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#Match: All
#Type: Helix Turn Helix
#PDB_ID	ENTRY_ID	PUBMED_ID	RESOLUTION	SPECIES	MULTICOMPLEXITY	NO_INTERFACES	ASYMMETRIC_UNIT	BIOLOGICAL_UNITS	IS_CRUCIFORM	HAS_ZDNA	HAS_WATER	CLASSIFICATION	TYPE	SUBTYPE	COMPLEX_ID	INTERFACE_ID	DNA_DOUBLE_STRAND	DNA_SINGLE_STRAND	STICKY_ENDS	FLIPPED_BASE	NICKED_DNA	GAPPED_DNA	OPEN_DNA	MODIFIED_DNA	PROTEIN_MONOMERS	MULTIMERIZATION	PROT_PROT_INTERACTION	DNA_PROT_INTERACTION	PROT_CHAIN_IDS	PROT_SEQS	DNA_CHAIN_IDS	DNA_SEQS	SEQ_GROUPS	INTERFACE_GROUP	NUMBER_EFF_CONTACTS	GROOVE_CONTACTS(MA;MI;BB;NA)	TYPE_CONTACTS(1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13;14;15;16;17;18;19;20)
1AKH	1akh_1_1	9838003	2.5	SACCHAROMYCES CEREVISIAE	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Homeodamain, Mat Alpha 2	1	1	1	0	2, 2	0	0	0	0	0	2	2	2	1	A;B	iSPQArAFLeEVFRRKQslnsKEkEEVAKKCGITPlqVrvwFinKrmrS;TKpyrghrfTkENvRILeSWFAKNIENPylDTKGLENLMKNTSLSriqIknwVsnRrrkEkTITIAPELADLLSGEPL	C;D	TacatgtaaaaatttacatCA;TAtgatgTAAATTtttacaTG	121;123	662	322	76;26;220;0	12;1;11;1;5;1;0;1;18;4;8;0;0;0;0;3;1;18;47;191
1AU7	1au7_1_1	9009203	2.3	RATTUS NORVEGICUS	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Homeodomain, Pit-1	1	1	1	0	1, 0	0	0	0	0	0	2	1	1	1	A;B	GMRALEQFANEFkVRrIKLGytqtNVGEALAAVHGSefsqttIcrFEnLqlsFknACklKAILSKWLEEAEQkrrttiSIAAkDALERHFGEHSkpSsQEiMRMAEELNLEkevVrvwFcnRrqrEkrVK;GMRALEQFANEFkVRriKLGYtqtNVGEALAAVhGSefsqttIcrFEnLqlsFknACklKAILSKWLEEAkrrttiSIAAkDALERHFGEHSKpSsQEiMRMAEELNLEkevVrvwFcnRrqREkrVK	C;D	TcctcatgtatatacatgAGGAAGG;CTTcctcatgtatatacatgAGGA	170	661	561	161;18;382;0	15;1;22;4;12;0;1;0;24;19;16;9;0;0;0;13;3;30;63;329
1AWC	1awc_1_1	9461436	2.15	MUS MUSCULUS	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Ets Domain, GABP	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	1	2	2	0	1	A;B	IqlWQFLLELLTDKDARDCISWVGDEGEFKLNQPELVAQKwGQRkNkPtmNyeklsraLryyyDGDMICkVQgkrfVyKFVCDLKTLIGYSAAELNRLVIECEQKKLARM;DLGKKLLEAARAGQDDEVRILMANGApFttDwLGTSPLHLAAQYGHFSTTEVLLRAGVSRDARTkVDRTPLHMAASEGHANIVEVLLKHGADVNAKDMLKMTALHWATEHNHQEVVELLIKYGADVHTQSKFCKTAFDISIDNGNEDLAEILQ	D;E	AAGaccggaaGTAAcgGA;TTCCGGGacttccGGTCAT	225;237	660	171	50;0;120;1	3;0;1;0;0;0;1;0;5;3;3;0;0;0;0;1;3;10;39;102
1B72	1b72_1_1	10052460	2.35	HOMO SAPIENS	1	2	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Homeodomain, PBX1	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	1	0	0	1	A	ARTFDwMKvlrtnfTTRQlTELEKEFHFNKylSrARrVEIAATLELNEtqVkiwFqnRrmkQkKRERE	D;E	ACTCTATGATtgatcGGCTG;TCAgccgaTcaatcATAGAG	251	657	148	18;6;123;1	3;0;1;0;1;0;0;0;10;2;3;0;0;0;0;0;0;11;26;91
1B72	1b72_1_2	10052460	2.35	HOMO SAPIENS	1	2	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Homeodomain, PBX1	1	2	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	1	0	0	1	B	rkrrnfNKQAtEILnEYFYSHLSNPypSeEAkEELAKKCGITVsqVsnwFgnkrirYkkNIGkfQEeANIYAA	D;E	ACTCTatgatTGATCGGCTG;TCAGCCGatcaatCatagAG	191	656	158	33;6;118;1	5;0;3;0;2;0;1;0;14;1;3;0;0;0;0;2;0;12;24;91
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1B8I	1b8i_1_2	10067897	2.4	DROSOPHILA MELANOGASTER	1	2	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Homeodomain, UBX|EXD	1	2	1	0	2, 2	0	0	0	0	0	1	0	0	1	B	rrnfSKQAsEILNEYFYSHLSNPypSeEAkEELARKCGITVSqVsnwFgnKrirYkkN	C;D	GTCGCCataaatCac;ACgtgatTTATGGCG	255	654	137	28;10;98;1	3;0;4;0;0;0;0;0;14;1;1;0;0;0;0;1;0;11;17;85
1BC7	1bc7_1_1	9734357	2.01	HOMO SAPIENS	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Ets Domain, SAP-1	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	1	0	0	1	C	MDSaItlWQFLLQLLQKPQNKHMICWTSNDGQFKLLQAeEVARLwGIRkNkPnmNydklSraLryyyVkNIIKkVnGqkfVyKFVSYPEILNM	A;B	gacaggatGtg;CacatccTGTC	92	653	183	54;1;127;1	5;0;1;0;1;1;2;0;5;0;3;0;0;0;0;1;2;11;38;113
1BC8	1bc8_1_1	9734357	1.93	HOMO SAPIENS	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Ets Domain, SAP-1	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	1	0	0	1	C	MDSAItlWQFLLQLLQKPQNKHMICWTSNDGQFKLLQAeEVARLwGIRkNkPnmNydklsraLryyyvkNIIKkVngqkfVyKFVSYPEILNM	A;B	taccggaaGt;AacttccGGT	92	652	188	57;2;128;1	1;0;3;0;3;0;0;0;5;2;5;0;0;0;0;5;2;10;43;109
1BL0	1bl0_1_1	9724717	2.3	ESCHERICHIA COLI	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Homeodomain, MARA	1	1	1	0	2, 2	0	0	0	0	0	1	0	0	1	A	dAITIHSILDWIEDNLESPLSlekVSERSGyskwhLqrmFkkETGHslgqYIrSRKMTEIAQKLKESNEpilYLAERYgfesqqtLtrtFknYFDVpphkYrMTNMQGESRFLHPL	B;C	GGGGAtttagCAAAacgtggcATC;CCGatgccaCGTtttgctaAATCc	232	645	253	85;0;168;0	3;1;7;0;1;0;2;0;6;7;14;0;0;0;0;8;2;13;46;143
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1DP7	1dp7_1_2	10706293	1.5		1	2	1	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	hRFX1	1	2	1	2	0, 0	0	0	0	0	1	1	0	0	1	Q	TVQWLLDNYETAEGVSLPrSTLYNHYLLHSQEQKLEPvnaasFgkLIrSVFMGLRtrrlgtrgNskyHyYGLRIKA	D;E	cgtaCCAggtaACG;CGTaccaggtAaCG	189	131	153	27;13;113;0	4;0;4;1;1;0;0;0;9;2;4;0;0;0;0;2;1;8;13;104
1DU0	1du0_1_1	10889025	2	DROSOPHILLA MELANOGASTER	1	2	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Homeodomain, Engrailed	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	1	0	0	1	A	afSSEQlARLkREFNENRylTeRRrQQLSSELGLNEAqIkiwFanKrakIkkS	C;D	TTTTGCCATgtaatTACCTAA;ATTAggtaatTACatGGCAAA	35	621	94	23;0;71;0	2;0;0;0;1;0;0;0;5;0;2;0;0;0;0;0;0;12;14;58
1DU0	1du0_1_2	10889025	2	DROSOPHILLA MELANOGASTER	1	2	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Homeodomain, Engrailed	1	2	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	1	0	0	1	B	rprTAFSSEQLARLKREFNENRylTeRRrQQLSSELGLNEaqIkiWFanKraKIkk	C;D	TTTTGCCATGTAATTacctaa;atTAGGTAATTACATGGCAAA	35	620	90	20;2;68;0	3;0;0;0;2;0;0;0;3;0;2;0;0;0;0;0;0;12;13;55
1DUX	1dux_1_1	10742173	2.1	HOMO SAPIENS	2	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Ets Domain, ELK-1	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	1	0	0	1	C	VtlWQFLLQLLREQGNGHIISWTSRDGGEFKLVDAeEVARLwgLRkNkTnmnydklsraLryyydkNIIRkVsGqkfVyKFVSYPE	A;B	TGaccggaAGtgT;ACacttccGGTCA	92	130	168	52;1;114;1	2;0;1;0;4;0;1;0;6;1;2;0;0;0;0;3;3;16;38;91
1DUX	1dux_2_1	10742173	2.1	HOMO SAPIENS	2	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Ets Domain, ELK-1	2	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	1	0	0	1	F	VtlWQFLLQLLREQGNGHIISWTSRDGGEFKLVDAeEVARLwgLRkNkTnmnydklsraLryyydkNIIRkVsGqkfVyKFVSYPE	D;E	TGaccggaAGtgT;ACacttccGGTCA	92	130	172	53;1;117;1	2;0;1;0;4;0;1;0;6;1;2;0;0;0;0;3;3;17;39;93
1E3O	1e3o_1_1	11583619	1.9	HOMO SAPIENS	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Homeodomain, Oct-1	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	1	0	0	1	C	EEPSDLEELEQFAKTFKQRRIKLGFTQGDVGLAMGKLYGNdfsqttIsrFEALnlsFknMSklKPLLEKWLNDAEkrtsiETNIrVALEKSFMENQkpTsEDiTLIAEQLNMEKevIrvwFsnRrqkEkrIN	A;B	atgcatgAGGA;TcctcatgcaT	227	619	208	64;3;141;0	6;0;6;1;10;0;0;0;4;10;9;0;0;0;0;6;1;15;25;115
