYACPVESCDrrfsrsdeLtrhIriHTGQkPfQCRICMrnfsrsdhLtthIrtHTGEkPfACDICGrkfarsderkrhTkiHL C;D gtggcgtgggcggcgtgggcgt;cacgcccacgccgcccacgCCA 19 496 513 183;1;329;0 25;1;24;0;16;0;0;0;12;26;5;0;0;0;0;10;1;44;51;298 1P51 1p51_1_1 12853489 2.5 ANABAENA SP. 2 1 1 2 0 0 1 Structural|DNA Binding protein DNA Packaging Histone-like, HU Protein 1 1 1 0 2, 2 1 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B MNKGELVDAVAEKASVTKKQADAVLTAALETIIEAVSSGDKVTLVGFGSFESrerkaregrnpkTnEkmEipAtRvPAfsAGKLFrEKVAPP;MNKGELVDAVAEKASVTKKQADAVLTAALETIIEAVSSGDkVTLVGFGSFeSrerkaregrnpktnEkmEipAtRvPAfsAGKLFrEKVAPP E;F gCatatcaatttgttgCAT;GCatatcaatttgttgcAT 42 495 320 14;87;215;4 7;0;7;0;0;0;2;4;16;4;6;0;0;0;0;0;0;22;46;206 1P51 1p51_2_1 12853489 2.5 ANABAENA SP. 2 1 1 2 0 0 1 Structural|DNA Binding protein DNA Packaging Histone-like, HU Protein 2 1 1 0 2, 2 1 0 0 0 0 2 1 1 1 C;D MNKGELVDAVAEKASVTKKQADAVLTAALETIIEAVSSGDkVtLVGFGsFeSrerkaregrnpktnEkmEipAtRvPAfsaGkLFrEKVAPP;MNKGELVDAVAEKASVTKKQADAVLTAALETIIEAVSSGDkVTLVGFGSFeSrerkaregrnpkTnEkmEiPAtRvPAfsAGKLFrEKVAPP H;I gCatatcaatttgttgcAT;gCatatcaatttgttgcAT 42 494 326 14;90;218;4 10;0;7;0;0;0;2;3;17;5;6;0;0;0;0;0;0;28;45;203 1P71 1p71_1_1 12853489 1.9 ANABAENA SP. 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein DNA Packaging Histone-like, HU Protein 1 1 1 0 0, 0 1 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B MNKGELVDAVAEKASVTKKQADAVLTAALETIIEAVSSGDkVTLVGFGSFESrerkaregrnpktnEkmEiPAtRvPAfsAGKLFrEKVAPPKa;MNKGELVDAVAEKASVTKKQADAVLTAALETIIEAVSSGDkVTLVGFGSFESrerkaregrnpkTnEkmEiPAtRvPAfsAGkLFrEKVAPPK C;D tgCttatcaatttgttgcAC;tGCttatcaatttgttgcAc 42 492 330 17;83;227;3 7;0;5;0;0;0;2;5;21;2;4;0;0;0;0;0;0;28;56;200 1P78 1p78_1_1 12853489 2.25 ANABAENA SP. 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein DNA Packaging Histone-like, HU Protein 1 1 1 0 0, 0 1 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B MNKGELVDAVAEKASVTKKQADAVLTAALETIIEAVSSGDkVTLVGFGSFESrerkaregrnpktnEkmEipAtRvPAfsAGKLFrEKVAPP;MNKGELVDAVAEKASVTKKQADAVLTAALETIIEAVSSGDkVTLVGFGSFESrerkaregrnpktnEkmEipAtRvPAfsAGkLFrEKVAPP C;D tgCatatcaatttgttgcAC;tGCatatcaatttgttgcAcC 42 491 312 14;82;214;2 8;0;6;0;0;0;2;4;15;3;5;0;0;0;0;0;0;26;57;186 1PUF 1puf_1_1 12923056 1.9 HOMO SAPIENS, MUS MUSCULUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Homeodomain, HoxA9 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 2 1 1 A;B NNPAANWlharStrkkrcpyTkHQtLELEKEFLFNMylTrDRrYEVARLLNLTErqVkiwFqnRrmkMkkiNKDRAK;ArRkrrnfNKQAtEILNEYFYSHLSNPypSeEAkEELAKKCGITVSqVsnwFgnKrirYkkNIGKfQEEANIY D;E ACTCTatgatttacgaCGCT;TAgcgtcgtaaatcatagAG 191;246 483 406 72;25;309;0 10;0;8;0;6;0;1;0;25;3;10;0;0;0;0;3;0;29;76;235 1QPI 1qpi_1_1 10700280 2.5 ESCHERICHIA COLI 1 1 1 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Tetracyclin Repressor 1 1 1 2 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B lNRESVIDAALELLNETGIdglttrkLAQKLgieqptLywhVknkRALLDALAVEILARHHDYSLPAAGESWQSFLRNNAMSFRRALLRYRDGAKVHLGTRPDEKQYDTVETQLRFMTENGFSLRDGLYAISAVSHFTLGAVLEQQEHTAALENLPPLLREALQIMDSDDGEQAFLHGLESLIRGFEVQLTALLQ;lNRESVIDAALELLNETGIdglttrkLAQKLgieqptLywhVknkRALLDALAVEILARHHDYSLPAAGESWQSFLRNNAMSFRRALLRYRDGAKVHLGTRPDEKQYDTVETQLRFMTENGFSLRDGLYAISAVSHFTLGAVLEQQEHTAALENLPPLLREALQIMDSDDGEQAFLHGLESLIRGFEVQLTALLQ M;N;Q;R cctatCAAtgatAGA;tctatCATtgatAGG;cctatCAAtgatAGA;tctatCATtgatAGG 159 478 436 156;0;280;0 16;0;8;0;4;0;6;0;4;28;24;0;0;0;0;4;4;16;96;226 1QPS 1qps_1_1 0 2.5 ESCHERICHIA COLI 1 1 1 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRI 1 1 1 2 1, 1 0 2 0 0 0 2 1 1 1 A;B SQGVIGIFGDYAKAHDLAVGEVSKLVKKALSNEYPQLSFRYRDSIKKTEINEALKKIDPDLGGTLFvsnssikPdGGIVEVKDDYGEWRVVLVAeakhqgkDIInIRNGLLvgkRGDqDLmaagnaIerSHknISEIANFMLSESHFPYVLFLEGSNFLTENISITRPDGRVVNLEYnsgiLNrLdrLTAANYGMPINSNLCINKFVNHKDKSIMLQAASIYTQGDGREWDSKIMFEIMFDISTTSLRVLGRDLFEQLTSK;SQGVIGIFGDYAKAHDLAVGEVSKLVKKALSNEYPQLSFRYRDSIKKTEINEALKKIDPDLGGTLFvsnssikPdGGIVEVKDDYGEWRVVLVAeakhqgkDIInIRNGLLvgkRGDqDLmaagnaIerSHknISEIANFMLSESHFPYVLFLEGSNFLTENISITRPDGRVVNLEYnsgiLNrLdrLTAANYGMPINSNLCINKFVNHKDKSIMLQAASIYTQGDGREWDSKIMFEIMFDISTTSLRVLGRDLFEQLTSK