1FJL	1fjl_1_1	7671301	2	DROSOPHILA MELANOGASTER	2	1	1	2	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Homeodomain, Paired Protein Pax	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	1	1	A;B	kQrrsrtTfSASQlDELERAFERTQypDiYTrEELAQRTNLTEArIqvwFqnRrarLrKQHTSVS;QrrsrtTfSASQlDELERAFERTQyPDiYTrEELAQRTNLTeArIqvwFqnRrarLrK	D;E	Aataatctgattac;Tgtaatcagattat	99	606	363	49;35;279;0	10;0;18;0;2;0;0;0;27;2;9;0;0;0;0;2;0;27;55;211
1FJL	1fjl_2_1	7671301	2	DROSOPHILA MELANOGASTER	2	1	1	2	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Homeodomain, Paired Protein Pax	2	1	1	2	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	1	1	C;D	kqrrsrtTfSASQlDELERAFERTQypDiYTrEELAQRTNLTEArIqvwFqnRrarLrK;kqrrsrtTfSASQlDELERAFERTQypDiYTrEELAQRTNLTEArIqvwFqnRrarLrK	E;F	Tgtaatctgattac;Tgtaatctgattac	99	605	370	56;34;280;0	8;0;20;0;2;0;0;0;30;2;12;0;0;0;0;4;0;26;54;212
1FYL	1fyl_2_1	11599025	2.1	KLUYVEROMYCES LACTIS	2	2	1	2	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Heat Shock Factor Protein	2	1	1	2	0, 0	0	0	0	0	1	1	0	0	1	B	RPAFVNKLWSVNDKSNEKFIHWSTSGESIVVPNreRFvQEVLPKYFKHSnfasFVrQLNYGWHKVDSRWEFEN	D;E	AGGAACGTTCC;AggaACGTTCC	34	122	36	0;0;36;0	0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;4;0;0;0;0;0;0;6;2;23
1FYL	1fyl_2_2	11599025	2.1	KLUYVEROMYCES LACTIS	2	2	1	2	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Heat Shock Factor Protein	2	2	1	2	0, 0	0	0	0	0	1	1	0	0	1	F	RPAFVNKLWSVNDKSNEKFIHWSTSGESIVVPNreRFvQEVLPKYFKHSnfasFVrQLNYGWHKVDSRWEFEN	D;E	AggaACGTTCC;AggaACGTTCC	34	122	36	0;0;36;0	0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;4;0;0;0;0;0;0;6;2;23
1FYM	1fym_2_1	11599025	2.2	KLUYVEROMYCES LACTIS	2	2	1	2	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Heat Shock Factor Protein	2	1	1	2	0, 0	0	0	0	0	0	1	0	0	1	B	ARPAFVNKLWSMVNDKSNEKFIHWSTSGESIVVPNreRFvQEVLPKYFKHSnfasFVrQLNMYGWHKVQdDSRWEFEN	D;E	GGTTcTAGAACC;GgttCTAGAACC	34	121	40	0;0;40;0	0;0;0;0;0;0;0;0;2;1;4;0;0;0;0;0;0;8;2;23
1FYM	1fym_2_2	11599025	2.2	KLUYVEROMYCES LACTIS	2	2	1	2	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Heat Shock Factor Protein	2	2	1	2	0, 0	0	0	0	0	0	1	0	0	1	F	ARPAFVNKLWSMVNDKSNEKFIHWSTSGESIVVPNreRFvQEVLPKYFKHSnfasFVrQLNMYGWHKVQdDSRWEFEN	D;E	GgttCTAGAACC;GGTTcTAGAACC	34	121	40	0;0;40;0	0;0;0;0;0;0;0;0;2;1;4;0;0;0;0;0;0;8;2;23
1IG7	1ig7_1_1	11580277	2.2	MUS MUSCULUS	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Homeodomain, Msx-1	1	1	1	0	2.1, 0	0	0	0	0	0	1	0	0	1	A	rkprtPfTTAQlLALeRKFRQKQylSiAErAEFSSSLSLTEtqVkiwFqnRrakAkrL	B;C	CActaattGAAGG;TCCttcaattagtGAC	256	588	172	29;13;130;0	6;0;7;0;2;0;0;0;11;2;5;0;0;0;0;2;0;11;23;103
1J59	1j59_1_1	8757802	2.5	ESCHERICHIA COLI	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Catabolite Gene Activator Protein	1	1	1	0	1, 1	0	2	0	0	0	2	1	2	1	A;B	PTLEWFLSHCHIHKYPSkSTLIHQGEKAETLYYIVKGSVAVLIKDEEGkEMILSYLNQGDFIGELGLFEEGQERSAWVRAKTACEVAEISYKKFRQLIQVNPDILMRLSAQMARRLQVTSEKVGNLAFLdvtGrIAQTLLNLAKQPDAMTHPDGMQIkItrqEIGQIVgcsretVgriLkMLEDQNLISAhgKTIVVYG;PTLEWFLSHCHIHKYPsKSTLIHQGEKAETLYYIVKGSVAVLIKDEEGkEMILSYLNQGDFIGELGLFEEGQERSAWVRAKTACEVAEISYKKFRQLIQVNPDILMRLSAQMARRLQVTSEKVGNLAFLdvtGrIAQTLLNLAKQPDAMTHPDGMQIkItrqeIGQIVGcsretVgriLkMLEDQNLISAhgKTIVV	C;D;E;F	GCGAAAagtgtgaC;ATatgtcacACTtttcG;GCGAAAAgtgtgaC;ATatgtcaCACTtttcG	62	583	274	70;0;204;0	6;0;12;0;4;0;0;0;7;15;11;0;0;0;0;6;0;18;31;164
1JE8	1je8_1_1	12352954	2.12	ESCHERICHIA COLI	2	1	1	2	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Response Regulator Protein NARL	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	RDVNQLtprERDILKLIAQGLpnkIARRLDitestVkvhvkhlkKKlksrvEAAVWVHQERIF;RDVNQLtprERDILKLIAQGLpnkIARRLDitestVkvhvkhlkKKlksrvEAAVWVHQERIF	C;D	cgtaccCATTaatgggtACG;cgtaccCATTaatgggtACG	32	6	311	84;0;227;0	7;0;6;0;0;0;2;0;6;17;11;0;0;0;0;0;4;17;49;192
1JE8	1je8_2_1	12352954	2.12	ESCHERICHIA COLI	2	1	1	2	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Response Regulator Protein NARL	2	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	E;F	ERDVNQLtprERDILKLIAQGLpnkIARRLDitestVkvhvkhlkKKlksrvEAAVWVHQERIF;RDVNQLtprERDILKLIAQGLpnkIARRLDitestVkvhvkhlkKKlksrvEAAVWVHQERIF	G;H	cgtacCCATTaatgggtACG;cgtaccCATTaatgggtACG	32	6	309	84;0;225;0	8;0;6;0;0;0;2;0;6;17;11;0;0;0;0;0;4;15;51;189
1JFT	1jft_1_1	11781089	2.5	ESCHERICHIA COLI	1	1	1	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Purine Repressor	1	1	1	2	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	1	1	A;D	atikDVAKRAnvstttVshVinKtrfvaEEtRNAVWAAIKELHyspsAVarSlkvnHTKSIGLLATSSEAAYFAEIIEAVEKNCFQKGYTLILGNAWNNLEKQRAYLSMMAQKrVDGLLVMCSEYPEPLLAMLEEYRHIPMVVMDAGEAKADFTDAVIDNAFEGGYMAGRYLIERGHREIGVIPGPLERNTGAGRLAGFMKAMEEAMIKVPESWIVQGDFEPESGYRAMQQILSQPHRPTAVFCGGDIMAMGALCAADEMGLRVPQDVSLIGYDNVRNARYFTPALTTIHQPKDSLGETAFNMLLDRIVNKREEPQSIEVHPRLIERRSVADGPFRDYRR;atikDVAKRAnvstttVshVinKtrfvaEEtRNAVWAAIKELHyspsAVarSlkvnHTKSIGLLATSSEAAYFAEIIEAVEKNCFQKGYTLILGNAWNNLEKQRAYLSMMAQKrVDGLLVMCSEYPEPLLAMLEEYRHIPMVVMDAGEAKADFTDAVIDNAFEGGYMAGRYLIERGHREIGVIPGPLERNTGAGRLAGFMKAMEEAMIKVPESWIVQGDFEPESGYRAMQQILSQPHRPTAVFCGGDIMAMGALCAADEMGLRVPQDVSLIGYDNVRNARYFTPALTTIHQPKDSLGETAFNMLLDRIVNKREEPQSIEVHPRLIERRSVADGPFRDYRR	B;E	TacgcaAacgtttgCGT;TacgcaAacgtttgCGT	68	98	388	88;50;246;4	4;2;4;4;6;0;2;2;6;20;10;0;0;0;0;10;6;8;60;244
1JGG	1jgg_1_1	8557047	2	DROSOPHILA MELANOGASTER	1	2	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Homeodomain, Even Skipped	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	1	0	0	1	A	ryrtafTRDQlGRLEKEFYKENYVSRPRRCELAAQLNLPEStIkvwFqnRRmkDkrQ	C;D	TAATtgaatt;aattcaatTA	202	581	146	30;15;101;0	9;0;7;0;2;0;0;0;7;3;4;0;0;0;0;0;0;2;24;88
1JGG	1jgg_1_2	8557047	2	DROSOPHILA MELANOGASTER	1	2	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Homeodomain, Even Skipped	1	2	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	1	0	0	1	B	ryrtAfTRDQlGRLEKEFYKENyVSRPRrCELAAQLNLPEStIkvwFqnRrmkDkrQ	C;D	taatTGAATT;AATtcaatta	202	580	140	33;12;95;0	5;0;4;0;4;0;0;0;6;3;4;0;0;0;1;0;0;6;19;88
1K61	1k61_1_1	12466549	2.1		1	4	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Homeodamain, Mat Alpha 2	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	1	1	0	0	1	A	rghrfTKENvRILESWFAKNIENPylDTKGLENLMKNTSLSriqIknwVsnRrrkEkTIt	E;F	ACATGTAATTCatttacaCGC;gcgtgtAaatgAATTACATG	101	573	165	40;14;111;0	3;1;7;1;4;0;0;0;6;1;4;0;0;0;0;2;1;7;22;106
1K61	1k61_1_2	12466549	2.1		1	4	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Homeodamain, Mat Alpha 2	1	2	1	0	1, 1	0	0	0	0	1	1	0	0	1	B	RGhrfTKENvRILeSWFAKNIENPylDTKGLENLMKNTSLSRiqIknwVsnRrrkEktI	E;F	acatgtAattcATTTACACGC;GCGTGTAAATGAattacaTG	101	572	167	42;11;114;0	3;1;9;1;3;0;0;0;8;1;3;0;0;0;0;2;1;8;30;97
1K61	1k61_1_3	12466549	2.1		1	4	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Homeodamain, Mat Alpha 2	1	3	1	0	1, 1	0	0	0	0	1	1	0	0	1	C	hrfTKENvRILeSWFAKNIENPYLDTKGLENLMKNTSLSRiqIKnwVsnRRrkEKT	E;F	ACATGTAATTCATTTAcacgc;gcGTgtaAATGAATTACATG	101	571	84	18;2;64;0	1;0;3;0;2;0;0;0;3;0;2;0;0;0;0;2;0;4;13;54
1K61	1k61_1_4	12466549	2.1		1	4	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Homeodamain, Mat Alpha 2	1	4	1	0	1, 1	0	0	0	0	1	1	0	0	1	D	rghrfTKENvRILESWFAKNIENPylDtKGLENLMKNTSLsriqIknwVsnRrrkEKT	E;F	ACATgtaattCATTTACACGC;GCGTGTAAAtgaatTacatG	101	570	169	22;10;137;0	4;2;1;1;2;0;1;0;14;3;7;0;0;0;0;1;0;7;24;102
1K78	1k78_1_1	11779502	2.25	MUS MUSCULUS, HOMO SAPIENS	2	1	1	2	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Homeodomain, Paired Protein Pax	1	1	1	0	2, 2	0	0	0	0	0	3	2	0	1	A;B;I	GvnqLGGVfvngrplPDVVrQRIVELAHQGVrpcDISrQLRvshgcVskilGrYyETGSIKpgviggskpkvaTPKVVEKIAEYkRQNPTmfawEIRDRLLAERVCDNdTvpsvssInriIrtK;IqlWQFLLELLTDKSCQSFISWTGDGWEFKLSDPDEVARRwGKRknkPkmNyeklSrgLryyydKNIIHkTAGkrYVYRFVCDLQSLLGYTPEELHAMLDVK;ggskpkvaTPKVVEKIAEYKRQNPTmfawEIrDRLLAERVCDNdTvPsvssInrIirT	C;D	TTGTgccggagatgggctccagtggcC;aaggccactggagcccatctccGGCAC	90;118;257	569	689	132;48;508;1	7;3;5;4;7;5;7;2;13;15;28;6;0;0;0;3;1;33;106;444
1K78	1k78_2_1	11779502	2.25	MUS MUSCULUS, HOMO SAPIENS	2	1	1	2	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Homeodomain, Paired Protein Pax	2	1	1	0	2, 2	0	0	0	0	0	2	2	0	1	E;F	GvnqLGGVfvngrplPDVVrQRIVELAHQGVrpcDISrQLRvshgcVskiLGrYYETGSIKpgviggskpkvaTPKVVEKIAEYkRQNPTmfawEIRDRLLAERVCDNdTvpsvssInrIirtK;piqlWQFLLELLTDKSCQSFISWTGDGWEFKLSDPDEVARRwGKRknkpkmNyeklSrgLryyydKNIIHkTAGKryVYRFVCDLQSLLGYTPEELHAMLDVK	G;H	TTGTgccggagatgggctccagtggcC;aaggccACtggagcccatctccGGCAC	90;118	568	531	101;34;395;1	7;3;6;2;6;2;3;2;15;7;23;6;0;0;0;2;1;18;89;339
1K79	1k79_1_1	11779502	2.4	MUS MUSCULUS	2	1	1	2	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Homeodomain, Paired Protein Pax	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	1	0	0	1	A	gpIqlWQFLLELLTDKSCQSFISWTGDGWEFKLSDPdEVARRwGKRknkpkmNyeklSrgLryyydkNIIHkTAgkryVyRFVCDLQSLLGYTPEELHAMLDVK	B;C	TAGTgccggaaAtgt;CACatttccGGCACT	90	567	188	48;1;138;1	1;0;2;0;2;0;1;0;5;0;4;0;0;0;0;2;2;16;41;112
1K79	1k79_2_1	11779502	2.4	MUS MUSCULUS	2	1	1	2	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Homeodomain, Paired Protein Pax	2	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	1	0	0	1	D	gpIqlwQFLLELLTDKSCQSFISWTGDGWEFKLSDPdEVARRwgKRknkPkmNyeklsrgLryyydkNIIHkTAgKryVyRFVCDLQSLLGYTPEELHAMLDVK	E;F	TAGtgccggaaATgt;CACatttccGGCACt	90	566	201	52;0;148;1	1;0;1;0;1;0;1;0;4;0;5;0;0;0;0;1;2;16;42;127
1KU7	1ku7_1_1	11931761	2.4	THERMUS AQUATICUS	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Sigma A Factor	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	2	0	1	A;D	SEELEKALSKLSErEAMVLKMrKGLIDGREHtleeVGAYFgvtrerIrqienkALRKLKYHESRTRKLRDFLE;KALSKLSEREAMVLKMRKGLIDGREHTLEEVGAYFGVTRERIRQIENKALRKLKYHESRTRKLRDFLE	B;C	ccttgaCAAAG;CCTTtgtcaAG	192	565	130	59;0;71;0	2;0;3;0;3;0;0;0;3;2;3;0;0;0;0;8;1;11;28;66
1L3L	1l3l_1_1	12087407	1.66	AGROBACTERIUM TUMEFACIENS	2	1	1	2	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	TraR Activator	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;C	QHWLDKLTDLAAIEGDECILKTGLADIADHFGFTGYAYLHIQHRHITAVTNYHRQWQSTYFDKKFEALDPVVKRARSRKHIFTWSGEHERPTLSKDERAFYDHASDFGIRSGITIPIKTANGFSFTASDKPVIDLDREIDAVAAAATIGQIHARISFLRTTPTAEDAAwLDPkEATYLRWiAVGKteeIADVEGVkynsVrvkLreAKRFDvrskAHLTALAIRRKLI;QHWLDKLTDLAAIEGDECILKTGLADIADHFGFTGYAYLHIQHRHITAVTNYHRQWQSTYFDKKFEALDPVVKRARSRKHIFTWSGEHERPTLSKDERAFYDHASDFGIRSGITIPIKTANGFSFTASDKPVIDLDREIDAVAAAATIGQIHARISFLAWLDPKEATYLRWiAVGKteEIADVEGVkynsVrvkLreAKRFDvrskAHLTALAIRRKLI	F;H	GAtgtgcAGAtctgcaCATC;GatgtgcAGAtctgcaCATC	77	108	203	73;0;130;0	5;0;15;0;0;0;0;0;6;6;4;0;0;0;0;2;0;17;25;123
1L3L	1l3l_2_1	12087407	1.66	AGROBACTERIUM TUMEFACIENS	2	1	1	2	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	TraR Activator	2	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	B;D	QHWLDKLTDLAAIEGDECILKTGLADIADHFGFTGYAYLHIQHRHITAVTNYHRQWQSTYFDKKFEALDPVVKRARSRKHIFTWSGEHERPTLSKDERAFYDHASDFGIRSGITIPIKTANGFSFTASDKPVIDLDREIDAVAAAATIGQIHARISFLRTTPTAEDAAwLDPkEATYLRWiAVGKteeIADVEGVkynsVrvkLreAKRFDvrskAHLTALAIRRKLI;QHWLDKLTDLAAIEGDECILKTGLADIADHFGFTGYAYLHIQHRHITAVTNYHRQWQSTYFDKKFEALDPVVKRARSRKHIFTWSGEHERPTLSKDERAFYDHASDFGIRSGITIPIKTANGFSFTASDKPVIDLDREIDAVAAAATIGQIHARISFLAWLDPKEATYLRWiAVGKteeIADVEGVkynsVrvkLreAKRFDvrskAHLTALAIRRKLI	E;G	GAtgtgcAGAtctgcaCATC;GatgtgcAGAtctgcaCATC	77	108	202	74;0;128;0	5;0;15;0;0;0;0;0;4;6;4;0;0;0;0;2;0;18;27;121
1LE8	1le8_1_1	12121651	2.3	SACCHAROMYCES CEREVISIAE	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Homeodamain, Mat Alpha 2	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	2	2	1	A;B	KSsiSPQArAFLEQVFRRKQslNsKEkEEVAKKCGITPlqVrvwFinKrmrSk;rghrfTKENvRILeSWFAKNIENPylDTKGLENLMKNTSLSriqIknwVaaRrakEktiTIAPELADLLSGEPL	C;D	acatgTAaaaatttacatCA;TtgatGtAAATTtttacaTG	121;123	553	271	61;14;196;0	5;0;7;0;2;0;1;0;11;3;4;0;0;0;0;1;1;18;41;177
1LLI	1lli_1_1	8278404	2.1	BACTERIOPHAGE LAMBDA	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Lambda Repressor	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	kkPlTQEQLEDARRLkAIyeKKkNELGLsqeSLADKLgmgqsgIgAlFnGinaLnAYnAALLAKILKVSVEEFSPSIAREIYEMYEAVS;stkkkPLTQEqLEDARRLkAIyeKKkNELGLsqeSLADKLgmgqsgIgalfnGinalnAYnAALLAKILKVSVEEFSPSIAREIYEMYEAVS	D;E	AataccACTggcggtgaTAT;TatatcaccgccagtggTAT	53	552	313	114;0;197;2	10;2;3;3;4;2;5;2;22;5;13;0;0;0;0;4;4;11;43;180
1LMB	1lmb_1_1	1387915	1.8	BACTERIOPHAGE LAMBDA	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Lambda Repressor	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	3;4	PlTQEQLEDARRLkAIyeKKkNELGLsqeSVADKMgmgqsgVgalFnGinaLnAYnAALLAKILKVSVEEFSPSIAREIYEMYEAVS;StkkkPLTQEQLEDARRLkAIyeKKkNELGLsqeSVADKMgmgqsgVgalfnGinalnAYnAALLAKILKVSVEEFSPSIAREIYEMYEAVS	1;2	AataccACTggcggtgaTAT;TatatcaccgCCagtggTAT	53	550	275	103;0;172;0	8;2;5;3;3;0;3;0;20;2;9;0;0;0;0;5;2;12;35;166
1LQ1	1lq1_1_1	12176382	2.3	BACILLUS SUBTILIS	2	1	1	2	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Initiation Factor Spo0A	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	KKNLDASITSIIHEIGVpAhikgYLyLREAISMVYNDIELlgsitkVLyPDIAKKFNttAsrVeraIrhAIEvAWSrGNIDSISSLFAkptnsEFIAMVADKLRLEH;NLDASITSIIHEIGVpAhikgYLYLREAISMVYNDIELLGSITKVLYPDIAKKFNTTASrVEraIRhAIEvAWSrGNIDSISSLFAKPTNSEFIAMVADKLRL	G;H	TTcgtgtcGAATtttg;acAAAattcgaCACGA	88	549	248	62;0;186;0	1;0;6;0;3;0;0;0;0;8;11;0;0;0;0;5;1;12;51;150