M;N;Q;R tcgcg;aattcgcg;tcgcg;aattcgcg 28 477 426 136;4;284;2 8;0;0;0;4;2;6;4;18;2;26;0;0;0;0;2;6;24;62;262 1QPZ 1qpz_1_1 10438625 2.5 ESCHERICHIA COLI 1 1 1 1 0 0 1 Transcription factor Helix Turn Helix Purine Repressor 1 1 1 2 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B atikDVAKRAnvstttVshVInKtrfvaEEtRNAVWAAIKELHyspsAVarSlkvnHTKSIGLLATSSEAAYFAEIIEAVEKNCFQKGYTLILGNAWNNLEKQRAYLSMMAQKrVDGLLVMCSEYPEPLLAMLEEYRHIPMVVMDWGEAKADFTDAVIDNAFEGGYMAGRYLIERGHREIGVIPGPLERNTGAGRLAGFMKAMEEAMIKVPESWIVQGDFEPESGYRAMQQILSQPHRPTAVFCGGDIMAMGALCAADEMGLRVPQDVSLIGYDNVRNARYFTPALTTIHQPKDSLGETAFNMLLDRIVNKREEPQSIEVHPRLIERRSVADGPFRDYR;atikDVAKRAnvstttVshVInKtrfvaEEtRNAVWAAIKELHyspsAVarSlkvnHTKSIGLLATSSEAAYFAEIIEAVEKNCFQKGYTLILGNAWNNLEKQRAYLSMMAQKrVDGLLVMCSEYPEPLLAMLEEYRHIPMVVMDWGEAKADFTDAVIDNAFEGGYMAGRYLIERGHREIGVIPGPLERNTGAGRLAGFMKAMEEAMIKVPESWIVQGDFEPESGYRAMQQILSQPHRPTAVFCGGDIMAMGALCAADEMGLRVPQDVSLIGYDNVRNARYFTPALTTIHQPKDSLGETAFNMLLDRIVNKREEPQSIEVHPRLIERRSVADGPFRDYR M;Q TacgcaAacgtttgCGT;TacgcaAacgtttgCGT 68 98 398 96;42;256;4 6;0;2;4;6;0;2;2;10;16;14;0;0;0;0;8;6;8;68;246 1QRH 1qrh_1_1 0 2.5 ESCHERICHIA COLI 1 1 1 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRI 1 1 1 2 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SQGVIGIFGDYAKAHDLAVGEVSKLVKKALSNEYPQLSFRYRDSIKKTEINEALKKIDPDLGGTLFvsnssIkPdGGIVEVKDDYGEWRVVLVAEakhqgkDIINIRNGLLvgkRGDQDLmaagnaIekSHknISEIANFMLSESHFPYVLFLEGSNFLTENISITRPDGRVVNLEYnsgiLNrLdrLTAANYGMPINSNLCINKFVNHKDKSIMLQAASIYTQGDGREWDSKIMFEIMFDISTTSLRVLGRDLFEQLTSK;SQGVIGIFGDYAKAHDLAVGEVSKLVKKALSNEYPQLSFRYRDSIKKTEINEALKKIDPDLGGTLFvsnssIkPdGGIVEVKDDYGEWRVVLVAEakhqgkDIINIRNGLLvgkRGDQDLmaagnaIekSHknISEIANFMLSESHFPYVLFLEGSNFLTENISITRPDGRVVNLEYnsgiLNrLdrLTAANYGMPINSNLCINKFVNHKDKSIMLQAASIYTQGDGREWDSKIMFEIMFDISTTSLRVLGRDLFEQLTSK M;Q TcgcgaattcgCg;TcgcgaattcgCg 28 476 368 122;10;234;2 10;0;2;0;4;0;6;4;12;8;18;0;0;0;0;2;6;16;52;228 1R0O 1r0o_1_1 14592980 2.24 DROSOPHILA MELANOGASTER 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Hormone Nuclear Receptor, Glucocorticoid Receptor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 2 1 1 A;B hLCSICGdrAsgkhygVySCegCkgfFkrTVrkDlTyACrENRNCIIDKRQrnrCqYCrYQKCLTCGMkREavqEe;EELCLVCGdrAsgyhyNALTCegCkgfFrrSVtkSAVyCCkFGRACEMDMYMrrkCqECrLKKCLAVGMRPEcVvpEn C;D CcgaggtCAatgaccTCG;CcgaggtCAttgaccTCG 46;245 472 295 75;0;220;0 7;0;6;0;3;0;2;0;14;0;10;0;0;0;0;1;0;31;29;192 1R71 1r71_1_1 15170177 2.2 ESCHERICHIA COLI 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Alpha Helix Repressor KorB 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 1 2 1 1 1 A;B EADQVIENlQRnELTpREiADFIGRELAKGKkkgdIAkEIgkspafitqhvtLLDLPEKIADAFNTGrVrdvtVVneLVtAFkkRPEEVEAWLDDDTQEitrgTVkLLrEFLdE;YNEADQVIENlQRnELTpREiADFIGRELAKGKkkgdIAkEIgkspafitqhvtLLDLPEKIADAFNTGRVrdvtVVneLVtAFkkRPEEVEAWLDDDTQEitrgTVkLLrEFLDE E;F;I;J atttAgcggctaAAAG;ctttagccgctaaAA;ctttaGccgctAaAA;atttagcggctAAAAG 87 97 376 111;0;263;2 4;3;7;0;4;0;0;0;6;15;20;0;0;0;0;13;6;30;50;218 1R71 1r71_2_1 15170177 2.2 ESCHERICHIA COLI 2 1 1 2 0 0 1 Transcription factor Alpha Helix Repressor KorB 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 1 2 1 1 1 C;D ADQVIENlQRnELTpREiADFIGRELAKGKkkgDIAKEIgkspafitqhvtLLDLPEKIADAFNTGrVrdvtVVneLvtAFkkRPEEVEAWLDDDTQEitrgTVkLLrEFLD;NEADQVIENlQRnELTpREiADFIGRELAKGKkkgDIAKEIgkspafitqhvtLLDLPEKIADAFNTGRVrdvtVVneLvtAFkkRPEEVEAWLDDDTQeitrgTVkLLrEFLdE G;H;K;L atttagcggctaaAAG;ctttAgccgctAAAA;atttagcggctaAAAG;ctttAGccgctAAAA 87 97 391 119;0;270;2 3;2;9;0;4;0;0;0;4;19;22;0;0;0;0;14;7;30;57;220 1R8E 1r8e_1_1 14985361 2.4 BACILLUS SUBTILIS 1 1 1 1 0 0 1 Transcription factor Alpha|Beta Activator MerR 1 1 1 2 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;D