1LQ1	1lq1_2_1	12176382	2.3	BACILLUS SUBTILIS	2	1	1	2	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Initiation Factor Spo0A	2	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	C;D	KNLDASITSIIHEIGVpAhikgYLyLREAISMVYNDIELLGSITKVLYPDIAKKFNTTASrVEraIRhAIEvAWSrGNIDSISSLFGYTKAKPTNSEFIAMVADKLRLEHKA;KNLDASITSIIHEIGVpAhikgYLyLREAISMVYNDIELlgsitkVLyPDIAKKFNttAsrVeraIrhAIEvAWSrGNIDSISSLFKAkptnsEFIAMVADKLRLEH	E;F	TTcgtgtcGAATtttg;ACAAAattcgaCACGA	88	548	240	70;0;170;0	2;0;6;0;2;0;1;0;2;8;11;0;0;0;0;6;1;14;50;137
1PDN	1pdn_1_1	7867071	2.5	DROSOPHILA MELANOGASTER	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Homeodomain, Paired Protein Pax	1	1	1	0	2, 2	0	0	0	0	0	1	0	0	1	C	qGrvnqLGGVfingrplPNNIrLKIVEMAADGIrpcVISrQLRvshgcVskiLnrYQETGSIRpgviggskprIAtPEIENRIEEYKRSSPGMFSWEIREKLIREGVCDRSTAPSVSAISRLV	A;B	AacgtcACggttgac;TTGTCaaccgtgacG	230	490	279	32;28;219;0	2;0;0;0;1;4;3;1;12;3;14;7;0;0;0;2;1;14;51;164
1PER	1per_1_1	8081737	2.5	BACTERIOPHAGE 434	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	434 Repressor	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	L;R	SISSRVkSKrIQLGLnqaELAQKVGttqqsIeqLEnGktkrprfLPELASALGVSVDWLLNGT;SISSRVkSKrIQLGLnqaELAQKVgttqqsIeqLEnGktkrprfLPELASALGVSVDWLLNGT	A;B	AAgtacaGTTTttcttgtAT;TatacaAGAaaaactgtACT	60	489	291	98;5;188;0	7;0;8;0;4;0;1;0;22;14;12;0;0;0;0;15;2;15;22;169
1PP7	1pp7_1_1	14622596	2.45	TRICHOMONAS VAGINALIS	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Initiator Binding Protein IBP39	1	1	1	0	1, 0	0	0	0	0	0	1	0	0	1	U	DLEASFTSRLPPEIVAAlKrkssrDPNSrfpRkLHMLLTYLASNPQLEEEIGLSWISDTEFKMKkkNVALVMgiklntLnvnLrdlAFEqLQhdKGGWtQwKRSGFTRNSVFED	E;F	gttacttcaCTT;caagtgAAGtaac	235	488	189	30;18;141;0	3;0;7;0;1;0;0;0;9;8;3;0;0;0;0;5;0;12;36;105
1PUE	1pue_1_1	8602247	2.1	MUS MUSCULUS	2	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Ets Domain, Pu.1	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	1	0	0	1	E	kirlYQFLLDLLRSGDMKDSIWWVDKDKGTFQFSsKHkEALAHRwGIQkgnrkKmTyekmAraLrnyGktGEVKkVkkklTyQFSGEV	A;B	AAAaaggggaAGtggg;TCCCacttcccCTTTt	177	485	208	46;1;161;0	4;0;3;0;2;0;0;0;10;1;7;0;0;0;0;2;3;15;41;120
1PUE	1pue_2_1	8602247	2.1	MUS MUSCULUS	2	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Ets Domain, Pu.1	2	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	1	0	0	1	F	kirlYQFLLDLLRSGDMKDSIWWVDKDKGTFQFSsKHkEALAHRwGIQkGnrkKmTyekmaraLrnyGktGeVKkVkkklTyQFSGEVL	C;D	AAAAaggggaAGtggg;TCCCacttcccCTTtt	177	484	199	46;1;151;1	4;0;2;0;2;0;0;0;5;1;8;0;0;0;0;2;3;16;35;121
1PUF	1puf_1_1	12923056	1.9	HOMO SAPIENS, MUS MUSCULUS	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Homeodomain, HoxA9	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	2	1	1	A;B	NNPAANWlharStrkkrcpyTkHQtLELEKEFLFNMylTrDRrYEVARLLNLTErqVkiwFqnRrmkMkkiNKDRAK;ArRkrrnfNKQAtEILNEYFYSHLSNPypSeEAkEELAKKCGITVSqVsnwFgnKrirYkkNIGKfQEEANIY	D;E	ACTCTatgatttacgaCGCT;TAgcgtcgtaaatcatagAG	191;246	483	406	72;25;309;0	10;0;8;0;6;0;1;0;25;3;10;0;0;0;0;3;0;29;76;235
1QPI	1qpi_1_1	10700280	2.5	ESCHERICHIA COLI	1	1	1	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Tetracyclin Repressor	1	1	1	2	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	1	1	A;B	lNRESVIDAALELLNETGIdglttrkLAQKLgieqptLywhVknkRALLDALAVEILARHHDYSLPAAGESWQSFLRNNAMSFRRALLRYRDGAKVHLGTRPDEKQYDTVETQLRFMTENGFSLRDGLYAISAVSHFTLGAVLEQQEHTAALENLPPLLREALQIMDSDDGEQAFLHGLESLIRGFEVQLTALLQ;lNRESVIDAALELLNETGIdglttrkLAQKLgieqptLywhVknkRALLDALAVEILARHHDYSLPAAGESWQSFLRNNAMSFRRALLRYRDGAKVHLGTRPDEKQYDTVETQLRFMTENGFSLRDGLYAISAVSHFTLGAVLEQQEHTAALENLPPLLREALQIMDSDDGEQAFLHGLESLIRGFEVQLTALLQ	M;N;Q;R	cctatCAAtgatAGA;tctatCATtgatAGG;cctatCAAtgatAGA;tctatCATtgatAGG	159	478	436	156;0;280;0	16;0;8;0;4;0;6;0;4;28;24;0;0;0;0;4;4;16;96;226
1QPZ	1qpz_1_1	10438625	2.5	ESCHERICHIA COLI	1	1	1	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Purine Repressor	1	1	1	2	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	1	1	A;B	atikDVAKRAnvstttVshVInKtrfvaEEtRNAVWAAIKELHyspsAVarSlkvnHTKSIGLLATSSEAAYFAEIIEAVEKNCFQKGYTLILGNAWNNLEKQRAYLSMMAQKrVDGLLVMCSEYPEPLLAMLEEYRHIPMVVMDWGEAKADFTDAVIDNAFEGGYMAGRYLIERGHREIGVIPGPLERNTGAGRLAGFMKAMEEAMIKVPESWIVQGDFEPESGYRAMQQILSQPHRPTAVFCGGDIMAMGALCAADEMGLRVPQDVSLIGYDNVRNARYFTPALTTIHQPKDSLGETAFNMLLDRIVNKREEPQSIEVHPRLIERRSVADGPFRDYR;atikDVAKRAnvstttVshVInKtrfvaEEtRNAVWAAIKELHyspsAVarSlkvnHTKSIGLLATSSEAAYFAEIIEAVEKNCFQKGYTLILGNAWNNLEKQRAYLSMMAQKrVDGLLVMCSEYPEPLLAMLEEYRHIPMVVMDWGEAKADFTDAVIDNAFEGGYMAGRYLIERGHREIGVIPGPLERNTGAGRLAGFMKAMEEAMIKVPESWIVQGDFEPESGYRAMQQILSQPHRPTAVFCGGDIMAMGALCAADEMGLRVPQDVSLIGYDNVRNARYFTPALTTIHQPKDSLGETAFNMLLDRIVNKREEPQSIEVHPRLIERRSVADGPFRDYR	M;Q	TacgcaAacgtttgCGT;TacgcaAacgtttgCGT	68	98	398	96;42;256;4	6;0;2;4;6;0;2;2;10;16;14;0;0;0;0;8;6;8;68;246
1RIO	1rio_1_1	14731393	2.3	BACTERIOPHAGE LAMBDA, THERMUS AQUATICUS	1	2	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Repressor Protein CI	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	stkkkPLTQEqLEDARRLkAIyeKKkNELglsqeSVADKggqsgVgalfnGinaLnAYnAALLAKILKVSVEEFSPSIAREIYEYEAVHHHHHH;stkkkPlTQEQLEDARRLkAIyeKKkNELGLsqeSVADKggqsgVgalFnGinaLnAYnAALLAKILKVSVEEFSPSIAREIYEYEAVHHHHH	T;U	CCATGTcaagcactggcggtgATACCG;CGgtatcaccgccagtgcTTGACATGG	53	466	284	110;0;173;1	10;2;5;1;4;0;4;0;20;3;15;0;0;0;0;4;4;14;37;161
1RIO	1rio_1_2	14731393	2.3	BACTERIOPHAGE LAMBDA, THERMUS AQUATICUS	1	2	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Repressor Protein CI	1	2	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	1	0	0	1	H	SEELEKALSKLSErEAMVLKLrKGLIDGrEHtleeVGAYFgvtrerIrqIenkALRKLKYH	T;U	CCAtgtcaAGCACTGGCGGTGATACCG;CGGTATCACCGCCAGTgcttGaCATGG	254	465	121	48;0;73;0	1;0;3;0;2;0;0;0;3;2;3;0;0;0;0;8;0;13;28;58
1RPE	1rpe_1_1	8355273	2.5	BACTERIOPHAGE 434	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	434 Repressor	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	L;R	SISSRVkSKrIQLGLnqaELAQKVGttqqsIeqLEnGktkrprfLPELASALGVSVDWLLNGT;SISSRVkSKrIQLGLnqaELAQKVgttqqsIeqLEnGktkrprfLPELASALGVSVDWLLNGT	A;B	ACaaacaagATacattgtAT;TatacaaTGTatcttgtTTG	60	463	290	90;5;195;0	10;0;10;0;5;0;0;0;18;12;12;0;0;0;0;11;1;11;30;170
1TRO	1tro_1_1	3419502	1.9	ESCHERICHIA COLI	2	1	1	2	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Trp Repressor	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;C	SPYSAAMAEERHQEWLRFVDLLKNAYQNDLHLPLLNLMLtPdeREaLGtrVRIVEELLRGEmsqrELkNElgagiatItrGsnSLkAAPVELRQWLEEVLLKSD;AMAEERHQEWLRFVDLLKNAYQNDLHLPLLNLMLtPdeREaLGtrVRIVEELLRGEmsqrELknElgagiatItrGsnSLkAAPVELRQWLEEVLLKSD	I;J	tgtactAGTTaactagtaC;tgtacTAGTTaactagtaC	31	85	262	93;0;169;0	4;2;7;0;4;2;0;2;18;12;6;0;0;0;0;6;1;21;30;147
1TRO	1tro_2_1	3419502	1.9	ESCHERICHIA COLI	2	1	1	2	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Trp Repressor	2	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	E;G	AEERHQEWLRFVDLLKNAYQNDLHLPLLNLMLtPdeREaLGtrVRIVEELLRGEmsqrELkNElgagiatItrGsnSLkAAPVELRQWLEEVLLKSD;SPYSAAMAEErHQEWLRFVDLLKNAYQNDLHLPLLNLMLtPdeREaLGtrVRIVEELLRGEmsqrELkNElgagiatItrGsnSLkAAPVELRQWLEEVLL	K;L	tgtactAGTTaactagtaC;tgtacTAGTTaactagtaC	31	85	261	86;0;175;0	4;2;7;0;2;3;0;2;13;13;6;0;0;0;0;6;2;22;24;155