ESYYsigEVSKLANVsikaLryyDKIDLFKPAYVdPdtsyryYTDSQLIHLDLIKSLkYIGTpleEMKKAQDLEMEELFAFYTEQERQIREKLDFLSALEQTISLVKKRMKRQMEYPALGEVFVLDEEEIRIIQTEAEGIGPENVLNASYSKLKKFIESADGFTNNSYGATFSFQPYTSIDEMTYRHIFTPVLTNKQISSITPDMEITTIPKGRYACIAYNFSPEHYFLNLQKLIKYIADRQLTVVSDVYELIIPIHYSPKKQEEYRVEMKIRIA;ESYYsigEVSKLANVsikaLryyDKIDLFKPAYVdPdtsyryYTDSQLIHLDLIKSLkYIGTpleEMKKAQDLEMEELFAFYTEQERQIREKLDFLSALEQTISLVKKRMKRQMEYPALGEVFVLDEEEIRIIQTEAEGIGPENVLNASYSKLKKFIESADGFTNNSYGATFSFQPYTSIDEMTYRHIFTPVLTNKQISSITPDMEITTIPKGRYACIAYNFSPEHYFLNLQKLIKYIADRQLTVVSDVYELIIPIHYSPKKQEEYRVEMKIRIA B;E GAccctcCCCTtaggggAGGgtc;GAccctcCCCTtaggggAGGgtc 141 468 286 44;10;232;0 2;0;4;0;0;0;0;0;2;6;12;0;0;0;0;0;0;14;50;196 1RH6 1rh6_1_1 15066428 1.7 BACTERIOPHAGE LAMBDA 1 1 1 2 0 0 1 Enzyme Excisionase Excisionase Lambda 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B MYLTLqEWNARQrrpRsleTVrRWVRESRIFPPPVKDGreYLFHESAVKVDLNRP;MYLtlqEWNARQRrPrsletVrrwVreSrIFPPPVkdgreyLFHESAVkVdL C;D tatgtaGTCtgttg;CAacagactaCATA 105 467 204 33;11;160;0 2;0;7;0;3;0;0;0;9;3;6;0;0;0;0;3;0;22;17;132 1RV5 1rv5_1_1 9545372 2.1 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRV 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtkVLsTIFELFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKENEKIkFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTrVSSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsQLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK;SLRSDLINALDVCGIISAEGKIYPLGSDtkVLsTIFeLFSRPIINKIAEKHGYIVEEPkqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKIkFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTRVLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsqLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK C;D aaagatatctt;aaagatatctt 1 460 444 117;13;314;0 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3;0;1;0;0;0;10;0;8;6;9;0;0;0;0;0;4;6;53;161 2AC0 2ac0_1_1 16793544 1.8 HOMO SAPIENS 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Loop Sheet Helix, Tumor Supressor Protein p53 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 1 0 2 1 1 1 A;B SSSVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGTaksvtCTYSPALNKMFCqLAkTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnssCmGGMnrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcacPGrdRRtEEEnLRKK;SSSVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGtaksVTCTYSPALNKMFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnSsCmGGMNrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcacPgrdRrtEEEnLRK E;F cgggCatgccCg;cgggCatgccCG 8 365 213 61;8;138;6 7;1;7;1;2;0;0;0;13;3;7;0;0;0;0;3;1;17;34;117 2AC0 2ac0_2_1 16793544 1.8 HOMO SAPIENS 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Loop Sheet Helix, Tumor Supressor Protein p53 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 C;D SVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGTaksVTCTYSPALNKMFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnssCmGGMnrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcacPGrdRrtEEEnLR;SVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGTaksvTCTYSPALNKMFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnSsCmGGMnrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcacPGrdRrtEEEnLRKKG G;H cgggCatgccCG;cgggCatgccCG 8 364 179 52;3;124;0 7;2;8;1;1;0;0;0;10;3;5;0;0;0;0;2;0;17;25;98 2ADY 2ady_1_1 16793544 2.5 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Loop Sheet Helix, Tumor Supressor Protein p53 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 1 0 2 1 1 1 A;B SSVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGTaksVTCTYSPALNKMFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnssCmGGMnrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcacPGrdRrtEEEnLRKK;SSSVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGtaksVTCTYSPALNKMFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnSsCmGGMNrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcacPGrdRrtEEenLRK E;F cggaCatgtcCG;cggaCatgtcCG 8 363 186 56;3;125;2 6;1;8;1;0;1;0;2;10;3;5;0;0;2;0;4;0;16;28;99 2AHI 2ahi_1_1 16793544 1.85 HOMO SAPIENS 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Loop Sheet Helix, Tumor Supressor Protein p53 