1TRR	1trr_1_1	8232559	2.4	ESCHERICHIA COLI	2	2	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Trp Repressor	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	aqqsPySAAMAEQrHEEWLRFVDLLKNAYQNDLHLPLLNLMLtPdeREaLGtrVRIVEELLRgEmsqreLkNELgagiatItrGsnSLkAAPVELRQWLEEVLLK;aqqsPySAAMAEQrHEEWLRFVDLLKNAYQNDLHLPLLNLMLtpdeREaLGtrVRIVEELLRGEMSQRELKNELgagIatITrGSNSLKAAPVELRQWLEEVLLK	C;I	AGcgtactagtACGCT;AGcgtacTAGtacgct	31	21	283	51;8;224;0	3;1;3;0;0;3;1;1;17;14;6;0;0;0;0;3;1;17;39;174
1TRR	1trr_1_2	8232559	2.4	ESCHERICHIA COLI	2	2	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Trp Repressor	1	2	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	G;H	aqqsPySAAMAEQrHEEWLRFVDLLKNAYQNDLHLPLLNLMLtPdeREaLGtrVRIVEELLRGEmsqreLkNELgagiatItrGsnSLkAAPVELRQWLEEVLLK;aqqsPySAAMAEQrHEEWLRFVDLLKNAYQNDLHLPLLNLMLtpdeREaLGtrVRIVEELLRGEMSQRELKNELgagIatITrGSNSLKAAPVELRQWLEEVLLK	C;I	AGcgtacTAGtacgct;AGcgtactagtACGCT	31	21	282	49;8;225;0	3;1;2;0;0;3;1;1;17;15;6;0;0;0;0;3;0;17;37;176
1TRR	1trr_2_1	8232559	2.4	ESCHERICHIA COLI	2	2	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Trp Repressor	2	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	D;E	aqqsPySAAMAEQrHEEWLRFVDLLKNAYQNDLHLPLLNLMLtPdeREaLGtrVRIVEELLRgEmsqreLkNELgagiatItrGsnSLkAAPVELRQWLEEVLLK;aqqsPySAAMAEQrHEEWLRFVDLLKNAYQNDLHLPLLNLMLtpdeREaLGtrVRIVEELLRGEMSQRELKNELgagIatITrGSNSLKAAPVELRQWLEEVLLK	F;L	AGcgtactagtACGCT;AGcgtacTAGtacgct	31	21	284	52;8;224;0	3;1;3;0;0;3;1;1;17;14;6;0;0;0;0;3;1;17;41;173
1TRR	1trr_2_2	8232559	2.4	ESCHERICHIA COLI	2	2	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Trp Repressor	2	2	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	J;K	aqqsPySAAMAEQrHEEWLRFVDLLKNAYQNDLHLPLLNLMLtPdeREaLGtrVRIVEELLRGEmsqreLkNELgagiatItrGsnSLkAAPVELRQWLEEVLLK;aqqsPySAAMAEQrHEEWLRFVDLLKNAYQNDLHLPLLNLMLtpdeREaLGtrVRIVEELLRGEMSQRELKNELgagIatITrGSNSLKAAPVELRQWLEEVLLK	F;L	AGcgtacTAGtacgct;AGcgtactagtACGCT	31	21	289	50;10;229;0	3;1;2;0;0;3;1;1;17;14;7;0;0;0;0;3;0;17;41;179
1YO5	1yo5_1_1	15882048	2	HOMO SAPIENS	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Ets Domain, PDEF	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	1	0	0	1	C	QpihlWQFLKELLLKPHSYGRFIRWLNKEKGIFKIEDsAQVARLwGIRkNrPamNydklsrsIrqyykkGiIRkPDIsQrlVyQFVHP	A;B	tagcaggatGtgt;ACacatccTGCta	243	378	221	54;7;159;1	6;1;3;0;3;0;1;0;5;4;4;0;0;0;0;3;1;10;45;135
1YRN	1yrn_1_1	7569974	2.5	SACCHAROMYCES CEREVISIAE	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Homeodomain, Mat Alpha 2	1	1	1	0	2, 2	0	0	0	0	0	2	2	2	1	A;B	iSPQArAFLeQVFRRKQslnsKEkEEVAKKCGITPlqVrvwFinKrmrS;TKpyrghrfTkENvRILESWFAKNIENPylDTKGLENLMKNTSLSriqIknwVsnRrrkEkTiTIAPELADLLSGEPL	C;D	TacatgtaatttattacatCA;TAtgatgTAATAAattacaTG	121;123	376	346	78;28;240;0	8;1;11;1;5;1;0;1;23;3;7;0;0;0;0;4;1;18;56;206
1ZG1	1zg1_1_1	16262254	2.3	ESCHERICHIA COLI	2	1	1	2	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Response Regulator Protein NARL 	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	RDVNQLtprERDILKLIAQGLpnkIARRLDitestVkvhvkhlkKKlksrVEAAVWVHQERIF;RDVNQLtprERDILKLIAQGLpnkIARRLditestVkvhvkhlkKKlksrvEAAVWVHQERIF	C;D	cgtactCCTTaatgggtACG;cgtaccCATTaaggagtACG	32	6	303	79;0;224;0	6;0;4;0;0;0;2;0;6;18;11;0;0;0;0;1;4;15;43;193
1ZG1	1zg1_2_1	16262254	2.3	ESCHERICHIA COLI	2	1	1	2	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Response Regulator Protein NARL 	2	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	E;F	RDVNQLtprERDILKLIAQGLpnkIARRLditestVkvhvkhlkKKlksrvEAAVWVHQERIF;RDVNQLtprERDILKLIAQGLpnkIARRLDitestVkvhvkhlkKKlksrVEAAVWVHQERIF	G;H	cgtaccCATTaaggagtACG;cgtactCCTTaatgggtACG	32	6	306	84;0;222;0	7;0;5;0;0;0;2;0;6;16;11;0;0;0;0;1;4;15;44;195
1ZG5	1zg5_1_1	16262254	2.3	ESCHERICHIA COLI	2	1	1	2	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Response Regulator Protein NARL 	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	RDVNQLtprERDILKLIAQGLpnkIARRLDitestVkvhvkhlkKKlksrVEAAVWVHQERIF;RDVNQLtprERDILKLIAQGLpnkIARRLditestVkvhvkhlkKKlksrVEAAVWVHQERIF	C;D	cgtaccCCTAtaggggtACG;cgtaccCCTAtaggggtACG	32	6	303	81;0;222;0	10;0;6;0;0;0;2;0;6;18;11;0;0;0;0;1;4;15;45;185
1ZG5	1zg5_2_1	16262254	2.3	ESCHERICHIA COLI	2	1	1	2	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Response Regulator Protein NARL 	2	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	E;F	ERDVNQLtprERDILKLIAQGLpnkIARRLDitestVkvhvkhlkKKlksrvEAAVWVHQERIF;RDVNQLtprERDILKLIAQGLpnkIARRLDitestVkvhvkhlkKKlksrVEAAVWVHQERIF	G;H	cgtacCCCTAtaggggtACG;cgtacCCCTAtaggggtACG	32	6	304	79;0;225;0	10;0;6;0;0;0;2;0;7;17;11;0;0;0;0;0;4;15;49;183
1ZRF	1zrf_1_1	16427082	2.1	ESCHERICHIA COLI	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Catabolite Gene Activator Protein	1	1	1	0	2, 1	0	2	0	0	0	2	1	2	1	A;B	TDPTLEWFLSHCHIHKYPskSTLIHQGEKAETLYYIVKGSVAVLIKDEeGkEMILSYLNQGDFIGELGLFEEGQERSAWVRAKTACEVAEISYKKFRQLIQVNPDILMRLSAQMARRLQVTSEKVGNLAFLdvtGRIAQTLLNLAKQPDAMTHPDGMQIkItrqeIGQIVgcsretVgriLkMLEDQNLISAhgktIVVYGTR;DPTLEWFLSHCHIHKYPskSTLIHQGEKAETLYYIVKGSVAVLIKDEeGkEMILSYLNQGDFIGELGLFEEGQERSAWVRAKTACEVAEISYKKFRQLIQVNPDILMRLSAQMARRLQVTSEKVGNLAFLdvtGRIAQTLLNLAKQPDAMTHPDGMQIkItrqEIGQIVgcsretVgriLkMLEDQNLISAhgktIVVYG	W;X;Y;Z	TTCGAAAaatgcgaT;CTagatcgCATTtttcGAAAT;TTTCGAAAaatgcgAT;CTagatcgCATTtttcGAAAT	62	371	269	61;0;208;0	6;2;6;0;4;0;0;0;3;13;18;0;0;0;0;6;0;24;28;159
1ZS4	1zs4_1_1	16039594	1.7	BACTERIOPHAGE LAMBDA	1	2	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Repressor Protein CII	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	1	0	2	1	2	1	A;B	GSHMANKRNEALRIESALLNKIAMLgtekTAEAVgvdksqIsrwkrdwIPKFSMLLAVLEWGVVDDDMARLARQVAAILTNK;GSHMANKRNEALRIESALLNKIAMLGTEKTAEAVGVDKSqISrWKrdwIPkFSMLLAVLEWGVVDDDMARLARQVAAILTNK	T;U	TATTCGTGCAAACAAacgcaaCGAGGT;TACCTcgttgcGTTTgttTGCACGAAT	96	370	124	51;0;73;0	3;1;3;1;3;0;0;0;6;3;4;0;0;0;0;4;2;12;18;64
1ZS4	1zs4_1_2	16039594	1.7	BACTERIOPHAGE LAMBDA	1	2	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Repressor Protein CII	1	2	1	0	1, 1	0	0	0	1	0	2	1	2	1	C;D	ANKRNEALRIESALLNKIaMLgtekTAEAVgvdksqIsrwkrdwIPKFSMLLAVLEWGVVDDDMARLARQVAAILTNKK;RNEALRIESALLNKIAMLGTEKTAEAVGVDKSqISrWKrdwIPkFSMLLAVLEWGVVDDDMARLARQVAAILT	T;U	TATtcgtgcaaACAAACGCAACGAGGT;TACCTCGTTGCGTTTgtttgcACGAat	96	369	147	58;2;87;0	4;1;4;0;2;0;0;0;8;4;5;0;0;0;0;6;2;12;26;73
2A07	2a07_1_1	16407075	1.9	HOMO SAPIENS	2	2	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Forkhead Box Protein P2	1	1	1	0	2, 2	0	0	0	0	0	2	1	0	1	F;G	VRPPFTYATLIRQAIMESSDRQLTLNEIYSWFTRTFAyFRrNAAtWKnaVrhnLslhKCFVRVENVKGAVWTVDEVEYQkrR;PftyaTLIRQAIMESSDRQLTLNEIYSWFTRTFAYFRRNAATWKNAVRHNLSLHKCFVRVENVKGAVWTVDEVEYQKRR	A;B	AACTAtgaaaCAAATTTTCCT;TTAGGAAAAtttgtttCATAG	55	78	94	26;0;68;0	2;0;2;0;0;0;0;0;3;3;2;0;0;0;0;2;0;5;9;66
2A07	2a07_1_2	16407075	1.9	HOMO SAPIENS	2	2	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Forkhead Box Protein P2	1	2	1	0	2, 2	0	0	0	0	0	1	0	0	1	J	IVrPPftyaTLIRQAIMESSDRQLTlnEIySWFTRTFAYFRRNAAtWKnaVrhnLslhkCFVrVeNVKGaVwTVDEVEYQKrr	A;B	AACTATGaaacaaATTTtcCT;TTAGGAAaatttgTTTCATAG	55	77	126	45;0;81;0	2;0;0;0;1;0;0;0;4;3;4;0;0;0;0;1;2;9;23;77
2A07	2a07_2_1	16407075	1.9	HOMO SAPIENS	2	2	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Forkhead Box Protein P2	2	1	1	0	2, 2	0	0	0	0	0	2	1	0	1	H;I	PftyaTLIRQAIMESSDRQLTLNEIYSWFTRTFAYFRRNAATWKNAVRHNLSLHKCFVRVENVKGAVWTVDEVEYQKRR;VRPPFTYATLIRQAIMESSDRQLTLNEIYSWFTRTFAyFRrNAAtWKnaVrhnLslhKCFVrVENVKGAVWTVDEVEYQKr	C;D	AACTAtgaaACAAATTTTCCT;TTAGGAAAATttgtttCATAG	55	78	87	24;0;63;0	2;0;2;0;0;0;0;0;3;3;2;0;0;0;0;2;0;5;9;59
2A07	2a07_2_2	16407075	1.9	HOMO SAPIENS	2	2	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Forkhead Box Protein P2	2	2	1	0	2, 2	0	0	0	0	0	1	0	0	1	K	IVrPPftyATLIRQAIMESSDRQLTlnEIySWFTRTFAYFRRNAAtWKnaVrhnLslhKCFVrVeNVKGaVwTVDEVEYQKrr	C;D	AACTATGaaacaaATTTtcCT;TTAGGAAaatttgTTTCATAG	55	77	127	44;0;83;0	2;0;0;0;1;0;0;0;4;3;4;0;0;0;0;1;2;9;24;77
2C6Y	2c6y_1_1	0	2.4	HOMO SAPIENS	1	2	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Forkhead Box Protein K2	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	1	0	0	1	A	DSkPPysyaQLIVQAITMAPDKQLTlnGIyTHITKNYPYYRTADkgWQnsIrhnLslnryFIkVPRSQEEpgkgsFwRIDPASESKLIEqAFRKrrPr	C;D	TGttgtaaaCAAtacA;ATGTattgtttaCAac	174	340	198	52;8;138;0	4;0;4;0;0;0;0;0;13;4;6;0;0;0;0;2;3;8;38;116
2C6Y	2c6y_1_2	0	2.4	HOMO SAPIENS	1	2	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Forkhead Box Protein K2	1	2	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	1	0	0	1	B	DSkPPysyAQLIVQAITMAPDKQLTlnGIyTHITKNYPYYRTADkgWQnsIrhnLslNRYFIkVPRSQEEPgkgsFwRIDPASESKLIEQAFRKrR	C;D	TGTTGTAAacaatacA;atgtatTGTTTACAAC	174	339	114	42;0;72;0	1;0;2;0;0;0;0;0;2;5;2;0;0;0;0;2;1;5;17;77
2CGP	2cgp_1_1	9096308	2.2	ESCHERICHIA COLI	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Catabolite Gene Activator Protein	1	1	1	0	4, 0	0	0	0	0	0	1	0	0	1	A	DPTLEWFLSHCHIHKYPSkSTLIHQGEKAETLYYIVKGSVAVLIKDEEGkEMILSYLNQGDFIGELGLFEEGQERSAWVRAKTACEVAEISYKKFRQLIQVNPDILMRLSAQMARRLQVTSEKVGNLAFLDvTGRIAQTLLNLAKQPDAMTHPDGMQIkItrqEIGQIVgcsretVGrILkMLEDQNLISAHgkTIVVYG	B;C	gtcaCATTaat;ATTaatgtgaCATAT	62	333	109	39;0;70;0	2;0;6;0;2;0;0;0;6;3;3;0;0;0;0;4;1;8;14;60
2D5V	2d5v_1_1	17223534	2	RATTUS NORVEGICUS	2	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Homeodomain, HNF-6	1	1	1	0	1, 0	0	0	0	0	0	1	0	0	1	A	MEEINTKEVAQRItTELkRYsipqaIFAQRVLcrsqgtLsdlLrnPkPWSklksgREtFRRMWKWLQEPEFQRMSALRLprlvfTDVQrRTLhAIFKENKrPSkELqITISQQLGLElstVsnfFmnArrrSLDk	C;D	TctaagtcaataAT;AttattgacTtaG	169	331	275	85;8;182;0	10;1;10;0;4;0;0;0;14;9;7;0;0;0;1;8;3;18;28;162
2D5V	2d5v_2_1	17223534	2	RATTUS NORVEGICUS	2	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Homeodomain, HNF-6	2	1	1	0	2, 0	0	0	0	0	0	1	0	0	1	B	MEEINTKEVAQRITTELkRYsipqaIFAQRVLcrsqgtLsdlLrnPkPWSklksgREtFRRMWKWLQEPEFQRMSALRLprlvfTDVQrRTLhAIFKENKrPSkELqITISQQLGLELstVsnfFmnArrrSLDk	E;F	tctaagtcaataAT;AttattgacTTA	169	330	272	73;8;189;2	8;1;7;0;4;1;0;0;13;9;8;0;0;0;0;7;2;15;30;167
2E1C	2e1c_1_1	18073105	2.1	PYROCOCCUS HORIKOSHII	1	1	1	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Transcriptional Regulator PH1519	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A	PLDEIDKKIIKILQNDGkaplrEISKITglaestIherIrkLRESGVIKKFTAIIDPEALGYSMLAFILVKVKAGKYSEVASNLAKYPEIVEVYETTGDYDMVVKIRTKNSEELNNFLDLIGSIPGVEGTHTMIVLKTHKETTELPI	B;D	agtgaaAATTttTCACA;TGTGAAAAAttttcACT	226	322	97	43;0;54;0	0;1;0;1;2;0;0;1;0;1;2;0;0;0;0;6;2;4;24;53
2H1K	2h1k_1_1	17315980	2.42	MESOCRICETUS AURATUS	2	1	1	2	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Homeodomain, Pdx1	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	1	0	0	1	A	rtrtayTRAQlLELeKEFLFNKyiSrPRrVELAVMLNLTERhIkiwFqnRrmkWkkEE	C;D	AGAaactcatTagag;TCTCtaatGAGTTTC	102	296	154	27;7;119;1	5;0;2;0;1;0;0;0;7;1;5;0;0;0;0;2;0;11;22;98
2H1K	2h1k_2_1	17315980	2.42	MESOCRICETUS AURATUS	2	1	1	2	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Homeodomain, Pdx1	2	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	1	0	0	1	B	NkrtrtayTrAQlLELeKEFLFNKyiSrPRrVELAVMLNLTErhIkiwFqnRrmkWkKEE	E;F	AGAaactcattagag;TCTCtaatgAGTTTC	102	295	189	31;14;143;1	5;0;3;0;2;0;1;0;12;1;3;0;0;0;0;2;0;15;31;114
2H27	2h27_1_1	16903784	2.3	ESCHERICHIA COLI	2	1	1	2	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Sigma E Factor	1	1	1	0	1, 0	0	0	0	0	0	1	0	0	1	A	SHMLSEELRQIVFRTIESLpEdlRMAITLrELDGLsyeEIAAIMDcpvgtVrsrIfrArEAIDNKVQPLIR	B;C	CCcggaaCTTCG;CGaagttcCGG	194	67	144	59;0;84;1	3;2;4;0;0;0;1;0;3;3;2;0;0;0;0;0;1;12;30;83
2H27	2h27_2_1	16903784	2.3	ESCHERICHIA COLI	2	1	1	2	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Sigma E Factor	2	1	1	0	1, 0	0	0	0	0	0	1	0	0	1	D	MLSEELRQIVFRTIESLpEdlRMAITLrELDGLsyeEIAAIMDcpVgtVrsrIfrArEAIDNKVQPLIR	E;F	CCcggaaCTTCG;CGaagttcCGG	194	67	143	60;0;82;1	3;2;4;0;0;0;1;0;1;4;3;0;0;0;0;0;1;14;33;77
2HDD	2hdd_1_1	9309220	1.9	DROSOPHILA MELANOGASTER	1	2	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Homeodomain, Engrailed	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	1	0	0	1	A	rtafSSEQlARLKREFNENRylTERRrQQLSSELGLNEAqIkiwFknKrakIkkS	C;D	TTTTGCCATgtaatcCCCGGA;ATCCggggatTacatGGCAAA	35	290	133	30;8;95;0	7;0;6;0;1;0;0;0;8;2;3;0;0;0;0;0;0;9;19;78
2HDD	2hdd_1_2	9309220	1.9	DROSOPHILA MELANOGASTER	1	2	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Homeodomain, Engrailed	1	2	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	1	0	0	1	B	krprTAFSSEQLARLKREFNENRylTeRRrQQLSSELGLNEAqIkiWFknKraKIk	C;D	TTTTGCCATGTAATCCccgga;atcCGGGGATTACATGGCAAA	35	289	95	22;2;71;0	3;0;2;0;1;0;0;0;2;0;2;0;0;0;0;0;0;10;16;59
2HOS	2hos_1_1	17240973	1.9	DROSOPHILA MELANOGASTER	1	2	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Homeodomain, Engrailed	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	1	0	0	1	A	rtafSSEQlARLKREFNENRylTeRRrQQLSSELGLNEAqVkgwFknMrakIkkST	C;D	TTTTGCCATgtaatcCCCGGA;ATCCggggatTacatGGCAAA	35	283	122	22;10;90;0	4;0;5;0;1;0;0;0;4;2;2;0;0;0;0;0;0;9;16;79
2HOS	2hos_1_2	17240973	1.9	DROSOPHILA MELANOGASTER	1	2	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Homeodomain, Engrailed	1	2	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	1	0	0	1	B	krprTAFSSEQLARLKREFNENRylTeRRrQQLSSELGLNEaqVkgWFknMraKIkKS	C;D	TTTTGCCATGTAATCcccgga;atcCGGGGATTACATGGCAAA	35	64	78	17;1;60;0	3;0;2;0;0;0;0;0;2;0;2;0;0;0;0;0;0;6;12;51