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SSVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGTaksvtCTYSPALNKMFCqLAkTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHhERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnssCmGGMnrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcacPGrdRRtEEEnLRKKG;SSSVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGTakSVTCTYSPALNKMFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnssCmGGMnrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcacPGrdRRtEEEnLRK E;F cggaCatgtC;gGACatgtcCG 8 361 185 34;10;141;0 13;0;4;0;0;0;0;0;19;2;6;0;0;2;0;2;0;12;25;100 2AHI 2ahi_2_1 16793544 1.85 HOMO SAPIENS 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Loop Sheet Helix, Tumor Supressor Protein p53 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 C;D SVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGTaksvTCTYSPALNKMFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnssCmGGMnrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcacPGrdRRtEEEN;SVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGTaksVTCTYSPALNKMFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnssCmGGMnrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcacPGrdRrtEEEnLRK G;H cggaCatgtCCG;cggaCatgtcCG 8 360 191 56;10;125;0 12;2;8;1;1;0;0;0;16;2;8;0;1;2;0;3;0;13;23;99 2ATA 2ata_1_1 16793544 2.2 HOMO SAPIENS 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Loop Sheet Helix, Tumor Supressor Protein p53 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGTaksVTCTYSPALNKMFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHhERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnssCmGGMnrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcacPGrdRRtEEEnLRKK;SSSVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGTaksVTCTYSPALNKMFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnssCmGGMnrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcacPGrdRRtEEEnLRKK E;F aaggCatgcc;aggCatgccTT 8 353 185 46;12;127;0 15;1;7;0;1;0;0;0;15;2;5;0;2;0;0;2;0;12;26;97 2ATA 2ata_2_1 16793544 2.2 HOMO SAPIENS 2 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Loop Sheet Helix, Tumor Supressor Protein p53 2 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 C;D SVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGTaksVTCTYSPALNKMFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnssCmGGMnrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcacPGrdRRtEEEnLRK;SSSVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGTaksVTCTYSPALNKMFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCnssCmGGMnrRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVrvcacPGrdRrtEEENLRK G;H aaggCatgccTT;aaggCatgccT 8 352 177 50;7;120;0 8;2;5;1;4;0;0;0;6;3;4;0;0;0;0;2;0;13;26;103 2B0D 2b0d_1_1 16236314 2 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRV 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtKVLsTIFELFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKEKIKFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTRVLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsqLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK;SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtKVLsTIFeLFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKEKIKFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTrVATSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsqLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK C;D aaagaattctt;aaagaattctt 1 351 430 96;11;322;1 2;0;1;5;4;6;4;2;18;28;23;0;0;0;0;7;2;22;58;248 2B0E 2b0e_1_1 16236314 1.9 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRV 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 1 2 1 1 1 A;B SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSdtKVLsTIFELFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTKIKFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVYTRVLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsqLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK;SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDtkVLsTIFELFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKqqnhyPdFTLYKPSEPNKKIAIdikttyTNKKIkFtLggYtsfIRNNTknIVYPFDQYIAHWIIGYVyTRVSLKTYNINELNEIPKPYKGVKVFLQDKWVIAGDlagsgnttnIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNyErtsQLrNDKYnNISEYRNWIYRGRK