2HOT	2hot_1_1	17240973	2.19	DROSOPHILA MELANOGASTER	1	2	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Homeodomain, Engrailed	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	1	0	0	1	A	rtafSSEQlARLkREFNENRylTeRRrQQLSSELGLNEaqVkgwFknMrakIkkST	C;D	TTTTGCCATgtaatCCCCGGA;ATCCggggatTacatGGCAAA	35	282	122	24;6;92;0	3;0;3;0;1;0;0;0;8;1;4;0;0;0;0;0;0;10;15;77
2HOT	2hot_1_2	17240973	2.19	DROSOPHILA MELANOGASTER	1	2	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Homeodomain, Engrailed	1	2	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	1	0	0	1	B	krprTAFSSEQLARLKREFNENRylTeRRrQQLSSELGLNEaqVkgWFknMraKIkkS	C;D	TTTTGCCATGTAATCcccgga;atcCGGGGATTACATGGCAAA	35	64	77	16;1;60;0	3;0;2;0;0;0;0;0;1;0;2;0;0;0;0;0;0;7;14;48
2IRF	2irf_1_1	10487755	2.2	MUS MUSCULUS	3	2	1	3	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Interferon Regulatory Factor 2	1	1	1	0	1, 0	0	0	0	0	1	1	0	0	1	G	RMrmRPWLEEQINSNTIPGLKWLNKEKKIFQIPWMHAARHGWDVEKDAPLFRNwAIHtGkHQPGIDKPDPKtWKanFRcaMNslpDIEEVKDRSIKKGNNAFRVYRMLP	A;F	AAGTgAaAGGA;TTCACTTTCact	52	59	59	9;1;49;0	0;0;0;0;0;0;0;0;2;1;1;0;0;1;0;1;1;1;15;36
2IRF	2irf_1_2	10487755	2.2	MUS MUSCULUS	3	2	1	3	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Interferon Regulatory Factor 2	1	2	1	0	1, 0	0	0	0	0	1	1	0	0	1	H	rMrmRPWLEEQINSNTIPGLKWLNKEKKIFQIPwmhaaRHGwDVEKDAPLFRNwAIHtGkHQPGIDKPDpktWkanFrcaMnslpDIEEVkDRSIkkGNNAFrVYRMLP	A;F	aagtgaaAGgA;TTCactttCACt	52	34	164	38;3;123;0	4;0;3;0;0;0;1;0;10;2;4;0;1;2;0;4;2;10;32;89
2IRF	2irf_2_1	10487755	2.2	MUS MUSCULUS	3	2	1	3	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Interferon Regulatory Factor 2	2	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	1	1	0	0	1	I	rMrmRPWLEEQINSNTIPGLKWLNKEKKIFQIPWMHAARHGWDVEKDAPLFRNwAIHtGkHQPGIDKPDPKtWKanFRcaMNslpDIEEVKDRSIKKGNNAFRVYRMLP	B;E	AAGTgAaAGGA;TCACTTTcact	52	59	59	9;2;48;0	0;0;1;0;0;0;0;0;3;1;3;0;0;1;0;1;1;1;13;34
2IRF	2irf_2_2	10487755	2.2	MUS MUSCULUS	3	2	1	3	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Interferon Regulatory Factor 2	2	2	1	0	0, 0	0	0	0	0	1	1	0	0	1	J	rMrmRPWLEEQINSNTIPGLKWLNKEKKIFQIPwmhaaRHGWDVEKDAPLFRNwAIHtGkHQPGIDKPDPktWkanFrcaMnslpDIEEVkDRSIkkGNNAFrVYRMLP	B;E	aagtgaaAGGA;TCactttCACt	52	34	165	35;5;125;0	2;0;1;0;0;0;1;0;10;1;5;0;1;3;0;4;2;13;32;90
2IRF	2irf_3_1	10487755	2.2	MUS MUSCULUS	3	2	1	3	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Interferon Regulatory Factor 2	3	1	1	0	1, 0	0	0	0	0	1	1	0	0	1	K	rMrmRPWLEEQINSNTIPGLKWLNKEKKIFQIPWMHAARHGWDVEKDAPLFRNwAIHtGkHQPGIDKPDPKtWKanFRcaMNslpDIEEVKDRSIKKGNNAFRVYRMLP	C;D	AAGTGAAAGGA;TTCACTTTCact	52	269	54	9;0;45;0	0;0;0;0;0;0;0;0;4;1;2;0;0;1;0;1;1;2;11;31
2IRF	2irf_3_2	10487755	2.2	MUS MUSCULUS	3	2	1	3	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Interferon Regulatory Factor 2	3	2	1	0	1, 0	0	0	0	0	1	1	0	0	1	L	RMrmRPWLEEQINSNTIPGLKWLNKEKKIFQIPwmhaaRHGwDVEKDAPLFRNwAIHtGkHQPGIDKPDPktWkanFrcaMnslpdIEeVKDRSIkKGNNAFrVYRMLP	C;D	aagtgaaAGgA;TTCactttCACt	52	34	150	36;3;111;0	3;0;2;0;0;0;1;0;7;1;4;0;1;2;0;3;2;9;32;83
2ISZ	2isz_1_1	17209554	2.4	MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS	1	2	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Repressor IdeR	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	mnElVdttEMyLRTIYDLEEEGVTPlrarIAeRLdqsgptVsqtVsrMErDGLLRVAGDrHLELTEKGRALAIAVMRKHRLAERLLVDVIGLPWEEVHAEACRWEHVMSEDVERRLVKVLNNPTTSPFGNPIPGLVELGV;mnElVdttEMyLRTIYDLEEEGVTPlrarIAeRLdqsgptVsqtVsrMErdGLLRVAgdrHLELTEKGRALAIAVMRKHRLAERLLVDVIGLPWEEVHAEACRWEHVMSEDVERRLVKVLNNPTTSPFGNPIPGLVELGV	E;F	CCCTGTTagcacaGGCTgccctaATTTtaGTGG;CACTAaaattagGGCagcctgTGCtAACAGGGC	83	266	296	65;6;225;0	3;0;4;0;4;1;1;0;22;22;14;0;0;0;0;11;0;22;38;154
2ISZ	2isz_1_2	17209554	2.4	MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS	1	2	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Repressor IdeR	1	2	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	C;D	mnElVDttEMyLRTIYDLEEEGVTPlrarIAERLdqsgptVsqtVSrMErDGLLRVAGDrHLELTEKGRALAIAVMRKHRLAERLLVDVIGLPWEEVHAEACRWEHVMSEDVERRLVKVLNNPTTSPFGNPIPGLVELGV;mnElVdttEMyLRTIYDLEEEGVTPlrarIAeRLdqsgptVsqtVSrMErDGLLRVAGDrHLELTEKGRALAIAVMRKHRLAERLLVDVIGLPWEEVHAEACRWEHVMSEDVERRLVKVLNNPTTSPFGNPIPGLVELGV	E;F	CCctgttagCAcaggctgCCCtAATTTTAGTGG;CACTAAAATTAgggcagCCTgtgctaACAGGGC	83	265	270	61;3;206;0	1;0;2;0;0;0;0;0;18;18;13;0;0;0;0;8;0;22;36;152
2O49	2o49_1_1	17652321	2	HOMO SAPIENS	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Trasncription Factor SATB1	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	1	0	0	1	A	EVSSEIYQWVrDElKRAgisqaVFArVAFnrtqglLseiLrKEEDPKTASQsLLVnLRAMQNFLQLPEAERDRIYQDErERslR	B;C	gctaaTATATGC;GCAtatattAGC	185	54	126	38;0;88;0	1;1;0;0;2;1;0;0;5;6;3;0;0;0;0;5;1;8;19;74
2O4A	2o4a_1_1	17652321	1.75	HOMO SAPIENS	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Trasncription Factor SATB1	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	1	0	0	1	A	EVSSEIYQWVrDElKRAGisqaVFArVAFnrtqglLseILrKEEDPKTASQsLLVnLRAMQNFLQLPEAERDRIYQDErERSlR	B;C	gctaaTATATGC;GCAtatattAGC	185	54	119	38;0;81;0	1;1;1;0;2;1;0;0;3;5;3;0;0;0;0;5;1;8;19;69
2OR1	2or1_1_1	3187531	2.5	BACTERIOPHAGE 434	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	434 Repressor	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	L;R	SISSRVkSKrIQLGLnqAELAQKVgttqqsIeqLEnGktkrprfLPELASALGVSVDWLLNGT;SISSRVkSKrIQLGLnqaELAQKVGttqqsIeqLEnGktkrprfLPELASALGVSVDWLLNGT	A;B	AAgtacaAACTttcttgtAT;TatacaaGAAagtttgtACT	60	245	279	95;4;180;0	5;0;8;0;3;0;0;0;17;10;13;0;0;0;0;15;1;10;31;166
2PI0	2pi0_1_1	17560375	2.31	HOMO SAPIENS	1	4	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Interferon Regulatory Factor 3	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	1	0	0	1	A	kpriLPWLVSQLDLGQLEGVAWVNKSRTRFRIPwkhglRGIFQAwAEAtGaYVPGRDKPdlptWkrnFrsaLnrkEGLRlAEdRskDPHDPHkIyEFV	E;F	CATaggaaaaCTGAAAGGGAGAAGTGAAAGTG;CACTTTCACTTCTCCCTTTCagttttCCTatg	89	237	204	46;4;154;0	5;1;2;1;1;0;0;0;9;3;3;0;0;0;0;3;2;12;35;127
2PI0	2pi0_1_2	17560375	2.31	HOMO SAPIENS	1	4	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Interferon Regulatory Factor 3	1	2	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	1	0	0	1	B	MGTPkpriLPWLVSQLDLGQLEGVAWVNKSRTRFRIPwkhglrqDAQQEDfGIFQAwAEAtGaYVPGRDKPDLptWkrnFrsaLnrkEGLRlAEdRskDPHDPHkIYEFVNS	E;F	CATAGGAaaactgaaaGgGaGAAGTGAAAGTG;CACTTTCACTTCTCcctttCAGTtttccTATG	89	236	220	38;9;173;0	3;1;1;1;1;0;1;0;8;2;6;0;0;0;0;2;2;11;37;144
2PI0	2pi0_1_3	17560375	2.31	HOMO SAPIENS	1	4	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Interferon Regulatory Factor 3	1	3	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	1	0	0	1	C	pkpriLPWLVSQLDLGQLEGVAWVNKSRTRFRIPwkhglrqDAQQEDFGIFQAwAEAtGaYVPGRDKPDLptWkrnFrsaLnrkEGLRlAEdRskDPHDPHkIYEFV	E;F	CATAGGAAAACTGaaagggagAAGtgaAAGTG;CACTTTCActtctcCCTttcagTTTTCCTATG	89	235	204	36;9;159;0	6;1;6;0;1;0;0;1;3;2;6;0;0;0;0;1;2;11;39;125