C;D aaagaatctt;aaagaatctt 1 350 397 91;14;292;0 6;1;4;1;4;6;4;2;17;27;18;0;0;0;0;8;0;14;49;236 2BAM 2bam_1_1 9783752 2 BACILLUS AMYLOLIQUEFACIENS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease BamHI 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B MEVEKEFITDEAKELLSKDKLIQQAYNEVKTSICSPIWPATSKTFTINNTEkNCNgvvPIkELCYTLLEDTYNWYReKPLDILkLEKKkggpIdVYKEFIENSELKRVGMefetgnIssAHrsMNkLLLGLKHGEIDLAIILMPIkqLAyyLtdrvTnFEeLEPyFELTEGQPFIFIGFNAEAYNSNVPLIpkgsdgmskRsikkwK;MEVEKEFITDEAKELLSKDKLIQQAYNEVKTSICSPIWPATSKTFTINNTEkNCNgvvPIkELCyTLLEDTYNWYReKPLDILKLEKKkggpIdVYKEFIENSELKRVGMefetgnIssAHrsMNkLLLGLKHGEIDLAIILMPIkQLAyYLtdrvTNFEeLEPyFELTEGQPFIFIGFNAEAYNSNVPLIPkgsDGmskRSIKkWKDKV C;D tatggatccaTA;tatggatccat 40 50 470 132;30;306;2 4;1;5;0;5;3;2;3;5;16;21;0;0;0;0;3;7;35;81;279 2C9L 2c9l_1_1 16483937 2.25 HUMAN HERPESVIRUS 4 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, BZLF1 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 Y;Z MlEIkrYknrVaarksrAkfkQLLQHYREVAAAKSSENDRLRLLLKQMCPSLDVDSIIPRTPD;LEiKrYknrVaarksrAkFkQLLQHYREVAAAKSSENDRLRLLLKQMCPSLDVDSIIPRTPD A;B AAGCactgactcatGAAGT;ACTtcatgagtcaGTGCT 199 334 187 65;0;122;0 4;0;5;0;4;0;0;0;1;4;1;0;0;0;0;4;4;24;38;98 2DGC 2dgc_1_1 7500340 2.2 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 1 1 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, GCN4 1 1 1 2 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;D ALkrArntEaarrsrArklQrMKQLEDKVEELLSKNYHLENEVARLKKL;ALkrArntEaarrsrArklQrMKQLEDKVEELLSKNYHLENEVARLKKL B;E TGGAgatgacgtcaTCTCC;TGGAgatgacgtcaTCTCC 206 329 172 62;0;110;0 6;0;2;0;4;0;0;0;6;6;0;0;0;0;0;6;4;42;26;70 2E42 2e42_1_1 0 1.8 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, C|EbpBeta 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B DkHSDeyKIrrErnnIaarksrdkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFK;DkHSDEyKIrrernnIaarksrDkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQL C;D TaggattgcgcaaTAT;aatattgcgcaaTCCT 23 321 232 95;0;137;0 8;0;7;0;2;0;0;0;11;5;0;0;0;0;0;4;5;29;33;128 2E43 2e43_1_1 0 2.1 HOMO SAPIENS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Leucine Zipper, C|EbpBeta 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SDeyKirrErnnIavrksrdkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFK;SDEyKIrrernnIavrksrDkakMrNLETQHKVLELTAENERLQKKVEQLSRELSTLRNLFKQL C;D TAggattgcgcaaTAT;aatattgcgcaaTCCT 23 24 245 107;0;138;0 8;0;8;0;2;0;0;0;9;4;0;0;0;0;0;4;5;25;37;143 2E52 2e52_1_1 0 2 HAEMOPHILUS INFLUENZAE 3 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease HindIII 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B KKSALEKLLSLIENLTNqefkQATNSLISFIYKLNRNEVIELVRSIGIlPEAIKpsstQekLFskAGdIVLAKAFQLLNLNSKPLeQrgnaGdVIALSKEFNYGLVAdaksfrLsrtaknqkdFkVKALSEwREDKDYAVLTAPFFQYpttksqIFKQSLDENVLLFSWEHLAILLQLDLEETNIFSFEQLWNFPKKQSKKTSVSDAeNNFMRDFNKYFMDLFKIDKDTLNQLLQKEINFIEERSLIEKEYWKKQINIIKNFTREEAIEALLkdInMSskIETIDSFIKGIKSNDRLYL;KSALEKLLSLIENLTNqefkQAtNSLISFIYKLNRNEVIELVRSIGIlPEAIkpsstQekLFskAGDIVLAKAFQLLNLNSKPLeqrgnaGdVIALSKEFNYGLVAdaksfrLsrtaknqkdFkVKALSEwREDKDYAVLTAPFFQYpttksqIFKQSLDENVLLFSWEHLAILLQLDLEETNIFSFEQLWNFPKKQSKKTSVSDAeNNFMRDFNKYFMDLFKIDKDTLNQLLQKEINFIEERSLIEKEYWKKQINIIKNFTREEAIEALLKdInMSskIETIDSFIKGIKSNDRLYL E;G gccaagcttggc;gccaagcttggc 70 71 611 94;43;472;2 10;2;8;2;11;0;0;0;23;24;30;0;0;0;0;6;4;30;100;361 2E52 2e52_2_1 0 2 HAEMOPHILUS INFLUENZAE 3 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease HindIII 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 C;D