2PI0	2pi0_1_4	17560375	2.31	HOMO SAPIENS	1	4	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Interferon Regulatory Factor 3	1	4	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	1	0	0	1	D	TPkprilPWLVSQLDLGQLEGVAWVNKSRTRFRIPwKhglrqdAGIFQAwAEAtGaYVPGRDKPDlptWkrnFrsaLnrkEGLRlAEdRskDPHDPHkIYEFVN	E;F	CATAGGAAAACTGAAAGGGAgaagtgaaaGTG;CactttCACTtctccCTTTCAGTTTTCCTATG	89	234	221	45;9;167;0	3;1;1;2;1;0;1;0;9;2;5;0;0;0;0;2;2;13;37;142
2R1J	2r1j_1_1	18237194	1.53	BACTERIOPHAGE P22	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Repressor P22 c2	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	2	1	L;R	TQLMGERIrARrkKLKIrqaALGKMVgvsnvaIsqwErSetepnGEnLLALSKALQCSPDYLLKGD;TQLMGERIrARrkKLKIrqaALGKMVgvsnvaIsqwErSetepnGEnLLALSKALQCSPDYLLKGD	A;B	TatttaaGATatcttaAATG;CatttaAGATatcttaAATA	197	223	283	102;0;181;0	0;0;4;0;3;0;0;0;14;7;11;0;0;0;0;19;2;15;54;154
2VY1	2vy1_1_1	18784751	2.1	ARABIDOPSIS THALIANA	1	1	1	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Protein Leafy	1	1	1	2	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	rehpfIVTEPGEVARGKKNGLDYLFHLYEQCREFLLQVQTIAKDRGEkCPTKvtnqVFrYAkKSGAsyInkpkMrhyVHCYALHCLDEEASNALRRAFKERGEnvgSWRQACYKPLVNIACRHGWDIDAVFNAHPRLSIWyvPtKLRQLCHLERNNAVAAAAAL;rehpfIVTEPGEVARGKKNGLDYLFHLYEQCREFLLQVQTIAKDRGEkCPTKvtnqVFrYAkKSGAsyInkpkMrhyVHCYALHCLDEEASNALRRAFKERGEnvgSWRQACYKPLVNIACRHGWDIDAVFNAHPRLSIWyvPtKLRQLCHLERNNAVAAAAAL	W;X	AgaaggaCCAGtggtcCgta;AgaaggaCCAGtggtcCgta	81	208	338	82;18;238;0	12;0;8;0;0;2;0;2;26;10;16;0;0;0;0;0;2;16;38;206
2VY2	2vy2_1_1	18784751	2.3	ARABIDOPSIS THALIANA	1	1	1	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Protein Leafy	1	1	1	2	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	A;B	rehpfIVTEPGEVARGKkNGLDYLFHLYEQCREFLLQVQTIAKDRGEkCPTKVtnqVFrYAkKSGAsYInkpkMrhyVHCYALHCLDEEASNALRRAFKERGEnvgSWRQACYKPLVNIACRHGWDIDAVFNAHPRLSIWyvPtKLrQLCHLERNNAVAAAAA;rehpfIVTEPGEVARGKkNGLDYLFHLYEQCREFLLQVQTIAKDRGEkCPTKVtnqVFrYAkKSGAsYInkpkMrhyVHCYALHCLDEEASNALRRAFKERGEnvgSWRQACYKPLVNIACRHGWDIDAVFNAHPRLSIWyvPtKLrQLCHLERNNAVAAAAA	W;X	AtttaatCCAAtggtTACaa;AtttaatCCAAtggtTACaa	81	207	290	52;12;226;0	8;0;8;0;0;0;0;0;20;10;14;0;0;0;0;0;0;16;40;174
3BPY	3bpy_1_1	0	1.87	HOMO SAPIENS	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Forkhead Box Protein O4	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	1	0	0	1	A	RrnawGNqsyaeLISQAIESAPEKRLTlaQIyEWMVRTVPyFKDKGDSnssAgWknsIrhnLslhSKFIkVHNEATgKssWwMLN	B;C	CTAtgtaaACAAC;gttgtttaCATag	93	195	169	57;0;112;0	2;0;1;0;1;0;0;0;6;12;7;0;0;0;0;2;3;5;34;96
3CO6	3co6_1_1	18786403	2.1	HOMO SAPIENS	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Forkhead Box Protein O1	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	1	0	0	1	C	SSRrnAwGNlsyaDLITKAIESSAEKRLTlsQIyEWMVKSVPyFKDKGDsNSSAgWknsIrhnLslhSKFIrVQNeGTgkssWwMLNPEGG	A;B	TGGTttgtttaCCTTG;CAAggtaaACAAAccA	93	180	146	50;0;96;0	2;0;2;0;1;0;0;0;3;9;6;0;0;0;0;2;3;4;32;82
3COA	3coa_1_1	18786403	2.2	HOMO SAPIENS	2	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Forkhead Box Protein O1	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	1	0	0	1	C	RrnawGNLsyadLITKAIESSAEKRLTlsQIyEWMVKSVPyFKDKGDsNSSAgWknsIrhnLslhSKFIrVqNEGtgkssWwMLNP	A;B	TGGTttgttttGCTTG;CAagcaaaaCAAAccA	93	179	150	47;0;103;0	2;2;1;0;2;0;0;0;3;7;6;0;0;0;0;1;2;4;30;90
3COA	3coa_2_1	18786403	2.2	HOMO SAPIENS	2	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Forkhead Box Protein O1	2	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	1	0	0	1	F	SRrnawGNLsyAdLITKAIESSAEKRLTlsQIyEWMVKSVPyFKDKGDsNSSAgWknsIrhnLslhSKFIrVqNEGTgkssWwMLNP	D;E	TGGTttgttttGCTtg;CAagcaaaaCAAAccA	93	178	153	47;4;102;0	4;1;3;0;2;0;0;0;8;7;5;0;0;0;0;1;2;5;27;88
3CRO	3cro_1_1	2038059	2.5	BACTERIOPHAGE 434	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Cro Repressor	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	2	1	2	1	L;R	MQTLSERLkKRrIALKMtqteLATKAgvkqqsIqliEaGvtkrprfLFEIAMALNCDPVWLQYGTK;MQTLSERLkKRrIALKMtqteLATKAGvkqqsIqliEAGvtkrprfLFEIAMALNCDPVWLQYG	A;B	AAgtacaAACtttcttgtAT;TatacaAGAaagtttgtACT	198	175	289	87;12;190;0	9;0;9;0;3;0;0;0;16;15;14;0;0;0;0;11;1;10;41;160
3ERE	3ere_1_1	0	2.5	MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS H37RV	1	1	1	2	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Arginine Repressor	1	1	1	0	0, 0	0	0	0	0	0	1	0	0	1	D	AaNrAGrQARIVAILSSAQVrsqneLAALLAAEGIevtqatLsrDLeELGAVkLrGADggtGIyVVPEDGSPVRGVSGGTDRMARLLGELLVSTDDSGNLAVLRTPPGAAHYLASAIDRAALPQVVGTIAGDDTILVVAREPTTGAQLAGMFENLR	A;B	ttgcaTAACGatGCAA;TTGCATCGttatgCAA	223	156	118	35;0;83;0	3;1;3;0;1;0;0;0;6;5;7;0;0;0;0;3;1;8;7;73
3HDD	3hdd_1_1	9813123	2.2	DROSOPHILA MELANOGASTER	1	2	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Homeodomain, Engrailed	1	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	1	0	0	1	A	rtafSSEQlARLkREFNENRylTeRRrQQLSSELGLNEAqIkiwFqnKrakIkkS	C;D	TTTTGCCATgtaattACCTAA;ATTAggtaatTacaTGGCAAA	35	149	149	32;10;106;1	5;0;7;0;2;0;0;0;7;2;3;0;0;0;0;1;0;13;21;88
3HDD	3hdd_1_2	9813123	2.2	DROSOPHILA MELANOGASTER	1	2	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Homeodomain, Engrailed	1	2	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	1	0	0	1	B	rprtAFSSEQLARLKREFNENRylTeRRrQQLSSELGLNEAqIkiWFqnKraKIkk	C;D	TTTTGCCATGTAATTAcctaa;attAGGTAATTACATGGCAAA	35	148	98	29;1;68;0	4;0;3;0;1;0;0;0;3;0;3;0;0;0;0;2;0;9;16;57
3HTS	3hts_1_1	10331875	1.75	KLUYVEROMYCES LACTIS	1	1	1	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Heat Shock Factor Protein	1	1	1	2	0, 0	0	0	0	0	0	2	1	1	1	B;E	MARpafVNkLWSMVNDKSNEKFIHWSTSGESIVVPNRERFVQEVLPKYfkhSnFasFvrqLnmyGWhkVqNNDSRwEFENER;MARpafVNkLWSMVNDKSNEKFIHWSTSGESIVVPNRERFVQEVLPKYfkhSnFasFvrqLnmyGWhkVqNNDSRwEFENER	A;D	GgttctagaACC;GgttctagaACC	34	147	230	78;0;150;2	4;0;0;0;0;0;0;0;6;4;12;0;0;0;0;6;2;10;26;160
6PAX	6pax_1_1	10346815	2.5	HOMO SAPIENS	1	1	0	1	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Homeodomain, Paired Protein Pax	1	1	1	0	2, 2	0	0	0	0	0	1	0	0	1	A	shSGvnqlGGVfvngrplPDSTrQRIVELAHSGArpcDISrILQvsngcVskiLGrYYATGSIRpraiggskprvaTPEVVSKIAQYKQECPSifawEIRDRLLSEGVCTNdNipsvssInrVLrnLASEKQQ	B;C	AAGCAttttcACgcatgagtgcACAG;TTctgtGCACtcatgcgtgaAAATGC	118	141	395	57;35;303;0	5;2;1;1;2;3;3;2;16;7;20;5;0;0;0;4;3;20;65;236
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9ANT	9ant_2_1	9699632	2.4	DROSOPHILA MELANOGASTER	2	1	1	2	0	0	1	Transcription factor	Helix Turn Helix	Homeodomain, Antennapedia	2	1	1	0	1, 1	0	0	0	0	0	1	0	0	1	B	rqtyTRYQtLELEKEFHFNRylTrRRrIEIAHALSLTErqIkiwFqnRrmkWkkEN	E;F	AGAaagccatTagag;TCTCtaatgGCTTTC	102	139	169	33;11;125;0	6;0;4;0;2;0;0;0;10;3;4;0;0;0;0;0;0;15;30;95