KKSALEKLLSLIENLTNqEfkQAtNSLISFIYKLNRNEVIELVRSIGIlPEAIKpsstQekLFskAGDIVLAKAFQLLNLNSKPLeqrgnaGdVIALSKEFNYGLVAdaksfrLsrtaknqkdFkVKALSEwREDKDYAVLTAPFFQYpttksqIFKQSLDENVLLFSWEHLAILLQLDLEETNIFSFEQLWNFPKKQSKKTSVSDAeNNFMRDFNKYFMDLFKIDKDTLNQLLQKEINFIEERSLIEKEYWKKQINIIKNFTREEAIEALLKdinMSskIETIDSFIKGIKSNDRLYL;KSALEKLLSLIENLTNQEfkQATNSLISFIYKLNRNEVIELVRSIGIlPEAIkpsstQekLFskAGdIVLAKAFQLLNLNSKPLeqrgnaGdVIALSKEFNYGLVAdaksfrLsrtaknqkdFkVKALSEwREDKDYAVLTAPFFQYpttksqIFKQSLDENVLLFSWEHLAILLQLDLEETNIFSFEQLWNFPKKQSKKTSVSDAeNNFMRDFNKYFMDLFKIDKDTLNQLLQKEINFIEERSLIEKEYWKKQINIIKNFTREEAIEALLKDInMSskIETIDSFIKGIKSNDRLYL F;H gccaagcttggc;gccaagcttggc 70 71 605 93;44;466;2 9;2;7;2;10;0;0;0;24;26;30;0;0;0;0;6;4;29;99;357 2FKC 2fkc_1_1 16473850 2.39 HAEMOPHILUS INFLUENZAE 2 1 1 2 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease HinP1I 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A MNlvElgsKtakdgfKNeKDIADRFENWKENSEAQDWLVTMGHNLDEIKSVKAVVLsgykSdINVQVLVFYKDALDIHNIqvklvsnKrgfnqidkhwLAhYQEMWKFDDNLLRILRHFTGELPPYHSNTKdKrrMfMTEFSQEEQNIVLNWLEKNRVLVLTDILRGRGDFAAEWVLVAQKVSNNARWILRNINEVLQHYGSGDISLsprGsInFGRVtIqrkggdngrEtANMLqFkIDPTELFDI C;D ccagcgctgg;ccagcgctgg 111 307 400 93;25;280;2 6;0;8;0;4;2;3;0;21;9;15;0;0;0;0;2;3;11;63;253 2FKC 2fkc_2_1 16473850 2.39 HAEMOPHILUS INFLUENZAE 2 1 1 2 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease HinP1I 2 1 1 0 0, 0 1 0 0 0 0 2 1 1 1 B MnlvElgsktakdgfKnekDIADRFENWKENSEAQDWLVTMGHNLDEIKSVKAVVLsgykSdINVQVLVFYKDALDIHNIqvklvsnKrgfnqidkhwLAHYQEMWKFDDNLLRILRHFTGELPPYHSNTKdKrrMfMTEFSQEEQNIVLNWLEKNRVLVLTDILRGRGDFAAEWVLVAQKVSNNARWILRNINEVLQHYGSGDISLsprGsInFGRVtIqrkggdngrEtANmLqFkIDPTELFDI E;F CCagcgctgg;ccagcgctgg 111 306 394 88;32;272;2 6;0;8;0;3;2;3;0;18;10;16;0;0;0;0;2;3;18;68;237 2FLD 2fld_1_1 16738662 2 MONOMASTIX SP. 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease I-MsoI 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B TLQPTEAAYIAGFLDgdgsiyalliprPdyKDIKYqvSLAIsFiqrKDkFPYLQDIYDQLGKRgnlrKdrgdGiAdYrIigsthLSIILPDLVPYLRIkKKQANRILHIINLyPQAqkNPSKFLDLVKIVDDvqNLnkrADeLKSTnYDRLLEEFLKAGKI;TLQPTEAAYIAGFLDgdgsiyalliprPdykDIKYqVslAIsFiqrKDkFPYLQDIYDQLGKRgnlrKdrgdGiAdYrIigsthLSIILPDLVPYLRIkKKQANRILHIINLyPQAqkNPSKFLDLVKIVDDvqNLnkrADeLKSTnYDrLLEEFLKAGKIES C;D gcagaaggtcGtgagaccgttCCG;cggaacggtcTcacgaccttcTGC 82 304 597 205;0;392;0 19;4;21;0;12;0;0;0;24;10;11;0;0;0;0;6;6;34;103;347 2FQZ 2fqz_1_1 16628220 2 ENTEROBACTER CLOACAE 2 1 1 2 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRII 1 1 1 0 0, 0 1 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B 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MELANOGASTER 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Hormone Nuclear Receptor, Glucocorticoid Receptor 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 2 1 1 A;B KHLCSICGdrAsgkhygVYScegCkgfFkrTVrkDlTyACrENRNCIIDKRQrnrCqYCrYQKCLTCGMKREavqeer;RVQEELCLVCGdrAsgyhyNALTCegCkgfFrRSVTkSAVyCCkFGRACEMDMYMrrkCqECrLKKCLAVGMRPEcvvpEnqcAMkr C;D CAagggttCAatgcacTtgt;GACaagtgcAttgaaCCctT 46;244 292 340 76;2;262;0 8;0;8;0;3;0;2;0;24;0;13;2;0;0;0;1;1;37;27;214 2HT0 2ht0_1_1 17097674 2 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein DNA Bending Integrator Host Factor 1 1 1 0 1, 1 0 2 0 0 0 2 1 1 1 A;B aLtkaEMSEYLFDKLGLSkRDAkELVELFFEEIRRALENGEQVkLsgfGnFDLrdknqrpgrnpkTGeDipiTArRvvtFrPgqkLkSRVENASPK;MtksELIeRLATQQSHIPakTVEDAVkEMLEHMASTLAQGErIeirgFgsFSLhYraPrtgrnpkTGDKvElEGkYvPhfkpgkeLrDRANIY C;D;E;F cGGTGCaacaaAt;tgataagcaatgCTTttttgGC;ggCCAAAAaagCAtt;GcttatcaattTGttgcacC 63;64 280 475 37;73;361;4 7;0;12;0;0;4;1;1;36;7;17;0;0;0;0;1;1;33;73;282 2OXV 2oxv_1_1 17997963 1.95 ESCHERICHIA COLI 1 1 1 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease EcoRI 1 1 1 2 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;D SQGVIGIFGDYAKAHDLAVGEVSKLVKKALSNEYPQLSFRYRDSIKKTEINEALKKIDPDLGGTLFvSnssikPdGGIVEVKDDYGEWRVVLVAeakhqgkDIInIRNGLLvgkRGDQDLmtagnaIerSHknISEIANFMLSESHFPYVLFLEGSNFLTENISITRPDGRVVNLeYnSgiLnrLDrLTAANYGMPINSNLCINKFVNHKDKSIMLQAASIYTQGDGREWDSKIMFEIMFDISTTSLRVLGRDLFEQLTSK;SQGVIGIFGDYAKAHDLAVGEVSKLVKKALSNEYPQLSFRYRDSIKKTEINEALKKIDPDLGGTLFvSnssikPdGGIVEVKDDYGEWRVVLVAeakhqgkDIInIRNGLLvgkRGDQDLmtagnaIerSHknISEIANFMLSESHFPYVLFLEGSNFLTENISITRPDGRVVNLeYnSgiLnrLDrLTAANYGMPINSNLCINKFVNHKDKSIMLQAASIYTQGDGREWDSKIMFEIMFDISTTSLRVLGRDLFEQLTSK C;E Tcgcgaattcgcg;Tcgcgaattcgcg 28 242 406 144;6;254;2 10;0;0;2;4;0;6;4;4;0;16;0;0;0;0;4;6;26;60;264 2P0J 2p0j_1_1 17437717 2.1 GEOBACILLUS STEAROTHERMOPHILUS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease BstYI 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B 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7;4;8;0;7;2;6;2;19;2;7;0;0;0;0;4;5;21;37;215 2QL2 2ql2_1_1 18069799 2.5 MUS MUSCULUS 2 1 1 3 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Helix Loop Helix, E47|NeuroD1 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B RrMAnnArerVrvRdinEAFrELGRMCQLHLKAQtklLILQQAVQVILGLEQQVRE;SRrMkanArerNrmhGlnAALDNLrKVVPCYSKTQKLskiETLRLAKNYIWALSEILRS E;F TAggccatctgGTCCT;AGgaccagatggCCTA 200;201 226 194 62;0;132;0 2;0;0;0;9;0;1;0;15;3;4;0;0;0;0;6;2;16;32;104 2QL2 2ql2_2_1 18069799 2.5 MUS MUSCULUS 2 1 1 3 0 0 1 Transcription factor Zipper Type Helix Loop Helix, E47|NeuroD1 2 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 C;D RrMAnnArerVrvRDinEAFRELGRMCQLHLKSDQtklLILQQAVQVILGLEQQVRER;RrMkanArernrmhGlnAALDNLrKVVPCYSKTQKLskieTLRLAKNYIWALSEILR G;H TAggccatctgGTCCT;AGgaccagatggCCTA 200;201 225 181 48;0;133;0 2;0;0;0;5;0;0;0;16;3;4;0;0;0;0;5;2;9;24;111 2RAM 2ram_1_1 9437432 2.4 MUS MUSCULUS 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Beta Sheet NFkB 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 1 2 1 1 1 A;B PYVEIIEQPKQRgmrFryKceGrsAgsIPGERSTDTTKTHPTIKINGYTGPGTVRISLVTKDPPHRPHPHELVGKDCRDGYYEADLCPDRSIHSFQNLGIQCVkkRDLEQAISQRIQTNNNPFHVPIEEQRGDYDlnAVRLCFQVTVRDPAGRPLLLTPVLSHPIFDNrApnTAELkICRVNRNSGSCLGGDEIFLLCDkVqkeDIEVYFTGPGWEARGSFSqADvHrqVAIVFRTPPYADPSLQAPVRVSMQLRRPSDRELSEPMEFQYLPD;PYVEIIEQPKQRGMrFryKceGrsaGSIPGERSTDTTKTHPTIKINGYTGPGTVRISLVTKDPPHRPHPHELVGKDCRDGYYEADLCPDRSIHSFQNLGIQCvkkrDLEQAISQRIQTNNNPFHVPIEEQRGDYDlnAVRLCFQVTVRDPAGRPLLLTPVLSHPIFDNrApNTAeLKICRVNRNSGSCLGGDEIFLLCDkVqkeDIEVYFTGPGWEARGSFSQADvHrqVAIVFRTPPYADPSLQAPVRVSMQLRRPSDRELSEPMEFQYLPD C;D CGGCtggaaatccAGCCG;CGgctggaaatCCaGCCG 142 218 224 55;0;169;0 11;1;7;0;2;0;1;0;11;5;9;0;0;0;0;0;3;17;21;136 2RBF 2rbf_1_1 18586269 2.25 ESCHERICHIA COLI 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Ribbon|Helix|Helix Bifunctional Protein PutA 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B tttmgVkLDDATRERIKSAATRIDRtphwLIkQAIFSYLEQLEN;ttmgvkLdDATrERIKSAATRIDRtphwLIkQAIFSYLEQLENSD C;D TGcggttgcaCCTTTCAAA;TTTGAAAggtgcaaCCGCA 208 217 175 70;0;105;0 4;1;4;1;4;1;1;1;1;6;8;0;0;0;0;1;3;6;36;97 2VE9 2ve9_1_1 18722176 1.9 PSEUDOMONAS AERUGINOSA 2 1 1 2 0 0 1 Enzyme Translocase DNA Translocase FTSK 1 1 1 0 2, 0 0 0 0 1 0 3 1 1 1 A;B;C DDPLYDEAVRFVTESRrAsisaVqRKLkigynrAARMIEAMEMAGVVTPmNTngsrEVIAPAP;DPLYDEAVRFVTESRrAsisAVqrKLkigynrAArMIEAMEMAGVVTPmNtngsrEVIAPAP;DdPLYDEAVRFVTESRrasisaVqrKLkigynrAarMIEAMEMAGVVTPmNTNgSrEVIAPAP I;J ACcagggcagggCg;GtcgccctgcccTGGT 59 52 328 85;1;242;0 3;1;3;0;8;2;0;4;5;9;18;0;0;0;0;5;0;22;59;189 2VE9 2ve9_2_1 18722176 1.9 PSEUDOMONAS AERUGINOSA 2 1 1 2 0 0 1 Enzyme Translocase DNA Translocase FTSK 2 1 1 0 2, 0 0 0 0 1 0 3 1 1 1 D;E;F dPLYDEAVRFVTESRrasisaVqrKLkigynrAarMIEAMEMAGVVTPmNTNgSrEVIAPAPV;DPLYDEAVRFVTESRrAsisAVqrKLkigynrAArMIEAMEMAGVVTPmNtngSrEVIAPAPV;EDDPLYDEAVRFVTESRrAsisaVqRKLkigynrAARMIEAMEMAGVVTPmNtngSrEVIAPAP K;L ACcagggcagggCg;GtcgccctgcccTGGT 59 52 321 84;1;236;0 3;1;3;0;6;2;0;4;6;12;18;0;0;0;0;4;0;18;56;188 2Z3X 2z3x_1_1 0 2.1 BACILLUS SUBTILIS 1 1 0 1 0 0 1 Structural|DNA Binding protein 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0;0;0;0;0;0;3;0;3;0;1;0;0;0;0;0;0;13;16;80 3BM3 3bm3_1_1 0 1.7 PYROCOCCUS SP. GI-H 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease PspGI 1 1 1 0 1, 1 1 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B VRNLVIDITKkptqNiPptNEiIEEAITELNVDELLDRLFEKDESGEVITPSRIAKLeEKafEIyKEYEKQVREAYLSAGYSREkLEqsFqqarfsrggkafeIIFTKLLNKFGIRYEHDRVIKIYDYITegEkPaFIIPSVRTFLNDPSSAILItvkrkVrerwreAVGeAQILRNKFGDEINFWFVGFDEeFtiySAIALDNGIDRVYVIDGRYDSLIEEIKRISDPNFNEDKYIQKIRRFSDIFDDIIQFLNKH;RNLVIDITKkptqNiPptnEIIEEAITELNVDELLDRLFEKDESGEVITPSRIAKLeEKafEIyKEYEKQVREAYLSAGYSRekLEqsFqqarfsrggkafeIIFTKLLNKFGIRYEhDRvIKIYDYITegEkPaFIIPSVRTFLNDPSSAILItvkrkVrerwreAVGeAQILRNKFGDEINFWFVGFDEEFtiySAIALDNGIDRVYVIDGRYDSLIEEIKRISDPNFNEDKYIQKIRRFSDIFDDIIQFLNKH C;D Catccaggtac;Ggtacctggat 147 196 646 141;90;406;9 9;1;3;3;10;3;3;3;23;15;15;0;0;0;0;6;1;42;123;386 3C25 3c25_1_1 18400177 2.5 NOCARDIA OTITIDISCAVIARUM 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease NotI 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B anFIAEFFGHRVYPEVVSTEAARNDQATGTCPFLTAAKLVETSCvkaEtsRGvCVVNTavDnERYDWLvCpNRALDPLFMSAASRKLFGYGPTEPLQFIAAPTLADQAVRDGIREWLDRGVHVVAYFQekLggelsIskTDSSpefsFdWTLAEVESIYPVPKIKRYGVLeiqtmdfhgsykhAVGAIDIALVEGIDFHGWLPTPAGRAALSKKMegpnlsnvFkrTFYqMAYkFALSGHQRCAGTGFAIPQSVWKSWLrhLANPTLIDNGDGTFSLGDTRNDSENAWIFVFELDPDTDASPRPLAPHLEIRVNVDTLIDLALRESPRAALGPSGPVATFTDkVEArMLrFWPK;anFIAEFFGHRVYPEVVSTEAARNDQATGTCPFLTAAKLVETSCvkaEtsRGvCVVNtavdnERYDWLvCpNRALDPLFMSAASRKLFGYGPTEPLQFIAAPTLADQAVRDGIREWLDRGVHVVAYFQekLggelsIskTDSSpefsFdWTLAEVESIYPVPKIKRYGVLeiqtmdfhgsykhAVGAIDIALVEGIDFHGWLPTPAGRAALSKKMegpnlsnvFkrTFYqMAYkFALSGHQRCAGTGFAIPQSVWKSWLrhLANPTLIDNGDGTFSLGDTRNDSENAWIFVFELDPDTDASPRPLAPHLEIRVNVDTLIDLALRESPRAALGPSGPVATFTDkVEArMLrFWP C;D CGGAggcgcggccgcgccgccG;CGGCggcgcggccgcgcctCcG 134 187 587 112;17;455;3 4;2;7;1;20;2;2;1;26;18;30;0;0;0;0;4;4;41;70;355 3COQ 3coq_1_1 18611375 2.4 SACCHAROMYCES CEREVISIAE 1 1 0 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating GAL4 Type, GAL4 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B 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PFTYSIEATRNLATTERCIQDIRNAPvrnrstQFqlaqqNMLAYTFGEVIPGFASAGINGMDYRDVIGRPVENAVTEGTHFFRDDFRVdsnakakvagdIfeIVSSAVMWNCAARWNSLMVGEGWRSQPRYSRPTLSPSPRRQVAVLNLprsfDWVSLLVPESQEVIEEFRAGLRKDGLGLPTstPdLAVVVLPEEFQNDEMWREEIAGLTrPNQILLsGAyQRLQGRVQPGEISLAVAfkrsLrsdrLyqPLYEANVMQLLLEGKLGAPKVEFEVHTLAPegtnAFVTYEAASLYGLAAVHRAIRELYVPPTAADLARRFFAFLNERMELVNG;PFTYSIEATRNLATTERCIQDIRNapvrnrstQfqlaqqNMLAYTFGEVIPGFASAGINGMDYRDVIGRPVENAVTEGTHFFRDDFRVdsnakakvagdIfeIVSSAVMWNCAARWNSLMVGEGWRSQPRYSRPTLSPSPRRQVAVLNLprsfDWVSLLVPESQEVIEEFRAGLRKDGLGLPTstPdLAVVVLPEEFQNDEMWREEIAGLTrPNQILLsGAyqRLQGRVQPGEISLAVAfkrsLrsdrLYqPLYEANVMQLLLEGKLGAPKVEFEVHTLAPegtnAFVTYEAASLYGLAEGAVHRAIRELYVPPTAADLARRFFAFLNERMELVNG G;H gagtccaccggtggacTC;GAgtccaccggtggacTC 38 29 602 107;57;437;1 15;1;6;0;10;2;2;0;24;23;24;0;0;0;0;6;2;23;82;382 3DW9 3dw9_1_1 18701646 2.2 STREPTOMYCES GRISEUS 1 1 0 1 0 0 1 Enzyme Endonuclease Endonuclease SgraIR 1 1 1 0 0, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B 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SFIKPIYQDINSILIGQKVKRagePFEKLVYKFLKENLSDLTFKQYEYLNDLFMKNPAIIGHEARyKLFNSPTLLFLLSrgkaaTENWSIENLFEEkqndtAdILLVKDQFYELLdvktrnISksafapniisAykLAqTCAKMIDNKEFDLFDINYLEVDwELNGEDLVCVSTSFAELFKSEPSELyInWaaamqIqFHVRDLDQGFNGTREEWAKSYLKHFVTQAEQrAIsMIDkfVKPFKKYIL;SFIKPIYQDINSILIGQKVKREKLVYKFLKENLSDLTFKQYEYLNDLFMKNPAIIGHEARyKLFNSPTLLFLLSrgkaaTENWSIENLFEEkndtAdILLVKDQFYELLdvktrnISksafapniisAykLAqTCAKMIDNKEFDLFDINYLEVDwELNGEDLVCVSTSFAELFKSEPSELyInWaaamqIqFHVRDLDQGFNGTREEWAKSYLKHFVTQAEQrAIsMIDkfVKPFKKYIL E;F GCcggttaaccggc;GCcggttaaccggc 13 28 522 160;31;306;25 4;1;6;1;6;4;6;1;15;11;22;0;0;0;0;2;8;33;102;300 3EXJ 3exj_1_1 18978813 2 MUS MUSCULUS 1 1 1 1 0 0 1 Transcription factor Zinc Coordinating Loop Sheet Helix, Tumor Supressor Protein p53 1 1 1 0 1, 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B 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PvuII 1 1 1 0 1, 1 0 0 0 0 0 2 1 1 1 A;B SHPDLNKLLELWPHIQEYQDLALKHGInDIFqgnGGkLLQVLLITGLTVLPGRegnDAVDNAGQEYelksinIDltkgFsthhHMNPviIAkyRQVPWIFAIYRGIAIEAIYRLEPKDLEfyYDkwERkWYSdGHkDInnpkIpVKYVMEHGTKIY;SHPDLNKLLELWPHIQEYQDLALKHGInDIFqgnGGKLLQVLLITGLTVLPGregndAVDNAGQEYelksinIDltkgFsthhHMNPviIAkyRQVPWIFAIYRGIAIEAIYRLEPKDLEfyYDkwERkWYSdGHkdinnpkIpVkYVMEHGTKIY C;D tgaccagctggtC;tgaccagctggtC 41 145 410 132;10;266;2 6;2;9;1;4;2;5;4;21;7;10;0;0;0;0;3;3;26;47;260